分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)成員第5小組夏昕日期_第1頁(yè)
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:學(xué)號(hào) 專業(yè):08基礎(chǔ)醫(yī)實(shí)驗(yàn)成員:第5小組///實(shí)驗(yàn)日期細(xì)胞組DNA的及其濃度測(cè)本實(shí)驗(yàn)以實(shí)驗(yàn)五所HL60細(xì)胞組DNA為模板,以c-myc上一329bpPCRPCRDNA補(bǔ)的寡核苷酸引物。PCR由變性、退火和延3DNA下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;DNA(復(fù)性模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;引物的延伸:DNA模板TaqDNA以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基下次循環(huán)的模板,使產(chǎn)物DNA的量按2的n槽,電泳儀,紫外觀察儀,200mlPCR器材:0.2ml,PCR(ABI樣槍及槍頭等。1)模板DNA:為HL60細(xì)胞組總22×EsMg2+、dNTPsPCR2x。預(yù)配好的PCR混合液使操作更加簡(jiǎn)單快捷,可最大限度地減少人為誤差和污染。獨(dú)創(chuàng)的MasterMix配方使整個(gè)反應(yīng)體系非常穩(wěn)定,重復(fù)性好。含的2xEsTaqMasterMixPCR1(100μmol/L2(100μmol/L1×TAE:0.04mol/LTris-乙酸;0.001 Agarose1.2g60mLTAE2%mg/ml0.2mlPCR2×EsTaq10Primer10.5Primer2(10μ0.5Template(0.50.520PCR94℃6057℃退火30 30個(gè)循72℃3072℃5PCR105℃配制2%的Agarose凝膠稱取1.2gAgarose放入200mL三角燒瓶中,60mLTAE55℃時(shí)加入溴化乙啶溶液3μL,0.5μg/mL。澆板(用薄梳子,水平放置,待凝。10μLPCR8μLDNAMarkerⅠ作為都必須經(jīng)過(guò)高壓蒸汽;PCR注意加樣順序:ddH2O、2×mixDNA,DNAPCR中,Taq酶在92.5℃和97.5℃其保持時(shí)間分別為180min和5-6min。95℃35min,PCR95℃;本組(5組)marker300-400bp329kbPCR假,不出現(xiàn)擴(kuò)增條PCR反應(yīng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有①模板核酸的②引物的質(zhì)量與特異性③酶質(zhì)量,④PCR模板:①模板中含有雜蛋白質(zhì),②模板中含有Taq酶抑制劑,③模板中蛋白失或不夠而導(dǎo)致假需注意的是有時(shí)PCR時(shí)忘了加Taq酶或電泳時(shí)忘了加溴PCRODPCRMg2+濃度:Mg2+PCRPCR擴(kuò)增的特異性濃度過(guò)低則影響PCR擴(kuò)增產(chǎn)量甚至使PCR擴(kuò)增失敗而不出擴(kuò)增條PCR20μl、30μl、50μl定,在做小體積如20μl后,再做大體積時(shí),一定要重新摸索條件,否則容易失極有可能出現(xiàn)假;退火溫度過(guò)低,可導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增而降低特異性擴(kuò)增效PCRPCRPCRPCRPCR擴(kuò)增時(shí),擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容靶序列或擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個(gè)組或大片段的交叉污染,導(dǎo)致假陽(yáng)性。這種假陽(yáng)性可用以下方法解決:①操作時(shí)應(yīng)物質(zhì)外所有試劑或器材均應(yīng)高壓所用離心管及進(jìn)樣槍頭均應(yīng)使用拼接,與引物互補(bǔ)后,可擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物,而導(dǎo)致假陽(yáng)性的產(chǎn)生,可用巢式PCRPCR性擴(kuò)增帶與非特異性擴(kuò)增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補(bǔ)、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過(guò)高、退火溫度過(guò)PCRPCR或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過(guò)高,Mg2+濃度過(guò)高,退火溫度過(guò)低,循環(huán)次數(shù)過(guò)多dNTPMg2+本次實(shí)驗(yàn)中,本組結(jié)果出現(xiàn)了圖上所顯示的片狀條帶,我有以下推斷因組DNA,純度并不如人意,A260/A280=1.70<1.8; 實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中,MIXPCRPCRPCRPCRPCRPCR主要是樣品DNA交叉污染。提取DNA使用的儀器上殘留的雜質(zhì)DNA或反應(yīng)管中殘留的PCR產(chǎn)物、PCR操作

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