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文檔簡(jiǎn)介
將某載體上的水稻DNA片段亞克隆到另一載體上第一部分:分子克隆技術(shù)pUC19pU1301+1.5KB外源雙酶切:
BamHI+KpnI兩種載體的抽提瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的質(zhì)量?jī)煞N載體的限制性內(nèi)切酶消化目的片段的回收及亞克隆載體的去磷酸化載體與外源DNA的連接感受態(tài)細(xì)胞的制備連接子轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞重組子篩選及鑒定亞克隆的主要步驟質(zhì)粒載體的提取是一個(gè)復(fù)制子,載體在受體細(xì)胞中能大量繁殖,其攜帶的外源基因才能在受體細(xì)胞中得到大量擴(kuò)增有1到多個(gè)限制內(nèi)切酶的單一識(shí)別與切割位點(diǎn),便于外源基因的插入具有選擇性的遺傳標(biāo)記(如抗生素抗性標(biāo)記等)以此知道它是否已進(jìn)入受體細(xì)胞,并據(jù)此標(biāo)記將攜帶載體的細(xì)胞從其他細(xì)胞中分離出來載體必備條件雙鏈閉合環(huán)狀DNA分子,具有自主復(fù)制和轉(zhuǎn)錄能力,能使子代細(xì)胞保持它們恒定的拷貝數(shù),可表達(dá)它所攜帶的遺傳信息。它可獨(dú)立游離于細(xì)胞質(zhì)中,也可整合到細(xì)菌染色體上。質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制可分為嚴(yán)謹(jǐn)型(只在細(xì)胞周期的一定階段進(jìn)行復(fù)制,一個(gè)細(xì)胞內(nèi)只有1至幾個(gè)拷貝)和松弛型(細(xì)胞周期中隨時(shí)可以復(fù)制,拷貝數(shù)較多,一般在細(xì)胞內(nèi)有20個(gè)以上)質(zhì)粒的基本特點(diǎn)SolutionI: Tris.HCl(pH7.5) 50mM EDTA 10mM RNaseA 100μg/mlSolutionII:NaOH 0.2M SDS 1%SolutionIII:Finalconcentration KAC1.32M UsingHACtoadjustpHto4.8TE(pH8.0):Tris.HCl(pH8.0) 10mM EDTA(pH8.0)
1mM苯酚/氯仿無水乙醇或異丙醇
堿裂解法用到的試劑SolutionIII中和后,宿主DNA由于很大,堿基還未來得及配對(duì)就在冰冷的條件下與SDS、蛋白質(zhì)、高分子量的RNA等纏繞在一起沉淀下來,而質(zhì)粒DNA由于很小且雙鏈未分開,能夠迅速配對(duì)重新形成超螺旋,處于溶解狀態(tài)。試劑的作用(二)試劑的作用(三)苯酚/氯仿:純化質(zhì)粒,去除質(zhì)粒溶液中殘留的蛋白質(zhì)等雜質(zhì);無水乙醇或95%乙醇或異丙醇:沉淀質(zhì)粒DNATE或H2O:溶解質(zhì)粒DNA實(shí)驗(yàn)材料攜帶pUC19質(zhì)粒載體的大腸桿菌菌液攜帶含有水稻DNA片段的pU1301載體的大腸桿菌菌液。操作步驟取含有相應(yīng)載體的大腸桿菌菌液于含有相應(yīng)抗生素的LA培養(yǎng)基上涂布或劃線分離單菌落,37℃過夜培養(yǎng));用無菌牙簽或接種環(huán)挑取單菌落,接種于含有相應(yīng)抗生素的LB培養(yǎng)基中,37℃搖床~250r/min過夜培養(yǎng)吸取1.5ml菌液,12000g離心2鐘,收集菌體,倒掉上清;再次吸取1.5ml菌液收集菌體,盡量將菌液倒干凈;加入300l溶液I振蕩打勻,重新懸浮細(xì)胞,震蕩混勻(注意:應(yīng)徹底打勻沉淀或碎塊);加入300l溶液II,輕柔顛倒混勻,放置至清亮,一般不超過5分鐘(最好不超過2分鐘);
加入300l溶液III顛倒混勻,放置于冰上10分鐘,使雜質(zhì)充分沉淀;氨芐青霉素(ampicillin):其主要是通過阻礙細(xì)胞壁的合成最終導(dǎo)致細(xì)胞的裂解。氨芐青霉素抗性基因(ampr):合成β-內(nèi)酰胺酶,在氨芐青霉素進(jìn)入細(xì)胞之前將其水解(使用濃度100μg/ml)卡那霉素(Kanamycinsulfate)
:核糖體結(jié)合,抑制蛋白質(zhì)的合成(使用濃度:50μg/ml)RNaseA:
C或U的3’-P與相鄰的5’-OH處切開RNA。配制:一般以10mg/ml溶于TE中,然后在沸水中煮15分鐘,分裝成小份儲(chǔ)存于-20℃。試驗(yàn)中用到的抗生素和酶DNA純度:吸光值檢測(cè):檢測(cè)260nm、280nm吸光值,紫外分光光度計(jì)A260/A280=1.8-1.9;1.8最佳,低于1.8說明有蛋白質(zhì),大于1.8說明有RNA。質(zhì)量檢測(cè):瓊脂糖凝膠電泳:一般有一至三條帶(超螺旋、線型、開環(huán)三種構(gòu)型),點(diǎn)樣孔附近無DNA帶(無染色體DNA污染)。質(zhì)粒DNA質(zhì)量檢測(cè)DNA的瓊脂糖凝膠電泳
帶電荷的物質(zhì)在電場(chǎng)中的趨向運(yùn)動(dòng)稱為電泳。電泳的種類多,應(yīng)用非常廣泛,它已成為分子生物學(xué)技術(shù)中分離生物大分子的重要手段。瓊脂糖凝膠電泳由于其操作簡(jiǎn)單、快速、靈敏等優(yōu)點(diǎn),已成為分離和鑒定核酸的常用方法。
影響DNA遷移速率的因素
DNA分子大小:遷移速率U與logN成反比(N為堿基對(duì)數(shù)目)。分子大小相等,電荷基本相等(DNA結(jié)構(gòu)重復(fù)性)。分子越大,遷移越慢。瓊脂糖濃度:logU=logU0-Kr
膠濃度,U為遷移率,U0
為DNA的自由電泳遷移率,為膠濃度,Kr為介質(zhì)阻滯系數(shù)。不同的凝膠濃度,分辨不同范圍的DNAAgarose: 0.5%:1-30kb; 0.7%:0.8-12kb1.2%:0.4-7kb;1.5%:0.2-3kb.DNA構(gòu)象:一般遷移速率超螺旋環(huán)狀>線狀DNA>開環(huán);當(dāng)條件變化時(shí),情況會(huì)相反,還與瓊脂糖的濃度、電流強(qiáng)度、離子強(qiáng)度及EB含量有關(guān)。所加電壓:低電壓時(shí),線狀DNA片段的遷移速率與所加電壓成正比。使分辨效果好,凝膠上所加電壓不應(yīng)超過5V/cm堿基組成與溫度:4-30℃一般影響不大嵌入染料的存在:降低線性DNA遷移率,(不提倡加在電泳液中)電泳緩沖液的組成及其離子強(qiáng)度:影響DNA的遷移率,無離子存在時(shí),核酸基本不泳動(dòng),離子強(qiáng)度過大產(chǎn)熱厲害,熔化凝膠并導(dǎo)致DNA變性,一般采用1×TAE,0.5×或1×TBE,1×TPE(均含EDTApH8.0)實(shí)驗(yàn)步驟:將洗凈、干燥的制膠板放入制膠槽中,水平放置在工作臺(tái)上;配制0.8%的瓊脂糖凝膠:稱取0.24g瓊脂糖于30ml0.5×TBE中,在微波爐中使瓊脂糖顆粒完全溶解,冷卻至溫?zé)釙r(shí)倒膠;凝膠凝固后,小心拔去梳子電泳指示劑:核酸電泳常用的指示劑有兩種,溴酚藍(lán)(bromophenolblue,Bb)呈藍(lán)紫色;二甲苯晴(xylenecyanol,Xc)呈藍(lán)色,它攜帶的電荷量比溴酚藍(lán)少,在凝膠中的的遷移率比溴酚藍(lán)慢。
1.含甘油或蔗糖,利于DNA樣品沉入點(diǎn)樣孔中2.含有電泳指示劑,以指示電泳的進(jìn)程上樣緩沖液:EB:溴化乙錠,可嵌入DNA分子中,受紫外光激發(fā)而發(fā)出熒光,利用它可檢測(cè)DNA。是誘變劑,可引起插入突變,并有中度毒性,操作時(shí)應(yīng)注意防護(hù)。操作時(shí)應(yīng)戴手套,盡量減少臺(tái)面污染。1000×貯存液(0.5mg/mL),使用時(shí)按1:1000稀釋配制染色液。質(zhì)粒電泳檢測(cè):一般有一至三條帶(質(zhì)粒DNA的三種構(gòu)型)超螺旋線型開環(huán)質(zhì)粒電泳檢測(cè)本科生試驗(yàn)圖片質(zhì)粒載體的抽提,外源DNA的準(zhǔn)備瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的質(zhì)量亞克隆載體與外源DNA的限制性內(nèi)切酶消化(目的片段的回收,亞克隆載體的去磷酸化)載體與外源DNA的連接感受態(tài)細(xì)胞的制備連接子轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞重組子的轉(zhuǎn)化及篩選、鑒定利用質(zhì)??寺⊥庠碊NA片段的主要步驟外源DNA克隆的要求特點(diǎn)不同的突出端用兩種限制酶消化后需純化質(zhì)粒以提高連接效率一般酶切位點(diǎn)可保留,非重組克隆背景低不需CIP處理外源DNA只以一個(gè)方向插入重組質(zhì)粒中相同的突出端線狀質(zhì)粒DNA常需用磷酸酶(CIP)處理一般酶切位點(diǎn)??杀A敉庠碊NA會(huì)以兩個(gè)方向插入重組質(zhì)??蓭в型庠碊NA的串聯(lián)拷貝末端為平端要求較高的DNA及連接酶不同酶切的平頭可連接非重組克隆的背景高質(zhì)粒及外源DNA連接處的酶切位點(diǎn)消失(不同平端酶)重組質(zhì)粒可能帶有外源DNA的串聯(lián)拷貝載體及外源片段的限制酶消化:限制性內(nèi)切酶切出相互匹配的粘性末端(一種酶)或不相匹配的粘性末端(不同酶消化)或平端;載體的去磷酸化:堿性磷酸酶去除載體的5’-P基團(tuán),以防載體自連;線狀載體與外源片段的連接:連接酶使雙鏈DNA5’-P與相鄰的3’-OH之間形成新的共價(jià)鍵,若質(zhì)粒載體的兩條鏈都帶有5’磷酸基團(tuán),則可形成4個(gè)新的磷酸二酯鍵,但如質(zhì)粒已去磷酸化,則只能形成2個(gè)新的磷酸二酯鍵,且產(chǎn)生的兩個(gè)雜交分子帶有2個(gè)單鏈切口,當(dāng)雜合體導(dǎo)入到感受態(tài)細(xì)胞后可被修復(fù)。限制性內(nèi)切酶堿性磷酸酶連接酶幾種工具酶有特定的識(shí)別序列,通常為4-6堿基的回文對(duì)稱序列。切割位點(diǎn)位于識(shí)別序列內(nèi)的固定位置上,切割后在5’末端有磷酸基團(tuán),3’末端有羥基。切割后形成粘性末端或平末端,前者又分為3’突出端(如PstI)和5’突出端(如EcoRI)兩種其活性發(fā)揮只需Mg2+作輔酶。II類限制性內(nèi)切酶的特點(diǎn)限制酶的一個(gè)活性單位(1U):原則上指在50μl反應(yīng)體系中,37℃下,經(jīng)過1小時(shí)的反應(yīng)將1μg的DNA完全分解所需要的酶量。限制酶的star活性:限制酶在極端非標(biāo)準(zhǔn)條件下使用時(shí)對(duì)底物DNA的特異性可能降低,即可將與原來識(shí)別的特定DNA序列不同的堿基序列切斷,這種現(xiàn)象叫限制酶的star活性。它的出現(xiàn)的頻率與酶、底物及反應(yīng)條件有關(guān)。高濃度的甘油(>5%);酶過量(>100U/ug);低離子強(qiáng)度(<25mM);高pH(>pH8.0);有機(jī)溶劑(DMSO,乙醇,乙二醇,二甲基乙酰胺;用其他二價(jià)陽離子代替Mg2+(Mn2+,Cu2+,Co2+,Zn2+)不同的酶對(duì)上述因素的敏感程度不同引起星星活性的主要因素:氯化鎂、氯化鈉/鉀、Tris鹽酸鹽、β-巰基乙醇或二硫蘇糖醇(DTT)牛血清白蛋白(BSA)典型的限制性內(nèi)切酶作用的緩沖體系成分包括:BamHI:
G▼GATTC CCTAA▲GKpnI: GGTAC▼C C▲CATGG含外源DNA片段的載體(M812)(50l反應(yīng)體系,用1.5mltube,冰上操作)
質(zhì)粒DNA
30lBamHI(10u/μl) 1lKpnI(10u/μl)
1l
10×buffer 5lddH2O 13l分別取5l酶切產(chǎn)物用0.8%-1.2%凝膠檢測(cè)酶切效果
50
lTotal目的載體(Puc19)的限制性內(nèi)切酶消化電泳檢測(cè)MarkerpUC19質(zhì)粒對(duì)照pUC19質(zhì)粒酶切產(chǎn)物M812質(zhì)粒對(duì)照M812質(zhì)粒酶切產(chǎn)物點(diǎn)樣順序:2011本科生酶切圖片
lane1-4,pUC19酶切產(chǎn)物L(fēng)ane5,pUC19質(zhì)粒Lane6,M812質(zhì)粒Lane7-10,M812酶切產(chǎn)物L(fēng)ane11,DL-2000
marker,1
11造成DNA酶切不完全的主要原因有:DNA不干凈,反應(yīng)體系中存在酶的抑制劑;操作不當(dāng),酶或DNA加至管壁上,反應(yīng)體系沒完全混合;反應(yīng)條件不合適,用錯(cuò)了緩沖液或溫度不合適;酶的活力不夠DNA樣品中抑制酶活的污染物主要有:DNA樣品中的蛋白質(zhì)、酚、氯仿、乙醇、EDTA、SDS、高濃度的鹽等均能抑制酶切活性解決辦法:增加酶作用的單位數(shù)(10-20U/μgDNA)增大反應(yīng)體積以稀釋可能的抑制劑延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間消化基因組DNA時(shí),加入終濃度1-2.5mmol/L多聚陽離子亞精胺可改善酶切效果,其作用是結(jié)合帶負(fù)電荷的污染物。純化DNA酶切反應(yīng)的終止加入終農(nóng)度為12.5mmol/L的EDTA以鰲合鎂離子而終止酶的反應(yīng)多數(shù)酶在65°C10分鐘可被不可逆滅活,少數(shù)65°C不失活的酶在75°C15分鐘也能失活若酶對(duì)熱具完全抗性,可通過酚抽提乙醇沉淀來純化pUC19酶切產(chǎn)物的純化:加入ddH2O150l(擴(kuò)大體積),加入200μl氯仿/異戊醇(24:1),顛倒混勻后離心10min;
吸出上清,加1/10體積3MNaAc和兩倍體積乙醇,-20℃放置15分鐘以上;12000rpm4℃冷凍離心15分鐘;倒去上清,用75%乙醇浸洗沉淀,風(fēng)干后溶于10lddH2O;
氯仿對(duì)眼睛、皮膚、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌劑并可損傷肝臟和腎臟,操作時(shí)需戴手套、安全鏡并在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。苯酚是強(qiáng)腐蝕劑,能引起嚴(yán)重?zé)齻?。操作時(shí)應(yīng)戴手套、安全鏡、穿防護(hù)服,并在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。注意當(dāng)一個(gè)體系中有多種DNA分子,而我們只需要其中的某種DNA時(shí)或者反應(yīng)體系中含有目的DNA子以外的其它分子如各種工具酶、dNTPs、引物及礦物油等時(shí),可以利用凝膠電泳分離各種DNA,然后挖膠回收目的DNA帶?;厥辗椒ㄖ饕校?/p>
1.低熔點(diǎn)瓊脂糖
2.透析帶電洗脫法
3.glassmilk純化
4.柱回收試劑盒DNA的回收純化:柱式DNA膠回收試劑盒操作步驟:1.通過瓊脂糖凝膠將目的DNA帶與載體帶分開;2.紫外燈下用干凈的刀片切下含目的DNA帶的膠塊放入1.5ml離心管中;(注意:不含DNA的膠盡可能切除,在長(zhǎng)波長(zhǎng)的紫外燈下切膠,并盡量縮短DNA暴露在紫外光下的時(shí)間)3.按400μl/100mg膠的比例加入BindingBufferII,50-60oC水浴中10分鐘,使膠融化,每2-3分鐘混勻一次;(注意若膠的濃度較大需增加BindingBufferII的比例、增加融膠的時(shí)間,若膠塊體積較大也需增加融膠的時(shí)間)4.將融化的膠溶液轉(zhuǎn)移到套放在2ml收集管內(nèi)的UNIQ-10柱中,放置2分鐘,8000rpm離心1分鐘;5.取下UNIQ-10柱,倒掉收集管內(nèi)的廢液,將UNIQ-10柱放入同一個(gè)收集管內(nèi),加入500μlWashSolution,8000rpm室溫離心1分鐘;6.重復(fù)5步一次,7.取下UNIQ-10柱,倒掉收集管內(nèi)的廢液,將UNIQ-10柱放入同一個(gè)收集管內(nèi),12000rpm室溫離心15秒;8.將UNIQ-10柱放入一個(gè)新的1.5ml離心管內(nèi),在柱子膜中央加40μlElutionBuffer或水(pH>7.0),室溫或37oC放置2分鐘;(提高洗脫溫度到55oC-80oC有利于提高DNA的洗脫效率)9.12000rpm室溫離心1分鐘,離心管中的溶液即為回收的DNA片段注意1.首次使用前,必須在WashSolution中加入4倍體積的無水乙醇,充分搖勻后使用,每次使用后將瓶蓋擰緊,以保持WashSolution中的乙醇含量。2.ElutionBuffer為2.0mmol/LTris-HCl,pH8.5.4oC保存。也可用PH8.0的TE或PH≥7.0的水代替。載體去磷酸化細(xì)菌堿性磷酸酶(BAP),牛小腸堿性磷酸酶(CIAP)以及小蝦堿性磷酸酶(SAP)都能催化磷酸單脂鍵的水解(包括DNA、RNA、dNTP和NTP上的5’-磷酸殘基),不能催化磷酸三脂的水解。比較而言,CIAP的活性比BAP的高10-20倍,CIAP經(jīng)加熱處理,容易失活但不能完全失活,若要使酶完全失活,不論是BAP還是CIAP還需要經(jīng)苯酚處理。而SAP經(jīng)65?C加熱15分鐘就可完全失活。活性定義:在37?C、pH9.8的條件下,1分鐘內(nèi)水解對(duì)硝基苯磷酸鹽(ρ-nitrophenylphosphate)生成1μM的對(duì)硝基苯(ρ-nitrophenol)所需的酶量定義為1個(gè)活性單位(U).堿性磷酸酶載體去磷酸化反應(yīng)體系:DNA 20lCIAP(TaKaRa) 0.5l10buffer 4.0lddH2O 15.5l37℃
或50℃反應(yīng)30min以上
Total40l去磷酸化載體的純化加0.4l0.5M的EDTA(終濃度5mM),75℃水浴10min,使CIAP失活;加入ddH2O150l(擴(kuò)大體積),加入等體積苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),顛倒混勻后離心10min;
吸出上清,加1/10體積3MNaAc和兩倍體積乙醇,-20℃放置15分鐘以上;12000rpm4℃冷凍離心15分鐘;倒去上清,用75%乙醇浸洗沉淀,風(fēng)干后溶于10lddH2O(0.5mltube中)載體與外源DNA片段的連接連接酶使雙鏈DNA5’-P與相鄰的3’-OH之間形成新的共價(jià)鍵,若質(zhì)粒載體的兩條鏈都帶有5’磷酸基團(tuán),則可形成4個(gè)新的磷酸二酯鍵,但如質(zhì)粒已去磷酸化,則只能形成2個(gè)新的磷酸二酯鍵,且產(chǎn)生的兩個(gè)雜交分子帶有2個(gè)單鏈切口,當(dāng)雜合體導(dǎo)入到感受態(tài)細(xì)胞后可被修復(fù)。大腸桿菌連接酶T4噬菌體連接酶。連接酶各種連接酶特性的比較:T4DNALigase
E.coliDNALigaseT4RNALigaseLigasesofthermophilicbacteria最適pH輔酶7.2-7.8ATP7.5-8.0NAD7.2-8.4ATPNAD平滑末端可能*不能NODNA5’P末端和RNA3’OH末端可能可能不能NORNA5’P末端和DNA3’OH末端可能不能不能NORNA和RNA少數(shù)可能不能可能NO外源DNA 4l目的載體DNA 4l10buffer 1lT4ligase(1U/l) 1l
連接反應(yīng)體系:16oC水浴保溫過夜Total10l感受態(tài)細(xì)胞的制備及質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)化是指將質(zhì)粒或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入細(xì)菌的過程。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞中,實(shí)現(xiàn)重組克隆的增殖,便于后續(xù)分子操作??梢圆捎枚喾N方法篩選和鑒定目的克隆。
感受態(tài)細(xì)胞的制備體外連接的DNA重組分子導(dǎo)入合適的受體細(xì)胞才能大量增殖。為了提高受體菌攝取外源DNA的能力,提高轉(zhuǎn)化效率以獲得更多的轉(zhuǎn)化子,人們摸索出了不同的方法處理細(xì)菌,使其處于感受態(tài)。目前主要采用電轉(zhuǎn)化法和CaCl2法將外源DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞中,因此需要相應(yīng)地制備電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞和CaCl2感受態(tài)細(xì)胞。將外源DNA導(dǎo)入大腸桿菌主要有兩種方法:CaCl2法:利用冰冷的CaCl2處理對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞,可以誘導(dǎo)其產(chǎn)生短暫的“感受態(tài)”,易于攝取外源DNA。106~107轉(zhuǎn)化子/gDNA。電轉(zhuǎn)化法:利用瞬間高壓在細(xì)胞上打孔。因而需用冰冷的超純水多次洗滌處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)前期的細(xì)胞,以使細(xì)胞懸浮液中應(yīng)含有盡量少的導(dǎo)電離子。109~1010轉(zhuǎn)化子/gDNA;所有操作均應(yīng)在無菌條件和冰上進(jìn)行;所使用的器皿必須干凈。跡量的去污劑或其它化學(xué)物質(zhì)的存在可能大大降低細(xì)菌的轉(zhuǎn)化效率。操作注意事項(xiàng)前夜接種受體菌(DH5),挑取單菌落于LB培養(yǎng)基中37℃搖床培養(yǎng)過夜(約16小時(shí));取1ml過夜培養(yǎng)物于100ml添加有20mMMgCl2的LB培養(yǎng)基中,在37℃搖床上劇烈振蕩培養(yǎng)約2.5-3小時(shí)(300rpm);將0.1MCaCl2溶液置于冰上預(yù)冷;以下步驟需在超凈工作臺(tái)和冰上操作吸取1.5ml培養(yǎng)好的菌液至1.5ml離心管中,在冰上冷卻10分鐘;CaCl2感受態(tài)細(xì)胞的制備(一)4℃下4000rpm冷凍離心10分鐘;棄去上清,加入100l預(yù)冷0.1MCaCl2溶液,用移液槍輕輕上下吸動(dòng)打勻,使細(xì)胞重新懸浮,在冰放置20分鐘;4℃下4000rpm冷凍離心10分鐘;棄去上清,加入100l預(yù)冷0.1MCaCl2溶液,用移液槍輕輕上下吸動(dòng)打勻,使細(xì)胞重新懸浮,4℃下4000rpm冷凍離心10分鐘;棄去上清,加入20l預(yù)冷0.1MCaCl2溶液,用移液槍輕輕上下吸動(dòng)打勻,使細(xì)胞重新懸?。患?xì)胞懸浮液可立即用于轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),48小時(shí)內(nèi)使用,可以暫時(shí)保存在4℃.長(zhǎng)時(shí)間保存,需添加冷凍保護(hù)劑(15%~20%甘油)后超低溫冷凍貯存?zhèn)溆茫ǎ?0℃)。CaCl2感受態(tài)細(xì)胞的制備(二)操作注意事項(xiàng)
密切注視細(xì)菌的生長(zhǎng)狀態(tài)和密度,盡量使用對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞(一般通過檢測(cè)OD600來控制。DH5菌株OD600為0.5時(shí)細(xì)胞密度是5×107/ml);所有操作均應(yīng)在無菌條件和冰上進(jìn)行;所使用的器皿必須干凈。跡量的去污劑或其它化學(xué)物質(zhì)的存在可能大大降低細(xì)菌的轉(zhuǎn)化效率。轉(zhuǎn)化步驟
制備選擇性培養(yǎng)基平板:在融化的250mlLA培養(yǎng)基中250lAmp,250lX-gal,25lIPTG,混勻后倒入滅菌培養(yǎng)皿中;取出3管制備好的感受態(tài)細(xì)胞,放在冰上融化;3管感受態(tài)細(xì)胞分別加DNA連接產(chǎn)物、標(biāo)準(zhǔn)超螺旋質(zhì)粒DNA(陽性對(duì)照)及不加入任何DNA(陰性對(duì)照),用移液器輕輕吸打均勻,在冰上放置30分鐘;熱擊:將離心管放置42℃水浴,熱擊90秒,注意:勿搖動(dòng)離心管;冰鎮(zhèn):快速將離心管轉(zhuǎn)移至冰浴,放置1-2分鐘;復(fù)蘇:每管加400lSOC培養(yǎng)基,在37℃搖床溫和搖動(dòng)溫育45分鐘,使細(xì)菌復(fù)蘇;布皿:取適當(dāng)體積均勻涂布于含有IPTG、X-gal、抗生素(Amp)的LA平板;培養(yǎng):倒置培養(yǎng)皿,于37℃培養(yǎng)12-16小時(shí)
即可觀察到藍(lán)白相間的菌落(其中白色菌落為含有外源插入片段的轉(zhuǎn)化子,藍(lán)色菌落是載體自連的轉(zhuǎn)化子)注意:利用氨芐青霉素抗性篩選轉(zhuǎn)化子時(shí),轉(zhuǎn)化細(xì)胞鋪平板的密度要低(90mm平板上不得超過105個(gè)菌落),同時(shí)37℃培養(yǎng)不應(yīng)超過20小時(shí),具氨芐青霉素抗性的轉(zhuǎn)化體可將-內(nèi)酰胺酶分泌到培養(yǎng)基中,迅速滅活菌落周圍的抗生素,從而導(dǎo)致對(duì)氨芐青霉素敏感的衛(wèi)星菌落的出現(xiàn)。電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞的制備(一)前夜接種受體菌(DH5),挑取單菌落于LB培養(yǎng)基中37℃搖床培養(yǎng)過夜(約16小時(shí));取1ml過夜培養(yǎng)物于100mlLB培養(yǎng)基中,在37℃搖床上劇烈振蕩培養(yǎng)約2.5-3小時(shí)(300rpm);將菌液迅速置于冰上,同時(shí)10%的甘油置于冰上預(yù)冷;以下步驟需在超凈工作臺(tái)和冰上操作吸取1.5ml培養(yǎng)好的菌液至1.5ml離心管中,在冰上冷卻10分鐘;4℃下3000g低溫離心5-10分鐘;電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞的制備(二)棄去上清,加入1500l預(yù)冷的10%的甘油,用移液器輕輕上下吸動(dòng)打勻,使細(xì)胞重新懸浮;4℃下3000g低溫離心5-10分鐘;棄去上清,加入750l預(yù)冷預(yù)冷的10%的甘油,用移液器輕輕上下吸動(dòng)打勻,使細(xì)胞重新懸浮;4℃下3000g低溫離心5-10分鐘;棄去上清,加入20l預(yù)冷預(yù)冷的10%的甘油,用移液槍輕輕上下吸動(dòng)打勻,使細(xì)胞重新懸浮超低溫冷凍貯存?zhèn)溆茫ǎ?0℃)。使用的培養(yǎng)基最好用NaCl減半的LB培養(yǎng)基;密切注視細(xì)菌的生長(zhǎng)狀態(tài)和密度,盡量使用對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞(一般通過檢測(cè)OD600來控制。DH5菌株OD600為0.5時(shí)細(xì)胞密度是5×107/ml);制備感受態(tài)細(xì)胞及配制試劑所用的水應(yīng)達(dá)到18MΩ,即使用超純水;化學(xué)試劑應(yīng)是分子生物學(xué)級(jí);所使用的槍頭和器皿都應(yīng)是新的,干凈無菌的;無菌操作;低溫(冰上)進(jìn)行。操作注意事項(xiàng)——特別控制鹽離子的殘留影響電轉(zhuǎn)化效率的因素細(xì)胞的生長(zhǎng)狀
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