Chapter 02 真核基因組的包裝課件_第1頁
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文檔簡介

1、第二章 真核基因組的包裝第一節(jié) 真核生物染色體 一、化學(xué)組成: DNA線形 蛋白質(zhì)Histones(組蛋白):H1,H2A,H2B,H3,H4Nonhistones(非組蛋白):1. 染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)核小體模型8 組蛋白分子(H2A+H2B+H3+H4)2核心:147bp DNA:環(huán)繞核心.二、空間結(jié)構(gòu)(1)核小體的組成DNA 螺旋組蛋白: 四種顏色 “串珠”兩個(gè)核小體之間 53bp spacer DNA 和 H1結(jié)合(2) 核小體11nm30nm直徑:6 個(gè)核小體一圈.Solenoid(螺線管)Solenoid(螺線管)(3)螺線管 染色質(zhì)纖維30nm300nm直徑:300nm環(huán)形結(jié)構(gòu)域如何

2、調(diào)控和表現(xiàn) DNA的功能?三、染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)域(Chromatin domains)間期細(xì)胞核中染色質(zhì)濃縮、染色深的部分基因失活;缺乏基因;晚復(fù)制.功能:維持染色質(zhì)的結(jié)構(gòu).1.異染色質(zhì)(Heterochromatin)間期細(xì)胞核中染色質(zhì)松散、染色淺的部分.2.常染色質(zhì)(Euchromatin)活性基因;早復(fù)制.由直徑30 nm 的染色質(zhì)纖維組成(1)基質(zhì)結(jié)合區(qū)(MARs)富含AT序列的DNA片段(2)結(jié)構(gòu)域(Structural domains)位于核基質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)之間的DNA環(huán)又稱:支架結(jié)合區(qū) (SARs)(3)功能域(Functional domains)結(jié)構(gòu)域中對(duì)DNase I 敏感的部位含

3、有更為松散和開放的組織形式 功能域被絕緣子分割1)絕緣子(Insulators):12 kb 序列,是功能域的邊界。絕緣子序列2)絕緣子的兩個(gè)功能: 克服位置效應(yīng)( positional effect);維持功能域的獨(dú)立性.位置效應(yīng)(positional effect):當(dāng)一個(gè)新基因被插入到染色體上后,其表達(dá)能力有變化。因?yàn)榛蛩幍奈恢貌煌淖兤浔硇?。絕緣子能修飾染色質(zhì)的包裝,從而建立一個(gè)功能域絕緣子維持功能域的獨(dú)立性 有些功能域具有基因座控制區(qū)(LCR)1)基因座控制區(qū)(LCR)克服位置效應(yīng).激活位于功能域中的基因表達(dá).一、染色質(zhì)修飾激活基因組1. 組蛋白修飾給位于核小體核心的組蛋白分子

4、的N端的賴氨酸上添加乙?;鶊F(tuán). 組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (HATs): 四膜蟲 : p55, 酵母 : GCN5, 哺乳動(dòng)物 : p300/CBP, 改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)。(1)組蛋白乙?;嚢彼嵋阴;鵋AT*HAT: histone acetyltransferase(組蛋白N端)“+”減少與DNA結(jié)合松散基因激活(3)組蛋白磷酸化磷酸根絲氨酸組氨酸Kinase的羥基增加 “-”與DNA結(jié)合松散基因激活組蛋白 H3 和H1.(4)組蛋白泛素化(Histone ubiquitination)對(duì) H2B 2. 核小體重建指在基因組的一小段區(qū)域上的核小體的修飾和位置變化。(2) 側(cè)滑或順式替換(cis-di

5、splacement)需要能量。減小核小體與DNA的相互作用指核小體結(jié)構(gòu)的變化(不包括位置)。 (1) 重建(Remodeling)指核小體沿著DNA的移動(dòng)。 (3) 轉(zhuǎn)位或反式替換( trans-displacement)核小體被轉(zhuǎn)移到另一條DNA上, 或者轉(zhuǎn)到同一個(gè)DNA的非臨近位置。核小體重建復(fù)合體: Swi/Snf 核小體重建復(fù)合體: Swi/Snf 二、染色質(zhì)修飾沉默基因組1. 組蛋白去乙?;溉閯?dòng)物: HDAC1, HDAC2 酵母 : Rpd3 組蛋白去乙?;?(HDACs)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶: Dnmt1, Dnmt3a , Dnmt3b 2. DNA 甲基化C 5-mC 低等

6、真核生物: 稀有 脊椎動(dòng)物 :10%, 5CG3 植物: 30%, 5CNG3 (1)維持甲基化(2)重新甲基化 在新的位置上進(jìn)行甲基化 DNA復(fù)制以后,在新鏈上對(duì)應(yīng)于母鏈的甲基化位置上進(jìn)行甲基化 Dnmt1,Dnmt3a , Dnmt3b(3)人CpG 島的甲基化CpG 島不甲基化某種組織里正在表達(dá)的特異基因的 CpG 島不甲基化 管家基因(Housekeeping genes):組織特異性基因(4)基因組印記與DNA甲基化基因組印記(Genomic imprinting): 同源染色體上的一對(duì)等位基因中只有一個(gè)表達(dá),另一個(gè)被甲基化所沉默人類和小鼠至少有30個(gè)基因表現(xiàn)印記有的基因來自于父本,有的來自于母本人11號(hào)染色體上的一對(duì)印記基因(5)X染色體失活與DNA甲基化組蛋白 H2A 被特殊組蛋白 macroH2A1

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