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文檔簡介
ICS65.020
B15
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T/CIXXX-2021
!"#$%&'())$*+,-)./01234
Technicalspecificationsforpathogendetectionanddisease
resistanceidentificationofsugarcanewhiteleafdiseaseinlow
latitudeplateau
(征求意?稿)
5655787889:565578788;<
=>>?@1ABC9:
前言
本指南按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)
和起草規(guī)則》起草。
本標(biāo)準(zhǔn)由中國國際科技促進(jìn)會標(biāo)準(zhǔn)化工作委員會提出。
本標(biāo)準(zhǔn)由中國國際科技促進(jìn)會歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)由云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所、臨滄南華糖業(yè)有限公司、保山市農(nóng)
業(yè)技術(shù)推廣中心、耿馬南華糖業(yè)有限公司、臨滄市甘蔗技術(shù)推廣站、瀾滄縣甘蔗
技術(shù)推廣站、西盟縣經(jīng)濟(jì)作物工作站負(fù)責(zé)起草。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:黃應(yīng)昆、李文鳳、李婕、盧文潔、王曉燕、代光偉、段
兆祜、單紅麗、張榮躍、董有波、黃丕忠、李銀煳、羅志堅(jiān)、南云剛、李茅苗、
巖文、石紅軍、唐吉昌、魯賓、段明雄、白升偉、林文根、董顯華、周中、施永
祥、者林成、李文富。
本標(biāo)準(zhǔn)是首次發(fā)布。
2
低緯高原甘蔗白葉病病原檢測與抗病性鑒定技術(shù)規(guī)程
1適用范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了低緯高原甘蔗白葉病病原檢測與抗病性鑒定的術(shù)語定義、縮略
語、癥狀及流行特點(diǎn)、病原檢測與抗病性鑒定的技術(shù)方法和標(biāo)準(zhǔn)。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于甘蔗白葉病的分子檢測和甘蔗種質(zhì)資源對甘蔗白葉病抗病性
的人工接種鑒定與評價(jià)。
2引用標(biāo)準(zhǔn)
下列文件中的條款,通過本標(biāo)準(zhǔn)的引用而成為本標(biāo)準(zhǔn)的條款。凡是注日期的
引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版
本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T28067甘蔗黃葉病毒實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測方法
3術(shù)語定義
3.1巢式PCR:巢式PCR是一種使用兩對PCR引物擴(kuò)增完整的片段,第一
對PCR引物擴(kuò)增片段和普通PCR相似,第二對引物結(jié)合在第一次PCR產(chǎn)物內(nèi)
部,使得二次PCR擴(kuò)增靈敏度高于一次PCR擴(kuò)增的變異聚合酶鏈反應(yīng)。
3.2甘蔗白葉?。⊿ugarcanewhiteleaf,SCWL):由甘蔗白葉病植原體
(Sugarcanewhiteleafphytoplasma)系統(tǒng)性侵染甘蔗使蔗葉上出現(xiàn)單條或
數(shù)條白色條紋甚至全葉變成白色葉質(zhì)柔軟,病株分蘗增多并矮縮的一種種傳植原
體病害。
4縮略語
3
bp:堿基對(basepair)
CTAB:十六烷基三甲基溴化銨(HexadecylTrimethylAmmonium
Bromide)
dNTPs:脫氧核苷三磷酸混合液(DeoxyribonucleosideTriphosphates
mixture)
ddH2O:雙蒸水
EDTA:乙二胺四乙酸(EdetateDisodium)
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerasechainreaction)
Tris:三羥甲基氨基甲烷(HydroxymethylMethylAminomethane)
5癥狀及流行特點(diǎn)
甘蔗白葉病癥狀及流行特點(diǎn)參見附錄A。
6病原檢測
6.1儀器與器材
儀器與器材包括臺式離心機(jī)、小型離心機(jī)、微量可調(diào)移液器、恒溫水浴鍋、
旋渦混勻儀、核酸蛋白分析儀、PCR擴(kuò)增儀、電泳槽、電泳儀等電泳裝置、凝
膠成像儀、冰箱(溫控范圍4℃和-20℃)、高壓滅菌鍋、鼓風(fēng)干燥箱、液氮罐、
電子天平、帶濾芯移液頭、PCR反應(yīng)管等。
6.2試劑
除另有規(guī)定外,所用試劑均為分析純。
6.2.1DNA提取試劑
DNA提取試劑及配制方法見附錄B。
4
6.2.2PCR試劑
PCR試劑及配制方法參見附錄B。
6.2.3電泳緩沖液
儲存液為50倍TAE電泳緩沖液,配制方法見附錄B,工作液用ddH2O將
儲存液稀釋50倍后獲得。
6.2.4擴(kuò)增產(chǎn)物檢測試劑
瓊脂糖、Goldenview核酸染料、6倍上樣緩沖液、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)。
6.3采樣及樣品處理
6.3.1采樣工具
采樣工具處理按照GB/T28067的要求執(zhí)行。
6.3.2采樣方法
采樣方法參照GB/T28067的要求執(zhí)行。其中,葉片樣品采集時(shí)首選疑似甘
蔗白葉病病株,具體參見附錄A,樣品獨(dú)立分裝,編號備用。
6.3.3樣品保存
樣品存放與運(yùn)送按照GB/T28067要求執(zhí)行。
6.4DNA提取
DNA提取方法參見附錄B。
6.5巢式PCR檢測
巢式PCR檢測方法參見附錄C。
6.6結(jié)果判定
陽性對照有條帶,陰性對照和空白對照無條帶時(shí),檢測結(jié)果有效,當(dāng)檢測結(jié)
果有效時(shí),依據(jù)表1進(jìn)行結(jié)果判定。
表1判定表
5
目的條帶大?。╞p)樣品陽性對照陰性對照空白對照結(jié)果判定
1240有有無無含白葉病植原體
1240無有無無不含白葉病植原體
7抗病性鑒定
7.1材料選擇與處理
7.1.1材料選擇
選擇經(jīng)Nest-PCR檢測不帶SCWL植原體的健壯蔗株。
7.1.2對照材料
鑒定材料中加入甘蔗品種粵糖86-368、新臺糖25號作感病對照,粵糖83-88、
云蔗05-51作抗病對照。
7.1.3材料處理
分別切成雙芽段,在流動冷水中浸泡48h之后,用(50±0.5)℃熱水處理
2h,再用70%噻蟲嗪水分散劑和50%多菌靈可濕性粉劑1:800液浸種5min~
10min。
7.1.4土壤準(zhǔn)備
土壤經(jīng)高溫蒸煮消毒后,按消毒土壤和有機(jī)肥(3:1)混勻,裝入(?35cm×
高30cm)塑料桶內(nèi),裝入量為桶容量的三分之二。
7.2接種病原
從甘蔗白葉病發(fā)病區(qū)域選擇具典型白葉病癥狀的高感品種粵糖86-368蔗株,
經(jīng)巢式PCR檢測篩選含SCWL植原體的蔗莖作接種病原。
7.3接種液制備
6
接種前通過壓榨作接種病原的蔗莖獲取攜帶SCWL植原體蔗汁,加入為攜
帶SCWL植原體蔗汁體積10倍量的無菌水稀釋混勻,用雙層紗布過濾,濾液即
為SCWL植原體接種液,現(xiàn)配現(xiàn)用。
7.4接種方法
7.4.1接種方法選擇
接種方法可選用包衣接種法或切莖接種法。
7.4.2包衣接種法
7.4.2.1包衣接種
處理好的蔗種置于塑料膜表面,按1000kg處理好的蔗種用15kg接種液的
比例,采用電動噴霧器將接種液均勻噴灑置于塑料膜表面的蔗種,邊噴邊翻動蔗
種,噴完后將該塑料膜的一半覆蓋蔗種,于25℃下保濕24h。
7.4.2.2材料種植
接種后的供試材料分別種植在塑料桶內(nèi),每份供試材料種植4桶,4次重復(fù),
每桶種植8芽,共32芽,置于20℃~30℃抗病蟲鑒定防蟲溫室中培養(yǎng)。
7.4.3切莖接種法
7.4.3.1材料種植
處理后的供試材料分別種植在塑料桶內(nèi),每份供試材料種植4桶,4次重復(fù),
每桶種植8芽,共32芽,置于20℃~30℃抗病蟲鑒定防蟲溫室中培養(yǎng)。接種
時(shí)每桶選擇長勢較一致的8株,共32株。
7.4.3.2切莖接種
供試材料6月株齡時(shí),在陰天的傍晚用滅菌鋒利切刀(或枝剪)把供試材料
7
植株地上部分沿土表快速切去,用移液槍將100μLSCWL植原體接種液滴入蔗
株根部切口上,每份供試材料接種32株,遮光24h。接種后置于20℃~30℃
抗病蟲鑒定防蟲溫室中培養(yǎng)觀察。
7.5病情調(diào)查
包衣接種30d和切莖接種20d后,調(diào)查各供試材料發(fā)病株率,以后每隔
15d調(diào)查1次,直至感病對照品種發(fā)病株率穩(wěn)定為止。記錄接種日期、接種芽
(株)數(shù)、出苗數(shù)、病害癥狀始現(xiàn)期、累計(jì)發(fā)病株數(shù)。
計(jì)算公式:
累計(jì)發(fā)病株率(%)按公式(1)計(jì)算:
BP=sn1/sn2×100%.............................................................(1)
式中:BP——累計(jì)發(fā)病株率(%)
sn1——累計(jì)發(fā)病株數(shù)
sn2——累計(jì)總株數(shù)
7.6抗病性評價(jià)
按以下分級標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行抗病性評價(jià),見表2。
表2甘蔗抗白葉病鑒定評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)
級別發(fā)病率%抗病性
1級0-3.0高抗(HR)
2級3.1-10.0抗病(R)
3級10.1-20.0中抗(MR)
4級20.1-40.0感病(S)
8
5級40.1-100高感(HS)
9
DEF
G資料.DEH
%&'()IJ及流?特點(diǎn)
FKL%&')IJ
?蔗?葉病癥狀類型可歸納為?葉型和草苗型兩類。?葉型病株葉?表現(xiàn)為
葉質(zhì)柔軟,葉綠素含量減少??化。有的整葉?化,有的呈條紋狀?化,有的呈
斑駁狀?化。草苗型病株莖部現(xiàn)???條紋,分蘗明顯增多,病株矮縮,莖細(xì),
節(jié)間縮短,頂部葉?叢?,外觀如草苗。草苗型病株和?葉型病株?;旌铣霈F(xiàn),
這種混合型病株最容易枯死,即使成活也常不成莖。僅葉??化??分蘗過多的
病株雖可枯死,但不枯死的病株可恢復(fù),有的恢復(fù)?例也較?,有的甚?恢復(fù)到
與健株外觀難以區(qū)別,但到宿根蔗?再現(xiàn)典型癥狀,?圖A.1。
ABCD
MFKL%&'()IJ
A:病葉;B:病株;C:病叢;D:病?
FK5%&'()流?特點(diǎn)
?蔗?葉病(Sugarcanewhiteleaf,SCWL)是由16SrXI組中的?蔗?葉病植
原體(Sugarcanewhiteleafphytoplasma)引起的?種檢疫性?蔗重要病害。
SCWL植原體為?細(xì)胞壁原核微?物,尚不能在??培養(yǎng)基離體培養(yǎng),潛育期較
?,最短的約為30天(少數(shù)),?般為2~3個(gè)?,有的甚??達(dá)?年之久。寄主
主要有?蔗(Sugarcane)、百慕?草(Bermudagrass)。
SCWL植原體存在于病株韌?部篩管中,?蔗是?性繁殖作物,SCWL可通
過帶病蔗種進(jìn)?遠(yuǎn)距離傳播,且傳播性極強(qiáng)。此外,SCWL在?間還可通過細(xì)針
葉蟬MatsumuratettixhiroglyphicusMatsumura和條紋閉顏葉蟬Yamatotettix
flavovittatusMatsumura傳播。?病蔗留種,特別是基部數(shù)節(jié)留種,?出的幼苗?
乎全為病苗,萌發(fā)后1個(gè)?左右就死亡。病害的發(fā)?受品種抗性,種蔗帶毒率、
傳毒?媒葉蟬的數(shù)量及環(huán)境條件等諸因素的影響。如品種?度感病,種蔗帶毒率
?,加上環(huán)境條件?有利于介體昆?的繁殖和傳毒活動,則病害往往發(fā)?較重,
反之則發(fā)?較輕。宿根蔗?般?新植蔗發(fā)病重。
10
DEN
O3P.DEQ
RSTUVWXFYZ
NKLWXFYZRSTU
DNA提取試劑配制?法?表B.1。
[FKL5\]^FN_Y`ab
組分配制量(L)配制?法
-1
1.0mol·L1稱取121.0gTris,溶解于800mL的ddH2O中,?6
-1
Tris-HCl(pH8.0)?液mol·L的HCL調(diào)節(jié)pH?8.0后,?ddH2O定容到
1.0L。
-1
0.5mol·L1稱取186.0gNa2EDTA·2H2O,加?800mLddH2O,充
EDTA(pH8.0)的?液分?jǐn)嚢瑁?2mol·L-1的NaOH調(diào)節(jié)pH?8.0后,?
ddH2O定容到1.0L。
2倍CTAB抽提緩沖液1依次加?20g的CTAB粉末,100mL的1.0mol·L-1的
Tris-HCl(pH8.0)?液,40mL的0.5mol·L-1的
EDTA(pH8.0)的?液,81.8g的NaCl,?滅菌雙蒸定
容到1.0L。
NK5WXFYZ
DNA提取?法如下:
a)取數(shù)?1.5mL?DNA酶的Eppendorf管,1管陽性對照、1管陰性對照,
對每個(gè)管進(jìn)?編號。
b)稱取0.2g新鮮葉?樣品剪細(xì),加液氮充分研磨成粉末狀后,轉(zhuǎn)?2.0mL
滅菌離?管。
c)?即加?1.0mL預(yù)熱(約65°C)的2倍CTAB抽提緩沖液,震蕩混勻,65°C
?浴30min,室溫12,000rpm離?10min。
d)取上清加等體積的氯仿/異戊醇(V/V=24:1),劇烈振蕩混勻,室溫12,000rpm
離?10min。
e)取750μL上清?另?新的滅菌離?管中,加2/3體積異丙醇,顛倒混勻,
-20°C放置1h,12000rpm離?10min。
f)沉淀加?70%?醇500μL,12000rpm離?5min,棄上清,沉淀于中室溫
下1.5mL滅菌離?管??,溶于50μLddH2O。
g)?核酸蛋?分析儀測定波?260nm和280nm處吸光值,當(dāng)A260/A280?值
在1.8~2.0之間時(shí),將樣品于-20°C保存?zhèn)?。
11
DE]
G3P.DEH
cde]f*+ghij
]KLklRSTU
PCR擴(kuò)增試劑配制配制?法如下。
]KLKLcdmnoe]fpqrsb
巢式第?次PCR反應(yīng)混合液配制?表C.1。
表C.1巢式PCR反應(yīng)混合液(25μL體系)
組分使?量(μL)終濃度
DNA1.0-
20μmol·L-1上游引物P11.00.4μmol·L-1
20μmol·L-1下游引物P71.00.4μmol·L-1
10倍PCR緩沖液2.51倍
-1-1
25mmol·LMgCl22.00.8μmol·L
10mmol·L-1dNTPs2.00.8μmol·L-1
5U·μL-1Taq酶0.20.32U·μL-1
ddH2O15.3-
]KLK5cdmtoe]fpqrsb
巢式第?次PCR反應(yīng)混合液配制?表C.2。
表C.2巢式PCR反應(yīng)混合液(25μL體系)
組分使?量(μL)終濃度
DNA1.0-
20μmol·L-1上游引物R16F2n1.00.4μmol·L-1
20μmol·L-1下游引物R16R21.00.4μmol·L-1
10倍PCR緩沖液2.51倍
-1-1
25mmol·LMgCl22.00.8μmol·L
10mmol·L-1dNTPs2.00.8μmol·L-1
5U·μL-1Taq酶0.20.32U·μL-1
ddH2O15.3-
]K5uv
陽性對照:確認(rèn)含?蔗?葉病植原體樣品的DNA做陽性對照。
陰性對照:確認(rèn)不含?蔗?葉病植原體樣品的DNA做陰性對照。
空?對照:?等體積ddH2O替代樣品做空?對照。
]Kwxy
]KwKLxyz{
巢式第?次PCR上游引物P1:5’-AAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATT-3’,下游引
物P7:5’-CGTCCTTCATCGGCTCCT-3’。
巢式第?次PCR上游引物R16F2n:5’-GAAACGACTGCTAAGACTGG-3’,下游引
物R16R2:5’-TGACGGGCGGTGTGTACAAACCCCG-3’。
]KwK5xy|TU
-1
上述巢式PCR引物?ddH2O稀釋?濃度為20μmol·L。
]K}cde]fkl
]K}KLcde]f~?TU
12
巢式PCR體系配制?法如下:
a)在冰上融化各反應(yīng)試劑組分,瞬間低速離?(2,000rpm下離?3s~5s),
加?陽性對照、陰性對照和空?對照。根據(jù)測試樣品數(shù)量,計(jì)算各試劑使?量,
每份樣品設(shè)置2個(gè)平?反應(yīng)。
b)第?次PCR反應(yīng):25μLPCR反應(yīng)體系,按表C.1依次加?反應(yīng)試劑,
瞬間低速離?混勻。
c)第?次PCR反應(yīng):取第?次PCR擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋30倍,取1.0μL作擴(kuò)增模
板,按表C.2依次加?反應(yīng)試劑,瞬間低速離?混勻。
]K}K5cde]fkl4z
在Bio-RadC1000PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)?擴(kuò)增,巢式PCR擴(kuò)增程序如下:
a)第?次PCR反應(yīng)程序:94°C預(yù)變性3min;94°C變性30s,55°C退?60s,
72°C延伸1min,35個(gè)循環(huán);72°C延伸10min。
b)第?次反應(yīng)程序:94°C預(yù)變性3min;94°C變性30s,57°C退?30s,72
°C延伸1min,35個(gè)循環(huán);72°C延伸10min。
]K€????…*+,???‰??
瓊脂糖電泳檢測與凝膠成像分析?法如下:
a)配制濃度為1.5%(W/V)的瓊脂糖凝膠(即1倍TAE電泳緩沖液100mL
加1.5g瓊脂糖),加熱融化混勻,冷卻?60°C左右,加?濃度為0.005%Goldenview
核酸染料(按每100mL瓊脂糖溶液中加?5μL核酸染料溶液的?例),混勻后
倒?膠槽,插上樣品梳。
b)室溫下待凝膠凝固后,垂直向上拔出固定在凝膠中的樣品梳,將瓊脂糖
凝膠和膠板置于電泳槽中,使樣本孔位于電場負(fù)極,向電泳槽中加?1倍TAE
電泳緩沖液。
c)取10μLPCR反應(yīng)產(chǎn)物,加2μl上樣緩沖液并混勻,然后依次將DNA分
?量標(biāo)準(zhǔn)、檢測樣品、陽性對照、陰性對照、空?對照上樣到點(diǎn)樣孔中。電泳電
壓為130V,當(dāng)上樣緩沖液中的溴酚藍(lán)條帶遷移?凝膠1/2的位置,停?電泳。
d)取出瓊脂糖凝膠,置于凝膠成像儀成像拍照、保存。
A___________________________
_________________________________
13
?錄
前?............................................................................................................................2
低緯?原?蔗?葉病病原檢測與抗病性鑒定技術(shù)規(guī)程............................................3
1適?范圍....................................................................................................................3
2引?標(biāo)準(zhǔn)....................................................................................................................3
3術(shù)語定義....................................................................................................................3
4縮略語........................................................................................................................3
5癥狀及流?特點(diǎn)........................................................................................................4
6病原檢測....................................................................................................................4
6.1儀器與器材.......................................................................................................4
6.2試劑...................................................................................................................4
6.3采樣及樣品處理...............................................................................................5
6.4DNA提取.........................................................................................................5
6.5巢式PCR檢測...............................................................................................5
6.6結(jié)果判定...........................................................................................................5
7抗病性鑒定................................................................................................................6
7.1材料選擇與處理...............................................................................................6
7.2接種病原...........................................................................................................6
7.3接種液制備.......................................................................................................6
7.4接種?法...........................................................................................................7
7.5病情調(diào)查...........................................................................................................8
7.6抗病性評價(jià).......................................................................................................8
附錄A(資料性附錄)?蔗?葉病癥狀及流?特點(diǎn)..................................10
A.1?蔗?病癥狀................................................................................................10
A.2?蔗?葉病流?特點(diǎn)....................................................................................10
附錄B........................................................................................................................11
附錄C........................................................................................................................12
(規(guī)范性附錄)...........................................................................................................12
巢式PCR檢測操作?法............................................................................................12
表C.1巢式PCR反應(yīng)混合液(25μL體系)............................................................12
表C.2巢式PCR反應(yīng)混合液(25μL體系)............................................................12
A___________________________............................................................................13
1
低緯高原甘蔗白葉病病原檢測與抗病性鑒定技術(shù)規(guī)程
1適用范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了低緯高原甘蔗白葉病病原檢測與抗病性鑒定的術(shù)語定義、縮略
語、癥狀及流行特點(diǎn)、病原檢測與抗病性鑒定的技術(shù)方法和標(biāo)準(zhǔn)。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于甘蔗白葉病的分子檢測和甘蔗種質(zhì)資源對甘蔗白葉病抗病性
的人工接種鑒定與評價(jià)。
2引用標(biāo)準(zhǔn)
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引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版
本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T28067甘蔗黃葉病毒實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測方法
3術(shù)語定義
3.1巢式PCR:巢式PCR是一種使用兩對PCR引物擴(kuò)增完整的片段,第一
對PCR引物擴(kuò)增片段和普通PCR相似,
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