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文檔簡介
1、,1,主要內(nèi)容,CMA在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況 CMA芯片平臺選擇 CMA應(yīng)用于產(chǎn)前診斷的臨床指征 CMA檢測前后的遺傳咨詢及結(jié)果解釋,2,CMA在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況,3,CMA在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用概況,在染色體核型分析未發(fā)現(xiàn)異常的病例中,CMA 技術(shù)對基因組不平衡重組的額外檢出率為0.4%50%(變異范圍較大的原因主要為樣本量、樣本選擇標(biāo)準(zhǔn)及芯片平臺存在差異),臨床意義不明確的CNV比例為1.4%; 在超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常且核型正常的病例中,CMA 技術(shù)的額外檢出率為10%,VOUS 比例為2.1%; 超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常且CMA 檢測正常的病例中,染色體核型分析的額外檢出率為0.8%,其中絕
2、大部分為染色體平衡重組。 而在CMA 檢測結(jié)果未發(fā)現(xiàn)異常的病例中,染色體核型分析的額外檢出率為0.6%,其中絕大部分為染色體平衡易位或倒位。,2013 年Hillman 等的meta 分析共涉及25 篇文獻(xiàn)共18 113 例個體:,CMA 技術(shù)可以作為臨床產(chǎn)前診斷常規(guī)檢測的 一部分,對于所有介入性產(chǎn)前診斷,特別是超聲提示胎兒結(jié)構(gòu)異常者,應(yīng)用CMA 技術(shù)可明顯提高有臨床意義的CNV 檢出率。,4,CMA芯片平臺選擇,基于微陣列的比較基因組雜交技術(shù)(aCGH),單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)(SNP array),優(yōu)勢:用戶可根據(jù)需要設(shè)計并制作芯片 可針對特定區(qū)域設(shè)計高密度探針 以增加在該區(qū)域的檢測靈敏
3、度和特異性,優(yōu)勢:SNP 芯片除了帶有拷貝數(shù)信息外, 還帶有SNP 分型的信息; 可檢測雜合性缺失(loss of heterozygous,LOH),從而用于檢測單親二倍體(uniparental disomy,UPD)、低水平嵌合體(mosaic)、近親婚配及三倍體。,5,6,CMA檢測前的遺傳咨詢,1. CMA 技術(shù)的優(yōu)勢:能夠檢出所有引起基因組不平衡改變的染色體異常,包括所有核型分析能夠檢出的染色體不平衡變異,以及核型分析無法檢出的染色體微缺失與微重復(fù)。 2. CMA 技術(shù)的局限性: (1) 無法檢測平衡染色體重組、極低比例嵌合體(10%)、某些標(biāo)記染色體、單基因突變及DNA 甲基化異
4、常、aCGH 芯片還無法檢測三倍體。 (2)可能會發(fā)現(xiàn)VOUS,即可能需要對父母樣本進(jìn)行檢測,通過家系綜合分析,以協(xié)助對胎兒檢測結(jié)果的判讀。但基于目前對人類基因組的認(rèn)識和數(shù)據(jù)庫的積累程度,仍然無法對某些檢測結(jié)果進(jìn)行精確判讀和解釋。,7,3. 檢出疾病的遺傳異質(zhì)性:所檢出的某些遺傳性疾病由于外顯率和表現(xiàn)度的差異,在不同患者間臨床表現(xiàn)可能存在很大的變異。 4. 可能檢出與臨床表型不相關(guān)的CNV:通過CMA 技術(shù)檢測可能發(fā)現(xiàn)非親生父親、近親婚配、遲發(fā)性的遺傳病或成人期發(fā)病的遺傳病(如腫瘤),這些結(jié)果應(yīng)該讓孕婦及家屬選擇是否被告知。,CMA檢測前的遺傳咨詢,8,CMA檢測報告及結(jié)果解釋,CMA 檢測的
5、臨床報告至少應(yīng)包括以下幾方面內(nèi)容:,9,CMA檢測后咨詢及臨床處理,1. 非致病性CNV: 基本可以排除由基因組不平衡改變而導(dǎo)致的遺傳病,但必須向患者說明CMA 技術(shù)不能檢測所有的遺傳病,如極低比例嵌合體(10%)、平衡染色體重組、單基因突變等。 2. 致病性CNV:(1)胎兒檢出明確致病性染色體微缺失或微重復(fù)綜合征:若其父母有再次妊娠計劃,應(yīng)建議父母行CMA 檢測以明確胎兒致病性片段是新發(fā)突變還是遺傳自父母,以對再次生育作遺傳風(fēng)險評估。(2)胎兒同時檢出缺失和重復(fù): 胎兒的缺失和重復(fù)可能來源于親代的染色體平衡易位片段的不平衡分離,若其父母有再次妊娠計劃,應(yīng)對父母樣本進(jìn)行熒光原位雜交FISH或
6、染色體核型分析以排除染色體相互易位或倒位,并對再發(fā)風(fēng)險進(jìn)行評估。,10,3. VOUS:應(yīng)建議父母行CMA 檢測,通過家系綜合分析以協(xié)助對胎兒檢測結(jié)果的判斷。 (1)新發(fā)CNV:若有證據(jù)表明該區(qū)域內(nèi)有疾病表型相關(guān)的功能基因,通常認(rèn)為是可能致病性;若該區(qū)域內(nèi)無基因,通常認(rèn)為是可能良性,也有可能目前未發(fā)現(xiàn)其臨床意義。 (2) 遺傳性CNV: 若胎兒父母有臨床表型,且該區(qū)域內(nèi)有疾病表型相關(guān)的功能基因,通常認(rèn)為該CNV 為可能致病性。 若胎兒父母無臨床表型,通常情況下,可判斷該CNV 為家族性良性CNV;若胎兒CNV與親代CNV 大小不同,且缺失或重復(fù)的范圍擴(kuò)大了,則應(yīng)考慮為可能致病性。此外,還需考慮不完全外顯、臨床表型差異(父母可能有亞臨床表現(xiàn))的可能。,11,CMA檢出數(shù)據(jù),對檢出的CNV進(jìn)行注釋,致病性CNV,良性CNV,臨床意義不確定CNV,報告對應(yīng)的遺傳
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