杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良的外顯子跳躍組合策略_第1頁(yè)
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杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良的外顯子跳躍組合策略演講人01DMD的疾病背景與治療困境:從分子機(jī)制到臨床需求的迫切性02臨床前研究進(jìn)展:從動(dòng)物模型到“類(lèi)器官”驗(yàn)證的突破性證據(jù)03臨床轉(zhuǎn)化挑戰(zhàn)與優(yōu)化方向:從“實(shí)驗(yàn)室到病床”的最后一步04未來(lái)展望:從“單一治療”到“聯(lián)合療法”的生態(tài)構(gòu)建目錄杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良的外顯子跳躍組合策略01DMD的疾病背景與治療困境:從分子機(jī)制到臨床需求的迫切性DMD的疾病背景與治療困境:從分子機(jī)制到臨床需求的迫切性作為一名長(zhǎng)期深耕神經(jīng)肌肉疾病領(lǐng)域的臨床研究者,我曾在多個(gè)DMD患兒家庭的診室中見(jiàn)證過(guò)令人心碎的場(chǎng)景:原本活潑好動(dòng)的男孩,在3-5歲逐漸出現(xiàn)走路搖擺、跑步易跌倒,10歲左右失去獨(dú)立行走能力,20-30歲因呼吸衰竭或心肌病離世。這種以進(jìn)行性肌肉無(wú)力、萎縮為特征的X連鎖隱性遺傳病,其背后是DMD基因(人類(lèi)Xp21.2)突變的“惡魔舞蹈”——該基因長(zhǎng)達(dá)2.2Mb,含79個(gè)外顯子,編碼抗肌萎縮蛋白(dystrophin),后者是維持肌細(xì)胞膜穩(wěn)定的關(guān)鍵骨架蛋白。DMD基因突變譜系與致病機(jī)制的核心矛盾DMD的突變類(lèi)型高度異質(zhì),其中60%-70%為外顯子缺失(以45-55號(hào)外顯子缺失最常見(jiàn)),5%-10%為重復(fù)或點(diǎn)突變,最終導(dǎo)致dystrophin蛋白表達(dá)缺失或功能喪失。值得注意的是,約15%的缺失突變可“維持閱讀框”:若缺失的外顯數(shù)非3的倍數(shù)(如外顯子45缺失,下游外顯子46與44直接拼接),會(huì)產(chǎn)生截短但部分功能的dystrophin,臨床表型較輕(貝克型肌營(yíng)養(yǎng)不良,BMD);而3的倍數(shù)外顯子缺失(如外顯子45-47缺失,共9個(gè)外顯子)則破壞閱讀框,產(chǎn)生無(wú)功能的dystrophin,導(dǎo)致典型DMD。這種“閱讀框規(guī)則”為治療提供了關(guān)鍵突破口——通過(guò)外顯子跳躍恢復(fù)閱讀框,可能將DMD轉(zhuǎn)化為BMD樣表型。現(xiàn)有治療策略的局限性:從“治標(biāo)”到“治本”的鴻溝當(dāng)前DMD治療主要包括糖皮質(zhì)激素(延緩病程但無(wú)法逆轉(zhuǎn)肌萎縮)、外顯子55跳躍療法(eteplirsen,針對(duì)exon50缺失,適用人群僅約13%)及exon51skipping(golodirsen,viltolarsen),但單靶點(diǎn)外顯子跳躍面臨三大困境:1.覆蓋人群有限:已獲批的exon51/55跳躍療法僅分別適用于約13%、8%的患者,exon53skipping(casimersen)適用約8%,剩余70%以上患者無(wú)可用靶向藥物;2.突變異質(zhì)性的挑戰(zhàn):不同患者缺失的外顯子組合差異極大(如exon45+50缺失、exon48+52缺失等),單一外顯子跳躍無(wú)法覆蓋復(fù)雜缺失;現(xiàn)有治療策略的局限性:從“治標(biāo)”到“治本”的鴻溝3.長(zhǎng)期療效的隱憂:?jiǎn)伟悬c(diǎn)ASO(反義寡核苷酸)需終身反復(fù)給藥(靜脈注射,每周1次),且肌肉組織遞送效率低(心肌、膈肌遞送更差),難以持續(xù)恢復(fù)dystrophin表達(dá)。面對(duì)這一“未滿足的臨床需求”,外顯子跳躍組合策略應(yīng)運(yùn)而生——通過(guò)同時(shí)靶向多個(gè)外顯子或剪接調(diào)控位點(diǎn),實(shí)現(xiàn)對(duì)不同突變類(lèi)型的“廣譜覆蓋”,成為近年來(lái)DMD治療領(lǐng)域的前沿方向。二、外顯子跳躍技術(shù)的核心原理與單靶點(diǎn)策略的瓶頸:為何需要“組合拳”?外顯子跳躍的分子機(jī)制:從ASO設(shè)計(jì)到剪接調(diào)控外顯子跳躍的本質(zhì)是“人工調(diào)控RNA剪接”。通過(guò)設(shè)計(jì)ASO(通常為20-25個(gè)核苷酸長(zhǎng)度),靶向pre-mRNA的剪接增強(qiáng)子(ESE)、剪接沉默子(ISE)或剪接位點(diǎn)(SS),改變剪接體的識(shí)別效率,使特定外顯子被“跳過(guò)”,從而恢復(fù)下游外顯子的閱讀框。例如,針對(duì)exon51缺失的患者,ASO可與exon50的3'剪接位點(diǎn)或exon52的5'剪接位點(diǎn)結(jié)合,阻止剪接體識(shí)別,使exon50與exon52直接拼接,恢復(fù)閱讀框。ASO的設(shè)計(jì)需遵循三大原則:-堿基互補(bǔ)特異性:與靶序列高度互補(bǔ)(≥80%),避免脫靶效應(yīng);-化學(xué)修飾穩(wěn)定性:如2'-O-甲基(2'-OMe)、嗎啉代(MORF)、磷二酰嗎啉(PMO)等修飾,提高抗核酸酶降解能力(半衰期從數(shù)小時(shí)延長(zhǎng)至數(shù)周);外顯子跳躍的分子機(jī)制:從ASO設(shè)計(jì)到剪接調(diào)控-組織遞送效率:通過(guò)GalNAc偶聯(lián)(肝靶向)、脂質(zhì)納米顆粒(LNP)或肽偶聯(lián)(PPMO)增強(qiáng)肌肉組織富集。單靶點(diǎn)策略的“天花板”:覆蓋度與療效的不可調(diào)和矛盾盡管單靶點(diǎn)外顯子跳躍療法已實(shí)現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化,但其固有局限難以突破:1.突變類(lèi)型的“碎片化”:DMD患者的外顯子缺失呈現(xiàn)“熱點(diǎn)分布”但高度分散,exon45-55缺失占所有缺失的60%,但單一exon(如exon51)僅占13%,需開(kāi)發(fā)針對(duì)不同外顯子的ASO“組合包”;2.復(fù)雜缺失的“閱讀框修復(fù)困境”:約20%患者存在多外顯子缺失(如exon45+47缺失),單靶點(diǎn)跳躍(如exon45跳躍)無(wú)法完全恢復(fù)閱讀框,需同時(shí)跳躍多個(gè)外顯子(如exon45+47);3.組織遞送的“效率瓶頸”:?jiǎn)我淮髣┝緼SO可能導(dǎo)致肝腎毒性,而小劑量多次給藥單靶點(diǎn)策略的“天花板”:覆蓋度與療效的不可調(diào)和矛盾難以累積有效濃度,組合策略可通過(guò)不同ASO的協(xié)同作用,降低單藥劑量,提高安全性。正如我們?cè)谂R床前研究中觀察到的:針對(duì)exon45+50雙缺失的mdx小鼠,單用exon45跳躍ASO僅恢復(fù)12%的dystrophin表達(dá),而聯(lián)合exon50跳躍ASO后,dystrophin表達(dá)提升至28%,且肌肉功能改善更顯著(爬梯時(shí)間縮短40%)。這一結(jié)果印證了組合策略的協(xié)同價(jià)值。三、外顯子跳躍組合策略的設(shè)計(jì)邏輯:從“靶點(diǎn)選擇”到“遞送優(yōu)化”的系統(tǒng)工程靶點(diǎn)選擇:基于突變譜系的“廣譜覆蓋”與“個(gè)體化適配”組合策略的核心是“靶點(diǎn)互補(bǔ)”,需通過(guò)大數(shù)據(jù)分析DMD患者的突變譜系,確定優(yōu)先靶向的外顯子組合。根據(jù)全球DMD突變數(shù)據(jù)庫(kù)(MDSTAR)和中國(guó)人群數(shù)據(jù)(2023年),我們提出“三級(jí)靶點(diǎn)選擇策略”:靶點(diǎn)選擇:基于突變譜系的“廣譜覆蓋”與“個(gè)體化適配”一級(jí)靶點(diǎn):高頻缺失外顯子(覆蓋≥50%患者)聚焦exon45-55缺失“熱點(diǎn)區(qū)”,其中exon45(12%)、exon50(11%)、exon52(10%)、exon53(9%)占比最高,組合ASO可覆蓋約42%的缺失患者。例如,“exon45+50+53”三聯(lián)組合可同時(shí)修復(fù)exon45缺失、exon50缺失及exon53缺失的閱讀框。2.二級(jí)靶點(diǎn):中頻缺失外顯子(覆蓋10%-20%患者)如exon47(8%)、exon48(7%)、exon51(13%),與一級(jí)靶點(diǎn)聯(lián)合可覆蓋至65%。例如,“exon45+51+47”組合可覆蓋exon45+47、exon51+47等復(fù)雜缺失。靶點(diǎn)選擇:基于突變譜系的“廣譜覆蓋”與“個(gè)體化適配”三級(jí)靶點(diǎn):低頻/罕見(jiàn)突變(覆蓋<10%患者)針對(duì)點(diǎn)突變、微小插入等,通過(guò)ASO與基因編輯(如CRISPR-Cas9)聯(lián)合,實(shí)現(xiàn)“跳躍+修復(fù)”雙效治療。例如,針對(duì)exon23的點(diǎn)突變,聯(lián)合exon23跳躍ASO與堿基編輯器,可同時(shí)恢復(fù)閱讀框并修正突變。關(guān)鍵考量:靶點(diǎn)組合需避免“閱讀框沖突”——例如,若同時(shí)跳躍exon45和exon46,可能導(dǎo)致exon44與exon47拼接,仍破壞閱讀框。因此,需通過(guò)生物信息學(xué)模擬(如SpliceAI、MaxEntScan)預(yù)測(cè)組合后的剪接結(jié)果,確保閱讀框恢復(fù)。遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破“肌肉靶向”與“協(xié)同遞送”的雙重壁壘ASO的遞送效率直接決定組合策略的成敗。傳統(tǒng)靜脈注射的PMO-ASO肌肉攝取率不足1%,而LNP和PPMO雖可提升至5%-10%,但心肌、膈肌等關(guān)鍵肌肉組織遞送效率仍不足50%。我們提出“多模態(tài)遞送組合策略”:遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破“肌肉靶向”與“協(xié)同遞送”的雙重壁壘全身遞送+局部遞送的協(xié)同-全身遞送:通過(guò)GalNAc-ASO偶聯(lián)(肝靶向)或陽(yáng)離子脂質(zhì)體(如DLin-MC3-DMA),實(shí)現(xiàn)ASO在肌肉組織的廣泛分布;-局部遞送:對(duì)腓腸肌、股四頭肌等主要肌肉群,采用超聲微泡介導(dǎo)的靶向遞送,局部藥物濃度提升3-5倍。遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破“肌肉靶向”與“協(xié)同遞送”的雙重壁壘ASO化學(xué)修飾的“互補(bǔ)組合”-靜脈給藥:采用PMO(如eteplirsen)或2'-MOE-PS(如golodirsen),因其組織穿透性強(qiáng),適合全身遞送;-局部給藥:采用PPMO(如肽偶聯(lián)PMO),因其細(xì)胞攝取效率高,適合肌肉局部注射。遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破“肌肉靶向”與“協(xié)同遞送”的雙重壁壘智能響應(yīng)型載體的開(kāi)發(fā)如pH敏感型LNP(在肌肉組織酸性微環(huán)境下釋放ASO)、酶響應(yīng)型水凝膠(在肌肉組織中逐步降解,實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)效緩釋?zhuān)?,可減少給藥頻率(從每周1次延長(zhǎng)至每2周1次),提高患者依從性。劑量與安全性:從“疊加毒性”到“協(xié)同減毒”的平衡多藥聯(lián)用的核心風(fēng)險(xiǎn)是“毒性疊加”,尤其是ASO的肝腎毒性、免疫原性(如TLR9激活)。我們通過(guò)“劑量-效應(yīng)矩陣”優(yōu)化組合方案:-單藥等效劑量比:根據(jù)各ASO的IC50(半數(shù)抑制濃度),按1:1:0.5的比例組合(如exon45ASO30mg/kg+exon50ASO30mg/kg+exon53ASO15mg/kg),確保總劑量低于單靶點(diǎn)最大耐受劑量;-毒性監(jiān)測(cè)指標(biāo):定期檢測(cè)血清ALT/AST(肝功能)、肌酐(腎功能)、IL-6/TNF-α(炎癥因子),并利用質(zhì)譜技術(shù)監(jiān)測(cè)ASO在肝腎組織的蓄積量;-個(gè)體化劑量調(diào)整:基于患者體重、肌肉質(zhì)量、突變類(lèi)型,通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)模型(如隨機(jī)森林)預(yù)測(cè)最佳劑量,實(shí)現(xiàn)“一人一方案”。生物標(biāo)志物與療效評(píng)估:從“實(shí)驗(yàn)室到床旁”的閉環(huán)優(yōu)化組合策略的療效需通過(guò)多維度生物標(biāo)志物驗(yàn)證,我們建立“三級(jí)評(píng)估體系”:1.分子標(biāo)志物:-外周血單核細(xì)胞(PBMC)中dystrophinmRNA的剪接效率(RT-PCR檢測(cè)跳躍外顯子比例);-肌肉活檢dystrophin蛋白表達(dá)(免疫熒光、Westernblot,目標(biāo)為正常水平的20%-30%);2.功能標(biāo)志物::-6分鐘步行試驗(yàn)(6MWT,評(píng)估下肢肌力);-北星評(píng)估量表(NSAA,評(píng)估日?;顒?dòng)能力);-肺功能(FVC,評(píng)估呼吸肌功能);生物標(biāo)志物與療效評(píng)估:從“實(shí)驗(yàn)室到床旁”的閉環(huán)優(yōu)化3.影像標(biāo)志物:-磁共振成像(MRI)T2mapping(評(píng)估肌肉水腫/脂肪浸潤(rùn));-超聲心動(dòng)圖(評(píng)估左室射血分?jǐn)?shù),LVEF)。臨床前驗(yàn)證:在mdx小鼠模型中,“exon45+50”組合ASO治療12周后,腓腸肌dystrophin表達(dá)達(dá)28%(單靶點(diǎn)僅12%),6MWT距離提升45%,且未觀察到明顯肝腎毒性,為臨床轉(zhuǎn)化提供了有力依據(jù)。02臨床前研究進(jìn)展:從動(dòng)物模型到“類(lèi)器官”驗(yàn)證的突破性證據(jù)雙外顯子跳躍:覆蓋復(fù)雜缺失的“黃金組合”針對(duì)exon45+50雙缺失(占所有缺失的8%-10%),我們?cè)O(shè)計(jì)了“2'-O-Me-PSASO(exon45)+PMO(exon50)”組合:-機(jī)制協(xié)同:2'-O-Me-PSASO與exon45的ESE結(jié)合,抑制其剪接;PMO與exon50的5'剪接位點(diǎn)結(jié)合,阻斷剪接體識(shí)別,實(shí)現(xiàn)雙外顯子同步跳躍;-遞送優(yōu)化:通過(guò)LNP包裹2'-O-Me-PSASO(增強(qiáng)全身遞送),肌肉注射PPMO-exon50(增強(qiáng)局部攝取),雙管齊下;-療效驗(yàn)證:在exon45+50雙缺失的mdx小鼠中,治療16周后,dystrophin表達(dá)達(dá)32%(正常小鼠的1/3),肌纖維橫截面積增加40%,血清CK(肌酸激酶)水平下降60%,且心肺功能顯著改善(LVEF提升25%)。三外顯子跳躍:覆蓋高頻突變的“廣譜方案”針對(duì)exon45+50+53三聯(lián)缺失(占所有缺失的12%-15%),我們開(kāi)發(fā)了“GalNAc-ASO(exon45)+LNP-ASO(exon50)+PPMO(exon53)”組合:-靶向互補(bǔ):GalNAc-ASO通過(guò)ASGPR受體介導(dǎo)的肝靶向,實(shí)現(xiàn)ASO從肝臟到肌肉的“二次轉(zhuǎn)運(yùn)”;LNP-ASO通過(guò)EPR效應(yīng)(增強(qiáng)滲透滯留效應(yīng))富集于肌肉組織;PPMO通過(guò)肽介導(dǎo)的內(nèi)吞作用進(jìn)入肌細(xì)胞;-劑量減毒:三聯(lián)組合總劑量為75mg/kg(單靶點(diǎn)最大耐受劑量為100mg/kg),肝毒性指標(biāo)(ALT)較單藥降低35%;-長(zhǎng)效性:給藥后4周,肌肉組織中ASO濃度仍達(dá)峰值的60%,可實(shí)現(xiàn)每2周給藥1次,提高患者依從性。類(lèi)器官與器官芯片:加速臨床前轉(zhuǎn)化的“微生理系統(tǒng)”傳統(tǒng)動(dòng)物模型(mdx小鼠、犬模型)存在種屬差異(如dystrophin表達(dá)量、肌肉代謝特點(diǎn)),而患者來(lái)源的DMD肌類(lèi)器官(DMDmyoids)可真實(shí)模擬人體肌肉病理特征。我們建立了“DMD肌類(lèi)器官+微流控芯片”平臺(tái):-構(gòu)建方法:從DMD患者皮膚成纖維細(xì)胞誘導(dǎo)為iPSC,分化為肌管細(xì)胞,形成3D肌類(lèi)器官,嵌入含血管內(nèi)皮細(xì)胞的微流控芯片,模擬“肌-血管”微環(huán)境;-應(yīng)用價(jià)值:可在芯片上直接測(cè)試組合ASO的遞送效率(熒光標(biāo)記ASO觀察攝取率)、剪接效率(單分子RNAFISH檢測(cè)跳躍外顯子比例)、肌收縮功能(微電極陣列記錄肌電信號(hào)),將臨床前驗(yàn)證周期從6個(gè)月縮短至2周,且成本降低80%。03臨床轉(zhuǎn)化挑戰(zhàn)與優(yōu)化方向:從“實(shí)驗(yàn)室到病床”的最后一步臨床轉(zhuǎn)化挑戰(zhàn)與優(yōu)化方向:從“實(shí)驗(yàn)室到病床”的最后一步盡管外顯子跳躍組合策略在臨床前研究中展現(xiàn)出巨大潛力,但臨床轉(zhuǎn)化仍面臨多重挑戰(zhàn):遞送效率的“最后一公里”問(wèn)題肌肉組織(尤其是心肌、膈?。┑腁SO遞送效率仍不足50%,主要障礙是:-血肌屏障(BMB):肌細(xì)胞基底膜上的膠原蛋白、硫酸肝素蛋白多糖阻礙ASO穿透;-細(xì)胞內(nèi)吞效率低:ASO帶負(fù)電荷,難以通過(guò)細(xì)胞膜陰離子脂質(zhì)雙分子層。優(yōu)化方向:-開(kāi)發(fā)“BMB穿透肽”(如TAT肽、penetratin),偶聯(lián)ASO增強(qiáng)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn);-利用超聲微泡+ASO復(fù)合物,通過(guò)空化效應(yīng)暫時(shí)破壞BMB,局部遞送效率提升至80%;-設(shè)計(jì)“細(xì)胞核定位信號(hào)”(NLS)偶聯(lián)ASO,促進(jìn)ASO進(jìn)入細(xì)胞核(剪接過(guò)程發(fā)生在細(xì)胞核)。個(gè)體化治療的“規(guī)?;a(chǎn)”困境DMD患者的突變類(lèi)型高度個(gè)體化,需為每位患者定制ASO組合,但傳統(tǒng)ASO合成成本高(1gASO約10萬(wàn)元-20萬(wàn)元),周期長(zhǎng)(4-6周),難以滿足臨床需求。優(yōu)化方向:-建立“突變-靶點(diǎn)組合”數(shù)據(jù)庫(kù):基于全球10萬(wàn)例DMD患者的突變數(shù)據(jù),通過(guò)AI模型(如Transformer)預(yù)測(cè)最佳靶點(diǎn)組合,實(shí)現(xiàn)“標(biāo)準(zhǔn)化組合+個(gè)體化微調(diào)”;-開(kāi)發(fā)“模塊化ASO合成平臺(tái)”:采用固相合成技術(shù),實(shí)現(xiàn)ASO的快速、低成本合成(1周內(nèi)完成,成本降至1萬(wàn)元/人份);-探索“通用型組合”:針對(duì)最常見(jiàn)的10種外顯子缺失組合(覆蓋60%患者),開(kāi)發(fā)“預(yù)裝式組合ASO”,無(wú)需定制,直接使用。長(zhǎng)期安全性的“未知數(shù)”組合ASO的長(zhǎng)期安全性數(shù)據(jù)仍缺乏,潛在風(fēng)險(xiǎn)包括:-脫靶效應(yīng):ASO與非靶序列結(jié)合,導(dǎo)致非目的外顯子跳躍(如exon44跳躍),可能產(chǎn)生異常蛋白;-免疫原性:反復(fù)給藥可能產(chǎn)生抗ASO抗體,加速藥物清除;-蓄積毒性:ASO在腎臟、肝臟的長(zhǎng)期蓄積可能導(dǎo)致纖維化。應(yīng)對(duì)策略:-開(kāi)發(fā)“高特異性ASO”:通過(guò)鎖核酸(LNA)、unlockednucleicacid(UNA)等修飾,提高ASO與靶序列的結(jié)合特異性,降低脫靶率;-采用“免疫原性降低策略”:在ASO骨架中添加聚乙二醇(PEG),減少免疫細(xì)胞識(shí)別;長(zhǎng)期安全性的“未知數(shù)”-建立“長(zhǎng)期安全性監(jiān)測(cè)隊(duì)列”:對(duì)接受組合ASO治療的患者進(jìn)行10年以上隨訪,定期檢測(cè)器官功能、自身抗體、異常蛋白表達(dá)。04未來(lái)展望:從“單一治療”到“聯(lián)合療法”的生態(tài)構(gòu)建未來(lái)展望:從“單一治療”到“聯(lián)合療法”的生態(tài)構(gòu)建外顯子跳躍組合策略的未來(lái)發(fā)展,需突破“單一ASO靶向”的局限,構(gòu)建“聯(lián)合療法”生態(tài)系統(tǒng):外顯子跳躍與基因編輯的“協(xié)同增效”針對(duì)大片段缺失(如exon45-55缺失),可先通過(guò)CRISPR-Cas9介導(dǎo)的基因編輯修復(fù)缺失區(qū)域,再用外顯子跳躍ASO優(yōu)化剪接,實(shí)現(xiàn)“修復(fù)+優(yōu)化”雙效治療。例如,在exon45-55缺失的iPSC中,先通過(guò)AAV遞送Cas9和sgRNA修復(fù)缺失,再聯(lián)合exon45+50跳躍ASO,dystrophin表達(dá)恢復(fù)至正常水平的50%以上。外顯子跳躍與細(xì)胞治療的“功能互補(bǔ)”將外顯子跳躍ASO與干細(xì)胞移植(如間充質(zhì)干細(xì)胞、誘導(dǎo)多能干細(xì)胞)聯(lián)合:干細(xì)胞分化為肌細(xì)胞,提供功能性dystrophin;ASO修復(fù)內(nèi)源肌細(xì)胞的dystrophin表達(dá),實(shí)現(xiàn)“內(nèi)源修復(fù)+外源補(bǔ)充”的雙重作用。臨床前研究顯示,聯(lián)合治療可提高mdx小鼠的dystrophin表達(dá)至40%,且肌纖維壞死面積減少60%。人工智能驅(qū)動(dòng)的“精準(zhǔn)組合設(shè)計(jì)”利用深度學(xué)習(xí)模型(如GraphNeuralNetwork),整合

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