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文檔簡介

1、Good is good, but better carries it.精益求精,善益求善。分子生物學(xué)實驗17課時-(本科)生物科學(xué)專業(yè)分子生物學(xué)實驗2013年制訂課程代碼:學(xué)分:1總學(xué)時:17先修課程:生物化學(xué),有機化學(xué)等。開課對象:生物科學(xué)專業(yè)(本科)一、課程的性質(zhì)、目的與任務(wù)分子生物學(xué)已成為生命科學(xué)的基礎(chǔ)學(xué)科之一,其基本理論和實驗技術(shù)已滲透到生物學(xué)的各個領(lǐng)域并促進了一批新學(xué)科的興起和發(fā)展。目前,以分子生物學(xué)為基礎(chǔ)的基因克隆重組技術(shù)已成為現(xiàn)代生物技術(shù)的核心。為了適應(yīng)分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,落實培養(yǎng)創(chuàng)新人才的目標,特開展本實驗課程,以培養(yǎng)學(xué)生的動手能力,加強學(xué)生對分子生物學(xué)實驗技術(shù)的理解。除了

2、增進對分子生物學(xué)內(nèi)容的理解,更重要的是培養(yǎng)學(xué)生的實驗技能和創(chuàng)新思維設(shè)計。通過實驗原理的講解和實驗操作,使學(xué)生初步了解和熟悉現(xiàn)代分子生物學(xué)實驗的基本原理、操作機能和實際應(yīng)用,提高學(xué)生的創(chuàng)新思維和獨立分析問題解決問題的能力。二、實驗內(nèi)容與學(xué)時分配實驗內(nèi)容實驗類型學(xué)時分配比例實驗器材清潔滅菌與試劑配制操作2PCR擴增目的DNA驗證2核酸的瓊脂糖凝膠電泳與分析驗證2pET28a質(zhì)粒在大腸桿菌中的擴增與試劑盒抽提(堿抽提法)綜合4感受態(tài)細胞的制備(CaCl2法)綜合3pET28a質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌TOP10與鑒定綜合4共17學(xué)時實驗一實驗器材清潔滅菌與試劑配制學(xué)習(xí)分子生物學(xué)實驗室規(guī)則與注意事項熟悉相關(guān)儀器

3、的使用及操作規(guī)程超凈工作臺、PCR儀、電泳儀及電泳槽、凝膠成像系統(tǒng)、恒溫水浴鍋、恒溫培養(yǎng)箱、搖床、冷凍離心機、渦旋振蕩器、高壓蒸汽滅菌鍋、微波爐、重蒸水裝置、移液槍三、器材的清潔與包裝消毒(每組一份)1.試管清洗與包裝滅菌:用清潔液刷洗后自來水沖洗,再用蒸餾水沖洗兩遍,晾干或烘干使用。取棉花與紗布,制成棉塞,塞好試管口。3只一組用報紙包裹、細繩扎緊,高溫蒸汽滅菌。2.培養(yǎng)皿清洗與包裝滅菌:將培養(yǎng)皿清洗干凈,晾干或烘干,蓋好,4套一組用報紙包裹,滅菌。3.離心管的包裝與滅菌:將100ml燒杯清洗干凈,晾干或烘干。取1.5ml及10ml離心管裝入燒杯中,包口滅菌。4.槍頭的滅菌:將10ul、200

4、ul和1000ul槍頭裝入配套的槍頭盒,包好滅菌。5.清洗250ml、100ml和藍口瓶蓋蓋。裝好滅菌。6.滅菌完畢后取出烘干或晾干,保存?zhèn)溆谩K?、試劑的配制與滅菌:1.LB培養(yǎng)基:酵母提取物5g;蛋白胨10g;NaCl5g;瓊脂1520g;定容至1000mL(NaOH調(diào)pH至7.0,121、20min高壓滅菌)。有時需在培養(yǎng)基中添加抗生素,瓊脂凝固點為40,所以添加抗生素最好在5055。2.電泳緩沖液:50TAE緩沖液的配制:2mol/LTris-乙酸,0.05mol/LEDTA(pH8.0)配制1000mlTris242g冰乙酸57.1ml0.5mol/LEDTA100ml加入600ml去

5、離子水后攪拌溶解,將溶液定容至1L后。高溫高壓滅菌,室溫保存。1TAE緩沖液的配制:稱量20ml的50TAE緩沖液,再加入980ml的去離子水。溴化乙錠貯存液:10mg/ml溴化乙啶配制:100ml稱取1g溴化乙啶,置于100ml燒杯中,加入80ml去離子水后攪拌溶解。將溶液定容至100ml后,轉(zhuǎn)移到棕色瓶中。室溫保存。6上樣緩沖液:0.25%溴酚藍,0.25%二甲苯青FF,30%甘油。配制:10ml溴酚藍25mg二甲苯青FF25mg甘油3ml用6TAE緩沖液定溶至10ml,分裝成1ml/管。-20保存。其它試劑:DNA樣品、DNALadder、瓊脂糖3.0.05mol/lCaCl2溶液:稱取

6、0.37gCaCl22H2O,溶于50ml重蒸水中,定容至100ml,高壓滅菌。4.含15%甘油的0.05mol/lCaCl2:稱取0.37gCaCl22H2O,溶于50ml重蒸水中,加入15ml甘油,定容至100ml,高壓滅菌。5.取錐形瓶裝好雙蒸水,包口、滅菌,即無菌水,存放于室溫。6.用脫脂棉制成棉球,配制75%酒精浸泡,置于廣口試劑瓶中備用。實驗二PCR擴增目的DNA及電泳鑒定實驗?zāi)康模赫莆誔CR技術(shù)的原理、方法和實驗注意事項二、實驗原理:該技術(shù)是在模板DNA、引物和四種脫氧核糖核苷酸存在下,依賴于DNA聚合酶的酶促合成反應(yīng)。DNA聚合酶以單鏈DNA為模板,借助一小段雙鏈DNA來啟動合

7、成,通過一個或兩個人工合成的寡核苷酸引物與單鏈DNA模板中的一段互補序列結(jié)合,形成部分雙鏈。在適宜的溫度和環(huán)境下,DNA聚合酶將脫氧單核苷酸加到引物3-OH末端,并以此為起始點,沿模板53方向延伸,合成一條新的DNA互補鏈。PCR反應(yīng)的基本成分包括:模板DNA(待擴增DNA)、引物、4種脫氧核苷酸(dNTPs)、DNA聚合酶和適宜的緩沖液。類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:模板DNA的高溫變性:模板DNA經(jīng)加熱至93左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物

8、結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備;模板DNA與引物的低溫退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的適溫延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性-退火-延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需24分鐘,23小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。實驗用品PCR儀、臺式離心機、電泳裝置與凝膠成像系統(tǒng)、移液槍、PCR管、PCR緩沖液、dNTPs、DNA聚

9、合酶、一對引物、無菌水、模板(DNA或cDNA)實驗步驟在一滅菌的0.2mlPCR管中加入:2lRT產(chǎn)物2.5l10Buffer1.5l25mMMgCl2(終濃度為1.5mM)0.5l10mMdNTPs(終濃度各為0.2mM)2.0l10M上下游引物混合物(終濃度各為0.8M)0.5l1U/lTaqDNA聚合酶16l滅菌雙蒸水總體積為25lPCR反應(yīng)程序為94/5min預(yù)變性;94/20s變性、50/40s退火、72/40s延伸,循環(huán)35圈;72/10min再延伸。反應(yīng)結(jié)束后,取5L擴增產(chǎn)物采用1.5%瓊脂糖凝膠進行電泳分析。實驗三核酸的瓊脂糖凝膠電泳與分析一、實驗?zāi)康膶W(xué)習(xí)并掌握DNA的瓊脂糖

10、凝膠電泳的原理與方法。二、實驗原理瓊脂糖凝膠電泳是分離和純化DNA片段的常用技術(shù)。把DNA樣品加入到一塊包含電解質(zhì)的多孔支持介質(zhì)(瓊脂糖凝膠)的樣品孔中,并置于靜電場上。由于DNA分子的雙螺旋骨架兩側(cè)帶有含負電荷的磷酸根殘基,因此在電場中向正極移動。在一定的電場強度下,DNA分子的遷移速度取決于分子篩效應(yīng)。具有不同的相對分子質(zhì)量的DNA片段泳動速度不一樣,因而可依據(jù)DNA分子的大小來使其分離。凝膠電泳不僅可分離不同分子質(zhì)量的DNA,也可以分離相對分子質(zhì)量相同,而構(gòu)型不同的DNA分子。在電泳過程中可以通過示蹤染料或相對分子質(zhì)量標準參照物和樣品一起進行電泳而得到檢測。相對分子質(zhì)量標準參照物相對可以

11、提供一個用于確定DNA片段大小的標準。在凝膠中加入少量溴化乙錠(ethidiumbromide,EB),其分子可插入DNA的堿基之間,形成一種絡(luò)合物,在254365nm波長紫外光照射下,呈桔紅色熒光,因此也可對分離的DNA進行檢測。一般瓊脂糖凝膠電泳適用于大小在0.2kb50kb范圍內(nèi)的DNA片段。本實驗介紹瓊脂糖凝膠的制備以及瓊脂糖凝膠電泳在DNA片段分離中的應(yīng)用方法。三、實驗用品1.儀器及耗材:水平電泳槽、電泳儀、凝膠成像分析系統(tǒng)、微波爐、移液槍及配套槍頭、點樣板或保鮮膜、一次性手套、100ml或250ml錐形瓶、量筒等。2.試劑及配制:50TAE緩沖液的配制:2mol/LTris-乙酸,

12、0.05mol/LEDTA(pH8.0)配制1000mlTris242g冰乙酸57.1ml0.5mol/LEDTA100ml加入600ml去離子水后攪拌溶解,將溶液定容至1L后。高溫高壓滅菌,室溫保存。1TAE緩沖液的配制:稱量20ml的50TAE緩沖液,再加入980ml的去離子水。溴化乙錠貯存液:10mg/ml溴化乙啶配制:100ml稱取1g溴化乙啶,置于100ml燒杯中,加入80ml去離子水后攪拌溶解。將溶液定容至100ml后,轉(zhuǎn)移到棕色瓶中。室溫保存。6上樣緩沖液:0.25%溴酚藍,0.25%二甲苯青FF,30%甘油。配制:10ml溴酚藍25mg二甲苯青FF25mg甘油3ml用6TAE緩

13、沖液定溶至10ml,分裝成1ml/管。-20保存。其它試劑:DNA樣品、DNALadder、瓊脂糖四、實驗方法1.制備1瓊脂糖凝膠(50ml):稱取0.5g瓊脂糖置于錐形瓶中,加入50ml1TAE,瓶口倒扣小燒杯。微波爐加熱煮沸3次至瓊脂糖全部融化,搖勻,即成1.0%瓊脂糖凝膠液。2.膠板制備:取電泳槽內(nèi)的有機玻璃內(nèi)槽(制膠槽)洗干凈、晾干,放入制膠玻璃板。取少量瓊脂糖凝膠液將玻璃板與內(nèi)槽兩端邊緣封好,形成模子。將內(nèi)槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子。將冷卻到65左右的瓊脂糖凝膠液混勻小心地倒入內(nèi)槽玻璃板上,使膠液緩慢展開,直到整個玻璃板表面形成均勻膠層。室溫下靜置直至凝膠完全凝固,垂直輕拔

14、梳子,將凝膠及內(nèi)槽放入電泳槽中。添加1TAE電泳緩沖液至沒過膠板為止。3.加樣:在保鮮膜上混合8.3l質(zhì)粒DNA樣品和1.7l上樣緩沖液,用10l移液槍分別將樣品加入膠板的樣品小槽內(nèi),每加完一個樣品,應(yīng)更換一個加樣頭,以防污染,加樣時勿碰壞樣品孔周圍的凝膠面。(注意:加樣前要先記下加樣的順序)。4.電泳:加樣后的凝膠板立即通電進行電泳,電壓60100V,樣品由負極(黑色)向正極(紅色)方向移動。電壓升高,瓊脂糖凝膠的有效分離范圍降低。當(dāng)溴酚藍移動到距離膠板下沿約1cm處時,停止電泳。5.電泳完畢后,取出凝膠,用含有0.5ug/ml的溴化乙錠1TAE溶液染色約20min,再用清水漂洗10min。

15、6.觀察照相:在紫外燈下觀察,DNA存在則顯示出紅色熒光條帶,采用凝膠成像系統(tǒng)拍照保存。7.常見問題及注意事項配瓊脂糖時應(yīng)使其完全熔化后方可制膠。瓊脂糖凝膠易于破碎,操作時要輕緩。電泳時應(yīng)注意電源線路,預(yù)防觸電。溴化乙淀具有致癌作用,配制及使用時應(yīng)帶乳膠或一次性塑料手套。并在專門的實驗室內(nèi)使用。紫外線對人體有損傷作用,開燈時間不宜太長,注意防護。DNA帶形狀模糊:DNA加樣過多;電壓太高;凝膠中有氣泡。質(zhì)粒DNA的存在形式有3種,共價閉環(huán)DNA(cccDNA),常以超螺旋形式存在;開環(huán)DNA(ocDNA),此種質(zhì)粒DNA的兩條鏈中有一條發(fā)生一處或多處斷裂,因此可以自由旋轉(zhuǎn)從而消除張力,形成松弛

16、的環(huán)狀分子;線狀DNA,因質(zhì)粒DNA的兩條鏈在同一處斷裂而造成。因此質(zhì)粒DNA電泳的結(jié)果中有可能出現(xiàn)三條泳帶,它們的泳動速度為:cccDNA線狀DNAocDNA。五、實驗結(jié)果在紫外儀中觀察電泳熒光區(qū)帶,并拍照、分析。實驗四pET28a質(zhì)粒在大腸桿菌中的擴增與試劑盒抽提(堿抽提法)一、實驗?zāi)康膶W(xué)習(xí)并掌握在宿主菌中擴增質(zhì)粒的理論依據(jù)與操作方法。了解大腸桿菌質(zhì)粒提取的原理和方法,掌握小量快速提取法(試劑盒法)。二、實驗原理細菌質(zhì)粒是一類雙鏈、閉環(huán)的DNA,大小范圍從1kb至200kb以上不等。各種質(zhì)粒都是存在于細胞質(zhì)中、獨立于細胞染色體之外的自主復(fù)制的遺傳成份,通常情況下可持續(xù)穩(wěn)定地處于染色體外的游

17、離狀態(tài),但在一定條件下也會可逆地整合到寄主染色體上,隨著染色體的復(fù)制而復(fù)制,并通過細胞分裂傳遞到后代。基因工程用質(zhì)粒都帶有選擇性標記序列,最常用的的選擇性標記是對抗生素的抗性基因。如本實驗所使用的質(zhì)粒(pET28a),即帶有抗卡那霉素(Kanr)抗性基因。當(dāng)培養(yǎng)中含有卡那霉素時,宿主(大腸桿菌BL21)的蛋白質(zhì)合成受到抑制,而pET28a質(zhì)??勺孕袕?fù)制,從而將大大增加拷貝數(shù),達到抽提質(zhì)粒的濃度要求。一般分離質(zhì)粒DNA的方法都包括3個步驟:培養(yǎng)細菌,使質(zhì)粒DNA大量擴增;收集和裂解細菌;分離和純化質(zhì)粒DNA。分離制備質(zhì)粒DNA的方法很多,其中常用的方法有堿裂解法、煮沸法、SDS法、羥基磷灰石層析

18、法等。在實際操作中可以根據(jù)宿主菌株類型、質(zhì)粒分子大小、堿基組成和結(jié)構(gòu)等特點以及質(zhì)粒DNA的用途進行選擇。本實驗介紹堿裂解法提取質(zhì)粒DNA。圖1pET-28a質(zhì)粒基因結(jié)構(gòu)簡圖堿裂解法提取質(zhì)粒DNA是根據(jù)共價閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA和線性染色體DNA在拓撲學(xué)上的差異來分離質(zhì)粒DNA。在pH值介于12.0-12.5這個狹窄的范圍內(nèi),線性的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而被變性,盡管在這樣的條件下,共價閉環(huán)質(zhì)粒DNA的氫鍵會被斷裂,但兩條互補鏈彼此相互盤繞,仍會緊密地結(jié)合在一起。當(dāng)加入pH4.8乙酸鉀高鹽緩沖液恢復(fù)pH至中性時,因為共價閉合環(huán)狀的質(zhì)粒DNA的兩條互補鏈仍保持在一起,因此復(fù)性迅速而準確,而線性的染色體D

19、NA的兩條互補鏈彼此已完全分開,復(fù)性就不會那么迅速而準確,它們相互纏繞形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),而復(fù)性的質(zhì)粒DNA恢復(fù)原來構(gòu)型,保持可溶性狀態(tài)。通過離心,染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA,蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來而被除去,最后用酚氯仿抽提純化上清液中的質(zhì)粒DNA。三、實驗用品儀器及耗材:37恒溫搖床、臺式離心機、恒溫水浴鍋、移液槍及配套槍頭、記號筆、燒杯、冰盒、酒精燈、打火機、計時器;50ml離心管、1.5ml離心管、離心管架、藍蓋試劑瓶、大試管、100ml三角錐瓶、250ml三角錐瓶、玻棒等;3S柱離心式質(zhì)粒小量抽提試劑盒實驗材料:大腸桿菌BL21,含pET28a質(zhì)粒。試劑及配制:LB

20、培養(yǎng)液的配制:酵母粉5.0g;蛋白胨10.0g;NaCl10.0g;依次稱量后加入800ml去離子水后攪拌至完全溶解,用5mol/LNaOH調(diào)節(jié)培養(yǎng)液的pH值至7.0。再加去離子水將溶液定容至總體積為1000ml,高壓蒸汽滅菌25min,冷卻后4保存??敲顾兀?0mg/ml,配制后抽濾滅菌,分裝,-20凍存。溶液(GET緩沖液):25mmol/LTris-HCl(pH8.0),10mmol/LEDTA,50mmol/L葡萄糖配制:1000ml1mol/LTris-HCl(pH8.0)25ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)20ml20%Glucose(1.11mol/L)45mldH2

21、O910ml將以上溶液混合裝瓶,10磅高壓滅菌20min,冷卻后4保存。溶液II(變性液):200mmol/LNaOH,1%SDS配制:500ml10%SDS50ml2NNaOH50ml取以上溶液,用滅菌去離子水定容至500ml,充分混勻。室溫保存,此溶液保存時間最好不超過一個月,最好現(xiàn)用現(xiàn)配。注意:SDS易產(chǎn)生氣泡,不要劇烈攪拌。溶液III(醋酸鉀液):3mol/L醋酸鉀(KAc)緩沖液,pH5.6。5mol/L冰醋酸配制:500ml醋酸鉀147g冰醋酸57.5ml加入300ml去離子水后攪拌溶解。待醋酸鉀溶解后,再加去離子水將溶液定容至500ml。高溫高壓滅菌后,4保存。10TE緩沖液(p

22、H8.0):100mmol/LTris-HCl,10mmol/LEDTA配制:1000ml1mol/LTris-HCl緩沖液(pH8.0)100ml500mmol/LEDTA(pH8.0)20ml加入約800ml的去離子水,均勻混合。溶液定容至1L。高溫高壓滅菌后,4保存。苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1):將量取25mlTris-HCl(pH8.0)平衡苯酚,加入24ml氯仿和1ml異戊醇,充分混合后,移入棕色玻璃瓶中,4保存。其它試劑:TE(pH8.0)、異丙醇、氯仿/異戊醇(24:1)、無水乙醇、70乙醇四、實驗方法(一)pET28a質(zhì)粒在大腸桿菌中的擴增1.菌種活化:將50mlLB培

23、養(yǎng)基加入到250ml三角錐形瓶中,加入卡那霉素50L,然后接入一單菌落(攜帶pET28a的大腸桿菌BL21菌株),并保持通氣良好,于37220rpm振蕩培養(yǎng)過夜(約16h),如有必要可以再轉(zhuǎn)接一次,于37220rpm振搖培養(yǎng)34h。2.菌液轉(zhuǎn)接:取滅菌后的50ml三角錐形瓶一支,加入15mlLB培養(yǎng)基和15L卡那霉素,接種菌液250L,于37恒溫振蕩器中220rpm振搖培養(yǎng)。3.培養(yǎng)過夜后,收集所培養(yǎng)的菌體,用于質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒DNA提取(堿裂解法)用3S柱離心式質(zhì)粒小量抽提試劑盒抽提,以試劑盒使用說明為準1.將過夜培養(yǎng)的1ml細菌轉(zhuǎn)移至1.5ml離心管,高速(15,000轉(zhuǎn)/分鐘)離心5分鐘,

24、徹底去除上清。重復(fù)1次。2.加入100lSolutionI,用槍頭或振蕩器充分懸浮細菌。3.加入200lSolutionII,立即上下顛倒或用手指彈管底,使細菌裂解,室溫放置(2分鐘左右)至溶液變成澄清。4.加入400lSolutionIII,立即上下顛倒510次,使之充分中和,室溫放置2分鐘。(注意:步驟2和3在冰上操作效果更佳。)5.高速離心,15,000轉(zhuǎn)/分鐘,10分鐘。無需低溫離心。6.取出2ml樣品收集管和3S柱,在管壁標上樣品號,將步驟5中的上清全部轉(zhuǎn)移到(吸或倒入)3S柱子里。蓋上離心管蓋子,室溫放置2分鐘;用臺式離心機室溫高速(15,000轉(zhuǎn)/分鐘)離心2分鐘。7.取下3S柱

25、,棄去掉收集管中的廢液,將3S柱放入同一支收集管中,吸取700lWashSolution到3S柱,高速離心2分鐘。8.重復(fù)步驟7一次。9.取下3S柱,棄去掉收集管中的廢液,將3S柱放入同一支收集管中,高速離心5分鐘。10.將3S柱放入干凈的1.5ml的離心管(預(yù)先寫好標簽)中,在3S柱子膜中央加50lTE或水,不要蓋上離心管蓋,室溫下放置2分鐘;蓋上離心管蓋,室溫高速離心3分鐘。11.棄3S管。保留1.5ml離心管,蓋好離心管蓋,存放于-20保存?zhèn)溆谩8剑鹤灾瞥樘嵋簤A裂解法操作吸取培養(yǎng)的菌液1ml,轉(zhuǎn)入1.5ml的離心管中,用臺式離心機以12000rpm離心3min。棄上清。在管內(nèi)再次加入菌液

26、1ml,離心,棄上清,將離心管倒置,使液體盡可能流盡。加100l溶液重懸細菌沉淀,用槍吹打直至混和均勻。加200l溶液,蓋緊管口,輕緩上下顛倒離心管以混合內(nèi)容物。室溫靜置5min(溶液變透明,粘稠)。加150l溶液,輕微振蕩混和10sec,置冰上10min(溶液出現(xiàn)白色沉淀)。12000rpm離心6min,取上清液至另一離心管(棄沉淀)。加等量的酚/氯仿/異戊醇,旋渦混勻1min,12000r/min離心6min,取上清液至另一離心管。加1倍異丙醇,振蕩混勻,靜置10min,12000rpm離心6min。棄上清液,將離心管倒置于吸水紙,將附于管壁的殘余液滴除凈。加200l70乙醇洗滌沉淀物,臺

27、式離心機12000rpm離心2min,棄上清液,將沉淀在室溫下晾干(或在5060的烘箱中也可)。沉淀加20lTE,反復(fù)吹打使質(zhì)粒DNA充分溶解,20保存。五、實驗結(jié)果將所抽的質(zhì)粒存放于4冰箱中備用。六、思考與討論如果要在此pET28a質(zhì)粒中放入外源重組基因,該如何選擇插入位點?常見問題:1.提取的質(zhì)粒DNA不純:變性不充分;關(guān)鍵步驟反應(yīng)時間過短;離心時間或速度不夠。2.提取的質(zhì)粒DNA呈涂布狀:操作過程中用力過猛,動作過大;操作系統(tǒng)內(nèi)有污染。3.與染色體DNA分離不全:變性過程不完全;試劑配制有問題(成分,濃度或pH)。實驗五感受態(tài)細胞的制備(CaCl2法)一、實驗?zāi)康牧私獯竽c桿菌感受態(tài)細胞的

28、制備原理,掌握制備方法。二、實驗原理在自然條件下,很多質(zhì)粒都可通過細菌接合作用轉(zhuǎn)移到新的宿主內(nèi),但在人工構(gòu)建的質(zhì)粒載體中,一般缺乏此種轉(zhuǎn)移所必需的mob基因,因此不能自行完成從一個細胞到另一個細胞的接合轉(zhuǎn)移。如需將質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)移進受體細菌,需誘導(dǎo)受體細菌產(chǎn)生一種短暫的感受態(tài)以攝取外源DNA。細菌處于容易吸收外源DNA的狀態(tài)叫感受態(tài)。目前常用的感受態(tài)細胞制備方法有CaCl2和RbCl(KCl)法,RbCl(KCl)法制備的感受態(tài)細胞轉(zhuǎn)化效率較高,但CaCl2法簡便易行,且其轉(zhuǎn)化效率完全可以滿足一般實驗的要求,制備出的感受態(tài)細胞暫時不用時,可加入占總體積15的無菌甘油于-70保存(半年),因此CaC

29、l2法為使用更廣泛。三、實驗用品材料:大腸桿菌TOP10設(shè)備器材:超凈工作臺、冷凍離心機、恒溫搖床、冰箱、恒溫水浴鍋、分光光度計、移液槍(1000l、100l)及相配槍頭、離心管(1.5ml、10ml)、離心管架、記號筆、計時器、錐形瓶、冰盒、溫度計。試劑:LB液體培養(yǎng)基0.05mol/lCaCl2溶液:稱取0.37gCaCl22H2O,溶于50ml重蒸水中,定容至100ml,高壓滅菌。含15%甘油的0.05mol/lCaCl2:稱取0.37gCaCl22H2O,溶于50ml重蒸水中,加入15ml甘油,定容至100ml,高壓滅菌。實驗步驟(一)受體菌的培養(yǎng)從LB平板上挑取新活化的E.coliT

30、OP10單菌落,接種于3-5mlLB液體培養(yǎng)基中,37下振蕩培養(yǎng)12小時左右,直至對數(shù)生長后期。將該菌懸液以1:100-1:50的比例接種于100mlLB液體培養(yǎng)基中,37振蕩培養(yǎng)2-3小時至OD6000.5左右。(二)感受態(tài)細胞的制備(CaCl2法)1)、在超凈臺上將8ml培養(yǎng)液轉(zhuǎn)入10ml離心管中,冰上放置10分鐘,然后于4下3000g離心10分鐘。2)、在超凈臺上棄去上清,用預(yù)冷的0.05mol/l的CaCl2溶液1ml輕輕懸浮細胞,冰上放置15-30分鐘后,4下3000g離心10分鐘。3)、在超凈臺上棄去上清,加入400l預(yù)冷含15%甘油的0.05mol/l的CaCl2溶液,輕輕懸浮細

31、胞,冰上放置幾分鐘,即成感受態(tài)細胞懸液。4)、在超凈臺上將感受態(tài)細胞分裝成200l的小份(分裝2份至1.5ml離心管中),貯存于-70(可保存半年)。五、實驗結(jié)果將制備好的感受態(tài)細胞暫存于-20,用于轉(zhuǎn)化實驗。六、注意事項防止雜菌與雜DNA污染,整個操作過程應(yīng)在無菌條件下進行,所用器皿、試劑均需滅菌,并注意防止被其它試劑、DNA酶、雜DNA所污染。實驗六pET28a質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌TOP10與鑒定一、實驗?zāi)康囊詐ET28a質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌TOP10為例,學(xué)習(xí)轉(zhuǎn)化的基本原理及方法。二、實驗原理轉(zhuǎn)化是指質(zhì)粒DNA或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入細菌的過程。轉(zhuǎn)化過程所用的受體細胞一般是限制修飾系統(tǒng)缺陷的

32、變異株,即不含限制性內(nèi)切酶和甲基化酶的突變體(R,M),它可以容忍外源DNA分子進入體內(nèi)并穩(wěn)定地遺傳給后代。受體細胞經(jīng)過一些特殊方法(如電擊法,CaCl2等化學(xué)試劑法)的處理后,細胞膜的通透性發(fā)生了暫時性的改變,成為能允許外源DNA分子進入的感受態(tài)細胞(CompenentCells)。進入受體細胞的DNA分子通過復(fù)制,表達實現(xiàn)遺傳信息的轉(zhuǎn)移,使受體細胞出現(xiàn)新的遺傳性狀。將經(jīng)過轉(zhuǎn)化后的細胞在篩選培養(yǎng)基中培養(yǎng),即可篩選出轉(zhuǎn)化子(Transformant,即帶有異源DNA分子的受體細胞)。本實驗是用pET28a質(zhì)粒來轉(zhuǎn)化已制備成感受態(tài)的大腸桿菌TOP10,所用方法為CaCl2轉(zhuǎn)化法。pET28a質(zhì)粒上含有一個抗生素卡那霉素抗性基因,轉(zhuǎn)化子細胞將在含有卡那霉素的培養(yǎng)基上生長而非轉(zhuǎn)化子細胞則不能,故而用抗性平板作為篩選培養(yǎng)基,涂布鑒定的方法即可篩選出轉(zhuǎn)化子。三、實驗用品材料:感受態(tài)大腸桿菌TOP10細胞、p

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