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從生物樣品中分離純化生物大分子第一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日概述1.課題研究背景2.課題研究?jī)?nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)3.課題技術(shù)路線4.儀器及試劑5.前期研究基礎(chǔ)或預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果第二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日概述1.課題研究背景2.課題研究?jī)?nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)3.課題技術(shù)路線4.儀器及試劑5.前期研究基礎(chǔ)或預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果第三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日1.課題研究背景生物大分子是指生物體內(nèi)廣泛的活性物質(zhì),分子量上千上萬(wàn)甚至更大,多數(shù)生物大分子為多聚體。由簡(jiǎn)單有機(jī)化合物聚合而成。20世紀(jì)以來(lái),生物化學(xué)、分子生物學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)生物迅猛發(fā)展,實(shí)驗(yàn)室里生物大分子的合成進(jìn)步速度可觀。大分子的分離純化與鑒定一直以來(lái)是生物化學(xué)研究的基礎(chǔ),是生物化學(xué)工作者的重要基本功。生物大分子廣泛存在于機(jī)體的各類組織中,以蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)、多糖為主。諸多生物大分子合成分離和純化已經(jīng)從實(shí)驗(yàn)室走向工廠化,因此生物大分子的相關(guān)技術(shù)尤為重要。第四頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日概述1.課題研究背景2.課題研究?jī)?nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)3.課題技術(shù)路線4.儀器及試劑5.前期研究基礎(chǔ)或預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果第五頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日2.課題研究?jī)?nèi)容1.從生物樣品中分離純化生物大分子2.利用分離純化生物大分子方法從肝組織中提取分離鑒定一種酶(該酶含三個(gè)大小不同亞基,pI=6.2。)第六頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日創(chuàng)新點(diǎn)對(duì)該酶的特性結(jié)果及分子量不明確,無(wú)法利用分子量差異分離,但可以利用其等電點(diǎn)完成分離。鑒定過(guò)程中利用SDS電泳技術(shù)可以鑒定亞基情況是否是符合要求。第七頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日概述1.課題研究背景2.課題研究?jī)?nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)3.課題技術(shù)路線4.儀器及試劑5.前期研究基礎(chǔ)或預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果第八頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.課題技術(shù)路線(一)從生物樣品中分離純化生物大分子方法1.提取對(duì)象選擇2.制定提取方案3.文獻(xiàn)查閱和前期預(yù)備性實(shí)驗(yàn)4.生物材料處理5.生物大分子提取方法第九頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日1.提取對(duì)象選擇:確定細(xì)胞內(nèi)目標(biāo)分子的種類,和目標(biāo)分子的位置。2.制定提取方案:確定一套能夠確定完善分離高純度目標(biāo)分子的方法。3.文獻(xiàn)查閱和前期預(yù)備性實(shí)驗(yàn):通過(guò)文獻(xiàn)資料掌握四種分子理化性質(zhì),完善計(jì)劃,確定分離途徑、第十頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日4.生物材料的處理:生物大分子來(lái)源通常為生物組織或微生物菌落,首先需要破碎組織。4.1機(jī)械法:1)研磨:將剪碎的動(dòng)物組織置于研缽或勻漿器中,加入少量石英砂研磨或勻漿。2)組織搗碎器:這是一種較劇烈的破碎細(xì)胞的方法,通??上扔眉矣檬称芳庸C(jī)將組織打碎,然后再用10000r/min~20000r/min的內(nèi)刀式組織搗碎機(jī)(即高速分散器)將組織的細(xì)胞打碎。(植物微生物)第十一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日4.2物理法:1)反復(fù)凍融法:將待破碎的細(xì)胞冷至-15℃到-20℃,然后放于室溫(或40℃)迅速融化,如此反復(fù)凍融多次,由于細(xì)胞內(nèi)形成冰粒使剩余胞液的鹽濃度增高而引起細(xì)胞溶脹破碎。2)超聲波處理法:此法是借助超聲波的振動(dòng)力破碎細(xì)胞壁和細(xì)胞器。破碎微生物細(xì)菌和酵母菌時(shí),時(shí)間要長(zhǎng)一些。3)壓榨法:這是一種溫和的、徹底破碎細(xì)胞的方法。在1000×105Pa~2000×105Pa的高壓下使細(xì)胞懸液通過(guò)一個(gè)小孔突然釋放至常壓,細(xì)胞將徹底破碎。4)冷熱交替法:從細(xì)菌或病毒中提取蛋白質(zhì)和核酸時(shí)可用此法。在90℃左右維持?jǐn)?shù)分鐘,立即放入冰浴中使之冷卻,如此反復(fù)多次,絕大部分細(xì)胞可以被破碎。第十二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日4.3化學(xué)與生物化學(xué)方法:1)自溶法:將新鮮的生物材料存放于一定的pH和適當(dāng)?shù)臏囟认?,?xì)胞結(jié)構(gòu)在自身所具有的各種水解酶(如蛋白酶和酯酶等)的作用下發(fā)生溶解,使細(xì)胞內(nèi)含物釋放出來(lái)。2)溶脹法:細(xì)胞膜為天然的半透膜,在低滲溶液和低濃度的稀鹽溶液中,由于存在滲透壓差,溶劑分子大量進(jìn)入細(xì)胞,將細(xì)胞膜脹破釋放出細(xì)胞內(nèi)含物。3)酶解法:利用各種水解酶,如溶菌酶、纖維素酶、蝸牛酶和酯酶等,于37℃,pH8,處理15分鐘,可以專一性地將細(xì)胞壁分解。4)有機(jī)溶劑處理法:利用氯仿、甲苯、丙酮等脂溶性溶劑或SDS(十二烷基硫酸鈉)等表面活性劑處理細(xì)胞,可將細(xì)胞膜溶解,從而使細(xì)胞破裂,此法也可以與研磨法聯(lián)合使用。第十三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5.生物大分子提取方法5.1.核酸的分離純化分離純化原則:(1)
保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性
意義:遺傳信息全部?jī)?chǔ)存在一級(jí)結(jié)構(gòu)之中,核酸的—級(jí)結(jié)構(gòu)還決定其高級(jí)結(jié)構(gòu)的形式以及和其他生物大分子結(jié)合的方式。
具體原則:溫度不要過(guò)高;控制pH值范圍(pH值5-9);保持一定離子強(qiáng)度;減少物理因素對(duì)核酸的機(jī)械剪切力。(2)
防止核酸生物降解DNA酶抑制劑:金屬離子螯合劑;陰離子型表面活性劑RNA酶抑制劑:皂土;DEPC(二乙基焦碳酸鹽);肝素;復(fù)合硅酸鹽;RNase阻抑蛋白;氧釩核糖核苷復(fù)合物第十四頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5.1.2分離純化的步驟:(1)去除雜質(zhì):生物樣品內(nèi)常含有大量多糖,脂質(zhì),蛋白質(zhì)等雜志,利用物理或化學(xué)方法將其除去。(2)濃縮:常用沉淀的方法。其好處是:改變核酸的溶解緩沖液;重新調(diào)整核酸的濃度;去除溶液中某些鹽離子與雜質(zhì)。(3)測(cè)定:一般選用紫外分光光度法或溴乙錠熒光法測(cè)定核酸的含量。(4)保存:目標(biāo)核酸的保存處理第十五頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5.2脂質(zhì)的分離純化(1)先配制氯仿/甲醇=2/1(v/v),取組織按1:20的量和氯仿/甲醇一起組織均漿,分層后在室溫下在搖床中搖動(dòng)15-20分鐘。(2)均漿通過(guò)濾紙過(guò)濾或者離心獲得液體。(3)在離心獲得的液體中加入0.2倍體積的水或者0.9%的生理鹽水,渦旋幾秒鐘混均,然后2000rpm離心得到兩相溶液,如果需要的話用甲醇/水(1/1)的將兩相界面洗一到兩次,洗的過(guò)程不要讓甲醇/水與下層混合。(4)通過(guò)離心和虹吸去掉上層后,下層氯仿相含有脂質(zhì),如果體積在2-3ml以下則通過(guò)真空旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)器或在氮?dú)庀聺饪s。(5)二氯甲烷可以替代氯仿,結(jié)果表明二氯甲烷/甲醇能夠取代氯仿/甲醇,因此能夠避免氯仿帶來(lái)的健康、安全和管理問(wèn)題。第十六頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5.3糖的分離純化5.3.1單雙糖的分離:常見(jiàn)的單、雙糖一般采用合成的方式。制備如下:脫脂→去雜→濃縮→再次去雜→脫色→濃縮→冷卻→結(jié)晶(→進(jìn)一步純化)。5.3.2多糖的分離純化:脫脂:由于多糖被脂質(zhì)包圍,通常用醇或醚回流脫脂。提?。簾崴岱?,微波輔助提取法,超聲輔助法,索氏提取法,醇提法,其它方法(如稀堿液浸提法、稀酸液浸提法、酶法等)除雜:去除混有的蛋白質(zhì)細(xì)胞色素等。純化:分部沉淀法,鹽析法,季銨鹽沉淀法,柱層析,制備性區(qū)域電泳,膜分離法,金屬絡(luò)合物法,其它方法(如超過(guò)濾法、活性炭柱色譜、LKB柱色譜系統(tǒng)等)第十七頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5.4蛋白質(zhì)的分離純化5.4.1前處理:破壞生物樣品組織,保證蛋白質(zhì)不失活下完成。粗分級(jí):選用一套適當(dāng)方法,把蛋白質(zhì)混合物提取液中,所要的蛋白質(zhì)與其他雜蛋白質(zhì)分離開(kāi)來(lái)。細(xì)分級(jí):樣品進(jìn)一步提純進(jìn)一步分離優(yōu)化:將蛋白精細(xì)分離開(kāi)來(lái)。常用有沉淀,離心。電泳。層析。5.4.5濃縮:常用減壓蒸餾法,空氣流動(dòng)蒸發(fā)蒸餾法,冰凍法,吸收法,超濾法提純。5.4.6干燥與保存:保證蛋白質(zhì)活性下將其干燥保存。第十八頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.課題技術(shù)路線(二)從肝組織中提取一種酶2.1.生物樣品的選擇2.2生物樣品處理2.3.具體檢測(cè)方法2.4.數(shù)據(jù)處理2.5.質(zhì)量控制方法第十九頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日1.生物樣品的選擇:健康2月齡wistar大鼠原理:由于肝臟內(nèi)酶常和脂類或者糖結(jié)合,故應(yīng)將實(shí)驗(yàn)動(dòng)物饑餓24h處理。保證肝內(nèi)酶的活性和減少不必要雜質(zhì)。第二十頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日2.生物樣品處理:2.1大鼠饑餓24h后處死,分離肝臟組織,切碎,勻漿處理,用32層紗布過(guò)濾得到勻漿液。2.2蛋白酶活性抑制:用苯甲基磺酰氟(PMSF)抑制蛋白酶活性,防止目標(biāo)酶水解。原理:細(xì)胞內(nèi)蛋白酶活性較強(qiáng),PMSF可和蛋白酶結(jié)合不破壞蛋白酶結(jié)構(gòu),防止細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)水解第二十一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日2.3去除核酸:原理:細(xì)胞內(nèi)含有大量核酸,會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。除核酸的常用方法是沉淀法,沉淀劑的選擇需要大量的試驗(yàn)來(lái)選定,已知的有1%~2%的鏈霉素硫酸鹽、PEG、溶菌酶等。這里選用鏈霉素硫酸鹽。第二十二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日2.3去除核酸:1%-2%鏈霉素硫酸鹽,沉淀去除核酸。第二十三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.1勻漿液的分離:原理:目標(biāo)酶位置未知,假設(shè)存在于基質(zhì)、線粒體、酶體三個(gè)位置,利用差速離心法分離取不同亞細(xì)胞組分。第二十四頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.1勻漿液的分離:組分的分離:取勻漿液1.5ml在4℃下12000r/min離心15min,EP管內(nèi)液面分三層,分別取中、下層。亞細(xì)胞組分的分離:(1)離心管加0.5ml0.34mol/L蔗糖,下層液體0.5ml輕輕覆蓋在上面,1600r/min離心10min,得到上清①。(2)沉淀加1ml0.25mol/L蔗糖混勻,3500r/min離心10min,得到上清②(3)上清①②混合為線粒體及酶體懸浮液。3.1.2亞細(xì)胞組分處理:用超聲破碎儀破碎處理線粒體及酶體懸浮液。第二十五頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.2目標(biāo)酶的初步提取:
原理:提取酶的方法有多種,但因?yàn)槊傅男再|(zhì)未知,故使用能分離酶且不損傷酶活性的鹽析法。鹽析法:中性鹽能破壞蛋白分子的表面電荷使蛋白質(zhì)聚沉析出。透析法:析出蛋白質(zhì)因含有大量鹽離子影響純化,故有半透膜透析,離子可以離開(kāi)半透膜,而蛋白質(zhì)分子不可以。第二十六頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.2目標(biāo)酶的初步提?。?.2.1提取液配置:飽和硫酸銨溶液調(diào)節(jié)PH值至6.2,將酶溶液與提取液混勻。3.2.2酶的提取:將混合液于離心機(jī)3000r/min離心10min,取沉淀物加緩沖溶液溶解,將溶液放入透析袋透析至不再有離子析出。第二十七頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.3目標(biāo)酶的分離純化:原理:DEAE-纖維素為二乙氨乙基纖維素,是陰離子交換劑。
其原理基于離子交換層析:離子交換層析中,基質(zhì)是由帶有電荷的樹(shù)脂或纖維素組成。
由于蛋白質(zhì)也有等電點(diǎn),當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)處于不同的pH條件下,其帶電狀況也不同。陰離子交換基質(zhì)結(jié)合帶有負(fù)電荷的蛋白質(zhì),所以這類蛋白質(zhì)被留在柱子上,然后通過(guò)提高洗脫液中的鹽濃度等措施,將吸附在柱子上的蛋白質(zhì)洗脫下來(lái)。結(jié)合較弱的蛋白質(zhì)首先被洗脫下來(lái)。反之陽(yáng)離子交換基質(zhì)結(jié)合帶有正電荷的蛋白質(zhì),結(jié)合的蛋白可以通過(guò)逐步增加洗脫液中的鹽濃度或是提高洗脫液的pH值洗脫下來(lái)。第二十八頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.3目標(biāo)酶的分離純化:(1)取DEAE-纖維素,調(diào)節(jié)PH至6.3,進(jìn)行裝柱平衡,用乙酸銨進(jìn)行第一次洗脫。同時(shí)用磺基水楊酸進(jìn)行檢測(cè),收集第二個(gè)峰的組分。(2)回收DEAE-纖維素,調(diào)節(jié)PH至6.1,再次裝柱平衡,上(1)取得樣品,洗脫,收集第一個(gè)峰的組分。第二十九頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3.4目標(biāo)酶的鑒定:取目標(biāo)酶提取液,進(jìn)行SDS電泳檢測(cè)。(1)樣品煮沸10-15min(2)制電泳膠(3)上樣(4)電泳(5)0.25%考馬斯亮藍(lán)R250染色10-15min(6)脫色處理(7)若出現(xiàn)三個(gè)條帶則確定為目標(biāo)酶,若無(wú)則取線粒體和酶體提取液,如重復(fù)3過(guò)程。第三十頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日4.數(shù)據(jù)處理:根據(jù)MARKER計(jì)算蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量。由于蛋白質(zhì)為三個(gè)亞基組成,三個(gè)亞基質(zhì)量和即為蛋白質(zhì)質(zhì)量。SDS電泳分別得到三個(gè)亞基質(zhì)量,即可得到蛋白質(zhì)分子量。第三十一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5.質(zhì)量控制方法:5.1控制樣品分析5.2比對(duì)第三十二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日概述1.課題研究背景2.課題研究?jī)?nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)3.課題技術(shù)路線4.儀器及試劑5.前期研究基礎(chǔ)或預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果第三十三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日4.儀器和試劑試劑:PBS溶液、1%-2%鏈霉素硫酸鹽、苯甲基磺酰氟、飽和硫酸銨溶液、氨水、硫酸、乙酸、蔗糖、磺基水楊酸、DEAE-纖維素、30%PEAG,1.5mol/LTris-HCl(PH8.8),1.9mol/LTris-HCl(PH6.8),5X電泳緩沖液、100g/L過(guò)硫酸銨溶液,四甲基乙二胺,0.25%考馬斯亮藍(lán),脫色液。儀器:試管、超速離心機(jī)、常速離心機(jī)、透析袋、電磁攪拌器、蠕動(dòng)泵、玻璃層
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