標(biāo)準(zhǔn)解讀
《GB/T 38481-2020 微生物超低頻突變測(cè)定 雙重測(cè)序法》是一項(xiàng)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn),旨在提供一種準(zhǔn)確檢測(cè)微生物中發(fā)生的超低頻率突變的方法。該標(biāo)準(zhǔn)詳細(xì)描述了如何通過(guò)雙重測(cè)序技術(shù)來(lái)識(shí)別和量化這些罕見(jiàn)的基因變異。
在標(biāo)準(zhǔn)文件中,首先定義了一些關(guān)鍵術(shù)語(yǔ),比如“超低頻突變”指的是在群體中的發(fā)生率低于常規(guī)測(cè)序方法檢測(cè)限值(通常為<0.1%)的遺傳變化。“雙重測(cè)序”則是一種能夠提高檢測(cè)靈敏度的技術(shù)手段,它通過(guò)兩次獨(dú)立地對(duì)同一DNA片段進(jìn)行測(cè)序,并比較結(jié)果來(lái)發(fā)現(xiàn)其中存在的差異點(diǎn),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)極低豐度突變體的有效捕捉。
接著,《GB/T 38481-2020》規(guī)定了一系列實(shí)驗(yàn)操作步驟,包括樣本準(zhǔn)備、文庫(kù)構(gòu)建、高通量測(cè)序以及數(shù)據(jù)分析等過(guò)程。特別強(qiáng)調(diào)了在整個(gè)流程中需要采取嚴(yán)格的質(zhì)量控制措施以確保數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性與可靠性。例如,在樣本處理階段要求使用無(wú)菌技術(shù)和條件;文庫(kù)制備時(shí)需注意避免交叉污染;而在數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié),則推薦采用特定算法過(guò)濾掉可能由測(cè)序錯(cuò)誤或PCR擴(kuò)增偏倚引起的人工變異信號(hào)。
此外,該標(biāo)準(zhǔn)還提出了針對(duì)不同應(yīng)用場(chǎng)景下選擇合適對(duì)照品的重要性,以及如何合理設(shè)置實(shí)驗(yàn)參數(shù)以優(yōu)化檢測(cè)效率等方面的指導(dǎo)建議。通過(guò)遵循這些建議,研究者可以獲得更精確的結(jié)果,進(jìn)而支持科學(xué)研究或臨床應(yīng)用中對(duì)于微生物遺傳多樣性的深入理解。
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....
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- 現(xiàn)行
- 正在執(zhí)行有效
- 2020-11-19 頒布
- 2020-11-19 實(shí)施
文檔簡(jiǎn)介
ICS07080
A21.
中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)
GB/T38481—2020
微生物超低頻突變測(cè)定雙重測(cè)序法
Determinationofultralow-frequencymutationsformicroorganisms—
Duplexsequencing
2020-11-19發(fā)布2020-11-19實(shí)施
國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局發(fā)布
國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)
中華人民共和國(guó)
國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)
微生物超低頻突變測(cè)定雙重測(cè)序法
GB/T38481—2020
*
中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)出版社出版發(fā)行
北京市朝陽(yáng)區(qū)和平里西街甲號(hào)
2(100029)
北京市西城區(qū)三里河北街號(hào)
16(100045)
網(wǎng)址
:
服務(wù)熱線
:400-168-0010
年月第一版
202011
*
書(shū)號(hào)
:155066·1-63938
版權(quán)專有侵權(quán)必究
GB/T38481—2020
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
本標(biāo)準(zhǔn)由中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化研究院提出并歸口
。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位清華大學(xué)洛陽(yáng)華清天木生物科技有限公司江漢大學(xué)中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化研究院
:、、、。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人張翀邢新會(huì)李梅剪興金王立言郭肖杰張樂(lè)樂(lè)彭海馬愛(ài)進(jìn)
:、、、、、、、、。
Ⅰ
GB/T38481—2020
微生物超低頻突變測(cè)定雙重測(cè)序法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了用雙重測(cè)序法測(cè)定微生物超低頻突變的方法
。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于微生物基因組或基因片段超低頻突變的測(cè)定
。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文
。,
件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件
。,()。
分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB/T6682
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件
。
31
.
超低頻突變ultralow-frequencymutations
化學(xué)物理或生物因素導(dǎo)致微生物發(fā)生的頻率低于-5的永久性改變
、DNA1×10。
32
.
條形碼標(biāo)簽barcodelabel
接在待測(cè)片段兩側(cè)的核苷酸片段用以標(biāo)示同一擴(kuò)增家族的協(xié)助進(jìn)行突變位點(diǎn)的
DNA,DNA,
確認(rèn)
。
33
.
互補(bǔ)標(biāo)簽家族complementarytagfamily
所有含兩端互補(bǔ)條形碼標(biāo)簽的片段
DNA。
34
.
雙鏈同源序列double-strandconsensussequencesDCSs
;
帶有相同條形碼標(biāo)簽的雙鏈序列包含反向互補(bǔ)鏈
DNA,。
4原理
在待測(cè)片段兩端接上一段隨機(jī)且互補(bǔ)的雙鏈核苷酸條形碼標(biāo)簽然后對(duì)所有帶有條形
DNA12nt,
碼標(biāo)簽的序列進(jìn)行雙重的高通量測(cè)序利用隨機(jī)互補(bǔ)標(biāo)簽排除掉測(cè)序文庫(kù)制備過(guò)程中所引入
。12nt,
的突變進(jìn)而準(zhǔn)確檢測(cè)突變位點(diǎn)和突變率
,。
5試劑
除非另有規(guī)定僅使用分析純?cè)噭?/p>
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