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文檔簡介
1、第十一章第十一章 BCR/TCRBCR/TCR編碼基因及多樣性的產生編碼基因及多樣性的產生nB細胞和T細胞的抗原識別受體分別是BCR和TCR。nT和B 淋巴細胞在表達抗原識別受體上具有“一個細胞(克?。槐磉_一種受體”的特點,人體內T和B細胞克隆的總數(shù)在1012 以上,至少可以表達1012 種獨具識別特異性的TCR和BCR,此即淋巴細胞抗原識別受體的多樣性。nBCR即mIg,由四條多肽鏈組成;TCR由兩條多肽鏈組成 鏈或 鏈。BCR和TCR都有可變區(qū)和恒定區(qū)組成,不同克隆T、B細胞的BCR恒定區(qū)可以相同,但可變區(qū)是不同的第一節(jié) BCR、TCR基因結構一、胚系BCR基因結構nIg的基因由3組不
2、連鎖的基因群控制,即 輕鏈基因群、 輕鏈基因群和重鏈基因群。n各基因群中含有許多基因節(jié)段(segment)。n在未分化的胚系B細胞和其他有核體細胞的染色體中,編碼Ig分子可變區(qū)和恒定區(qū)各個部分的基因節(jié)段是相互分離的。n在B細胞發(fā)育過程中,一部分基因節(jié)段互相接近、重新排列,形成功能性的Ig基因單位,這一過程稱為基因重排(gene rearrangement)。n編碼人Ig基因在染色體上的分布:H鏈(14q32.3)、鏈(2p12)、鏈(22q11)。其在染色體上的總長度為80萬至200萬個bp(堿基對),是普通基因長度的50倍以上。n根據(jù)WHO命名委員會關于Ig分子多肽鏈及其編碼基因寫法規(guī)則,抗
3、體分子重、輕鏈分別寫為IgH、Ig 和Ig,相應的編碼基因簇分別以大寫斜體IGH、IGK和IGL代表。IGH中的V、D、J、和C基因片斷分別寫為IGHV、IGHD、IGHJ和IGHC。IGK和IGL基因簇中的V、J、C基因片斷分別寫為IGKV(或IGLV)、IGKJ(或IGLJ)、IGKC(或IGLC)。(一)胚系B細胞中Ig重鏈基因的結構n胚系B細胞中重鏈基因結構:(1)可變區(qū)由V(variable)基因、D(diversity)基因和J(joining)基因3個基因編碼;(2)編碼重鏈恒定區(qū)各亞類的C基因在可變區(qū)的下游呈簇狀串聯(lián)排列;(3)每個亞類(鏈除外)的重鏈恒定區(qū)基因節(jié)段上游都有一個
4、轉換區(qū),基因節(jié)段中編碼Ig各功能區(qū)的外顯子之間有內含子分隔,在功能區(qū)外顯子下游有控制免疫球蛋白分泌或膜結合的元件。n人IGH基因總長約1.3Mb,包括95個V、23個D、6個J和11個C基因節(jié)段。 n1Ig重鏈可變區(qū)(V)基因(1)VH基因: VH基因節(jié)段編碼重鏈可變區(qū)的疏水前導肽和N端的96 101個氨基酸,其中包括CDR1和CDR2。人的VH基因節(jié)段至少有95個,只有50個是功能基因,其余為假基因。(2)DH和JH 基因:CDR3由DH和JH基因共同編碼。DH基因位于VH和JH 基因之間。重排后的DH基因在序列和長度上變化很大,約編碼1 15個氨基酸。人的DH節(jié)段數(shù)目為23個。JH 基因在
5、DH基因的下游,位于CH基因上游。人的JH 基因有9個節(jié)段,其中3個是假基因。JH 基因節(jié)段編碼重鏈V區(qū)的其余氨基酸部分。n2Ig重鏈恒定區(qū)(C)基因(1)C區(qū)基因片段 編碼重鏈各亞類的CH基因在JH基因的下游成簇狀依次排列。人的CH基因有11個。CH基因節(jié)段在染色體上的排列與其編碼的免疫球蛋白在體內成熟的順序相似;C 基因和C 基因離JH基因最近,其次是各亞類C 基因,最后是C基因和C 基因。Ig的重鏈恒定區(qū)分為2 4個功能區(qū)和鉸鏈區(qū),在每個CH基因節(jié)段中同樣含有分別編碼各功能區(qū)的外顯子。除C 以外,其他CH基因節(jié)段前都有一個轉換區(qū)。轉換區(qū)與免疫應答過程中的類型轉換有關。(2)控制膜結合型或
6、分泌型Ig的基因(二)胚系B細胞中Ig輕鏈基因的結構n完整的輕鏈由3個基因編碼:V(variable)基因和J(joining)基因編碼可變區(qū),C(constant)基因編碼恒定區(qū)。n1鏈基因人的IGK基因簇總長2Mb,包括70個V(約半數(shù)為假基因,5個J 基因和一個C 基因。V 基因編碼Ig輕鏈V區(qū)110個氨基酸的主要部分(1 96)。每一個V 基因節(jié)段的5 都有一個編碼前導肽的前導序列(leader)。J 基因位于V 基因的下游,也串聯(lián)排列。V基因和J 基因中間有內含子(intron)分隔。J 基因編碼輕鏈V區(qū)的其余部分。只有1個C基因,位于J基因的下游。編碼 鏈恒定區(qū)。n2鏈基因IGL基
7、因總長約880kb,包括60個V(約20個為假基因)、7個J基因節(jié)段和7個C(4個功能基因)基因節(jié)段。 此外,IGL基因群中還包括2個VpreB和3個IGLL基因節(jié)段,分別在B細胞發(fā)育早期編碼PreBCR組成成分VpreB和IGLL(相當于小鼠的5)。二、胚系TCR基因結構nT細胞抗原識別受體(T cell receptor, TCR)的 、 四條肽鏈均由多個基因編碼組成,在胚胎期以生發(fā)系(germline)形式存在于染色體上。隨T 細胞的祖細胞(pro-T)在胸腺在的發(fā)育,TCR、 的各個基因節(jié)段先后發(fā)生重排,TCR功能性的基因完全重排,則轉錄為 mRNA,進而轉譯為多肽鏈,分別構成TCR
8、及TCR 兩肽鏈,再與CD3復合分子組裝,表達于T細胞膜上,與此同時,T細胞亦發(fā)育為免疫功能細胞。(一)TCR 鏈基因結構n 鏈基因的結構與Ig重鏈的結構相似,也是由V(variable)、D(diversity)和J(joining)基因編碼可變區(qū),由C基因編碼恒定區(qū)。nV 基因位于D 和J 基因的上游。各V基因節(jié)段(segment)隨機排列。人的V基因約有50 100個節(jié)段,分為30個亞家族,各亞家族含有1 9個成員。其中V30基因節(jié)段位于C2基因節(jié)段的下游,也可以通過反轉錄和插入機理形成功能性的V區(qū)。n人有2個D 基因片段,12 14bp長,分別位于J1和J2的上游,J1和J2各含有7個
9、J 節(jié)段,C1和C2分別位于J1和J2的下游。兩個C節(jié)段高度同源。nC基因節(jié)段有4個外顯子:第一個外顯子編碼Ig樣的C功能區(qū)和小部分TCR胞外區(qū)與穿膜區(qū)之間的連接氨基酸;第二個外顯子編碼連接氨基酸的中間部分;第三個外顯子編碼連接氨基酸的其余部分和全部穿膜區(qū);第四個外顯子編碼56個胞質內尾肽和3非翻譯區(qū)。兩個C節(jié)段的選用率相等,產生的蛋白質結構也相同。nTCR基因群位于人的染色體7q32。(二)TCR鏈基因的結構nTCR 鏈基因有三組:V、J 和C。各組基因中的節(jié)段成簇狀串聯(lián)排列在染色體上。n人胚系V 基因的節(jié)段數(shù)約在50 100個之間。J 基因含有至少50個節(jié)段。C 基因只有一個節(jié)段,此節(jié)段分
10、為四個外顯子:第一個外顯子編碼類似于Ig的C功能區(qū)。第二個外顯子編碼TCR胞外區(qū)與穿膜區(qū)之間的連接氨基酸部分;第三個外顯子編碼全部穿膜區(qū)和胞漿內尾肽。第四個外顯子的產物是3非翻譯區(qū)。C 基因中也沒有與分泌相關的片段。nTCR 基因群位于人的染色體14q11區(qū)帶。(三)TCR 鏈基因的結構nTCR的鏈也是由三組基因編碼:V、J 和C。n人的功能性V 基因節(jié)段已發(fā)現(xiàn)了8個。n人的C 只有2個節(jié)段。在C1上游有3個J1節(jié)段,在C2上游有2個J2節(jié)段。nTCR 基因群位于人染色體7p15。(四)TCR 鏈基因的結構n 基因位于V 基因節(jié)段的3端,在V 基因簇與J 基因簇之間。人的V 基因節(jié)段有3個;D
11、 基因節(jié)段和J 基因節(jié)段各有3個和(或)2個。nTCR 基因群位于人的染色體14q11。第二節(jié) 淋巴細胞分化成熟過程中BCR/TCR基因的重排一、B細胞分化過程中的基因重排(一)可變區(qū)基因的重排nV區(qū)基因重排的順序:在V區(qū)基因重排時,先分兩個階段構建重鏈可變區(qū)基因,即選擇一個DH節(jié)段與一個JH節(jié)段連接在一起,然后選擇一個VH節(jié)段與DH-JH相連。一旦VH-DH-JH重排成功并且得到功能性表達,其產物就會抑制另一條染色體上等位基因的重排,此現(xiàn)象稱為等位基因排除(allelic exclusion)。同時,基因產物觸發(fā)VL基因重排。 基因優(yōu)于 基因。一個V 節(jié)段與一個J 連接成為功能性V-J基因后
12、,其產物就會發(fā)生等位基因排除,同時也會抑制 基因重排,稱為同型排除。n如果一條染色體上重排的VH或VL基因不能獲得功能性表達,即重排不成功,稱為無產物重排,細胞就會啟動另一條染色體上等位基因重排。如果兩條染色體上VH基因都是無產物重排,或者 基因和 基因都是無產物重排,細胞即死亡。n在VDJ節(jié)段重排時,對各JH節(jié)段的選擇基本上是隨機的。但是,對VH或DH節(jié)段的選擇并不隨機,一些VH節(jié)段和一些DH節(jié)段會被優(yōu)先選用。這種優(yōu)先選用特定節(jié)段可能與某些疾病有關,其生理或病理學意義尚待進一步研究。(二)V(D)J重排的調控nVDJ基因重排的啟動需要重組活化基因(recombination activati
13、ng genes, RAG)的表達。此基因的產物RAG-1和RAG-2介導VDJ重排的起始步驟。兩種蛋白主要表達于未成熟的pro-B和pre-B細胞核內。 n在未成熟的淋巴細胞中,RAG-1的表達與活性在整個細胞增殖周期中很穩(wěn)定;而RAG-2的表達與活性有周期性,在G1期表達增多,半壽期延長,活性穩(wěn)定,在G1向S期過渡時RAG-2被迅速降解,至M期甚至不能檢出。n當RAG-1及RAG-2同時存在發(fā)揮協(xié)同作用時,方能啟動V(D)J重排,故V(D)J重排僅發(fā)生于G1期。增加內源性RAG1和RAG2基因轉錄時,VDJ重排的頻率也伴隨增加。n在RAG1或RAG2基因缺損的純合子小鼠,T細胞和B細胞的功
14、能缺如,也不發(fā)生VDJ重排。一旦VH基因重排成功并轉錄表達,RAG的表達就被抑制。n其他與啟動VDJ重排有關的基因產物還有LyF-1/lkaros、LEF-1、OCT-1和OCT-2,其中OCT-2是B細胞特有的。(三)基因節(jié)段間連接的1223bp規(guī)律 n核苷酸序列分析發(fā)現(xiàn),在BCR基因的VDJ基因節(jié)段的側面都有重排信號序列。n在基因節(jié)段側面存在的這種特殊的、相互關聯(lián)的側翼序列(flanking sequence)或稱共有序列,能觸發(fā)VDJ節(jié)段的重排并決定節(jié)段間的連接,又稱重組信號片段(recombination signal segment, RSS)。n每個側翼序列含有一個7核苷酸的回文序
15、列(palindromic sequence)和一個9核苷酸的保守序列,兩者之間有一段固定數(shù)目(121和231)的隨機核苷酸序列分隔。nRSS的重要特點是,分隔7核苷酸和9核苷酸的隨機核苷酸序列數(shù)目是固定的12 bp或23 bp。這個數(shù)目代表DNA雙螺旋的一個或兩個完整螺旋,說明圍繞每個待連接基因節(jié)段的側翼序列在空間上和方位上也是精確互補的,很可能因此決定或控制了重排的發(fā)生。nRSS位于V基因的下游,J基因的上游,D基因的兩側。n一個側面有12 bp分隔序列的基因節(jié)段只能與一個側面有23 bp 分隔序列的基因節(jié)段重組或連接,反之亦然。這一現(xiàn)象稱為1223 bp 規(guī)律。二、TCR基因重排nTCR
16、基因重排在胸腺中完成。T細胞中TCR基因的重排順序與B細胞中Ig基因重排順序相似。在前T細胞中,TCR的鏈或鏈VDJ基因節(jié)段的D和J首先連接在一起,然后在胸腺細胞中再與V連接,形成VDJ基因。VDJ基因或VJ基因( 鏈和 鏈)重排完成后,再與C基因節(jié)段連接成為功能性基因。TCR基因重排的次序在胸腺中受到嚴格的控制。(一)基因重排的順序n在V區(qū)基因重排時,先選擇一個DH節(jié)段與一個JH節(jié)段連接在一起,然后選擇一個VH節(jié)段與DH-JH相連。一旦VH-DH-JH重排成功并且得到功能性表達,其產物就會抑制另一條染色體上等位基因的重排,此現(xiàn)象稱為等位基因排除。同時,基因產物觸發(fā)VL基因重排。n一條染色體上
17、重排的VH或VL基因不能獲得功能性表達,即重排不成功,稱為無產物重排,細胞就會啟動另一條染色體上等位基因重排。如果兩條染色體上VH基因都是無產物重排,細胞即死亡。n首先是D-J重排,剪切去除兩基因節(jié)段間的DNA片段,使D-J連接,第二步是D-J與V間的重排,使V-D-J連接,重排后的DNA構成編碼V區(qū)基因,以其為模板,產生初級轉錄RNA,進而與編碼C區(qū)基因的轉錄RNA拼接(splicing),構成mRNA。nTCR 基因重排與IgL基因重排相似,重排使V-J 連接,進而產生初級轉錄RNA,再與C區(qū)基因轉錄拼接形成TCR mRNA。nTCR 基因重排與TCR 因重排相似。nTCR 基因重排與TC
18、R 基因重排相似。nTCR 及 基因重排均在胸腺內不成熟細胞階段,但成熟T細胞只表達一種TCR,即TCR(占90%以上),或TCR,同一T細胞表面不會表達兩類TCR,其原因與沉默子(silencer)相關,當TCR 基因重排后, Silencer滅活,則TCR 基因重排,產生 型TCR;若 Silencer仍活化,則抑制TCR 重排,發(fā)生TCR 基因重排,產生 型TCR。n一個克隆的T細胞只表達一種抗原特異性TCR,乃是由等位基因排斥所致,TCR重排后,抑制其它TCR 基因節(jié)段發(fā)生重排,從而保證克隆化T細胞對特異抗原應答的專一性。(二)TCR基因重排啟動TCR基因重排nTCR基因重排發(fā)生在胸腺
19、內的CD44-CD25+CD3-CD4-CD8-的早期T細胞階段,當細胞發(fā)育至CD44-CD25-CD3+CD4-CD8-階段,發(fā)生TCR基因重排,當細胞發(fā)育至CD4+CD8+階段時,則表達TCR鏈。n故TCR 基因重排發(fā)生在TCR基因重排之后。若將TCR 基因滅活,則無TCR 基因重排。將p56lck基因滅活,亦無TCR 基因重排,推測是TCR鏈與配基結合后,信號經CD3分子傳導活化, p56lck逐步活化TCR 基因重排。(三)TCR基因重排的控制n在小鼠T細胞發(fā)育過程中, 鏈基因和 鏈基因首先重排。小鼠胚胎第14天,這兩種基因就有較高的轉錄;第15天時,即可在小鼠T細胞表面檢出。在胚胎發(fā)
20、生時 鏈基因和 鏈基因的重排稍遲: 鏈基因較早重排,胚胎第14天可檢出D-J重排,第15天可見完整的V-D-J基因,而到第16天才能檢出鏈基因的重排。第三節(jié) BCR/TCR多樣性產生的機制一、BCR (一)組合連接造成多樣性n在胚系中,VH、VL、DH、JH、JL基因節(jié)段眾多的數(shù)目,使B細胞可以從中各選擇一個基因節(jié)段組合并連接成各種不同的功能性基因。其編碼的可變區(qū)可以識別107種抗原特異性。(二)VDJ連接的多樣性n在DH-JH、VH-DHJH和VL-JL連接時,由于接合過程的不精確性,大大增加了多樣性。從107增加到1011。1密碼子錯位 接合可以發(fā)生在連接部位的任何密碼子之間。因此,同一對
21、基因節(jié)段連接時,由于接合的核苷酸密碼子不同,可以導致氨基酸序列中單個氨基酸殘基的改變。2框架移位突變 不精確的連接可引起框架移位(frame-shift)突變。這種突變在接合完成后改變了DNA的閱讀框,使接合點以后的氨基酸種類完全改變。 n 核苷酸 氨基酸A V J 95 96 97 CCXCCC TGGACG P W T CCXCCC TGGACG P T CCXCCC TGGACG P P TB CAGCCG GATCAG CAG CGA TCA GC CAGCCT TGGACG GAG CCT AGT TTC TGG ACGn3N-序列插入 有時,在連接的過程中插入了一個并不屬于待連接基
22、因節(jié)段的外來核苷酸序列(N-序列)。N序列的長度不等(約1 20個核苷酸),可以在V、D或J重排的任何位點插入,多見于CDR3區(qū)。N序列的插入增加了可變區(qū)的長度。多余的核酸能有效地改變免疫球蛋白結合抗原的特異性,但其發(fā)生率相對較低。N序列插入與V、D和J基因模板無關,而與末端脫氧核苷轉換酶(TdT)的作用有關。(三)體細胞突變n體細胞突變(somatic mutation)可以產生免疫球蛋白的多樣性。插入性突變和缺失性突變可以發(fā)生在B細胞發(fā)育的任何階段和免疫球蛋白的任何部位。這種替換是單個核苷酸發(fā)生突變所致。體細胞突變多發(fā)生在免疫球蛋白的CDR區(qū)域,與抗體的親和力成熟有關。Ig其他部位的突變往
23、往引起蛋白結構的非許可性改變,因而導致克隆流產;CDR區(qū)域的體細胞突變則可以提高抗體的親和力。(四)不同的輕重鏈的組合n由于BCR結合抗原的部位是由重鏈和輕鏈的V區(qū)共同完成的,所以不同的輕重鏈組合就會產生不同的抗原結合結構。二、TCR與BCR基本相似n(一)沒有體細胞高頻突變(二)N區(qū)插入多于BCR(三)TCRV區(qū)基因發(fā)生有效重排機會較多TCR基因在某一位點的反復基因重排次數(shù),較B細胞的Ig重排次數(shù)要多,從而增加其基因重排的成功率,如在TCR基因重排時,若V-D-J不能與C重排,則尚可進行再次V-D-J 重排而與C產生功能重排,使細胞得以挽救存活,在TCR基因重排時亦然。 三、抗原受體互補決定區(qū)(CDR)的分布及其意義nBCR和TCR都是通過抗原結合部位識別抗原的,其識別和結合抗原的部位稱CDR。每條肽鏈都有3個CDR,即CDR1、CDR2和CDR3(一)BCRV基因編碼CD
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