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文檔簡介

1、生物化學(xué)知識點總結(jié)生物化學(xué)知識點總結(jié)第一章 蛋白質(zhì)化學(xué)1、氨基酸的分類: 生物體中的氨基酸常見蛋白質(zhì)氨基酸(20種)不常見蛋白質(zhì)氨基酸非蛋白質(zhì)氨基酸第一章 蛋白質(zhì)化學(xué)1、氨基酸的分類:生物體中的常見蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)氨基酸按側(cè)鏈R基的極性分為:蛋白質(zhì)氨基酸按側(cè)鏈R基的極性分為:記?。?0種蛋白質(zhì)氨基酸的結(jié)構(gòu)式,三字母符號。例題:1、請寫出下列物質(zhì)的結(jié)構(gòu)式: 賴氨酸,組氨酸,谷氨酰胺。 2、寫出下列縮寫符號的中文名稱: Ala Glu Asp Cys 3、是非題: 1)天然氨基酸都有一個不對稱碳原子。 2)自然界的蛋白質(zhì)和多肽類物質(zhì)均由L氨基酸組成。記?。?0種蛋白質(zhì)氨基酸的結(jié)構(gòu)式,三字母符號。2、氨

2、基酸的酸堿性質(zhì)Henderson-Hasselbalch方程:pH=pKa + lg質(zhì)子受體即堿質(zhì)子供體即酸例題:1、Henderson-Hasselbalch方程為 。 2、當(dāng)溶液中的pH值大于某一可解離的pKa值時,該基團有一半以上被解離。2、氨基酸的酸堿性質(zhì)Henderson-Hasselbalc3、氨基酸的等電點(pI):使氨基酸處于凈電荷為零時的pH。對于R基不解離和酸性氨基酸:pI=1/2(pK1+pK2)對于堿性氨基酸:pI=1/2(pK2+pK3)3、氨基酸的等電點(pI):使氨基酸處于凈電荷為零時的pH。4、紫外光譜性質(zhì):三種氨基酸具有紫外吸收性質(zhì)。最大吸收波長:酪氨酸275

3、nm;苯丙氨酸257nm;色氨酸280nm。一般考選擇題或填空題。4、紫外光譜性質(zhì):三種氨基酸具有紫外吸收性質(zhì)。最大吸收波長:5、化學(xué)反應(yīng): 與氨基的反應(yīng):?;磻?yīng) 氨基酸與 5一二甲氨基萘-1-磺酰氯(dansyl chloride,DNS)的反應(yīng) 烴基化反應(yīng) 與2、4一二硝基氟苯的反應(yīng) ,與苯異硫氰酸(酯)的反應(yīng) 與羧基的反應(yīng):成鹽和成酯反應(yīng)(保護羧基);成酰氯反應(yīng)和疊氮反應(yīng)(活化羧基)氨基和羧基共同參加的反應(yīng):與茚三酮反應(yīng),成肽鍵反應(yīng)5、化學(xué)反應(yīng):?;磻?yīng) 氨基酸與 5一二甲氨基萘-1-磺酰(1)Millon反應(yīng):檢測Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。 Millon試劑:汞的硝酸鹽與亞

4、硝酸鹽溶液。 產(chǎn)物:紅色的化合物。(2)Folin反應(yīng):檢測Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。 Folin試劑:磷鉬酸、磷鎢酸混合溶液。 產(chǎn)物:藍色的鉬藍、鎢藍。(3)坂口反應(yīng):檢測Arg或含Arg的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。 坂口試劑:萘酚的堿性次溴酸鈉溶液。 產(chǎn)物:磚紅色的沉淀。側(cè)鏈反應(yīng)(顏色反應(yīng)):(1)Millon反應(yīng):檢測Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反6、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次一級(10)結(jié)構(gòu)(primary structure):指多肽鏈中以肽鍵相連的氨基酸序列。 二級(20)結(jié)構(gòu)(secondary structure):指多肽鏈借助氫鍵排列成一些規(guī)則片斷,螺旋,-折疊, -轉(zhuǎn)角及無規(guī)則卷曲。6、蛋白

5、質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次 三級(30)結(jié)構(gòu)(tertiary structure):指多肽鏈借助各種非共價鍵在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進一步彎曲,折疊成具有特定走向的緊密球狀構(gòu)象。 四級(40)結(jié)構(gòu)(quaternary struture):指寡聚蛋白質(zhì)中各亞基之間在空間上的相互關(guān)系和結(jié)合方式。 三級(30)結(jié)構(gòu)(tertiary structure超二級結(jié)構(gòu):在球狀蛋白質(zhì)中,若干相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元如-螺旋,-折疊,-轉(zhuǎn)角組合在一起,彼此相互作用,形成有規(guī)則的在空間上能辨認的二級結(jié)構(gòu)組合體,并充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件,基本組合有:,。超二級結(jié)構(gòu):結(jié)構(gòu)域: 結(jié)構(gòu)域是多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)或超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級結(jié)構(gòu)的局部折

6、疊區(qū),它是一個相對獨立的緊密球狀實體結(jié)構(gòu)域:7、維持蛋白質(zhì)各級結(jié)構(gòu)的作用力:一級結(jié)構(gòu):肽鍵二,三,四級結(jié)構(gòu):氫鍵,范德華力,疏水作用力,離子鍵和二硫鍵。7、維持蛋白質(zhì)各級結(jié)構(gòu)的作用力:測定多肽鏈的數(shù)目拆分多肽鏈斷開多肽鏈內(nèi)的二硫鍵測定每一肽鏈的氨基酸組成鑒定多肽鏈的N-末端和C-末端裂解多肽鏈為較小的肽段測定各肽段的氨基酸序列利用重疊肽重建完整多肽鏈的一級結(jié)構(gòu)確定二硫鍵的位置8、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定(9步)測定多肽鏈的數(shù)目拆分多肽鏈斷開多肽鏈內(nèi)的二硫鍵測定每一肽鏈的酶裂解法: 蛋白水解酶可以用于肽鏈的斷裂。 最常用的酶:胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶(糜蛋白酶),胃蛋白酶,嗜熱菌蛋白酶,梭菌蛋白酶等等

7、。酶裂解法:胰蛋白酶: Lys和Arg羧基所參加的反應(yīng)糜蛋白酶:Phe,Tyr,Trp羧基端肽鍵。梭菌蛋白酶: Arg的羧基端溴化氰:只斷裂Met的羧基形成的肽鍵。胰蛋白酶: 螺旋結(jié)構(gòu)要點: (1)螺旋的每圈有3.6個氨基酸,螺旋間距離為0.54nm,每個殘基沿軸旋轉(zhuǎn)100,上升0.15nm。 (2)第n個肽鍵的羰基氧與遠在第(n+4)個氨基酸氨基上的氫形成鏈內(nèi)氫鍵(hydrogen bond),氫鍵的走向平行于螺旋軸,所有肽鍵都能參與鏈內(nèi)氫鍵的形成。R基伸向螺旋的外側(cè)。 (3)螺旋中每個-C的和分別在47和57。 (4)99是右手螺旋。 生物化學(xué)知識點總結(jié)課件10080氧分壓氧飽和度6060

8、9012015030氧合曲線血紅蛋白氧合曲線肌紅蛋白氧合曲線10080氧分壓氧飽和度60609012015030氧合曲 波耳效應(yīng):當(dāng)H+離子濃度增加時,pH值下降,氧飽和度右移,這種pH對血紅蛋白對氧的親和力影響被稱為波耳效應(yīng)(Bohr效應(yīng))。 波耳效應(yīng):第二章 核酸化學(xué)1、核苷酸: 四種堿基的結(jié)構(gòu)式,四種核苷酸的結(jié)構(gòu)式,四種脫氧核苷酸的結(jié)構(gòu)式,假尿嘧啶核苷酸的結(jié)構(gòu)式,環(huán)腺苷酸的結(jié)構(gòu)式。第二章 核酸化學(xué)1、核苷酸:2、核酸的一級結(jié)構(gòu):核苷酸是核酸的基本結(jié)構(gòu)單位。核苷酸以磷酸二酯鍵連接。例題:核酸的基本結(jié)構(gòu)單位是 。2、核酸的一級結(jié)構(gòu):核苷酸是核酸的基本結(jié)構(gòu)單位。核苷酸以磷酸3、DNA的二級結(jié)構(gòu)

9、:雙螺旋 Watson雙螺旋的結(jié)構(gòu)特點,雙螺旋類型,雙螺旋的維持力3、DNA的二級結(jié)構(gòu):雙螺旋Watson的雙螺旋結(jié)構(gòu)要點1、兩條反向的多核苷酸鏈圍繞同一條中心軸呈右手螺旋盤繞。2、磷酸和脫氧核糖鏈在螺旋的兩側(cè),堿基在螺旋的中間,兩條鏈的堿基兩兩配對,A與T形成兩個氫鍵,G與C形成三個氫鍵。3、雙螺旋直徑為2nm,相鄰兩對堿基垂直距離為0.34nm,每圈螺旋中有10對堿基每圈螺距為3.4nm。4、在雙螺旋的表面形成大、小兩個凹槽分別稱為大溝、小溝。5、兩條鏈借堿基之間的氫鍵和堿基堆積力牢固的連結(jié)起來,維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。 Watson的雙螺旋結(jié)構(gòu)要點DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的不同類型: Watson

10、雙螺旋結(jié)構(gòu)被稱為BDNA。除此之外還有A型和Z型等等。 Z型雙螺旋是左手螺旋。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的不同類型:DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的維持力: 氫鍵 堿基堆積力 離子鍵 范德華力DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的維持力:4、tRNA的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu) 二級結(jié)構(gòu):三葉草形結(jié)構(gòu) 三級結(jié)構(gòu):倒L形。4、tRNA的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)5、原核生物和真核生物mRNA的區(qū)別 原核生物mRNA為多順反子mRNA。真核生物mRNA具5端帽子和3端多聚腺苷酸結(jié)構(gòu),是單順反子。5、原核生物和真核生物mRNA的區(qū)別6、限制性內(nèi)切酶:在細菌中發(fā)現(xiàn)的,具有嚴(yán)格的堿基序列專一性,主要是降解外源的DNA一類酶。6、限制性內(nèi)切酶:在細菌中發(fā)現(xiàn)的,具有

11、嚴(yán)格的堿基序列專一性,7、核酸的紫外吸收在260nm處有最大光吸收DNA和RNA的定量測定和純度測定 測定純度:通過測定A260/A280的比值鑒定純度,純DNA比值大于1.8,純RNA比值大于2.0 7、核酸的紫外吸收8、 增色效應(yīng):核酸的光吸收值比核苷酸光吸收值的和少3040%,當(dāng)核酸變性或降解時光吸收值顯著增加(增色效應(yīng)) 減色效應(yīng):核酸復(fù)性后,光吸收值又回復(fù)到原有水平(減色效應(yīng))。 Tm:通常把DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半時的溫度稱為DNA的熔點或熔解溫度(melting temperature, Tm)。8、 增色效應(yīng):核酸的光吸收值比核苷酸光吸收值的和少304DNA的Tm值大小與下列

12、因素有關(guān):()DNA的均一性()GC之含量 ()介質(zhì)中的離子強度 DNA的Tm值大小與下列因素有關(guān):9、定糖法 原理:根據(jù)RNA中的核糖,DNA中的脫氧核糖的顏色反應(yīng)可以對RNA和DNA進行定量測定。 DNA的測定用二苯胺法;RNA的測定用地衣酚法。9、定糖法第三章 酶1、酶的概念 經(jīng)典概念:是一類由活細胞產(chǎn)生的,具有特殊催化能力,高度專一性的蛋白質(zhì)。 目前的定義:是生物體內(nèi)一類具有催化能力和特定空間構(gòu)象的生物大分子。第三章 酶1、酶的概念2、酶作為生物催化劑的特點 1)酶易失活: 2)催化效率高: 3)具有高度專一性: 4)酶活性受到調(diào)節(jié)和控制: 2、酶作為生物催化劑的特點4、全酶酶蛋白輔助

13、因子5、酶的系統(tǒng)命名法例題:寫出下列反應(yīng)酶的國際系統(tǒng)命名乳酸丙酮酸4、全酶酶蛋白輔助因子乳酸丙酮酸6、酶的分類 1)氧化還原酶 2)轉(zhuǎn)移酶 3)水解酶 4)裂合酶 5)異構(gòu)酶 6)合成酶6、酶的分類7、酶活力的概念,酶活力單位,比活力,總活力 酶活力是指酶催化某一化學(xué)反應(yīng)的能力。用一定條件下所催化的某一反應(yīng)的速率來表示。 酶活力單位:在一定條件下,一定時間內(nèi)將一定量的底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量(unit, U)。7、酶活力的概念,酶活力單位,比活力,總活力8、酶的專一性假說:鎖鑰學(xué)說,誘導(dǎo)契合假說9、酶的專一性分為結(jié)構(gòu)專一性和立體異構(gòu)專一性。10、酶的活性部位:酶分子中能和底物結(jié)合并起催化作用的

14、空間部位,分為結(jié)合部位和催化部位。8、酶的專一性假說:鎖鑰學(xué)說,誘導(dǎo)契合假說11、米氏方程 米氏常數(shù)的意義:米氏常數(shù)Km是當(dāng)酶的反應(yīng)速率達到最大反應(yīng)速率一半時的底物濃度,單位是濃度單位(mol/L)。Km是酶的一個特性常數(shù),只與酶的性質(zhì)有關(guān)。vVmaxSKm S11、米氏方程vVmaxSKm S5、Km的求法: 1)Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法 1/v1/S-1/Km1/Vmax將米氏方程兩邊取倒數(shù),得此方程:=KmVmax1S1v1Vmax5、Km的求法:1/v1/S-1/Km1/Vmax將米氏12、溫度系數(shù)(Q10):反應(yīng)提高10,其酶促反應(yīng)速率與原來反應(yīng)速率之比。13、酶的

15、抑制作用:酶的必需基團受到某種物質(zhì)影響發(fā)生改變,導(dǎo)致酶活性降低或喪失。12、溫度系數(shù)(Q10):反應(yīng)提高10,其酶促反應(yīng)速率與原抑制作用的類型 根據(jù)抑制劑與酶的結(jié)合方式分為1)不可逆抑制2)可逆抑制 1)不可逆抑制作用:抑制劑與酶以共價鍵結(jié)合,引起酶活性下降或喪失,不能用透析,過濾等方法除去抑制劑使酶復(fù)活。抑制作用的類型 根據(jù)抑制劑與酶的結(jié)合方式分為1)不可逆抑制 可逆抑制作用:抑制劑與酶以非共價鍵結(jié)合,引起酶活性喪失或者降低,可以用物理化學(xué)方法除去抑制劑,使酶復(fù)活。分為三類: 競爭性抑制作用 非競爭性抑制作用 反競爭性抑制作用 可逆抑制作用:抑制劑與酶以非共價鍵結(jié)合,引起酶 競爭性抑制作用:

16、抑制劑(I)與底物(S)有相似的結(jié)構(gòu),它們競爭酶的活性部位,從而影響底物與酶的正常結(jié)合,使酶的活性降低,這種抑制作用可以通過增加底物濃度解除。 競爭性抑制作用:抑制劑(I)與底物(S)有相似的結(jié)構(gòu),它非競爭性抑制作用:抑制劑與酶活性中心以外的部位結(jié)合,不妨礙酶與底物的結(jié)合,可以形成ESI復(fù)合物,這種復(fù)合物不能進一步轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物。這種抑制作用不能用增加底物的方式解除。反競爭性抑制作用:酶與底物結(jié)合后才能與抑制劑結(jié)合形成ESI復(fù)合物,這種復(fù)合物不能分解為產(chǎn)物,從而抑制了酶的活性。非競爭性抑制作用:抑制劑與酶活性中心以外的部位結(jié)合,不妨礙可逆抑制作用的動力學(xué) 1)競爭性抑制作用加入競爭性抑制劑后的米氏

17、方程:v=VmaxSKm(1+I/Ki)+S 加入競爭性抑制劑后,Vmax不變,Km變大??赡嬉种谱饔玫膭恿W(xué)加入競爭性抑制劑后的米氏方程:v=Vma2)非競爭性抑制劑:加入非競爭性抑制劑后的米氏方程:v=Km+SVmax(1+I/Ki)S 加入非競爭性抑制劑后,Vmax變小,Km不變。2)非競爭性抑制劑:加入非競爭性抑制劑后的米氏方程:v=Km3)反競爭抑制作用 米氏方程變?yōu)椋?Vmax(1+I/Ki)S+Sv=Km(1+I/Ki)加入反競爭抑制劑,Vmax和Km都變小。3)反競爭抑制作用Vmax(1+I/Ki)S+S16、決定酶高效率的機制: 鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng);誘導(dǎo)契合;酸堿催化;共價催

18、化;局部微環(huán)境的影響。17、酶的別構(gòu)調(diào)節(jié):酶分子的非催化部位與某些化合物可逆的非共價結(jié)合,使酶發(fā)生構(gòu)象的改變,進而改變酶活性狀態(tài),稱為酶的別構(gòu)調(diào)節(jié)。效應(yīng)物:能使酶分子發(fā)生別構(gòu)作用的物質(zhì),又分為正效應(yīng)物和負效應(yīng)物。16、決定酶高效率的機制:第四章 維生素1、維生素:是維持機體正常生命活動不可缺少的小分子有機物。分為脂溶性維生素和水溶性維生素2、維生素A缺乏癥:夜盲癥3、維生素D缺乏癥:佝僂病4、維生素B1:是TPP的前體;TPP是丙酮酸脫羧酶,乙酰乳酸合成酶,戊糖磷酸途徑中轉(zhuǎn)酮酶的輔酶。缺乏癥是腳氣病。第四章 維生素1、維生素:是維持機體正常生命活動不可缺少的5、維生素PP:是NAD,NADP的

19、組成成分。6、維生素B2是FAD,F(xiàn)MN的組成成分7、泛酸是輔酶A的組成成分8、維生素B6是磷酸吡哆胺和磷酸吡哆醛的前體,這兩種物質(zhì)主要作為轉(zhuǎn)氨酶和脫羧酶的輔酶5、維生素PP:是NAD,NADP的組成成分。9、維生素B12的缺乏癥:惡性貧血10、葉酸:是四氫葉酸的前體,四氫葉酸是體內(nèi)一碳單位的載體。11、硫辛酸作為丙酮酸脫氫酶系中的一個輔酶。9、維生素B12的缺乏癥:惡性貧血第五章 糖代謝1、糖酵解:發(fā)生場所,反應(yīng)過程,酶,調(diào)控酶,限速反應(yīng),能量變化及生理意義場所:細胞質(zhì)調(diào)控酶:己糖激酶,磷酸果糖激酶,丙酮酸激酶凈產(chǎn)生2個ATP第五章 糖代謝1、糖酵解:發(fā)生場所,反應(yīng)過程,酶,調(diào)控酶,糖酵解途

20、徑的生理意義 1)在缺氧條件下為機體提供能量 2)為其它合成反應(yīng)提供碳骨架 3)把葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)楸幔瑸闄幟仕嵫h(huán)最終的氧化做準(zhǔn)備 糖酵解途徑的生理意義2、三羧酸循環(huán):場所,反應(yīng)過程,酶,調(diào)控酶,能量產(chǎn)生,生理意義產(chǎn)所:線粒體調(diào)控酶:檸檬酸合成酶、異檸檬酸脫氫酶和-酮戊二酸脫氫酶能量產(chǎn)生:10個ATP2、三羧酸循環(huán):場所,反應(yīng)過程,酶,調(diào)控酶,能量產(chǎn)生,生理意檸檬酸循環(huán)的生理意義 1)是機體獲得能量的主要途徑 2)是物質(zhì)代謝的中樞 3)檸檬酸循環(huán)的中間產(chǎn)物可作為細胞組分碳骨架的前體物質(zhì)。檸檬酸循環(huán)的生理意義3、糖原合成和分解:場所和過程4、糖異生:三個迂回措施5、磷酸戊糖途徑的生理意義是細胞產(chǎn)

21、生還原力(NADPH)的主要途徑。是細胞內(nèi)不同結(jié)構(gòu)糖分子的重要來源,并為各種單糖的相互轉(zhuǎn)變提供條件3、糖原合成和分解:場所和過程6、乙醛酸途徑中兩個特有的酶:異檸檬酸裂合酶和蘋果酸合酶7、胰島素,胰高血糖素,腎上腺素,糖皮質(zhì)激素對血糖的作用。6、乙醛酸途徑中兩個特有的酶:異檸檬酸裂合酶和蘋果酸合酶第六章 生物氧化1、生物氧化的概念: 是有機物在活細胞中進行氧化分解生成二氧化碳和水,并釋放出能量的過程。2、呼吸鏈:在生物氧化過程中,基質(zhì)脫下的氫經(jīng)過一系列傳遞體傳遞,最后與氧結(jié)合生成水的電子傳遞系統(tǒng),在具有線粒體的生物中,呼吸鏈分為NADH鏈和FADH2鏈兩種。第六章 生物氧化1、生物氧化的概念:

22、4、呼吸鏈的組成:NADH鏈:NADH輔酶Q還原酶,輔酶Q,輔酶Q細胞色素c還原酶,細胞色素c,細胞色素氧化酶。FADH2鏈:FADH2輔酶Q還原酶,輔酶Q,輔酶Q細胞色素c還原酶,細胞色素c,細胞色素氧化酶。4、呼吸鏈的組成:5、底物水平磷酸化:在代謝過程中,由于底物分子內(nèi)部能量重新分布產(chǎn)生的高能磷酸鍵轉(zhuǎn)移給ADP,產(chǎn)生ATP或GTP的反應(yīng)。6、氧化磷酸化:電子在呼吸鏈傳遞過程中釋放的能量,在ATP合成酶催化下,促使ADP生成ATP,這是氧化與磷酸化相偶聯(lián)的反應(yīng),稱為氧化磷酸化,是生物合成ATP的主要方式。5、底物水平磷酸化:在代謝過程中,由于底物分子內(nèi)部能量重新分7、氧化作用和磷酸化作用相

23、偶聯(lián)的部位7、氧化作用和磷酸化作用相偶聯(lián)的部位8、呼吸抑制劑阻斷呼吸鏈的部位:NADHNADH-Q還原酶QH2C1C細胞色素氧化酶魚藤酮安密陀殺粉蝶菌素抗霉素A氰化物疊氮化合物CO8、呼吸抑制劑阻斷呼吸鏈的部位:NADHNADH-Q還原酶Q 9、解偶聯(lián)劑:2,4-二硝基苯酚 10、氧化磷酸化抑制劑:寡霉素 11、離子載體抑制劑:纈氨霉素 12、磷氧比(P/O比):指每消耗一分子O2產(chǎn)生的ATP分子數(shù)。從NADH到O2,P/O比是3;從FADH2到O2,P/O比是2。 12、磷氧比(P/O比):指每消耗一分子O2產(chǎn)生的AT計算當(dāng)一對電子從NADH轉(zhuǎn)移到細胞色素C的反應(yīng)中,標(biāo)準(zhǔn)自由能的變化。 (p

24、H=7.0,250C,NAD/NADH+H+ E0,=-0.32V, Cyt C Fe3+/Fe2+ E0,=+0.235V ) 答案:G0nFE 223.062【0.235(0.32)】25.6 Kcal/mol計算當(dāng)一對電子從NADH轉(zhuǎn)移到細胞色素C的反應(yīng)中,標(biāo)準(zhǔn)自由能第七章 脂類代謝脂類代謝分解代謝合成代謝脂肪分解磷脂分解酮體代謝脂肪的合成磷脂的合成膽固醇的合成第七章 脂類代謝脂類代謝分解代謝合成代謝脂肪分解磷脂分解酮-氧化:脂肪酸氧化從羧基端的位碳原子開始,每次分解出一個2碳片斷,生成一個乙酰CoA的過程,是脂肪酸氧化的主要方式。-氧化:脂肪酸氧化從羧基端的位碳原子開始,每次分解出一個

25、1、脂肪酸的氧化分解氧化1)脂肪酸的活化 部位:細胞質(zhì);酶:脂酰輔酶A合成酶 需要消耗1個ATP,2個高能磷酸鍵。不可逆反應(yīng)。1、脂肪酸的氧化分解氧化2)長鏈脂肪酸的轉(zhuǎn)運:脂酰肉堿轉(zhuǎn)運機制線粒體外膜線粒體內(nèi)膜脂酰肉堿轉(zhuǎn)移酶脂酰肉堿轉(zhuǎn)移酶脂酰CoA脂酰CoA 肉堿輔酶A 脂酰肉堿脂酰肉堿 輔酶A脂酰CoA 肉堿膜間隙基質(zhì)細胞質(zhì)載體2)長鏈脂肪酸的轉(zhuǎn)運:脂酰肉堿轉(zhuǎn)運機制線粒體外膜線粒體內(nèi)膜脂3)氧化 部位:線粒體 反應(yīng)過程:脫氫,水化,脫氫,硫解 酶:脂酰輔酶A脫氫酶(FAD輔酶),烯酰輔酶A水合酶,3羥脂酰輔酶A脫氫酶(NAD+輔酶),硫解酶 能量產(chǎn)生:乙酰輔酶A進入TCA循環(huán),NADH和FAD

26、H2進入呼吸鏈。 3)氧化-氧化過程 4步反應(yīng):脫氫,加水,脫氫,硫解CH3-(CH2)12-CH2-CH2-COSCoA脂酰輔酶A脫氫酶FADFADH2CH3-(CH2)12-C=C-COSCoAHH脂酰輔酶A2-tris-烯酰輔酶A烯酰輔酶A水合酶H2OCH3-(CH2)12-CH-CH2-COSCoAOH3-羥脂酰輔酶ACH3-(CH2)12-C-CH2-COSCoAO3羥脂酰脫氫酶NADH+H+硫解酶CH3-(CH2)10CH2-COSCoACH3-COCoA-氧化過程CH3-(CH2)12-CH2-CH2-COS2、磷脂酶A1,磷脂酶A2,磷脂酶C,磷脂酶D的作用位點。CH2-O-C

27、-R1OR2-C-O-CH2OCH2-O-P-O-XOOH2、磷脂酶A1,磷脂酶A2,磷脂酶C,磷脂酶D的作用位點。C3、酮體產(chǎn)生 酮體:是一類小分子有機物,脂肪酸分解代謝產(chǎn)生的特有中間產(chǎn)物,包括乙酰乙酸, 羥丁酸,丙酮。 產(chǎn)所:肝臟線粒體 原料:乙酰輔酶A 關(guān)鍵酶:羥甲基戊二酸單酰輔酶A合成酶3、酮體產(chǎn)生4、酮體的利用:解酮作用(ketolysis) 由于肝內(nèi)缺乏分解酮體所需要的硫激酶,酮體的分解須在肝外組織中進行(轉(zhuǎn)硫酶的作用相當(dāng)于硫激酶),最終轉(zhuǎn)變成乙酰CoA進入三羧酸循環(huán)途徑氧化供能。4、酮體的利用:5、脂肪酸的合成 分為從頭合成途徑和延長途徑從頭合成途徑的產(chǎn)所:細胞質(zhì)原料:乙酰輔酶A

28、乙酰輔酶A的轉(zhuǎn)運:檸檬酸丙酮酸循環(huán)?;d體蛋白(ACP)的作用:脂肪酸合成酶系中的?;d體。合成氫源:NADPH+H+5、脂肪酸的合成6、脂肪酸合成與分解代謝的區(qū)別區(qū)別點脂肪酸合成脂肪酸分解發(fā)生場所 細胞質(zhì) 線粒體載體 ACP CoASH轉(zhuǎn)運機制 檸檬酸-丙酮酸循環(huán) 肉堿載體系統(tǒng) 二碳片斷 丙二酸單酰CoA 乙酰CoA反應(yīng)方向 最后合成羧基端 最先分解羧基端羥脂基中間體 D-型 L-型氫受體 NADPH FAD, NAD+ 酶 7個酶 4個酶能量變化 吸收能量 釋放能量6、脂肪酸合成與分解代謝的區(qū)別區(qū)別點脂肪酸合成脂肪酸分解發(fā)生丙酮酸氧化脫羧氧化酮體分解乙酰輔酶ATCA循環(huán)脂酸合成生成酮體膽固

29、醇合成丙酮酸氧化脫羧氧化酮體分解乙酰輔酶ATCA循環(huán)脂酸合成生第八章 氨基酸的代謝氨基酸的代謝分解代謝合成代謝共同代謝途徑碳骨架代謝第八章 氨基酸的代謝氨基酸的代謝分解代謝合成代謝共同代謝途1、氮的平衡:氮的總平衡;氮的正平衡;氮的負平衡2、必需氨基酸:8種,纈氨酸,亮氨酸,異亮氨酸,蘇氨酸,甲硫氨酸,苯丙氨酸,色氨酸,賴氨酸1、氮的平衡:氮的總平衡;氮的正平衡;氮的負平衡3、氨基酸共同代謝途徑脫氨基作用:轉(zhuǎn)氨,脫氨,聯(lián)合脫氨轉(zhuǎn)氨作用的酶:轉(zhuǎn)氨酶(輔酶是磷酸吡哆醛,維生素B6的衍生物)轉(zhuǎn)氨作用的機制:乒乓機制3、氨基酸共同代謝途徑轉(zhuǎn)氨基作用轉(zhuǎn)氨基作用由轉(zhuǎn)氨酶(transaminase)催化,將

30、-氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移到-酮酸酮基的位置上,生成相應(yīng)的-氨基酸,而原來的-氨基酸則轉(zhuǎn)變?yōu)橄鄳?yīng)的-酮酸。R-CH-COOH R”-C-COOH R-C-COOH R”-CH-COOH 轉(zhuǎn)氨酶NH2OONH2轉(zhuǎn)氨酶的輔酶是磷酸吡哆醛,維生素B6的衍生物轉(zhuǎn)氨基作用轉(zhuǎn)氨基作用由轉(zhuǎn)氨酶(transaminase)催化脫氨基作用的酶:L氨基酸氧化酶,谷氨酸脫氫酶(輔酶NAD+ NADP+)R-CH-COOHNH2 2H R-C-COOH + NH3 OH2OR-C-COOHNH 酶脫氨基作用的酶:L氨基酸氧化酶,谷氨酸脫氫酶(輔酶NAD+聯(lián)合脫氨基作用:以谷氨酸為中心的聯(lián)合脫氨基作用,天冬氨酸的聯(lián)合脫氨基作用

31、聯(lián)合脫氨基作用:氨基酸與-酮戊二酸經(jīng)轉(zhuǎn)氨作用生成-酮酸和谷氨酸,后者經(jīng)L-谷氨酸脫氫酶作用生成游離氨和-酮戊二酸的過程。是轉(zhuǎn)氨基作用和L-谷氨酸氧化脫氨基作用聯(lián)合反應(yīng)。聯(lián)合脫氨基作用:以谷氨酸為中心的聯(lián)合脫氨基作用,天冬氨酸的聯(lián)轉(zhuǎn)氨酶氨基酸-酮酸L-谷氨酸脫氫酶NH3 + NADH + H+H2O + NAD+ -酮戊二酸谷氨酸以谷氨酸為中心的聯(lián)合脫氨基作用轉(zhuǎn)氨酶氨基酸-酮酸L-谷氨酸脫氫酶NH3 + NADH +天冬氨酸的聯(lián)合脫氨基作用COOHCH2H2NCHCOOH+天冬氨酸(Asp)OHNNNNR-5-P次黃嘌呤核苷酸(IMP)NNNNR-5-PCOOHCH2 HNCHCOOH腺苷酸代琥

32、珀酸H2O裂合酶NH2NNNNR-5-P+COOHCH2 CHCOOH延胡索酸腺苷酸(AMP)H2ONH3天冬氨酸的聯(lián)合脫氨基作用COOHCH2H2NCHCOOH+骨骼肌中氨基轉(zhuǎn)運:葡萄糖丙氨酸循環(huán)氨基的去路尿素循環(huán) 產(chǎn)所:線粒體和細胞質(zhì) 限速酶:精氨酸代琥珀酸合成酶骨骼肌中氨基轉(zhuǎn)運:葡萄糖丙氨酸循環(huán)尿素循環(huán):是路生動物排氨的主要途徑,氨基酸氧化時產(chǎn)生的氨,在肝臟細胞線粒體和胞質(zhì)中,經(jīng)過谷氨酸,瓜氨酸,精胺琥珀酸,精氨酸,鳥氨酸循環(huán),生成尿素的過程。尿素循環(huán):是路生動物排氨的主要途徑,氨基酸氧化時產(chǎn)生的氨,在胞液線粒體2ATP+CO2+NH3+H2O氨基甲酰磷酸 2ADP+Pi瓜氨酸精氨酸代琥

33、珀酸ATP+AspAMP+PPiNH3 草酰乙酸蘋果酸 鳥氨酸瓜氨酸Pi延胡索酸精氨酸尿素鳥氨酸H2O尿素合成的鳥氨酸循環(huán)胞液線粒體2ATP+CO2+NH3+H2O氨基甲酰磷酸 2氨基的脫羧反應(yīng):產(chǎn)物是一級胺,大部分一級胺有毒,少數(shù)作為生物活性物質(zhì)。-氨基丁酸:抑制性神經(jīng)遞質(zhì)組胺:強烈的血管舒張劑,能增加毛細血管的通透性。5-羥色胺:腦內(nèi)5-羥色胺可作為抑制性神經(jīng)遞質(zhì)。在外周組織,5-羥色胺有收縮血管的作用氨基的脫羧反應(yīng):產(chǎn)物是一級胺,大部分一級胺有毒,少數(shù)作為生物第九章 核酸代謝核酸代謝核酸降解核酸合成核苷酸的合成DNA的合成RNA的合成第九章 核酸代謝核酸代謝核酸降解核酸合成核苷酸的合成D

34、NA1、核酸的降解:蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶的作用位點PPPPPP A G C T G C OH53牛脾磷酸二酯酶蛇毒磷酸二酯酶1、核酸的降解:蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶的作用位點PP腺苷酸腺苷酸脫氨酶次黃苷酸次黃苷核苷酸酶Pi戊糖1磷酸次黃嘌呤核苷磷酸化酶核苷核苷脫氨酶腺嘌呤腺嘌呤脫氨酶黃嘌呤鳥嘌呤尿酸尿囊素尿囊酸尿素乙醛酸人,猿,鳥其他哺乳類硬骨魚兩棲類,魚嘌呤的降解產(chǎn)物腺苷酸腺苷酸脫氨酶次黃苷酸次黃苷核苷酸酶Pi戊糖1磷酸次胞嘧啶NH3尿嘧啶二氫尿嘧啶 H2OCO2 + NH3-丙氨酸-脲基異丁酸-氨基異丁酸H2O丙二酸單酰CoA乙酰CoATCA肝尿素甲基丙二酸單酰CoA琥珀酰

35、CoATCA糖異生胸腺嘧啶嘧啶降解產(chǎn)物胞嘧啶NH3尿嘧啶二氫尿嘧啶 H2OCO2 + NH3-2、核苷酸的合成:從頭合成途徑和補救途徑從頭途徑中元素來源2、核苷酸的合成:從頭合成途徑和補救途徑CCCCNN氨甲酰磷酸谷胺酰胺二氧化碳天冬氨酸CCCCNN氨甲酰磷酸谷胺酰胺二氧化碳天冬氨酸3、DNA的生物合成半保留復(fù)制:即新的雙鏈DNA中,一股鏈來自模板,一股鏈為新合成的。復(fù)制子:基因組能獨立進行復(fù)制的單位 半不連續(xù)復(fù)制:DNA雙鏈在進行復(fù)制時,一條模板鏈35方向,復(fù)制鏈以5 3方向連續(xù)合成,另一條模板鏈3 5方向,復(fù)制鏈以5 3方向合成許多DNA片斷,最后連成完整的鏈。3、DNA的生物合成岡崎片斷

36、:岡崎用電子顯微鏡看到了DNA復(fù)制過程中出現(xiàn)一些不連續(xù)片段,這些不連續(xù)片段只存在與DNA復(fù)制叉上其中的一股。后來就把這些不連續(xù)的片段稱為岡崎片段。岡崎片斷:岡崎用電子顯微鏡看到了DNA復(fù)制過程中出現(xiàn)一些不連DNA聚合酶DNA聚合酶DNA聚合酶不同種類亞基數(shù)目1710相對分子質(zhì)量103 00088 000900 000 53核酸聚合酶活性+35核酸外切酶活性+53核酸外切酶活性+-聚合速度(核苷酸/分)1 0001200240015 00060 000持續(xù)合成能力32001500500 000分子數(shù)/細胞4001001020功能切除引物,修復(fù)修復(fù)復(fù)制大腸桿菌DNA聚合酶的種類DNA聚合酶DNA聚

37、合酶DNA聚合酶不同種類亞基數(shù)目1DNA連接酶(ligase)原核生物以NAD+為能量供體,為DNA連接酶提供能量。真核生物以ATP為能量供體,為DNA連接酶提供能量拓撲異構(gòu)酶:是一類可改變DNA拓撲性質(zhì) 的酶。解旋酶 通過ATP水解提供能量,使堿基對分開 大部分的解旋酶方向是沿著5 3方向單鏈結(jié)合蛋白 和 引發(fā)酶 DNA連接酶(ligase) DNA聚合酶 1)以四種dNTP為底物 2)以DNA為模板,并且需要一段引物,引物是一段與模板互補的核酸(DNA或RNA)片斷,有3OH。 3)合成方向是5 3 4)合成的DNA分子性質(zhì)與親代DNA相同。生物化學(xué)知識點總結(jié)課件復(fù)制過程分為:起始,延伸,

38、終止三個階段復(fù)制過程分為:起始,延伸,終止三個階段增加負超螺旋打開雙螺旋單鏈結(jié)合蛋白DnaA拓撲異構(gòu)酶DNA 的起始過程形成引物Dna B增加負超螺旋打開雙螺旋單鏈結(jié)合蛋白DnaA拓撲異構(gòu)酶DNA復(fù)制的延伸同時進行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成共同途徑前導(dǎo)鏈的合成滯后鏈的合成復(fù)制的延伸同時進行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成共同途徑前導(dǎo)鏈的合成滯3、復(fù)制的終止50 ori ter0 ter為終止區(qū),有6個終止位點,每個終止位點有22bp,可與終止蛋白結(jié)合,阻止復(fù)制叉的移動。3、復(fù)制的終止50 ori ter0 ter為終止區(qū),有原核生物和真核生物DNA復(fù)制的區(qū)別原核生物真核生物復(fù)雜程度簡單復(fù)雜復(fù)制起點1個多個單個復(fù)

39、制叉速度快慢連續(xù)進行DNA復(fù)制是否酶聚合酶解旋酶,拓撲酶連接酶,SSB聚合酶,SSB岡崎片段長度較長較短端粒復(fù)制無有原核生物和真核生物DNA復(fù)制的區(qū)別原核生物真核生物復(fù)雜程度簡 2、堿基對的置換(點突變):DNA錯配堿基在復(fù)制后被固定下來,由原來的一個堿基對被另一個堿基對所取代點突變轉(zhuǎn)換:兩種嘧啶或嘌呤之間的互換顛換:嘧啶和嘌呤交換,或是嘌呤和嘧啶交換點突變的結(jié)果錯義突變:三聯(lián)體密碼子改變蛋白質(zhì)中某種氨基酸的改變。無義突變:氨基酸轉(zhuǎn)變?yōu)榻K止密碼子蛋白質(zhì)合成停止 2、堿基對的置換(點突變):DNA錯配堿基在復(fù)制 3、移碼突變:由于一個或多個非三整倍數(shù)的核苷酸對插入或缺失,而使編碼區(qū)該位點后的三聯(lián)

40、體密碼子改變,導(dǎo)致蛋白質(zhì)翻譯錯誤。 3、移碼突變:由于一個或多個非三整倍數(shù)的核苷酸對插DNA的損傷修復(fù)DNA的修復(fù)系統(tǒng)直接修復(fù)切除修復(fù)錯配修復(fù)重組修復(fù)SOS修復(fù)與易錯修復(fù)DNA的損傷修復(fù)DNA的修復(fù)系統(tǒng)直接修復(fù)切除修復(fù)錯配修復(fù)重組5、DNA指導(dǎo)的RNA聚合 RNA聚合酶活性特點: 1)底物:4種NTP 2)模板:DNA雙鏈中的一條鏈 3)合成方向:5 3 4)合成RNA鏈第一個核苷酸5有3個磷酸基 5)引物:無 6)外切酶作用:無 5、DNA指導(dǎo)的RNA聚合表1:E.coli RNA聚合酶各亞基的大小與功能:亞基亞基數(shù)分子量基因功能1160rpoC與模板DNA結(jié)合1150rpoB與核苷酸結(jié)合,起始和催化部位。170rpoD起始識別因子237rpoA與DNA上啟動子結(jié)合19-不詳表1:E.coli RNA聚合酶各亞基的大小與功能:亞基亞基模板鏈:用于轉(zhuǎn)錄的DNA鏈。編碼鏈:與模板鏈相對應(yīng)的DNA鏈。例題:是非題:DNA

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