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文檔簡介
ICS65.020.20
B16
備案號(hào):60524-2018DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T3487—2018
黃瓜綠斑駁花葉病毒苗期檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
TechnicalSpecificationfortheSeedlingDetectionofCucumberGreenMottle
MosaicVirus
2018-11-09發(fā)布2018-11-30實(shí)施
江蘇省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布
DB32/T3487—2018
黃瓜綠斑駁花葉病毒苗期檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了苗床期瓜苗黃瓜綠斑駁花葉病毒的檢測(cè)條件、檢測(cè)技術(shù)、結(jié)果判定和結(jié)果記載。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于苗床期癥狀尚未表現(xiàn)的瓜類作物上黃瓜綠斑駁花葉病毒的檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的的修改單)適用于本文件。
GB/T35335黃瓜綠斑駁花葉病毒病監(jiān)測(cè)規(guī)范
SN/T2964植物病毒檢測(cè)規(guī)范
3檢測(cè)條件
3.1主要試劑
磷酸氫二鈉(Na2HPO4)、磷酸二氫鉀(KH2PO4)、氯化鉀(KCl)、氫氧化鈉(NaOH)、碳酸氫二
鈉(Na2HCO3)、氯化鈉(NaCl)、疊氮化鈉(NaN3)、PVP-400、雞卵清蛋白、無水亞硫酸鈉(Na2SO3)、
吐溫-20、焦碳酸二乙酯(DEPC)、溴百里酚藍(lán)、乙二醇、Tris堿、Tris-HCl、硼酸、EDTA、無水乙醇、
瓊脂糖、DIGDNALabelingKit、CGMMV抗體。PCR試劑和檢測(cè)過程中所需溶液配方,參見附錄A。
除另有規(guī)定外,所用試劑均為分析純或生化試劑。
3.2用具及儀器
用具耗材:移液器、一次性手套、牛皮紙袋、標(biāo)簽紙、記號(hào)筆等
儀器設(shè)備:高壓滅菌鍋、培養(yǎng)箱、高速冷凍離心機(jī)(規(guī)格:-6℃~20℃、最高轉(zhuǎn)速12000轉(zhuǎn)/分以上)、
電泳儀(規(guī)格:電壓50~120V、電流10~800mA)、PCR儀、凝膠成像系統(tǒng)、超純水儀。
4檢測(cè)技術(shù)
4.1采樣方法
4.1.1采樣時(shí)間
待檢材料為嫁接或未嫁接的黃瓜、西瓜、甜瓜、南瓜等瓜類作物幼苗,采樣時(shí)間為出廠定植前3
天~7天植株處于2片~4片真葉期。
4.1.2采樣部位
植株最上部半展開-展開的心葉,心葉未達(dá)要求時(shí)取位于心葉下部一張完全展開葉。
4.1.3取樣方法
五點(diǎn)法取樣,一株為一個(gè)樣本,不同品種或同一品種不同時(shí)間播種的為不同批次,每批次樣本數(shù)量
不小于200株或同批次苗的0.1%。樣本采集時(shí)使用一次性手套單株采集并臨時(shí)保存在一次性手套中。
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4.1.4樣品處置
取樣后葉片一分為二,一半為檢測(cè)樣品、一半為留存樣品。樣品用吸水紙包裹置于透氣牛皮紙袋中,
新鮮檢測(cè)樣品在4℃下臨時(shí)保存3天內(nèi)檢測(cè)完畢,如不能在3天內(nèi)檢測(cè)則將樣品于-20℃的條件下冰凍
保存。留存樣品室溫下蔭干-20℃的條件下冰凍保存一年后,確認(rèn)不再需要時(shí)焚燒或深埋處置。
4.2檢測(cè)方法
4.2.1樣品處理
稱取0.1g待檢樣品葉片,加入適量液氮充分研磨成粉末后加入10倍體積的通用樣品處理緩沖液(見
附錄A)溶解,10000轉(zhuǎn)/分離心5分鐘,上清即為樣品提取液。同一批樣品中加入具典型斑駁花葉癥狀
并經(jīng)PCR法鑒定確認(rèn)為CGMMV的病樣稀釋1000倍為陽性對(duì)照、經(jīng)PCR法確認(rèn)無CGMMV的健康
葉片為陰性對(duì)照。
4.2.2免疫捕獲
4.2.2.1用碳酸鹽包被緩沖液(見附錄A)稀釋黃瓜綠斑駁花葉病毒的抗血清500倍,取稀釋后的抗血
清30μL包被PCR管,4℃孵育過夜或37℃下放置2h。
4.2.2.2棄包被緩沖液,用洗滌緩沖液(見附錄A)洗滌3次~4次,加入50μL樣品提取液,37℃孵育
2h。
4.2.2.3棄樣品提取液,用洗滌緩沖液洗滌3次~4次,再用無菌去離子水洗一次,吸盡管底余液后直接
在包被了病毒的PCR管中進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。
4.2.3反轉(zhuǎn)錄
4.2.3.1CGMMV特異性引物的設(shè)計(jì)及合成根據(jù)CGMMV分離物(Genbank序列號(hào)DQ217778)序列
設(shè)計(jì)一對(duì)用于擴(kuò)增CGMMV-cp基因的特異性引物:F:5′-ATGGCTTACAATCCGATCAC-3′;R:5′-
TGGGCCCCTACCCGGGGAAAAG-3′,-20℃保存。
4.2.3.2反轉(zhuǎn)錄體系及操作在免疫捕獲后的CR管中加入CGMMV3’端引物1μL,DEPC水9μL,
65℃變性5min,取出置于冰上5min,再依次加入下列試劑:5×M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶緩沖液2μL,40
mmol/LdNTPs(每種10mmol/L)0.5μL,RNasin(40U/μL)0.5μL,M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶(20U/μL)
0.5μL,42℃水浴1h,70℃滅活10min,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
管,參照NY/T2288-2012中7.4的要求進(jìn)行,并略有改進(jìn)。
具體操作參見附錄B。
4.2.4PCR
以反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA第一條鏈為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增反應(yīng)體系25μL。
25μLPCR標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系:10×TaqPCRBuffer(WithMg2+)2.5μL,40mmol/LdNTPs(每種10
mmol/L)0.5μL,TaqDNAPolymerase(5u/ul)0.5μL,CGMMV上游引物(10μmol/L)0.5μL,CGMMV
下游引物(10μmol/L)0.5μL,cDNA3μL和DEPC水17.5μL。
PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5min;94℃變性50s,53℃退火50s,72℃延伸1min,循環(huán)30次;
72℃延伸10min。
上述PCR結(jié)束后,每個(gè)PCR管中取出1μL加入新PCR管中,采用同樣的25μLPCR標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體
系和PCR反應(yīng)程序再次進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
5結(jié)果判定
7.1電泳檢測(cè)
配制1%瓊脂糖凝膠,將PCR產(chǎn)物3μL與上樣緩沖液3μL混合加入樣品孔中,100V電泳30分鐘。
核酸染料染色15min,凝膠成像系統(tǒng)拍照觀察。
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7.2結(jié)果判定
觀察瓊脂糖凝膠電泳(參見附錄B)結(jié)果,陽性對(duì)照在660bp處有條帶出現(xiàn),且陰性對(duì)照無條帶
出現(xiàn)的前提下,待測(cè)樣品在660bp處有條帶出現(xiàn),即可判定樣品攜帶CGMMV;否則為陰性反應(yīng),即
樣品不攜帶CGMMV。
當(dāng)樣品檢測(cè)為陽性時(shí),按GB/T35335規(guī)定執(zhí)行。
8結(jié)果記載
將實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)鑒定結(jié)果記載于表1(瓜苗攜帶黃瓜綠斑駁花葉病毒檢測(cè)結(jié)果記錄表)(見附錄B),
記錄保存1年以上。
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附錄A
(資料性附錄)
試劑及配制方法
A.1免疫捕獲緩沖液
A.1.1洗滌緩沖液(WashBuffer,0.01MPBST)
稱取8gNaCl、0.2gKCl、0.2gKH2PO4、3gNa2HPO4溶化于800mL無菌去離子水中,再加入
0.5mLTween-20定溶于1000mL,即為0.01MPBST,4℃保存。
A.1.2通用樣品處理緩沖液(GeneralExtractBuffer)
稱取2g雞卵清蛋白,1.3g無水亞硫酸鈉,20gPVP-400和0.2g疊氮化鈉,加入1000mLA.1.1
所述0.01MPBST中,再加入10mLTween-20,4℃保存。
A.1.3碳酸鹽包被緩沖液(Coatingbuffer,0.5M)
稱取1.59g無水Na2CO3和2.93gNaHCO3,加水定容至1000mL,用HCl調(diào)節(jié)pH值至9.6,4℃保存。
A.2RT-PCR試劑
A.2.1RT-PCR分子試劑
TaqDNA聚合酶、dNTP、購自大連寶生物公司。反轉(zhuǎn)錄酶M-MLV、RNA酶抑制劑購自Promega
公司,-70℃保存。
A.2.2電泳緩沖液TBE
在1000mL去離子水中加入Tris堿54g、硼酸27.5g、20mL0.5MEDTA(pH8.0),使用時(shí)利用去
離子水10倍稀釋,即為0.5×TBE。
A.2.3瓊脂糖凝膠
在0.5×TBE工作液中加入1%(w/v)的瓊脂糖,融化,冷卻至60℃倒入插入梳子的制膠槽中,冷卻
凝固后點(diǎn)樣電泳。
A.2.4上樣緩沖液
取溴百里酚藍(lán)0.025g,乙二醇3g,加10mL蒸餾水。
4
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附錄B
(資料性附錄)
檢測(cè)結(jié)果記載表
表1瓜苗攜帶黃瓜綠斑駁花葉病毒檢測(cè)結(jié)果記錄表
第一次PCR結(jié)果第二次PCR結(jié)果
樣品采集樣品采集樣品種類測(cè)定樣品
陽性樣品陰性樣品帶毒株率陽性樣品陰性樣品帶毒株率鑒定技術(shù)負(fù)責(zé)人
日期地點(diǎn)與名稱數(shù)量(株)
數(shù)(株)數(shù)(株)(%)數(shù)(株)數(shù)(株)(%)
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