能等方面存在差異，表1理建和高通量測序，分析和鑒定檢測范圍內(nèi)的病原體【15]較高，一般20000000(20M)序列或以上【12,13]較高【12]圍一般檢測數(shù)十種至數(shù)百種病原體(多重/超多重PCR技術(shù)路線);或數(shù)十種至上千本較低(多重/超多重PCR技術(shù)路線)或中等(探針捕獲技術(shù)路線)能宿主背景較高時，檢測靈敏度下降；測序低(探針捕獲技術(shù)路線)[23];耐藥基因來源較明確、靈敏度較高，可用于耐藥基因分析期約為24~38h【3,16.切共識1相對于mNGS,tNGS具有靶向性、測序數(shù)據(jù)量要求低、生難度低、檢測范圍窄、檢測成本低、靈敏度90%以上mNGS陽性檢出病原微生物種類不超過200種，而tNGS的檢測范圍主要針對常見、致病相對明確的100~300種病原微生物，共識7共識2菌藥物24h后或下次用藥前同步送檢tNGS和血培養(yǎng)。共識3疑似呼吸系統(tǒng)感染，常規(guī)用藥效果不佳，3d內(nèi)病原學(xué)檢測陰性共識4疑似tNGS檢測范圍內(nèi)特殊病原體感染(如螺旋體、軍團菌、支原體、衣原體、分枝桿菌等)且病情進展快或病程長的患者，免疫抑制、合并基礎(chǔ)疾病、反復(fù)呼吸系統(tǒng)感染等病情危重者，有臨床癥狀、共識5測。無法獲得優(yōu)質(zhì)樣本時，不建議送檢mNGS或tNGS。共識6疑似中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染，若3d內(nèi)未明確感染病原體且抗感染經(jīng)驗性治療無效，推薦送檢腦脊液tNGS。疑似tNGS檢測范圍內(nèi)特殊病原體(隱球菌、腦膜炎雙球菌、結(jié)核分枝桿菌等)且病勢迅疾或遷延感染患者，建議送檢tNGS。疑似局灶性感染，3d內(nèi)常規(guī)病原學(xué)檢測陰性，經(jīng)驗性用藥治療效果不佳，或疑似檢測范圍內(nèi)特殊病原體且病勢迅疾或遷延者，推薦共識10疑似其他感染，無法明確感染源，或病情持續(xù)進展及抗感染治療以及明確急、危、重癥患者感染源時，建議首選mNGS。三、樣本采集規(guī)范所有樣本采集應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行無菌操作，同時盡量在抗微生物藥物首次或下一次使用前采集標(biāo)本，及時送檢。此外，無菌操作仍有可能引入其他非目標(biāo)微生物的核酸，尤其是采樣部位的定植微生物。為保障檢測質(zhì)量，需根據(jù)感染類型規(guī)范送檢。共識11根據(jù)不同感染類型，推薦不同樣本類型和采集容器，并按不同的采集時機、采集要點、樣本量要求、保存和運輸條件規(guī)范送檢，樣本采集規(guī)范參考宏基因組檢測或常規(guī)微生物采集要求。共識12到共識20(省略，見《靶向二代測序在感染性疾病診療中的規(guī)范化應(yīng)用專家共識2025》4.石蠟組織樣本：每張切片面積大于25mm2,10-20張切片全血2-8℃保存不超過4小時，采血后4小時內(nèi)完成血漿分離，-80℃保存，專用保存液(如DNA/RNAShield)可穩(wěn)定核酸72小時；腦脊液2-8℃保存不超過4小時，-20℃保存不超過1周，檢測時間長于1周的樣本需-80℃保存，并避免反復(fù)凍融新鮮組織離體30分鐘內(nèi)置于組織保存液中(如RNAlater)室溫避光保存，但需注意核酸降解(建議1年內(nèi)檢測)五、臨床解讀正式報告中，致病、條件致病和定植/微生態(tài)微生物是基于特定樣本類型中病原體的致病性進行分級，具體是否為病原體，需綜合臨床情況進行判斷。共識21致病性微生物，建議考慮為病原體。條件致病微生物，建議結(jié)合免疫狀態(tài)、宿主因素、理化指標(biāo)、影像特征、用藥史、治療效果、傳統(tǒng)微生物檢測結(jié)果等，綜合判斷是否為病原體。共識22定植或微生態(tài)微生物，一般不考慮為病原體；如為免疫抑制或與其他微生物檢測結(jié)果一致或與臨床診斷相符，建議作為病原體依據(jù)之共識23耐藥基因，建議主要關(guān)注臨床常見導(dǎo)致耐藥的調(diào)控基因。革蘭陰性桿菌或腸桿菌科，建議關(guān)注頭孢菌素耐藥相關(guān)的碳青霉烯類耐藥相關(guān)的blaNDM、blaKPC、blaIMP、blaVIM、甲氧西林耐藥相關(guān)的mecA等基因；萬古霉素耐藥相關(guān)的vanA、vanB、vanC等基因；大環(huán)內(nèi)酯類耐藥相關(guān)的核糖體23SrRNA基因突變；結(jié)核分枝桿菌一二線用藥相關(guān)的基因突變及非結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)的erm、rrl等基因。三、哪些眼部感染該用tNGS?根據(jù)共識中“局灶性感染”的推薦原則，結(jié)合眼部感染特點，這些情況尤其適合做tNGS:懷疑細(xì)菌性角膜炎、角膜潰瘍，涂片和培養(yǎng)都是陰性，視力還在懷疑特殊病原體感染(如結(jié)核分枝桿菌、棘阿米巴),病情進展快或治療