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第二章基因概念的演變與發(fā)展1、名詞解釋C值矛盾:C值和生物結(jié)構(gòu)或組成的復(fù)雜性不一致的現(xiàn)象。DNA變性:在某些理化因素作用下,DNA分子互補堿基對之間的氫鍵斷裂,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)松散,變成單鏈的過程。DNA的Tm:DNA的Tm——熔鏈溫度等于OD增加值的中點溫度(一般為85-95℃)或DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半時的溫度Tm值計算公式:Tm=69.3+0.41(G+C)%GC%=(Tm-69.3)×2.44DNA復(fù)性:DNA水溶液加熱變性時,雙螺旋兩條鏈分開;如果緩慢冷卻至低于Tm值25股螺旋過程。斷裂(間隔)基因:真核生物的結(jié)構(gòu)基因是由若干外顯子和內(nèi)含子序列相間隔排列組成。2、簡答題DNA是否是唯一的遺傳物質(zhì)?答:否。RNA一類能侵染動物并在宿主細胞內(nèi)復(fù)制的小分子的無免疫性疏水蛋白質(zhì)。請問哪些條件可促使DNA退火)?變性1,加熱變性2,極端酸堿變性 3,變型劑處復(fù)性:1、溫度和時間。DNA復(fù)性時,溫度不宜過低,Tm-25℃是比較合適的復(fù)性溫度,而且時間也不能過短,時間太短DNA復(fù)性效果不明顯。2、DNA性速度越快。3、DNADNA4、DNA序列的復(fù)雜性。片段內(nèi)的重復(fù)序列多,則容易形成互補區(qū),因而復(fù)性較快。5、反應(yīng)溶液中的離子強度。維持溶液中一定的離子強度,消除磷酸基負電荷造成的斥力,可加快復(fù)性速度。原核生物和真核生物基因和基因組結(jié)構(gòu)特點比較。原核生物基因結(jié)構(gòu):多順反子,轉(zhuǎn)錄區(qū)序列區(qū)(5,-UTR;cDNA序列區(qū)-編碼區(qū);3,-UTR);mRNA5-,poly(A)尾巴。原核生物基因組 真核生物基因組特點 1)原核生物的基因組很小,大多只有一條染色體,且DNA含量少沒有重復(fù)序列2)結(jié)構(gòu)簡練:存在轉(zhuǎn)錄單元:有重疊基因:
3×109bp存在大量的重復(fù)序列轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順反子斷裂基因,含有內(nèi)含子有大量順式作用元件DNA多態(tài)性具有端粒結(jié)構(gòu)3) 義。重復(fù)基因:基因組中拷貝數(shù)不止一份的基因。意義:影響著生命的進化、遺傳、變異;同時它對基因表達、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、染色體的構(gòu)建以及生理代謝都起著不可或缺的作用。斷裂基因:真核生物的結(jié)構(gòu)基因是由若干外顯子和內(nèi)含子序列相間隔排列組成。意義3.大生物體的遺傳信息儲量4.利用內(nèi)含子進行代謝調(diào)節(jié)。跳躍基因:在基因組中可移動的一段DNA序列。意義:1.有利于基因組的進化。2.用于哺乳動物基因功能的研究。假基因意義重疊基因:不同的基因功能共用一段相同的NBA序列。意義b選擇的適應(yīng)性。3、論述題DNA模型的提出是分子生物學(xué)發(fā)展史上的里程碑,具有劃時代的貢獻?答Crick1953分子是由兩條反向平行的多聚核苷酸鏈組成的,連酸骨架主鏈位于螺旋的外緣,A/T,G/C以氫鍵方式連接形成的堿基對堆積在螺旋內(nèi)部,向右盤旋的B-雙螺旋棒狀實體。意義:標志著生物科學(xué)的發(fā)展進入了分子生物學(xué)階段。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的提出開始,便開啟了分子生物學(xué)時代.分子生物學(xué)使生物大分子的研究進入一個新的階段,使遺傳的研究深入到分子層次,"生命之謎"被打開,人們清楚地了解遺傳信息的構(gòu)成和傳遞的途徑.在以后的近50年里,分子遺傳學(xué),分子免疫學(xué),細胞生物學(xué)等新學(xué)科如雨后春筍般出現(xiàn),一個又一個生命的奧秘從分子角度得到了更清晰的闡明,DNA重組技術(shù)更是為利用生物工程手段的研究和應(yīng)用開辟了廣闊的前景.在人類最終全面揭開生命奧秘的進程中,化學(xué)已經(jīng)并將更進一步地為之提供理論指導(dǎo)和技術(shù)支持.第三章DNA的復(fù)制1、名詞解釋DNA保留復(fù)制:DNA在復(fù)制時,以親代DNA的每一股作模板,合成完全相同的兩個雙鏈子代DNA,每個子代DNA中都含有一股親代DNA鏈DNA半不連續(xù)復(fù)制:前導(dǎo)鏈的連續(xù)復(fù)制和滯后鏈的不連續(xù)復(fù)制在生物界是有普遍性的,因而稱之為DNA的半不連續(xù)復(fù)制。復(fù)制子:從復(fù)制原點到終點,組成一個復(fù)制單位。崗崎片段DNADNA短鏈稱為岡崎片段。2,簡答題DNA復(fù)制為何選擇RNA作為引物?答:有兩方面的原因。DNA3-OH3-OH3-OH的作用,而RNA3-OHRNA比較好。DNADNA復(fù)制開始處的幾個核苷酸最容易出現(xiàn)差錯,因此,用RNADNADNA復(fù)制的準確性。RNADNA聚RNA3'-OH端而DNA鏈的延伸階段DNA復(fù)制起始過程如何,有哪些因子參與?答:a.20DnaAOriC49合;b.識別并使3個13堿基串聯(lián)重復(fù)區(qū)DNA形成開環(huán)結(jié)構(gòu);c.DnaBDnaC的幫助下與未解鏈序列結(jié)合。每六個DnaB蛋白形成一DNADNASSBDNADnaB復(fù)制過程中,只有復(fù)制起始受細胞周期的嚴格調(diào)控因子:DnaA蛋白,DnaB蛋白,DnaC蛋白,DnaT蛋白,HU蛋白,旋轉(zhuǎn)酶,ssB,RNA聚合酶。DNA5’末端短縮的解決辦法有哪幾種。答:1.DNARNA引物,并由該酶催5端短縮。2.在真核生物中端粒酶的作用4)原核生物DNA復(fù)制的形式有哪幾類?()線性A雙鏈的復(fù)制——在A末端形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(2)DNA雙鏈的復(fù)制——θ型復(fù)制。5)真核與原核復(fù)制的比較。答一)相同:1、基本機制相似。如半保留復(fù)制、半不連續(xù)復(fù)制。2所需酶相似。(二)區(qū)別:復(fù)制起始點復(fù)制起始點復(fù)制方向復(fù)制速度復(fù)制DNA的酶引物酶的結(jié)合情況真核生物多個雙向較快不原核生物一個單向較慢是δ)(polⅢ)DNA聚合酶與解旋酶為什么核酸分子的復(fù)制均是從5’向3’進行的?答DNA3′—OH末端聚合dNTPDNA聚合酶只能以5′→3′方向聚合子代DNA鏈。第四章 RNA的轉(zhuǎn)錄1,名詞解釋轉(zhuǎn)錄單位——一段從啟動子開始至終止子結(jié)束的DNA序列。轉(zhuǎn)錄起點——與新生RNA鏈第一個核甘酸相對應(yīng)DNA鏈上的堿基。啟動子——DNARNADNARNARNARNA2,簡答題1、簡述因子在轉(zhuǎn)錄起始中的作用可提高RNA(103),DNA104σ因子負責(zé)模板鏈的選擇和轉(zhuǎn)錄的起始σ因子不參與轉(zhuǎn)錄延伸過程,在轉(zhuǎn)錄起始后RNADNARNA但不能在正確位置起始轉(zhuǎn)錄。σRNARNA8~92、簡述原核生物基因啟動子的結(jié)構(gòu)1)轉(zhuǎn)錄起始點:多數(shù)情況下(>90%)CAT,A2)-10Pribnow結(jié)構(gòu)特點:具保守序列TATAAT(T80A95T45A60A50T96,A.T解鏈。-35Sextamabox結(jié)構(gòu)特點:具保守序列TTGACA(T82T84G78A65C54A45,與-10序列,相隔16-19bp。-10-35基序列并不重要DNA50150bp起始的頻率。3、簡述原核生物轉(zhuǎn)錄終止的兩種機制不依賴ρ因子的終止7~20bpIRIR6-8URNARNApolRNApol6-8URNApolRNA-DNAU-ARNApol依賴ρ因子的終止子終止轉(zhuǎn)錄dnaρdna錄。機制:rnaρrna5’端的某個可能有序列或二級結(jié)構(gòu)特異性的位點上利用atp水解產(chǎn)生的能量沿著5’ 方向朝轉(zhuǎn)錄泡靠近,其運動速度可能比rna聚合酶移動的速度快些;當rna聚合酶移動到終止而暫停時,ρ因子到達rna的3’-OH端追上并取代了暫停在終止位點上的rna聚合酶,它所具有的rna-dna解旋酶活性使轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物rna從模板dna上釋放,隨后,轉(zhuǎn)錄復(fù)合物解體,完成轉(zhuǎn)錄過程。、4、RNA聚合酶II的啟動子有哪些基本元件,各元件的作用是什么?帽子位點(capsite:轉(zhuǎn)錄起始位點TATACAAT增強子:表明其作用具有細胞或組織特異性(調(diào)節(jié)蛋白。GC3、思考題:一個轉(zhuǎn)錄單元就是指一個基因,這種說法對嗎?為什么?答DNADNARNA的區(qū)段。真核生物轉(zhuǎn)錄和原核生物轉(zhuǎn)錄的差異?答RNA必須經(jīng)過加工,將內(nèi)含子轉(zhuǎn)RNA不需要剪切、拼接等加工過程。再有,原核生物基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯通常是在同一時間同一地點進行的,即在轉(zhuǎn)錄可見,真核生物基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯具有時間和空間上的分隔。上述真核生物基因轉(zhuǎn)錄和復(fù)制都是合成的過程,二者有何不同?答:轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄模板原料以DNA的一條鏈或RNA為RNA四種核糖核苷酸RNA聚合酶,轉(zhuǎn)錄酶酶引物不需要復(fù)制DNA的兩條鏈為模板,合成雙鏈DNA四種脫氧核苷酸DNADNA連接酶需要RNA在生物進化中的地位?RNADNARNADNA分子,直接影響后代的基因型。RNARNARNA是功能分子,它在表達過程中起著信息提取和加工作用。內(nèi)含子的“功能”及其在生物進化中的地位。答:由于內(nèi)含子(intron)的進化目前還沒有一致的觀點,一般認為內(nèi)含子組織特異性表達、蛋白質(zhì)變異、基因轉(zhuǎn)錄等多種生物學(xué)過程。RNA聚合酶如何找到DNA上的一個特異性的啟動子?答DNA不能在正確位置起始轉(zhuǎn)錄。RNARNA鏈合成8~9個堿基后釋放。比較原核生物和真核生物mRNA的特征原核生物mRNA的特征半衰期短mRNAmRNAmRNAmRNA。AUGGUUUGpoly(A)結(jié)構(gòu)。SD序列:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。AUG7~1216SrRNA端反向互補端無帽子poly(A)結(jié)構(gòu)。SD序列:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。原核生物起始AUG7~1216SrRNA端反向互補。
真核生物mRNA的特征☆5’端存在“帽子”結(jié)構(gòu)mRNApoly(A)尾巴(組蛋白除外)以單順反子的形式存在AUGRNA要怎樣才能變成有活性的RNA分子?答:真核生物的RNA5′苷化(加尾,內(nèi)含子的剪切,編輯修飾和內(nèi)部腺嘌呤甲基化等過程。原核生物沒有內(nèi)含子,所以不用內(nèi)含子剪切。第五章蛋白質(zhì)翻譯1、名詞解釋:翻譯mRNAtRNAmRNA密碼序列轉(zhuǎn)變?yōu)榘被嵝蛄?,合成多肽的過程。多順反子:原核細胞中數(shù)個結(jié)構(gòu)基因常串聯(lián)為一個轉(zhuǎn)錄單位,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA課編碼幾種功能相關(guān)的蛋白質(zhì)。ORF的閱讀框可編碼完整的多肽鏈,其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。反密碼子:RNA3tRNA3mRNA上的密碼子互補配對,因而叫反密碼子。核糖體結(jié)合位點:是細胞mRNA的一個序列,它包括蛋白質(zhì)合成起始期被30S亞基結(jié)合的一個起始密碼子。2、思考題原核生物和真核生物的核糖體組成。答:1)9%,rRNARNA的80%以上,Euk中相對比例小些。49338×103~4.0×104之間。核糖體作為蛋白質(zhì)的合成場所,具有哪些方面的功能?答:一是提供rRBA遺傳密碼的特點。()間斷也無交叉。(2)密碼的簡并性:由一種以上密碼子編碼同一個氨基酸的現(xiàn)象稱為簡并發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動物細胞的線粒體、植物細胞的葉綠體。tRNAmRNA上的4)什么是SD序列?其功能是什么?答:SD序列是核糖體與mRNA結(jié)合序列,其功能是對翻譯起到調(diào)控作用。核糖體有哪些活性中心?答:核糖體發(fā)揮生物學(xué)功能的5個活性位點①mRNA結(jié)合位點;②結(jié)合A位點(A位;③結(jié)合肽基A位點(P位;④空載A移出位點(E位;⑤形成肽鍵的位點(轉(zhuǎn)肽酶中心)。此外,還有用于起始和延伸的各種蛋白質(zhì)因子結(jié)合位點。tRNA答:1)組成:tRNA在蛋白質(zhì)生物合成過程中起關(guān)鍵作用,稱為第二遺傳密碼tRNA,4S,74~22tRNA的稀有堿基2)tRNA的空間結(jié)構(gòu):三葉草的二級結(jié)構(gòu)①氨基酸接受臂:tRNA5’7bp3’XCCA序列,A功能:負責(zé)攜帶氨基酸TψC臂:特殊的堿基ψ(假尿嘧啶p莖環(huán)的配對,功能:負責(zé)和核糖體上的識別結(jié)合;③反密碼子臂:5bp莖環(huán)的配對,反密碼子,功能:負責(zé)對mRNA上的密碼子的識別與配對。D環(huán):莖區(qū)常為,含有特殊的堿基D(雙氫尿嘧啶功能:起連接作用⑤額外環(huán):可變性大,從4Nt到21Nt不等,功能:在tRNA三維結(jié)構(gòu)中連接兩個區(qū)域(DTψ受體臂。⑥含豐富的稀有堿基:約70余種,每個tRNA分子至少含有2個稀有堿基,最多有19個“LmRNA上。-tRNA:催化反應(yīng)(2步:活化:氨基酸→氨基酰轉(zhuǎn)移:氨基酰-AMP-E+tRNA→AA-tRNA+AMP+E能。起始因子延伸因子終止因子簡要說明原核生物與真核生物的翻譯過程的差別。核糖體核糖體數(shù)量起始tRNA真核80S原核70S8060啟動tRNAmeteIFtRNA結(jié)合tRNAfmetIF三種,先與mRNA/
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