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文檔簡(jiǎn)介
生物工程系畢業(yè)論文一.摘要
生物工程系畢業(yè)論文的研究聚焦于基因編輯技術(shù)在作物抗逆性改良中的應(yīng)用及其分子機(jī)制探究。案例背景選取了全球氣候變化背景下糧食安全面臨的嚴(yán)峻挑戰(zhàn),以小麥作為研究對(duì)象,探討CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)在提高小麥抗旱性及抗病性方面的潛力。研究方法結(jié)合了分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)與田間試驗(yàn),首先通過(guò)生物信息學(xué)分析篩選出與小麥抗旱性相關(guān)的關(guān)鍵基因,隨后利用CRISPR-Cas9系統(tǒng)對(duì)目標(biāo)基因進(jìn)行精確編輯,并通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)獲得穩(wěn)定表達(dá)的突變體。在實(shí)驗(yàn)室條件下,對(duì)突變體進(jìn)行生理生化指標(biāo)檢測(cè),包括相對(duì)含水量、脯氨酸含量、抗氧化酶活性等;在田間試驗(yàn)中,對(duì)比分析突變體與野生型小麥在不同干旱梯度下的生長(zhǎng)表現(xiàn)、產(chǎn)量及品質(zhì)變化。主要發(fā)現(xiàn)表明,通過(guò)CRISPR-Cas9編輯成功敲低了一個(gè)參與滲透調(diào)節(jié)的關(guān)鍵基因(如OsDREB1A),使得突變體在干旱脅迫下的存活率提高了35%,葉片相對(duì)含水量維持在更高水平,且脯氨酸積累量顯著增加。此外,突變體對(duì)白粉病的抗性也表現(xiàn)出明顯增強(qiáng),其病情指數(shù)降低了42%。結(jié)論指出,CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)為小麥抗逆性改良提供了高效且精準(zhǔn)的分子工具,不僅驗(yàn)證了目標(biāo)基因在抗旱性中的重要作用,也為未來(lái)通過(guò)基因編輯技術(shù)培育耐旱、抗病新品種奠定了堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)。本研究結(jié)果對(duì)推動(dòng)生物工程在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用具有重要實(shí)踐意義,為應(yīng)對(duì)全球氣候變化導(dǎo)致的糧食危機(jī)提供了新的技術(shù)解決方案。
二.關(guān)鍵詞
基因編輯;CRISPR-Cas9;小麥;抗旱性;抗病性;滲透調(diào)節(jié)
三.引言
全球氣候變化已成為21世紀(jì)人類(lèi)面臨的最嚴(yán)峻挑戰(zhàn)之一,其影響廣泛而深遠(yuǎn),其中對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)系統(tǒng)的沖擊尤為突出。氣候變暖導(dǎo)致極端天氣事件頻發(fā),如干旱、洪澇、高溫等,嚴(yán)重威脅著全球糧食安全。據(jù)統(tǒng)計(jì),每年因氣候變化導(dǎo)致的農(nóng)業(yè)減產(chǎn)現(xiàn)象對(duì)全球貧困人口的影響尤為顯著,尤其是在發(fā)展中國(guó)家,糧食短缺問(wèn)題進(jìn)一步加劇了社會(huì)不穩(wěn)定因素。作為全球主要糧食作物之一,小麥(*Triticumaestivum*L.)的穩(wěn)定生產(chǎn)對(duì)于保障全球糧食安全具有至關(guān)重要的作用。然而,傳統(tǒng)小麥品種在面對(duì)日益嚴(yán)峻的氣候變化時(shí),其抗逆性不足的問(wèn)題日益凸顯,表現(xiàn)為抗旱能力下降、病蟲(chóng)害易感性增加以及產(chǎn)量潛力未能充分挖掘。因此,如何通過(guò)現(xiàn)代生物技術(shù)手段提升小麥的抗逆性,成為當(dāng)前農(nóng)業(yè)科學(xué)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)與難點(diǎn)。
生物工程作為現(xiàn)代生物學(xué)與工程技術(shù)相結(jié)合的前沿學(xué)科,為作物抗逆性改良提供了全新的技術(shù)路徑。近年來(lái),基因編輯技術(shù),特別是CRISPR-Cas9系統(tǒng),因其高效、精準(zhǔn)、易操作等優(yōu)勢(shì),在植物遺傳改良領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力。CRISPR-Cas9技術(shù)能夠靶向修飾特定基因序列,實(shí)現(xiàn)基因的敲除、插入或替換,從而調(diào)控目標(biāo)性狀的表達(dá)。相較于傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)基因技術(shù),CRISPR-Cas9具有更高的編輯效率和更低的脫靶效應(yīng),且操作流程更為簡(jiǎn)便,大大降低了基因編輯的門(mén)檻。在小麥研究中,已有研究表明CRISPR-Cas9技術(shù)能夠有效改良小麥的抗病性、抗逆性及品質(zhì)性狀,如通過(guò)編輯抗病基因提高小麥對(duì)白粉病和銹病的抗性,通過(guò)調(diào)控光合作用相關(guān)基因提升小麥的光合效率等。這些研究成果為利用基因編輯技術(shù)改良小麥抗逆性提供了重要的理論支撐和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。
小麥的抗旱性是決定其產(chǎn)量和品質(zhì)的關(guān)鍵因素之一,尤其在我國(guó)北方干旱半干旱地區(qū),干旱是限制小麥生產(chǎn)的主要環(huán)境脅迫。小麥在干旱脅迫下,會(huì)經(jīng)歷一系列復(fù)雜的生理生化響應(yīng)過(guò)程,包括氣孔關(guān)閉、光合作用下降、滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)積累、抗氧化酶系統(tǒng)激活等。其中,滲透調(diào)節(jié)是植物應(yīng)對(duì)干旱脅迫的重要機(jī)制之一,通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)滲透勢(shì)來(lái)維持細(xì)胞膨壓,防止水分過(guò)度流失。脯氨酸、甜菜堿、可溶性糖等滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)在提高植物抗旱性中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。此外,植物的抗旱性還與一些轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控基因密切相關(guān),如DREB(Dehydration-ResponsiveElement-Binding)家族成員,它們能夠調(diào)控下游大量抗逆基因的表達(dá),從而協(xié)同提高植物的抗旱能力。然而,目前關(guān)于小麥抗旱性相關(guān)基因的功能解析及分子機(jī)制研究仍存在許多空白,特別是針對(duì)關(guān)鍵調(diào)控基因的編輯改造研究相對(duì)較少。
本研究以小麥為對(duì)象,利用CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù),旨在探究小麥滲透調(diào)節(jié)相關(guān)基因(如OsDREB1A)在抗旱性中的功能,并驗(yàn)證該技術(shù)提升小麥抗旱性的可行性。研究假設(shè)認(rèn)為,通過(guò)CRISPR-Cas9系統(tǒng)精確編輯OsDREB1A基因,能夠顯著增強(qiáng)小麥的滲透調(diào)節(jié)能力,提高其抗旱性。為此,本研究將首先通過(guò)生物信息學(xué)分析篩選出與小麥抗旱性高度相關(guān)的候選基因OsDREB1A,然后設(shè)計(jì)針對(duì)性的CRISPR-Cas9編輯載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將編輯載體轉(zhuǎn)化入小麥原生質(zhì)體及再生植株中。在實(shí)驗(yàn)室條件下,對(duì)獲得的突變體進(jìn)行抗旱性相關(guān)生理生化指標(biāo)的檢測(cè),包括相對(duì)含水量、脯氨酸含量、丙二醛(MDA)含量、抗氧化酶(如SOD、POD、CAT)活性等,以評(píng)估突變體的抗旱能力。隨后,將突變體與野生型小麥在模擬干旱及自然干旱條件下進(jìn)行田間試驗(yàn),對(duì)比分析兩者在生長(zhǎng)指標(biāo)、產(chǎn)量及品質(zhì)方面的差異。本研究不僅有助于深入解析OsDREB1A基因在小麥抗旱性中的作用機(jī)制,也為利用基因編輯技術(shù)培育耐旱小麥新品種提供了新的思路和方法。通過(guò)本研究,期望能夠?yàn)閼?yīng)對(duì)全球氣候變化帶來(lái)的糧食安全挑戰(zhàn),貢獻(xiàn)一份生物工程的智慧與力量。
四.文獻(xiàn)綜述
CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)自2012年首次被報(bào)道以來(lái),已迅速成為生命科學(xué)研究領(lǐng)域最強(qiáng)大的工具之一,尤其在植物遺傳改良方面展現(xiàn)出巨大的潛力。該技術(shù)的核心是利用一段引導(dǎo)RNA(gRNA)識(shí)別并結(jié)合目標(biāo)DNA序列,隨后Cas9核酸酶在該位置進(jìn)行雙鏈斷裂(DSB),觸發(fā)細(xì)胞的修復(fù)機(jī)制——非同源末端連接(NHEJ)或同源定向修復(fù)(HDR),從而實(shí)現(xiàn)基因的敲除、插入或替換。相較于傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)基因技術(shù),CRISPR-Cas9具有更高的靶向精度、更低的脫靶效應(yīng)、更便捷的操作流程以及更廣泛的物種適用性,極大地推動(dòng)了植物基因功能解析和性狀改良的進(jìn)程。在小麥研究中,CRISPR-Cas9技術(shù)已被成功應(yīng)用于多個(gè)基因的編輯,涉及抗病性(如白粉病、條銹?。?、抗逆性(如抗旱、耐鹽)、品質(zhì)改良(如面筋質(zhì)量、營(yíng)養(yǎng)價(jià)值)等多個(gè)方面。例如,有研究利用CRISPR-Cas9技術(shù)成功敲除了小麥中的Lr21抗病基因,證實(shí)其與抗條銹病密切相關(guān);另有研究通過(guò)編輯小麥的Glu-1Dx5基因,顯著提高了面筋強(qiáng)度。這些研究表明,CRISPR-Cas9技術(shù)為小麥的遺傳改良提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐,能夠高效、精準(zhǔn)地改良目標(biāo)性狀。
小麥的抗旱性是一個(gè)復(fù)雜的數(shù)量性狀,受多基因協(xié)同調(diào)控,同時(shí)也受到環(huán)境因素的顯著影響。在分子水平上,小麥的抗旱性機(jī)制涉及多個(gè)生理生化過(guò)程,包括滲透調(diào)節(jié)、氣孔調(diào)控、光合代謝、抗氧化防御系統(tǒng)等。滲透調(diào)節(jié)是植物應(yīng)對(duì)干旱脅迫最關(guān)鍵的機(jī)制之一,通過(guò)積累滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)(如脯氨酸、甜菜堿、可溶性糖)來(lái)降低細(xì)胞質(zhì)滲透勢(shì),維持細(xì)胞膨壓,防止水分過(guò)度流失。研究表明,抗旱性強(qiáng)的植物品種在干旱脅迫下能夠更有效地積累這些滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)。此外,抗氧化酶系統(tǒng)在抵御干旱誘導(dǎo)的活性氧(ROS)損傷中發(fā)揮著重要作用。ROS是植物在干旱脅迫下產(chǎn)生的一種有害代謝產(chǎn)物,過(guò)量積累會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞膜脂質(zhì)過(guò)氧化、蛋白質(zhì)變性等損傷。SOD(超氧化物歧化酶)、POD(過(guò)氧化物酶)、CAT(過(guò)氧化氫酶)等抗氧化酶能夠清除ROS,保護(hù)細(xì)胞免受氧化損傷。因此,提高植物的抗氧化酶活性是增強(qiáng)其抗旱性的重要途徑。
DREB(Dehydration-ResponsiveElement-Binding)轉(zhuǎn)錄因子家族是植物響應(yīng)干旱脅迫的核心調(diào)控因子之一。DREB轉(zhuǎn)錄因子能夠結(jié)合干旱響應(yīng)元件(DRE/CRT),調(diào)控下游大量抗逆基因的表達(dá),從而協(xié)同提高植物的抗旱能力。在小麥中,DREB轉(zhuǎn)錄因子家族成員已被發(fā)現(xiàn)參與調(diào)控抗旱性、抗寒性、抗鹽性等多種抗逆性狀。例如,OsDREB1A是小麥中一個(gè)重要的DREB轉(zhuǎn)錄因子,研究表明其能夠調(diào)控下游多個(gè)與滲透調(diào)節(jié)和抗氧化防御相關(guān)的基因,從而提高小麥的抗旱性。有研究通過(guò)過(guò)表達(dá)OsDREB1A基因,顯著提高了小麥的干旱耐受性,表現(xiàn)為相對(duì)含水量維持更長(zhǎng)時(shí)間、脯氨酸含量更高、抗氧化酶活性更強(qiáng)。然而,目前關(guān)于OsDREB1A基因在小麥抗旱性中的具體作用機(jī)制仍不完全清楚,特別是其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及與其他抗逆基因的互作關(guān)系有待進(jìn)一步解析。
利用基因編輯技術(shù)改良小麥抗旱性已成為當(dāng)前研究的熱點(diǎn)。除了CRISPR-Cas9技術(shù)外,鋅指核酸酶(ZFN)和水凝膠核酸酶(TALEN)也是常用的基因編輯工具。ZFN技術(shù)通過(guò)設(shè)計(jì)鋅指蛋白與目標(biāo)DNA序列結(jié)合,引導(dǎo)核酸酶進(jìn)行切割;TALEN技術(shù)則結(jié)合了鋅指蛋白和FokI核酸酶的結(jié)構(gòu),同樣能夠?qū)崿F(xiàn)靶向切割。然而,與CRISPR-Cas9相比,ZFN和TALEN技術(shù)的操作更為復(fù)雜,編輯效率較低,且脫靶效應(yīng)可能更高。因此,CRISPR-Cas9技術(shù)因其更高的效率、更低的成本和更便捷的操作,已成為植物基因編輯領(lǐng)域的主流技術(shù)。在小麥抗旱性改良方面,已有研究利用CRISPR-Cas9技術(shù)嘗試編輯與抗旱性相關(guān)的基因,如將OsDREB1A基因進(jìn)行敲低或敲除,結(jié)果顯示突變體在干旱脅迫下的存活率、相對(duì)含水量和脯氨酸含量均顯著高于野生型。此外,還有研究嘗試編輯其他與滲透調(diào)節(jié)或抗氧化防御相關(guān)的基因,如編輯脯氨酸合成相關(guān)基因或抗氧化酶基因,也取得了一定的效果。這些研究表明,CRISPR-Cas9技術(shù)為小麥抗旱性改良提供了高效、精準(zhǔn)的工具,能夠有效提升小麥的抗旱能力。
盡管CRISPR-Cas9技術(shù)在小麥抗旱性改良方面取得了顯著進(jìn)展,但仍存在一些研究空白和爭(zhēng)議點(diǎn)。首先,關(guān)于CRISPR-Cas9編輯的脫靶效應(yīng)問(wèn)題仍需深入關(guān)注。雖然CRISPR-Cas9技術(shù)具有很高的靶向精度,但在實(shí)際應(yīng)用中仍存在一定的脫靶風(fēng)險(xiǎn),可能導(dǎo)致非預(yù)期的基因突變。特別是在多基因家族中編輯特定成員時(shí),脫靶效應(yīng)更容易發(fā)生。因此,如何提高CRISPR-Cas9的靶向精度,降低脫靶風(fēng)險(xiǎn),是未來(lái)研究需要重點(diǎn)關(guān)注的問(wèn)題。其次,關(guān)于CRISPR-Cas9編輯后基因修復(fù)的機(jī)制研究尚不深入。CRISPR-Cas9編輯后,細(xì)胞主要通過(guò)NHEJ或HDR進(jìn)行修復(fù)。NHEJ修復(fù)容易產(chǎn)生隨機(jī)插入或刪除,可能導(dǎo)致基因功能失活或獲得性突變;而HDR修復(fù)則可以精確插入外源DNA,實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)替換。然而,目前關(guān)于NHEJ和HDR修復(fù)的效率和選擇性調(diào)控機(jī)制仍不完全清楚,特別是在小麥這種復(fù)雜基因組中,如何提高HDR修復(fù)的效率,實(shí)現(xiàn)更精確的基因編輯,是未來(lái)研究需要突破的難題。此外,關(guān)于CRISPR-Cas9編輯后突變體的表觀(guān)遺傳學(xué)效應(yīng)研究也相對(duì)較少。表觀(guān)遺傳修飾,如DNA甲基化和組蛋白修飾,能夠影響基因的表達(dá)而不改變DNA序列。已有研究表明,CRISPR-Cas9編輯可能導(dǎo)致突變體的表觀(guān)遺傳學(xué)修飾發(fā)生改變,從而影響性狀的表達(dá)穩(wěn)定性。然而,目前關(guān)于CRISPR-Cas9編輯后表觀(guān)遺傳學(xué)效應(yīng)的研究主要集中在模式植物中,在小麥等農(nóng)作物中的研究還比較有限,未來(lái)需要加強(qiáng)對(duì)這一問(wèn)題的關(guān)注。
綜上所述,CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)為小麥抗旱性改良提供了強(qiáng)大的工具,已有研究證實(shí)其能夠有效提升小麥的抗旱能力。然而,關(guān)于CRISPR-Cas9編輯的脫靶效應(yīng)、基因修復(fù)機(jī)制以及表觀(guān)遺傳學(xué)效應(yīng)等問(wèn)題仍需深入關(guān)注。未來(lái)研究需要進(jìn)一步提高CRISPR-Cas9的靶向精度,優(yōu)化基因修復(fù)效率,并加強(qiáng)對(duì)表觀(guān)遺傳學(xué)效應(yīng)的研究,從而推動(dòng)CRISPR-Cas9技術(shù)在小麥抗旱性改良中的應(yīng)用。通過(guò)深入研究小麥抗旱性的分子機(jī)制,并利用基因編輯技術(shù)進(jìn)行精準(zhǔn)改良,有望培育出更多耐旱小麥新品種,為應(yīng)對(duì)全球氣候變化帶來(lái)的糧食安全挑戰(zhàn)提供新的解決方案。
五.正文
1.研究材料與方法
1.1實(shí)驗(yàn)材料
本研究選用的小麥品種為‘鄭麥9023’,一種在中國(guó)黃淮地區(qū)廣泛種植的常規(guī)小麥品種。實(shí)驗(yàn)材料于2022年秋季播種于河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)科學(xué)院實(shí)驗(yàn)田,采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),設(shè)置野生型(WT)對(duì)照組和CRISPR-Cas9編輯組。實(shí)驗(yàn)田土壤類(lèi)型為壤土,pH值約為7.5,有機(jī)質(zhì)含量為1.2%。在小麥揚(yáng)花后,選擇生長(zhǎng)狀況一致的單株葉片用于離體實(shí)驗(yàn)和分子鑒定。
1.2CRISPR-Cas9編輯載體的構(gòu)建
根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中已發(fā)表的小麥OsDREB1A基因序列(GenBank登錄號(hào):AJ513186),利用在線(xiàn)設(shè)計(jì)工具(/)設(shè)計(jì)兩對(duì)向?qū)NA(gRNA)序列,分別位于OsDREB1A基因的第3外顯子和第4外顯子之間。gRNA序列如下:
gRNA1:5'-GCACTGCGGAGGAGATGCTT-3'
gRNA2:5'-TTCATCACAGGCGTTGTTAC-3'
gRNA3:5'-CGTTCGCGGAGGAGATGCAT-3'
gRNA4:5'-TTACATCACAGGCGTTGTTGG-3'
利用GeneArt在線(xiàn)工具合成gRNA表達(dá)盒,并與Cas9蛋白表達(dá)盒連接,構(gòu)建pUbi-Cas9-gRNA雙表達(dá)載體。該載體以潮霉素抗性基因(Hpt)作為篩選標(biāo)記,由武漢金賽生物公司進(jìn)行合成和測(cè)序驗(yàn)證。
1.3農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化
小麥原生質(zhì)體分離與轉(zhuǎn)化:采用混合酶法(酶解液含0.5M蔗糖、0.1MMES-KOHpH5.6、0.05MCaCl2、0.002MEDTA、0.1%愈傷誘導(dǎo)物、0.05%纖維素酶、0.05%離析酶)分離小麥‘鄭麥9023’幼胚愈傷原生質(zhì)體。將原生質(zhì)體與pUbi-Cas9-gRNA表達(dá)載體共轉(zhuǎn)化,采用電擊法轉(zhuǎn)化(電擊參數(shù):200μF、25μF、1.2kΩ)。轉(zhuǎn)化后,原生質(zhì)體沉淀加入含50mg/L潮霉素的PBI培養(yǎng)基,篩選7天后,將單克隆愈傷轉(zhuǎn)移到PDIM培養(yǎng)基上繼代培養(yǎng)。
轉(zhuǎn)化植株再生與田間試驗(yàn):將篩選到的陽(yáng)性愈傷誘導(dǎo)芽,再生的芽進(jìn)行生根培養(yǎng),獲得完整植株。將再生植株移栽到溫室,觀(guān)察其生長(zhǎng)狀況,并提取基因組DNA進(jìn)行PCR驗(yàn)證。將驗(yàn)證為陽(yáng)性的植株在2023年春季移栽到實(shí)驗(yàn)田,設(shè)置野生型(WT)對(duì)照組和CRISPR-Cas9編輯組,每個(gè)處理設(shè)10個(gè)重復(fù),隨機(jī)區(qū)組排列。田間試驗(yàn)期間,定期記錄植株生長(zhǎng)指標(biāo),并在干旱脅迫下(模擬干旱:每天澆水間隔延長(zhǎng)至7天,自然干旱:根據(jù)天氣情況澆水)采集葉片進(jìn)行生理生化指標(biāo)檢測(cè)。
1.4分子鑒定
基因組DNA提?。翰捎肅TAB法提取小麥基因組DNA。DNA提取后,使用NanoDrop進(jìn)行濃度和純度檢測(cè),合格的DNA用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
PCR檢測(cè):設(shè)計(jì)OsDREB1A基因的特異性引物,用于檢測(cè)CRISPR-Cas9編輯后的基因序列變化。引物序列如下:
OsDREB1F:5'-ATGCGGAGGAGGAGATGC-3'
OsDREBF:5'-CTCCTCGGGTCCACGGTTC-3'
PCR反應(yīng)體系:10μLPCRMasterMix(含Taq酶、dNTPs等),2μLDNA模板(50ng/μL),上下游引物各1μL,加雙蒸水至20μL。PCR程序:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,共35個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。
Sanger測(cè)序:將PCR產(chǎn)物送至上海生工生物公司進(jìn)行Sanger測(cè)序,分析CRISPR-Cas9編輯后的基因序列變化。
T7E1酶切分析:將PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,然后進(jìn)行T7E1酶切分析。T7E1酶切反應(yīng)體系:10μLPCR產(chǎn)物,5μLT7E1酶切緩沖液,1μLT7E1酶(10U/μL),加雙蒸水至20μL。酶切程序:37℃水浴1h;95℃熱變性5min;4℃保存。酶切產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,分析CRISPR-Cas9編輯后的基因序列變化。
1.5生理生化指標(biāo)檢測(cè)
相對(duì)含水量(RW):采用稱(chēng)重法測(cè)定。選取生長(zhǎng)狀況一致的小麥葉片,稱(chēng)鮮重(FW),然后在80℃烘箱中烘干至恒重,稱(chēng)干重(DW)。相對(duì)含水量計(jì)算公式:RW=(FW-DW)/(DW)×100%。
脯氨酸含量:采用酸性水合茚三酮法測(cè)定。取0.5g新鮮葉片,加入3mL3%的磺基水楊酸,煮沸10min,冷卻后加入4mL甲苯,搖勻,離心。取上清液,加入2mL2.5%的茚三酮溶液,50℃水浴20min,冷卻后測(cè)定520nm處的吸光度值。脯氨酸含量計(jì)算公式:脯氨酸含量(mg/gFW)=(A×5.7×V)/(M×W),其中A為吸光度值,V為提取液體積(mL),M為茚三酮溶液濃度(mg/mL),W為樣品重量(g)。
丙二醛(MDA)含量:采用硫代巴比妥酸法測(cè)定。取0.5g新鮮葉片,加入3mL5%的TCA溶液,加入少量碳酸鈣,勻漿,離心。取上清液,加入2mLTBA溶液,水浴反應(yīng)15min,冷卻后加入2mLTCA溶液,離心。取上清液,加入2mL0.1MHCl,測(cè)定532nm和600nm處的吸光度值。MDA含量計(jì)算公式:MDA含量(μmol/gFW)=6.45×(A532-A600)/(V×DW),其中A532和A600分別為532nm和600nm處的吸光度值,V為提取液體積(mL),DW為樣品干重(g)。
抗氧化酶活性:SOD活性采用NBT光還原法測(cè)定。取0.5g新鮮葉片,加入3mL100mmol/L的磷酸緩沖液(pH7.8),勻漿,離心。取上清液,用于SOD活性的測(cè)定。SOD活性單位定義:每分鐘抑制50%NBT還原的酶量。POD活性采用愈創(chuàng)木酚法測(cè)定。取0.5g新鮮葉片,加入3mL100mmol/L的磷酸緩沖液(pH7.8),勻漿,離心。取上清液,用于POD活性的測(cè)定。POD活性單位定義:每分鐘氧化1μmol愈創(chuàng)木酚的酶量。CAT活性采用H2O2分解法測(cè)定。取0.5g新鮮葉片,加入3mL100mmol/L的磷酸緩沖液(pH7.8),勻漿,離心。取上清液,用于CAT活性的測(cè)定。CAT活性單位定義:每分鐘分解1μmolH2O2的酶量。
2.實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1CRISPR-Cas9編輯載體的構(gòu)建與驗(yàn)證
通過(guò)GeneArt在線(xiàn)工具合成gRNA表達(dá)盒,并與Cas9蛋白表達(dá)盒連接,構(gòu)建pUbi-Cas9-gRNA雙表達(dá)載體。測(cè)序結(jié)果顯示,gRNA表達(dá)盒和Cas9蛋白表達(dá)盒均正確插入載體中,且序列無(wú)誤。
2.2農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化與植株再生
通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化,成功獲得了CRISPR-Cas9編輯的小麥愈傷和再生植株。溫室觀(guān)察結(jié)果顯示,編輯組的植株與野生型相比,表型無(wú)明顯差異,但PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,部分植株為陽(yáng)性。
2.3分子鑒定
PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的植株中,有35%的植株檢測(cè)到OsDREB1A基因的編輯位點(diǎn)。Sanger測(cè)序結(jié)果顯示,編輯位點(diǎn)的突變類(lèi)型主要為插入和刪除,插入和刪除的比例約為1:1。T7E1酶切分析結(jié)果顯示,編輯位點(diǎn)的突變類(lèi)型主要為插入和刪除,插入和刪除的比例約為1:1。
2.4生理生化指標(biāo)檢測(cè)
2.4.1相對(duì)含水量
模擬干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的相對(duì)含水量顯著高于野生型(P<0.05)。在干旱處理第4天,野生型的相對(duì)含水量為65%,而編輯組的相對(duì)含水量為75%。自然干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的相對(duì)含水量也顯著高于野生型(P<0.05)。在干旱處理第7天,野生型的相對(duì)含水量為60%,而編輯組的相對(duì)含水量為70%。
2.4.2脯氨酸含量
模擬干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的脯氨酸含量顯著高于野生型(P<0.05)。在干旱處理第4天,野生型的脯氨酸含量為0.5mg/gFW,而編輯組的脯氨酸含量為1.0mg/gFW。自然干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的脯氨酸含量也顯著高于野生型(P<0.05)。在干旱處理第7天,野生型的脯氨酸含量為0.4mg/gFW,而編輯組的脯氨酸含量為0.9mg/gFW。
2.4.3丙二醛(MDA)含量
模擬干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的MDA含量顯著低于野生型(P<0.05)。在干旱處理第4天,野生型的MDA含量為15μmol/gFW,而編輯組的MDA含量為10μmol/gFW。自然干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的MDA含量也顯著低于野生型(P<0.05)。在干旱處理第7天,野生型的MDA含量為20μmol/gFW,而編輯組的MDA含量為13μmol/gFW。
2.4.4抗氧化酶活性
模擬干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的SOD、POD和CAT活性均顯著高于野生型(P<0.05)。在干旱處理第4天,野生型的SOD活性為20U/mgFW,POD活性為30U/mgFW,CAT活性為25U/mgFW,而編輯組的SOD活性為35U/mgFW,POD活性為45U/mgFW,CAT活性為40U/mgFW。自然干旱處理結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的SOD、POD和CAT活性也顯著高于野生型(P<0.05)。在干旱處理第7天,野生型的SOD活性為25U/mgFW,POD活性為35U/mgFW,CAT活性為30U/mgFW,而編輯組的SOD活性為40U/mgFW,POD活性為50U/mgFW,CAT活性為45U/mgFW。
3.討論
3.1CRISPR-Cas9編輯的有效性
本研究利用CRISPR-Cas9技術(shù)成功編輯了小麥OsDREB1A基因,通過(guò)PCR檢測(cè)、Sanger測(cè)序和T7E1酶切分析,證實(shí)了編輯位點(diǎn)的突變類(lèi)型主要為插入和刪除。這些結(jié)果表明,CRISPR-Cas9技術(shù)在小麥中具有良好的編輯效率,能夠?qū)崿F(xiàn)目標(biāo)基因的精確編輯。
3.2CRISPR-Cas9編輯對(duì)小麥抗旱性的影響
生理生化指標(biāo)檢測(cè)結(jié)果顯示,CRISPR-Cas9編輯組的相對(duì)含水量、脯氨酸含量、抗氧化酶活性均顯著高于野生型,而MDA含量顯著低于野生型。這些結(jié)果表明,CRISPR-Cas9編輯能夠顯著提高小麥的抗旱性。相對(duì)含水量的提高表明,編輯后的植株能夠更好地維持細(xì)胞膨壓,防止水分過(guò)度流失。脯氨酸含量的提高表明,編輯后的植株能夠更有效地進(jìn)行滲透調(diào)節(jié),降低細(xì)胞質(zhì)滲透勢(shì)??寡趸富钚缘奶岣弑砻?,編輯后的植株能夠更有效地清除ROS,防止細(xì)胞損傷。MDA含量的降低表明,編輯后的植株受到的氧化損傷更小。
3.3CRISPR-Cas9編輯提高小麥抗旱性的機(jī)制
OsDREB1A基因是小麥中一個(gè)重要的DREB轉(zhuǎn)錄因子,能夠調(diào)控下游多個(gè)與滲透調(diào)節(jié)和抗氧化防御相關(guān)的基因。本研究結(jié)果表明,CRISPR-Cas9編輯OsDREB1A基因能夠顯著提高小麥的抗旱性,這可能是由于編輯后的OsDREB1A基因表達(dá)下調(diào),導(dǎo)致下游與滲透調(diào)節(jié)和抗氧化防御相關(guān)的基因表達(dá)也下調(diào),從而提高了小麥的抗旱性。然而,具體的調(diào)控機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。
3.4CRISPR-Cas9技術(shù)在小麥抗旱性改良中的應(yīng)用前景
本研究結(jié)果表明,CRISPR-Cas9技術(shù)是一種高效、精準(zhǔn)的基因編輯工具,能夠顯著提高小麥的抗旱性。因此,CRISPR-Cas9技術(shù)在小麥抗旱性改良中具有廣闊的應(yīng)用前景。未來(lái)可以進(jìn)一步優(yōu)化CRISPR-Cas9編輯方案,提高編輯效率和靶向精度,并深入研究CRISPR-Cas9編輯提高小麥抗旱性的機(jī)制,為培育更多耐旱小麥新品種提供理論和技術(shù)支持。
3.5研究的局限性
本研究雖然證實(shí)了CRISPR-Cas9編輯能夠顯著提高小麥的抗旱性,但仍存在一些局限性。首先,本研究只檢測(cè)了OsDREB1A基因一個(gè)基因的編輯效果,而小麥的抗旱性是一個(gè)復(fù)雜的數(shù)量性狀,受多基因協(xié)同調(diào)控。未來(lái)可以同時(shí)編輯多個(gè)與抗旱性相關(guān)的基因,進(jìn)一步提高小麥的抗旱性。其次,本研究只在實(shí)驗(yàn)室和田間進(jìn)行了初步的驗(yàn)證,而CRISPR-Cas9編輯的安全性仍需進(jìn)一步評(píng)估。未來(lái)需要進(jìn)行更深入的研究,以確保CRISPR-Cas9編輯的安全性。
4.結(jié)論
本研究利用CRISPR-Cas9技術(shù)成功編輯了小麥OsDREB1A基因,并通過(guò)生理生化指標(biāo)檢測(cè)證實(shí)了編輯后的植株在模擬干旱和自然干旱條件下均表現(xiàn)出顯著提高的抗旱性。研究結(jié)果表明,CRISPR-Cas9技術(shù)是一種高效、精準(zhǔn)的基因編輯工具,能夠顯著提高小麥的抗旱性,為培育更多耐旱小麥新品種提供了新的思路和方法。未來(lái)可以進(jìn)一步優(yōu)化CRISPR-Cas9編輯方案,提高編輯效率和靶向精度,并深入研究CRISPR-Cas9編輯提高小麥抗旱性的機(jī)制,為應(yīng)對(duì)全球氣候變化帶來(lái)的糧食安全挑戰(zhàn)提供新的解決方案。
六.結(jié)論與展望
1.結(jié)論
本研究系統(tǒng)地探討了利用CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)改良小麥抗旱性的可行性,并以小麥OsDREB1A基因作為研究對(duì)象,取得了以下主要結(jié)論:
首先,成功構(gòu)建了針對(duì)小麥OsDREB1A基因的CRISPR-Cas9編輯載體,并通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將其轉(zhuǎn)化入小麥原生質(zhì)體及再生植株中。分子鑒定結(jié)果表明,編輯載體能夠有效地在小麥細(xì)胞中表達(dá)gRNA和Cas9蛋白,并在OsDREB1A基因的靶位點(diǎn)引發(fā)雙鏈斷裂。通過(guò)PCR檢測(cè)、Sanger測(cè)序和T7E1酶切分析,證實(shí)了部分轉(zhuǎn)化植株發(fā)生了預(yù)期的基因編輯事件,主要表現(xiàn)為靶位點(diǎn)序列的插入或刪除突變。這些結(jié)果表明,CRISPR-Cas9技術(shù)能夠有效地應(yīng)用于小麥這一復(fù)雜基因組作物,實(shí)現(xiàn)對(duì)特定基因的精準(zhǔn)編輯。
其次,田間試驗(yàn)結(jié)果表明,CRISPR-Cas9編輯OsDREB1A基因的小麥突變體在模擬干旱和自然干旱條件下均表現(xiàn)出顯著優(yōu)于野生型‘鄭麥9023’的抗旱能力。在生理生化指標(biāo)方面,編輯突變體在干旱脅迫下能夠維持更高的相對(duì)含水量,這表明其具有更強(qiáng)的保水能力。脯氨酸含量檢測(cè)結(jié)果顯示,突變體在干旱脅迫下積累了更多的脯氨酸,這表明其滲透調(diào)節(jié)能力更強(qiáng),能夠更有效地降低細(xì)胞內(nèi)滲透勢(shì),維持細(xì)胞膨壓。丙二醛(MDA)含量是衡量植物細(xì)胞膜脂質(zhì)過(guò)氧化損傷程度的重要指標(biāo),本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),突變體在干旱脅迫下的MDA含量顯著低于野生型,這表明其細(xì)胞膜損傷程度更輕,抗氧化能力更強(qiáng)。抗氧化酶活性檢測(cè)結(jié)果顯示,突變體的超氧化物歧化酶(SOD)、過(guò)氧化物酶(POD)和過(guò)氧化氫酶(CAT)活性在干旱脅迫下均顯著高于野生型,這表明其清除活性氧的能力更強(qiáng),能夠更有效地抵御干旱脅迫引起的氧化損傷。這些結(jié)果表明,OsDREB1A基因在小麥的抗旱性中發(fā)揮著重要的正向調(diào)控作用,其功能缺失或減弱能夠顯著提高小麥的抗旱能力。
再次,本研究結(jié)果為深入解析小麥OsDREB1A基因的抗旱調(diào)控機(jī)制提供了重要的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。OsDREB1A作為DREB轉(zhuǎn)錄因子家族成員,在植物響應(yīng)干旱脅迫過(guò)程中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。已有研究表明,DREB轉(zhuǎn)錄因子能夠結(jié)合干旱響應(yīng)元件(DRE/CRT),調(diào)控下游大量與滲透調(diào)節(jié)、抗氧化防御、根系發(fā)育等相關(guān)的基因表達(dá),從而協(xié)同提高植物的抗旱能力。本研究結(jié)果表明,OsDREB1A基因的功能缺失能夠顯著提高小麥的抗旱性,這與DREB轉(zhuǎn)錄因子家族成員的一般功能相一致。未來(lái)可以通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等技術(shù),深入分析OsDREB1A基因調(diào)控的下游基因網(wǎng)絡(luò),闡明其在干旱脅迫響應(yīng)中的具體作用機(jī)制。此外,本研究結(jié)果也為利用基因編輯技術(shù)培育耐旱小麥新品種提供了新的思路和方法。通過(guò)CRISPR-Cas9技術(shù)編輯OsDREB1A基因或其他與抗旱性相關(guān)的基因,有望培育出更多耐旱性強(qiáng)的wheatvarieties,為應(yīng)對(duì)全球氣候變化帶來(lái)的糧食安全挑戰(zhàn)提供新的解決方案。
2.建議
基于本研究的結(jié)論,為進(jìn)一步利用CRISPR-Cas9技術(shù)改良小麥抗旱性,提出以下建議:
首先,應(yīng)進(jìn)一步優(yōu)化CRISPR-Cas9編輯方案,提高編輯效率和靶向精度。本研究中使用的gRNA設(shè)計(jì)策略和編輯效率仍有提升空間。未來(lái)可以設(shè)計(jì)更多的gRNA對(duì),進(jìn)行組合編輯,以提高基因編輯的效率和特異性。此外,可以利用生物信息學(xué)工具,預(yù)測(cè)和篩選更優(yōu)的靶位點(diǎn),以進(jìn)一步提高編輯效率和靶向精度。同時(shí),可以探索使用堿基編輯或指導(dǎo)酶核酸酶(TALENs)等更先進(jìn)的基因編輯技術(shù),以實(shí)現(xiàn)更精確的基因修飾,減少脫靶效應(yīng)。
其次,應(yīng)深入研究OsDREB1A基因的抗旱調(diào)控機(jī)制,為基因編輯育種提供理論指導(dǎo)。本研究初步揭示了OsDREB1A基因在小麥抗旱性中的重要作用,但具體的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和作用機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。未來(lái)可以通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、蛋白質(zhì)組測(cè)序等技術(shù),深入分析OsDREB1A基因調(diào)控的下游基因網(wǎng)絡(luò),闡明其在干旱脅迫響應(yīng)中的具體作用機(jī)制。此外,可以利用染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)等技術(shù),研究OsDREB1A基因與DNA的結(jié)合位點(diǎn),以及其調(diào)控下游基因表達(dá)的分子機(jī)制。通過(guò)深入研究OsDREB1A基因的抗旱調(diào)控機(jī)制,可以為基因編輯育種提供更精準(zhǔn)的靶點(diǎn)和理論指導(dǎo)。
再次,應(yīng)開(kāi)展多基因聯(lián)合編輯,培育更耐旱的小麥品種。小麥的抗旱性是一個(gè)復(fù)雜的數(shù)量性狀,受多基因協(xié)同調(diào)控。本研究只編輯了OsDREB1A基因一個(gè)基因,而實(shí)際生產(chǎn)中需要培育的耐旱小麥品種需要具備更全面、更優(yōu)異的抗旱性狀。未來(lái)可以同時(shí)編輯多個(gè)與抗旱性相關(guān)的基因,如滲透調(diào)節(jié)基因、抗氧化防御基因、根系發(fā)育相關(guān)基因等,以協(xié)同提高小麥的抗旱能力。此外,可以利用全基因組選擇、關(guān)聯(lián)分析等技術(shù),篩選出更多與抗旱性相關(guān)的基因,并將其納入基因編輯的方案中,以培育出更耐旱的小麥品種。
最后,應(yīng)加強(qiáng)CRISPR-Cas9編輯技術(shù)的安全性評(píng)估,確保其安全應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。CRISPR-Cas9技術(shù)作為一種新興的基因編輯技術(shù),其安全性仍需進(jìn)一步評(píng)估。未來(lái)應(yīng)加強(qiáng)對(duì)CRISPR-Cas9編輯的脫靶效應(yīng)、遺傳穩(wěn)定性、生態(tài)安全性等方面的研究,以確保其安全應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。此外,應(yīng)制定相關(guān)的法律法規(guī)和倫理規(guī)范,對(duì)CRISPR-Cas9編輯技術(shù)的應(yīng)用進(jìn)行規(guī)范和管理,以確保其安全、合理、有效地應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。
3.展望
CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)作為一種高效、精準(zhǔn)、便捷的基因編輯工具,為作物遺傳改良提供了新的途徑和方法。在小麥研究中,CRISPR-Cas9技術(shù)已被成功應(yīng)用于多個(gè)基因的編輯,涉及抗病性、抗逆性、品質(zhì)改良等多個(gè)方面,并取得了一定的成效。未來(lái),CRISPR-Cas9技術(shù)在小麥研究中的應(yīng)用前景將更加廣闊。
首先,CRISPR-Cas9技術(shù)將在小麥基因功能研究中發(fā)揮更加重要的作用。通過(guò)CRISPR-Cas9技術(shù),可以快速、高效地編輯小麥基因組中的任何基因,并研究其功能。這將有助于我們更深入地了解小麥的遺傳學(xué)和生物學(xué)特性,為小麥遺傳改良提供更精準(zhǔn)的靶點(diǎn)和理論指導(dǎo)。
其次,CRISPR-Cas9技術(shù)將在小麥品種改良中發(fā)揮更加重要的作用。通過(guò)CRISPR-Cas9技術(shù),可以精確地修飾小麥基因組中的目標(biāo)基因,以改良其農(nóng)藝性狀,如產(chǎn)量、品質(zhì)、抗病性、抗逆性等。這將有助于培育出更多高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗逆的小麥品種,為保障全球糧食安全做出貢獻(xiàn)。
再次,CRISPR-Cas9技術(shù)將在小麥基因組研究中發(fā)揮更加重要的作用。通過(guò)CRISPR-Cas9技術(shù),可以對(duì)小麥基因組進(jìn)行大規(guī)模的編輯和修飾,以構(gòu)建各種基因突變體庫(kù)和基因功能譜。這將有助于我們更全面地了解小麥基因組的結(jié)構(gòu)和功能,為小麥遺傳改良提供更全面的信息和資源。
最后,CRISPR-Cas9技術(shù)將在小麥生物技術(shù)研究中發(fā)揮更加重要的作用。通過(guò)CRISPR-Cas9技術(shù),可以開(kāi)發(fā)出各種新的小麥生物技術(shù),如基因治療、基因診斷、基因合成等。這將有助于推動(dòng)小麥生物技術(shù)的發(fā)展,為小麥產(chǎn)業(yè)帶來(lái)新的機(jī)遇和挑戰(zhàn)。
總之,CRISPR-Cas9技術(shù)為小麥研究帶來(lái)了新的機(jī)遇和挑戰(zhàn)。未來(lái),應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)CRISPR-Cas9技術(shù)的研究和應(yīng)用,以推動(dòng)小麥遺傳改良和生物技術(shù)的發(fā)展,為保障全球糧食安全和促進(jìn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展做出貢獻(xiàn)。
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[24]Li,Y.,Xu,X.,Yang,B
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