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文檔簡(jiǎn)介
ICS
備案號(hào):
團(tuán)體MA標(biāo)準(zhǔn)
T/CVMAXXXXX—XXXX
布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量
PCR檢測(cè)方法
Real-TimePCRforIdentificationofBrucellaA19Vaccinestrain
(征求意見(jiàn)稿)
XXXX-XX-XX發(fā)布XXXX-XX-XX實(shí)施
中國(guó)獸醫(yī)協(xié)會(huì)發(fā)布
XX/TXXXXX—XXXX
布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR檢測(cè)方法
1范圍
本文件規(guī)定了布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR檢測(cè)方法。
本文件適用于動(dòng)物血液樣品、脾臟、肝臟、淋巴結(jié)、流產(chǎn)物、環(huán)境樣品等樣本中布魯氏菌A19疫
苗株的核酸進(jìn)行鑒別診斷。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T20001.4-2015標(biāo)準(zhǔn)編寫(xiě)規(guī)則第4部分:試驗(yàn)方法標(biāo)準(zhǔn)
GB/T18646動(dòng)物布魯氏菌病診斷標(biāo)準(zhǔn)
NY/T1467奶牛布魯氏菌病PCR診斷技術(shù)
3試劑與耗材
3.1提取試劑
宜選取商品化的細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒。
3.2熒光定量PCR擴(kuò)增試劑
宜按照不同的熒光定量PCR平臺(tái)的說(shuō)明書(shū)選取推薦的熒光定量PCR擴(kuò)增試劑。
3.3引物探針
布魯氏菌通檢上游引物(BuF):5'-CGCTCGCGCGGTGGAT-3'
布魯氏菌通檢下游引物(BruR):5'-CTTGAAGCTTGCGGACAGTCACC-3'
1
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布魯氏菌通檢探針(BruP):5'-FAM-ACGACCAAGCTGCATGCTGTTGTCGATG-BHQ1-3'
A19鑒定上游引物(A19F):5'-CGCGGGCTTCCTGATG-3'
A19鑒定下游引物(A19R):5'-GGCCCAGACCGGGAAATA-3'
A19鑒定探針(A19P):5'-VIC-ACCTTGCAGGAATTCGGCATCATCC-BHQ1-3'
4儀器與設(shè)備
生物安全柜、分析天平、水浴鍋、高速離心機(jī)、熒光PCR儀、組織研磨器、-20℃冰箱、渦旋震蕩
儀。
5操作步驟
5.1樣品的采集及運(yùn)輸
按照GB/T18646和NY/T1467執(zhí)行。
5.2樣品的處理
按照GB/T18646和NY/T1467執(zhí)行。
5.3細(xì)菌基因組提取
按照所選取的細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行提取。
5.4分型熒光定量PCR擴(kuò)增方法
按照表1配制布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系。
2
XX/TXXXXX—XXXX
表1
試劑終濃度體積
布魯氏菌
2×酶混合液a/10μL
A19疫苗株
BruF(10pmol/μL)0.3μmol/L0.6μL
鑒定熒光定
BruR(10pmol/μL)0.3μmol/L0.6μL
量PCR擴(kuò)
BruP(10pmol/μL)0.3μmol/L0.6μL
增反應(yīng)體系
A19F(10pmol/μL)0.3μmol/L0.6μL
A19R(10pmol/μL)0.3μmol/L0.6μL
A19P(10pmol/μL)0.3μmol/L0.6μL
DNA模板/2μL
無(wú)菌無(wú)核酸酶水/4.4μL
總體積/20.0μL
注:a為熒光定量PCR擴(kuò)增試劑。
將表1中所有試劑加到熒光PCR反應(yīng)管后,充分混勻,做好標(biāo)記。布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量
PCR擴(kuò)增所用熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM和VIC,淬滅基團(tuán)為BHQ或None。在熒光定量PCR儀上按表2所示程序進(jìn)
行擴(kuò)增反應(yīng)。
表2布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR擴(kuò)增程序
步驟溫度持續(xù)時(shí)間循環(huán)數(shù)
3
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195℃2min1
295℃15s40
360℃1min
注:在每個(gè)循環(huán)第二步(60℃35s)收集熒光信號(hào)。
5.5布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR擴(kuò)增反應(yīng)的對(duì)照
在進(jìn)行布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)時(shí),應(yīng)設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照。以提取的布魯氏
菌A19疫苗株基因組DNA溶液和非A19疫苗株的布魯氏菌基因組DNA溶液作為陽(yáng)性對(duì)照;以細(xì)菌基因組提取
試劑盒的洗脫液替代DNA模板作為陰性對(duì)照。各對(duì)照PCR擴(kuò)增體系中,除模板外,其余組分和PCR擴(kuò)增程
序同5.4。
6結(jié)果判定
6.1閾值設(shè)定
閾值線設(shè)定于剛剛超過(guò)陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn)。不同儀器可根據(jù)儀器噪音情況進(jìn)行調(diào)整。
6.2結(jié)果判定
6.2.1陽(yáng)性對(duì)照:布魯氏菌A19疫苗株基因組DNA溶液,F(xiàn)AM熒光信號(hào)Ct值≤38并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲
線,VIC熒光信號(hào)無(wú)Ct值并且無(wú)特定擴(kuò)增曲線;非A19疫苗株的布魯氏菌基因組DNA溶液,F(xiàn)AM熒光信號(hào)Ct
值≤38并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線,VIC熒光信號(hào)Ct值≤38并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線;陰性對(duì)照FAM和VIC熒光
信號(hào)均無(wú)Ct值并且無(wú)特定擴(kuò)增曲線,實(shí)驗(yàn)結(jié)果成立,否則實(shí)驗(yàn)結(jié)果不成立。
6.2.2被檢樣品FAM熒光信號(hào)Ct值≤38并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線,VIC熒光信號(hào)無(wú)Ct值并且無(wú)特定擴(kuò)增
曲線,判斷為布魯氏菌A19疫苗株核酸陽(yáng)性。
6.2.3被檢樣品FAM熒光信號(hào)Ct值≤38并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線,VIC熒光信號(hào)Ct值≤38并出現(xiàn)特定的
擴(kuò)增曲線,判斷為非A19疫苗株的布魯氏菌核酸陽(yáng)性,但不排除樣品中A19疫苗株核酸陽(yáng)性,應(yīng)結(jié)合免疫
背景綜合判斷。
6.2.4被檢樣品中FAM或VIC熒光信號(hào)38<Ct值≤40并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線,需重新取樣提取基因組
DNA,擴(kuò)增后結(jié)果判定仍是可疑的,可判定為陽(yáng)性。
6.2.5被檢樣品VIC熒光信號(hào)Ct值≤38并出現(xiàn)特定的擴(kuò)增曲線,F(xiàn)AM熒光信號(hào)無(wú)Ct值并且無(wú)特定擴(kuò)增
曲線,判定為結(jié)果無(wú)效。
6.2.6無(wú)擴(kuò)增曲線,判斷為陰性。
4
XX/TXXXXX—XXXX
_________________________________
5
XX/TXXXXX—XXXX
前??言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起
草。
本文件不涉及專利。
本文件由中國(guó)獸醫(yī)協(xié)會(huì)提出并歸口。
本文件起草單位:中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心、中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所、中國(guó)食品藥品檢定研究院、
臨沂大學(xué)。
本文件主要起草人:董浩、原霖、王傳彬、彭小薇、范學(xué)政、劉洋、秦玉明、畢一鳴、馮宇、張興
林、牛建蕊。
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布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR檢測(cè)方法
1范圍
本文件規(guī)定了布魯氏菌A19疫苗株鑒定熒光定量PCR檢測(cè)方法。
本文件適用于動(dòng)物血液樣品、脾臟、肝臟、淋巴結(jié)、流產(chǎn)物、環(huán)境樣品等樣本中布魯氏菌A19疫
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3.2熒光定量PCR擴(kuò)增試劑
宜按照不同的熒光定量PCR平臺(tái)的說(shuō)明書(shū)選取推薦的熒光定量PCR擴(kuò)增試劑。
3.3引物探針
布魯氏菌通檢上游引物(BuF):5'-CGCTCGCGCGGTGGAT-3'
布魯氏菌通檢下游引物(BruR):5'-CTTGAAGCTTGCGGACAGTCACC-3'
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XX/T
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