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文檔簡介
生物學生物研究實驗室研究實習報告一、摘要
2023年6月5日至8月22日,我在XX生物研究實驗室擔任助理研究員,參與細胞分化信號通路研究項目。通過8周實踐,完成對30份樣本的RNA提取實驗,平均純度達98.2%,為后續(xù)qPCR驗證提供合格材料;協(xié)助構(gòu)建并優(yōu)化了3種雙熒光素酶報告基因系統(tǒng),使報告基因活性檢測重復性系數(shù)(RSD)降低至5.3%;運用ImageJ軟件對200張顯微圖像進行定量分析,建立細胞核形態(tài)參數(shù)數(shù)據(jù)庫,相關(guān)系數(shù)(R2)達0.89。掌握RNA提取純化檢測全流程操作規(guī)范,熟悉雙熒光素酶報告系統(tǒng)構(gòu)建方法,驗證了細胞信號通路干預的實驗可行性,形成可復用的樣本標準化處理方法論。
二、實習內(nèi)容及過程
2023年6月5日入職實驗室,我的實習目的主要是了解細胞信號通路研究的實際操作流程,并參與項目執(zhí)行。單位是XX生物研究實驗室,研究方向偏向于腫瘤細胞分化機制,實驗室有十幾個研究員和博士后,設(shè)備挺全乎,流式細胞儀、高通量測序平臺都挺新。
第13周主要熟悉環(huán)境,導師給我安排了RNA提取實驗培訓。6月12日第一次獨立操作TRIzol法提取總RNA,用了15份樣本,純度在97%99%之間,但有兩份得率低到4%,導師說可能是裂解不充分。我重新調(diào)整了試劑比例,加了一步溫和的氯仿抽提,第二次做的時候得率提到8%,純度也穩(wěn)定在98%以上。這個經(jīng)歷讓我記住了樣本均一性對結(jié)果的重要性。
第46周參與雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灐?月25日構(gòu)建了第一個報告系統(tǒng),用野生型JAK2基因檢測EGFR信號通路活性,但報告基因熒光值波動大,RSD達到12%。后來發(fā)現(xiàn)是細胞轉(zhuǎn)染效率問題,實驗室常用PEI轉(zhuǎn)染試劑,但效果不理想。我嘗試優(yōu)化了轉(zhuǎn)染條件,把PEI濃度從3μg/mL降到1.5μg/mL,同時加入20%FBS,重復三次實驗后RSD降到5.3%,熒光信號也跟預期方向變化了。導師說這種優(yōu)化在實驗里很常見,關(guān)鍵要找對變量。
第78周負責顯微圖像定量分析。7月30日拿到一批共200張H&E染色圖片,需要量化細胞核形態(tài)參數(shù)。剛開始用肉眼測量,誤差明顯,后來學了ImageJ軟件的ROI分析功能,通過設(shè)置閾值自動分割細胞核,再用粒度分析方法計算圓形度、面積等參數(shù),相關(guān)系數(shù)R2提升到0.89。雖然還有小問題,但基本能滿足項目需求。
遇到的最大困難是早期實驗失敗率高。比如有一次做WesternBlot,膜上條帶很彌散,花了兩天才意識到是抗體稀釋比例不對。解決方法就是查閱文獻,并請教師兄師姐,最后把抗體濃度從1:1000降到1:2000,條帶才清晰。這個經(jīng)歷讓我明白文獻和溝通同樣重要。
實習成果具體體現(xiàn)在:完成30份樣本RNA提取,合格率98.2%;建立雙熒光素酶報告系統(tǒng)穩(wěn)定性標準(RSD<5.3%);生成200張圖像的細胞核參數(shù)數(shù)據(jù)庫。這些數(shù)據(jù)后來直接用于導師的基金申請材料。這段經(jīng)歷讓我對實驗設(shè)計有了更直觀認識,比如意識到對照組設(shè)置要全面,不能只看主效應。
實驗室管理上,感覺每周的組會效率不高,經(jīng)常跑題,有時候一個簡單問題討論半天。培訓機制也有待改進,新來的師兄師姐都是靠師兄帶,沒有系統(tǒng)培訓手冊。崗位匹配度方面,我的任務(wù)偏向技術(shù)執(zhí)行,但希望能接觸更多實驗設(shè)計討論。建議可以建立標準化操作流程文檔,并定期組織專題培訓,比如針對常用軟件的使用技巧。另外可以多安排輪崗,這樣能更快了解不同實驗方向需求。
三、總結(jié)與體會
這8周在實驗室的經(jīng)歷,讓我對生物研究有了更實的感受。剛開始6月5日進實驗室時,面對實際操作還是有些懵,特別是RNA提取時,第一次做15個樣本,純度數(shù)據(jù)在97%99%之間,但有兩份低于5%,當時挺焦慮的,因為知道后續(xù)qPCR會受影響。后來跟著師兄師姐學,調(diào)整了TRIzol試劑比例,加了一步氯仿重抽,第二次做時得率提到8%以上,純度也穩(wěn)定在98%以上,這個轉(zhuǎn)變讓我明白嚴謹操作的重要性。
雙熒光素酶報告系統(tǒng)優(yōu)化是另一個收獲。6月25日第一次構(gòu)建時,野生型JAK2檢測EGFR通路,報告基因熒光值RSD高達12%,波動太大了。后來發(fā)現(xiàn)是細胞轉(zhuǎn)染效率問題,實驗室常用PEI轉(zhuǎn)染試劑,但效果不理想。我嘗試把PEI濃度從3μg/mL降到1.5μg/mL,同時加入20%FBS,重復三次實驗后RSD降到5.3%,熒光信號也跟預期方向變化了。這個過程中體會到實驗設(shè)計要考慮多因素,不能只看單一指標。
7月30日拿到200張H&E染色圖片進行定量分析時,一開始用肉眼測量細胞核參數(shù),誤差很大。后來學了ImageJ軟件的ROI分析功能,通過設(shè)置閾值自動分割細胞核,再用粒度分析方法計算圓形度、面積等參數(shù),相關(guān)系數(shù)R2提升到0.89。雖然還有小問題,但基本能滿足項目需求,這個經(jīng)歷讓我意識到數(shù)字化工具對科研的巨大幫助。
這次實習最大的價值是讓我完成了從學生到職場人的心態(tài)轉(zhuǎn)變。以前做實驗覺得差不多就行,現(xiàn)在明白每個步驟都要有數(shù)據(jù)支撐。比如有一次WesternBlot膜上條帶很彌散,花了兩天時間排查,最后發(fā)現(xiàn)是抗體稀釋比例不對,從1:1000降到1:2000才解決。這個經(jīng)歷讓我明白實驗失敗是常態(tài),關(guān)鍵是要有耐心和解決問題的能力。
對職業(yè)規(guī)劃來說,這次經(jīng)歷讓我更清楚自己喜歡什么。我發(fā)現(xiàn)自己對實驗技術(shù)細節(jié)很感興趣,但也很想?yún)⑴c實驗設(shè)計。接下來打算深化分子生物學技能,特別是學習更多生物信息學分析方法,考慮考取相關(guān)證書,比如實驗技術(shù)師資格證。同時也在關(guān)注行業(yè)趨勢,比如單細胞測序和空間轉(zhuǎn)錄組學在腫瘤研究中的應用越來越廣,這些技術(shù)可能成為未來發(fā)展方向。
實習也讓我看到自身不足,比如剛開始寫實驗記錄不規(guī)范,后來才養(yǎng)成及時記錄關(guān)鍵參數(shù)和操作細節(jié)的習慣。實驗室管理上,每周組會經(jīng)常跑題,效率不高,這讓我意識到團隊溝通很重要。未來如果參與項目,希望能更早接觸實驗設(shè)計討論,而不是只做執(zhí)行者??偟膩碚f,這次實習讓我收獲滿滿,不僅提升了專業(yè)技能,更讓我對科研工作有了更深的理解和敬畏。
四、致謝
感謝XX生物研究實驗室提供這次
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