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文檔簡介
第十二章
蛋白質(zhì)的生物合成(翻譯)
ProteinBiosynthesis,Translation
第一節(jié)蛋白質(zhì)生物合成體系第二節(jié)蛋白質(zhì)生物合成過程第三節(jié)蛋白質(zhì)合成后加工和輸送第四節(jié)蛋白質(zhì)生物合成的干擾和抑制翻譯的模板:DNA----原始模板
RNA----直接模板
翻譯的場所:核蛋白體(細(xì)胞質(zhì))
翻譯過程分為起始、延長、終止三個階段。概述
翻譯(translation):即蛋白質(zhì)的生物合成,就是將核酸中由4種核苷酸序列編碼的遺傳信息,通過遺傳密碼破譯的方式解讀為蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)中20種氨基酸的排列順序。簡言之,就是生物體以mRNA為模板合成蛋白質(zhì)的過程。
第一節(jié)蛋白質(zhì)生物合成體系
原料:氨基酸
其它物質(zhì):三種RNA(mRNA、tRNA、rRNA)
各種酶和蛋白質(zhì)因子
ATP和GTP、無機(jī)離子等遺傳學(xué)將編碼一個多肽的遺傳單位稱為順反子(cistron)。原核細(xì)胞中數(shù)個結(jié)構(gòu)基因常串聯(lián)為一個轉(zhuǎn)錄單位,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA可編碼幾種功能相關(guān)的蛋白質(zhì),為多順反子(polycistron)
。真核mRNA只編碼一種蛋白質(zhì),為單順反子(singlecistron)
。
一、翻譯模板mRNA及遺傳密碼
mRNA是遺傳信息的攜帶者mRNA上存在遺傳密碼mRNA分子上從5
至3
方向,由AUG開始,每3個核苷酸為一組,決定肽鏈上某一個氨基酸或蛋白質(zhì)合成的起始、終止信號,稱為三聯(lián)體密碼(tripletcoden)。起始密碼(initiationcoden):AUG
終止密碼(terminationcoden):UAA,UAG,UGA
共64個,其中61個為有意義密碼。第三個字母UCAG開放讀碼框:從mRNA5’端起始密碼子AUG到3’端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開放讀碼框(openreadingframe,ORF)。遺傳密碼的特點:
(一)連續(xù)性(commaless)
編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間既無間斷也無交叉,如mRNA鏈上的堿基發(fā)生插入或缺失,可造成框移突變。
(二)簡并性(degenecy)
遺傳密碼的簡并性是指一種氨基酸有2個或2個以上的密碼子為之編碼的現(xiàn)象。
(三)通用性(universal)
(四)擺動性(wobble)(圖)
密碼子與反密碼子配對出現(xiàn)不嚴(yán)格遵守常見的堿基配對規(guī)律的情況,稱為擺動配對(表12-2)原核生物真核生物核蛋白體小亞基大亞基核蛋白體小亞基大亞基S值70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白質(zhì)rpS21種rpL36種rpS33種rpL49種
原核、真核核蛋白體的組成
三、tRNA與氨基酸的活化
(一)氨基酰-tRNA合成酶
tRNA的3’末端-CCA-OH是氨基酸的結(jié)合位點,tRNA的功能是轉(zhuǎn)運氨基酸。
1.tRNA攜帶氨基酸的反應(yīng)如下:(氨基酸的活化)
此反應(yīng)可分為兩步完成:
氨基酸+ATP-E→氨基酰-AMP-E+PPi
氨基酰-AMP-E+tRNA→氨基酰-tRNA+AMP+E氨基酸+tRNA氨基酰-tRNA氨基酰-tRNA合成酶ATPAMP+PPi
2.氨基酰-tRNA合成酶的作用特點
a.對aa、tRNA兩種底物有高度特異性;
b.有校正活性,當(dāng)發(fā)生錯配時,可以水解酯鍵,再重新與正確的底物結(jié)合。
3.氨基酰-tRNA的書寫
(1)氨基酰-tRNA完整的寫法是:
ala-tRNAala;met-tRNAemet;fmet-tRNAfmet等。
(2)各種氨基酰-tRNA的生成反應(yīng)如下:
gly+tRNAgly+ATP→gly-tRNAgly+AMP+PPi
met+tRNAemet+ATP→met-tRNAemet+AMP+PPi
(二)起始肽鏈合成的氨基酰-tRNA
密碼子AUG為甲硫氨酸(Met)編碼,同時作為起始密碼。
與甲硫氨酸結(jié)合的tRNA,在真核生物中至少有兩種:tRNAimet和tRNAemet;原核生物的起始密碼只能辨認(rèn)甲?;募琢虬彼幔碞-甲酰甲硫氨酸(fMet)。第二節(jié)蛋白質(zhì)生物合成過程
翻譯過程分為起始、延長和終止三個階段。
一、肽鏈合成起始
肽鏈合成起始階段,是指mRNA和起始氨基酰-tRNA分別與核蛋白體結(jié)合而形成翻譯起始復(fù)合物的過程。需要起始因子(IF或eIF)和ATP、GTP參與。
翻譯的起始是mRNA能忠實翻譯的關(guān)鍵步驟,也是調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)合成的部位。(一)原核翻譯起始復(fù)合物形成
(圖12-3)
1.蛋白體大、小亞基分離。
2.mRNA在小亞基定位結(jié)合;
S-D序列:又稱核蛋白體結(jié)合位點(ribosomalbindingsite,RBS),是mRNA起始密碼上游的一段富含嘌呤核苷酸的序列,該序列以…AGGA…為核心。(圖12-2)
3.起始氨基酰-tRNA在小亞基上就位;
4.核蛋白體大亞基結(jié)合。(二)真核生物翻譯起始復(fù)合物形成
1.核蛋白質(zhì)體大小亞基的分離;
2.起始氨基酰-tRNA結(jié)合;
3.mRNA在核蛋白質(zhì)體小亞基的準(zhǔn)確定;(圖12-4A)
4.核蛋白質(zhì)體大亞基結(jié)合。(圖12-4)
eIF2是真核肽鏈合成調(diào)節(jié)的關(guān)鍵成分。二、肽鏈的延長
肽鏈合成的延長是根據(jù)mRNA密碼序列的指導(dǎo),依次添加氨基酸從N端向C端延伸肽鏈,直到合成終止的過程。由于肽鏈延長在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,又稱核蛋白體循環(huán)(ribosomalcycle),每次核蛋白體循環(huán)肽鏈增加一個氨基酸。
需要延長因子、各種酶和GTP參與。
原核生物延長因子:EF-T(EF-Tu、EF-Ts)
EF-G
真核生物延長因子:EF-1、EF-2
翻譯延長因子核蛋白體循環(huán)分三個步驟:
1.進(jìn)位(entrance)
2.成肽(peptidebondformation)
3.轉(zhuǎn)位(translocation)
核蛋白體閱讀mRNA密碼子的方向是5’→3’,肽鏈合成從N→C端進(jìn)行的。需EF-T參與。成肽反應(yīng)在A位上進(jìn)行。(三)轉(zhuǎn)位
延長因子EF-G有轉(zhuǎn)位酶活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3’側(cè)移動。程三、肽鏈合成的終止
當(dāng)核蛋白體A出現(xiàn)mRNA的終止密碼后,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽酰-tRNA中釋出,mRNA、核蛋白體大、小亞基等分離,這些過程稱為肽鏈合成終止(termination)。
需要釋放因子(RF)的參與。
原核生物RF:RF-1、RF-2、RF-3
真核生物RF:eRF
釋放因子的功能:
1.識別終止密碼,如RF-1特異識別UAA、UAG;而RF-2可識別UAA、UGA。
2.誘導(dǎo)轉(zhuǎn)肽酶改變?yōu)轷ッ富钚?,相?dāng)于催化肽?;D(zhuǎn)移到水分子-OH上,使肽鏈從核蛋白體上釋放。IFRF1RF2RF3GTPGDP+Pi第三節(jié)蛋白質(zhì)合成后加工和輸送
一、多肽鏈折疊為天然功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)
二、一級結(jié)構(gòu)的修飾
三、空間結(jié)構(gòu)的修飾
四、蛋白質(zhì)合成后的靶向輸送一、多肽鏈折疊為天然功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)
幾種有促進(jìn)蛋白折疊功能的大分子:
1、分子伴侶(molecularchaperon)
2、蛋白二硫鍵異構(gòu)酶(proteindisulfideisomerase,PDI)
3、肽-脯氨酰順反異構(gòu)酶(peptideprolylcis-isomerase,PPI)
分子伴侶:是細(xì)胞中一類保守蛋白質(zhì),可識別肽鏈的非天然構(gòu)象,促進(jìn)各功能域和整體蛋白質(zhì)的正確折疊。
1、熱休克蛋白(heatshockprotein,HSP)
HSP70、HSP40和GreE家族
2、伴侶素(chaperonins)
GroEL和家族GroES
二、一級結(jié)構(gòu)的修飾
(一)肽鏈N-端的修飾
(二)個別氨基酸的共價修飾
(三)多肽鏈的水解修飾(圖12-10)
三、空間結(jié)構(gòu)的修飾
(一)亞基聚合
(二)輔基連接
(三)疏水脂鏈的共價修飾
四、蛋白質(zhì)合成后的靶向輸送
蛋白質(zhì)合成后經(jīng)過復(fù)雜機(jī)制,定向輸送到最終發(fā)揮生物功能的目標(biāo)地點,這一過程稱為蛋白質(zhì)的靶向輸送(proteintargeting)。
所有靶向輸送的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中存在分選信號,主要為N末端特異氨基酸序列,可引導(dǎo)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞的適當(dāng)靶部位,這一序列稱為信號序列(signalsequence)。(一)分泌蛋白的靶向輸送
1.信號肽:各種新生分泌蛋白的N端有保守的氨基酸序列稱為信號肽(signalpeptide)。(見圖)
2.分泌性蛋白進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng):
(圖12-11)
第四節(jié)蛋白質(zhì)生物合成干擾和抑制
一、抗生素(antibiotics)
由微生物產(chǎn)生的具有抑制其它生物生長的物質(zhì)。
1.四環(huán)素(tetracyclin)族
2.氯霉素(chloromycetin)
3.鏈霉素(streptomycin)和卡那霉素(karamycin)
4.嘌呤霉素(puromycin)
5.放線菌酮(cycloheximide)
各種抗生素影響翻譯過程的作用點見圖12-14轉(zhuǎn)位酶二、其它干擾蛋白質(zhì)合成的物質(zhì)
(一)毒素
白喉毒素對真核生物的延長因子EF-2起共價修飾作用,生成EF-2的腺苷二磷酸核糖衍生物,從而使EF-2失活。(圖12-15)
(二)干擾素(interferon,IF)
由真核生物細(xì)胞感染病毒后分泌的具有抗病毒作用的蛋白質(zhì)。
tRNA反密碼子第1位堿基IGACmRNA密碼子第3位堿基U,C,AA,GUGGCGCGAPuPu堿性N端9、春去春又回,新桃換舊符。在那桃花盛開的地方,在這醉人芬芳的季節(jié),愿你生活像春天一樣陽光,心情像桃花一樣美麗,日子像桃子一樣甜蜜。3月-253月-25Thursday,March13,202510、人的志向通常和他們的能力成正比例。14:35:3314:35:3314:353/13/20252:35:33PM11、夫?qū)W須志也,才須學(xué)也,非學(xué)無以廣才,非志無以成學(xué)。3月-2514:35:3314:35Mar-2513-Mar-2512、越是無能的人,越喜歡挑剔別人的錯兒。14:35:3314:35:3314:35Thursday,March
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