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22DetectionofClonorchissinensiseggsinhumanfeces-PCRandrealtimePCRI 5.2材料 2 2 2 3 3 3 4 4 5 6 7本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定本文件主要起草人:馬文晨、孟慶峰、趙大力、王瑋琳、劉金華、孟日增、王偉1人糞便中華支睪吸蟲蟲卵檢測PCR和實時熒光PCR法GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗4縮略語CTAB:十六烷基三甲基溴化銨(cetyltrithyDNA:脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacidNTP:脫氧核苷酸三磷酸(deoxyriboEDTA:乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraaceticaFAM:6-羧基熒光素(6-carboxyfluorescTE緩沖液:Tris-HCl、EDTA緩沖液(Tris-EMGB:小溝結(jié)合物(minorgroovebinder)5.1.1除另有規(guī)定外,試劑為分析純或生化試劑。25.1.10異丙醇。5.1.13加樣緩沖液。5.1.14GoldenView核5.1.15PremixTaq反應(yīng)預(yù)混5.1.16PremixExTaq(ProbeqPCR2×)反應(yīng)預(yù)混液(市售商品化熒光PCR基礎(chǔ)試劑)。5.1.17瓊脂糖凝膠。5.35.3.1無DNA酶污染的離心5’-TTGTCTGGGTAGGGTGGTTTG-3’5’-ACTATCCCAGTAACCCCGCC-3’5’-TATAGTTTGTCTGGGTAGGGTGGTT-3’5’-AACAGCAGTCCCCAAATCCA-3’5’-FAM-AGCTCATCATATGTTTACTG-MGB-3’36.5生物安全柜。6.7核酸蛋白分析儀或紫外分光6.9研缽或冷凍粉碎裝置。6.12高壓滅菌器。8.4加2倍體積CTAB沉淀液(0.5%),室溫靜止60m8.5加入350μLNaCl溶液將沉淀重懸浮。再加入350μL三氯甲烷,旋渦振蕩進(jìn)行混勻,8.9可使用等效的商品化DNA提取試劑盒,按操作說明書進(jìn)行操作。4N——核酸稀釋倍數(shù)。作陽性對照,用不含目標(biāo)基因的核酸做陰性對照,用水做空用量(μL)(含PCR緩沖液、dNTP、Mg2+、Tap酶)分子量作對照,使用100bpDNA分子量標(biāo)準(zhǔn)。5V/cm恒壓電泳3卵核酸陰性,表述為“未檢出華支睪吸蟲蟲卵核酸”;如被檢樣品有條帶,大小為231bp,即判定為華支睪吸蟲蟲卵核酸陽性,表述為“檢出華支睪吸蟲蟲10.1.4.2必要時取PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列測定,測序結(jié)果與附錄B華支睪吸蟲蟲卵的D5作陽性對照,用不含目標(biāo)基因的核酸做陰性對照,用水做空用量(μL)PremixExTaq(ProbeqPCR2×)(含PCR緩沖液、dNTP、Mg2+、Ta),線,判定為華支睪吸蟲蟲卵核酸陽性,否則判定為華支睪吸蟲蟲卵6試劑配制A.6蛋白酶K溶液(20mg/mL稱量A.7NaCl溶液(1.2mol/L稱取8kPa蒸汽壓(121℃)條件下滅菌20min,室溫保存。A.11加樣緩沖液:稱取0.88gNa2EDTA?7B.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列(231bp,GenBankNo.:OM81033TTGTCTGGGTAGGGTGGTTTGAGCTCATCATATGTTTACTGTTGGGCTGGATTTGGGGACTGCTGTTTTTTTTAGCTCGGTATGATTATAGGTGTGCCTACAGGGATCAAGGT
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