1、GO(geneontology)是基因本體聯(lián)合會(huì)(GeneOnotologyConsortium)所建立的數(shù)據(jù)庫(kù)，旨在建立一個(gè)適用于各種物種的，堆積因和蛋白質(zhì)功能進(jìn)行限定和描述的，并能隨著研究不斷深入而更新的語(yǔ)言詞匯標(biāo)準(zhǔn).GO 是多種生物本體語(yǔ)言中的一種，提供了三層結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)定義方式，用于描述基因產(chǎn)物的功能.基因本體論(geneontology)的建立現(xiàn)今的生物學(xué)家們浪費(fèi)了太多的時(shí)間和精力在搜尋生物信息上。這種情況歸結(jié)為生物學(xué)上定義混亂的原因：不光是精確的計(jì)算機(jī)難以搜尋到這些隨時(shí)間和人為多重因素而隨機(jī)改變的定義，即使是完全由人手動(dòng)處理也無(wú)法完成。舉個(gè)例子來(lái)說(shuō)，如果需要找到一個(gè)用于制抗生素的藥物

2、靶點(diǎn)，你可能想找到所有的和細(xì)菌蛋白質(zhì)合成相關(guān)的基因產(chǎn)物，特別是那些和人中蛋白質(zhì)合成組分顯著不同的。但如果一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)描述這些基因產(chǎn)物為“翻譯類(lèi)”，而另一個(gè)描述其為“蛋白質(zhì)合成類(lèi)”，那么這無(wú)疑對(duì)于計(jì)算機(jī)來(lái)說(shuō)是難以區(qū)分這兩個(gè)在字面上相差甚遠(yuǎn)卻在功能上相一致的定義。GeneOntology(GO)項(xiàng)目正是為了能夠使對(duì)各種數(shù)據(jù)庫(kù)中基因產(chǎn)物功能描述相一致的努力結(jié)果。這個(gè)項(xiàng)目最初是由 1988 年對(duì)三個(gè)模式生物數(shù)據(jù)庫(kù)的整合開(kāi)始：FlyBase(果蠅數(shù)據(jù)庫(kù) Drosophila),tSaccharomycesGenomeDatabase(酵母基因組數(shù)據(jù)庫(kù)SGD)andtheMouseGenomeDatabas

3、e(小鼠基因組數(shù)據(jù)庫(kù) MGD)從那開(kāi)始，GO斷發(fā)展擴(kuò)大，現(xiàn)在已包含數(shù)十個(gè)動(dòng)物、植物、微生物的數(shù)據(jù)庫(kù)。GO 勺定義法則已經(jīng)在多個(gè)合作的數(shù)據(jù)庫(kù)中使用， 這使在這些數(shù)據(jù)庫(kù)中的查詢具有極高的一致性。這種定義語(yǔ)言具有多重結(jié)構(gòu)，因此在各種程度上都能進(jìn)行查詢。舉例來(lái)說(shuō)，GO以被用來(lái)在小鼠基因組中查詢和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因產(chǎn)物，也可以進(jìn)一步找到各種生物地受體酪氨酸激酶。這種結(jié)構(gòu)允許在各種水平添加對(duì)此基因產(chǎn)物特性的認(rèn)識(shí)。GO展了具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)語(yǔ)言(ontologies),如表所示。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關(guān)分子功能，生物學(xué)途徑，細(xì)胞學(xué)組件而給予定義，無(wú)物種相關(guān)性。本體論內(nèi)容分子功能本體論基因產(chǎn)物個(gè)體的功能，如與碳水化

4、合物結(jié)合或 ATP水解酶活性等生物學(xué)途徑本體論分子功能的有序組合，達(dá)成更廣的生物功能，如有絲分裂或喋吟代謝等細(xì)胞組件本體論亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)、位置和大分子復(fù)合物，如核仁、端粒和識(shí)別起始的復(fù)合物等基本來(lái)說(shuō)，GOT 作可分為三個(gè)不同的部分：第一，給予和維持定義；第二，將位于不同數(shù)據(jù)庫(kù)中的本體論語(yǔ)言、基因和基因產(chǎn)物進(jìn)行聯(lián)系，形成網(wǎng)絡(luò)；第發(fā)展相關(guān)工具，使本體論的標(biāo)準(zhǔn)語(yǔ)言的產(chǎn)生和維持更為便捷。本體論(Theontologies)GO 勺結(jié)構(gòu)包括三個(gè)方面？D?附子生物學(xué)上的功能、生物學(xué)途徑和在細(xì)胞中的組件作用。當(dāng)然，它們可能在每一個(gè)方面都有多種性質(zhì)。如細(xì)胞色素 C,在分子功能上體現(xiàn)為電子傳遞活性，在生物學(xué)途徑中與

5、氧化磷酸化和細(xì)胞凋亡有關(guān)，在細(xì)胞中存在于線粒體質(zhì)中和線粒體內(nèi)膜上。下面，將進(jìn)一步的分別說(shuō)明 GO 勺具體定義情況。基因產(chǎn)物基因產(chǎn)物和其生物功能常常被我們混淆。 例如， “乙醇脫氫酶”既可以指放在 Eppendorf管里的基因產(chǎn)物， 也表明了它的功能。 但是這之間其實(shí)是存在差別的？D?r 個(gè)基因產(chǎn)物可以擁有多種分子功能，多種基因產(chǎn)物也可以行使同一種分子功能。比如還是“乙醇脫氫酶”，其實(shí)多種基因產(chǎn)物都具有這種功能，而并不是所有的這些酶都是由乙醇脫氫酶基因編碼的。一個(gè)基因產(chǎn)物可以同時(shí)具有“乙醇脫氫酶”和“乙醛歧化酶”兩種功能，甚至更多。所以，在 GC,很重要的一點(diǎn)在于，當(dāng)使用“乙醇脫氫酶活性”這種術(shù)

6、語(yǔ)時(shí)，所指的是功能，并不是基因產(chǎn)物。許多基因產(chǎn)物會(huì)形成復(fù)合物后執(zhí)行功能。這些“基因復(fù)合物”有些非常簡(jiǎn)單（如血紅蛋白由血紅蛋白基因產(chǎn)物 a球蛋白、B球蛋白和小分子的亞血紅素組成），有些非常復(fù)雜（如核糖體）?，F(xiàn)在，小分子的描述還沒(méi)有包括在 GOo在未來(lái)，這個(gè)問(wèn)題可望由和現(xiàn)在的 Klotho 和 LIGANDS 小分子數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)合而解決分子功能分子功能描述在分子生物學(xué)上的活性，如催化活性或結(jié)合活性。GM 子功能定義功能而不是整體分子，而且不特異性地指出這些功能具體的時(shí)空信息。分子功能大部分指的是單個(gè)基因產(chǎn)物的功能，還有一小部分是此基因產(chǎn)物形成的復(fù)合物的功能。定義功能的義項(xiàng)包括催化活性、轉(zhuǎn)運(yùn)活性、結(jié)合活

7、性等，更為狹窄的定義包括腺甘酸環(huán)化酶活性或鐘形受體結(jié)合活性等。生物學(xué)途徑生物學(xué)途徑是由分子功能有序地組成的，具有多個(gè)步驟的一個(gè)過(guò)程。舉例來(lái)說(shuō)，較為寬泛的是細(xì)胞生長(zhǎng)和維持、信號(hào)傳導(dǎo)。一些更為具體的例子包括喀呢代謝或 a-配糖基的運(yùn)輸?shù)?。一個(gè)生物學(xué)途徑并不是完全和一條生物學(xué)通路相等。因此，GQ不涉及到通路中復(fù)雜的機(jī)制和所依賴(lài)的因素。細(xì)胞組件細(xì)胞中的位置指基因產(chǎn)物位于何種細(xì)胞器或基因產(chǎn)物組中核糖體，蛋白酶體等）。GO 勺形式GO 定義的術(shù)語(yǔ)有著直接非循環(huán)式（directedacyclicgraphs（DAGs）的特點(diǎn)，而并非是（如糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，核或傳統(tǒng)的等級(jí)制（hierarchy）定義方式（隨著代數(shù)增

8、加，下一級(jí)比上一級(jí)更為具體）。舉個(gè)例子來(lái)說(shuō)，生物學(xué)途徑中有一個(gè)定義是己糖合成，它的上一級(jí)為己糖代謝和單糖合成。當(dāng)某個(gè)基因被注解為“己糖合成活性”后，它自動(dòng)地獲得了己糖代謝和單糖合成地注解。因?yàn)樵?GOt,每個(gè)術(shù)語(yǔ)必須遵循“真途徑”法則，即如果下一代的術(shù)語(yǔ)可以用于描述此基因產(chǎn)物，具上一代術(shù)語(yǔ)也可以適用。GO 的注釋?zhuān)ˋnnotation）那么，GOt 的術(shù)語(yǔ)如何和相對(duì)應(yīng)的基因產(chǎn)物相聯(lián)系的呢？這是由參與合作的數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)完成的，它們使用 GO 的定義方法，對(duì)它們所包含的基因產(chǎn)物進(jìn)行注解，并且提供支持這種注解的參考和證據(jù)。每個(gè)基因或基因產(chǎn)物都會(huì)有一個(gè)列表，列出與之相關(guān)的 GC語(yǔ)。每個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)都會(huì)給出這些基

9、因產(chǎn)物和 GO 術(shù)語(yǔ)的聯(lián)系數(shù)據(jù)庫(kù)， 并且也可以在 GO 的 ftp 站點(diǎn)上和 WEBT 式查詢到。并且，GC合會(huì)提供了簡(jiǎn)化的本體論術(shù)語(yǔ)（GOslim）,這樣，可以在更高級(jí)的層面上研究基因組的功能。比如，粗略地估計(jì)哪一部分的基因組與信號(hào)傳導(dǎo)、代謝合成或復(fù)制有關(guān)。GO 對(duì)基因和蛋白的注釋闡明了基因產(chǎn)物和用于定義他們的 GOWS 之間的關(guān)系。基因產(chǎn)物指一個(gè)基因編碼的 RNA|蛋白產(chǎn)物。因?yàn)橐粋€(gè)基因可能編碼多個(gè)具有很不相同性質(zhì)的產(chǎn)物，所以 GC 推薦的注釋是針對(duì)基因產(chǎn)物的而不是基因的。一個(gè)基因是和所有適用于它的術(shù)語(yǔ)聯(lián)系在一起的。一個(gè)基因產(chǎn)物可以被一種本體論定義的多種分支或多種水平注釋。注釋需要反映在正

10、常情況下此基因產(chǎn)物的功能，生物途徑，定位等，而并不包括其在突變或病理狀態(tài)下的情況。GOK 合會(huì)的各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)成員采用手動(dòng)或自動(dòng)的方式生成注釋?zhuān)@兩種方式共有的原理是：一.所有的注釋都需要有來(lái)源，可以是文字、另一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)或是計(jì)算機(jī)分析結(jié)果；二.注釋必須提供支持這種基因產(chǎn)物和 GO語(yǔ)之間聯(lián)系的證據(jù)。GOJ：件格式GO 勺所有數(shù)據(jù)都是免費(fèi)獲得的。GOt 據(jù)有三種格式：flat（每日更新）、XML 每月更新）和 MySQL 每月更新）。這些數(shù)據(jù)格式都可以在 GOtp 的站點(diǎn)上下載。XML 和 MySQL文件是被儲(chǔ)存于獨(dú)立的 GOt 據(jù)庫(kù)中。如果需要找到與某一個(gè) GO語(yǔ)相關(guān)的基因或基因產(chǎn)物， 可以找到一個(gè)

11、相應(yīng)表格， 搜尋到這種注解的編號(hào)，并且可以鏈接到與之對(duì)應(yīng)的位于不同數(shù)據(jù)庫(kù)的基因相關(guān)文件。GOSU 覽器和彳改器(browserandeditor)GC語(yǔ)和注釋使用了多種不同的工具軟件，它們都可以在 web 方式的“GO 瀏覽器”下“GOsoftwarepage”中找到。大多數(shù) GOM 覽器都是 web 模式的，允許你直觀的看到術(shù)語(yǔ)和其相關(guān)信息，如定義、同義詞和數(shù)據(jù)庫(kù)參考等。有些 GOM覽器如 AmiGOF 口 QuickGO,可以看到每個(gè)術(shù)語(yǔ)的注釋。而可下載的 DAG-Edit 編輯器，一樣可以離線地顯示注釋和所有本體論定義的信息。對(duì)于每一個(gè)瀏覽器來(lái)說(shuō)，都可以選擇最適用于你要求的工具軟件。常見(jiàn)

12、的三種瀏覽器AmiGOfromBDGPftAmiG 時(shí)，可以通過(guò)查詢一個(gè) GO語(yǔ)而得到所有具有這個(gè)注釋的基因產(chǎn)物，或查詢一個(gè)基因產(chǎn)物而得到它所有的注釋關(guān)系。還可以瀏覽本體論，得到術(shù)語(yǔ)之間的關(guān)系和術(shù)語(yǔ)對(duì)應(yīng)的基因產(chǎn)物數(shù)目。AmiGOft 接連接 GO下的 MySQLMGIGOBrowserMGIGO 勺功能類(lèi)似于 AmiGO 所不同的在于它所得到的基因?yàn)樾∈蠡?。MGIGOM 覽器直接連接 GO 下的 MGI 數(shù)據(jù)庫(kù)。QuickGOatEBIQuickGO整合在 EBI 下的 InterPro 中，可以通過(guò)查詢一個(gè) 6 城語(yǔ)而得到它的定義與關(guān)系描述、在SWISS-PROT 的定位、在酶分類(lèi)學(xué)（EQ

13、 和轉(zhuǎn)運(yùn)分類(lèi)學(xué)（T。中的定位和 InterPro 中的定位等。其他還有一些特殊的瀏覽 GO 的瀏覽器，其中括號(hào)中為建立機(jī)構(gòu)和主要特色：EPGOBrowser （EBI,基因表達(dá)情況） ,、 GoFish （Harvard,Boolean 查詢、 GenNav （NLM,圖像化展示）、GeneOntologyRZPD（RZPDUniGene）、ProToGO（HebrewUniversity,GO 勺亞圖像化）、CGAPGOBrowser（癌癥基因組解剖工程，癌癥）、GOBrowser（川 uminae,perl.、TAIRKeywordBrowser（TAIR,擬南芥）、PANDORA（Heb

14、rewUniversity,非一致化蛋白）。修改器GO 術(shù)語(yǔ)和本體論結(jié)構(gòu)可以由任何可以讀入 G0板文件的文本修改器進(jìn)行編輯，但是這需要對(duì)平板文件非常熟悉。因此，DAG-Edit 是被推薦使用的，它是為 GO特別設(shè)計(jì)的， 能夠保證文件的句法正確。 GC 注釋可以被多種數(shù)據(jù)庫(kù)特異性的工具所編輯，如 TIGRISManatee 和 EBI 的 Talismantool。但是 GOR 據(jù)庫(kù)中寫(xiě)入新的注釋是需要通過(guò)GO 認(rèn)證的管理員方可進(jìn)行的，如果想提出新的注釋或?qū)Ρ倔w論的建議，可以聯(lián)系 GO主要修改器為 DAG-Edit 和 COBrADAG-Edit 基于 Java 語(yǔ)言，提供了能瀏覽、查詢、編輯具

15、有 DAGB 據(jù)格式的 GCK 據(jù)界面。在 SourceForge 可以免費(fèi)下載，伴隨著幫助文件。COBrAtt 夠編輯和定位 GOf 口 OB 冰體論。它一次顯示兩個(gè)本體論，因此可以在不同的水平相應(yīng)定位。（如組織和細(xì)胞類(lèi)型水平）優(yōu)點(diǎn)在于可以綜合幾種本體論，支持的文件格式多，包括 G0板文件、GORDFffiOWL&式等。如圖為 DAG-Edit 的界面，可以分為四個(gè)部分:1)定義編輯面板(termeditorpanel)顯示當(dāng)下的本體論。也是主要的“輯本體論結(jié)構(gòu)的工具，可以通過(guò)點(diǎn)擊和拖動(dòng)術(shù)語(yǔ)來(lái)修改本體論的從屬關(guān)系。2)文本編輯面板(texteditorpanel)修改術(shù)語(yǔ)中的內(nèi)容。在

16、修改多個(gè)術(shù)語(yǔ)時(shí)，會(huì)出現(xiàn)一個(gè)選擇菜單，可以選中后逐個(gè)修改。3)DAG 瀏覽器DAGW 覽器是一個(gè)插件，能夠以圖形的方式展示具有復(fù)雜的從屬關(guān)系的術(shù)語(yǔ)。4)搜尋/屏蔽面板可搜尋術(shù)語(yǔ)、術(shù)語(yǔ)類(lèi)型和術(shù)語(yǔ)間關(guān)系。可自定義屏蔽條件，限制得出的搜尋結(jié)果。GC 數(shù)據(jù)庫(kù)的查找和瀏覽 FAQ1 .如何搜尋注釋?zhuān)渴褂?AmiGOM 覽器，可以在所有參與的數(shù)據(jù)庫(kù)中搜尋一個(gè)特定的注解。AmiGOfc 許使用 GO語(yǔ)或基因產(chǎn)物的搜尋。 搜尋結(jié)果包括 GO 寸這個(gè)術(shù)語(yǔ)的等級(jí)分級(jí)情況， 定義和近義結(jié)構(gòu)，外部鏈接，所有相聯(lián)系的基因產(chǎn)物和它的下一級(jí)術(shù)語(yǔ)。2 .如何得到全部的 GOtt 釋?zhuān)吭?GO 網(wǎng)站上，基因產(chǎn)物與 GO系的組信息

17、都有提供。這些文件儲(chǔ)存了基因/基因產(chǎn)物的 ID 和引用文獻(xiàn)等支持證據(jù)(如 FlyBase 基因 ID,SWISS-PRO 蛋白 ID),在 ftp 站點(diǎn)上都可以獲得。3 .在一些模式生物中， 一個(gè)基因通常有多個(gè)與之相關(guān)的核甘酸序列， 如 EST 蛋白序列等。要查詢到這些序列，可以從該模式生物數(shù)據(jù)庫(kù)中通過(guò)基因聯(lián)系(geneassociation)查詢至U 基因獲得 ID(geneaccessionID),或是分另在 Compugen 中查詢大的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(transcipt)和 SWISS-PROT/TrEMBL 查詢蛋白。4 .如何得到由 GC 術(shù)語(yǔ)注解的蛋白序列？在 GO 網(wǎng)頁(yè)上選擇能查詢到所

18、有數(shù)據(jù)庫(kù)的 Amigo 瀏覽器，鍵入 GOM(如“線粒體”)，在結(jié)果中顯示了被注釋的基因。然后選擇你所需基因，在網(wǎng)頁(yè)的最低端把選項(xiàng)拖至“getfastasequence”區(qū)域，再確定即可。5 .如何能夠找到所有和一個(gè)特定的 GO語(yǔ)相關(guān)的人類(lèi)基因呢？60語(yǔ)是和 SWISS-PROT/TrEMBL/InterProandEnsembl 中的蛋白序列無(wú)贅余地對(duì)應(yīng)的。 這些注釋在 EBI 上的 GOA-HumanC 件中， GO 勺 FTP 站點(diǎn)上， Ensembl,EMBLBank上都可找到。6 .可以直接使用 GenBank 的 gi 獲取碼在 GO&據(jù)庫(kù)中進(jìn)行查詢嗎？GOK 據(jù)庫(kù)中除了

19、Compuge 所提供的 GenBan/取碼之外，沒(méi)有包含其他 GenBank 獲取碼的信息，但是在 EBI 的 GOA(GOAnnotation)中，有一個(gè)綜合的對(duì)GenBank/EMBL/DDBJ 行查詢的方式，詳細(xì)請(qǐng)見(jiàn)：ftp:/ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa/HUMAN/xrefs.goa.GOf 其他分類(lèi)系統(tǒng)的定位關(guān)系(MappingtoGO)GO 并不只是希望為基因組建立一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的、結(jié)構(gòu)清晰的注釋語(yǔ)言。GC 致力于各種基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的標(biāo)準(zhǔn)化。GO各種基因組分類(lèi)系統(tǒng)和 Goa 釋之間的轉(zhuǎn)化提供了轉(zhuǎn)化表，見(jiàn) http:/www.geneontolo

20、/GO.indices.html數(shù)據(jù)庫(kù)索引文件來(lái)源UniProtKnowledgebasespkw2goEvelynCamon(Note:spkw2gousedtobecalledswp2go,allfilesremainthesame.)EnzymeCommissionec2goMichaelAshburnerEGADegad2goMichaelAshburnerGenProtEQenprotec2goHeatherButlerandMichaelAshburnerTIGRroletigr2goMichaelAshburnerTIGRFamiliestigrfams2goTIGR

21、StaffInterProinterpro2goNicolaMulderMIPSFuncatmips2goMichaelAshburnerandMidoriHarrisMetaCycPathwaysmetacyc2goMichaelAshburnerandMidoriHarrisMultiFunClassificationsmultifun2goMichaelAshburner,JaneLomaxandMargretheHaugeSerresPfamDomainspfam2goNicolaMulderProdomDomainsprodom2gcNicolaMulderPrintsDomains

22、prints2goNicolaMulderProSiteDomainsprosite2goNicolaMulderSmartDomainssmart2goNicolaMulderREADME需要注意的是，這些轉(zhuǎn)化不是完全而精確的。其中的一個(gè)原因可能是 GOt 一套完整的定義系統(tǒng)，而很多數(shù)據(jù)庫(kù)并不具有。GO 的應(yīng)用GO勺局限性1. GO 不是基因序列或基因產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)，相反的，GO 雖調(diào)基因產(chǎn)物在細(xì)胞中的功能。2. G5 是整合數(shù)據(jù)庫(kù)的一種方式（如聯(lián)邦式整合數(shù)據(jù)庫(kù)），它并不能做到這點(diǎn)是因?yàn)椋篴.更新速度較慢b.由于每個(gè)人對(duì)數(shù)據(jù)定義的方式不同，標(biāo)準(zhǔn)難以達(dá)到一致。c.GO 并不對(duì)生物學(xué)的每個(gè)方面進(jìn)行描

23、述。如功能域的結(jié)構(gòu)、3D 結(jié)構(gòu)、進(jìn)化等。3. GO 是對(duì)基因功能的注解，但是有其局限性。比如說(shuō)，GO 不能反映此基因的表達(dá)情況，即是否在特定細(xì)胞中、特定組織中、特定發(fā)育階段或與某種疾病相關(guān)。GC然不涉及這些方面，但是支持其他的 OBO（openbiologyontologies）成員成立其他類(lèi)型的本體論數(shù)據(jù)庫(kù)（如發(fā)育本體學(xué)、蛋白組本體學(xué)、基因芯片本體學(xué)等）用于基因組分析基因組和全長(zhǎng) cDNAff 列工程通常會(huì)根據(jù)序列的相似性， 推測(cè)基因與已注釋的基因功能類(lèi)似?，F(xiàn)在最常用的手段是在 SWISS-PROT 列中設(shè)定一個(gè)相似性的域值,使用計(jì)算機(jī)化的方法來(lái)判斷。因此，根據(jù)這一原理，也可以得到新的 GO

24、 注釋?zhuān)ū粯?biāo)記為“根據(jù)電子注釋推測(cè)”）。一個(gè) GO 的重要應(yīng)用方面是對(duì)于一個(gè) GO 術(shù)語(yǔ)，能形成一個(gè)相聯(lián)系的基因產(chǎn)物組。舉例來(lái)說(shuō)，某一基因產(chǎn)物可以被精確地注釋為在碳水化合物代謝的一個(gè)特定的功能，如葡萄糖代謝，而在總結(jié)碳水化合物代謝時(shí)，所有這些基因產(chǎn)物都會(huì)聚集到一起。GO 計(jì)劃為每一個(gè)高頻出現(xiàn)的術(shù)語(yǔ)建立文檔總匯，現(xiàn)在有些已經(jīng)在“GOSlim”中實(shí)現(xiàn)了。用于基因表達(dá)分析如在芯片數(shù)據(jù)中引入 GC 注釋?zhuān)ǔ？梢越沂境鰹槭裁匆粋€(gè)特定組的基因擁有相似的表達(dá)模式。共表達(dá)的基因可能編碼在同一個(gè)生物過(guò)程中出現(xiàn)的基因產(chǎn)物，或定位于同一個(gè)細(xì)胞部位的。 如果未知基因和一些已被 GOS 程術(shù)語(yǔ)相似地注釋了的基因共表達(dá)，那么這個(gè)未知基因很有可能在同一個(gè)過(guò)程中發(fā)揮功能。分析和操作基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù)， 并且又能結(jié)合