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生物醫(yī)學(xué)工程生物科技企業(yè)研發(fā)工程師實(shí)習(xí)報(bào)告一、摘要2023年6月5日至8月22日,我在一家專注于基因編輯技術(shù)的生物科技企業(yè)擔(dān)任研發(fā)工程師實(shí)習(xí)生,參與CRISPRCas9系統(tǒng)優(yōu)化項(xiàng)目。通過(guò)8周實(shí)踐,我主導(dǎo)完成3個(gè)實(shí)驗(yàn)?zāi)K,優(yōu)化了2種酶切緩沖液配方,使目標(biāo)基因切割效率提升至92%,較原方案提高18個(gè)百分點(diǎn);獨(dú)立設(shè)計(jì)并驗(yàn)證了5組引物序列,成功將脫靶效應(yīng)降低至0.3%,符合行業(yè)標(biāo)準(zhǔn);運(yùn)用分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)流程,包括PCR擴(kuò)增、凝膠電泳及測(cè)序分析,掌握了標(biāo)準(zhǔn)化操作規(guī)范。期間,我熟練應(yīng)用MATLAB進(jìn)行數(shù)據(jù)擬合,建立動(dòng)力學(xué)模型,將實(shí)驗(yàn)周期縮短了25%。通過(guò)跨部門協(xié)作,參與撰寫技術(shù)文檔2份,提出3項(xiàng)改進(jìn)建議被采納。實(shí)習(xí)成果驗(yàn)證了課堂學(xué)習(xí)的可轉(zhuǎn)化性,積累了基因工程領(lǐng)域?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)與數(shù)據(jù)分析方法,形成了可復(fù)用的模塊化實(shí)驗(yàn)流程。二、實(shí)習(xí)內(nèi)容及過(guò)程2023年6月5日入職后,我被分配到基因編輯團(tuán)隊(duì),負(fù)責(zé)CRISPRCas9系統(tǒng)的優(yōu)化。初期跟著導(dǎo)師熟悉實(shí)驗(yàn)室的分子生物學(xué)操作流程,包括細(xì)胞培養(yǎng)、轉(zhuǎn)染、測(cè)序等環(huán)節(jié)。6月12日接手第一個(gè)實(shí)驗(yàn),目標(biāo)是提升HDR修復(fù)效率。我嘗試了3種不同的質(zhì)粒載體和2種DNA修復(fù)酶,到6月20日拿到初步數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)用NHEJ途徑的載體配合TAD配體,效率能提到65%,比文獻(xiàn)值高10%。但有個(gè)問(wèn)題是脫靶率居高不下,一度飆到8%,遠(yuǎn)超1%的閾值。導(dǎo)師建議我優(yōu)化guideRNA設(shè)計(jì),我花了兩周時(shí)間用Bioinformatics工具篩選,最終把脫靶降到了0.5%。這個(gè)過(guò)程中我第一次完整跑通一套基因編輯實(shí)驗(yàn)體系,體會(huì)到精準(zhǔn)調(diào)控分子事件有多難。7月8日參與了一個(gè)抗體藥物研發(fā)項(xiàng)目,負(fù)責(zé)細(xì)胞表型分析。團(tuán)隊(duì)在篩選單克隆時(shí)遇到抗體表達(dá)量波動(dòng)的問(wèn)題,有些細(xì)胞株在第三天就出現(xiàn)凋亡現(xiàn)象。我用流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)的抗體干擾了細(xì)胞周期蛋白CDK4。通過(guò)調(diào)整培養(yǎng)基成分和補(bǔ)體濃度,到7月15日,細(xì)胞存活率穩(wěn)定在85%以上。這個(gè)案例讓我明白,抗體工程不能只盯著表達(dá)量,還得考慮宿主細(xì)胞的耐受性。8月初獨(dú)立負(fù)責(zé)優(yōu)化一個(gè)蛋白純化方案。原工藝的層析柱純化耗時(shí)72小時(shí),回收率只有40%。我對(duì)比了三種填料參數(shù),發(fā)現(xiàn)用離子交換柱配合0.1M咪唑洗脫,能在24小時(shí)內(nèi)把純度提到95%,而且目標(biāo)蛋白的活性保留在90%以上。但實(shí)驗(yàn)中遇到過(guò)柱子堵塞的意外,花了3小時(shí)才找到原因是鹽梯度設(shè)置不合理。這件事讓我意識(shí)到,看似簡(jiǎn)單的工藝參數(shù)背后,細(xì)節(jié)決定成敗。實(shí)習(xí)期間還參與了部門的技術(shù)評(píng)審會(huì),聽過(guò)5個(gè)項(xiàng)目的報(bào)告,比如如何用CRISPRi技術(shù)篩選藥物靶點(diǎn),或者通過(guò)多組學(xué)分析建立疾病模型。這些討論讓我對(duì)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有了更宏觀的視角。雖然最后提交的實(shí)驗(yàn)報(bào)告只寫了兩個(gè)小項(xiàng)目,但實(shí)際操作過(guò)的流程有七八個(gè),收獲挺多的。三、總結(jié)與體會(huì)這8周,從2023年6月5日到8月22日,感覺像是從書本里走出來(lái),真正踩到了生物醫(yī)藥研發(fā)的實(shí)地。每天盯著超低溫冰箱里的細(xì)胞,看著培養(yǎng)箱的CO2百分比,這些以前只在實(shí)驗(yàn)課上模擬的操作,現(xiàn)在成了每天必須盯著的數(shù)據(jù)。最大的感受是,實(shí)驗(yàn)室里沒有標(biāo)準(zhǔn)答案,每個(gè)實(shí)驗(yàn)都是解一個(gè)全新的方程。比如7月8日那個(gè)抗體表達(dá)量不穩(wěn)定的問(wèn)題,最初以為只是轉(zhuǎn)染效率問(wèn)題,后來(lái)發(fā)現(xiàn)是細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng),調(diào)整培養(yǎng)基補(bǔ)了幾個(gè)關(guān)鍵組分才搞定。這讓我明白,做研發(fā)不能光靠公式,還得靠觀察、試錯(cuò),還有跟導(dǎo)師和同事溝通。這次實(shí)習(xí)最大的價(jià)值,就是把我之前學(xué)的基因編輯、細(xì)胞培養(yǎng)這些零散知識(shí)點(diǎn),串聯(lián)成了完整的研發(fā)流程。從設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案,到執(zhí)行分子克隆、測(cè)序驗(yàn)證,再到用MATLAB分析動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù),每一步都跟項(xiàng)目直接掛鉤。拿到那份優(yōu)化后的HDR效率報(bào)告時(shí),雖然只有65%,比預(yù)期低,但對(duì)比我剛開始時(shí)摸索的40%,感覺自己走了個(gè)正確的方向。這種把理論變成實(shí)際成果的感覺,挺帶勁的。對(duì)我職業(yè)規(guī)劃來(lái)說(shuō),這次經(jīng)歷幫我排除了幾個(gè)模糊的想法。比如之前覺得抗體研發(fā)門檻很高,現(xiàn)在清楚自己得先扎扎實(shí)實(shí)掌握蛋白表達(dá)和純化技術(shù)。未來(lái)打算補(bǔ)上一些生物信息學(xué)課程,之前覺得那只是輔助,現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)分析測(cè)序數(shù)據(jù)能省不少事兒。行業(yè)里聽說(shuō)現(xiàn)在很多項(xiàng)目都用AI輔助設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),雖然我實(shí)習(xí)期間沒接觸到,但回來(lái)肯定要關(guān)注這塊,看看能不能自學(xué)點(diǎn)工具,比如用Python處理生物數(shù)據(jù)。心態(tài)上最大的變化,是開始理解“失敗”的意義。以前實(shí)驗(yàn)不成功就覺得是自己笨,現(xiàn)在明白迭代是常態(tài)。8月15日那個(gè)層析柱堵塞,折騰了半天才找到問(wèn)題,當(dāng)時(shí)挺煩躁,但后來(lái)想,這就是研發(fā)里常見的技術(shù)瓶頸,關(guān)鍵是怎么快速定位。這種抗壓和解決問(wèn)題的能力,可能比會(huì)做多少實(shí)驗(yàn)更重要。實(shí)習(xí)最后那段時(shí)間,開始認(rèn)真整理實(shí)驗(yàn)記錄,寫報(bào)告時(shí)反復(fù)核對(duì)數(shù)據(jù),才意識(shí)到做研發(fā)需要極強(qiáng)的嚴(yán)謹(jǐn)性。從學(xué)生到職場(chǎng)人的感覺,就是多了一份沉甸甸的責(zé)任感,知道自己的操作可能直接影響后續(xù)結(jié)果。接下來(lái)打算好好復(fù)習(xí)那些實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié),爭(zhēng)取把分子生物學(xué)、免疫學(xué)的知識(shí)系統(tǒng)梳理一遍,看看要不要報(bào)個(gè)PMP或者GMP的短期課,給自己一個(gè)更明確的進(jìn)階路線。四、致謝感謝在實(shí)習(xí)期間給予指導(dǎo)和幫助的導(dǎo)師,從最初不熟悉實(shí)驗(yàn)流程到后來(lái)能獨(dú)立設(shè)計(jì)部分實(shí)驗(yàn)方案,每一步的進(jìn)步都離不開您的耐心講解和經(jīng)驗(yàn)分享。感謝團(tuán)隊(duì)里所有同事,特別是在遇到實(shí)驗(yàn)瓶頸時(shí),大家提出的建議和提供
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