1、第二章 原核生物及主要類群,2.1原核生物的分類和鑒定 2.2真細(xì)菌 2.3古細(xì)菌,分類 鑒定-分類的操作過程 命名,一、細(xì)菌分類的原則,界（Kingdom） 門（Phylum） 綱（Class） 目（Order） 科（Family） 屬（Genus） 種（Species）基本單位 亞種（Subspecies，subsp.或ssp.） 變種（Variety，var.）,菌株：?jiǎn)蝹€(gè)細(xì)胞或1個(gè)孢子在人工培養(yǎng)基上繁殖而來的群體。 ATCC-美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心 雙名法(參照P137) 三名法,二、細(xì)菌分類鑒定的依據(jù)和方法,（一）傳統(tǒng)方法（常規(guī)鑒定方法） 主要根據(jù)細(xì)菌形態(tài)、培養(yǎng)特征和生理生化特性 1

2、.細(xì)菌形狀、大小、結(jié)構(gòu)和染色反應(yīng),0.5-1 mm （直徑）,0.2-1mm（直徑）X 1-80mm（長(zhǎng)度）,0.3-1mm（直徑）X 1-50 mm長(zhǎng)度） (長(zhǎng)度是菌體兩端點(diǎn)之間的距離，而非實(shí)際長(zhǎng)度),(1)球菌（ cocci ） 球菌是球狀細(xì)菌的總稱。,四聯(lián)球菌、鏈球菌、八疊球菌、葡萄球菌,Arrangement of Spherical Bacterial Cells,桿菌只在短軸面分裂,(2)桿菌（Bacilli）,Single bacillus,Diplobacilli,streptobacilli,Coccobacillus,Vibrio, Spirillum and Spiroc

3、hete,弧菌,螺旋菌,螺旋體,螺旋菌是細(xì)胞呈彎曲桿狀細(xì)菌統(tǒng)稱。根據(jù)其長(zhǎng)度、螺旋數(shù)目和螺距等差別， 分為弧菌Vibrio和螺旋菌（螺旋狀，超過1圈）。,與螺旋體 Spirochaete 區(qū)別：螺旋菌靠鞭毛運(yùn)動(dòng)，而螺旋體靠軸絲運(yùn)動(dòng)，無鞭毛；螺旋菌剛性強(qiáng)，螺旋體柔韌。,2. 細(xì)菌的群體形態(tài),（1）菌落形態(tài) 菌落：在固體平板培養(yǎng)基上，細(xì)菌局限在一處大量繁殖，聚集形成的團(tuán)塊。 細(xì)菌菌落大多數(shù)表面光滑濕潤(rùn)，黏稠、有光澤，菌落較小，同培養(yǎng)基結(jié)合不緊密，有臭味。,菌落的特征： （包括大小、形狀、顏色、邊緣、質(zhì)地、透明度、光澤、表面、濕潤(rùn)度等）,菌苔：,菌苔：微生物密集生長(zhǎng)所形成的。其作用是可用來保存菌種。,

4、細(xì)菌形態(tài)不是一成不變，受環(huán)境條件影響 （如溫度、培養(yǎng)基濃度及組成、菌齡等）,細(xì)菌培養(yǎng)特征,液體培養(yǎng)基,表面生長(zhǎng),沉淀生長(zhǎng),混濁生長(zhǎng),3.生理生化特性測(cè)定,Carbohydrate Fermentation Tests 糖發(fā)酵試驗(yàn),Urease Test 尿素酶試驗(yàn),Citrate Utilization Test 枸櫞酸鹽利用試驗(yàn),利用枸櫞酸鹽生長(zhǎng) + 不能利用 -,大腸桿菌 產(chǎn)氣桿菌,Indole Test 吲哚試驗(yàn),色氨酸吲哚玫瑰吲哚 吲哚試劑,大腸桿菌 產(chǎn)氣桿菌,（二）分子分類法,1.G+C百分比測(cè)定 2.核酸雜交 3.16S rRNA堿基測(cè)序,系統(tǒng)分類中常用的數(shù)據(jù)庫(kù),NCBI（美國(guó)國(guó)家

5、生物技術(shù)信息中心） EBI（歐洲生物信息研究所）,細(xì)菌的分類系統(tǒng),兩部著作： 伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)，1923年以來已出至第九版（1994）； 伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)1984年問世，至1989年出齊，共4卷。,2.1原核生物的分類和鑒定 2.2真細(xì)菌 2.3古細(xì)菌,植物病原細(xì)菌分屬于棒桿菌屬、黃單胞桿菌屬，假單胞桿菌屬、土壤桿菌屬和歐氏桿菌屬,一、革蘭氏陰性菌,1.固氮菌屬 自生固氮 2.根瘤菌 與豆科植物共生固氮 3.腸道細(xì)菌 大腸桿菌（Escherichia coli）常被用于分子遺傳學(xué)和遺傳工程方面，構(gòu)建新的工程菌。 4.假單胞菌、黃單胞菌,飲用水的微生物指標(biāo)： 總菌數(shù)： 100個(gè)/ml 大

6、腸桿菌： 3 個(gè)/L,（一）、需氧性桿菌,（二）、支原體、立克次氏體和衣原體,支原體（Mycoplasma） 立克次氏體（Rickettsia） 衣原體（Chlamydia） 革蘭氏陰性細(xì)菌，,立克次氏體（Rickettsia）專性活細(xì)胞內(nèi)寄生的 原核微生物。,1. 立克次氏體（Rickettsia）,H.T.Ricketts 1909年， 首次發(fā)現(xiàn)斑疹傷寒的 病原體，并因研究此 病而犧牲，1916年人 們以他的名字命名 這類病原體作為紀(jì)念。,a 概念,2. 支原體（Mycoplasma）,a 概念,又稱類菌質(zhì)體，是介于一般細(xì)菌與立克次氏體之間 的原核微生物。,b 特性,1）無細(xì)胞壁，細(xì)胞形態(tài)

7、多變；,2）個(gè)體很小，能通過細(xì)菌過濾器，曾被認(rèn)為是 最小的可獨(dú)立生活的細(xì)胞型生物。,3）可進(jìn)行人工培養(yǎng)，但營(yíng)養(yǎng)要求苛刻，菌落微 小，呈典型的“油煎荷包蛋”形狀；,4）一些支原體能引起人類、牲畜、家禽和作物 的病害疾病,3. 衣原體（Chlamydia）,a 概念,介于立克次氏體與病毒之間，能通過細(xì)菌濾器， 專性活細(xì)胞內(nèi)寄生的一類原核微生物。,過去誤認(rèn)為“大病毒”，但它們的生物學(xué)特性更接近細(xì)菌而不同于病毒。,在宿主細(xì)胞內(nèi)觀察到的 衣原體微菌落（microcolony）,b 特性,1）細(xì)胞結(jié)構(gòu)與細(xì)菌類似；,2）細(xì)胞呈球形或橢圓形，能通過細(xì)菌濾器；,3）專性活細(xì)胞內(nèi)寄生；,4）在宿主細(xì)胞內(nèi)生長(zhǎng)繁殖具

8、有獨(dú)特的生活周期，即存在 原體和始體兩種形態(tài)。,5）衣原體廣泛寄生于人類、哺乳動(dòng)物及鳥類，少數(shù)致??；,1956年，我國(guó)微生物學(xué)家湯飛凡等應(yīng)用雞胚卵黃囊接種法， 在國(guó)際上首先成功地分離培養(yǎng)出沙眼衣原體。,沙眼衣原體是人類沙眼的病原體，甚至引起結(jié)膜炎、角膜炎、 等臨床癥狀，成為致盲的重要原因。,沙眼,（三）蛭弧菌（ Bdellovirio ）,單生鞭毛，獵食其它G-，稱為細(xì)菌的寄生者或獵食者。 生活史分生長(zhǎng)期和侵染期,(四)、藍(lán)細(xì)菌（Cyanobacteria）,1、概念,也稱藍(lán)藻或藍(lán)綠藻是一類含有葉綠素a、通過光 合作用同化CO2為有機(jī)物質(zhì)的光合細(xì)菌。,2、特性,1）分布極廣；可固氮的種類多,許

9、多藍(lán)細(xì)菌生長(zhǎng)在池塘和 湖泊中，在夏、秋兩季大 量繁殖，并形成膠質(zhì)團(tuán)浮 于水面，形成“水華”，使 水體變色。,2）形態(tài)差異極大，有球狀、桿狀和絲狀等形態(tài)；,3）細(xì)胞中含有葉綠素a，進(jìn)行產(chǎn)氧型光合作用；,4）具有原核生物的典型細(xì)胞結(jié)構(gòu)：,5）異形胞是進(jìn)行固氮的場(chǎng)所。,6）分泌粘液層、莢膜或形成鞘衣，具有強(qiáng)的抗干旱能力。,7）無鞭毛，但能在固體表面滑行，進(jìn)行光趨避運(yùn)動(dòng)。,8）許多種類細(xì)胞質(zhì)中有氣泡，使菌體漂浮，保持在光線 最充足的地方，以利光合作用。,異形胞-絲狀藍(lán)藻所特有 （魚腥、念珠藍(lán)細(xì)菌屬） 營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞光合作用產(chǎn)生的糖 異形胞， 異形胞（谷氨酸鹽） 營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞,絲狀項(xiàng)圈藻 (SEM x5,000)

10、,二、革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌,1.革蘭氏陽(yáng)性球菌 雙球菌、鏈球菌、葡萄球菌、四聯(lián)球菌、 八疊球菌 如金黃葡萄球菌、乳鏈球菌、肺炎雙球菌,2.革蘭氏陽(yáng)性桿菌,a 芽孢桿菌（枯草芽孢桿菌、巨大芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、蘇云金芽孢桿菌） b G+無芽孢桿菌-棒桿菌屬（放線菌） 引起馬鈴薯環(huán)腐病 C 乳桿菌食品發(fā)酵中，牛奶接入嗜熱鏈球菌和保加利亞乳桿菌可發(fā)酵成乳酸。,三、放線菌,（一）概念（P163）,放線菌單細(xì)胞，由菌絲組成、以孢子進(jìn)行繁殖、G+的一類原核微生物，屬于真細(xì)菌范疇。 (6378% GC含量高),（二）形態(tài)與結(jié)構(gòu),1、營(yíng)養(yǎng)菌絲,也稱基內(nèi)菌絲,功能:吸收營(yíng)養(yǎng)，排泄廢物。,2、氣生菌絲,較基內(nèi)菌絲粗，功能是分化成孢子絲,3、孢子絲,又稱產(chǎn)孢絲或繁殖菌絲，功能是形成孢子。常被 作為對(duì)放線菌進(jìn)行分類的依據(jù)。,孢子絲,培養(yǎng)基,基內(nèi)菌絲,氣生菌絲,早期菌落類似細(xì)菌，后期表面干燥、粉粒狀并常有輻射皺折。菌落一般小，質(zhì)地較密，不易挑起，不易挑起并常有各種不同的顏色。打開皿蓋時(shí)可聞到菌落產(chǎn)生的土腥味。,（三）菌落特征,主要通過形成無性孢子的方式進(jìn)行繁殖， 也可靠菌絲片斷進(jìn)行繁殖。 孢子形成方式：橫隔分裂。,（四）繁殖,（五）分布特點(diǎn)及與人類的關(guān)系,能產(chǎn)生大量的、種類繁多的抗生素 （其中90%由鏈霉菌產(chǎn)生）,少數(shù)寄生型放線菌可引起人、動(dòng)物（如皮膚、 腦、肺和腳部感染）、植物（如馬鈴薯