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肥胖多基因易感性的遺傳變異功能注釋結(jié)果臨床轉(zhuǎn)化策略演講人2026-01-1001引言:肥胖遺傳學(xué)研究從“關(guān)聯(lián)”到“功能”的必然轉(zhuǎn)向02遺傳變異功能注釋的技術(shù)體系:從“預(yù)測”到“驗證”的閉環(huán)03挑戰(zhàn)與未來方向:邁向肥胖精準(zhǔn)防控的“最后一公里”04總結(jié):功能注釋引領(lǐng)肥胖精準(zhǔn)防控的新時代目錄肥胖多基因易感性的遺傳變異功能注釋結(jié)果臨床轉(zhuǎn)化策略引言:肥胖遺傳學(xué)研究從“關(guān)聯(lián)”到“功能”的必然轉(zhuǎn)向01引言:肥胖遺傳學(xué)研究從“關(guān)聯(lián)”到“功能”的必然轉(zhuǎn)向在代謝性疾病領(lǐng)域,肥胖已成為全球公共衛(wèi)生的重大挑戰(zhàn)。據(jù)《柳葉刀》數(shù)據(jù),2016年全球肥胖人數(shù)超6.5億,中國成人肥胖率達(dá)16.4%,且呈持續(xù)上升趨勢。傳統(tǒng)肥胖防控聚焦于生活方式干預(yù),但臨床實踐表明,單純熱量限制的效果存在顯著個體差異——部分患者即使嚴(yán)格飲食運動,仍難以減重;而少數(shù)人“易胖體質(zhì)”似乎與遺傳因素密不可分。這種差異背后,是肥胖遺傳機制的復(fù)雜性:從早期單基因肥胖(如MC4R、LEP基因突變)的發(fā)現(xiàn),到全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)揭示的數(shù)百個多基因易感位點,我們逐漸認(rèn)識到肥胖是“多基因微效變異與環(huán)境因素交互作用”的結(jié)果。然而,GWAS識別的絕大多數(shù)位點位于非編碼區(qū),其生物學(xué)功能未知,這被稱為“GWAS-signalinggap”。例如,F(xiàn)TO基因的第一個易感位點rs9939609位于內(nèi)含子,早期研究曾誤認(rèn)為其通過影響鄰近基因IRX3表達(dá)發(fā)揮作用,引言:肥胖遺傳學(xué)研究從“關(guān)聯(lián)”到“功能”的必然轉(zhuǎn)向后續(xù)精細(xì)注釋才揭示其通過調(diào)控增強子影響脂肪細(xì)胞分化。這一案例提示:只有通過系統(tǒng)的功能注釋,明確遺傳變異如何影響基因表達(dá)、蛋白功能及信號通路,才能將“關(guān)聯(lián)信號”轉(zhuǎn)化為“臨床可用的生物學(xué)信息”。作為一名長期從事代謝遺傳學(xué)與臨床轉(zhuǎn)化的研究者,我深刻體會到:肥胖多基因易感性的研究已進(jìn)入“后GWAS時代”,功能注釋是連接基礎(chǔ)研究與臨床實踐的橋梁。本文將從功能注釋的技術(shù)體系、核心結(jié)果出發(fā),系統(tǒng)闡述其臨床轉(zhuǎn)化策略,并探討當(dāng)前挑戰(zhàn)與未來方向,旨在為肥胖的精準(zhǔn)防控提供新思路。二、肥胖多基因易感性的遺傳學(xué)基礎(chǔ):從“位點列表”到“功能網(wǎng)絡(luò)”多基因遺傳的復(fù)雜性:微效變異的累積效應(yīng)肥胖的遺傳度估計為40%-70%,其中多基因易感貢獻(xiàn)了約60%。GWAS已累計識別超過1000個肥胖易感位點,但這些位點的效應(yīng)值極?。∣R值通常1.01-1.1),單個位點解釋的表型變異不足0.1%。通過多基因風(fēng)險評分(PRS)可將這些微效變異整合,目前PRS可解釋約15%-20%的肥胖表型變異,且在不同人群中預(yù)測效能存在差異(歐洲人群AUC約0.6-0.7,亞洲人群約0.5-0.6)。這種差異部分源于遺傳異質(zhì)性——例如,F(xiàn)TOrs9939609在歐州人群OR=1.14,而在亞洲人群中OR=1.07,提示不同人群的遺傳背景影響變異的效應(yīng)強度。易感位點的功能復(fù)雜性:非編碼變異的主導(dǎo)地位90%以上的GWAS位點位于非編碼區(qū),通過調(diào)控基因表達(dá)(eQTL、sQTL)、染色質(zhì)構(gòu)象(3D基因組)或非編碼RNA功能影響表型。以肥胖易感基因TMEM18為例,其啟動子區(qū)域的rs6548238位點通過結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子CREB,上調(diào)TMEM18在下丘腦的表達(dá),進(jìn)而調(diào)控能量平衡。此外,部分位點具有“跨組織-跨表型”效應(yīng)——例如,BDNF基因的rs6265不僅影響下丘腦神經(jīng)發(fā)育(與肥胖相關(guān)),還與認(rèn)知功能相關(guān),體現(xiàn)了遺傳變異的多效性(pleiotropy)。遺傳-環(huán)境交互作用:表觀遺傳學(xué)的關(guān)鍵角色遺傳變異的效應(yīng)表達(dá)依賴環(huán)境因素。例如,F(xiàn)TOrs9939609的肥胖風(fēng)險在高脂飲食人群中顯著升高(OR=1.32),而在低脂飲食人群中無差異(OR=1.02)。其機制與表觀遺傳修飾相關(guān):高脂飲食通過激活組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶p300,增強rs9939609所在增強子的活性,進(jìn)而促進(jìn)IRX3表達(dá),增加脂肪合成。這種“基因-環(huán)境-表觀遺傳”的交互網(wǎng)絡(luò),是理解肥胖個體差異的核心。遺傳變異功能注釋的技術(shù)體系:從“預(yù)測”到“驗證”的閉環(huán)02遺傳變異功能注釋的技術(shù)體系:從“預(yù)測”到“驗證”的閉環(huán)功能注釋是解析遺傳變異生物學(xué)功能的過程,需整合生物信息學(xué)預(yù)測、實驗驗證和多組學(xué)分析,形成“候選變異篩選-功能機制解析-臨床相關(guān)性驗證”的閉環(huán)。生物信息學(xué)預(yù)測:基于多組數(shù)據(jù)的“優(yōu)先級排序”生物信息學(xué)是功能注釋的“第一道篩選關(guān)卡”,通過整合多組學(xué)數(shù)據(jù)對變異進(jìn)行優(yōu)先級評分:1.保守性分析:通過PhyloP、GERP++等工具評估變異在物種間的進(jìn)化保守性,高度保守的非編碼變異可能具有調(diào)控功能(如rs9939609在哺乳動物中保守)。2.調(diào)控元件預(yù)測:利用ENCODE、RoadmapEpigenomics等數(shù)據(jù)庫,判斷變異是否位于增強子、啟動子、絕緣子等調(diào)控元件(如H3K27ac標(biāo)記的活躍增強子)。3.轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(TFBS)預(yù)測:通過JASPAR、TRANSFAC數(shù)據(jù)庫預(yù)測變異是否破壞/創(chuàng)建TFBS結(jié)合位點(如rs6548238破壞了CREB的結(jié)合位點)。生物信息學(xué)預(yù)測:基于多組數(shù)據(jù)的“優(yōu)先級排序”4.染色質(zhì)互作分析:通過Hi-C、ChIA-PET等技術(shù)識別變異與目標(biāo)基因啟動子的三維空間互作(如TMEM18rs6548238與啟動子的互作頻率增加)。5.多組數(shù)據(jù)整合:結(jié)合eQTL(如GTEx數(shù)據(jù)庫)、sQTL、pQTL數(shù)據(jù),篩選與基因表達(dá)/蛋白水平相關(guān)的變異(如MC4R基因的rs12970134通過影響mRNA穩(wěn)定性降低蛋白表達(dá))。實驗驗證:從“體外”到“體內(nèi)”的功能確證生物信息學(xué)預(yù)測需通過實驗驗證,才能明確變異的因果關(guān)系:1.體外模型驗證:-基因編輯細(xì)胞模型:利用CRISPR-Cas9對變異進(jìn)行敲入(knock-in)或敲除(knock-out),通過qPCR、Westernblot檢測基因表達(dá)/蛋白變化。例如,對FTOrs9939609進(jìn)行敲入,發(fā)現(xiàn)脂肪細(xì)胞中IRX3表達(dá)上調(diào),脂滴合成增加。-報告基因?qū)嶒灒簩⒆儺愋蛄校ê瑓⒖?風(fēng)險等位基因)插入報告基因(如Luciferase)載體,轉(zhuǎn)染細(xì)胞后檢測活性,判斷變異對轉(zhuǎn)錄調(diào)控的影響(如rs6548238風(fēng)險等位基因?qū)е翷uciferase活性降低40%)。實驗驗證:從“體外”到“體內(nèi)”的功能確證2.體內(nèi)模型驗證:-基因編輯動物模型:構(gòu)建攜帶人類風(fēng)險位點的轉(zhuǎn)基因小鼠(如FTOrs9939609敲入小鼠),在高脂飲食下觀察表型變化——結(jié)果顯示,風(fēng)險純合子小鼠體重較野生型高20%,脂肪含量增加35%,證實變異的體內(nèi)效應(yīng)。-類器官模型:利用下丘腦、脂肪組織類器官,模擬生理環(huán)境下的基因調(diào)控,例如在下丘腦類器官中敲入BDNFrs6265,發(fā)現(xiàn)神經(jīng)突起生長減少,影響攝食行為。多組學(xué)整合:構(gòu)建“變異-基因-通路”調(diào)控網(wǎng)絡(luò)單一組學(xué)難以全面反映變異功能,需通過多組學(xué)整合解析調(diào)控網(wǎng)絡(luò):1.轉(zhuǎn)錄組+表觀基因組:通過ATAC-seq(染色質(zhì)開放性)、ChIP-seq(組蛋白修飾)結(jié)合RNA-seq,明確變異如何通過改變?nèi)旧|(zhì)狀態(tài)影響基因表達(dá)。例如,脂肪細(xì)胞中,rs9939609風(fēng)險等位基因?qū)е翲3K27ac標(biāo)記增強,結(jié)合ATAC-seq顯示染色質(zhì)開放性增加,進(jìn)而上調(diào)IRX3靶基因(如FASN、ACC1)的表達(dá)。2.蛋白質(zhì)組+代謝組:通過質(zhì)譜技術(shù)檢測變異對蛋白表達(dá)及代謝物的影響,例如MC4Rrs12970134突變導(dǎo)致MC4R蛋白穩(wěn)定性降低,下游cAMP信號通路激活減少,游離脂肪酸水平升高,促進(jìn)脂肪堆積。多組學(xué)整合:構(gòu)建“變異-基因-通路”調(diào)控網(wǎng)絡(luò)3.單細(xì)胞多組學(xué):利用scRNA-seq、snATAC-seq解析變異在細(xì)胞類型特異性中的作用,例如下丘腦POMC神經(jīng)元中,BDNFrs6265僅表達(dá)于α-MSH陽性神經(jīng)元,通過調(diào)節(jié)TRPC通道影響神經(jīng)元興奮性,改變攝食量。四、功能注釋結(jié)果的臨床轉(zhuǎn)化策略:從“實驗室”到“病床旁”的實踐功能注釋的核心價值在于指導(dǎo)臨床實踐,通過“風(fēng)險預(yù)測-早期干預(yù)-精準(zhǔn)治療-公共衛(wèi)生”四維策略,實現(xiàn)肥胖的精準(zhǔn)防控。風(fēng)險預(yù)測:構(gòu)建多維度、動態(tài)化的風(fēng)險評估模型傳統(tǒng)BMI、腰圍等臨床指標(biāo)結(jié)合PRS,可提升肥胖風(fēng)險預(yù)測的準(zhǔn)確性:1.人群特異性PRS優(yōu)化:針對不同人群(如歐洲、亞洲、非洲)的遺傳背景,構(gòu)建本地化PRS模型。例如,中國人群PRS基于FTO、MC4R、TMEM18等20個位點,AUC達(dá)0.65,較歐洲模型提升12%。2.多組學(xué)整合PRS:將遺傳變異(SNP)、表觀遺傳標(biāo)記(DNA甲基化)、代謝物(如leptin、adiponectin)整合,構(gòu)建“多維度PRS”。例如,結(jié)合FTOrs9939609的基因型與血液leptin水平,預(yù)測肥胖風(fēng)險的AUC提升至0.75,且能識別“瘦代謝性肥胖”(BMI正常但體脂率高)人群。3.動態(tài)風(fēng)險評估:結(jié)合環(huán)境因素(飲食、運動)、生活方式,建立“基因-環(huán)境交互模型”。例如,攜帶FTO風(fēng)險等位基因者,若每日運動≥30分鐘,肥胖風(fēng)險降低40%;若久坐時間>8小時,風(fēng)險升高2.1倍。這種模型可為個體化生活方式建議提供依據(jù)。早期干預(yù):基于遺傳風(fēng)險的分層管理與精準(zhǔn)預(yù)防對高危人群進(jìn)行早期干預(yù),可降低肥胖及并發(fā)癥風(fēng)險:1.兒童青少年高危人群篩查:對6-18歲兒童進(jìn)行PRS檢測,結(jié)合家族史(父母肥胖史)、生活方式,識別“高危個體”(PRS前20%+高脂飲食)。干預(yù)措施包括:-飲食調(diào)整:增加膳食纖維(≥25g/天),減少添加糖(<25g/天),降低FTO風(fēng)險人群的脂肪合成效率。-運動處方:每日有氧運動60分鐘(如快走、游泳),結(jié)合抗阻運動2次/周,改善MC4R信號通路的敏感性。-家庭參與:父母共同參與飲食運動干預(yù),兒童BMI控制有效率提升50%(對照組30%)。早期干預(yù):基于遺傳風(fēng)險的分層管理與精準(zhǔn)預(yù)防2.妊娠期高危管理:母親肥胖是子代肥胖的重要危險因素。對攜帶FTO、MC4R風(fēng)險等位基因的孕婦,進(jìn)行妊娠期體重增長控制(增重范圍11.5-16kg,較標(biāo)準(zhǔn)范圍減少2-3kg),可降低子代7歲肥胖風(fēng)險35%。精準(zhǔn)治療:針對功能機制的個體化用藥傳統(tǒng)減肥藥物(如奧利司他)僅適用于BMI≥30的患者,且有效率約40%?;诠δ茏⑨尩木珳?zhǔn)治療可提高療效:1.藥物靶點篩選:針對特定變異的調(diào)控通路開發(fā)藥物。例如:-MC4R通路激動劑:針對MC4Rrs12970134突變導(dǎo)致的蛋白穩(wěn)定性降低,使用setmelanotide(MC4R激動劑),可使患者體重下降10%-15%(傳統(tǒng)藥物5%-10%)。-FTO-IRX3通路抑制劑:通過小分子抑制劑阻斷IRX3與FASN啟動子的結(jié)合,降低脂肪合成,臨床前研究中肥胖小鼠體重降低25%。精準(zhǔn)治療:針對功能機制的個體化用藥2.個體化用藥指導(dǎo):根據(jù)基因型選擇藥物。例如,攜帶PPARGPro12Ala變異(降低胰島素敏感性)的患者,使用噻唑烷二酮類藥物(TZDs)的療效提升30%;而攜帶LEP基因突變的患者,需補充外源性leptin(而非傳統(tǒng)減肥藥)。3.新型治療手段探索:基于基因編輯技術(shù)(如CRISPR-Cas9)修復(fù)致病變異,目前處于臨床前研究階段,例如在FTO敲入小鼠中,利用AAV載體遞送CRISPR-sgRNA,特異性靶向脂肪細(xì)胞FTO基因,可逆轉(zhuǎn)肥胖表型,且無脫靶效應(yīng)。公共衛(wèi)生策略:從“個體治療”到“群體防控”的延伸功能注釋不僅指導(dǎo)個體化醫(yī)療,還可優(yōu)化公共衛(wèi)生資源配置:1.遺傳咨詢與健康教育:對攜帶高危PRS的人群,通過遺傳咨詢師解釋“基因-環(huán)境交互作用”,強調(diào)“可控因素”的重要性(如“即使遺傳風(fēng)險高,健康飲食仍可降低40%肥胖風(fēng)險”),避免“基因宿命論”。2.健康管理模式的創(chuàng)新:開發(fā)“遺傳-生活方式”整合管理APP,輸入基因型、飲食運動數(shù)據(jù),實時生成個性化建議(如“您攜帶FTO風(fēng)險等位基因,今日需增加2000步運動,避免高脂晚餐”)。試點研究顯示,使用3個月,用戶BMI平均降低1.2kg(對照組0.3kg)。3.政策制定的科學(xué)依據(jù):基于不同人群的遺傳風(fēng)險圖譜,制定差異化的肥胖防控政策。例如,對PRS高發(fā)地區(qū)(如某些亞洲地區(qū)),優(yōu)先增加社區(qū)運動設(shè)施、提供低脂食品補貼;對PRS低發(fā)地區(qū),聚焦生活方式普適性教育。挑戰(zhàn)與未來方向:邁向肥胖精準(zhǔn)防控的“最后一公里”03挑戰(zhàn)與未來方向:邁向肥胖精準(zhǔn)防控的“最后一公里”盡管功能注釋的臨床轉(zhuǎn)化已取得初步進(jìn)展,但仍面臨諸多挑戰(zhàn),需通過跨學(xué)科協(xié)作突破瓶頸。當(dāng)前挑戰(zhàn)1.功能注釋的局限性:-非編碼變異的解析難題:僅10%的非編碼變異通過實驗驗證功能,多數(shù)變異的調(diào)控機制仍未知(如遠(yuǎn)端增強子通過染色質(zhì)環(huán)調(diào)控靶基因的機制尚未闡明)。-組織特異性與動態(tài)性:變異的功能可能因組織(如脂肪vs.下丘腦)、發(fā)育階段(胎兒vs.成年)而異,現(xiàn)有模型(如細(xì)胞系、動物模型)難以完全模擬生理環(huán)境。2.臨床轉(zhuǎn)化的障礙:-倫理與隱私問題:基因數(shù)據(jù)涉及個人隱私,PRS檢測可能引發(fā)“基因歧視”(如保險公司拒絕承保),需建立完善的數(shù)據(jù)保護法規(guī)(如GDPR、中國《個人信息保護法》)。-成本效益比:PRS檢測、多組學(xué)分析成本較高(單次檢測約2000-5000元),需通過技術(shù)進(jìn)步降低成本,并驗證其在長期健康管理中的成本效益(如預(yù)防1例糖尿病需投入的成本)。當(dāng)前挑戰(zhàn)-臨床認(rèn)知與應(yīng)用不足:多數(shù)臨床醫(yī)生對遺傳變異功能注釋的理解有限,缺乏“從基因到臨床”的轉(zhuǎn)化思維,需加強醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)培訓(xùn)。3.人群差異的復(fù)雜性:-遺傳異質(zhì)性:不同人群的易感位點、效應(yīng)頻率差異顯著(如非洲人群GWAS位點發(fā)現(xiàn)率僅為歐州人群的1/3),需加強全球多人群合作(如H3Africa計劃)。-環(huán)境因素差異:不同地區(qū)飲食結(jié)構(gòu)(如高碳水vs.高脂)、生活方式(如久坐時間)不同,影響遺傳效應(yīng)的表達(dá),需建立“人群特異性-環(huán)境”交互模型。未來方向1.技術(shù)創(chuàng)新:多組學(xué)與人工智能的深度融合:-單細(xì)胞多組學(xué):利用空間轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞ATAC-seq等技術(shù),解析變異在特定細(xì)胞類型、空間位置的功能,例如下丘腦ARC神經(jīng)元中POMC與NPY神經(jīng)元的遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。-人工智能輔助注釋:通過深度學(xué)習(xí)模型(如Transformer、圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò))整合GWAS、多組學(xué)數(shù)據(jù),預(yù)測變異功能(如DeepSEA、Enformer模型),準(zhǔn)確率較傳統(tǒng)方法提升30%。未來方向2.臨床研究:前瞻性隊列與真實世界證據(jù):-大規(guī)模前瞻性隊列:建立包含10萬人的“肥胖遺傳-環(huán)境-健康”前瞻性隊列,長期追蹤PRS、生活方式與肥胖并發(fā)癥的關(guān)系,驗證風(fēng)險模型的預(yù)測效能。-真實世界研究:通過電子病歷、醫(yī)保數(shù)據(jù)庫分析“基因指導(dǎo)治療”的長期效果(如MC4R激動劑使用5年的體重維持率、心血管事件發(fā)生率)。3.跨學(xué)科合作:基礎(chǔ)-臨床-公共衛(wèi)生的協(xié)同:-建立“遺傳學(xué)家-臨床醫(yī)生-公共衛(wèi)生專家”聯(lián)合團隊,從“實驗室發(fā)現(xiàn)”到“臨床應(yīng)用”再到“群體防控”形成閉環(huán)。例如,針對FTO變異,基
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