李敏檢驗(yàn)科上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院測序技術(shù)分析社區(qū)獲得性MRSA毒力進(jìn)化關(guān)系

金黃色葡萄球菌是臨床最重要的致病菌之一占革蘭陽性菌感染30-40%,占醫(yī)院獲得性感染病原菌的30%-60%；繼HIV之后第二大威脅人類生命的病原微生物金黃色葡萄球菌(SA)引起的感染累及全身各個(gè)臟器臨床SA感染類型醫(yī)院獲得性SA(HA-SA:住院期間)

社區(qū)獲得性SA(CA-SA:未接觸過醫(yī)院危險(xiǎn)因素)入院24小時(shí)以內(nèi)的感染，且排除以下危險(xiǎn)因素：近6個(gè)月內(nèi)接觸過醫(yī)院環(huán)境；近1年內(nèi)被診斷同樣的病原體感染；被診斷感染時(shí)帶有中心靜脈導(dǎo)管；近期有抗生素使用史（基礎(chǔ)疾?。┑菻A-MRSA感染在下降，CA-SA感染在上升流行克隆株：流行克隆株：ST59(MRSA)ST398(MSSA)ST239(MRSA)ST5(MRSA)

中國CA-SA感染：值得關(guān)注CA-MRSA主要克隆株：ST59分離率在上升CA-MSSA主要克隆株：

ST398分離率在上升CA-MRSAST398開始出現(xiàn)CA-MRSAST398引起的感染性心內(nèi)膜炎合并腦膿腫病例男性，14歲，學(xué)生；無誘因全身皮疹，大塊風(fēng)團(tuán)，數(shù)小時(shí)后開始出現(xiàn)持續(xù)性高熱伴畏寒，體溫最高達(dá)40.2℃，伴頭痛。WBC11.5↑x10^9/L,N72↑%,心超示二、三尖瓣返流，二尖瓣區(qū)有2/6級(jí)隆隆樣雜音。腦脊液(1.28)WBC230↑x10^6/L，查體有頸抵抗。血培養(yǎng)：金葡菌心超示“二尖瓣后葉脫垂伴感染性心內(nèi)膜炎”頭顱CT示“右額頂葉及左枕頂葉異常密度影（考慮腦膿腫）”，腦脊液結(jié)果示“WBC:110x10^6/L,多核89%,蛋白:562mg/L,糖:3.5mmol/L,氯化物:126mmol/L發(fā)病過程：皮膚軟組織感染→搔抓細(xì)菌入血→感染性心內(nèi)膜炎→血流感染→腦膿腫合并腦膜腦炎16種抗菌藥物的MIC：MRSA患者開始發(fā)病前無住院或看護(hù)病人等醫(yī)院接觸史:CA-MRSAMLST：ST398抗生素MIC值(ug/l)青霉素16(R)氨芐西林16(R)苯唑西林8(R)頭孢唑林16(R)左氧氟沙星0.25(S)紅霉素〉128(R)克林霉素〉32(R)萬古霉素1(S)替加環(huán)素0.25(S)利奈唑胺1(S)替考拉寧0.5(S)TMP/SMZ0.59(S)磷霉素2(S)阿米卡星4(S)慶大霉素0.25(S)利福平≤0.06(S)治療（青少年男性）：萬古霉素1g靜滴q12h聯(lián)合磷霉素8g靜滴q12h利福平0.45g口服qd方案治療治療3個(gè)月后心臟換瓣手術(shù)病原菌特點(diǎn)CA-MRSA致病力強(qiáng)，引起感染發(fā)病急，多臟器受累

感染免疫力正常健康人

毒力強(qiáng)，

致死率高

—出血性壞死性肺炎:死亡率50-80%CA-SA感染特點(diǎn)人畜共患病原體是主要公共威脅感染者分離SACA-SAHA-SA人群中流行播散(人傳人)LA-SA家畜(禽)相關(guān)SAST398人畜共患上海地區(qū)家畜和人群ST398感染形勢嚴(yán)峻

EmergInfectDis.(2016;IF:7.0)ST398在動(dòng)物感染占第四位ST398在人群感染率持續(xù)上升主要引起嚴(yán)重SSTIs人畜共患SAST398研究存在的疑問SAST398在不同物種傳播方向？新出現(xiàn)的人源CA-MRSAST398從何而來？動(dòng)物和人源SAST398基因組差異？CA-MSSAST398轉(zhuǎn)為MRSA的核心分子及對(duì)毒力影響？CA-MRSA如何平衡毒力和耐藥之間的關(guān)系？

12174ST398全基因組測序分析

76株

ST398本實(shí)驗(yàn)室測序結(jié)果

7株

人源

CA-MRSAST398(無動(dòng)物接觸史)

54株人源

CA-MSSAST398(無動(dòng)物接觸史)

15株

動(dòng)物L(fēng)A-MSSAST398(奶牛乳腺炎)

98株

ST398GenBank測序結(jié)果（不同國家，有動(dòng)物接觸史）animal-to-human?human-to-human?人畜共患SAST398進(jìn)化多樣性

人源MRSAST398

動(dòng)物MSSAST398

動(dòng)物MRSAST398人源MSSAST398SAST398在不同物種傳播方向？新出現(xiàn)的人源CA-MRSAST398從何而來？174CC398(76株本實(shí)驗(yàn)室+98株GenBank）菌株全基因組測序前噬菌體3上的免疫逃逸蛋白是主要差異分子Sak：人纖溶酶原轉(zhuǎn)變?yōu)槔w溶酶Scn：抗中性粒細(xì)胞的趨化Chp:抑制補(bǔ)體激活抗吞噬人源ST398對(duì)宿主侵襲性感染3.動(dòng)物和人源SAST398基因組差異？4.CA-MSSAST398轉(zhuǎn)為MRSA核心分子及對(duì)毒力影響除了獲得SCCmec可移動(dòng)的耐藥基因元件，CA-MRSAST398在基因組上無共性變化的分子174.CA-MSSAST398轉(zhuǎn)為MRSA核心分子及對(duì)毒力影響皮膚軟組織感染模型，肺炎模型結(jié)果顯示：

CA-MSSAST398轉(zhuǎn)為MRSA未對(duì)細(xì)菌致病力產(chǎn)生影響;CA-MSSAST398致病力依然明顯高于HA-MRSAST5/ST239185.CA-MRSA如何平衡毒力和耐藥之間關(guān)系？基因和蛋白水平：耐藥分子低水平表達(dá)來自不同國家CA-MRSA流行株：MIC均顯示明顯的低水平耐藥的特點(diǎn)；195.CA-MRSA如何平衡毒力和耐藥之間關(guān)系？不同國家CA-MRSA均攜帶SCCmecIV/V型耐藥基因元件；

SCCmecIV/V型低水平表達(dá)是CA-MRSA低水平耐藥的關(guān)鍵CA-MRSA通過低水平耐藥來維持高毒力總結(jié)全基因組測序技術(shù)是研究重要病原體遺傳進(jìn)化好的技術(shù)平臺(tái)；通過對(duì)臨床感染背景清晰的高毒力人畜共患SAST398的全基因組分析，發(fā)現(xiàn)其在不同物種傳播方向及新出現(xiàn)的CA-MRSAST398的進(jìn)化來源;CA-MSSAST398轉(zhuǎn)為MRSA關(guān)鍵分子是獲得SCCmec可移動(dòng)的耐藥基因元件；該耐藥基因元件的獲得未對(duì)細(xì)菌毒力產(chǎn)生影響；CA-MRSA通過低水平表達(dá)SCCmecIV/V型耐藥基因元件，從而低水平耐藥來維持高毒力；對(duì)重新認(rèn)識(shí)CA-MRSA遺傳進(jìn)化，診斷和臨床治療具有指導(dǎo)意義。2