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生化專業(yè)常用英文縮寫(xiě)及應(yīng)用指導(dǎo)手冊(cè)引言在生物化學(xué)及分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)等交叉領(lǐng)域的研究與實(shí)踐中,英文縮寫(xiě)的廣泛使用極大提升了學(xué)術(shù)交流與文獻(xiàn)閱讀的效率。然而,縮寫(xiě)的多義性(如“AMP”既指腺苷一磷酸,也可能指代“氨芐青霉素”或“抗微管相關(guān)蛋白”)、領(lǐng)域特異性(如“RACE”在核酸領(lǐng)域指“快速擴(kuò)增cDNA末端”,在免疫學(xué)中可能關(guān)聯(lián)“受體編輯”相關(guān)概念),以及新縮寫(xiě)的持續(xù)涌現(xiàn),常導(dǎo)致理解偏差或操作失誤。本手冊(cè)聚焦生化核心領(lǐng)域,系統(tǒng)梳理核酸、蛋白質(zhì)、酶學(xué)、代謝通路、實(shí)驗(yàn)技術(shù)等方向的高頻縮寫(xiě),結(jié)合其全稱、定義內(nèi)涵、典型應(yīng)用場(chǎng)景展開(kāi)解析,為科研工作者、學(xué)生及技術(shù)人員提供精準(zhǔn)的縮寫(xiě)認(rèn)知與應(yīng)用參考,助力學(xué)術(shù)溝通的準(zhǔn)確性與科研實(shí)踐的規(guī)范性。一、核酸與基因相關(guān)縮寫(xiě)核酸(DNA、RNA)是遺傳信息的載體,其研究涉及大量序列、結(jié)構(gòu)及操作技術(shù)的縮寫(xiě),需結(jié)合分子生物學(xué)背景理解。1.DNA相關(guān)核心縮寫(xiě)gDNA(genomicDNA):基因組DNA。包含生物體全部遺傳信息的DNA(含外顯子、內(nèi)含子及調(diào)控序列),常用于基因定位、多態(tài)性分析(如全基因組測(cè)序、SNP檢測(cè))。dsDNA/ssDNA(double-stranded/single-strandedDNA):雙鏈/單鏈DNA。dsDNA是天然DNA的主要存在形式(如染色體);ssDNA在PCR引物、DNA測(cè)序(如Sanger法的測(cè)序引物結(jié)合單鏈模板)及重組技術(shù)(如M13噬菌體載體的單鏈文庫(kù)構(gòu)建)中應(yīng)用廣泛。2.RNA相關(guān)核心縮寫(xiě)mRNA(messengerRNA):信使RNA。攜帶基因編碼信息、指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的RNA,是轉(zhuǎn)錄組學(xué)(如RNA-seq)、翻譯調(diào)控研究的核心對(duì)象(如通過(guò)qPCR檢測(cè)mRNA豐度分析基因表達(dá))。rRNA(ribosomalRNA):核糖體RNA。與核糖體蛋白共同構(gòu)成核糖體,參與蛋白質(zhì)合成的催化與結(jié)構(gòu)支撐,其序列保守性常用于系統(tǒng)發(fā)育分析(如16SrRNA用于微生物分類)。tRNA(transferRNA):轉(zhuǎn)運(yùn)RNA。負(fù)責(zé)在翻譯過(guò)程中攜帶氨基酸至核糖體、與mRNA密碼子配對(duì),其反密碼子突變可能導(dǎo)致遺傳疾病(如線粒體tRNA突變引發(fā)的神經(jīng)肌肉疾?。?。siRNA/miRNA(smallinterferingRNA/microRNA):小干擾RNA/微小RNA。均為非編碼小RNA:siRNA通過(guò)RNA干擾(RNAi)特異性降解靶mRNA(如基因功能的敲低實(shí)驗(yàn));miRNA通過(guò)結(jié)合mRNA的3’UTR調(diào)控翻譯(如腫瘤發(fā)生中miRNA的異常表達(dá)與靶基因調(diào)控)。二、蛋白質(zhì)與氨基酸相關(guān)縮寫(xiě)蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者,其結(jié)構(gòu)、功能研究涉及氨基酸、修飾、相互作用等方向的縮寫(xiě)。1.氨基酸與肽相關(guān)AA(AminoAcid):氨基酸。蛋白質(zhì)的基本組成單位,20種天然AA的側(cè)鏈結(jié)構(gòu)決定其化學(xué)性質(zhì)(如疏水性、帶電性),是肽段設(shè)計(jì)、蛋白質(zhì)工程的基礎(chǔ)(如突變AA殘基優(yōu)化酶活性)。pep(Peptide):肽。由AA通過(guò)肽鍵連接形成的短鏈(通常<50個(gè)AA),如信號(hào)肽(引導(dǎo)蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位)、抗菌肽(參與天然免疫)。MALDI-TOF(Matrix-AssistedLaserDesorption/Ionization-TimeofFlight):基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜。雖為技術(shù)縮寫(xiě),但常用于肽段/蛋白質(zhì)的分子量鑒定(如蛋白組學(xué)中肽段的質(zhì)譜分析)。2.蛋白質(zhì)修飾與結(jié)構(gòu)PTM(Post-TranslationalModification):翻譯后修飾。蛋白質(zhì)合成后發(fā)生的共價(jià)修飾(如磷酸化、乙酰化、泛素化),調(diào)控蛋白質(zhì)活性、定位與相互作用(如p53的磷酸化激活其腫瘤抑制功能)。Dom(Domain):結(jié)構(gòu)域。蛋白質(zhì)中具有獨(dú)立折疊和功能的結(jié)構(gòu)單元(如SH2結(jié)構(gòu)域結(jié)合磷酸化酪氨酸,參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)),是蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè)的關(guān)鍵特征(如通過(guò)保守結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫(kù)CDD分析蛋白功能)。HMW/LMW(High-Molecular-Weight/Low-Molecular-Weight):高分子量/低分子量蛋白。用于描述蛋白質(zhì)的分子量范圍,如HMW蛋白可能參與細(xì)胞骨架組裝(如肌動(dòng)蛋白的高分子量聚合形式),LMW蛋白如細(xì)胞因子(分子量通常<30kDa)。三、酶與催化相關(guān)縮寫(xiě)酶是生物催化劑,其分類、活性調(diào)控涉及大量專業(yè)縮寫(xiě)。1.酶分類與活性Km(Michaelis-Mentenconstant):米氏常數(shù)。酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)參數(shù),反映酶與底物的親和力(Km越小,親和力越高),用于酶的底物特異性分析(如比較不同同工酶的Km值篩選優(yōu)勢(shì)底物)。kcat(Turnovernumber):轉(zhuǎn)換數(shù)。單位時(shí)間內(nèi)單個(gè)酶分子催化的底物分子數(shù),反映酶的催化效率(kcat/Km為酶的催化效率常數(shù),用于評(píng)估酶的優(yōu)劣)。2.酶抑制劑與激活劑KI(KinaseInhibitor):激酶抑制劑。靶向抑制蛋白激酶活性的小分子(如Imatinib抑制BCR-ABL激酶,用于白血病治療),是藥物研發(fā)與信號(hào)通路研究的工具(如用KI阻斷MAPK通路分析下游基因表達(dá))。AI(AllostericInhibitor):別構(gòu)抑制劑。結(jié)合酶的別構(gòu)位點(diǎn)而非活性中心,通過(guò)構(gòu)象變化抑制酶活性(如ATP對(duì)磷酸果糖激酶-1的別構(gòu)抑制,調(diào)控糖酵解)。AA(Aminoacylase):氨基酰酶。催化氨基酸與酰基的水解反應(yīng),在氨基酸制備(如拆分外消旋氨基酸)中有應(yīng)用,但需注意與“氨基酸(AA)”縮寫(xiě)的區(qū)分,需結(jié)合上下文判斷。四、代謝通路與小分子相關(guān)縮寫(xiě)代謝是生物化學(xué)的核心研究?jī)?nèi)容,涉及糖、脂、核酸代謝及小分子調(diào)控。1.糖代謝與能量相關(guān)Gly(Glycolysis):糖酵解。葡萄糖分解為丙酮酸的代謝途徑,產(chǎn)生ATP與NADH,是細(xì)胞無(wú)氧/有氧代謝的共同起始步驟(如腫瘤細(xì)胞的Warburg效應(yīng)依賴高Gly活性)。TCA(TricarboxylicAcidcycle):三羧酸循環(huán)(又稱Krebs循環(huán))。丙酮酸氧化為CO?的循環(huán)反應(yīng),產(chǎn)生大量NADH、FADH?,是能量代謝的核心(如線粒體功能障礙常伴隨TCA紊亂)。AMP/ADP/ATP(AdenosineMono/Di/Triphosphate):腺苷一/二/三磷酸。細(xì)胞能量貨幣,ATP水解為ADP/AMP釋放能量,參與酶活性調(diào)控(如AMP激活A(yù)MPK,調(diào)控細(xì)胞能量穩(wěn)態(tài))。2.脂代謝與信號(hào)分子FA(FattyAcid):脂肪酸。脂類的基本組成單位,分為飽和(如棕櫚酸)與不飽和(如油酸),參與膜結(jié)構(gòu)、能量?jī)?chǔ)存(如甘油三酯合成)及信號(hào)分子合成(如花生四烯酸衍生前列腺素)。PL(Phospholipid):磷脂。細(xì)胞膜的主要脂質(zhì)成分(如磷脂酰膽堿、磷脂酰肌醇),其代謝產(chǎn)物(如IP?、DAG)是重要第二信使(如PLC水解PIP?產(chǎn)生IP?和DAG,激活鈣信號(hào)與PKC)。ROS(ReactiveOxygenSpecies):活性氧。如超氧陰離子、過(guò)氧化氫等,低水平參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(如H?O?激活MAPK通路),高水平引發(fā)氧化應(yīng)激(如衰老、疾病中的ROS積累)。五、實(shí)驗(yàn)技術(shù)與儀器相關(guān)縮寫(xiě)生化實(shí)驗(yàn)依賴大量技術(shù)方法,其縮寫(xiě)需結(jié)合操作原理與應(yīng)用場(chǎng)景理解。1.分離與檢測(cè)技術(shù)SDS-PAGE(SodiumDodecylSulfate-PolyacrylamideGelElectrophoresis):十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳。通過(guò)SDS使蛋白帶負(fù)電,按分子量分離蛋白(如分析蛋白純度、分子量),是蛋白研究的基礎(chǔ)技術(shù)。HPLC(High-PerformanceLiquidChromatography):高效液相色譜。基于物質(zhì)在固定相和流動(dòng)相的分配差異分離化合物,用于代謝物定量(如檢測(cè)血液中葡萄糖濃度)、蛋白純化(如反相HPLC分離肽段)。ELISA(Enzyme-LinkedImmunosorbentAssay):酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定。通過(guò)抗體-抗原特異性結(jié)合與酶催化顯色,定量檢測(cè)蛋白、抗體或小分子(如檢測(cè)血清中細(xì)胞因子濃度)。2.分子操作技術(shù)PCR(PolymeraseChainReaction):聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。通過(guò)DNA聚合酶擴(kuò)增特定DNA片段,用于基因克隆、突變檢測(cè)(如RT-PCR檢測(cè)RNA反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,qPCR定量基因表達(dá))。CRISPR/Cas9(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats/CRISPR-associatedprotein9):規(guī)律間隔成簇短回文重復(fù)序列/CRISPR相關(guān)蛋白9?;蚓庉嫾夹g(shù),通過(guò)sgRNA引導(dǎo)Cas9切割靶DNA,實(shí)現(xiàn)基因敲除、敲入(如構(gòu)建基因編輯細(xì)胞系研究基因功能)。ChIP(ChromatinImmunoprecipitation):染色質(zhì)免疫沉淀。通過(guò)抗體富集與靶蛋白結(jié)合的DNA片段,研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用(如分析轉(zhuǎn)錄因子的靶基因結(jié)合位點(diǎn))。六、生物信息與數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)縮寫(xiě)生物信息學(xué)加速了生化數(shù)據(jù)的整合與分析,其工具與數(shù)據(jù)庫(kù)縮寫(xiě)需精準(zhǔn)掌握。1.數(shù)據(jù)庫(kù)與資源PDB(ProteinDataBank):蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)。存儲(chǔ)蛋白質(zhì)、核酸及復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu),用于結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究(如分析酶的活性中心結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)抑制劑)。KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes):京都基因與基因組百科全書(shū)。整合基因、代謝通路、疾病相關(guān)信息,用于通路富集分析(如差異基因的KEGG通路注釋)。2.分析工具與算法BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool):基本局部比對(duì)搜索工具。用于序列相似性比對(duì)(如核酸/蛋白序列的同源性分析,鑒定新基因的同源物)。RNA-seq(RNASequencing):RNA測(cè)序。通過(guò)高通量測(cè)序分析轉(zhuǎn)錄組,定量基因表達(dá)、鑒定新轉(zhuǎn)錄本(如比較腫瘤與正常組織的RNA-seq數(shù)據(jù)篩選差異基因)。七、應(yīng)用指導(dǎo)與注意事項(xiàng)1.縮寫(xiě)的歧義性規(guī)避多義縮寫(xiě)需結(jié)合上下文判斷:如“IP”在代謝中是“肌醇-1,4,5-三磷酸(Inositol1,4,5-Trisphosphate)”,在蛋白研究中是“免疫沉淀(Immunoprecipitation)”;“R”在酶學(xué)中是“氣體常數(shù)(GasConstant)”,在核酸中是“嘌呤(Purine)”或“限制性內(nèi)切酶(RestrictionEnzyme,如EcoRⅠ)”。首次出現(xiàn)縮寫(xiě)需標(biāo)注全稱:學(xué)術(shù)寫(xiě)作、報(bào)告中首次使用縮寫(xiě)時(shí),需在括號(hào)內(nèi)注明全稱(如“采用PCR(PolymeraseChainReaction)擴(kuò)增目的基因”),避免讀者誤解。2.領(lǐng)域交叉的縮寫(xiě)適配跨領(lǐng)域縮寫(xiě)需參考所屬領(lǐng)域:如“CD”在免疫學(xué)中是“分化簇(ClusterofDifferentiation,如CD4?T細(xì)胞)”,在蛋白結(jié)構(gòu)中是“圓二色性(CircularDichroism)”;“MS”在代謝組學(xué)中是“質(zhì)譜(MassSpectrometry)”,在神經(jīng)科學(xué)中是“多發(fā)性硬化(MultipleSclerosis)”。3.新縮寫(xiě)的跟蹤與驗(yàn)證前沿領(lǐng)域(如合成生物學(xué)、單細(xì)胞組學(xué))的新縮寫(xiě)需通過(guò)權(quán)威文獻(xiàn)、數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證:如“scRNA-seq”(Single-cellRNASequencing)需結(jié)合“單細(xì)胞”
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