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文檔簡介
ICS11.220
CCSB41
53
云南省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB53/T1064.1—2021
綠孔雀檢疫技術(shù)
綠孔雀檢疫技術(shù)
第1部分:禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范
QuarantinetechniqueforPavomuticus
—Part1:Technicalspecificationsforlaboratoryexaminationof
avianparamyxoviruses
2021-09-30發(fā)布2021-10-14實(shí)施
云南省市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB53/T1064.1—2021
目??次
前言...................................................................................................................................................................III
引言.......................................................................................................................................................................I
1范圍.................................................................................................................................................................1
2規(guī)范性引用文件.............................................................................................................................................1
3術(shù)語和定義.....................................................................................................................................................1
4縮略語.............................................................................................................................................................2
5總則.................................................................................................................................................................2
6儀器設(shè)備和試劑.............................................................................................................................................2
6.1實(shí)驗(yàn)室設(shè)備.............................................................................................................................................2
6.2試劑.........................................................................................................................................................3
7樣品.................................................................................................................................................................3
7.1采樣要求與原則.....................................................................................................................................3
7.2采集工具.................................................................................................................................................3
7.3樣品類型與采樣方法.............................................................................................................................3
7.4采樣登記表的填寫.................................................................................................................................4
7.5樣品的保存和運(yùn)輸.................................................................................................................................4
8試驗(yàn)步驟.........................................................................................................................................................4
8.1雞胚接種(病毒分離).........................................................................................................................4
8.2病毒血凝(HA)試驗(yàn)和血凝抑制(HI)試驗(yàn)....................................................................................4
8.3禽副黏病毒L和M基因的RT-PCR擴(kuò)增..............................................................................................5
8.4新城疫病毒F基因的RT-PCR擴(kuò)增及測序分析..................................................................................6
9試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理.................................................................................................................................................7
9.1HA試驗(yàn)結(jié)果判定....................................................................................................................................7
9.2HI試驗(yàn)結(jié)果判定....................................................................................................................................7
9.3L和M基因擴(kuò)增結(jié)果判定......................................................................................................................7
9.4F基因擴(kuò)增結(jié)果及毒力判定..................................................................................................................7
附錄A(規(guī)范性)試劑配制........................................................................................................................8
附錄B(規(guī)范性)采樣記錄表..................................................................................................................10
附錄C(規(guī)范性)RT-PCR引物.................................................................................................................11
I
DB53/T1064.1—2021
前??言
本文件按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起
草。
本文件DB53/T1064《綠孔雀檢疫技術(shù)》的第1部分。DB53/T1064已經(jīng)發(fā)布了以下部分:
——第1部分:禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范;
——第2部分:禽流感病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范;
——第3部分:羽虱實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范;
——第4部分:消化道線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范。
請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識別專利的責(zé)任。
本文件由云南省林業(yè)與草原局、云南省市場監(jiān)督管理局共同提出。
本文件由云南省林業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(YNTC02)歸口。
本文件主要起草單位:云南農(nóng)業(yè)大學(xué)、云南省標(biāo)準(zhǔn)化研究院。
本文件主要起草人:陳培富、黃艷梅、胡世享、楊敏、卓娜、李寧、錢麗敏、鄒豐才、何依蓉、楊
建發(fā)。
III
DB53/T1064.1—2021
引??言
綠孔雀(Pavomuticus)在我國僅分布于云南,是國家Ⅰ級重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物,也是全球?yàn)l危物種,
并已列入《瀕危野生動(dòng)植物種國際貿(mào)易公約》(CITES)和《世界自然保護(hù)聯(lián)盟瀕危物種紅色名錄》。為
切實(shí)貫徹《中華人民共和國野生動(dòng)物保護(hù)法》和《中華人民共和國動(dòng)物防疫法》,編制并發(fā)布DB53/T1064
《綠孔雀檢疫技術(shù)》地方標(biāo)準(zhǔn),可讓從事綠孔雀保護(hù)的相關(guān)人員按標(biāo)準(zhǔn)化和規(guī)范化程序開展綠孔雀病原
學(xué)診斷,從而采取必要的防治措施,以提高染疫綠孔雀的成活率,維護(hù)綠孔雀種群健康和地區(qū)生態(tài)平衡,
提升生物多樣性保護(hù)成效。
本文件已發(fā)布4個(gè)部分:
——第1部分:禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范。本部分從禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)的總則、儀
器設(shè)備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定了規(guī)范;
——第2部分:禽流感病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范。本部分從禽流感病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)的總則、禽
流感病毒毒株的毒力劃分和血清亞型、儀器設(shè)備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方
面制定了規(guī)范;
——第3部分:羽虱實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范。本部分從羽虱實(shí)驗(yàn)室檢測的原理、試驗(yàn)條件、儀器設(shè)備
和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定了規(guī)范;
——第4部分:消化道線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范。本部分從消化道線蟲實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)的試驗(yàn)原理、
常見線蟲形態(tài)特征、試驗(yàn)條件、儀器設(shè)備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟、試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理等方面制定
了規(guī)范。
Ⅴ
DB53/T1064.1—2021
綠孔雀檢疫技術(shù)
第1部分:禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)規(guī)范
重要提示:本檢測技術(shù)規(guī)范中,氯仿有中等毒性,操作時(shí)應(yīng)在通風(fēng)條件下進(jìn)行并戴手套和口罩,不
小心接觸皮膚應(yīng)立即沖洗;凝膠電泳若使用溴化乙啶(EB)作核酸染色劑,操作時(shí)應(yīng)戴手套和口罩,被
EB污染的物品要進(jìn)行無害化處理;操作焦碳酸二乙酯(DEPC)應(yīng)戴手套和口罩并在通風(fēng)條件下,不小心
接觸皮膚應(yīng)立即沖洗。由于新城疫病毒可引起人一過性結(jié)膜炎,采樣及檢測人員應(yīng)佩戴口罩和防護(hù)眼鏡,
并采取必要的消毒措施。本文件中凡接觸病毒樣品的檢驗(yàn)器材、廢棄物及其包裝物均應(yīng)做消毒或滅菌無
害化處理,以免污染環(huán)境或擴(kuò)散病毒。
1范圍
本文件規(guī)定了綠孔雀(Pavomuticus)檢疫技術(shù)中禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)涉及的總則、儀器設(shè)
備和試劑、樣品、試驗(yàn)步驟和試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理。
本文件適用于綠孔雀檢疫技術(shù)中禽副黏病毒實(shí)驗(yàn)室檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,標(biāo)注日期的引用文
件,僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不標(biāo)注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適
用于本文件。
NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范
NY/T1948獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室生物安全要求通則
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
禽副黏病毒avianparamyxoviruses
一類感染家禽和野禽的單鏈負(fù)股RNA病毒,屬于副黏病毒科(Paramyxoviridae)、副黏病毒亞科
(Paramyxovirinae)、禽腮腺炎病毒屬(Avulavirus),包括至少禽副黏病毒1~9血清型,其中禽副黏病
毒1型又稱作新城疫病毒(Newcastlediseasevirus),其致病性最受關(guān)注。
3.2
F蛋白酶切位點(diǎn)cleavagesiteofFprotein
新城疫病毒融合蛋白(F)的F2亞基(位于F氨基端)與F1亞基(位于F羧基端)之間被宿主細(xì)胞蛋
白內(nèi)切酶識別的一個(gè)短肽,由113~117位氨基酸殘基組成,其中113~116位可能含多個(gè)堿性氨基酸,如
精氨酸(R)或賴氨酸(K)。
3.3
病毒血凝試驗(yàn)viralhemagglutinationtest
1
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利用有血凝活性的病毒與特定動(dòng)物的紅細(xì)胞結(jié)合而使紅細(xì)胞凝集(即紅細(xì)胞不再自然下沉匯集)的
特性,測定病毒效價(jià)即滴度的方法。
3.4
病毒血凝抑制試驗(yàn)viralhemagglutinationinhibitiontest
使用抗體阻斷或抑制病毒的血凝活性,用于測定血清抗體效價(jià)或病毒種類的一種方法。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件。
AMV:禽成髓細(xì)胞瘤病毒Avianmyeloblastosisvirus
cDNA:互補(bǔ)DNAcomplementaryDNA
DEPC:焦碳酸二乙酯Diethypyrocarbonate
dNTP:脫氧核苷酸Deoxyribonucleotidetriphosphate
EB:溴化乙啶Ethidiumbromide
F:融合蛋白Fusionprotein
HA:血凝Hemagglutination
HAU:血凝單位Hemagglutinationunit
HI:血凝抑制Hemagglutinationinhibition
L:大聚合酶蛋白Largepolymeraseprotein
M:基質(zhì)蛋白Matrixprotein
NDV:新城疫病毒Newcastlediseasevirus
PBS:磷酸緩沖鹽溶液Phosphate-bufferedsaline
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)Polymerasechainreaction
RBCs:紅細(xì)胞Redbloodcells
RNA:核糖核酸Ribonucleicacid
RT-PCR:反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)Reverse-transcriptionpolymerasechainreaction
SPF:無特定病原體Specificpathogenfree
5總則
5.1采用雞胚接種方法從綠孔雀檢測樣品分離禽副黏病毒。
5.2取5.1得到的雞胚尿囊液做病毒血凝(HA)試驗(yàn)和血凝抑制(HI)試驗(yàn),確定分離毒株的種屬和
血清型(亞型)。
5.3用RT-PCR擴(kuò)增分離毒株的RNA聚合酶(L)基因和基質(zhì)蛋白(M)基因,對禽副黏病毒及其第1
血清型(新城疫病毒)分別做出鑒定。
5.4對5.2或5.3確定的新城疫病毒分離株,采取RT-PCR擴(kuò)增其融合蛋白(F)基因,再做測序分析,
對新城疫病毒分離株做出毒力判定。
6儀器設(shè)備和試劑
6.1實(shí)驗(yàn)室設(shè)備
6.1.1PCR儀:溫度范圍4.0℃~99.9℃,樣品基座配置至少包括單個(gè)0.2mL孔。
2
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6.1.2凝膠成像系統(tǒng):對EB染色的DNA檢測靈敏度低至0.1ng;有效像數(shù)1360×1024、10bit,數(shù)
據(jù)線接口USB2.0。
6.1.3冷凍高速離心機(jī):最高離心力20000g;容量1.5mL×12。
6.1.4電泳儀:電壓50V~120V,電流10mA~800mA,定時(shí)0min~999min。
6.1.5電泳槽:耐高溫、耐腐蝕、不漏液;緩沖液新鮮且容量充足。
6.1.6冰箱:具有冷藏和冷凍功能分區(qū)(?20℃~4℃)。
6.1.7微量移液器:單道可調(diào),量程0.5μL~10μL、2μL~20μL、10μL~100μL和100μL~1000μL。
6.1.8水浴鍋:溫度范圍20℃~100℃。
6.1.9過濾器:一次性無菌用品,內(nèi)含孔徑0.45μm的濾膜。
6.1.10V形孔血凝反應(yīng)板:一次性或可重復(fù)使用的血凝反應(yīng)板。
6.2試劑
6.2.1阿氏液(Alsever'sSolution),pH7.2、0.01mol/L磷酸緩沖鹽溶液(PBS)、1%健康未免疫雞
紅細(xì)胞懸液、標(biāo)準(zhǔn)新城疫病毒抗原、陽性對照血清和陰性對照血清。
6.2.2RNA提取試劑盒、氯仿、異丙醇、75%乙醇、1.0%瓊脂糖凝膠、50×TAE緩沖液、10μg/μL溴
化乙啶(EB)或其他可替代的核酸染料、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)、2×TaqMasterMix、無RNA酶滅菌超純水
(DEPC處理水)、10×擴(kuò)增反應(yīng)緩沖液、dNTPs、RNase抑制劑(40U/μL)、AMV反轉(zhuǎn)錄酶(5U/μL)、
膠回收試劑盒。
6.2.3試劑配制見附錄A。
7樣品
7.1采樣要求與原則
7.1.1采樣應(yīng)符合NY/T541的要求。
7.1.2采集的樣品具有代表性,應(yīng)從瀕死、死禽和處于急性發(fā)病期的綠孔雀采集樣品,對暴發(fā)疫病的
群體宜采集多只發(fā)病或死亡個(gè)體的樣品,采樣過程應(yīng)無菌操作,容器應(yīng)密封,注意避免被污染。
7.2采集工具
棉拭子、剪刀、鑷子、1.5mL離心管、研缽等采樣工具經(jīng)121℃、20min高壓滅菌并烘干。
7.3樣品類型與采樣方法
7.3.1組織樣品
取病死孔雀待檢樣品,采集肺臟(或氣管)、腦、心、肝、脾、胃、腎等組織各1份,每份不少于
3g,置于潔凈樣品袋或平皿內(nèi)。將樣品封口貼上標(biāo)簽,做好標(biāo)記。
7.3.2拭子樣品
7.3.2.1取待檢樣品,采集喉氣管拭子和泄殖腔拭子(或新鮮糞樣)各1份,將拭子樣品端剪下或折
斷,分別置于無菌試管或器皿中,加1.0mL~1.5mL含抗生素的PBS。將樣品封口,貼上標(biāo)簽,做好
標(biāo)記。
7.3.2.2抗生素含量視具體情況而定:
a)對氣管拭子,PBS應(yīng)含青霉素(1000U/mL)、鏈霉素(1mg/mL)或卡那霉素(50μg/mL)
和制菌霉素(1000U/mL);
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b)對泄殖腔拭子和糞便PBS,上述抗生素濃度應(yīng)提高至5倍。
7.3.3血清樣品
采集靜脈血液2mL~3mL于無菌離心管中,自然放置析出血清,3000r/min離心10min,將血清轉(zhuǎn)
移、分裝于新的無菌試管中,蓋緊蓋子,封好口,貼上標(biāo)簽。不同個(gè)體的血清樣品不能混合。
7.3.4整只采樣
將病死孔雀裝入封閉的無毒塑料袋內(nèi),至少用兩層塑料袋包裝,封口并貼上標(biāo)簽,作好標(biāo)記。
7.4采樣登記表的填寫
填寫采樣記錄表(見附錄B),樣品編號應(yīng)與標(biāo)簽一致,隨樣品送至符合NY/T1948要求的實(shí)驗(yàn)室。
7.5樣品的保存和運(yùn)輸
7.5.1樣品應(yīng)置于加干冰或冰袋的保溫瓶或隔熱泡沫盒中運(yùn)輸,也可用液氮罐運(yùn)輸,保溫容器應(yīng)密封,
防止?jié)B漏。保溫容器外貼封條,封條有貼封人(單位)簽字或蓋章,并注明貼封日期。
7.5.2所有樣品在4℃以下運(yùn)輸,拭子樣品和組織樣品應(yīng)作暫時(shí)的冷藏(4℃)或冷凍(–20℃)處
理,隨即送至實(shí)驗(yàn)室。
7.5.3血清樣品宜單獨(dú)存放。若24h內(nèi)可運(yùn)達(dá)實(shí)驗(yàn)室,在保溫箱內(nèi)加冰袋冷藏運(yùn)輸;若超過24h,應(yīng)
先冷凍,其后在保溫箱內(nèi)加大量冰袋運(yùn)輸,途中不能超過48h。
7.5.4各種樣品到達(dá)實(shí)驗(yàn)室后,若暫時(shí)不進(jìn)行處理,則應(yīng)冷凍(–20℃以下)保存,不應(yīng)反復(fù)凍融。
8試驗(yàn)步驟
8.1雞胚接種(病毒分離)
8.1.1樣品處理
將棉拭子在PBS中充分混勻至拭子上沒有肉眼可見的樣品;糞便、研碎的組織加樣品稀釋液充分研
磨,按照1g組織加10mLPBS的比例混成懸液。樣品液經(jīng)3000r/min離心10min,取上清液用濾器過濾,
再取濾過液作為接種材料。
8.1.2樣品接種
取按8.1.1處理完畢的樣品,以0.2mL/胚的量經(jīng)尿囊腔途徑接種孵化9d~11d的SPF雞胚,每個(gè)樣品
接種3~5枚雞胚,在37℃孵化箱內(nèi)孵育,每天上午和下午定點(diǎn)觀察雞胚死亡情況。無菌收集24h~96h
死亡雞胚及96h仍存活雞胚的尿囊液,用于病毒血凝試驗(yàn)以測定有無HA活性。
8.2病毒血凝(HA)試驗(yàn)和血凝抑制(HI)試驗(yàn)
8.2.1病毒血凝(HA)試驗(yàn)
8.2.1.1在96孔V型微量反應(yīng)板,每孔預(yù)先加25μLPBS。
8.2.1.2向第1孔加入25μL尿囊液,反復(fù)吹吸3次~5次混勻。
8.2.1.3從第1孔吸取25μL溶液加入第2孔,混勻后吸取25μL加入第3孔,如此進(jìn)行2倍連續(xù)稀
釋至第11孔,從第11孔吸取25μL溶液棄去,但第12孔加入25μLPBS或正常尿囊液作為陰性對照
孔。
4
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8.2.1.4每孔加入25μLPBS。
8.2.1.5每孔加入25μL1%雞紅細(xì)胞懸液。
8.2.1.6輕輕振蕩血凝反應(yīng)板以混勻反應(yīng)體系,室溫(20℃~25℃)靜置40min,或4℃靜置60min,
當(dāng)陰性對照孔的紅細(xì)胞在孔底匯集成原點(diǎn)時(shí)判定結(jié)果。
8.2.2病毒血凝抑制(HI)試驗(yàn)
8.2.2.1在96孔血凝反應(yīng)板,每孔預(yù)先加入25μLPBS。
8.2.2.2向第一孔加入25μL血清樣品,混勻。
8.2.2.3在血凝反應(yīng)板上將血清作橫向的2倍連續(xù)稀釋,但第12孔、第13孔、第14孔和第15孔分
別設(shè)置為加25μLPBS的紅細(xì)胞對照孔、加未做任何免疫禽血清的陰性對照孔、加禽流感病毒抗體的對
照孔和加禽腺病毒抗體的對照孔(對已確定禽副黏病毒血清型的分離毒株,還可設(shè)置陽性對照孔)。
8.2.2.4每孔加入25μL4HAU的病毒抗原,室溫(20℃~25℃)靜置不少于30min,或4℃靜置不
少于60min。
8.2.2.5每孔加入25μL1%RBCs,輕輕振蕩混勻,室溫(20℃~25℃)靜置約40min,或4℃放置
約60min,當(dāng)紅細(xì)胞對照孔呈顯著鈕扣狀時(shí)判定結(jié)果。
8.3禽副黏病毒L和M基因的RT-PCR擴(kuò)增
8.3.1病毒RNA的提取
可用商品化RNA提取試劑盒提取待檢樣品(棉拭子、組織或雞胚尿囊液)、陽性對照樣品及陰性
對照樣品的病毒RNA。也可用RNA提取試劑(如Trizol)提取,方法如下:
a)將經(jīng)過預(yù)處理的250μL待檢樣品加入750μLRNA提取試劑(如Trizol)中,振蕩2min,室
溫放置5min;
b)加入250μL氯仿,在微量振蕩器上振蕩1min,室溫放置5min后,4℃、12000r/min(約14000×g)
離心15min;
c)吸取上層水相轉(zhuǎn)入一新的離心管中,加入等量的異丙醇,混勻,室溫放置15min,4℃、12000
r/min(約14000×g)離心15min;
d)小心吸棄上清,加入DEPC處理的75%乙醇750μL,4℃、12000r/min(約14000×g)離心
5min;
e)小心吸棄上清,將沉淀自然風(fēng)干或于50℃干燥箱中晾干,加適量的DEPC處理水溶解;
f)取5μL提取物與1μL6×核酸上樣緩沖液混勻,做1%瓊脂糖凝膠電泳檢查RNA提取效果,
對組織樣品觀測到28S、18S及5.8SrRNA三個(gè)條帶或至少前兩個(gè)條帶,提示RNA提取合格;
g)提取的RNA應(yīng)在2h內(nèi)進(jìn)行RT或RT-PCR擴(kuò)增,若需長期保存RNA,應(yīng)置于?80℃冰箱或
液氮內(nèi)。
8.3.2RT-PCR擴(kuò)增(兩步法)
8.3.2.1反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(cDNA的合成):取提取的RNA11μL,加入2μL、10μmo1//L的反轉(zhuǎn)錄引物
(見附錄C),4μL5×反轉(zhuǎn)錄緩沖液、0.5μL反轉(zhuǎn)錄酶、0.5μLRNA酶抑制劑、2μLdNTPMixture至
20μL,42℃孵育1h,即得到cDNA溶液,直接用于PCR擴(kuò)增或?20℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
8.3.2.2PCR擴(kuò)增體系:在反應(yīng)管中依次加入8μL無核酸酶水、10μL2×TaqMasterMix、1μL上述
cDNA溶液、0.5μL上游引物和0.5μL下游引物(見附錄C,引物濃度均為10μmol/L),混勻,瞬時(shí)
離心,使液體全部集中于管底。
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8.3.2.3PCR擴(kuò)增條件:94℃預(yù)變性3min,94℃變性10s,56℃退火30s,72℃延伸25s,循環(huán)30
次,72℃延伸5min。擴(kuò)增反應(yīng)結(jié)束后立即取擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢查或置于4℃冰箱備用。
8.3.3擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳檢測
制備1.5%瓊脂糖凝膠板。在電泳槽內(nèi)加入1×TAE電泳緩沖液,使液面剛剛沒過凝膠。取3μL~5μL
擴(kuò)增產(chǎn)物加到凝膠孔,加入5μLDNA分子量標(biāo)準(zhǔn)。恒壓(8V~10V/cm凝膠長度)電泳30min~40min,
隨后取出凝膠,置于凝膠成像系統(tǒng)下觀察擴(kuò)增結(jié)果。
8.4新城疫病毒F基因的RT-PCR擴(kuò)增及測序分析
8.4.1病毒RNA的提取
按照8.3.1步驟進(jìn)行。
8.4.2引物
針對新城疫病毒F基因設(shè)計(jì)的引物見附錄C。
8.4.3RT-PCR擴(kuò)增(一步法)
8.4.3.1RT-PCR擴(kuò)增體系配制見表1。體系配好后,蓋緊PCR反應(yīng)管蓋,并做好標(biāo)記。
8.4.3.2使用瞬時(shí)離心使液體都沉降到PCR管底。同時(shí)設(shè)立陽性對照和陰性對照。PCR擴(kuò)增程序:42℃
反轉(zhuǎn)錄30min;95℃預(yù)變性3min;94℃變性30s,55℃退火30s;72℃延伸45s共進(jìn)行35次循環(huán);72℃
再延伸7min。PCR產(chǎn)物置于4℃保存或?20℃凍存?zhèn)錂z。
表1RT-PCR擴(kuò)增體系
組分體積(μL)
無RNA酶滅菌超凈水14.6
10×擴(kuò)增反應(yīng)緩沖液2.5
dNTPs(2.5mmol/Leach)2.0
RNase抑制劑(40U/μL)0.5
AMV反轉(zhuǎn)錄酶(5U/μL)0.7
Taq酶(5U/μL)0.7
F基因上游引物(10μmol/L)0.5
F基因下游引物(10μmol/L)0.5
模板RNA3.0
總計(jì)25
8.4.4擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢查
參照8.3.3操作。
8.4.5測序分析
將PCR產(chǎn)物用膠回收試劑盒回收、純化,做核酸測序,所獲序列用DNAstar(5.0)分析并在NCBI
網(wǎng)站上做BLAST在線比對。根據(jù)核苷酸序列推導(dǎo)分離毒株F的氨基酸序列,確定內(nèi)切蛋白酶識別位點(diǎn)的
堿性氨基酸數(shù)量。
6
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9試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理
9.1HA試驗(yàn)結(jié)果判定
9.1.1將血凝反應(yīng)板傾斜呈約60°,觀察RBCs有無呈淚珠樣流淌,出現(xiàn)淚珠樣流淌的反應(yīng)孔判定為病
毒血凝陰性。
9.1.2完全凝集(無淚珠樣流淌)的病毒最大稀釋倍數(shù)為該病毒樣品(尿囊液)的血凝滴度,其相應(yīng)
的病毒含量表示為1個(gè)血凝單位(HAU),再根據(jù)開始的稀釋倍數(shù)精確計(jì)算血凝滴度。
9.1.3血凝判定標(biāo)準(zhǔn):紅細(xì)胞均勻分散在孔內(nèi)、傾斜血凝板時(shí)不流淌判為完全凝集,記作++++;75%
凝集記作+++;50%凝集記作++;25%凝集記作+;紅細(xì)胞匯集于孔底中央呈圓點(diǎn)、傾斜血凝板時(shí)與對照
孔(僅含25μLRBCs和50μLPBS)RBCs流淌相同的孔判定為不凝集,記作?。
9.2HI試驗(yàn)結(jié)果判定
9.2.1紅細(xì)胞均勻分散在孔底周圍、傾斜血凝板時(shí)不流淌判為完全凝集,記作++++;75%凝集記作+++;
50%凝集記作++;25%凝集記作+;紅細(xì)胞集中在孔底中央呈圓點(diǎn)、傾斜血凝板時(shí)與對照孔(僅含25μL
RBCs和50μLPBS)RBCs流淌相同的孔判定為不凝集或血凝被抑制,記作?。
9.2.2完全抑制4HAU病毒抗原的最高血清稀釋倍數(shù)為該血清的HI滴度。
2
9.2.3檢查各種對照:陰性對照血清HI滴度不高于4(記作2或2log2),陽性對照血清HI滴度應(yīng)
在已知滴度的一個(gè)稀釋度以內(nèi),紅細(xì)胞對照應(yīng)無自凝現(xiàn)象,結(jié)果有效,試驗(yàn)成立。
4
9.2.4如果高于1:16(2或4log2)稀釋度的血清能抑制4HAU的病毒抗原,HI滴度被判為HI抗體
陽性,表明動(dòng)物發(fā)生新城疫病毒感染或接種過新城疫疫苗。
9.2.5如果血清HI滴度為16,判為可疑,需重復(fù)HI試驗(yàn),若HI滴度仍為16,可判定血清抗體陽性,
若HI滴度為8則判定為血清抗體陰性。
9.2.6在所有的確診試驗(yàn)中針對試驗(yàn)采用的HAU應(yīng)設(shè)病毒HA滴度的追溯性測定。
9.2.7當(dāng)血凝活性不被禽流感病毒抗體和禽腺病毒抗體阻斷,便可初步判定為禽副黏病毒陽性。
9.3L和M基因擴(kuò)增結(jié)果判定
使用L基因引物做PCR擴(kuò)增呈陽性結(jié)果時(shí),禽副黏病毒各血清型的擴(kuò)增產(chǎn)物均約121bp。進(jìn)而使用
M基因引物擴(kuò)增NDV陽性對照、陰性對照和待測分離毒株,其擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,陰、
陽性對照同時(shí)成立表明試驗(yàn)有效,否則試驗(yàn)無效。在陰、陽性對照結(jié)果成立的前提下,如果待檢樣品的
RT-PCR產(chǎn)物凝膠電泳后在約300bp位置出現(xiàn)特異性的單一條帶,則初步判定為禽副黏病毒1型即NDV
核酸陽性。
9.4F基因擴(kuò)增結(jié)果及毒力判定
9.4.1試驗(yàn)成立條件:凝膠電泳陽性對照出現(xiàn)約535bp擴(kuò)增條帶,同時(shí)陰性對照無擴(kuò)增條帶。
9.4.2待檢樣品出現(xiàn)535bp左右的目的片段(與陽性對照大小相符),判為新城疫病毒核酸陽性;待
檢樣品未出現(xiàn)目的片段,判為新城疫病毒核酸陰性。
9.4.3若NDV分離毒株F2亞基的羧基端有3個(gè)以上堿性氨基酸(精氨酸或賴氨酸)殘基而F1亞基
的氨基端即117位為苯丙氨酸,判定該分離毒株為NDV強(qiáng)毒株。
7
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AA
附錄A
(規(guī)范性)
試劑配制
A.11.5%瓊脂糖凝膠
稱取瓊脂糖1.5g,放入100mL1×TAE電泳緩沖液中,加熱融化,溫度降至60℃時(shí),加入5μL核酸
染料,迅速混勻并鋪板,使凝膠厚度為3mm~5mm。
A.250×TAE電泳緩沖液
A.2.10.5mol/LEDTA溶液(pH8.0):稱取EDTA18.61g,加滅菌雙蒸水至100mL,后用氫氧化鈉
調(diào)pH至8.0。
A.2.250×TAE電泳緩沖液:Tris堿242g,冰乙酸57.1mL,0.5mol/LEDTA100mL,加滅菌雙蒸水
溶解至1000mL。
A.3溴化乙啶(EB)溶液
溴化乙啶20mg,加滅菌雙蒸水溶解至20mL,避光保存。
A.4DEPC處理的雙蒸水
焦碳酸二乙酯(DEPC)50μL,加滅菌雙蒸水至100mL,室溫放置6h~8h,121℃±2℃高壓滅菌
20min,分裝到DEPC處理過的1.5mL離心管。
A.5阿氏液(Alsever'sSolution)
A.5.1阿氏液配方見表A.1。
表A.1阿氏液配方
序號成分含量(g/100mL)
1葡萄糖2.05
2檸檬酸鈉0.80
3檸檬酸0.055
4氯化鈉0.42
A.5.2配制方法:加蒸餾水100mL,加熱溶解后調(diào)pH值至6.1,69kPa15min高壓滅菌,4℃保存?zhèn)?/p>
用。
A.6pH7.2、0.01mol/L磷酸緩沖鹽溶液(PBS)
A.6.1配制25×PB
磷酸氫二鈉2.74g;磷酸二氫鈉0.79g;加蒸餾水100mL。
A.6.2配制1×PBS
8
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25×PB40
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