1、細(xì)菌的分類、形態(tài)和進(jìn)化吳震州引起肺炎的病原體細(xì)菌 肺炎鏈球菌、金黃色葡萄球菌、甲型溶血性鏈球菌、肺炎克雷白桿菌、 流感嗜血桿菌、變形桿菌、銅綠假單胞菌、腸桿菌屬一些細(xì)菌、變形桿 菌、軍團(tuán)菌、棒狀桿菌、梭狀桿菌等病毒 腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒、副流感病毒、麻疹病毒、巨細(xì)胞 病毒、單純皰疹病毒、漢坦病毒、禽流感病毒、尼巴病毒、冠狀病毒等支原體 肺炎支原體衣原體 肺炎衣原體、鸚鵡熱衣原體真菌 白色念珠菌、曲菌、放線菌等其它 立克次體（Q熱立克次體等）、弓形蟲(chóng)（鼠弓形蟲(chóng)等)、原蟲(chóng)（卡氏肺孢 子蟲(chóng)等）、寄生蟲(chóng)類（肺包蟲(chóng)、肺吸蟲(chóng)、肺血吸蟲(chóng)等）SARS病原體的發(fā)現(xiàn)與確證2002年11月，廣東出現(xiàn)SA

2、RS病人2003年3月15日，WHO組織國(guó)際研究網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室3月18日20日，觀察到副粘病毒顆粒以及獲得相關(guān)序列3月21日，猴腎細(xì)胞培養(yǎng)獲得病毒分離物，并排除甲乙型流感病毒病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒1、2、3型、腺病毒、鼻病毒、腸道病毒、人間質(zhì)肺炎病毒等，報(bào)告發(fā)現(xiàn)衣原體顆粒3月22日，發(fā)現(xiàn)冠狀病毒樣顆粒3月23日，明確發(fā)現(xiàn)冠狀病毒顆粒和核酸片段，開(kāi)始靈長(zhǎng)類動(dòng)物實(shí)驗(yàn)3月244月11日，獲得更多的SARS病毒分離物、核酸片段序列，抗體檢測(cè)4月12日、14日，SARS冠狀病毒的全基因組序列公布4月16日，WHO宣布確認(rèn)一種變異冠狀病毒引起SARS4月17日，利用動(dòng)物實(shí)驗(yàn)按科赫原則確定SARS病原

3、體SARS coronavirus“SARS的研究速度令人驚訝。由于全世界各國(guó)實(shí)驗(yàn)室之間非同尋常的合作，我們現(xiàn)在肯定地知道誰(shuí)是SARS的元兇?！?（WHO傳染病規(guī)劃執(zhí)行主任David Heymann 博士）嗜高溫菌桿菌球菌霍亂弧菌梅毒螺旋體細(xì)菌分類的意義解決兩個(gè)問(wèn)題，一是鑒定，即這個(gè)細(xì)菌是什么；從進(jìn)化論的角度描述細(xì)菌彼此間的演化、進(jìn)化關(guān)系，誰(shuí)更古老一些，細(xì)菌的從屬關(guān)系等等，這一方法主要是用于解決第二個(gè)方面的問(wèn)題。準(zhǔn)確的細(xì)菌分類對(duì)深入了解不同種屬間細(xì)菌的功能差異和抗菌新藥的研發(fā)具有重要的指導(dǎo)意義。微生物分類學(xué)的發(fā)展經(jīng)典分類學(xué)：按微生物表型分類微生物系統(tǒng)學(xué)：按親緣關(guān)系和進(jìn)化規(guī)律分類發(fā)展表型特征：形

4、態(tài)學(xué)、生理生化學(xué)、生態(tài)學(xué)等，推斷微生物的系統(tǒng)發(fā)育。表型特征結(jié)合分子水平上比較微生物的基因型特征（如16S rDNA)探討微生物進(jìn)化、系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定。微生物分類學(xué)的三個(gè)任務(wù)：分類、鑒定及命名分類是根據(jù)微生物的相似性和親緣關(guān)系，將微生物歸入不同的分類類群。鑒定是確定一個(gè)新的分離物屬于已經(jīng)確認(rèn)的分類單元的過(guò)程。命名是根據(jù)國(guó)際命名法規(guī)給微生物分類單元以科學(xué)的名稱。5界論6界論8界論古生菌古生菌古生菌古始動(dòng)物菌三域?qū)W說(shuō)系統(tǒng)分類學(xué)Phylogenetic Classification系統(tǒng)建立于演化關(guān)系上，而不是表型的相似性缺少好的化石記錄，對(duì)于證明原核生物和其他微生物是很困難直接比較遺傳物質(zhì)和基因產(chǎn)物

5、RNA或蛋白質(zhì)分類學(xué)依據(jù)經(jīng)典(傳統(tǒng))特性Classical Characteristics 分子特性Molecular Characteristics傳統(tǒng)特性形態(tài)特性Morphological Characteristics形態(tài)學(xué)容易研究和分析形態(tài)比較很有價(jià)值，因?yàn)闃?gòu)造特征由許多基因所表達(dá)，形態(tài)相似性常常是系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系密切光學(xué)顯微鏡、穿透式和掃描式電子顯微鏡 生理和代謝特性 Physiological and Metabolic Characteristics 生理和代謝特性直接和微生物酵素和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的本質(zhì)和活性有關(guān)蛋白是基因產(chǎn)物，分析這些特性可以提供微生物基因間的間接比較 細(xì)菌生理學(xué)檢查法

6、糖酵解試驗(yàn) 不同微生物分解利用糖類的能力有很大差異，或能利用或不能利用，能利用者，或產(chǎn)氣或不產(chǎn)氣?？捎弥甘緞┘鞍l(fā)酵管檢驗(yàn)。 LET肉湯管或BGLB是否產(chǎn)氣？Biolog微生物鑒定系統(tǒng)生態(tài)特性Ecological Characteristics自然界中的生態(tài)特性影響微生物與其環(huán)境關(guān)系生命循環(huán)類型，天然共生關(guān)系，對(duì)特定宿主致病能力，和棲息地喜好之要求，如溫度、pH、氧氣和滲透濃度遺傳分析Genetic Analysis經(jīng)由轉(zhuǎn)化作用transformation和接合作用conjugation交換染色體基因轉(zhuǎn)化作用可在不同原核生物種間發(fā)生，但在屬間則非常少。兩個(gè)菌株之間發(fā)生轉(zhuǎn)化作用顯示它們關(guān)系近 免疫

7、學(xué)分析Immunological Analysis血清學(xué)，抗原結(jié)構(gòu)形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理生化、少量的化石資料、行為習(xí)性，等等表型特征：5、 進(jìn)化指征的選擇:b）形態(tài)特征在不同類群中進(jìn)化速度差異很大，僅根據(jù)形態(tài)推斷進(jìn)化關(guān)系往往不準(zhǔn)確；缺點(diǎn)：a）由于微生物可利用的形態(tài)特征少，很難把所有生物放在同一水平上進(jìn)行比較；蛋白質(zhì)、RNA和DNA序列進(jìn)化變化的顯著特點(diǎn)是進(jìn)化速率相對(duì)恒定，也就是說(shuō)，分子序列進(jìn)化的改變量(氨基酸或核苷酸替換數(shù)或替換百分率)與分子進(jìn)化的時(shí)間成正比。生物大分子作為進(jìn)化標(biāo)尺依據(jù)a）在兩群生物中，如果同一種分子的序列差異很大時(shí)，進(jìn)化距離遠(yuǎn)，進(jìn)化過(guò)程中很早就分支了。b）如果兩群生物同一來(lái)源的大分子

8、的序列基本相同，處在同一進(jìn)化水平上。大量的資料表明：功能重要的大分子、或者大分子中功能重要的區(qū)域，比功能不重要的分子或分子區(qū)域進(jìn)化變化速度低。RNA作為進(jìn)化的指征16S rRNA被普遍公認(rèn)為是一把好的譜系分析的“分子尺”：1）rRNA具有重要且恒定的生理功能；2）在16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列區(qū)域，又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域，因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究；3）16SrRNA分子量大小適中，1500bp左右，便于序列分析；4）rRNA在細(xì)胞中含量大(約占細(xì)胞中RNA的90%)，也易于提??；5）16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分

9、子是18SrRNA)。因此它可以作為測(cè)量各類生物進(jìn)化的工具。rRNA序列的測(cè)定分離和純化RNA合成互補(bǔ) DNA (cDNA) 擴(kuò)增cDNA cDNA序列測(cè)定 反推rRNA序列 細(xì)菌基因組16S rDNA 可以直接以PCR放大，然后測(cè)序反轉(zhuǎn)錄酶聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)Eubacteria （真細(xì)菌界）Archaebacteria （古細(xì)菌界） Eukarya （真核生物界）利用16SrRNA建立分子進(jìn)化樹(shù)同一菌種的各個(gè)細(xì)菌，在某些方面仍有一定的差異，可再分成亞種（subspecies）亞種以下的分類等級(jí)為型（type），以區(qū)別某些特殊的特征。例如：抗原結(jié)構(gòu)不同而分的血清型（serotype）；對(duì)

10、噬菌體敏感性不同的噬菌體型（phagetype）；對(duì)細(xì)菌素敏感性不同的細(xì)菌素型（bacteriocin-type），生化反應(yīng)和某些生物學(xué)性狀不同的生物型（biotype）。 由不同來(lái)源分離的同一種、同一亞種或同一型的細(xì)菌，稱為株（strain）。株的建立是從一次單獨(dú)分離物的單個(gè)原始菌落傳代的純培養(yǎng)物，例如從10個(gè)肺結(jié)核患者的痰液中分離出的10株結(jié)核分枝桿菌。具有某種細(xì)菌典型特征的菌株稱為模式菌（typical strain）或標(biāo)準(zhǔn)菌株（standardstrain），它是該種菌株的參比菌株。在細(xì)菌的分類、鑒定和命名時(shí)以模式菌為依據(jù)，也可作為質(zhì)量控制的標(biāo)準(zhǔn)。伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè) BERGEYS

11、MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY 1923年，賓夕法尼亞大學(xué)細(xì)菌學(xué)教授David Bergey和四位同事出版能鑒定細(xì)菌種的細(xì)菌分類法， 伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)，現(xiàn)在已發(fā)行至第九版伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第一版 The First Edition of Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 4卷33組中，每組包括原核生物有幾個(gè)容易鑒定的共同特性一般形狀和形態(tài)學(xué)、革蘭氏染色性質(zhì)，氧的關(guān)系，運(yùn)動(dòng)性，內(nèi)生孢子的存在，產(chǎn)能方式等等 分成4卷 (1)普通、醫(yī)學(xué)或工業(yè)有用的革蘭氏陰性細(xì)菌 (2)除放線菌外的革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌 (3)具顯著

12、特性的革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌和古生菌 (4)放線菌(革蘭氏陽(yáng)性絲狀細(xì)菌) 表型性分類中，以革蘭氏染色性質(zhì)分在哪一卷伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第二版 The Nineth Edition of Bergeys Manual of Systematic Bacteriology自從1984年，第一版出版以來(lái)，原核生物分類學(xué)已經(jīng)有很大的精湛特別是 rRNA、DNA和蛋白質(zhì)測(cè)序使原核生物的系統(tǒng)發(fā)育分析成為可能大幅依據(jù)系統(tǒng)發(fā)育，而非表型性特征，因此與第一版相當(dāng)大的差異第1卷 古生菌、深分支和光合細(xì)菌，2001年出版第2卷 變形桿菌，2003年出 版第3卷 低G+C含量革蘭氏陽(yáng)性菌第4卷高G+C含量革蘭氏陽(yáng)性菌

13、第5卷螺旋體、絲桿菌、擬桿菌和 梭桿菌(第5卷也將包含自第1卷出版後已被修訂之 描述和系統(tǒng)發(fā)育排列) 常用的檢測(cè)技術(shù)一、免疫學(xué)技術(shù)應(yīng)用免疫學(xué)理論而設(shè)計(jì)一系列測(cè)定抗原、抗體、免疫細(xì)胞及其分泌細(xì)胞因子的實(shí)驗(yàn)方法，其基本原理是利用抗原、抗體間能發(fā)生特異性免疫反應(yīng)以檢測(cè)病原免疫學(xué)技術(shù)1、免疫熒光技術(shù)（IFT）將不影響抗原、抗體活性的熒光色素標(biāo)記在抗體（或抗原）上，與其相應(yīng)抗原（或抗體）結(jié)合后，形成免疫復(fù)合物在一定波長(zhǎng)光激發(fā)下可產(chǎn)生熒光，借助熒光顯微鏡可檢測(cè)或定位被檢抗原。用于沙門(mén)氏菌、葡萄球菌毒素、E.ColiO157 和單核細(xì)胞增生李斯特氏菌等快速檢測(cè)免疫學(xué)技術(shù)2、酶免疫技術(shù)利用抗原、抗體反應(yīng)高度特

14、異性和酶促反應(yīng)高度敏感性，通過(guò)肉眼或顯微鏡觀察及分光光度計(jì)測(cè)定，達(dá)到在細(xì)胞或亞細(xì)胞水平上示蹤抗原或抗體部位，及對(duì)其進(jìn)行定量目的。免疫學(xué)技術(shù)3、免疫印跡技術(shù)以生物物理學(xué)方法（凝膠電泳高效分離）與特異性免疫反應(yīng)（固相免疫測(cè)定）相結(jié)合而建立技術(shù)。綜合 SDSPAGE 高分辨率及 ELISA 高敏感性和高特異性，是一種有效分析手段，目前應(yīng)用于酵母和真菌檢測(cè)。分子生物學(xué)技術(shù)1、基因探針技術(shù)從微生物中提取或擴(kuò)增特異性 DNA 片段，純化后再將此 DNA 片段標(biāo)記上可被檢測(cè)指示劑，如放射性同位素、熒光物質(zhì)等，使之成為特異性 DNA 探針。微生物經(jīng)處理后固定于另一固相表面上，經(jīng)洗滌變性后加入 DNA 探針進(jìn)行

15、雜交，DNA 探針可與同源性靶DNA 進(jìn)行互補(bǔ)性結(jié)合，依據(jù)指示劑選用合適方法進(jìn)行檢測(cè)。分子生物學(xué)技術(shù)2、基因芯片技術(shù)采用原位合成或顯微打印手段，將數(shù)以萬(wàn)計(jì)核酸探針固化于支持物表面，與標(biāo)記樣品進(jìn)行雜交，通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)實(shí)現(xiàn)對(duì)樣品快速檢測(cè)?；蛐酒夹g(shù)是基于芯片上探針與樣品中靶基因片段之間發(fā)生特異性核酸雜交。代謝技術(shù)1、ATP 生物發(fā)光法熒光素酶以D 熒光素、三磷酸腺苷和氧氣為底物，在存在 Mg2+ 時(shí)，可將化學(xué)能轉(zhuǎn)化為光能，發(fā)出光量子。ATP 既是熒光素酶催化發(fā)光必需底物，又是所有生物生命活動(dòng)能量來(lái)源。在熒光素酶催化發(fā)光反應(yīng)中，ATP 在一定濃度范圍內(nèi)，其濃度與發(fā)光強(qiáng)度呈線性關(guān)系，各生長(zhǎng)期細(xì)菌均

16、有較恒定水平 ATP 含量。因此，提取細(xì)菌 ATP，利用生物發(fā)光法測(cè)出 ATP 含量后，即可推算出樣品中含菌量，整個(gè)過(guò)程僅為十幾分鐘。代謝技術(shù)2、電阻抗技術(shù)通過(guò)測(cè)量微生物代謝引起培養(yǎng)基電特性變化以測(cè)定樣品微生物含量一種快速檢測(cè)方法。代謝技術(shù)3、放射測(cè)量技術(shù)利用細(xì)菌在生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中代謝碳水化合物而產(chǎn)生 CO2 原理。儀器分析技術(shù)1、氣相色譜法（GC）和高效液相色譜法（HPLC）依據(jù)不同微生物化學(xué)組成或其產(chǎn)生代謝產(chǎn)物各異。利用上述色譜檢測(cè)可直接分析各種體液中細(xì)菌代謝產(chǎn)物、細(xì)胞中脂肪酸、蛋白質(zhì)、氨基酸、多肽、多糖等，以確定病原微生物特異性化學(xué)標(biāo)志成分，協(xié)助病原診斷和檢測(cè)。儀器分析技術(shù)2、質(zhì)譜技術(shù)不同

17、微生物具有不同質(zhì)譜圖，即微生物指紋圖譜，采用新型質(zhì)譜軟電離方法可獲得微生物質(zhì)譜圖，將實(shí)驗(yàn)得到質(zhì)譜圖與已被編入質(zhì)譜指紋圖庫(kù)中已知微生物指紋圖譜進(jìn)行比對(duì)，即可達(dá)到檢測(cè)和鑒定微生物目的。生物傳感器技術(shù)生物傳感器技術(shù)利用生物活性物質(zhì)（即生物元件）作為敏感器件，配以適當(dāng)換能器（即信號(hào)傳導(dǎo)器）所構(gòu)成分析檢測(cè)工具。待測(cè)物質(zhì)進(jìn)入固定生物功能敏感元件（由酶、抗原、抗體、細(xì)胞器、完整細(xì)胞、激素、核酸等制成）后，經(jīng)分子識(shí)別而發(fā)生生物學(xué)反應(yīng)，產(chǎn)生信息，如光、熱等被相應(yīng)信號(hào)轉(zhuǎn)換器轉(zhuǎn)變?yōu)榭啥亢涂商幚淼碾娦盘?hào)，從而換算出被測(cè)物質(zhì)的量或濃度。生物傳感器技術(shù)1、光學(xué)傳感器將細(xì)胞固定于傳感器表面 ,由于厚度的變化 ,光發(fā)生折射

18、 ,光學(xué)傳感器可以檢測(cè)到此微小變化。只適用于檢測(cè)能產(chǎn)生熒光素的細(xì)菌 ,且靈敏度不高。生物傳感器技術(shù)2、生物發(fā)光傳感器特異性好 ,能區(qū)分活菌體和死菌體。但不足之處在于檢測(cè)時(shí)間太長(zhǎng) ,靈敏度不高。細(xì)菌原核微生物與真核微生物在細(xì)胞結(jié)構(gòu)上的根本區(qū)別生物性狀 原核微生物 真核微生物 核 擬核，無(wú)核膜、核仁 真正的核，有核膜、核仁 DNA 1條 1至數(shù)條，與RNA、組蛋白合 核糖體 70S 80S(細(xì)胞質(zhì)中),70S(細(xì)胞器中) 細(xì)胞分裂 二分裂 有絲分裂,減數(shù)分裂 有性生殖 無(wú) 有 細(xì)胞器 無(wú) 線粒體、高基體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等 呼吸鏈 細(xì)胞膜上 線粒體上 細(xì)胞壁成分 肽聚糖、磷壁質(zhì) 多聚糖,幾丁質(zhì) 大小 110

19、m 10100m一、細(xì)菌的基本形態(tài)及空間排列二、細(xì)菌的大小及其測(cè)定方法三、細(xì)菌的菌落形態(tài)及其意義(一)基本形態(tài)與結(jié)構(gòu)桿菌球菌霍亂弧菌梅毒螺旋體一、細(xì)菌的基本形態(tài)及空間排列細(xì)菌的基本形態(tài)有球狀、桿狀和螺旋狀,分別被稱為球菌、桿菌和螺旋菌。各類群基本形態(tài)比較穩(wěn)定。菌體細(xì)胞形態(tài)和排列具有種的特異性，是進(jìn)行分類的依據(jù)之一。（一）球菌（Coccus）是一類菌體呈球形或近似球形的細(xì)菌。根據(jù)繁殖時(shí)細(xì)胞分裂面的方向不同以及分裂后菌體間相互黏附的松緊程度和組合狀態(tài)不同，可分為六種不同的排列方式（圖2-1）。1單球菌 如尿素小球菌 （Micrococcus ureae）。2雙球菌 如肺炎雙球菌 （Diplococ

20、cus pneumoniae）。3鏈球菌 如乳鏈球菌 （Streptococcus lactis）4四聯(lián)球菌 如四聯(lián)小球菌 （Micrococcus tetragenus）。5八疊球菌 如乳酪八疊球菌 （Sarcina casei）6葡萄球菌 如金黃色葡萄球菌 （Staphylococcus aureus）（二）桿菌(Bacillus) 菌細(xì)胞呈桿狀的細(xì)菌稱為桿菌。 長(zhǎng)桿菌:(長(zhǎng):寬2） 桿菌: :(長(zhǎng):寬=2） 短桿菌: :(長(zhǎng):寬2） 兩端呈鈍圓狀或半圓狀: 兩端呈平截狀或稱刀切狀: 菌體一端膨大(棒狀桿菌)。 桿菌在培養(yǎng)條件下有的呈單個(gè)存在，如大腸桿菌（Escherichia coli，

21、E.coli）；有的呈鏈狀排列，如枯草芽包桿菌（Bacillus subtilis）；有的呈柵狀排列或“V”排列，如棒狀桿菌（Corynebacterium).（二）桿菌(Bacillus)（二）桿菌(Bacillus)大腸桿菌金黃色葡萄球菌（三）螺旋菌(Spirillum) 彎曲的桿菌稱為螺旋菌。按照其彎曲的程度不同，可分為弧菌（Vibrio）和螺旋菌（Spirillum）兩種（圖2-3）。 1弧菌 菌體僅一個(gè)彎曲, 呈弧形或逗號(hào)形如霍亂弧 菌（Vibrio cholerae）。 2螺旋菌 菌體有多個(gè)彎曲， 回轉(zhuǎn)呈螺旋狀如小螺菌 （Spirillum minor）。二、細(xì)菌的大小及其測(cè)定方法

22、（一）細(xì)菌的大小與表示方法 細(xì)菌的個(gè)體很小，通常以微米（m）作為測(cè)量單位細(xì)菌大小的表示方法因不同形態(tài)的細(xì)菌而異球菌: 一般用其直徑表示，通常介于0.52m之間；桿菌: 用其長(zhǎng)和菌細(xì)胞直徑（寬）來(lái)表示，長(zhǎng)和寬之間用一連字符“”連接起來(lái)，桿菌的大小差異較大，一般桿菌的大小為：150.51m ；螺旋菌: 其大小表示方法與桿菌相同，螺旋菌的長(zhǎng)度僅表示其兩端的空間距離。一般在進(jìn)行形態(tài)鑒定時(shí)，尚需測(cè)定菌細(xì)胞的螺旋度、螺距等指標(biāo)。值得注意的是，菌體的大小具有種的穩(wěn)定性，但也受染色方法、培養(yǎng)基、菌齡、滲透壓等外界因素等影響。有關(guān)細(xì)菌大小的記載，通常是平均值或代表性數(shù)字。三、細(xì)菌的菌落形態(tài)及其意義菌落的概念：

23、在固體培養(yǎng)基上，由一個(gè)菌細(xì)胞生長(zhǎng)繁殖而形成具有一定形態(tài)特征的菌細(xì)胞的群體叫菌落（colony)。菌苔的概念： 當(dāng)兩個(gè)或兩個(gè)以上的菌落融合在一起時(shí)的菌細(xì)胞群體叫做菌苔菌落的特征：菌落的形態(tài)具有種的特異性且具有相對(duì)的穩(wěn)定性，是菌種鑒定的依據(jù)之一。菌落形態(tài)包括菌落大小、形狀、邊緣、隆起、光澤、質(zhì)地、顏色、擴(kuò)展性、透明度等。球菌常形成隆起的菌落，有鞭毛細(xì)菌常形成表面干燥皺折、邊緣不規(guī)則的菌落；有莢膜的細(xì)胞組成的菌落表面透明、邊緣光滑整齊； 能產(chǎn)色素的細(xì) 菌菌落還顯出 各種顏色。 菌落的意義：菌種分離活菌計(jì)數(shù)細(xì)菌的菌落放大支原體（mycoplasma） mycoplasma支原體：是一類缺乏細(xì)胞壁、呈多

24、形性、 能通過(guò)除菌濾器并能在無(wú)生命培 養(yǎng)基中生長(zhǎng)繁殖的最小原核細(xì)胞 型微生物。衣原體：目前分為病毒一類沒(méi)有細(xì)胞壁的原核細(xì)胞型微生物細(xì)胞膜含膽固醇能通過(guò)濾菌器二分裂繁殖，含DNA與RNA 能在人工培養(yǎng)基中繁殖的最小微生物一、微生物學(xué)特性形態(tài)與染色最小多形性：球形，桿形，長(zhǎng)絲狀細(xì)胞膜（膽固醇）特殊結(jié)構(gòu)：頂端結(jié)構(gòu)繁殖方式：二分裂、出芽等染色方法：Giemsa染色( 淡紫色) 革蘭染色陰性 培養(yǎng)營(yíng)養(yǎng)要求比一般細(xì)菌高 對(duì)低滲透壓敏感pH7.6-8.0（解脲脲原體pH6.0-6.5）生長(zhǎng)緩慢典型的菌落呈油煎蛋狀液體培養(yǎng)基不易見(jiàn)到混濁是引起細(xì)胞培養(yǎng)污染的一個(gè)重要因素支原體與細(xì)菌L型的區(qū)別 支原體 L型 在遺

25、傳上與細(xì)菌無(wú)關(guān) 與原菌相關(guān)，?？梢曰貜?fù) 細(xì)胞膜含高濃度膽固醇 細(xì)胞膜不含膽固醇 在一般培養(yǎng)基中穩(wěn)定 大多需高滲培養(yǎng) 生化反應(yīng)支原體 分解葡萄糖 水解 精氨酸 脲酶肺炎支原體 + - -解脲脲原體 - - +人型支原體 - + -抗原結(jié)構(gòu)抗原結(jié)構(gòu)：細(xì)胞膜上的蛋白質(zhì)和糖脂各型交叉少補(bǔ)體結(jié)合試驗(yàn)ELISA試驗(yàn)抵抗力比細(xì)菌敏感對(duì)醋酸鉈、結(jié)晶紫抵抗力強(qiáng)對(duì)青霉素等耐藥對(duì)干擾蛋白質(zhì)合成的抗生素敏感二、致病性與免疫性致病性 支原體 致病性 肺炎支原體 原發(fā)性非典型肺炎 支氣管炎 表面感染人型支原體 泌尿生殖道感染 表面感染生殖道支原體 泌尿生殖道感染 表面感染穿透支原體 多見(jiàn)于艾滋病 入血解脲脲原體 泌尿生殖

26、道感染 表面感染致病性形成細(xì)胞損傷粘附素細(xì)胞損傷莢膜或微莢膜抗吞噬產(chǎn)生有毒代謝產(chǎn)物免疫損傷 (IgM、IgG)免疫性體液免疫和細(xì)胞免疫 SIgA藍(lán)細(xì)菌Cyanobacteria是一類含葉綠素A，具有放氧性光合作用的原核微生物（一）藍(lán)細(xì)菌形態(tài) （二）藍(lán)細(xì)菌細(xì)胞生理特性 （三）藍(lán)細(xì)菌的繁殖（四）常見(jiàn)的藍(lán)細(xì)菌類群藍(lán)細(xì)菌的形態(tài)藍(lán)細(xì)菌細(xì)胞生理特性 （一）原核，G-，細(xì)胞壁與G-細(xì)菌相似，由肽聚糖等多粘復(fù)合物組成，并含有二氨基庚二酸，細(xì)胞壁可以分泌許多膠粘物質(zhì)使一群群的細(xì)胞或絲狀結(jié)合在一起形成膠團(tuán)或膠鞘；細(xì)胞核無(wú)核膜；細(xì)胞質(zhì)中有汽泡，可使細(xì)胞漂浮藍(lán)細(xì)菌細(xì)胞生理特性（二）藍(lán)細(xì)菌可進(jìn)行光合作用。具有特殊結(jié)構(gòu)光

27、合器，是光能自養(yǎng)型生物：只需空氣、陽(yáng)光、水分、少量無(wú)機(jī)鹽光合器中含有光合作用色素有葉綠素a、藻膽素和類胡蘿卜素。藍(lán)細(xì)菌的繁殖藍(lán)細(xì)菌無(wú)有性繁殖，以分裂繁殖為主，極少種類有孢子。有的利用藻殖段繁殖。藍(lán)細(xì)菌的分群第一群：色球藍(lán)細(xì)菌群第二群：厚球藍(lán)細(xì)菌群第三群：無(wú)異形胞絲狀藍(lán)細(xì)菌群第四群：有異形胞絲狀藍(lán)細(xì)菌群第五群：多分裂的有異形胞絲狀藍(lán)細(xì)菌群古細(xì)菌定義1：常生活于熱泉水、缺氧湖底、鹽水湖等極端環(huán)境中的原核生物。具有一些獨(dú)特的生化性質(zhì)，如膜脂由醚鍵而不是酯鍵連接。在能量產(chǎn)生與新陳代謝方面與真細(xì)菌有許多相同之處，而復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯則更接近真核生物。古核生物與真核生物可能共有一個(gè)由真細(xì)菌的祖先歧化而來(lái)的共

28、同祖先。定義1.單細(xì)胞生物，無(wú)真正的核2.染色體含有組蛋白3.RNA聚合酶組成比細(xì)菌的復(fù)雜，4.細(xì)胞壁中無(wú)肽聚糖5.核糖體蛋白與真核細(xì)胞的類似 6.其內(nèi)部構(gòu)造沒(méi)有核膜、具環(huán)狀DNA結(jié)構(gòu)以及細(xì)胞產(chǎn)能、細(xì)胞分裂、新陳代謝等生活方式與原核細(xì)胞相似 特點(diǎn)代表性古細(xì)菌 極端嗜鹽菌（extremehalophiles）：生活在高鹽度環(huán)境中，鹽度可達(dá)25%，如死海和鹽湖中。 極端嗜酸菌（acidophiles）：能生活在pH值1以下的環(huán)境中，往往也是嗜高溫菌，生活在火山地區(qū)的酸性熱水中，能氧化硫，硫酸作為代謝產(chǎn)物排出體外。 極端嗜堿菌（alkaliphiles）：多數(shù)生活在鹽堿湖或堿湖、堿池中，生活環(huán)境pH

29、值可達(dá)11.5以上，最適pH值810。 產(chǎn)甲烷菌（metnanogens）：是嚴(yán)格厭氧的生物，能利用CO2使H2氧化，生成甲烷，同時(shí)釋放能量。 CO2+4H2CH4+2H2O+能量 生存環(huán)境及形態(tài)一些生存在極高的溫度（經(jīng)常100以上）下，比如間歇泉或者海底黑煙囪中。還有的生存在很冷的環(huán)境或者高鹽、強(qiáng)酸或強(qiáng)堿性的水中。然而也有些古菌是嗜中性的，能夠在沼澤、廢水和土壤中被發(fā)現(xiàn)。很多產(chǎn)甲烷的古菌生存在動(dòng)物的消化道中，如反芻動(dòng)物、白蟻或者人類。古菌通常對(duì)其它生物無(wú)害，且未知有致病古菌 單個(gè)古菌細(xì)胞直徑在0.1到15微米之間，有一些種類形成細(xì)胞團(tuán)簇或者纖維，長(zhǎng)度可達(dá)200微米。它們可有各種形狀，如球形、

30、桿形、螺旋形、葉狀或方形。 與真細(xì)菌主要區(qū)別 1形態(tài)學(xué)上，古細(xì)菌有扁平直角幾何形狀的細(xì)胞，而在真細(xì)菌中從未見(jiàn)過(guò)。 2中間代謝上，古細(xì)菌有獨(dú)特的輔酶。如產(chǎn)甲烷菌含有F420，F(xiàn)430和COM及B因數(shù)。 3有無(wú)內(nèi)含子(introns)上，許多古細(xì)菌有內(nèi)含子。 4膜結(jié)構(gòu)和成分上，古細(xì)菌膜含醚而不是酯，其中甘油以醚鍵連接長(zhǎng)鏈碳?xì)浠衔锂愇於皇且怎ユI同脂肪酸相連。 5呼吸類型上，嚴(yán)格厭氧是古細(xì)菌的主要呼吸類型。 6代謝多樣性上，古細(xì)菌單純，不似真細(xì)菌那樣多樣性。 7在分子可塑性(molecular plasticity)上，古細(xì)菌比真細(xì)菌有較多的變化。 8在進(jìn)化速率上，古細(xì)菌比真細(xì)菌緩慢，保留了

31、較原始的特性 性質(zhì)細(xì)菌古細(xì)菌真核生物有核仁、核膜的細(xì)胞核無(wú)無(wú)有復(fù)雜內(nèi)膜胞器無(wú)無(wú)有細(xì)胞壁含胞壁酸的肽聚糖多種類型，無(wú)胞壁酸無(wú)胞壁酸膜脂有酯鍵、直鏈脂肪酸有醚鍵，支鏈脂肪酸有酯鍵、直鏈脂肪酸氣囊有有無(wú)tRNA含有thymineN-甲酰甲硫胺基起始無(wú)thymine甲硫胺基起始含有thymine甲硫胺基起始細(xì)菌、古細(xì)菌與真核生物的比較性質(zhì)細(xì)菌古細(xì)菌真核生物順?lè)磎RNA有有無(wú)mRNA剪切、加帽及poly A tail無(wú)無(wú)有核糖體大小無(wú)無(wú)有 延長(zhǎng)因子2無(wú)無(wú)有對(duì)氯霉素和卡那霉素敏感含胞壁酸的肽聚糖多種類型，無(wú)胞壁酸無(wú)胞壁酸對(duì)anosimycin敏感有酯鍵、直鏈脂肪酸有醚鍵，支鏈脂肪酸有酯鍵、直鏈脂肪酸性質(zhì)細(xì)

32、菌古細(xì)菌真核生物依賴DNA的RNA聚合酶數(shù)目結(jié)構(gòu)對(duì)rifampicin敏感一個(gè)簡(jiǎn)單次單元-4個(gè)敏感幾個(gè)復(fù)雜次單元-812個(gè)不敏感三個(gè)復(fù)雜次單元-1214個(gè)不敏感聚合酶II型啟動(dòng)子無(wú)有有代謝相似ATP酶無(wú)是是甲烷生成無(wú)有無(wú)固氮有有無(wú)以葉綠素進(jìn)行光和作用有無(wú)有化學(xué)無(wú)機(jī)自養(yǎng)有有無(wú)放線菌(Actinomycetes) 放線菌的形態(tài)構(gòu)造 放線菌的繁殖 放線菌的群體特征 放線菌的主要屬 放線菌是一類主要呈菌絲狀生長(zhǎng)和以孢子繁殖的陸生性較強(qiáng)的原核生物, 介于細(xì)菌和真菌之間。一方面,放線菌的細(xì)胞構(gòu)造和細(xì)胞壁的化學(xué)組成與細(xì)菌相似,與細(xì)菌同屬原核生物;另一方面,放線菌菌體呈纖細(xì)的菌絲狀,而且分枝,又以外生孢子的形

33、式繁殖,這些特征又與霉菌相似.放線菌菌落中的菌絲常從一個(gè)中心向四周輻射狀生長(zhǎng),因此叫放線菌.同為單細(xì)胞，菌絲比真菌細(xì)，其直徑與細(xì)菌接近；同屬原核生物。無(wú)核膜、核仁和線粒體等。核糖體70S等；胞壁含磷壁酸，二氨基庚二酸，不含幾丁質(zhì)，纖維素；G+（少數(shù)陰性）;對(duì)環(huán)境的要求與細(xì)菌相近；對(duì)溶菌酶敏感；對(duì)抗生素的反應(yīng)類似細(xì)菌。放線菌與細(xì)菌的比較放線菌分布：主要存在于含有機(jī)質(zhì)豐富的中性或偏堿性的 土壤中，在空氣、淡水和海水等處也有一定的分布。放線菌的生活類型：多數(shù)腐生；少數(shù)寄生。放線菌的應(yīng)用： 能產(chǎn)生大量的、種類繁多的抗生素，到目前為止，已分離得到的放線菌產(chǎn)生的抗生素達(dá)4000種以上；生產(chǎn)維生素和酶；進(jìn)行

34、甾體轉(zhuǎn)化、烴類發(fā)酵和污水處理。放線菌的危害：有的放線菌能引起人和動(dòng)植物病害，如人 類的皮膚病、腦、肺和足部感染等；有的放線菌能使水和 食品變味，或破壞棉毛織品和紙張等。 一、放線菌的形態(tài)構(gòu)造 大部分放線菌由分枝狀的菌絲組成，菌絲大多無(wú)隔膜，屬單細(xì)胞。菌絲的粗細(xì)與細(xì)菌中的桿菌寬度相近（1m左右）。細(xì)胞壁含胞壁酸、二氨基庚二酸，不含幾丁質(zhì)、纖維素；革蘭氏陽(yáng)性。根據(jù)形態(tài)和功能不同可分為：基內(nèi)菌絲（營(yíng)養(yǎng)菌絲）(Substrate mycelium）氣生菌絲(Aerial mycelium)孢子絲(Reproductive mycelium)放線菌孢子絲類型：垂直單輪(無(wú)螺旋)彎曲叢生松環(huán)、初級(jí)螺旋鉤狀

35、松螺旋緊螺旋單輪(有螺旋)雙輪(無(wú)螺旋)雙輪(有螺旋)單輪生螺旋狀 放線菌孢子絲的光學(xué)顯微鏡圖片孢子形態(tài)：有圓、卵圓、柱狀等。 表面：或光滑或粗糙；有的還帶有毛刺、鞭毛。 色素：因種而異。 放線菌主要通過(guò)形成無(wú)性孢子的方式進(jìn)行繁殖，也可 借菌絲斷片（液體培養(yǎng)時(shí)）進(jìn)行繁殖。無(wú)性孢子主要有三種：分生孢子、孢囊孢子和橫隔孢子。二、放線菌的繁殖1. 分生孢子(conidiospores)在氣生菌絲頂端形成成串或單個(gè)孢子，菌絲分裂形成。 在氣生菌絲頂端或基內(nèi)菌絲頂端膨大或盤(pán)卷纏繞形成孢 子囊，在孢子囊內(nèi)形成孢囊孢子。孢囊：菌絲細(xì)胞在不同平面反復(fù)分裂，形成孢囊孢子.有的孢囊孢子可以叢毛運(yùn)動(dòng)。2. 孢囊孢子3. 橫隔孢子 基內(nèi)菌絲或氣生菌絲橫隔分裂