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文檔簡介

遺傳信息的轉(zhuǎn)錄與翻譯規(guī)程一、概述

遺傳信息的轉(zhuǎn)錄與翻譯是生物體將DNA中的遺傳密碼轉(zhuǎn)化為功能性蛋白質(zhì)的核心過程,對于維持生命活動至關(guān)重要。本規(guī)程詳細(xì)闡述了轉(zhuǎn)錄和翻譯的基本原理、操作步驟及注意事項(xiàng),旨在為相關(guān)研究提供標(biāo)準(zhǔn)化參考。

二、轉(zhuǎn)錄過程

轉(zhuǎn)錄是指以DNA為模板合成RNA的過程,主要分為模板識別、RNA合成及終止三個階段。

(一)轉(zhuǎn)錄所需材料與條件

1.模板DNA:選擇目標(biāo)基因片段作為轉(zhuǎn)錄模板。

2.RNA聚合酶:根據(jù)需要選擇不同類型的RNA聚合酶(如細(xì)菌中的RNA聚合酶)。

3.四種核糖核苷三磷酸(NTPs):包括ATP、GTP、CTP、UTP作為合成RNA的原料。

4.緩沖液:提供適宜的pH和離子環(huán)境(pH7.5-8.0,Mg2?濃度5-10mM)。

5.溫度:通??刂圃?7°C或根據(jù)酶特性調(diào)整。

(二)轉(zhuǎn)錄操作步驟

1.模板準(zhǔn)備:

(1)提取并純化目標(biāo)DNA片段,確保無RNA污染。

(2)設(shè)計(jì)引物(如T7啟動子引物),用于啟動RNA聚合酶結(jié)合。

2.反應(yīng)體系配置:

(1)在無菌管中依次加入:模板DNA(100-500ng/μL)、RNA聚合酶(10-50U/μL)、NTPs(各0.5mM)、緩沖液、引物(10μM)。

(2)補(bǔ)充去離子水至總體積20μL。

3.轉(zhuǎn)錄反應(yīng):

(1)離心混勻反應(yīng)體系。

(2)37°C水浴孵育60-90分鐘,根據(jù)模板長度調(diào)整時間。

(3)加入RNA酶抑制劑(如RNaseOut)終止反應(yīng)(可選)。

(三)產(chǎn)物檢測與純化

1.檢測方法:

(1)凝膠電泳:通過1.5%瓊脂糖凝膠分離RNA產(chǎn)物,觀察條帶大小。

(2)Northernblot:檢測特定RNA序列的特異性。

2.純化步驟:

(1)使用RNA純化試劑盒(如RNeasyMiniKit)去除未反應(yīng)的NTPs和DNA模板。

(2)乙醇沉淀法進(jìn)一步濃縮RNA(-20°C沉淀30分鐘)。

三、翻譯過程

翻譯是指以mRNA為模板合成蛋白質(zhì)的過程,由核糖體和多種tRNA共同完成。

(一)翻譯所需材料與條件

1.mRNA模板:純化的mRNA或體外合成的RNA鏈。

2.核糖體:根據(jù)宿主系統(tǒng)選擇(如E.coli核糖體)。

3.氨基酸:提供必需的20種氨基酸(濃度0.1-1mM)。

4.起始因子:如IF-1、IF-2、IF-3(細(xì)菌系統(tǒng))。

5.能量底物:GTP或ATP(根據(jù)需要)。

(二)翻譯操作步驟

1.mRNA準(zhǔn)備:

(1)通過瓊脂糖凝膠電泳去除殘留RNA酶。

(2)凍存于-80°C備用。

2.翻譯體系配置:

(1)在無菌管中依次加入:mRNA(1μg/μL)、核糖體(50A260單位/μL)、氨基酸混合物、起始因子、緩沖液(50mMTris-HCl,pH7.8)、GTP(0.5mM)。

(3)補(bǔ)充去離子水至總體積50μL。

3.翻譯反應(yīng):

(1)37°C水浴孵育30-60分鐘,根據(jù)蛋白質(zhì)大小調(diào)整時間。

(2)加入蛋白終止劑(如NaN?,終濃度0.1M)終止反應(yīng)。

(三)產(chǎn)物檢測與純化

1.檢測方法:

(1)SDS:通過12%聚丙烯酰胺凝膠分離蛋白質(zhì),銀染或考馬斯亮藍(lán)染色。

(2)Westernblot:使用特異性抗體檢測目標(biāo)蛋白。

2.純化步驟:

(1)通過Ni-NTA親和層析(針對His標(biāo)簽蛋白)或離子交換層析進(jìn)行初步純化。

(2)使用超濾管濃縮至1mg/mL。

四、注意事項(xiàng)

1.酶與試劑活性:確保RNA聚合酶和核糖體處于活性狀態(tài),避免反復(fù)凍融。

2.RNA/DNA污染:操作時使用無RNA酶的耗材(如DEPC水處理)。

3.溫度控制:轉(zhuǎn)錄和翻譯反應(yīng)需精確控制在37°C,避免非特異性結(jié)合。

4.產(chǎn)物鑒定:通過測序或質(zhì)譜驗(yàn)證RNA序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。

本規(guī)程適用于基礎(chǔ)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的轉(zhuǎn)錄與翻譯操作,實(shí)際應(yīng)用時可根據(jù)具體需求調(diào)整參數(shù)。

一、概述

遺傳信息的轉(zhuǎn)錄與翻譯是生物體將DNA中的遺傳密碼轉(zhuǎn)化為功能性蛋白質(zhì)的核心過程,對于維持生命活動至關(guān)重要。本規(guī)程詳細(xì)闡述了轉(zhuǎn)錄和翻譯的基本原理、操作步驟及注意事項(xiàng),旨在為相關(guān)研究提供標(biāo)準(zhǔn)化參考。

二、轉(zhuǎn)錄過程

轉(zhuǎn)錄是指以DNA為模板合成RNA的過程,主要分為模板識別、RNA合成及終止三個階段。

(一)轉(zhuǎn)錄所需材料與條件

1.模板DNA:選擇目標(biāo)基因片段作為轉(zhuǎn)錄模板。

(1)模板DNA的質(zhì)量和純度直接影響轉(zhuǎn)錄效率,建議使用PCR純化或凝膠回收的片段,純度應(yīng)>98%。

(2)若為質(zhì)粒載體,需先進(jìn)行質(zhì)粒小量提取并驗(yàn)證插入基因的正確性。

2.RNA聚合酶:根據(jù)需要選擇不同類型的RNA聚合酶(如細(xì)菌中的RNA聚合酶)。

(1)通用型RNA聚合酶(如T7、T3、SP6):適用于線性DNA模板,需預(yù)設(shè)計(jì)啟動子序列(如T7啟動子)。

(2)逆轉(zhuǎn)錄酶(如AMV、M-MLV):用于反轉(zhuǎn)錄病毒或cDNA合成,需在酸性條件下(pH5.5)反應(yīng)。

3.四種核糖核苷三磷酸(NTPs):包括ATP、GTP、CTP、UTP作為合成RNA的原料。

(1)NTPs濃度需精確控制,過高會導(dǎo)致非特異性延伸,過低則影響產(chǎn)量。建議終濃度各為0.5-1.0mM。

4.緩沖液:提供適宜的pH和離子環(huán)境(pH7.5-8.0,Mg2?濃度5-10mM)。

(1)商業(yè)試劑盒通常包含優(yōu)化緩沖液,若自配需精確稱量Tris、KCl、NaCl等成分。

5.溫度:通常控制在37°C或根據(jù)酶特性調(diào)整。

(1)T7RNA聚合酶最適溫度為37°C,而E.coliRNA聚合酶需45-50°C。

(二)轉(zhuǎn)錄操作步驟

1.模板準(zhǔn)備:

(1)質(zhì)粒模板:使用限制性內(nèi)切酶線性化質(zhì)粒,或直接提取質(zhì)粒作為模板。線性化時需確保切在啟動子上游。

(2)PCR產(chǎn)物模板:通過凝膠電泳回收目標(biāo)片段,使用AmpureXP柱進(jìn)行純化(去除PCR酶殘留)。

2.引物設(shè)計(jì):

(1)引物需包含RNA聚合酶識別的啟動子序列(如T7RNA聚合酶的TAATACGACTCACTATAGAA)。

(2)引物長度15-25bp,GC含量40%-60%,避免發(fā)夾結(jié)構(gòu)和二聚體形成。

3.反應(yīng)體系配置:

(1)在無菌管中依次加入:模板DNA(100-500ng/μL)、RNA聚合酶(10-50U/μL)、NTPs(各0.5mM)、緩沖液、引物(10μM)。

(2)補(bǔ)充去離子水至總體積20μL,混勻后短暫離心。

4.轉(zhuǎn)錄反應(yīng):

(1)熱啟動:95°C預(yù)變性5分鐘,然后降至37°C進(jìn)行延伸。

(2)程序控制:建議使用熱循環(huán)儀設(shè)置以下參數(shù):37°C反應(yīng)60-90分鐘(根據(jù)模板長度調(diào)整)。

(3)終止反應(yīng):加入RNA酶抑制劑(如RNaseOut,20U/μL)或熱處理(70°C15分鐘)滅活酶活性。

(三)產(chǎn)物檢測與純化

1.檢測方法:

(1)凝膠電泳:

-配制1.5%-2.0%瓊脂糖凝膠,加入核酸染料(如Goldview)。

-電泳電壓5-10V/cm,根據(jù)RNA分子量估算遷移時間。

-通過UV燈觀察條帶,預(yù)期大小與基因長度一致。

(2)Northernblot:

-將RNA轉(zhuǎn)移至尼龍膜(42°C預(yù)雜交30分鐘)。

-使用32P標(biāo)記的探針(或地高辛標(biāo)記)雜交(65°C過夜)。

-X光片曝光或化學(xué)發(fā)光成像檢測。

2.純化步驟:

(1)乙醇沉淀法:

-加入等體積異丙醇,-20°C沉淀30分鐘。

-12,000rpm離心15分鐘,棄上清。

(2)洗滌:用75%乙醇洗滌沉淀,重復(fù)離心。

(3)干燥:真空干燥5分鐘,加入DEPC水溶解RNA。

(2)試劑盒純化:

-使用RNeasyMiniKit(Qiagen)等商品化試劑盒,按說明書操作。

-包括洗脫、離心等步驟,可同時去除DNA和蛋白質(zhì)雜質(zhì)。

三、翻譯過程

翻譯是指以mRNA為模板合成蛋白質(zhì)的過程,由核糖體和多種tRNA共同完成。

(一)翻譯所需材料與條件

1.mRNA模板:純化的mRNA或體外合成的RNA鏈。

(1)mRNA需無二級結(jié)構(gòu)(如發(fā)夾環(huán)),可使用熱變性(70°C5分鐘)處理。

(2)純度要求>95%,可通過SDS或AgilentBioanalyzer驗(yàn)證。

2.核糖體:根據(jù)宿主系統(tǒng)選擇(如E.coli核糖體)。

(1)商業(yè)試劑盒通常包含完整核糖體系統(tǒng)(含30S和50S亞基)。

(2)自制時需提取純化E.coli細(xì)胞裂解物,通過蔗糖密度梯度離心分離核糖體。

3.氨基酸:提供必需的20種氨基酸(濃度0.1-1mM)。

(1)需額外添加甲硫氨酸(起始密碼子AUG對應(yīng)的氨基酸)。

(2)對于真核系統(tǒng),還需補(bǔ)充UTP、GTP等能量底物。

4.起始因子:如IF-1、IF-2、IF-3(細(xì)菌系統(tǒng))。

(1)商業(yè)試劑盒已預(yù)混起始因子,無需額外添加。

(2)若自配,需精確復(fù)性IF-2(含GDP-GTP交換酶活性)。

5.能量底物:GTP或ATP(根據(jù)需要)。

(1)終濃度通常設(shè)為2-5mM(GTP)。

(二)翻譯操作步驟

1.mRNA準(zhǔn)備:

(1)線性化處理:若mRNA為環(huán)狀,需用DNaseI或RNase-FreeDNase處理去除殘留DNA。

(2)脫氧處理:加入DTT或β-巰基乙醇(10mM)消除氧化應(yīng)激。

2.翻譯體系配置:

(1)在無菌管中依次加入:mRNA(1μg/μL)、核糖體(50A260單位/μL)、氨基酸混合物、起始因子、緩沖液(50mMTris-HCl,pH7.8)、GTP(0.5mM)。

(2)補(bǔ)充去離子水至總體積50μL,混勻后短暫離心。

3.翻譯反應(yīng):

(1)預(yù)孵育:37°C孵育5分鐘,使各組分充分結(jié)合。

(2)加入ATP:補(bǔ)充ATP(5mM)以供起始密碼子識別。

(3)程序控制:37°C反應(yīng)30-60分鐘(根據(jù)蛋白質(zhì)大小調(diào)整時間)。

(4)終止反應(yīng):加入蛋白終止劑(如NaN?,終濃度0.1M)終止反應(yīng)。

(三)產(chǎn)物檢測與純化

1.檢測方法:

(1)SDS:

-配制12%聚丙烯酰胺凝膠,加入蛋白上樣緩沖液(含β-巰基乙醇)。

-電泳電壓12V/cm,根據(jù)分子量估算遷移時間。

-銀染或考馬斯亮藍(lán)染色后觀察條帶。

(2)Westernblot:

-將SDS分離的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜。

-使用特異性抗體(如兔抗His標(biāo)簽)孵育(4°C過夜)。

-HRP標(biāo)記的二抗孵育后,化學(xué)發(fā)光成像檢測。

2.純化步驟:

(1)Ni-NTA親和層析(針對His標(biāo)簽蛋白):

-將表達(dá)蛋白溶液過Ni-NTA柱(預(yù)洗脫緩沖液)。

-用咪唑梯度(50-500mM)洗脫目標(biāo)蛋白。

(2)離子交換層析:

-根據(jù)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)選擇CM或SP離子交換柱。

-用鹽梯度(0.1-1.0M)分離純化目標(biāo)蛋白。

(3)超濾濃縮:

-使用10kDa超濾管濃縮至1mg/mL,去除鹽離子雜質(zhì)。

四、注意事項(xiàng)

1.酶與試劑活性:確保RNA聚合酶和核糖體處于活性狀態(tài),避免反復(fù)凍融。

(1)RNA聚合酶需儲存于-20°C,避免反復(fù)凍融。使用前需在4°C解凍30分鐘。

(2)核糖體若需自備,需在-80°C儲存,避免多次離心操作。

2.RNA/DNA污染:操作時使用無RNA酶的耗材(如DEPC水處理)。

(1)所有試劑需使用RNA酶-Free處理(如高壓滅菌前加入DEPC)。

(2)實(shí)驗(yàn)

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