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文檔簡介
甲基化分析務(wù)報(bào)告書1樣信1.1.共2樣品,樣本名稱參照管上的原始編號公編
基編
樣類物
組
細(xì)
溶液Wnt4-1Wnt4-2Wnt4-3Wnt4-4Wnt4-5Wnt4-6
小鼠小鼠小鼠小鼠小鼠小鼠
√√√√√√2服內(nèi)檢測,BSP實(shí)驗(yàn)3驗(yàn)容3.1基因DNA的檢3.2BSP實(shí)驗(yàn)(1)亞硫酸鹽處理及純化(QIAGEN,cat:操作步驟:嚴(yán)格按照試劑盒說明書操作,取基因組行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化并純化回收。(2)引物的設(shè)(加粗斜體下劃線部分為引物位置)Tcttttccttagttgagaataccactcactgtgaatttgcttacctgcgggatctccttatcagctgggggttggtggtggtagatgggcgggaaaggccccaccctggccgcctgatgtcagccctgttctcgggaactgagctgaaaacaagctaagaaacctgggaatggatgaagaaatgaggattctttctaacctttcgaagtcaccaggatgagaggggctccatccggtccccagtgggctaaacatgctagattcagctatggctactgtccacacagcacagcctggactatatgtcccaaacaaaactaacaaactaaaagaaaaaaatatacattagtagaaaaagtcctgcc:GTGAGTTAGTTTTGAAGGTTTTTTG:TTTTTCTTTTAATTTATTAATTTTATTTAAPCR產(chǎn)物大小:312bp(3)PCR擴(kuò)增:系PCR體(50μl)cat2×PCRMix上游引物()下游引物()模板水
25μl補(bǔ)至50μl1
反應(yīng)程序:℃℃℃
4min30s30s
40cycles℃℃
40s5min(4)克隆與測序PCR產(chǎn)物純化:按照試劑盒中的產(chǎn)品說明操作,將目標(biāo)片段割膠純化Generay,cat:GK2043連接T載體:采用的pTG19-T(:GV6021)作為載體,按照試劑盒中的產(chǎn)品說明操作。轉(zhuǎn)化采用XL10-Gold感受態(tài),按照產(chǎn)品說明進(jìn)行轉(zhuǎn)化、復(fù)蘇和涂板。酶切法鑒定陽性菌落挑取質(zhì)粒送測序,具體如下:樣品編
克隆測號(個(gè))Wnt4-150Wnt4-210Wnt4-3Wnt4-4Wnt4-5Wnt4-6
152020154
實(shí)結(jié)4.1DNA質(zhì)量檢a)測定樣品在和280nm的吸收值確定的質(zhì)量(儀超微量紫外可見分光光度儀內(nèi)容見下表公司編Abs260
260/280
樣品濃ng/ulWnt4-1Wnt4-2Wnt4-3Wnt4-4Wnt4-5Wnt4-6
0.3
1.9
15.000223.2287b)進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,確定抽提的完整性。2
4.2序果分展(Wnt4-111111111101111011111101111101111101
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