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文檔簡介
第7章基因突變與交換GeneMutation&Crossing-Over第7章GeneMutation1變異是自然選擇的基本對象變異是物種改良的基因資源變異是遺傳研究的理論根基變異是自然選擇的基本對象變異是遺傳研究的理論根基27.1.Pointmutation的類型7.2.突變發(fā)生的機理7.3.保證遺傳穩(wěn)定的機制7.4.基因重組交換的分子機制7.1.Pointmutation的類型7.2.37.1.Pointmutation
7.1.Pointmutation4dNtdeletionorinsertion
=3×dNt
±nxAminoacid
≠3×dNt
Framshift
Transition(轉換)
PyPy
PuPu
Transvertion(顛換)
Py
Pu
●Conversion(取代)●dNtdeletionorinsertion
dNtdeletionorinsertion=3×5---Samesensemut.
GAA(E)→GAG(E)
---Missensemut.
GAA(E)→AAA(K)
---Nonsensemut.
GAA(E)→TAA(stop)
●
突變的表達類型
獲得突變型是遺傳學研究的重要前提
非條件型突變;
RFLP,RAPD…紅花/白花,糯/非糯…條件型突變;
突變的表現(xiàn)=突變基因型+誘導條件
(光,溫敏感不育,Ts,su--…)
●conversioneffect
---Samesensemut.GAA(E)→G6突變的表達類型
Nullmutation:完全消除了基因功能的突變(缺失)
Loss-of-functionmutation
失去效應突變或阻止基因功能的突變
Gain-of-functionmutation突變獲得新的功能
Silentmutation
沒有明顯表型改變的突變
突變的表達類型Nullmutation:Loss-o7
7.2.突變發(fā)生的機理
(自發(fā)突變,誘發(fā)突變)7.2.突變發(fā)生的機理87.2.1.自發(fā)突變
7.2.1.1.堿基異構式引起DNA的復制錯誤
a)堿基異構式
A(amino)A(imino)
C(a)C(i)
G(keto)G(enol)
orG(e,i)
T(keto)
T(enol-2’)orT(enol-4’)
7.2.1.自發(fā)突變7.2.1.1.堿基異構式引起DN9(amino)HHN(imino)
(keto)(enol)
OH堿基異構式(amino)HHN(imino)(keto)(eno10(amino)(imino)
HHN(keto)OH(enol)
堿基異構式(amino)(imino)HHN(keto)OH(e11b)堿基異構式引起DNA復制的堿基錯配
(a)(k)(k)(a)堿基正常配對b)堿基異構式引起DNA復制的堿基錯配(a)(k)(k)12堿基異構式的錯配
(a)(i)H(k)O(e)H堿基異構式的錯配(a)(i)H(k)O(e)H13堿基異構式的錯配
(i)(a)H(e)H(k)堿基異構式的錯配(i)(a)H(e)H(k)14堿基異構式的錯配
HG(e)antiG(k)syn(i)A(a)synHA(i)anti堿基異構式的錯配HG(e)antiG(k)syn(15
堿基異構式的錯配
(i)A(i)antivHG(k)synG(e)antiHOA(a)syn堿基異構式的錯配(i)A(i)antivHG(k)16堿基異構式引起DNA復制的堿基錯配
A(a)
T(k)
G(k)C(a)
正確配對
錯誤配對
G(k)T(e)
A(a)
C(i)
A(i,anti)A(a,syn)A(i,anti)G(k,syn)
G(e,i,anti)G(k,syn)G(e,i,anti)A(a,syn)
A(i)
C(a)
G(e)
T(k)
堿基異構式引起DNA復制的堿基錯配A(a)17A(a)
T(k)
A(a,anti)
T(k,anti)
C(i)
C(a,anti)
A(a)
A(a,anti)
堿基異構式引起DNA的錯配突變
C(i)
C(a)G(k,syn)
G(k,syn)
G(k,anti)G(k)A(a)T(k)A(a,anti)T(k,187.2.1.2.增變基因(mutatorgene)
w.t.維持遺傳的穩(wěn)定性mut.
隨機引起其他各類基因的突變
butbewronged!7.2.1.2.增變基因(mutatorgene)19增變基因類別;DNApolymerase相關基因3’
5’editingfunctionmutation
錯配修復系統(tǒng)的基因
MCE(mismatchcorrectionenzyme)DNA
損傷修復系統(tǒng)基因錯配修復功能喪失,突變率升高修復過程是基因
突變的重要來源增變基因類別;DNApolymerase相關基因3’20
南京大學田大成等發(fā)現(xiàn)遺傳突變新機制
Nature,doi:10.1038/nature07175,自發(fā)突變的數(shù)量是由Indel的數(shù)量和密度所決定生物多樣性最初變異來源主要是由Indel誘導產(chǎn)生自然選擇在很大程度上是通過對Indel的選擇而實現(xiàn)突變在進化中的作用相當巨大
南京大學田大成等發(fā)現(xiàn)遺傳突變新機217.2.2.誘發(fā)突變
7.2.2.1.物理誘變
a)電離輻射誘變;
Co60(χ)(γ)ray
Cs137(χ)(γ)ray
H3(α)ray
P32,,S35(β)ray
衛(wèi)星搭載誘變;
高真空,強輻射,微重力
(χ)(γ)ray穿透性
(外照射處理)
(α)(β)ray非穿透性
(內標記處理)
dNt電荷及結構改變
7.2.2.誘發(fā)突變7.2.2.1.物理誘變a)22聶海勝
張曉光
王亞平神舟10號
聶海勝張曉光王亞平神舟10號23利用太空創(chuàng)造變異(衛(wèi)星搭載育種)微重力高輻射弱磁場
利用太空創(chuàng)造變異(衛(wèi)星搭載育種)微重力24b)非電離輻射—UltraVioletlight(U.V)---pyrimidinedimer(TTdimer)isgeneratedbycovalentlinks
betweenadjacentTT
∧U.V.…CTTA…共價鍵b)非電離輻射—UltraVioletlight25deamination—oxidationU.V.CUA(a)U.V.U.V.H2OH++OH-C(a)
C(i)A(a)depurinationdeamination—oxidationU.V.CU267.2.2.2.生物技術定點誘變
7.2.2.2.生物技術定點誘變27基因的定點誘變
oligo-dNt介導的定點誘變
合成與靶基因區(qū)段互補并含突變位點的oligo-dNt
錯配位點不能在3‘-end
renaturation
replicationtwotimesCGCCCAAGCCCAA基因的定點誘變oligo-dNt介導的定點誘變合成與28兩通用引物(commonP1&commonP2)
設計兩突變引物(mut.P1&mut.P2)
第一次PCR:
兩種產(chǎn)物混合,變性,復性
第二次PCRmP1/mP2不能進行PCRcP1/cP2的PCR產(chǎn)物為mutant
引物重疊延伸的PCR誘變
cP1
mP1mP2cP2
cP1
mP1mP2cP2兩通用引物(commonP1&commonP2)設29
DNAshuffling技術的基因誘變Mutants.Digestionligation
transformationselectionDNAshuffling技術的基因誘變Mutants30
插入突變體庫的構建定向選擇表型鑒定+AIMS…定向選擇表型鑒定+gfp…轉座子介導突變體庫的構建Ti質粒介導突變體庫的構建具有標簽的植物突變體插入突變體庫的構建定向選擇定向選擇轉座子介導突變31
T-DNA-mediatedGenetrap
LB
GenetrapRB經(jīng)過改造的質粒、轉座子載體插入受體基因組中使靶位點基因功能喪失檢測載體中報告基因的表達及載體保守序列鑒定插入位點并分離基因T-DNA-mediatedGenetra32
T-DNA-mediatedGenetrap
LB
GenetrapRB
根據(jù)結構和“陷阱效應”
增強子陷阱(enhancertrap)
啟動子陷阱
(promotertrap)
基因陷阱(genetrap)T-DNA-mediatedGenetra33Ti質粒介導的基因突變ReportgeneReportgeneReportgeneTi質粒介導的基因突變ReportgeneReportg34GUSassayinriceflowerorgans(I)GUSassayinriceflowerorgan35GUSassayinriceflowerorgans(II)
GUSassayinriceflowerorgan36MutantInformation:BZ2×MuActivator
Bz2
MutantInformation:BZ2×MuAc37Ac/DsAc/Ds38大型Mu插入突變體庫大型Mu插入突變體庫39基因突變和遺傳重組的分子機制課件40QPMQPM417.2.2.3.化學誘變a)干擾堿基合成的化學誘變劑6-Mercaltopurine干擾嘌呤合成SH5-AminoUracil干擾嘧啶合成OOH2N7.2.2.3.化學誘變a)干擾堿基合成的化學誘變劑42b)baseanologsleadsbasemispairing(5-BrU)BrBrb)baseanologsleadsbasemi435-BrU(k)
5-BrU(e)ReplicationBrU(k)BrU(e)ATGCreplicationerrorA/TG/CincorporationerrorG/C
A/T(來源:基礎分子生物學(第二版)(2012),鄭用璉,第313頁)5-BrU(k)5-BrU(e)44A(a)T(k)5-BrU(k)G(k)5-BrU(e)C(a)mispairingmispairingT(k)A(a)5-BrU(k)G(k)C(e)5-BrU(e)A(a)G(k)G(k)A(a)ReplicationerrorIncorporationerror5-BrU(k)5-BrU(e)A(a)T(k)5-BrU(k)G(k)5-BrU(e)C(45HNO2(NitrousacidNA)
ACGInosineCUracilAXanthineCdeamination
HNO2BasemodifyingchemicalmutagenHNO2(NitrousacidNA)AInos46
BasemodifyingchemicalmutagenNH2OH(Hydroxylamine
HA羥胺
)HNHHOC(a)HAHNHHHOHNHHOC(i)A(a)
NHHOHNHHONH
HBasemodifyingchemicalmutag47d)AlkylationagentmutagensEMS(Ethylmethanesulfonate)CH3—S—O--CH2CH3OOMMS
CH3—S—O--CH3OOSM(SulfurMustardsgas硫芥子氣)HSCH2CH2ClCH2CH2Cld)AlkylationagentmutagensE48e)Mutagen-insertion-framshiftAO(AcridineOrange)扁平分子EB(EthidiumBromide)-ATTTTTCG--TAAAAAGC--ATTTCG--TAAAGC-TAO
T-ATEBTTTTCG--TA分子插入AO
EB-ATTTCG--TAAAGC--ATX’TTTTCG--TAX
AAAAGC-XAAAAGC-e)Mutagen-insertion-framshi497.3.保證遺傳穩(wěn)定的機制
7.3.保證遺傳穩(wěn)定的機制50復制過程中的錯配修復DNA的損傷修復基因的回復突變密碼的簡并致死突變多倍體……7.3.1.復制過程中的錯配修復機制(ξ=10-11)DNAmismatch+-----A------
------C---DNApol(ξ=10-8)經(jīng)第二次校正ξ=10-11MRSMismatchRepairSystem復制過程中的錯配修復DNA的損傷修復基因的回復突變密碼的簡并517.3.1.1.MismatchrepairsystemDNApolymeraseligaseMCE(mismatchcorrectenzyme)3subunitsmutH,L,Sdamgenem6AmethylaseScanning新生鏈中錯配堿基識別新生鏈中非
m6A
的GATC序列酶切含錯配堿基的新生DNA區(qū)段7.3.1.1.Mismatchrepairsys52MCEscanningDNA中的GATC(回紋序列.m6A甲基化敏感位點
)
GATCseq./per2kb±3’
-------C----------CTAG----------CTAG----5’
5’-----------T----------GATC----------GATC----3’
3’-------------------------------------------------------
5’少
多(m6A)新生鏈MCEscanningDNA中的GATC(回紋序列.53MCEscanningendonucleasePolymeraseligaseGATC
GATCCTAG
CTAGTCGATC
GATCCTAGCTAGTGATC
GATCCTAGCTAGTAMCEscanningendonucleasePolyme547.3.1.2.ungsystem(尿嘧啶-N-糖苷酶系統(tǒng))---TAGC------ATCG------TAGC------A
CG---U---TAGC---ung-aseGCUAU---TAGC------ACG---Apurinase(內切酶)---TAGC------ADNApolligaseTCG---7.3.1.2.ungsystem(尿嘧啶-N-糖苷酶55phR471aa----TT--------AA--------TT--------AA--------TT--------AA--------TT--------AA----可見光激活U.V
Beforereplication&Error-free
400nmBluelight&phRgene(photo-reactivationenzyme)7.3.2.DNA的損傷修復7.3.2.1.photoreactivationphR471aa----TT--------TT---567.3.2.2.Exision—RepairBeforeReplicationError-freeUvrA,B,Cgene
EndonucleasesExonucleaseDNApolLigase
7.3.2.2.BeforeReplicationUvr57E.coli
存活%U.V計量w.t.UvrA+RecA+RecA+
uvra-reca-uvra-Rec-A.gene
以某種方式參與DNA損傷修復7.3.2.3.Recombinative—RepairE.coli存活%U.V計量w.t.UvrA+RecA58Rupp.Howard-FlandersTTTTAAAATTTTTTTTAAAATTTT變性
E.coli(Rec-A,uvr-6-)D.S.DNAS.S.DNAU.V.復制提取變性TTTTTTAAAAAAReplicationisforcedtoskippastTTdimergapleftinnewlystrand繼續(xù)復制Rupp.Howard-FlandersTT59E.colik12w.t.5003200uvr-a/Rec-A
850Uvr-A/rec-a
320uvr-a/rec-a
0.21.3存活率為對照37%的U.V.計量Genotype
(爾格/mm2)
TT數(shù)量/107bp存在與重組有關的暗修復機制與Rec-A基因引起的strandtransfer有關TT未被修復,僅后代群體中
TT
濃度的稀釋鏈的非準確轉移,導致突變機率的增加E.colik12w.t.60
Recombinative—Repair(strandtransferrepair)AfterreplicationrepairError-proneRecA,DNApolymeraeligasegenesbeneeded
Recombinative—RepairAfter617.3.2.4.SOSrepair(U.V.reactivationorWreactivation)JeanWeigleE.coliE.coliE.coliλ8010100mut.95%50%10%
DamagedDNAofphageberepairedinE.coliASOSrepairinE.colihavetobeinducedbyU.V.(A&B)HighfrequencymutationbySOSrepair(Error-prone)ABC7.3.2.4.SOSrepair(U.V.rea62DNAdamaged300XsignalRecAcleavesLexA
SOSUmuCmutation---Beforeinducing.LexA-p
Rec-A,UmuC…11genesNeg.repression---U.V.damageDNASignal(S.S.DNAtailor5NtS.S.DNA)機制DNAdamaged300XsignalRecAcle63β-galactosidaseasreportgene
withaUVcellswithlacoperonundercontrolofumuDCpromoter
umuDCtranscriptionisUV-inducibleβ-galactosidaseasreportgene64RecA-P;三種功能●DNA重組●與S.S.DNA結合●少數(shù)蛋白的proteinase當DNA正常復制時(無復制受阻,無DNA損傷,無TTdimer)
RecA-p不表現(xiàn)
proteinase活性!RecA-P;三種功能●DNA重組●與S.S.65當DNA復制受阻/DNAdamaged能量大量消耗細胞內原少量的RecA-p與
S.S,DNA結合激活RecA-p的proteinase活性修復損傷LexA-p降解RecA-p高效表達300timesupSOSopen當DNA復制受阻/DNAdamaged能量大量消耗細胞內66當DNA復制度過難關后SOSrepair:error-prone極強的“竭盡全力,治病救人”修復機制(正常狀態(tài)下,SOS是關閉的)RecA-p很快消失LexAgeneonSOSoff當DNA復制度過難關后SOSrepair:error-677.3.2.5.突變的形成DNA未經(jīng)修復經(jīng)過修復/校正
死亡突變率降低傾向差錯修復(間接)
(重組修復,SOS)避免差錯修復(直接)(光修復,切補修復)形成突變不形成突變DNAdamaged/mispairing物理誘變,化學誘變,自發(fā)突變突變是在修復過程中形成的(非準確的修復)7.3.2.5.突變的形成DNA未經(jīng)修復經(jīng)過修復/校正687.3.3.基因的回復突變
(backmutation/reversemutation)7.3.3.1.回復突變的概念w.t.mutant(phenotype)mutation(lowF.)backmutation(verylowF.)7.3.3.基因的回復突變7.3.3.1.回復突變697.3.3.2.回復突變的分子機制a)AGC(Ser)
ACC(Thr)
AGC(Ser)b)AGC(Ser)
AGG(Arg)
AGT(Ser)c)AGC(Ser)
AGG(Arg)
AAG(Lys)
ifSer≈Lysd)Intragenicsuppression第二位點突變引起的基因內校正密碼子間兩次錯義突變的互補7.3.3.2.回復突變的分子機制a)AGC(Ser70e.g.trp.A---UGG174----------GGA210---(w.t.)(lys)(Gly)backmutation(Cys)
(Gly)----UGG174-----------GGA210--------UGG174----------GGA210--------UGC174-----------GAA210----無活性結構CA無活性結構
(Lys)(Glu)蛋白質構型吻合酶分子具有活性高溫敏感性?!e.g.trp.A---UGG174----------71Howtodistinguishbtwbackmut.andintragenicsuppressionbygeneticassay?----UGC
174-----------GGA210--------UGG174----------GAA210--------UGC174-----------GAA210----w.t.(phenotype)Intragenicsuppression---UGG174----------GGA210---(w.t.)backmutationHowtodistinguishbtwbackmu72Intergenicsuppression—2(Su+)NonsensesuppressorIntergenicsuppression—2(Su+)73
MissensesuppressorIntergenicsuppression—2AGAUCUGlyArgGlyUCUUCUGGACCUGlyGlyMissenseIntergenicA74
Intergenicsuppresion-3(多聚體酶類構型的吻合)Subunit-1Subunit-2+ActiveformABB+InactiveformabBackmutActiveform+Intergenicsuppresion-3(多聚體酶757.4.基因重組交換的分子機制7.4.基因重組交換的767.4.1.自然界的DNA分子均是重組體
(recombinant)變異是生物進化的重要因素變異是自然選擇的重要基礎7.4.1.自然界的DNA分子均是重組體變異是生物進化的重77可遺傳的變異突變(點突變,染色體變異)頻率低,突變修復遺傳重組交換染色體的自由組合染色單體間的交換分子克隆和轉基因技術
(invitro)普遍發(fā)生自然界DNA分子均是重組體突變壓改變群體的基因頻率
Pn
=(1-P0)n可遺傳的變異突變(點突變,染色體變異)頻率低,突變修復遺傳重787.4.2.遺傳重組的類型a)HomologousRecombination
occurbtwHomo-chromosome/Homo-seq.sister&non-sisterchromatidstransformation,transductionconjugation,transfection…
largefragmentexchange
Recombinationsiteisinhotspotmostly
Recombinasebeneeded(RecA,BC)7.4.2.遺傳重組的類型a)HomologousRe79Intermolecular(singlecrossover;doublecrossover)Intramolecular(directrepeat;invertedrepeat)Intermolecular(singlecrossov807.4.3.Homologousrecombination7.4.3.1.前期的兩種假說a)Breakage—rejoining(1930Darlington)abABaBAb7.4.3.Homologousrecombinati81b)copy-choice(1931Belling)染色體的交換與復制有關!b)copy-choice(1931Belling)染82c)Breakage–rejoiningmodel的證據(jù)-1E.coligrowinginamediumofC12&N14infectedwithphageofABC
/abcABCabcC12N14ABCabc×DNA分子的交換是斷裂—錯接的過程ABcabCRareRecom.abcabcABCmostC13N15C12N14E.colic)Breakage–rejoiningmodel的83
Breakage–rejoiningmodel的證據(jù)-2E.coligrowinginamediumofC12&N14infectedwithphageofAB
/
abABC13N15abC13N15C12N14ABab×DNA分子的交換與復制是兩個不同的過程aBAbrareABabAbaBmostE.colirareBreakage–rejoiningmodel的證據(jù)847.4.3.2.同源重組的分子模式a)Illegitimatesegregation—基因轉換
(geneconversion)Neuraspora
A
xaaAAAAAaA
a
AaAAAA
a
Aa
AaAaa
A
aa
Aa
AAA
a
Aaa
A
a
AA
aaa
A
Aaa
Aaaaa
A
A
aa
Aaaaa
Aa
AA
aaaaa
A
a
AA
a5/33/52/64/4A:ameiosisaaAAaAaA7.4.3.2.同源重組的分子模式a)Illegit85Illegitimatesegregation
—
geneconversion特定基因被同源染色體上等位基因影響所發(fā)生的替代現(xiàn)象!Howdoesthealleleconversion?Illegitimatesegregation特定基因被86Drosophila(ry
黃嘌呤脫氫酶基因)afeww.t.ry41–
ryx–
(♀)×ryx–ryx–
(♂)w.t.allele非全同等位基因內Alleleconversion?回復突變!基因間互補!非全同等位基因內交換!
now.t.ryx–
ryx–
(♀)×ry41–
ry5–
(♂)Drosophila(ry黃嘌呤脫氫酶基因)afew87afeww.t.ry41–
ryx–
(♀)×ryx–ryx–
(♂)w.t.allelery41–
ryx–
(♀)×ryx–ryx–
(♂)♀×♂afeww.t.♀×♂afeww.t.非全同等位基因內Alleleconversion?回復突變!基因間互補!雌果蠅染色體交換!afeww.t.ry41–ryx–(♀)88now.t.雄果蠅染色體不發(fā)生交換!ryx–
ryx–
(♀)×ry41–
ry5–
(♂)非全同等位基因內Alleleconversionryx–
ryx–
(♀)×ry41–
ry5–
(♂)♀×♂butnow.t.
!now.t.雄果蠅染色體不發(fā)生交換!ryx–ry89afeww.t.非全同等位基因內交換!Drosophila(ry
黃嘌呤脫氫酶基因)ry41–
ryx–
(♀)×ryx–ryx–
(♂)w.t.allelenow.t.ryx–
ryx–
(♀)×ry41–
ry5–
(♂)afeww.t.非全同等位基因內交換!Drosop90
b)同源重組的基本特征
同源染色體的聯(lián)會配對(Synapsis)
DNA分子在交換位點發(fā)生斷裂和錯接
S.S.DNA-end是發(fā)生交換的重要信號RecBCD;nicksmadeinhomologousDNARecA;leadstobrokenS.S.DNA
endsmove
andcross-overtopairwithcomplementin
otherduplexb)同源重組的基本特征同源染色體的聯(lián)會配對(Syn91c)同源重組的分子模式1964.Holliday.R
HollidayIntermediateWhitehouse
PolaronHybridDNAmodelc)同源重組的分子模式1964.Holliday.R92
HollidayIntermediatestructureHollidayIntermediatestructu93Strandinvasion;D-loopformationScanforhomology.NickStrandexchange(RecA+SSB)RecBCDunwindsDNAandleaves3′–protrudingend,coatedwithRecA
de
fGC
DEFATSNP:
e(G/C)ChisiteSNP:E
(A/T)Strandinvasion;D-loopformat94Branchmigration(RuvA+RuvB)Crossoverresolution(RuvC)Noncrossoverresolution(RuvC)Repairgapsandsealnicks
(Hollidayjunction)Branchmigration(RuvA+RuvB)95Branchmigration(RuvA+RuvB)Crossoverresolution(RuvC)Noncrossoverresolution(RuvC)Repairgapsandsealnicks
(Hollidayjunction)de
fGA
DEFTCde
fGA
DE
F
CTBranchmigration(RuvA+RuvB)96Noncrossover(heteroduplex,orpatch)recombinants
Crossover(splice)recombinants
SNP:E(A/T)
e(G/C)DE
Fde
fAGTCDEFde
fAGTCAGCTDEFde
fNoncrossover(heteroduplex,or97CTATde
fde
fdE
fdE
fDeFDEFDEFDEFE5e3=DF4df4=GCAT
heteroduplexregionreplicationcorrectCAdefde98第二條染色單體內C/T的校正可能第一條染色單體內C/T校正可能C/T
A/TC/T
C/G
未校正C/T
A/TC/T
C/G未校正AAAAAACCAACCAACCAAACAACCTTTTTTGGTTGGTTGGTTTGTTGG(6:2)(4:4)(5:3)AACCCCCCAAACCCCCTTGGGGGGTTTGGGGG
(2:6)(3:5)AAACACCCTTTGTGGG(4:4)雜合DNA區(qū)域SNP的校正與遺傳異常分離第二條染色單體內C/T的校正可能第一條染色單體C/T99
交換不是發(fā)生在1bp間的斷裂—錯接事件
交換涉及兩條D.S.DNA之間的
hollidayintermediate,
branchmigration,
isomerization,resolution等一系列過程
交換位點兩端出現(xiàn)
Pt:Rt=1:1正常分離比例conclusionpalaronhybridDNAmodel交換不是發(fā)生在1bp間的斷裂—錯接事件交換涉及兩條100
交換發(fā)生在某allele內,其SNP可能因交叉移
動,而被包括在heteroduplexregion之內,
從而引起geneconversionconclusion
geneconversion的機率,隨SNP位點離交換
位點(chisite)的距離增大,而表現(xiàn)逐漸變
小的極性梯度的效應交換發(fā)生在某allele內,其SNP可能因交叉移conc101e.g.yeastArg4
(JackSzostak
1989)7multip—alleles(非全同等位基因內的SNP)NsphI,Acc-I,R-V,Bel-I,Dra-III,Aha-II,Bgl-II在雜合二倍體中,基因轉換頻率從5’
3’極性遞減NsphIAcc-IR-VBel-IDra-IIIAha-IIBgl-II9.6%7.46.23.42.81.50.45’3’Why?重組斷點e.g.yeastArg4(JackSzostak102RecB,C,DHelicase(ATPase)tounwindDNA&exonucleaseRec-b,c,dmut.Crossingovergodown100XRecBCDcomplex300kd,produce
free
S.S.DNA-endat4-6bpdownstreamChisite,helpRecAtobindS.S.DNA-end.Strandinvasionexchanged)交換相關酶類ChisiteRecB,C,DHelicase(ATPase)toun103
RecBCDrecognition
GCTGGTGGTseq.cutS.S.DNAat4-6bpdownstreamChisiteχ(c
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