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文檔簡介
ICS65.020.30
CCSB44
22
吉林省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB22/T3678—2024
普通級實(shí)驗(yàn)用貓金黃色葡萄球菌檢測PCR
法
DetectionofconventionalexperimentalcatStaphylococcusaureusPCRmethod
2024-12-31發(fā)布2025-02-10實(shí)施
吉林省市場監(jiān)督管理廳發(fā)布
DB22/T3678—2024
前言
本文件按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)
定起草。
請注意本文件中的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識別專利的責(zé)任。
本文件由吉林省科學(xué)技術(shù)廳提出并歸口。
本文件由吉林省科學(xué)技術(shù)廳組織實(shí)施。
本文件標(biāo)準(zhǔn)起草單位:吉林大學(xué)。
本文件標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:高飛、袁寶、任文陟、劉殿峰、張嘉保、高巍、陳健、胡進(jìn)平、權(quán)福實(shí)。
I
DB22/T3678—2024
普通級實(shí)驗(yàn)用貓金黃色葡萄球菌檢測PCR法
1范圍
本文件描述了普通級實(shí)驗(yàn)用貓金黃色葡萄球菌的PCR檢測方法,給出了試驗(yàn)原理、材料、樣品、試
驗(yàn)步驟和結(jié)果判定。
本文件適用于普通級實(shí)驗(yàn)用貓金黃色葡萄球菌檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范
3術(shù)語和定義
本文件沒有需要界定的術(shù)語和定義。
4原理
根據(jù)金黃色葡萄球菌nuc基因設(shè)計(jì)特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),通過凝膠電泳檢測,判定檢測結(jié)
果。
5儀器設(shè)備
儀器設(shè)備包括但不限于:
a)高速離心機(jī),離心速度:1000r/min~20000r/min;
a)PCR擴(kuò)增儀;
b)電泳儀;
c)凝膠成像系統(tǒng);
d)恒溫培養(yǎng)箱,溫度:36℃±1℃;
e)微量移液器(量程:5μL~50μL,50μL~200μL,100μL~1000μL);
f)均質(zhì)器。
6材料
材料包括但不限于:
a)陽性對照品:金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌株(ATCC25923);
1
DB22/T3678—2024
b)陰性對照品:無菌水;
c)7.5%氯化鈉營養(yǎng)肉湯,配制方法按A.1配制;
d)1.5%瓊脂糖凝膠,配制方法按A.2配制;
e)DNA染料;
f)1%溴酚藍(lán),配制方法按A.3配制;
g)50×TAE電泳緩沖液,配制方法按A.4配制;
h)無RNase去離子水,配制方法按A.5配制;
i)DNA標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)志物:100bp~2000bp;
j)70%乙醇溶液(用無RNase去離子水配制);
k)核苷酸混合物(dNTPs)。
7樣品
采集
7.1.1死亡貓
7.1.1.1無菌采集胃、腸道等典型病灶組織或內(nèi)容物。
7.1.1.2用滅菌接種環(huán)挑取適量7.1.1.1樣品,加入4mL7.5%氯化鈉營養(yǎng)肉湯,均質(zhì)后置于
(36℃±1℃)培養(yǎng)箱中培養(yǎng)18h~24h,取上清液,注明編號后備用。
7.1.2活體貓
7.1.2.1采集中段糞便,干糞便加入7.5%氯化鈉營養(yǎng)肉湯均質(zhì)后進(jìn)行接種,稀便直接接種培養(yǎng)。置于
培養(yǎng)箱中36℃培養(yǎng)18h~24h,取上清液,注明編號后備用。
7.1.2.2無菌采集分泌物或濃汁接種在7.5%氯化鈉營養(yǎng)肉湯中,置于培養(yǎng)箱中36℃培養(yǎng)18h~
24h,取上清液,注明編號后備用。
存放
采集或處理的樣品在2℃~8℃條件下保存應(yīng)不超過24h;如需長期保存,應(yīng)放置在-80℃
冰箱中。
運(yùn)輸
按照NY/T541的規(guī)定操作。
8試驗(yàn)步驟
DNA的提取
采用商品化DNA提取試劑盒,按說明書方法進(jìn)行操作;或采用等效方法提取。
PCR擴(kuò)增目的片段
8.2.1反應(yīng)體系
PCR反應(yīng)體系見表1。上游引物為5’-GCTTGCTATGATTGTGGTAGCC-3’,下游引物為5’-
CTCTAGCAAGTCCCTTTTCCAC-3’,產(chǎn)物DNA片段長度為423bp,產(chǎn)物基因序列應(yīng)符合B.1。
2
DB22/T3678—2024
表1PCR反應(yīng)體系
試劑用量/μL
10×Buffer2.5
dNTP(2.5μmol/L)0.7
上游引物(20μmol/L)0.25
下游引物(20μmol/L)0.25
DNA模板(20ng/μL~50ng/μl)2.0
TaqE(5U/μL)0.7
ddH2O(去離子水)18.6
總體積25
8.2.2PCR反應(yīng)參數(shù)
PCR反應(yīng)參數(shù)見表2。
表2PCR反應(yīng)參數(shù)
序號步驟溫度/℃時(shí)間循環(huán)數(shù)
1預(yù)變性955min1
2變性9540s
35
3退火6030s
4延伸7260s
5再延伸728min1
注:可使用其他等效PCR檢測試劑盒進(jìn)行,反應(yīng)體系和反應(yīng)參數(shù)可做相應(yīng)調(diào)整。
8.2.3質(zhì)量控制
金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA作為陽性對照;用不含有金黃色葡萄球菌的其他細(xì)菌DNA作為陰
性對照;用無菌水代替DNA模板作為空白對照。
8.2.4電泳檢測
配制含DNA染料的1.5%瓊脂糖凝膠,取7μL~15μL混有溴酚藍(lán)的PCR產(chǎn)物加入到凝膠孔中,
與適合的DNA標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)志物做對比;電壓60V~100V進(jìn)行電泳,當(dāng)溴酚藍(lán)移動到距離膠板下緣1cm
處時(shí),停止電泳。將瓊脂糖凝膠置于凝膠成像系統(tǒng)中,觀察PCR反應(yīng)結(jié)果。
結(jié)果判定
8.3.1陰性對照和空白對照未出現(xiàn)目的條帶,陽性對照出現(xiàn)423bp特異性目的條帶,試驗(yàn)成立;否
則重新檢驗(yàn)。
8.3.2檢測樣品未觀察到423bp處有擴(kuò)增條帶,樣品檢測結(jié)果為陰性;檢測樣品觀察到423bp處
有擴(kuò)增條帶,樣品檢測結(jié)果為陽性,應(yīng)符合圖B.2。
3
DB22/T3678—2024
A
A
附錄A
(規(guī)范性)
溶液的配制
A.17.5%氯化鈉營養(yǎng)肉湯
稱取蛋白胨10g,牛肉浸粉3g,氯化鈉75g,放入燒杯中,用1L雙蒸水加熱攪拌充分溶解,
調(diào)整pH7.4±0.2;121℃高壓滅菌15min,密封冷卻備用。
A.2含DNA染料的1.5%瓊脂糖凝膠
稱取1.5g瓊脂糖放入燒杯中,加入100mL1×TAE電泳緩沖液,混合后加熱至完全融化,放在
室溫冷卻至50℃~55℃時(shí),向其中加入DNA染料,輕輕晃動混勻,避免產(chǎn)生氣泡,將電泳梳子置入
制膠板中,然后將瓊脂糖溶液倒入制膠板,凝膠適宜厚度為3mm~5mm,需確認(rèn)在梳齒下或梳齒間沒
有氣泡,待凝固后取下梳子備用。
A.31%溴酚藍(lán)
稱取1g水溶性鈉型溴酚藍(lán)放入燒杯中,再向燒杯中加入100mL雙蒸水,攪拌或渦旋混合直到
完全溶解。
A.450×TAE電泳緩沖液
稱取242g羥基甲基氨基甲烷(Tris)和37.2gEDTANa2·2H2O放入1L燒杯中,再向燒杯中
加入800mL雙蒸水,充分?jǐn)嚢杈鶆颍患尤?7.1mL冰醋酸;用NaOH調(diào)至pH8.3,加雙蒸水定容
至1L,室溫保存?zhèn)溆谩S脮r(shí)用雙蒸水稀釋至1×使用。
A.5無RNase去離子水
去離子水按體積比0.1%加入DEPC搖勻,室溫靜置過夜,121℃高壓滅菌15min,冷卻備用。
4
DB22/T3678—2024
B
B
附錄B
(規(guī)范性)
標(biāo)準(zhǔn)對照圖和參考基因序列
B.1參考基因序列
A
GCTTGCTATGATTGTGGTAGCCATCATTATTGTAGGTGTATTAGCATTTCAATTTATGAATCATAC
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