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畢赤酵母表達(dá)實驗手冊大腸桿菌表達(dá)統(tǒng)最突出的優(yōu)點是藝簡單、產(chǎn)量高、產(chǎn)成本低。然而,多蛋白質(zhì)在翻后,需經(jīng)過翻譯后修飾加工,如磷酸、糖基化、酰胺化蛋白酶水解等過程才轉(zhuǎn)化成活性形式。腸桿菌缺少上述加機(jī)制,不適合用于達(dá)結(jié)構(gòu)復(fù)雜的蛋白質(zhì)另外,蛋白質(zhì)的活還依賴于形成正確二硫鍵并折疊成高結(jié)構(gòu),在大腸桿菌中表達(dá)的蛋白質(zhì)往往不能進(jìn)行正確的折疊,是以包含體狀態(tài)存在。包含體的形成雖然簡化了產(chǎn)物的純化,但不利于產(chǎn)物的活性,為了得到有活性的蛋白,就需要進(jìn)變性溶解及復(fù)性等作,這一過程比較瑣,同時增加了成。與大腸桿菌相比,母是低等真核生物具有細(xì)胞生長快,于培養(yǎng),遺傳操作單等原核生物的特點又具有真核生物時達(dá)的蛋白質(zhì)進(jìn)行正加工,修飾,合理空間折疊等功能,非有利于真核基因的達(dá),能有效克服大桿菌系統(tǒng)缺乏蛋白澤后加工、修飾的不。因此酵母表達(dá)系受到越來越多的重和利用。大腸桿菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表達(dá)系統(tǒng),當(dāng)前已商業(yè)化的基因工程產(chǎn)品大多是通過大腸桿菌表達(dá)的,其主要優(yōu)點是成本低、產(chǎn)量高、易于操作。但大腸桿菌是原核生物,不具有真核生物的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制和蛋白質(zhì)的加工修飾能力,其產(chǎn)物往住形成沒有活性的包涵體,需要經(jīng)過變性、復(fù)性等處理,才能應(yīng)用。近年來,以酵母作為工程菌表達(dá)外源蛋白日益引起重視,主更是因為酵母是單細(xì)胞真核生物,不但具有大腸桿菌易操作、繁殖快、易于工業(yè)化生產(chǎn)的特點,還具有真核生物表達(dá)系統(tǒng)基因表達(dá)調(diào)控和蛋白修飾功能,避免了產(chǎn)物活性低,包涵體變性、復(fù)性等等間題[]。與大腸桿菌相比,酵母是單細(xì)胞真核生物,具有比較完備的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制和對表達(dá)產(chǎn)物的加工修飾能力,人們對釀酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae分子遺傳學(xué)方面的認(rèn)識最早,釀酒酵母也最先作為外源基因表達(dá)的酵母宿主.1981年釀酒酵母表達(dá)第一個外源基因一擾素基因,隨后又一系列外源基因在系統(tǒng)得到表達(dá)。雖然擾素和胰島素已大生產(chǎn)并在人群中廣應(yīng)用,但很大部分達(dá)由實驗室擴(kuò)展到工業(yè)規(guī)模時,培養(yǎng)基中維特質(zhì)粒高拷貝數(shù)的選擇壓力消失,質(zhì)粒變得不穩(wěn)定,拷貝數(shù)下降,而大多數(shù)外源基因的高效表達(dá)需要高拷貝數(shù)的維特,因此引起產(chǎn)量下降。同時,實驗室用培養(yǎng)基復(fù)雜而昂貴,采用工業(yè)規(guī)模能夠接受的培養(yǎng)基時,往往導(dǎo)致產(chǎn)量的下降。為克服釀酒酵母的局限,人們發(fā)展了以
甲基營養(yǎng)型酵母(methylotrophicyeast為代表的第二代酵母表達(dá)系統(tǒng)[
2]甲基營養(yǎng)型酵母包括:、Candida等.以Pichia.pastoris(畢赤斯德酵母)為宿主的外源因表達(dá)系統(tǒng)近年來展最為迅速,應(yīng)用最為廣泛,已利用系統(tǒng)表達(dá)了一系列有要生物學(xué)活性的蛋質(zhì)。畢赤酵母系統(tǒng)廣泛應(yīng)用,原因在該系統(tǒng)除了具有一般酵母所具有的特點外,還有以下幾個優(yōu)點[
1、];⑴有醇氧化酶
AOX1基啟動子,這是目前最強(qiáng),調(diào)控機(jī)理最嚴(yán)格的啟動子之一
。表達(dá)質(zhì)粒能在基因組的特定位點以單拷貝或多拷貝的形式穩(wěn)定整合。(即同源重組)菌株易于進(jìn)行高密度發(fā)酵,外源蛋白表達(dá)量高。⑷畢赤酵母中存在過氧化物酶體,表達(dá)的蛋白貯存其中,可免受蛋白酶的降解,而且減少對細(xì)胞的毒害作用。Pichia.pastoris
基因表達(dá)系統(tǒng)經(jīng)過近十年發(fā)展,已基本成為較完善的外源基因表達(dá)系統(tǒng),具有易于高密度發(fā)酵,表達(dá)基因穩(wěn)定整合在宿主基因組中,能使產(chǎn)物有效分泌并適糖基化,培養(yǎng)方便濟(jì)等特點。利用強(qiáng)可調(diào)控啟動子
AOX1,高效表達(dá)了HBsAg、TNFEGF破傷風(fēng)毒素C片段、因工程抗體等多種源基因,證實該系統(tǒng)為高效、實用、簡便,以提高表達(dá)量并保持產(chǎn)物生物學(xué)活性為突出特征的外源基因表達(dá)系統(tǒng),而且非常適宜子擴(kuò)大為工業(yè)規(guī)模4FDA價來自該系統(tǒng)的基因工程產(chǎn)品,最近來自該系統(tǒng)的
Cephelon制劑已獲得批準(zhǔn),所以該系統(tǒng)被認(rèn)為是安全的.Pichia.pastoris
表達(dá)系統(tǒng)在生工程領(lǐng)域?qū)l(fā)揮越來越重要的作用,促進(jìn)更多外源基因在該系統(tǒng)的高效表達(dá),提供更為廣泛的基因工程產(chǎn)品[。近年來,Invitrogon公司開了畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)的系列產(chǎn)品,
短短幾年已經(jīng)有多種外源蛋自在該系得到有效表達(dá),被認(rèn)為是目前最有效的酵母表達(dá)系統(tǒng)。畢赤酵母宿主菌常用的有GS115和KM71兩種,都具有HIS4養(yǎng)缺陷標(biāo)記其中,GS115茵株具有AOX1基因,是+,即甲醇利用正常型;而KM71菌株的AOX1位點被ARG4基因插入,表型為Muts,即甲醇利緩慢型,兩種菌株都適用于一般的酵母轉(zhuǎn)化方法。Pichia.pastoris酵母菌體內(nèi)無天然質(zhì)粒,所以表達(dá)載體需與宿主染色體發(fā)生同源重組,將外源基因表達(dá)框架整合于染色體中以實現(xiàn)外源基因的表達(dá)[5.包括啟動子、外源基因克隆位點、終止序列、篩選標(biāo)記等。表達(dá)載體都是穿梭質(zhì)粒,先在大腸桿菌復(fù)制擴(kuò)增,然后被導(dǎo)入宿主酵母細(xì)胞。為使產(chǎn)物分泌胞外,表達(dá)載體還需帶有信號肽序列。畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)有多種分泌型表達(dá)質(zhì)粒,有許多蛋白在畢赤酵母得到了高效分泌表達(dá)。胞外表達(dá)需要在外源蛋白的N末加上一段信號肽序列,引導(dǎo)重組蛋白進(jìn)入分泌途徑,可使蛋白蛋白質(zhì)在分泌到胞外之后獲得準(zhǔn)確的構(gòu)型。畢赤酵母對外源蛋白自身的信號序列識別能力差,在本試驗中所使用α質(zhì),其信號肽來自釀酒酵母的交配因子(α),能很好的達(dá)到以上的要求。并且作為新一代的畢赤酵母分泌表達(dá)質(zhì)粒,它還擁有一個特點是其具有
Zeocin抗標(biāo)記基因,給我們篩選轉(zhuǎn)化子的工作帶來很大的便利[
12。pPICZA質(zhì)粒是作為新一代的畢赤酵母分泌表達(dá)質(zhì)粒,它的主特點簡如下:⑴有強(qiáng)效可調(diào)控啟動子
AOX1(alcohol,醇氧化);⑵有抗性選標(biāo)記基因,重組轉(zhuǎn)化子可直接用
Zeocin進(jìn)行篩選,即在YPDZ平板上生長的轉(zhuǎn)化子中%都有外基因的合,大大簡化了重組轉(zhuǎn)化酵母的篩選過程[。在操作過程中,可用來篩選含表達(dá)載體αA的大腸桿菌轉(zhuǎn)化子,不必另外使用Amp經(jīng)濟(jì)而又簡便;。在表達(dá)載體A0X15’端啟動子序列下游,有供外源基因插入的多克隆位點,多克隆位點下游有A0X13’端止序列;分泌效率強(qiáng)的信號肽α-factor.Invitrogen
公司開發(fā)的畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)的系列產(chǎn)品作為目前被應(yīng)用為最為廣泛的酵母表達(dá)系統(tǒng),其主要的優(yōu)點有:醇氧化酶可調(diào)控的強(qiáng)啟動子,能高密度發(fā)酵,重組蛋白表達(dá)量高。外源基因整合在酵母基因組上,可以穩(wěn)定存在。同時,高效分泌表達(dá)質(zhì)粒能將外源蛋白表達(dá)后,進(jìn)行翻譯后加工處理,將外源蛋白分泌到細(xì)胞外,不但提高表達(dá)蛋白的活性,而且,有利于產(chǎn)物的純化。一.畢赤酵母表達(dá)常用溶液及緩沖液的配制11種母液的配制10*YNB
(含有硫酸銨、無氨基酸的
13.4%酵母基礎(chǔ)氮源培養(yǎng)基)4℃保存34g酵母基礎(chǔ)氮源培養(yǎng)基(無硫酸銨)
+100g硫酸銨,溶于
水,過濾除菌。500*B(0.02%生物素4℃保保存期1。20mg的生物素溶于100ml水中,過濾除菌。100*H(0.4%Histidine組氨酸)4℃保存保存期1年。400mg的組氨酸溶于100ml水中,(加熱至℃以促進(jìn)溶解),過濾除菌。10*D
(20%Dextrose葡萄糖)
1200g1000ml中,滅菌15min過濾除菌。10*M
(5%Methanol
甲醇)
25ml95ml勻,過濾除菌。10*GY
(10%Glycerol
甘油)保存為1年以上。100ml甘油和900ml水混勻后,高壓滅菌或過濾除菌。100*AA
(0.5%ofeachAminoAcid,各種氨基酸)
4保存保存期為1年。分別將500mg的谷氨酸、蛋氨酸、賴氨酸、亮氨酸和異亮氨酸溶于100ml水中,過濾除菌。1M磷酸鉀溶液(potassiumphosphatebuffer
),1mol/L的K2HPO4
液132ml與的液868ml混勻,為,需調(diào)節(jié),使用磷酸和氫氧化鉀調(diào)節(jié)pH1.2常用溶液緩沖夜1.2.1堿裂解法抽提質(zhì)粒所溶液Ⅰ:50mmol/Lglucose100mmol/LEDTA25mmol/L-HCI(pH8.0)溶液Ⅱ:LNaOH,SDS臨用時配制)溶液Ⅲ:29.44gKAc11.5mlAceticacid4保存。1.2.210%甘油(Glycerol):
ddH2O100ml。將100ml甘油和900ml水混勻后,高壓滅菌或過濾除菌。保存期為1.2.3Rnase-H2O:1ulRnasedd。℃保存。
1年以上1.2.4
緩沖液:10mmol/Tris-CI(pH80,lmmol/LEDTA(8.0)1.2.5STE
緩沖液:0.1mol//LTris-HCl(pH8.0),1mmol/LEDTA(pH8.0)1.2.6SCE
緩沖液:1mol/LSorbitol(山梨醇),10mmol/L檸檬酸鈉,/LEDTA1.2.7potassiumphosphatebuffer132ml1MK2HPO4868ml1MKH2PO4
(pH6.0):1.2.850XTAE
瓊脂糖凝膠電泳緩沖液,pH8.0():242gTris57.1mlAceticAcid37.2gEDTA二.畢赤酵母表達(dá)的培養(yǎng)基配制[
5]2.1LB
(Luria-Bertani
)培養(yǎng)基:lTryptonYeastExtract0.5
%
%NaClPH7.0
l
%制作平板時加
2%瓊脂。℃壓滅菌用于培養(yǎng)pPICZA原核宿主菌TOP10F加入Zeocin25ugml2.2(Salt)培養(yǎng)基:lTryptonYeastExtract0.5
。%
%NaClPH7.0
0.5%制作平板時加入2瓊粉?!娓邏簻?0min??捎谑覝卮鏀?shù)月用培養(yǎng)pPICZA核主菌
TOP10F’,加入25ug/條下保存2。2.3)YeastExtractPeptoneDextrose,(YeastExtractPeptoneDextroseMedium,酵母浸出粉胰蛋白胨右旋萄糖培養(yǎng)基)Trypton2%dextrose(glucose)2%+agar2%+Zeocin100μ液體YPD培養(yǎng)基可常溫保存;瓊脂YPD平板在可保存幾個月。入Zeocin100ug/ml,成YPDZ培養(yǎng)基,可以
條件下存
。2.4YPDS+Zeocinyeastextract1%peptone2%
培養(yǎng)基(ExtractPeptoneDextroseMedium
):dextrose(glucose)2%sorbitol+agar
M%+Zeocin100μ不管是液體
培養(yǎng)基,都必存放
4℃件下,有效期
1~周2.5MGYMinimalGlycerolMedium
(最小甘油培基)
;甘油;滅100ml2ml的500*B液和100ml10*GY母液混勻即可,℃保存,保存為2.6MGYH
2個月。MinimalGlycerolMedium+Histidine
(最小甘油培基
+0.004%
組氨酸)在1000ml的MGY培養(yǎng)基中加10ml的母液混,℃保,保存為2月。2.7RDRegenerationDextroseMedium
(葡萄糖再生養(yǎng)基)(含有:的梨醇;葡萄糖1.34%YNB;4*10-5%生物素氨基酸)1.將186g的山梨醇定容至
,高壓滅菌;冷卻后于℃水?。粚?00ml的10*D、100ml的10*YNB;2ml的500*B;10ml的100*AA等母液和無菌水混勻,預(yù)熱至℃后,與步驟的山梨溶液混合。存。2.8RDHRegenerationDextroseMedium+Histidine酸)
(葡萄糖再生培養(yǎng)基+0.004%組氨在RD培養(yǎng)基配制的第三步中在加入
10ml100*H液同時無水的體積減少至即可,其余配制方法與相同。℃保存。2.9RD及RDH平板的制備將186g的山梨和15~20g瓊脂粉容至,高壓菌;冷后于℃浴;參照RD/RDH液體培養(yǎng)基制的步100ml的10*D、100ml的10*YNB;的500*B;的100*AA母液、(10ml的100*H液)和()菌水混勻,預(yù)熱至℃后,與步驟1的山梨脂液混勻;3.迅速制備平板。℃可保數(shù)月。2.10RD及的TOP瓊脂的制備(常用于酵母菌的包被)將186g的山梨醇和瓊脂粉定容至
高壓滅菌;冷卻后于℃水??;參照RD/RDH液體培養(yǎng)基配制的步驟
將100ml的10*D、100ml的10*YNB;2ml的500*B;的100*AA母液、(10ml的100*H液)和()菌水混勻,預(yù)熱至℃后,與步驟1的山梨脂液混勻;將該TOP瓊脂置于℃水浴冷卻、保溫,備用。2.11MD與MDHMinimalDextroseMedium+(Histidine)
最小葡萄糖培養(yǎng)基+(%組氨酸)(含有:1.34%YNB;;4*10-5%生素;葡萄糖)1.100ml的10*YNB的500*B和100ml10*D母液,用800ml的無菌定容至1000ml即可;2.如配制MDH,可在上述的
MD中加入的100*H可;3.如配制平板,可無菌水的滅菌前,加入2.12SOC培養(yǎng)基:
15~20g的瓊脂。可保存數(shù)月。Trypton
l
%℃高壓滅菌
YeastExtract0.5NaCl0.05Glucose(1mol/L),卻后,℃保存
%%三.主要試驗環(huán)節(jié)的操作3.1酵母菌株分離純化接種GS115于5mlYPD液體培養(yǎng)基,℃,200rpm振蕩過夜,涂YPD平板,℃培養(yǎng)小時,用YNB基本培養(yǎng)基和含His的補充培養(yǎng)基作點種分離純化,挑
3.2pPICZA原核宿主菌TOP10F’做為菌種保存在-
TOP10F’活化培養(yǎng)℃條件下,進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)抽提質(zhì)粒之前先要進(jìn)行活化培養(yǎng)。接種TOP10F于(入25ugml)中℃200,培養(yǎng)~18時。畢赤酵母表達(dá)的試驗方法3.3.1狀質(zhì)粒DNA的脫磷酸化處理為了防止載體質(zhì)粒的自用小牛腸堿性磷酸酶(質(zhì)粒DNA,具體操作如下:⑴建立反應(yīng)體系:線性化的質(zhì)粒
35ul10xCIP4ulCIPddH2O5ul———————————————————total45ul⑵PCR儀上控制反應(yīng)溫度(加石蠟油封閉),℃,30(滅活)。
℃,15min
50℃,15;⑶℃未開始前停止,加入
proteinseK,用于滅活加入試劑如下:反應(yīng)物
45ul10x%SDS10xEDTA(pH8.0
7ulproteinseKddH2O
ulul——————————————————total70ul⑷純化使用
QIAquickspinkit
,按照步驟進(jìn),20ul菌洗脫純化產(chǎn)物。行
1%脂糖凝膠電泳,
120V觀察純化結(jié)果,并大約估計
DNA濃度。3.3.2E.coliTOP10F
’感受態(tài)細(xì)胞的制備及轉(zhuǎn)化⑴10ulTOP10F液,接種于200mlLB液體培養(yǎng)基中活化培養(yǎng),℃200rpm,~18時。取100菌液接種于
200ml液體LB培養(yǎng)中。37℃200培養(yǎng)~18時。滅菌500ml心管,,4000,20min。得菌體沉淀。棄上清,菌體用%甘油重懸并洗滌。重復(fù)洗滌
。⑷第三次離心后,棄絕大部分上清,留下約
1ml液體用于重懸體。⑸從制得的感受態(tài)細(xì)胞中,取
200ul于滅菌EP中,加入連接反應(yīng)產(chǎn)物
,混勻,不要產(chǎn)生氣泡,在冰上放置
5⑹將混勻后得200ul液移入電擊杯中。⑺使用電擊穿孔儀進(jìn)行轉(zhuǎn)化,設(shè)置為
電壓2500V,時間5ms。⑻電擊后,往電擊杯中加入
800ul培養(yǎng)基,沖洗出菌體,轉(zhuǎn)移至滅菌1.5mlEP管中。℃,150rpm,輕搖~60。⑼取全部均勻涂布于含
Zeocin25ug/ml
的Zeocin板上,正放,待涂布液不在流動,℃養(yǎng)~16時。*:設(shè)空載體做對照。3.4
畢赤酵母電轉(zhuǎn)方法3.4.1菌體的準(zhǔn)備:1.挑取酵母單菌落,接種至含有250~300r/min培養(yǎng)過;
5ml培養(yǎng)基的50ml三角瓶中,℃、2.取100~500μl的培養(yǎng)物種至含有
鮮培養(yǎng)基的三角搖瓶中,℃、250~300r/min培養(yǎng)過,至OD600達(dá)到1.3~1.5;將細(xì)胞培養(yǎng)物于,1500g離心5min,用500ml的冰預(yù)的無菌水將菌體沉淀重懸;按步驟3離心,用250ml的冰預(yù)冷的無水將菌體沉淀重懸;按步驟3離心,用的冰預(yù)冷的按步驟3離心,用的冰預(yù)冷的積約為1.5ml;
1mol的山梨醇溶液將菌體沉淀重懸;1mol的山梨醇溶液將菌體沉淀重懸,其終體7.備注:可將其分裝為μl份的包裝冷凍起來,但會影響其轉(zhuǎn)化效率(內(nèi))。3.4.2電擊轉(zhuǎn)化:
2周之8.將5~20線性化DNA溶解在5~10lTE溶液中,與μl上述步驟6所得的菌體混勻,轉(zhuǎn)至0.2cm預(yù)冷的電轉(zhuǎn)化杯中;9.將電轉(zhuǎn)化杯冰浴
;根據(jù)電轉(zhuǎn)化儀提供的資料,參考其他文獻(xiàn)及多次摸索,確定合適的電壓、電流、電容等參數(shù),按優(yōu)化的參數(shù),進(jìn)行電擊;電擊完畢后,加入冰預(yù)冷的山梨醇溶液將菌體混勻,轉(zhuǎn)至1.5ml的EP管中12.將菌體懸液涂布于
MDRDB平板上,每
μl布一塊平板;13.將平板置于℃培養(yǎng),直至單個菌落出現(xiàn)。推薦:電壓電容μF;電阻Ω。電擊時間為10msec。3.5Pichia
3.5.1
模板的處理:1.平板上的菌落長到肉眼可見時(約
小時)2.將除了模板之外的其它
PCR反應(yīng)液的組分備好,并分裝。引物最好使用Kit中已有的檢測專用的引物,或者一條使用載體上的引物,一條使用基因的特異性引物(這樣做可以鑒定非定向克隆的方向);用半根滅菌的牙簽(節(jié)約,而且好用)挑取菌落,在PCR管中涮以下,放入一個滅菌的毫升離心管,對PCR管和毫升離心管編號;PCR擴(kuò)增,%agarose電;對于PCR擴(kuò)增顯現(xiàn)特異性條帶的克隆,把置于毫升離心管中的半截牙簽扔到5升YPDZ培養(yǎng)基中,度培養(yǎng),小時后提質(zhì)粒,酶切鑒定確認(rèn)。注意:本驗方法應(yīng)用在需要挑取克隆較多(也就是克效率低),使用篩可以使工作量大為降低。3.5.2PCR反應(yīng)體系:
PCR初以TaqDNA
聚合酶反應(yīng)為例:組分μl體系μl體系10xReactionBuffer5.0μl2.0μ25mmol/LMgCl23.0μl1.2l2.5mmol/LdNTPs5.0l3.0μlPrimer1μmol/L)μl1.0Primer2μmol/L)μl1.0ddH2O31.5μl12.6l
l
μμTaqDNA聚合酶μl0.2TOTAL50.0μμl
μ
l3.5.3PCR反應(yīng)條件:初始變性℃4min變性℃30s34
個循環(huán)退火50~5430s延伸℃30s結(jié)束延伸℃10min保存℃3.6畢赤酵母因組提取方法⑴種重組和空質(zhì)粒轉(zhuǎn)化子于
5mlYPDZ培養(yǎng)基,GS115菌于YPD培養(yǎng)基作對照,℃,培養(yǎng)~小時。室溫下,1500g心收集菌體100ulTE(pH7.0)重懸,入ulEDTA(8.0)0.07M,β-基乙醇,1ulLyticase,℃水。⑷離心5~10min,沉淀,加
90ul重懸。⑸200ul飽和酚,200ul氯,混勻,離心30s取上層水相。⑹入兩倍體積無水乙醇以及
1/10體積的NaAC,-20℃置30min;⑺10000g離心20min,棄上;75%乙醇漂洗沉淀一次;⑻燥后,加入
μlTE或H2O溶解,-20℃?zhèn)溆谩?.7表型重組酵母的誘導(dǎo)表達(dá)實驗1.挑選一單菌落,置于裝有
25mlMGYBMG或BMGY培養(yǎng)基的250ml搖瓶,于28-30C/250-300rpm培養(yǎng)至OD600=2-6(~16-18h);2.室溫下1500~3000g離心5min,收集菌體,用MM、OD600=1.0左右(約100~200ml;
或BMMY
重懸菌體,使3.將步驟2所得的液置于
的搖瓶中,用雙層紗布或粗棉布封口,放置于28-30C/250-300rpm的搖床上繼續(xù)生長;4.每24h向培養(yǎng)基中添加
%甲醇至終濃度
~;5.按時間點分別取菌液樣品,取樣量為
置于1.5ml管中,最大轉(zhuǎn)速離心2~3min,分別收集上清和菌體,分析目的蛋白的表達(dá)量和菌液最佳收獲時間。時間點一般?。?、、、、、、和;對分泌表達(dá),分離樣品的上清液;對胞內(nèi)表達(dá),分離樣品的菌體沉淀,帶檢測樣品用液氮或干冰速凍后,于-80°C保存?zhèn)溆茫豢梢杂肧DS、Western-Blot活性實驗檢測與鑒定重組蛋白的表達(dá)。3.7Muts表重組酵母的誘導(dǎo)表達(dá)實驗1.挑選一單菌落,置于裝有
25mlMGYBMG或BMGY培養(yǎng)基的250ml搖瓶,于28-30C/250-300rpm培養(yǎng)至OD600=2-6(~16-18h);2.,收集菌1/5到或
重懸菌體(約
10~20ml);3.將步驟2所得的液置于
的瓶中,用雙層紗布或粗棉布封口,放置于28-30C/250-300rpm的搖床上繼續(xù)生長;4.每24h向培養(yǎng)基中添加
%甲醇至終濃度
~;5.按時間點分別取菌液樣品,取樣量為
置于1.5ml管中,最大轉(zhuǎn)速離心2~3min,分別收集上清和菌體,分析目的蛋白的表達(dá)量和菌液最佳收獲時間。時間點一般取:、、、和120h6.對分泌表達(dá)分離樣的上清;對胞內(nèi)表達(dá)分離樣的菌體淀,帶檢測樣品用液氮或干冰速凍后,于°保備用;7.可以用SDS、Western-Blot活性實驗檢測與鑒定重組蛋白的表達(dá)。四試驗的注意事項信號肽識別位點的設(shè)計以質(zhì)粒A為例。在利PCR反應(yīng)在外源基因兩端引入酶切位點的試驗中。如果質(zhì)粒α雙酶切中失了KEX2蛋白酶的酶切位點-,應(yīng)該在上游中,增加了編碼、Arg的密碼子AGA。酵母細(xì)胞膜中中的KEX2蛋白酶是信號肽的切割酶,它能有效識別酶切位點-,過對信號肽的切割使基因表達(dá)產(chǎn)物釋放至胞外。4.2PCR產(chǎn)物酶切保護(hù)堿基的設(shè)計利用轉(zhuǎn)換酶切位點,通過、P4兩引物的擴(kuò)增在的兩端加上Ⅰ、XbaⅠ的識別位點和5個保護(hù)基。根據(jù)限制性核酸內(nèi)切酶的工作原理,內(nèi)切酶首先需要結(jié)合到核苷酸序列上,并在上面進(jìn)行滑行,直至識別到酶切位點,為了能使內(nèi)切酶有效的結(jié)合到序列上以利于其的有效加工。在利用PCR進(jìn)行酶切位點轉(zhuǎn)換的時候,通常應(yīng)在端限制酶位點外再加保護(hù)堿基GC6,防止引物合成中因為合成效率和純化問題而導(dǎo)致的酶切位點的殘缺。核苷酸保護(hù)堿基之為了保證限制型內(nèi)切酶的工作效率,在其識別位點的兩側(cè)應(yīng)該保證一定的旁側(cè)序列,換言之,識別位點是限制型內(nèi)切酶識別并特異性切割底物的必要而不充分的條件。鑒于NEB(NewEnglandBiolabs)公司在限制酶領(lǐng)域的總體研究水平和對保護(hù)堿基方面的獨到理解,在設(shè)計引物時可以參照NEB公司產(chǎn)品目錄后面的附錄:CleavagetotheendofDNAfragments
進(jìn)行[7],是,一些不常用的酶或雖有推薦的保護(hù)堿基序列但酶切效率仍不高的酶還是很難設(shè)計保護(hù)堿基。本次實驗中,根據(jù)美國基因動力實驗室文獻(xiàn)的報道[];XbaINheI和SpeI位點端保護(hù)堿基須在5個左右才容易被酶切割,以一些前人的經(jīng)驗總結(jié),我們在設(shè)計引物時在識別位點端,設(shè)計了5個保護(hù)堿基。以保證較高酶切效率。高保真聚合酶的Vent聚酶是從高溫嗜熱菌分高出的高保真(Fidelity
DNA聚合酶,能糾正DNA擴(kuò)增中產(chǎn)生的錯誤,而傳統(tǒng)的
TaqDNA聚合酶,DNA聚合酶及其變體AmpliTaqKlenTaq等都無至’糾錯功能因此在擴(kuò)增時出現(xiàn)堿基錯配的機(jī)率為。對于大批量的PCR產(chǎn)物而言,并不是十分嚴(yán)重的問題,因為又同樣錯誤的DNA分子僅占全部合成的DNA分子群體的極少一部分。但是,如果PCR擴(kuò)增的DNA片段是用于分子克隆,那么這就是件值得重視的事情,因為此種分子含有一個或數(shù)個錯誤摻入的核苷酸,那么在該克隆中的所有克隆DNA都將帶有同樣的“突變”。將會導(dǎo)致嚴(yán)重的后果[]。具有校正功能的DNA聚合酶還有Pfu,DeepVent,Pwo,UlTma等,Pfu是中出錯率最低的,比TaqDNA聚合酶低倍在本論文中,為了減少hEGF在PCR過程的錯誤擴(kuò)增,在人工合成hEGF的過程中使用了Vent聚合酶。隨著PCR技術(shù)的不斷發(fā)展成熟(擴(kuò)增長度、保證性、產(chǎn)量和特異性等),質(zhì)粒構(gòu)建過程的大多數(shù)細(xì)胞內(nèi)的DNA復(fù)制將被PCR這一細(xì)胞外的DNA復(fù)制所代替,質(zhì)粒構(gòu)建效率將有質(zhì)的飛躍。密碼子的偏好性的原則酵母菌對外源基因的表達(dá)也和外源基因密碼子的選用有關(guān)。了解表達(dá)系統(tǒng)宿主在密碼子使用上的偏愛性對從翻譯水平分析外源基因表達(dá)的規(guī)律有重要意義也為改造外源基因或改造宿主細(xì)胞提供依據(jù)[、]。線性化及采用電轉(zhuǎn)化的原因:在pPICZA-EGF電轉(zhuǎn)整合入GS115的時候,因為需要比較高的轉(zhuǎn)染率,我們對其用限制性內(nèi)切酶Sac進(jìn)行線性化的處理。細(xì)菌內(nèi)同源重組被認(rèn)為是重組質(zhì)粒構(gòu)建過程的難點。因為未線性化的環(huán)狀質(zhì)粒之間發(fā)生同源重組的幾率非常低,所以重組轉(zhuǎn)移載體必須用特定的限制性內(nèi)切酶進(jìn)行線性化處理。這種處理的目的:防止隨機(jī)插入重組時質(zhì)粒在功能區(qū)斷開,造成目的基因表達(dá)失活;讓同源重組以指定的方式發(fā)生。4.5乙醇沉淀的問題主要步驟如下:1酶切體系(80ul)中2倍積的無水乙醇加分鐘沉淀3)13200rpm,20min,心后棄上清
1/10體積的NaAC,混4)75%乙醇300ul輕輕洗,同上離心
,棄上清37度烘箱至無乙醇?xì)馕叮ɑ蚴怯脫u床的出風(fēng)口吹出的暖風(fēng)吹)。20ulddH2O重溶如果想提高轉(zhuǎn)化效率,可以稍微做一些改進(jìn):還是用酚抽一下,去除內(nèi)切酶;75%乙醇應(yīng)兩遍,盡可能去除鹽離子,防止電轉(zhuǎn)化杯被擊穿,同時可提高效率;在沉淀時,如用終濃度2.5M醋酸鈉+2.5體積的無水乙醇,可沉淀幾乎所有的DNA,但需要用75%的乙醇認(rèn)真的洗兩遍。6酶切的總影響重組質(zhì)粒構(gòu)建效率的最關(guān)鍵步驟在于酶切,不管是否是定向克隆還是非定向克隆。酶切的關(guān)鍵在于切干凈,徹底的酶切反應(yīng)是成功的一半,特別是載體的酶切,尤其是雙酶切。雙酶切一般是先反應(yīng)低鹽的、后反應(yīng)高鹽的,如果低鹽的酶在高鹽的的反應(yīng)條件下有低活性(一般來講在NEB的手冊上都有標(biāo)示),最好就先純化(酚氯仿抽提、乙醇沉淀過,再進(jìn)行第二次酶切反應(yīng)。注意:有相同
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