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文檔簡介
第11章
單基因遺傳病
的分子診斷
單基因遺傳?。阂粚Φ任换蚩刂瞥H旧w遺傳X連鎖遺傳單基因遺傳病線粒體遺傳基因結(jié)構(gòu)異常表達異常第一節(jié)策略第二節(jié)遺傳病的分子診斷第三節(jié)產(chǎn)前診斷一、血紅蛋白病二、血友病三、肌營養(yǎng)不良癥四、苯丙酮尿癥五、囊性纖維化六、亨廷頓病七、脆性X綜合征一、血紅蛋白病珠蛋白基因簇16p13.33-p13.1111p15.5珠蛋白基因簇:血紅蛋白的類型成人Hb:HbA2297~98%
HbA2
222~3%胎兒Hb:HbF22
α2Gγ2α2Aγ2胚胎Hb:HbGowerⅠ22
ζ2Gγ2ζ2Aγ2
HbGowerⅡ22
HbPortland22
血紅蛋白病hemoglobinopathy
結(jié)構(gòu)異常
鐮刀狀細胞貧血;不穩(wěn)定血紅蛋白病血紅蛋白M病氧親和力改變表達異常(地中海貧血)
珠蛋白的合成降低或消失1、鐮刀形紅細胞貧血正常細胞鐮刀形細胞
帶氧的功能只有正常紅細胞的一半,患者常因此缺氧窒息。N-val·his·leu·thr·pro·glu
·glu·····C(146)HbSβ肽鏈HbAβ肽鏈N-val·his·leu·thr·pro·val·glu·····C(146)鐮刀狀細胞貧血分子機制
GTGCATCTGACTCCTGAGGAGGTGCATCTGACTCCTGTGGAG正常的(N)的ASO探針:5′-ACTCCTGAGGAGAAGTCTGC-3′突變的(M)的ASO探針:5′-ACTCCTGTGGAGGAAGTCTGC-3′1.鐮刀型貧血病--ASO雜交法斑點雜交結(jié)果N:正常;M突變鐮狀紅細胞貧血患者ASO雜交法檢測N-ASOM-ASO正常突變突變
純合子雜合子純合子5′3′正?;?.15kb(CCTGAGG)×5′3′突變基因1.35kb(CCTGTGG)MstⅡ酶切2.HBS的限制性內(nèi)切酶譜分析目錄0.2kb1.15kb1.35kb正常人突變攜帶者患者鐮狀紅細胞貧血病的限制性內(nèi)切酶譜分析目錄3.HBS的PCR-RFLP分析
正常人的擴增產(chǎn)物經(jīng)MstⅡ消化可生成54bp和56bp兩個片段,而鐮狀細胞貧血癥患者的DNA片段不被酶切,仍為110bp,雜合子可見三條帶正常人雜合體患者MarkerPCR-SSCP(單鏈構(gòu)象多態(tài)性,single-strand
conformation
polymorphism)
當雙鏈DNA變性為兩條單鏈后,各自會在中性條件下形成各自特定的空間構(gòu)象,因而在電泳時將在不同的位置上出現(xiàn)各自電泳條帶。如果DNA序列發(fā)生變化,甚至只有一個堿基變化,空間構(gòu)象也有可能發(fā)生變化,電泳條帶也隨之變化。PCR-SSCPSβ肽鏈Aβ肽鏈ACTCCTGAGGAGACTCCTGTGGAGRE法(SouthernBlot)MstII
CCTNAGG
GGANTCC1.15kb0.2kb1.35kbASSASβ肽鏈Aβ肽鏈ACTCCTGAGGAGACTCCTGTGGAGRE法(PCR-RFLP)DdeI
CTNAG
GANTC268bpASSA175bp175268443
2.地中海貧血
由于珠蛋白鏈的合成不平衡所造成的一類常見的單基因遺傳性、溶血性疾病。α地中海貧血β地中海貧血γ地中海貧血δ地中海貧血α地中海貧血
16號染色體有兩個α基因(α-)為α+地貧,α鏈減少。(--)為α0地貧,α鏈不合成。臨床類型類型癥狀正常人靜止型+地貧雜合子無癥狀輕型(標準型)0地貧雜合子輕度貧血+地貧純合子血紅蛋白H病0地貧和+地貧雙重雜合子溶血性貧血HbBart’s胎兒水腫綜合征0地貧純合子胎兒水腫胎兒水腫
HVRψξ13’5’ca2
HVRψξ1
ψ2
ψ113’5’abcNormal(a+b)=1050bpMutant(a+c)=740bpLocationofPrimersandDetectionofthe--SEADeletionbyGap-PCRM12345678910HeterozygoteHomozygoteNormalNormalMutantDirectGenotypingofthe--SEADeletionbyDHPLCAssay––SEA/––SEA
//––SEASEAtypeofdeletion2
HVRψξ1
ψ2
ψ113’5’cdabNormal(a+b)=885bpMutant(c+d)=813bpPCR
DHPLCDetection
DNASamples非缺失型(點突變)無義突變、移碼突變、終止密碼突變、剪接突變等結(jié)果1
生成無功能或穩(wěn)定性降低的mRNA
無義突變移碼突變終止密碼突變起始密碼突變
2
RNA加工突變
3
產(chǎn)生不穩(wěn)定Hbβ地中海貧血
β珠蛋白Gene突變或缺失→β珠蛋白鏈合成速率下降→溶血性貧血
β0
地貧:β鏈完全不能合成
β+地貧:β鏈可部分合成β-地中海貧血臨床分類臨床類型基因型基因產(chǎn)物臨床表現(xiàn)重型地貧+/+、0/00/0、+/0鏈幾乎不能合成鏈合成相對增加HbF和HbA2增高地中海貧血面容溶血性貧血(需輸血)輕型地貧+/A、0/A0/A能合成適量的鏈貧血不明顯或輕度貧血中間型地貧+/+
鏈部分合成介于重型和輕型之間(不需輸血)遺傳性胎兒血紅蛋白持續(xù)增多癥缺失或突變鏈和鏈合成受抑制鏈合成明顯增加成人HbF持續(xù)增加,無癥狀患兒顱骨及面頰部骨骼增大,頭顱變大,額部隆起,顴高,鼻梁塌陷,兩眼距離增寬,眼瞼浮腫,形成地中海貧血的特殊面容。-地中海貧血的分子基礎(chǔ)
地中海貧血已發(fā)現(xiàn)100多種突變類型,包括點突變和基因缺失。絕大多數(shù)地中海貧血是由于基因發(fā)生點突變所致,突變涉及基因內(nèi)及側(cè)翼序列。(1)編碼區(qū)突變(2)非編碼區(qū)突變(3)啟動子區(qū)突變(4)RNA裂解信號突變(5)加帽位點單個堿基突變☆編碼區(qū)突變
——mRNA穩(wěn)定性降低或形成無功能mRNA(1)無義突變密碼子17:A→C
密碼子43:G→Tβ0地貧(2)移碼突變密碼子71/72:+A
密碼子41/42:-TCTTβ0地貧(3)起始密碼突變
ATG→AGGβ0地貧⑴內(nèi)含子IGT→AT喪失一個剪切信號。⑵新的切點產(chǎn)生同義突變→激活→I和Exon隱蔽裂解位點如:GGT→AGT產(chǎn)生新的剪切點☆非編碼區(qū)突變
——影響mRNA剪切、加工過程GT→ATGGT→AGT,激活隱蔽剪切位點☆啟動子區(qū)突變
——降低mRNA的轉(zhuǎn)錄效率-28位A→G突變破壞了TATABox。☆RNA裂解信號突變
——不能準確裂解和加polyAβ珠蛋白基因3’側(cè)翼序列中AATAAA→AACAAA☆加帽位點單個堿基突變
——不能準確裂解和加polyA加帽位點發(fā)生A→C顛換,影響轉(zhuǎn)錄效率。通常是mRNA的第一個核苷酸。分子診斷方法
PCR反向點雜交(PCR-RDB)法PCR—RFLP法基因芯片法等-地貧診斷--反向斑點雜交ReverseDotBlot(RDB)ReverseDotBlot(RDB)analysis:反向斑點雜交-29-28cd17cd261-11-5cd27/28cd41/42NormalMutant
NMNMNMcd43cd71/72654二、肌營養(yǎng)不良癥X連鎖性隱性遺傳,患者都為男孩。肌細胞膜上的抗肌萎縮蛋白(dystrophin)基因突變。細胞膜不穩(wěn)定,通透性增加而變性或壞死。
2.分子診斷
(1)多重PCR技術(shù)(2)短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandemrepeat,STR)連鎖分析(3)定量PCR技術(shù)
三、血友病缺乏凝血第8因子(FⅧ)--甲型。缺乏凝血第9因子(FⅨ)--乙型。甲型血友病分子機制
(二)乙型血友病及其分子診斷FⅨ基因缺陷,導致FⅨ含量缺乏或結(jié)構(gòu)異常,從而凝血功能障礙。直接測序法、基因芯片法和毛細管電泳(capillaryelectrophoresis,CE);間接檢測方法有:RFLP法、SSCP法、DGGE法、雙脫氧指紋圖譜(dideoxyfingerprint,ddF)、變性高效液相色譜法(denaturinghighperformanceliquidchromatography,DHPLC)四a1-抗胰蛋白酶缺乏癥是蛋白酶抑制劑,侵入組織,與中性粒細胞釋放的蛋白水解酶(主要彈性蛋白酶)結(jié)合抑制其活性,減少組織損傷.兒童缺乏引起肝病;成人引起肺氣腫.苯丙氨酸酪氨酸苯丙氨酸羥化酶苯丙酮酸(苯丙酮尿癥)
苯丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶五、苯丙酮尿癥(phenylketonuria,PKU)(二)分子診斷1.PCR-STR連鎖分析2.PCR-SSCP法3.PCR-RFLP4.多重ASPCR法
六、亨廷頓?。℉untington'sdisease,HD)4號染色體上IT15基因CAG重復(fù)序列異常。常染色體顯性遺傳。舞蹈運動為特征的神經(jīng)退行性疾病。
異常蛋白質(zhì)積聚成塊,形成包涵體,損壞部分腦細胞,特別是那些與肌肉控制有關(guān)的細胞,導致患者神經(jīng)系統(tǒng)逐漸退化,神經(jīng)沖動彌散,動作失調(diào),出現(xiàn)不可控制的顫搐,并能發(fā)展成癡呆,甚至死亡。
正常:9~30個拷貝。HD患者:大于35-100個或更多。拷貝數(shù)目與HD的發(fā)病年齡負相關(guān)。突變率在單基因遺傳性疾病中最低。HD的分子診斷PCR擴增鑒定IT15基因(CAG)n串聯(lián)重復(fù)序列拷貝數(shù)。
七脆性X綜合征(fragileXsyndrome,FraX)1.FMR-15′端(CGG)n重復(fù)異常2.FMR-15′端CpG島的異常甲基化3.缺失4.點突變脆性X綜合征的分子診斷
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