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文檔簡介
第三篇基因信息的傳遞遺傳信息
DNA是遺傳的主要物質(zhì)(自我復(fù)制)*
遺傳信息:DNA分子中堿基或核苷酸的排列順序四種核苷酸:A、G、C、T
基因:編碼生物活性產(chǎn)物的DNA功能片段*概述二.遺傳信息傳遞的中心法則
CentralDogmaofgeneticinformationtransferJamesWatson(right)andFrancisCrick遺傳信息傳遞的中心法則*DNARNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA的過程。翻譯:以mRNA為模板合成蛋白質(zhì)的過程。逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA的過程。復(fù)制:DNA以自身為模板合成DNA,將親代DNA的遺傳信息傳遞給子代DNA本篇內(nèi)容DNA生物合成
RNA生物合成蛋白質(zhì)生物合成基本概念、特點(diǎn)參與的酶及蛋白質(zhì)因子基本過程
基因表達(dá)調(diào)控基因工程真核、原核20世紀(jì)70年代,生物技術(shù)
第十章DNA的生物合成
DNABIOSYNTHESIS第一節(jié)復(fù)制的基本規(guī)律復(fù)制*:DNA以自身為模板合成DNA,將親代DNA的遺傳信息傳遞給子代DNA。復(fù)制
親代DNA
子代DNA一.DNA的半保留復(fù)制
子代DNA繼承母鏈遺傳信息的幾種可能方式全保留式復(fù)制半保留式復(fù)制混合式復(fù)制
Dispersivereplicationsemi-conservativereplicationconservativereplicationsemi-conservativeDNAreplication
MatthewMeselson1958FranklinStahl半保留復(fù)制的實驗依據(jù)以15NH4Cl培養(yǎng)細(xì)菌數(shù)代14NH4Cl培養(yǎng)第一代14NH4Cl培養(yǎng)第二代M.Messelson&F.W.Stahl,1958密度梯度離心母鏈子鏈全保留半保留混合式???第一代第二代
——實驗結(jié)果支持半保留復(fù)制的設(shè)想
DNA的半保留復(fù)制*
semi-conservativereplicationAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC親代DNA
復(fù)制過程中形成的復(fù)制叉子代DNA
+
半保留復(fù)制的意義*子代DNA保留了親代DNA的全部遺傳信息,體現(xiàn)了遺傳的保守性,是物種穩(wěn)定性的分子基礎(chǔ)
遺傳的保守性并不是絕對的復(fù)制親代DNA子代DNA二.雙向復(fù)制(bidirectionalreplication)1.復(fù)制的起始點(diǎn)(1)原核生物通常只有一個originori
245bp
E.Coli4×106bpE.coli雙向復(fù)制5’3’oriorioriori5’3’5’5’3’3’5’5’3’復(fù)制子3’(2)真核生物每個染色體有多個ori復(fù)制子(replicon)兩個復(fù)制起始點(diǎn)之間的DNA片段
是獨(dú)立完成復(fù)制的功能單位。
2.復(fù)制的方向DNA新鏈的合成具有方向性:5’—3’DNA復(fù)制時不能自行從頭合成DNA鏈,需要引物。復(fù)制叉DirectionofmovementofreplicationforkDNA雙鏈分成兩股,各自作為模板,子鏈沿模板延長所形成的Y型結(jié)構(gòu)三.DNA的半不連續(xù)復(fù)制
semi-discontinuousreplication*復(fù)制的半不連續(xù)性*:
DNA雙鏈反向互補(bǔ),解鏈后,復(fù)制叉上兩條單鏈的走向也相反,在復(fù)制時,一條新鏈連續(xù)合成,另一條新鏈不連續(xù)合成。5’3’3’3’5’3’5’OkazakifragmentLaggingstrandLeadingstrand5’領(lǐng)頭鏈(leadingstrand)連續(xù)合成,方向與復(fù)制叉一致不連續(xù)合成,方向與復(fù)制叉相反隨從鏈(laggingstrand)岡崎片段(Okazakifragment)
原核細(xì)胞—1000-2000bp真核細(xì)胞—100-200bp一.DNA復(fù)制特點(diǎn):(1)高效率細(xì)菌500核苷酸/秒哺乳動物50核苷酸/秒(2)高度忠實多種酶參與DNA復(fù)制第二節(jié)DNA復(fù)制的酶學(xué)和拓?fù)鋵W(xué)變化
(一)DNA聚合酶*
1.作用:以親代DNA的一條鏈為模板,按堿基互補(bǔ)配對原則,催化單個脫氧核苷酸合成新的
DNA鏈。又稱DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶(DDDP)DNAdirectedDNApolymerase脫氧核糖核苷酸二.參與DNA復(fù)制的酶類簡稱:DNA-pol
2.DDDP特點(diǎn)*:1)DNA鏈的合成具有方向性;5’3’2)DDDP合成DNA需要引物;(RNA)
多核苷酸鏈3)有的DNA聚合酶有校對活性,保持DNA復(fù)制過程中的高效性和保真性。3’3’5’5’3.DNA聚合酶種類DNA-pol(DNA損傷修復(fù))
DNA-polⅠ(引物切除與修復(fù))DNA-polⅡ(DNA損傷修復(fù))DNA-pol
Ⅲ(DNA復(fù)制)原核生物真核生物DNA-pol(合成引物)DNA-pol(DNA損傷修復(fù))DNA-pol(線粒體內(nèi))DNA-pol
(新DNA鏈的延長)活性*:1)5
3
的聚合活性2)3’5’外切酶活性3)5
3
外切酶活性4.DNA聚合酶的活性核酸外切酶:從核酸鏈的末端把核苷酸依次水解出來的酶,有方向性。
1)5
3
的聚合活性dNTPDNApolPrimerDNAtemplate作用1:形成3’,5’-磷酸二酯鍵,使DNA鏈沿5’→3’方向延伸DNA聚合酶活性
2)3
5
外切酶活性5′
AGCTTCAGGAT
3′
|||||||||||3′TCGAAGTCCTAGCGAC5′?AC作用2:辨認(rèn)并水解3’末端錯誤堿基,具有校對功能保證DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性(profreading)
作用3:去除錯誤堿基在DNA損傷修復(fù)中起作用3)5
3
外切酶活性5′
GCUUCAGGATCGC
3′|||||||||||
|
|3′TCGAAGTCCTAGCGAC5′C|
功能:原核DNA-polI(109kD)對復(fù)制中的錯誤進(jìn)行校讀對復(fù)制和修復(fù)中出現(xiàn)的空隙進(jìn)行填補(bǔ)。二級結(jié)構(gòu)-α螺旋
原核DNA-polII
DNA-polII基因發(fā)生突變,細(xì)菌依然能存活功能:在沒有polI和polIII時起作用,可能與
DNA損傷修復(fù)有關(guān)活性:5
3
聚合活性
3
5
外切酶活性
原核DNA-polIII5’→3’聚合酶活性3’→5’外切酶活性參與大腸桿菌DNA復(fù)制的最主要的DNA聚合酶*
真核生物的DNA聚合酶DNA-pol
起始引發(fā),有引物酶活性DNA-pol
參與低保真度的復(fù)制DNA-pol
在線粒體DNA復(fù)制中起催化作用DNA-pol
DNA合成,有解螺旋酶活性DNA-pol
校讀、修復(fù)和填補(bǔ)缺口(二)引物酶定義:催化RNA引物合成的酶。
DNA聚合酶不能自行從頭以2個游離的單脫氧核苷酸為起點(diǎn)合成DNA鏈,需合成一小段多核苷酸為引物,主要為DNA鏈合成提供自由3`-OH末端。作用:以復(fù)制起始部位的DNA鏈為模板,按堿基互補(bǔ)配對的原則合成引物RNA。特殊的RNA聚合酶*引物長度:10至幾十個核苷酸(三)參與DNA解旋、解鏈的酶及蛋白因子
DNA一級結(jié)構(gòu):脫氧核苷酸排列順序DNA二級結(jié)構(gòu):雙螺旋DNA三級結(jié)構(gòu):超螺旋DNA拓樸異構(gòu)酶解鏈酶DNA結(jié)合蛋白DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNAtopoisomerase)拓?fù)涞暮x:幾何學(xué)名詞,指物體或圖像做彈性變形(如環(huán)形橡皮筋放大、縮小、扭曲),而構(gòu)成它的各點(diǎn)(或組分)間的相連關(guān)系沒有改變。定義:能催化DNA拓?fù)洚悩?gòu)體互變的一類酶分類:拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ功能:既能水解、又能連接磷酸二酯鍵拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ切斷DNA雙鏈中一股鏈?zhǔn)笵NA超螺旋松弛反應(yīng)不需ATP拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ切斷環(huán)狀DNA分子兩股鏈?zhǔn)笵NA超螺旋松弛;也可利用ATP穩(wěn)定負(fù)超螺旋;環(huán)連和解環(huán)連;打結(jié)和解結(jié)作用機(jī)制
松弛DNA超螺旋
2.DNA解鏈酶(DNAhelicase)功能:解開DNA雙鏈,需要
ATP供能沿復(fù)制叉行進(jìn)方向解鏈種類多
E.coli解鏈酶Ⅱ、Ⅲ
E.coli
Rep蛋白HelicaseII,IIIRepprotein5’3’3’5’3’5’3.單鏈結(jié)合蛋白
(singlestrandbindingprotein,SSB)DNA結(jié)合蛋白(DNAbindingprotein,DBP)功能:維持模板的單鏈狀態(tài)保護(hù)新合成的單鏈,使其免受核酸酶水解
作用:將一個DNA片段的3’-OH末端與另一個DNA片段的5’-P末端連接,形成磷酸二酯鍵
*。
DNA復(fù)制過程中,有一條鏈的合成是不連續(xù)的,先合成許多短鏈的DNA片段,然后再由DNA連接酶將這些片段連接成完整的DNA長鏈。P-OHP-OHDNA連接酶(四)DNA連接酶第三節(jié)DNA生物合成過程*
復(fù)制的起始和引物RNA的合成
復(fù)制的延長
復(fù)制的終止(一)
復(fù)制起始:DNA解鏈形成引發(fā)體一.原核生物的DNA生物合成從復(fù)制起始點(diǎn)oriC
開始o(jì)ri
245bpE.coliE.coli“oriC”region(~245bp)識別區(qū)
AT區(qū)9-Basepairsrepeat13-BasepairsrepeatDnaADNA解旋、解鏈,復(fù)制叉形成DnaA:同四聚體,辨認(rèn)并結(jié)合于AT區(qū)DnaC:協(xié)作DnaBDnaB:解旋酶,解開DNA雙鏈SSB:維持模板的單鏈狀態(tài)拓?fù)洚悩?gòu)酶DnaA解旋酶拓?fù)洚悩?gòu)酶引發(fā)體(primosome)
DnaA
DnaB、DnaCDNA拓?fù)洚悩?gòu)酶引物酶SSB5
3
5
3
DnaGDnaA、B、C、引物酶及其它復(fù)制因子形成的復(fù)合體,參與復(fù)制起始模板
親代DNA的兩條鏈(二)復(fù)制的延長*原料
dNTP(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)合成方向5’→3’(指新鏈的延伸方向)酶:DNA聚合酶
(polymerase)其它的酶和蛋白質(zhì)因子
復(fù)制叉移動方向領(lǐng)頭鏈隨從鏈3’5’3’5’拓樸異構(gòu)酶解鏈酶DNA結(jié)合蛋白DNA聚合酶III引物酶復(fù)制過程動畫(三)DNA復(fù)制的終止
原核生物基因是環(huán)狀DNA,雙向復(fù)制的復(fù)制片段在復(fù)制的終止區(qū)(ter)處匯合teroriter終止區(qū):terminationregion,ter
DNA片段合成至一定長度后,鏈中的RNA引物即被核酸酶水解而切斷。此時出現(xiàn)的缺口由DNA片段的繼續(xù)延長而填補(bǔ)。
3’5’3’5’3’5’核酸酶核酸酶切除引物
DNA片段5’端引物切除,缺口由DNApol
填補(bǔ),相鄰的片段由連接酶連接
RNA酶pol連接酶5’5’5’5’5’5’5’5’填補(bǔ)空缺,連接切口隨從鏈:相鄰岡崎片段連接,形成大分子DNA,
再與模板鏈形成雙螺旋DNA分子。完整DNA分子的形成前導(dǎo)鏈:也與相應(yīng)的模板鏈形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。真核細(xì)胞和原核細(xì)胞的DNA復(fù)制方式基本相似,但有關(guān)的酶和一些復(fù)制細(xì)節(jié)有些區(qū)別。十分精確,保證了遺傳的穩(wěn)定性。二.真核生物的DNA生物合成G1期:DNA復(fù)制準(zhǔn)備S期:DNA復(fù)制*G2期:細(xì)胞分裂準(zhǔn)備M期:細(xì)胞分裂
1.DNA復(fù)制與細(xì)胞周期的關(guān)系
DNA合成期
真核生物DNA復(fù)制與細(xì)胞周期哺乳動物的細(xì)胞周期DNA復(fù)制只發(fā)生在S期*每個細(xì)胞周期只進(jìn)行一次DNA復(fù)制特點(diǎn):24hG1最長M期最短2.復(fù)制的過程真核生物復(fù)制起始點(diǎn)多自主復(fù)制序列(ARS,autonomousreplicationsequence)類似于原核的富含AT區(qū)復(fù)制的起始DNA-pol
:引物酶DNA-pol
:解旋酶拓?fù)涿笍?fù)制因子(replicationfactor,RF)增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)參與因子復(fù)制的延長DNA-pol
:合成引物DNA-pol
:鏈的延長復(fù)制終止和端粒酶復(fù)制與核小體裝配同步進(jìn)行真核生物染色體DNA線性復(fù)制,5’端第一片段的空隙如何填補(bǔ)?5’5’?端粒(telomere)又稱端區(qū)真核生物染色體的末端結(jié)構(gòu),呈膨大粒狀由染色體末端DNA與蛋白質(zhì)組成末端DNA序列富含T、G重復(fù)序列功能維持染色體的穩(wěn)定性維持DNA復(fù)制的完整性組成:
RNA+蛋白質(zhì)端粒酶(Telomerase)作用:反轉(zhuǎn)錄酶,以RNA為模板,合成端粒DNA片段20世紀(jì)80年代中期發(fā)現(xiàn)(Human)原核真核復(fù)制速度快慢起始點(diǎn)1個多個引物幾十nt10nt岡崎片段1000~2000nt100~200nt主要復(fù)制酶PolI,III
Pol
,
真核與原核生物DNA復(fù)制的比較第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄和其它復(fù)制方式大多數(shù)生物的遺傳物質(zhì)是雙鏈DNA
某些病毒的遺傳物質(zhì)是RNAM13含單鏈DNA
染色體外DNA
(原核質(zhì)粒、真核線粒體DNA)一.逆轉(zhuǎn)錄和逆轉(zhuǎn)錄酶某些病毒的遺傳物質(zhì)是RNAsarsvirusHIV
HIV(人類免疫缺陷病毒)一種逆轉(zhuǎn)錄病毒
感染人的T淋巴細(xì)胞人體免疫缺陷廣泛感染逆轉(zhuǎn)錄酶:以RNA為模板催化DNA合成的酶又稱RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶(RDDP)逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA的過程反轉(zhuǎn)錄酶活性RNA酶活性DNA聚合酶活性逆轉(zhuǎn)錄酶(以RNA為模板合成DNA)(水解RNA模板)(合成第二條DNA鏈)H.TeminD.Baltimore19701975年諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎*逆轉(zhuǎn)錄病毒的致癌機(jī)理+病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄酶
RNA-DNA
雜交體RNA單鏈DNA
DNA聚合酶雙鏈DNA整合入宿主細(xì)胞DNA致癌逆轉(zhuǎn)錄酶RNaseRDDP二.逆轉(zhuǎn)錄研究的意義(一)中心法則的補(bǔ)充DNARNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制逆轉(zhuǎn)錄(二)RNA的重要性逆轉(zhuǎn)錄、核酶(三)逆轉(zhuǎn)錄病毒致病機(jī)理(四)分子生物學(xué)技術(shù)(RT-PCR)三.滾環(huán)復(fù)制和D環(huán)復(fù)制滾環(huán)復(fù)制(低等生物,不需引物)+
X174A蛋白5’3’D環(huán)復(fù)制線粒體DNA(mtDNA)DNA-pol
+ori1ori2第五節(jié)DNA的損傷與修復(fù)DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性,保證了遺傳的穩(wěn)定性自發(fā)突變:10-10生物體變異物種進(jìn)化
DNAmutation:DNA
分子中個別核苷酸或小片段的異常變化,普遍存在。一.突變(mutation)的意義(一)突變是進(jìn)化、分化的分子基礎(chǔ)(二)基因的多態(tài)性polymophism(三)致死性的突變(四)突變是某些疾病的發(fā)病基礎(chǔ)相同物種個體之間的基因型差別親子鑒定、器官移植配型消滅有害病原體
二.引起突變的因素自身因素:自發(fā)突變
環(huán)境因素:電離輻射、紫外線、化學(xué)誘變劑、致癌病毒
1.點(diǎn)突變,錯配(編碼AA的改變)2.缺失;插入(導(dǎo)致框移突變)
3.重組或重排(rearrangement)
DNA分子較大片段的交換三.突變類型*移碼突變
鐮刀型紅細(xì)胞貧血(纈AA)1.點(diǎn)突變
(pointmutation)
GAACTTCATGTAHbA基因肽鏈N-Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu---C1234567…..HbSN-Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu---C1234567……
正常成人紅細(xì)胞(谷AA)()
正常紅細(xì)胞鐮刀型紅細(xì)胞
2.缺失移碼突變……GCA
GUA
CAU
GUC……
丙
纈
組
纈
C……G
AG
UAC
AUG
UC…..
谷
酪
蛋
絲Deletionframeshiftmutation四.DNA損傷的修復(fù)*DNA損傷修復(fù)是體內(nèi)的生
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