滄州市人民醫(yī)院基因測序技術(shù)考核一、單選題（每題2分，共20題）說明：下列每題只有一個最佳答案。1.滄州市人民醫(yī)院臨床基因測序?qū)嶒炇页Ｓ玫母咄繙y序平臺是？A.IlluminaHiSeqXTenB.IonTorrentNext-GenerationSequencingC.PacBioSMRTbellD.OxfordNanoporePromethION2.在滄州地區(qū)常見的遺傳病篩查中，哪種疾病最適合采用全外顯子組測序（WES）技術(shù)？A.某單基因遺傳病（已知致病基因）B.某復(fù)雜遺傳?。ǘ嗷蜃儺惱鄯e）C.某腫瘤的體細(xì)胞突變檢測D.某罕見代謝病（需精確基因定位）3.以下哪種方法不屬于二代測序（NGS）的建庫步驟？A.DNA片段化B.PCR擴增C.粘性末端連接D.亞克隆載體構(gòu)建4.滄州市人民醫(yī)院在腫瘤精準(zhǔn)治療中，常通過基因測序檢測的靶點不包括？A.EGFRB.KRASC.BRCAD.TERT5.基因測序數(shù)據(jù)中，"SAM"格式的文件主要用途是什么？A.存儲原始測序讀長B.對齊測序讀長到參考基因組C.篩查基因突變D.繪制基因組瀏覽器圖譜6.在滄州地區(qū)開展新生兒遺傳病篩查時，哪種技術(shù)靈敏度最高？A.Sanger測序B.數(shù)字PCRC.NGSD.基因芯片7.以下哪種情況不適合進行RNA測序（RNA-Seq）？A.腫瘤樣本差異基因表達(dá)分析B.病毒感染時mRNA變化檢測C.線粒體基因組分析D.基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究8.基因測序中，"Coveragedepth"的含義是？A.基因組區(qū)域被測序的次數(shù)B.測序反應(yīng)的重復(fù)率C.篩查的基因數(shù)量D.質(zhì)量控制參數(shù)9.滄州市人民醫(yī)院臨床基因檢測報告的解讀中，哪種變異被列為"意義未明"（VUS）？A.已報道的致病突變B.新發(fā)現(xiàn)的罕見變異C.同義突變（無氨基酸改變）D.復(fù)合雜合變異10.在基因測序質(zhì)量控制中，"Adaptercontamination"指什么問題？A.測序讀長過短B.引物二聚體干擾C.參考基因組污染D.堿基調(diào)用錯誤二、多選題（每題3分，共10題）說明：下列每題有多個正確答案，錯選、漏選均不得分。1.滄州市人民醫(yī)院開展腫瘤基因測序時，需關(guān)注哪些基因的胚系突變？A.BRCA1/BRCA2B.Lynch綜合征相關(guān)基因（MLH1等）C.APCD.TP532.基因測序數(shù)據(jù)分析流程中，哪些工具常用于變異檢測？A.GATKB.SamtoolsC.VarScanD.IGV3.在滄州地區(qū)開展地中海貧血篩查時，常檢測哪些基因的突變？A.HBA1B.HBA2C.HBBD.G6PD4.基因測序樣本前處理中，哪些方法可提高測序效率？A.磷酸化末端處理B.A-tailingC.封端反應(yīng)D.直接測序5.腫瘤基因測序報告的臨床意義解讀中，需關(guān)注哪些情況？A.腫瘤抑制基因失活B.驅(qū)動基因突變C.藥物靶點存在D.基因拷貝數(shù)變異6.RNA-Seq實驗中，以下哪些因素會影響數(shù)據(jù)質(zhì)量？A.RNA降解程度B.線粒體mRNA比例C.底物殘留污染D.轉(zhuǎn)錄本定量偏差7.基因測序中，"readalignment"的目的是？A.定位測序讀長在參考基因組B.去除低質(zhì)量讀長C.計算基因表達(dá)量D.檢測基因突變8.滄州市人民醫(yī)院在遺傳病診斷中，哪些情況需進行基因測序？A.先天性心臟病家族史B.不明原因的智力低下C.特發(fā)性癲癇D.肌肉萎縮癥9.基因測序質(zhì)量控制指標(biāo)包括？A.測序覆蓋度B.重復(fù)測序率C.Q30堿基比例D.異質(zhì)性指數(shù)10.臨床基因測序報告的倫理要求包括？A.知情同意B.數(shù)據(jù)脫敏C.變異敏感性篩選D.醫(yī)患溝通記錄三、判斷題（每題2分，共10題）說明：下列每題判斷正誤，正確打"√"，錯誤打"×"。1.滄州市人民醫(yī)院開展腫瘤液體活檢時，ctDNA的檢測靈敏度高于組織活檢。（√）2.基因測序數(shù)據(jù)中，"SNP"指單堿基插入。（×）3.RNA-Seq可檢測基因表達(dá)量變化，但不能用于變異篩查。（×）4.臨床基因檢測報告必須由兩個執(zhí)業(yè)醫(yī)師審核簽字。（√）5.基因測序樣本必須使用無RNA酶的管材處理。（√）6.全基因組測序（WGS）比全外顯子組測序（WES）成本更低。（×）7.基因測序中，"QCreport"是分析報告的一部分。（×）8.滄州地區(qū)地中海貧血篩查首選NGS技術(shù)。（√）9.基因測序數(shù)據(jù)存儲一般使用FASTQ格式。（√）10.臨床基因檢測報告的VUS變異需動態(tài)隨訪更新。（√）四、簡答題（每題5分，共4題）說明：根據(jù)要求簡要回答問題。1.簡述滄州市人民醫(yī)院開展腫瘤基因測序的樣本類型及適用范圍。（答案要點：樣本類型包括腫瘤組織、血液、唾液等；適用范圍：肺癌、結(jié)直腸癌、乳腺癌等常見腫瘤的靶向用藥指導(dǎo)、遺傳風(fēng)險評估。）2.解釋基因測序數(shù)據(jù)中"Coveragedepth"的概念及其臨床意義。（答案要點：Coveragedepth指基因組區(qū)域被測序的次數(shù)，臨床意義在于反映測序深度是否足夠檢測低頻突變，影響腫瘤異質(zhì)性分析。）3.列舉三種基因測序樣本前處理的關(guān)鍵質(zhì)量控制措施。（答案要點：DNA/RNA濃度與純度檢測、片段化均勻性評估、接頭連接效率驗證。）4.說明臨床基因檢測報告中的"變異分類標(biāo)準(zhǔn)"及其意義。（答案要點：分為致病、可能致病、良性、意義未明等；意義在于指導(dǎo)臨床決策，如用藥選擇、遺傳咨詢。）五、論述題（每題10分，共2題）說明：根據(jù)要求詳細(xì)闡述問題。1.結(jié)合滄州市人民醫(yī)院實際情況，論述基因測序技術(shù)在遺傳病診斷中的應(yīng)用價值。（答案要點：可提高罕見病診斷效率、減少誤診、指導(dǎo)遺傳咨詢、優(yōu)化治療方案；需結(jié)合本地流行病學(xué)特點，如地中海貧血篩查。）2.分析基因測序數(shù)據(jù)分析流程中可能存在的技術(shù)難點及解決方案。（答案要點：技術(shù)難點包括數(shù)據(jù)質(zhì)控、變異檢測假陽性、復(fù)雜變異解讀；解決方案：采用標(biāo)準(zhǔn)化分析流程、多工具交叉驗證、臨床遺傳專家審核。）答案與解析一、單選題答案與解析1.A（IlluminaHiSeqXTen是滄州地區(qū)主流測序平臺，高通量適合臨床應(yīng)用。）2.B（復(fù)雜遺傳病需WES全面篩查多基因變異。）3.D（亞克隆載體構(gòu)建是三代測序特征。）4.D（TERT非滄州腫瘤常見靶點，EGFR/KRAS/BRCA更常見。）5.B（SAM格式用于序列對齊。）6.C（NGS靈敏度高，適合新生兒篩查。）7.C（線粒體基因組需特定測序技術(shù)。）8.A（Coveragedepth指測序深度。）9.B（VUS指新發(fā)現(xiàn)變異，臨床意義不明。）10.B（Adapter污染影響數(shù)據(jù)質(zhì)量。）二、多選題答案與解析1.A、B、D（胚系突變關(guān)注遺傳風(fēng)險。）2.A、C（GATK/VarScan是主流變異檢測工具。）3.A、B、C（滄州地中海貧血以α/β鏈突變?yōu)橹?。?.A、B、C（前處理關(guān)鍵步驟影響建庫效率。）5.A、B、C（臨床意義在于指導(dǎo)治療。）6.A、B、D（RNA質(zhì)量影響數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性。）7.A、D（對齊用于定位突變。）8.A、B、C（常見遺傳病適用測序診斷。）9.A、B、C（質(zhì)控指標(biāo)包括深度、重復(fù)率、Q值。）10.A、B、D（倫理要求需嚴(yán)格遵循。）三、判斷題答案與解析1.√（液體活檢靈敏度高。）2.×（SNP指單堿基替換。）3.×（RNA-Seq可檢測變異。）4.√（需雙醫(yī)師審核。）5.√（管材需無RNA酶。）6.×（WGS成本更高。）7.×（QCreport是質(zhì)控報告。）8.√（地中海貧血篩查首選NGS。）9.√（FASTQ是標(biāo)準(zhǔn)格式。）10.√（VUS需隨訪更新。）四、簡答題答案與解析1.答案要點：樣本類型包括腫瘤組織、血液、唾液等；適用范圍：肺癌、結(jié)直腸癌、乳腺癌等常見腫瘤的靶向用藥指導(dǎo)、遺傳風(fēng)險評估。解析：滄州地區(qū)腫瘤高發(fā)類型需重點覆蓋。2.答案要點：Coveragedepth指基因組區(qū)域被測序的次數(shù)，臨床意義在于反映測序深度是否足夠檢測低頻突變，影響腫瘤異質(zhì)性分析。解析：深度不足會導(dǎo)致漏檢。3.答案要點：DNA/RNA濃度與純度檢測、片段化均勻性評估、接頭連接效率驗證。解析：前處理質(zhì)量決定后續(xù)數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性。4.答案要點：分為致病、可能致病、良性、意義未明等；意義在于指導(dǎo)臨床決策，如用藥選擇、遺傳咨詢。解析：分類需嚴(yán)格遵循國際標(biāo)準(zhǔn)。五、論述題答案與解析1.答案要點