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一、蛋白質(zhì)通論二、肽三、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定四、蛋白質(zhì)的氨基酸(Suan)序列與生物學(xué)功能第一頁(yè),共九十一頁(yè)。蛋白質(zhì)、多肽、寡肽蛋白質(zhì)與多肽可以通用有時(shí)也以胰島(Dao)素(51個(gè)氨基酸,MW=5807)作為一個(gè)分界線,大于稱為蛋白質(zhì),小于為多肽寡肽通常指2-10個(gè)氨基酸的小分子肽第二頁(yè),共九十一頁(yè)。一、蛋白(Bai)質(zhì)通論(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織層次(二)蛋白質(zhì)的形狀和大小(一)蛋白質(zhì)的分類第三頁(yè),共九十一頁(yè)。N末(Mo)端C末端牛核糖核酸酶第四頁(yè),共九十一頁(yè)。一、蛋白(Bai)質(zhì)通論蛋白質(zhì)的分類依據(jù)蛋白質(zhì)的外形分類球狀蛋白質(zhì):globularprotein,外形接近球形或橢圓形,溶解性較好,能形成結(jié)晶,大多數(shù)蛋白質(zhì)屬于這一類。球狀蛋白的長(zhǎng)度與直徑之比一般小于10第五頁(yè),共九十一頁(yè)。纖維狀蛋白(Bai)質(zhì):fibrousprotein,分子類似纖維或細(xì)棒。它又可分為可溶性纖維狀蛋白質(zhì)和不溶性纖維狀蛋白質(zhì)。第六頁(yè),共九十一頁(yè)。依據(jù)(Ju)蛋白質(zhì)的組成分類結(jié)合蛋白(conjugatedprotein)簡(jiǎn)單蛋白(simpleprotein)單純蛋白質(zhì):這類蛋白質(zhì)只含由-氨基酸組成的肽鏈,不含其它成分清蛋白和球蛋白albuminandglobulin由簡(jiǎn)單蛋白與其它非蛋白成分結(jié)合而成第七頁(yè),共九十一頁(yè)。含(Han)量57-672-54-96.2-1212-20抗體(丙種球蛋白)注意等電點(diǎn)及分子量1937年Tiselius和Kabat的電泳方法第八頁(yè),共九十一頁(yè)。色蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與色素物質(zhì)結(jié)合而成。如血紅蛋白、葉綠蛋白和細(xì)胞色素等。糖蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與糖類物質(zhì)組成。如細(xì)胞膜中的糖蛋白等。脂蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與脂類結(jié)合而成。如血清-,-脂蛋白等。核蛋白:由簡(jiǎn)單蛋白與核酸結(jié)合而成。如DNA拓(Tuo)撲異構(gòu)酶、病毒的DNA或RNA復(fù)制過(guò)程中等。結(jié)合蛋白共價(jià)通過(guò)絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸的側(cè)鏈羥基經(jīng)磷酸二酯鍵連接到DNA或RNA的3′或5′端第九頁(yè),共九十一頁(yè)。(二)蛋白(Bai)質(zhì)的形狀和大小纖維蛋白質(zhì)、球狀蛋白質(zhì)、膜蛋白質(zhì)長(zhǎng)度/直徑>10第十頁(yè),共九十一頁(yè)。蛋白質(zhì)分子量變化范圍很大,從(Cong)大約6000到1,000,000道爾頓甚至更大。(二)蛋白質(zhì)的形狀和大小第十一頁(yè),共九十一頁(yè)。(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組(Zu)織層次化學(xué)結(jié)構(gòu)(construct,構(gòu)造
):是指組成分子的原子種類+數(shù)量以及它們之間的鍵合(化學(xué)鍵)形式
C2H5OH乙醇 CH3OCH3乙醚
構(gòu)型(configuration):在給定的化學(xué)結(jié)構(gòu)下,分子中原子在鍵合時(shí)所形成的不同的空間排列(可分離)旋光異構(gòu)順反異構(gòu)第十二頁(yè),共九十一頁(yè)。構(gòu)象(conformation):在化學(xué)結(jié)構(gòu)和(He)configuration相同的分子中,其原子由于單鍵的內(nèi)旋轉(zhuǎn)(internaltotation)而在空間形成的不同的構(gòu)象體可以相互轉(zhuǎn)化
一種物質(zhì)它的構(gòu)造和構(gòu)型只有一種,但它的構(gòu)象可以有許多種!第十三頁(yè),共九十一頁(yè)。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次分一級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三(San)級(jí)結(jié)構(gòu)和四級(jí)結(jié)構(gòu)在二、三級(jí)結(jié)構(gòu)之間又分出二個(gè)亞層次:超二級(jí)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域??臻g結(jié)構(gòu)=三維結(jié)構(gòu)=蛋白質(zhì)的構(gòu)象第十四頁(yè),共九十一頁(yè)。第十五頁(yè),共九十一頁(yè)。二(Er)、肽
1、肽的基本概念2、肽命名3、動(dòng)植物體內(nèi)重要的肽4、肽的物理和化學(xué)性質(zhì)第十六頁(yè),共九十一頁(yè)。1、肽的(De)基本概念一分子氨基酸的α-羧基與另一分子氨基酸α-氨基脫水縮合的化合物叫做肽,氨基酸之間通過(guò)酰胺鍵(蛋白質(zhì)化學(xué)中將這類酰胺鍵專稱為肽鍵)連接而成。指示:
刪除樣本文檔圖標(biāo),并替換為工作文檔圖標(biāo),如下:在Word中創(chuàng)建文檔.返回PowerPoint在“插入”菜單中選擇“對(duì)象...”單擊“從文件創(chuàng)建”定位“文件”框中的文件名確認(rèn)選中“顯示為圖標(biāo)”。單擊“確定”選擇圖標(biāo)從“幻燈片放映”菜單中選擇“動(dòng)作設(shè)置”單擊“對(duì)象動(dòng)作”,并選擇“編輯”單擊“確定”第十七頁(yè),共九十一頁(yè)。肽鍵性(Xing)質(zhì)1:肽鍵中的C-N鍵具有部分雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)。肽鍵性質(zhì)2:在大多數(shù)情況下,以反式結(jié)構(gòu)存在。相鄰2個(gè)氨基酸的側(cè)鏈R形成反式構(gòu)型
組成肽鍵的原子(4+2)處于同一平面-肽平面。第十八頁(yè),共九十一頁(yè)。第十九頁(yè),共九十一頁(yè)。
-H2O二(Er)肽:丙氨酰甘氨酸
N——C2、肽命名
第二十頁(yè),共九十一頁(yè)。寡肽——少(Shao)數(shù)幾個(gè)氨基酸
組成的肽絲氨酸甘氨酸酪氨酸丙氨酸亮氨酸第二十一頁(yè),共九十一頁(yè)。多肽鏈、蛋白質(zhì)就是由幾十個(gè)到幾百個(gè)甚至幾千個(gè)氨基酸(Suan)分子借肽鍵相互連接起的多肽鏈肽鏈中的氨基酸不是原來(lái)完整的分子,多肽鏈中的氨基酸單位稱為氨基酸殘基第二十二頁(yè),共九十一頁(yè)。
無(wú)論肽鏈有多長(zhǎng),在鏈的兩端一端有游離的氨基(-NH2),稱為N端;鏈的另(Ling)一端有游離的羧基(-COOH),稱為C端。
多肽化合物的名稱,通常按照肽內(nèi)氨基酸殘基的排列順序,以殘基名稱(如某某氨酰)從N端依次閱讀到C端,并以C端殘基全名結(jié)束肽的名稱。第二十三頁(yè),共九十一頁(yè)。命名舉(Ju)例氨基末端羧基末端下列五肽命名為:丙氨酰谷氨酰亮氨酰纈氨酰組氨酸第二十四頁(yè),共九十一頁(yè)。注(Zhu)意:在開鏈肽的N端和C端可以有游離的α氨基和α羧基,而有的開鏈肽的N端或C端的游離的α氨基或α羧基被別的基團(tuán)結(jié)合(如烷基化、?;龋┗騈端殘基自身環(huán)化。第二十五頁(yè),共九十一頁(yè)。例如促甲狀腺素釋放激素的N端殘基是谷氨酸(Suan),此殘基易于自身環(huán)化成焦谷氨?;é涟被c谷氨酸的γ羧基脫水縮和而成)。第二十六頁(yè),共九十一頁(yè)。在生物體中,多肽(Tai)最重要的存在形式是作為蛋白質(zhì)的亞單位。但是,也有許多分子量比較小的多肽以游離狀態(tài)存在。這類多肽通常都具有特殊的生理功能,常稱為活性肽。如:腦啡肽;激素類多肽;抗生素類多肽;谷胱甘肽;蛇毒多肽等?;钚噪摹に仉幕蛏窠?jīng)肽3、動(dòng)植物體內(nèi)重要的肽第二十七頁(yè),共九十一頁(yè)。
1)、谷胱(Guang)甘肽
γ-肽鍵
GSH容易氧化,二分子GSH脫氫以二硫鍵相連成氧化型的谷胱甘肽(GSSG)谷胱甘肽是某些酶的輔酶,在體內(nèi)氧化還原過(guò)程中起重要作用。第二十八頁(yè),共九十一頁(yè)。2)、促腎上腺皮質(zhì)激(Ji)素(ACTH)大腦分泌的ACTH參與意識(shí)行為的調(diào)控;腺垂體分泌的ACTH主要作用于腎上腺皮質(zhì)
第二十九頁(yè),共九十一頁(yè)。3)、腦(Nao)啡肽
Leu-腦啡肽
Met-腦啡肽
神經(jīng)遞質(zhì),有鎮(zhèn)痛作用而又不會(huì)像嗎啡那樣使病人上癮的藥物第三十頁(yè),共九十一頁(yè)。嗎啡是鴉片中最主要的生物堿(含量約10-15%),1806年法國(guó)化學(xué)家F·澤爾蒂納首次從鴉片中分離出來(lái)。分離得到的白色粉末在狗和自己身上進(jìn)行實(shí)驗(yàn),結(jié)果狗吃下去后很快昏昏睡去,用強(qiáng)刺激法也無(wú)法使其興奮蘇醒;他本人吞下這些粉末后也長(zhǎng)眠不醒。據(jù)此他用希臘神話中的睡眠之(Zhi)神嗎啡斯(Morphus)的名字將這些物質(zhì)命名為“嗎啡”。第三十一頁(yè),共九十一頁(yè)。腦啡肽(endorphin),是一種內(nèi)成性(腦下垂體分泌)的類嗎啡生物化學(xué)合成物激素。它能與嗎啡受體結(jié)合,產(chǎn)生跟嗎啡、鴉片劑一樣(Yang)有止痛和欣快感。等同天然的鎮(zhèn)痛劑。runner'shigh
1975年,兩個(gè)小組分別自豬腦和牛腦中發(fā)現(xiàn)2008年3月《Science》第三十二頁(yè),共九十一頁(yè)。4)、胰高血糖(Tang)素——29肽
第三十三頁(yè),共九十一頁(yè)。4、肽(Tai)的物理和化學(xué)性質(zhì)離子晶體,熔點(diǎn)高,兩性離子。1、雙縮脲反應(yīng)(biuretreaction)是肽和蛋白質(zhì)所特有的一個(gè)反應(yīng)。一般含有兩個(gè)或兩個(gè)以上的肽鍵的化合物與CuSO4堿性溶液都能發(fā)生雙縮脲反應(yīng)面生成紫紅色或蘭紫色復(fù)合物利用這個(gè)反應(yīng)可以以分光光度計(jì)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量(非蛋白質(zhì)特異性)第三十四頁(yè),共九十一頁(yè)。第三十五頁(yè),共九十一頁(yè)。肽的等(Deng)電點(diǎn)如何求出?2、兩性離子第三十六頁(yè),共九十一頁(yè)。+H3N—His—Glu—Val—COO-COO-查(Cha)P133pK9.17pK6.00pK4.25pK2.322.324.256.009.17+-+2+10-1-2pK=4.25*6/2=5.125第三十七頁(yè),共九十一頁(yè)。蛋(Dan)白質(zhì)分子的一級(jí)結(jié)構(gòu)及其測(cè)定
一級(jí)結(jié)構(gòu)組成多肽鏈的氨基酸殘基的連接方式和排列順序二硫鍵第三十八頁(yè),共九十一頁(yè)。蛋白質(zhì)(Zhi)的一級(jí)結(jié)構(gòu):(Primarystructure)組成蛋白質(zhì)的多肽鏈數(shù)目多肽鏈的氨基酸順序多肽鏈內(nèi)或鏈間二硫鍵的數(shù)目和位置第三十九頁(yè),共九十一頁(yè)。1,樣品必需純(>97%以上);2,知道蛋白質(zhì)的分子量;3,知道蛋白質(zhì)由幾個(gè)亞基組成;4,測(cè)定蛋白質(zhì)的氨基酸組成;并根據(jù)分子量計(jì)算每種氨基酸的個(gè)數(shù)。5,測(cè)定水解液中的氨量,計(jì)算酰(Xian)胺的含量。測(cè)定蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)的要求第四十頁(yè),共九十一頁(yè)。三、蛋白(Bai)質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定1.氨基酸組成分析
2.氨基酸末端分析
3.蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離4.肽鏈的部分降解及肽片斷的分離5.肽段氨基酸順序測(cè)定及肽段重疊6.二硫鍵與酰胺基的定位
第四十一頁(yè),共九十一頁(yè)。1.氨基酸組成(Cheng)分析第四十二頁(yè),共九十一頁(yè)。N-末端(Duan)分析C-末端分析2.氨基酸末端分析N末端測(cè)定方法比C末端更加成熟、可靠和準(zhǔn)確,第四十三頁(yè),共九十一頁(yè)。N-末(Mo)端分析二硝基氟苯法(FDNB法)二甲基氨基萘磺酰氯法(DNS-Cl法)異硫氰酸苯酯法(Edman法)氨基酸末端分析2.氨基酸末端分析N-末端分析第四十四頁(yè),共九十一頁(yè)。二硝基氟苯(Ben)法(FDNB法)1945年由Sanger發(fā)明此法曾用此方法測(cè)定了胰島素的N-末端。2.氨基酸末端分析第四十五頁(yè),共九十一頁(yè)。二甲基氨基萘磺酰(Xian)氯法(DNS-Cl法)1956年hartley等提出靈敏度較高(比FDNB法提高100倍)樣品量小于1毫微摩爾DNS-氨基酸穩(wěn)定性較高2.氨基酸末端分析第四十六頁(yè),共九十一頁(yè)。異硫氰(Qing)酸苯酯法(Edman法)2.氨基酸末端分析生成PTH-氨基酸非常穩(wěn)定,在268nm處有強(qiáng)吸收峰第四十七頁(yè),共九十一頁(yè)。C-末(Mo)端分析肼解法還原法羧肽酶法2.氨基酸末端分析第四十八頁(yè),共九十一頁(yè)??膳c苯甲醛(Quan)作用形成不溶的二亞芐基衍生物而除去溶于上清中第四十九頁(yè),共九十一頁(yè)。2.還原(Yuan)法2.氨基酸末端分析硼氫化鋰還原成α-氨基醇。完全水解后分析α-氨基醇第五十頁(yè),共九十一頁(yè)。3.羧(Suo)肽酶法主要方法
根據(jù)不同的反應(yīng)時(shí)間測(cè)出酶水解所釋放的氨基酸種類和數(shù)量,從而知道蛋白質(zhì)的C末端殘基順序。實(shí)際應(yīng)用時(shí),由于羧肽酶對(duì)不同的C末端氨基酸作用的速度不同,而且反應(yīng)是連續(xù)的,不能停在某一步上,因此給正確判斷氨基酸的順序造成了一定的困難。2.氨基酸末端分析肽鏈外切酶自多肽鏈的C端逐個(gè)的水解氨基酸第五十一頁(yè),共九十一頁(yè)。第五十二頁(yè),共九十一頁(yè)。4種(Zhong)常用羧肽酶:羧肽酶來(lái)源專一性CpA胰臟能釋放除pro、Arg和Lys以外的所有C端氨基酸CpB胰臟主要水解C端為Arg或Lys的肽鍵CpC植物或微生物相當(dāng)廣泛,幾乎能釋放C端的所有氨基酸CpY面包酵母可釋放C端所有氨基酸羧肽酶A、B均不作用于C-末端第二位為Pro的C-末端的殘基的肽鍵第五十三頁(yè),共九十一頁(yè)。-AA-AA-Lys-AA-AA-Arg-AA-AA-Pro-AA-AA-pro-AA羧肽酶A不(Bu)作用-AA-AA-Lys-AA-AA-Arg羧肽酶B只作用羧肽酶A、B均不作用羧肽酶Y設(shè)計(jì)自動(dòng)化序列儀return第五十四頁(yè),共九十一頁(yè)。肽鏈間的(De)結(jié)合非共價(jià)鍵血紅蛋白(四聚體)烯醇化酶(二聚體)共價(jià)鍵結(jié)合胰島素免疫球蛋白等3、蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離第五十五頁(yè),共九十一頁(yè)。非共價(jià)鍵連接(Jie)的多肽鏈溫和條件下可以解離通過(guò)二硫鍵連接的多肽鏈需要較強(qiáng)的條件將二硫鍵切斷3、蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離第五十六頁(yè),共九十一頁(yè)。拆(Chai)分二硫鍵結(jié)構(gòu)是半胱氨酸殘基經(jīng)氧化作用而形成胱氨酸殘基。還原法氧化法3、蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離第五十七頁(yè),共九十一頁(yè)。主要二種方法:1.過(guò)(Guo)甲酸氧化法巰基(-SH)和二硫鍵(-S-S-)同時(shí)氧化成磺基,生成的磺酸基很穩(wěn)定,肽鏈不再重新形成二硫鍵,便于肽鏈分離二硫橋的斷裂第五十八頁(yè),共九十一頁(yè)。巰基乙醇8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍二硫橋的(De)斷裂2.巰基化合物還原法蛋白質(zhì)變性二硫鍵暴露第五十九頁(yè),共九十一頁(yè)。可以用碘乙酸等烷基化試劑保護(hù)生成(Cheng)的半胱氨酸的-SH+HI+巰基保護(hù)試劑第六十頁(yè),共九十一頁(yè)。
由于氨基酸順序測(cè)定多數(shù)采用Edman降解法,它一次能分析肽鏈長(zhǎng)(Chang)度約10余個(gè)氨基酸殘基,所以分離得到的單鏈如果太長(zhǎng),須將長(zhǎng)的肽鏈斷裂成易分析的較短肽鏈。
肽鏈部分降解的方法要求選擇性強(qiáng)、裂解點(diǎn)少、反應(yīng)率高,一般采用化學(xué)裂解和酶解法兩種。4.肽鏈的部分降解及肽片斷的分離第六十一頁(yè),共九十一頁(yè)。1).化學(xué)裂解法
溴化氰(CNBr)與肽鏈中Met殘基側(cè)鏈的硫醚基發(fā)生反應(yīng),生成環(huán)化的溴化亞氨內(nèi)酯,此產(chǎn)物水解后,產(chǎn)生高絲氨酸內(nèi)酯,使蛋氨酸羧基端的肽鍵斷裂。這一方法的優(yōu)點(diǎn)是產(chǎn)率高(可達(dá)85%)、專一性強(qiáng),故實(shí)際應(yīng)用(Yong)較多。甲硫氨酸,人體唯一的含硫必需AA第六十二頁(yè),共九十一頁(yè)。氰化物(Wu),帶有氰基(CN)的化合物cyanide['sai?,naid]叁鍵給予氰基以相當(dāng)高的穩(wěn)定性,使之在通常的化學(xué)反應(yīng)中都以一個(gè)整體存在。該基團(tuán)具有和鹵素類似的化學(xué)性質(zhì),常被稱為擬鹵素。
有機(jī)氰化物可分類為腈jīng(C-CN)異腈(C-NC)
第六十三頁(yè),共九十一頁(yè)。苦杏仁中毒機(jī)理主要是由于苦杏仁苷被腸道菌群中的β-葡萄糖苷酶水解,產(chǎn)生氫氰(Qing)酸而被吸收。氰離子能與細(xì)胞色素氧化酶的三價(jià)鐵(Fe3+)結(jié)合,阻斷了氧化呼吸過(guò)程中電子的傳遞,致使血紅蛋白喪失攜氧能力,最后組織細(xì)胞因缺氧而窒息。有報(bào)道,成人一次口服生苦杏仁40-60??芍卸荆?0-100??芍滤?。亦有文獻(xiàn)報(bào)道,小兒口服5粒引起中毒,服10余粒致死的。第六十四頁(yè),共九十一頁(yè)。產(chǎn)生(Sheng)片段的C端是Met第六十五頁(yè),共九十一頁(yè)。
2).酶解法
酶解法相對(duì)化學(xué)(Xue)裂解法而言,有許多優(yōu)點(diǎn),如專一性強(qiáng)、裂解條件溫和、副反應(yīng)少等,再則蛋白水解酶對(duì)肽鏈的水解率也比較高;不同的蛋白水解酶對(duì)不同氨基酸形成的肽鍵水解專一性不同。廣泛使用第六十六頁(yè),共九十一頁(yè)。胰蛋白(Bai)酶胰凝乳(糜)蛋白酶葡萄球菌V8蛋白酶胃蛋白酶溴化氰梭菌蛋白酶(Arg蛋白酶)pH2-3Arg(C)第六十七頁(yè),共九十一頁(yè)。胰(Yi)蛋白酶第六十八頁(yè),共九十一頁(yè)。胰蛋白酶:R1=賴氨酸Lys和精(Jing)氨酸Arg側(cè)鏈(專一性較強(qiáng),水解速度快)。肽鏈水解位點(diǎn)第六十九頁(yè),共九十一頁(yè)。胰凝乳蛋白酶或糜蛋白酶:R1=苯丙氨酸Phe,色氨酸Trp,酪(Lao)氨酸Tyr(速度快);亮氨酸Leu,蛋氨酸Met和組氨酸His水解速度稍慢。肽鏈水解位點(diǎn)第七十頁(yè),共九十一頁(yè)。5、肽段的分離提純
肽鏈經(jīng)部分裂解得到肽片段必須分離提純,才能進(jìn)一步測(cè)定其氨基酸(Suan)順序。先采用凝膠過(guò)濾,得到不同相對(duì)分子質(zhì)量的肽片段組分肽片段組分可用離子交換層析進(jìn)一步提純,也可應(yīng)用雙相高壓紙電泳和層析相結(jié)合的方法,HPLC或FPLC具有更高的分辨率。第七十一頁(yè),共九十一頁(yè)。6.肽段氨基酸序列的測(cè)(Ce)定主要Edman降解法現(xiàn)在主要由氨基酸序列推定法7.肽段在多肽鏈中次序的決定重疊肽段拼湊法重建多肽鏈序列8.二硫橋位置的確定——對(duì)角線電泳第七十二頁(yè),共九十一頁(yè)。
取少量的樣品,首先用碘代乙酰胺將肽鏈中未參與二硫鍵形成(Cheng)的巰基保護(hù)起來(lái),然后用胃蛋白酶水解。肽水解后,可用Brown和Hartlay提出的對(duì)角線法電泳分離。8.二硫橋位置的確定——對(duì)角線電泳第七十三頁(yè),共九十一頁(yè)。對(duì)角線電(Dian)泳圖譜混合肽段點(diǎn)到濾紙中央,兩個(gè)方向的電泳條件完全相同第一向第二向過(guò)甲酸蒸氣處理2小時(shí),使-S-S-斷裂,此時(shí)含-S-S-肽段的靜電荷發(fā)生了改變第七十四頁(yè),共九十一頁(yè)。序列分析中(Zhong)的重要方法和技術(shù)測(cè)定N-末端基的異硫氰酸苯酯(PITC)法;分析C-末端基的羧肽酶法;用于多肽鏈局部斷裂的酶裂解和CNBr化學(xué)裂解;斷裂二硫橋的疏基乙醇處理;測(cè)定肽段氨基酸序列的Edman化學(xué)降解和電噴射串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù);重建多肽鏈一級(jí)序列的重疊肽拼湊法用于二硫橋定位的對(duì)角線電泳等。第七十五頁(yè),共九十一頁(yè)。蛋白質(zhì)順序測(cè)定基本(Ben)戰(zhàn)略將肽段順序進(jìn)行疊聯(lián)以確定完整的順序?qū)㈦亩畏蛛x并測(cè)出順序?qū)R恍粤呀饽┒税被釡y(cè)定二硫鍵拆開純蛋白質(zhì)第七十六頁(yè),共九十一頁(yè)。9.蛋白質(zhì)(Zhi)測(cè)序舉例
英國(guó)Sanger等人在1953年首次完成了牛胰島素(bovineinsulin)的全部化學(xué)結(jié)構(gòu)的測(cè)定工作——這是一個(gè)里程碑性的工作FrederickSanger1918,8,13-1958年、1980年兩度獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)第七十七頁(yè),共九十一頁(yè)。A鏈(Lian)B鏈過(guò)甲酸產(chǎn)物分離第七十八頁(yè),共九十一頁(yè)。用胰蛋白酶用糜蛋白酶分離肽片(Pian)段,測(cè)定肽序列第七十九頁(yè),共九十一頁(yè)。用重疊肽重建多肽鏈序(Xu)列第八十頁(yè),共九十一頁(yè)。胰(Yi)島素中二硫橋位置的確定糜蛋白酶溫和酸水解第八十一頁(yè),共九十一頁(yè)。由于蛋白質(zhì)序列測(cè)定技術(shù)先于DNA序列測(cè)定技術(shù)問(wèn)世,蛋白質(zhì)序列的搜集也早于DNA序列。60年代中期到80年代初,美國(guó)國(guó)家生物醫(yī)學(xué)研究基金會(huì)(簡(jiǎn)稱NBRF)Dayhoff領(lǐng)導(dǎo)的研究組將搜集到的蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)信(Xin)息以“蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)地圖集”(AtlasofProteinSequenceandStructure)的形式發(fā)表,主要用來(lái)研究蛋白質(zhì)的進(jìn)化關(guān)系。1984年,“蛋白質(zhì)信息資源”(ProteinInformationResource,簡(jiǎn)稱PIR)計(jì)劃正式啟動(dòng),蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)PIR也因此而誕生。
10.蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)第八十二頁(yè),共九十一頁(yè)。10.蛋白(Bai)質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)
SWISS-PROTSWISS-PROT蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù),由日內(nèi)瓦大學(xué)醫(yī)學(xué)生物化學(xué)系與EMBL(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室)共同維護(hù),是歐洲最主要的蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù),世界兩大蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)之一。PIRPIR(ProteinInformationResource)蛋白信息數(shù)據(jù)庫(kù),由美國(guó)國(guó)家生物醫(yī)學(xué)研究基金會(huì)(NationalBiomedicalResearchFoundation)維護(hù)。是美國(guó)最主要的蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù),為世界兩大蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)之一。PDBBrookhaven蛋白序列三維立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)。PROSITE蛋白特征序列字典。ENZYME蛋白酶數(shù)據(jù)庫(kù)。REBASE限制酶數(shù)據(jù)庫(kù)。HSSP同類二級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白(Homology-derivedsecondarystructureofproteins)數(shù)據(jù)庫(kù)。BLOCKS蛋白序列塊數(shù)據(jù)庫(kù)(ProteinBlocksDatabase)。KABAT具有免疫學(xué)重要性的蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)(DatabaseofProteinsofimmunologicalinteres
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