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染色體與DNA分子生物學(xué)第1頁/共71頁2.1.1染色體概述染色體(chromosome)是細(xì)胞核中載有遺傳信息的物質(zhì),在顯微鏡下呈絲狀或棒狀,由核酸和蛋白質(zhì)組成,在細(xì)胞發(fā)生有絲分裂時期容易被堿性染料著色,因此而得名。染色體包括DNA和蛋白兩大部分。同一物種內(nèi)每條染色體所帶DNA的量是一定的,但不同染色體或不同物種之間變化很大,從上百萬到幾億個核苷酸不等。組成染色體的蛋白質(zhì)(組蛋白和非組蛋白)種類和含量也是十分穩(wěn)定的。第2頁/共71頁人類22對常染色體及1對性染色體顯微結(jié)構(gòu)圖1.28億個核苷酸對,1465個基因0.19億個核苷酸對,210個基因第3頁/共71頁除外觀結(jié)構(gòu)不同之外,在細(xì)胞內(nèi)的存在方式也不同:原核細(xì)胞染色體外裹著稀疏的蛋白質(zhì),其中一部分與DNA的折疊有關(guān),另一些則參與DNA復(fù)制、重組及轉(zhuǎn)錄過程。真核細(xì)胞的染色體中,DNA與蛋白質(zhì)完全融合在一起,其蛋白質(zhì)與相應(yīng)DNA的質(zhì)量比約為2:1.染色體位于真核細(xì)胞的核仁內(nèi),極細(xì)微的線性構(gòu)造,生命之線。染色體只有在細(xì)胞有絲分裂過程中,才可在光學(xué)顯微鏡下觀察到,分裂間期則以較細(xì)且松散的染色質(zhì)形式存在。端粒—生命時鐘第4頁/共71頁染色體特征:分子結(jié)構(gòu)相對穩(wěn)定;能夠自我復(fù)制,使親、子代之間保持連續(xù)性;指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成,控制整個生命過程;產(chǎn)生可遺傳的變異。真核細(xì)胞DNA的轉(zhuǎn)錄和翻譯在不同的空間和時間上進(jìn)行,其基因表達(dá)的調(diào)控不僅與DNA序列有關(guān),也與染色體的結(jié)構(gòu)有關(guān)。2.1.2真核細(xì)胞染色體的組成第5頁/共71頁1.蛋白質(zhì)包括組蛋白和非組蛋白。組蛋白是染色體的結(jié)構(gòu)蛋白,它與DNA組成核小體。組成:DNA,組蛋白,非組蛋白,RNA富含賴氨酸和精氨酸,H3、H4富含精氨酸,H1富含賴氨酸,H2A、H2B介于之間。第6頁/共71頁組蛋白的特性1.進(jìn)化上的極端保守性。不同種生物組蛋白的氨基酸組成十分相似。特別是H3、H4,牛、豬、大鼠的H4完全相同。2.無組織特異性。
僅發(fā)現(xiàn)兩個例外(鳥魚兩棲紅細(xì)胞H1-H5,精細(xì)胞魚精蛋白)3.肽鏈上氨基酸分布的不對稱性。
N端堿性氨基酸C端疏水氨基酸4.組蛋白的修飾作用
甲基化、乙酰化、磷酸化、多聚ADP糖基化等,修飾作用只發(fā)生在細(xì)胞周期的特定時間和組蛋白的特定位點上。
5.富含賴氨酸的組蛋白H5。
只存在于鳥類、兩棲類等含有細(xì)胞核的紅細(xì)胞中。與H1并無明顯的親緣關(guān)系。第7頁/共71頁非組蛋白包括酶類、細(xì)胞分裂有關(guān)的蛋白(收縮蛋白、骨架蛋白、核孔復(fù)合物蛋白)、肌動蛋白、肌球蛋白、微管蛋白、原肌蛋白等。高速泳動蛋白(highmobilitygroupprotein,HMG蛋白)能與DNA結(jié)合,也能與H1作用,可能與超螺旋結(jié)構(gòu)有關(guān)。DNA結(jié)合蛋白可能是一些與DNA復(fù)制或轉(zhuǎn)錄有關(guān)的酶或調(diào)解物質(zhì)。A24非組蛋白C端與H2A相同,功能不詳?shù)?頁/共71頁2.真核生物基因組DNA特點:含有大量的重復(fù)序列;功能DNA序列大多被非功能DNA隔開。C值(Cvalue):一種生物單倍體基因組DNA的總量。真核生物中,C值一般隨生物進(jìn)化而增加。C值反?,F(xiàn)象(C-valueparadox):C值往往與種系進(jìn)化的復(fù)雜程度不一致。各種生物細(xì)胞內(nèi)DNA總量比較第9頁/共71頁不重復(fù)序列一個或幾個拷貝,占DNA總量的40-80%,序列長約750-2000bp.
結(jié)構(gòu)基因基本上屬于不重復(fù)序列。單拷貝基因也可以合成大量蛋白:蠶絲心蛋白DNA-104mRNA-109protein中度重復(fù)序列重復(fù)次數(shù)10-104,占DNA總量的10-40%,編碼rRNA、tRNA和某些結(jié)構(gòu)蛋白。中度重復(fù)序列往往分散在不重復(fù)序列之間。
高度重復(fù)序列衛(wèi)星DNA(satelliteDNA),只在真核生物中發(fā)現(xiàn),占基因組的10-60%,由6-100個堿基組成。高度濃縮,異染色質(zhì)的組成部分。大多位于染色體著絲粒。不轉(zhuǎn)錄,功能不明,可能與染色體的穩(wěn)定性有關(guān)。真核細(xì)胞核酸序列大致可被分為3類:第10頁/共71頁核小體——染色體DNA的一級包裝染色質(zhì)螺線管(30nmfiber)——二級包裝染色質(zhì)纖維環(huán)—三級包裝
3.染色質(zhì)和核小體第11頁/共71頁染色質(zhì)和核小體染色質(zhì)DNA的Tm值比自由DNA高。
Tm值的概念:DNA的熔解溫度,指把DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)降解一半時的溫度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比。染色質(zhì)DNA的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄活性比自由DNA低。DNA酶I對染色質(zhì)DNA的消化慢于純DNA。由DNA和組蛋白組成的染色質(zhì)纖維細(xì)絲是許多核小體連成的念珠狀結(jié)構(gòu)。第12頁/共71頁染色質(zhì)的電子顯微鏡圖和X線衍射圖微球菌核酸酶(Micrococcalnuclease)處理染色質(zhì)后電泳,被保留的DNA片段均為200bp基本單位的倍數(shù)。第13頁/共71頁核小體單體被微球菌核酸酶處理后,隨著時間延長,其降解產(chǎn)物(DNA片段)會逐漸縮短,從200bp降至146bp,至此很難再進(jìn)一步降解。這種穩(wěn)定結(jié)構(gòu)為核心顆粒,它是由146bp的DNA片段和H2A、H2B、H3和H4各2分子組成。第14頁/共71頁第15頁/共71頁核小體是一種串珠狀結(jié)構(gòu),由核心顆粒和連結(jié)線DNA兩部分組成,可描述如下:①每個核小體單位包括約200bp的DNA、一個組蛋白核心和一個H1;②由H2A、H2B、H3、H4各兩分子形成八聚體,構(gòu)成核心顆粒;③DNA分子以左手螺旋纏繞在核心顆粒表面,每圈80bp,共1.75圈,約146bp,兩端被H1鎖合;④相鄰核心顆粒之間為一段60bp的連接線DNA。核小體的形成是染色體中DNA壓縮的第一步,收縮至原尺寸的1/7.第16頁/共71頁Twoquestions:DNA復(fù)制過程中是否從核心顆粒上解離下來,復(fù)制完再組裝上去?還是在核小體上復(fù)制?DNA纏繞在核心顆粒上為何不掉落?第17頁/共71頁染色質(zhì)螺線管(30nmfiber)在較高離子強(qiáng)度下,并保留H1,電鏡可觀察到10nm纖維會折轉(zhuǎn)成較粗的30nm纖維,這就是染色體DNA的二級包裝——螺線管纖維(solenoidalfiber)。螺線管纖維(的形成使DNA一級包裝又壓縮了6倍。是分裂間期染色質(zhì)和分裂中期染色體的基本組分。第18頁/共71頁螺線管纖維相隔一定間距的某些區(qū)段被"拉攏"固定在蛋白軸上,從而產(chǎn)生了許多從骨架上伸出的纖維環(huán)(loops)。第19頁/共71頁螺線管纖維纏繞在非組蛋白構(gòu)成的中心軸(centralaxis)骨架(支架蛋白質(zhì))上形成染色質(zhì)纖維環(huán)。染色質(zhì)纖維環(huán)是在螺線管纖維基礎(chǔ)上的更高一級包裝。從螺線管纖維環(huán)到包裝形成染色體是DNA壓縮程度最高的階段,估計在200~240倍。纖維環(huán)的形成是基因表達(dá)較理想的結(jié)構(gòu),這些環(huán)狀區(qū)是基因表達(dá)的活性單位所在。因為纖維環(huán)DNA比其它區(qū)域有更伸展的結(jié)構(gòu)。第20頁/共71頁染色體(chromosome)的形成染色質(zhì)濃縮時,纖維環(huán)會再繞成直徑600nm的螺旋。若用染料染色,即呈現(xiàn)觀察到的染色體。這種更高層次上的組裝機(jī)理,目前尚無明確定論。第21頁/共71頁第22頁/共71頁過程成分名稱寬度增加長度壓縮第一級DNA+組蛋白核小體5倍7倍第二級核小體螺線管3倍6倍第三級螺線管超螺旋13倍40倍第四級超螺旋染色體2.5-5倍5倍合計500-1000倍8400倍(8000-10000)染色體形成過程中長度與寬度的變化第23頁/共71頁真核生物基因組的結(jié)構(gòu)特點基因組龐大存在大量重復(fù)序列大部分為非編碼序列(>90%)真核生物與細(xì)菌、病毒最主要區(qū)別轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順反子真核基因是斷裂基因,有內(nèi)含子存在大量順式作用元件(啟動子、增強(qiáng)子、沉默子)存在大量的DNA多態(tài)性有端粒結(jié)構(gòu)決定啟動子的轉(zhuǎn)錄效率
RNA聚合酶Ⅱ識別序列對mRNA加尾有重要作用終止子,轉(zhuǎn)錄終止的信號第24頁/共71頁2.1.3原核生物基因組
原核生物的基因組都較小,DNA與少量蛋白(非組蛋白)結(jié)合構(gòu)成染色體,染色質(zhì)中無組蛋白。原核細(xì)胞有一條環(huán)狀的染色體(現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)了有些原核細(xì)胞含多條染色體,或線性染色體,或二者皆有);質(zhì)粒(plasmid)DNA第25頁/共71頁質(zhì)粒DNA:染色體外的DNA分子,其大小范圍在1kb至200kb以上不等,以超螺旋狀態(tài)存在于宿主細(xì)胞中。
質(zhì)粒主要發(fā)現(xiàn)于細(xì)菌、放線菌和真菌細(xì)胞中,大多數(shù)質(zhì)粒的宿主范圍較窄,復(fù)制和轉(zhuǎn)錄或多或少依賴于宿主編碼的酶和蛋白質(zhì)。質(zhì)粒攜帶的一些基因賦予宿主某些特殊的表型,其中不少具有重要的醫(yī)學(xué)和商業(yè)價值。由質(zhì)粒產(chǎn)生的表型包括對抗生素的抗性,產(chǎn)生抗生素、大腸桿菌素、腸毒素、限制性酶與修飾性酶,以及降解復(fù)雜有機(jī)化合物等。基因工程中質(zhì)粒常被用作基因的載體。第26頁/共71頁第27頁/共71頁E.coli的基因組幾乎全部由基因構(gòu)成。E.coli的單條染色體上大多數(shù)DNA都編碼蛋白質(zhì)或RNA,非編碼序列也都參與調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。原核細(xì)胞基因組DNA的特點:1結(jié)構(gòu)簡練
絕大部分編碼蛋白質(zhì)第28頁/共71頁2.存在轉(zhuǎn)錄單元功能相關(guān)的基因往往集中在一起,它們可被一起轉(zhuǎn)錄成多順反子mRNA。第29頁/共71頁3.有重疊基因閱讀框改變或不改變即同一段DNA能攜帶兩種不同蛋白質(zhì)的信息。
一個基因完全在另一個基因里;B-AE-D
部分重疊;K-C
兩個基因只有一個堿基對重疊。D-J第30頁/共71頁2.2DNA的結(jié)構(gòu)第31頁/共71頁2.2.1DNA一級結(jié)構(gòu)(PrimaryStructure)DNA的一級結(jié)構(gòu)是指組成DNA分子的脫氧核苷酸的連接方式和排列順序。
DNA是由很多個dAMP、dGMP、dCMP和dTMP通過3’,5’-磷酸二酯鍵連成的無分支雙鏈線狀或環(huán)狀多核苷酸。由于核苷酸之間的差異僅僅是堿基的不同,故可稱為堿基順序第32頁/共71頁DNA(脫氧核糖核酸deoxyribonucleicacid)的組成成分:核糖和脫氧核糖嘌呤(purine)嘧啶(pyrimidine)第33頁/共71頁第34頁/共71頁許許多多個脫氧核苷酸或核苷酸經(jīng)3’-5’磷酸二酯鍵聚合而成為DNA或RNA鏈第35頁/共71頁所謂DNA的一級結(jié)構(gòu),就是指4種核苷酸的連接及排列順序,表示了該DNA分子的化學(xué)構(gòu)成。核苷酸序列對DNA高級結(jié)構(gòu)的形成有很大影響DNA是巨大的生物高分子,如人的DNA就包含了3x109堿基對,如此數(shù)目的堿基可容納巨大的信息量。生物界里的遺傳信息都包含在組成DNA的A、G、C、T這四種核苷酸的排列順序之中。第36頁/共71頁DNA的方向是5’-3’(蛋白質(zhì)是N-C)DNA通常以線性或環(huán)狀形式存在DNA通常是雙鏈的(dsDNA),少數(shù)是單鏈的(ssDNA)DNA的一級結(jié)構(gòu)是指4種核苷酸的排列順序。GC豐富區(qū)易形成左手螺旋反向重復(fù)的片段易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)一級結(jié)構(gòu)對高級結(jié)構(gòu)的影響:延伸:5‘TCTCTCTCTCTCTAGAGAGAGAGAGA’3
3‘AGAGAGAGAGAGATCTCTCTCTCTCT’55‘NNNGAAGGTCCNNNNGGACCTTCNNN’3
3‘NNNCTTGCAGGNNNNCCTGGAAGNNN’5反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)回文結(jié)構(gòu)(Palindrome)NNNN
CGCGTAGCGCATATGCNNNNNN第37頁/共71頁核酸一級結(jié)構(gòu)可用簡寫式表示;核酸分子簡寫式表示的中心含義即是核酸分子中的核苷酸(或堿基)排列順序。
第38頁/共71頁線條式:
在堿基符號書寫基礎(chǔ)上,以垂線(位于堿基之下)和斜線(位于垂線與P之間)分別表示糖基和磷酸酯鍵。第39頁/共71頁字符式:用A、T、G、C、U代表堿基,用P代表磷酸殘基。核酸分子中的糖基、糖苷鍵和酯鍵等均省略不寫,將堿基和磷酸相間排列即可。不再注解“脫氧”與否,簡寫式中出現(xiàn)T的為DNA鏈,出現(xiàn)U則為RNA鏈。以5‘和3’表示鏈的末端及方向,分別置于簡寫式的左右二端。5’pApCpTpTpGpApApCpG3’
DNA5’pApCpUpUpGpApApCpC3’RNA第40頁/共71頁簡化為:5’pACTTGAACG3’DNA5’pACUUGAACG3’RNA簡寫式的5‘-末端均含有一個磷酸殘基(與糖基的C-5’位上的羥基相連),3‘-末端含有一個自由羥基(與糖基的C-3’位相連);若5‘端不寫P,則表示5’-末端為自由羥基。雙鏈DNA分子的簡寫式多采用省略了磷酸殘基的寫法,在上述簡式的基礎(chǔ)上再增加一條互補(bǔ)鏈(complementarystrand)即可。
5’GGAATCTCAT3’3’CCTTAGAGTA5’第41頁/共71頁DNA分子中不同排列順序的DNA區(qū)段構(gòu)成特定的功能單位,這就是基因,不同基因的功能各異,各自分布在DNA的一定區(qū)域?;虻墓δ苋Q于DNA的一級結(jié)構(gòu),要解釋基因的生物學(xué)含義,就必須弄清DNA順序。因此,DNA序列測定是分子遺傳學(xué)中一項既重要又基本的課題。第42頁/共71頁DNA不僅具有嚴(yán)格的化學(xué)組成,還具有特殊的空間結(jié)構(gòu),主要以有規(guī)則的雙螺旋形式存在。2.2.2DNA的二級結(jié)構(gòu)DNA雙螺旋的基本特點:由兩條互相平行的脫氧核苷酸長鏈盤繞而成;脫氧核糖和磷酸交替連接,排在外側(cè),構(gòu)成基本骨架,堿基排列在內(nèi)側(cè);兩條鏈上的堿基通過氫鍵結(jié)合,按一定規(guī)律形成堿基對---堿基互補(bǔ)配對原則。第43頁/共71頁DNA的二級結(jié)構(gòu)是指兩條多核苷酸鏈反向平行盤繞所生成的雙螺旋結(jié)構(gòu)。生物活體中,二級結(jié)構(gòu)和高級結(jié)構(gòu)都是時刻變化的,即在二級結(jié)構(gòu)的各種構(gòu)象間、二級結(jié)構(gòu)與高級結(jié)構(gòu)間或高級結(jié)構(gòu)的各種構(gòu)象間存在動力學(xué)平衡。第44頁/共71頁B-DNA的反向平行雙螺旋結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)參數(shù):螺旋直徑2nm;螺旋周期包含10bp;螺距3.4nm;相鄰堿基對平面的間距0.34nm。第45頁/共71頁第46頁/共71頁右手螺旋:A-DNA,B-DNA左手螺旋:Z-DNA第47頁/共71頁B構(gòu)象:生物體內(nèi)天然存在的DNA幾乎都以B-DNA存在。A構(gòu)象:是在以鈉、鉀或銫作為反向離子時,將DNA纖維在75%相對濕度下進(jìn)行X光衍射測定出來的。DNA-RNA雜交分子、RNA-RNA雙鏈結(jié)構(gòu)均為A構(gòu)象。對基因表達(dá)有重要意義。Z構(gòu)象:在DNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄或其他一些生理過程中會產(chǎn)生Z-DNA結(jié)構(gòu),之后DNA會放出能量,形成B-DNA。
螺距殘基數(shù)堿基傾斜
A型(75%,Na)2.81120°B型(92%,Na)3.4100°C型(66%,Li)3.19.36°D/Rhybrid2.81120°Z型4.6129°第48頁/共71頁左手螺旋Z-DNA是右手螺旋結(jié)構(gòu)模型的補(bǔ)充和發(fā)展。B-DNA是最常見的DNA構(gòu)象,A-DNA和Z-DNA具有不同的生物活性。第49頁/共71頁Z-DNA的生物學(xué)意義Z-DNA的形成通常在熱力學(xué)上是不利的。因為Z-DNA中帶負(fù)電荷的磷酸根距離太近了,這會產(chǎn)生靜電排斥。但DNA鏈的局部不穩(wěn)定區(qū)的存在就成為潛在的解鏈位點。DNA解螺旋卻是DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄等過程中必要的環(huán)節(jié),因此認(rèn)為這一結(jié)構(gòu)位點與基因調(diào)節(jié)有關(guān)。可能提供某些調(diào)節(jié)蛋白的識別位點。Z-DNA與B-DNA連接處的結(jié)構(gòu),韓國人發(fā)表在2005年10月20日《nature》上。第50頁/共71頁DNA雙鏈的變性和復(fù)性當(dāng)DNA溶液溫度接近沸點或者PH較高時,互補(bǔ)的兩條鏈就可能分開,稱為DNA的變性(denaturation).可逆的。應(yīng)用于現(xiàn)代分子生物學(xué)研究。增色效應(yīng)減色效應(yīng)第51頁/共71頁Tm值吸光度增加到最大值一般時的溫度稱為DNA的解鏈溫度或熔點(meltingpoint)。
DNA中G+C的含量。Tm=69.3+0.41(G+C)%<25merTm=4(G+C)+2(A+T)溶液中的離子強(qiáng)度。DNA一般在含鹽緩沖液中比較穩(wěn)定。DNA的均一性。第52頁/共71頁2.2.3DNA的高級結(jié)構(gòu)超螺旋是雙螺旋DNA進(jìn)一步扭曲盤繞形成的三級結(jié)構(gòu)。第53頁/共71頁(1)超螺旋(superhelixorsupercoil)的發(fā)現(xiàn)1965年電鏡發(fā)現(xiàn)SV40和多瘤病毒的環(huán)形DNA的超螺旋;第54頁/共71頁
絕大多數(shù)原核生物DNA都是共價封閉環(huán)(covalentlyclosedcircleDNA,cccDNA)分子,雙螺旋環(huán)狀分子螺旋化成為超螺旋結(jié)構(gòu)。第55頁/共71頁有些單鏈環(huán)形染色體(如φ×174)或雙鏈線形染色體(如噬菌體),在其生活周期的某一階段,染色體也變?yōu)槌菪Y(jié)構(gòu)。真核生物的染色體多為線形分子,但DNA均與蛋白質(zhì)相結(jié)合,同樣具有超螺旋形式。第56頁/共71頁(2)超螺旋的形成DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)中,一般每轉(zhuǎn)一圈有10個核苷酸對,平時,雙螺旋總處于能量最低狀態(tài)。若正常DNA雙螺旋額外地多轉(zhuǎn)或少轉(zhuǎn)幾圈,使每一圈的核苷酸數(shù)目大于或小于10,就會出現(xiàn)雙螺旋空間結(jié)構(gòu)的改變,在DNA分子中產(chǎn)生額外張力。若此時雙螺旋的末端是固定的或是環(huán)狀分子,雙鏈不能自由轉(zhuǎn)動,額外的張力不能釋放,導(dǎo)致DNA分子造成扭曲,形成超螺旋。第57頁/共71頁負(fù)超螺旋:形成超螺旋時,旋轉(zhuǎn)方向與DNA雙螺旋方向相反,旋轉(zhuǎn)結(jié)果使DNA分子內(nèi)部張力減小,稱為松旋效應(yīng)。在自然條件下共價封閉環(huán)狀DNA呈負(fù)超螺旋結(jié)構(gòu)。正超螺旋:與負(fù)超螺旋相反,形成超螺旋時的旋轉(zhuǎn)方向與DNA雙螺旋方向相同,結(jié)果加大了DNA分子內(nèi)部張力,有緊旋效應(yīng)。正超螺旋右旋負(fù)超螺旋左旋第58頁/共71頁第59頁/共71頁第60頁/共71頁連環(huán)數(shù)(linkingnumber):指在雙螺旋DNA中,使兩條鏈完全分開時一條鏈必須穿過另一條鏈的次數(shù),以Lk表示;是共價閉環(huán)DNA(cccDNA)的固有拓?fù)涮匦?。在不發(fā)生鏈斷裂時其值為常數(shù),是環(huán)狀DNA的一個很重要特性;L是整數(shù),右手螺旋對L取正值。扭轉(zhuǎn)數(shù)(twistingnumber):指DNA分子中的WatsonCrick螺旋數(shù),即一條鏈纏繞另一條鏈的次數(shù),以Tw表示。Tw為變量,可以是非整數(shù),右手螺旋時T為正值。纏繞數(shù)(writhingnumber)或超螺旋數(shù),以Wr表示。Wr為變量,可以是非整數(shù)。第61頁/共71頁如果一個cccDNA分子處在一個平面上,在這種平面構(gòu)象中,其連環(huán)數(shù)(Lk)等于扭轉(zhuǎn)數(shù)(Tw);但cccDNA分子通常不是處在一個平面上,它容易發(fā)生扭轉(zhuǎn)變形,形成超螺旋;在不破壞共價鍵的條件下,部分扭轉(zhuǎn)數(shù)轉(zhuǎn)變?yōu)槔p繞數(shù);而扭轉(zhuǎn)數(shù)與纏繞數(shù)之和(即連環(huán)數(shù))是不變的,即:Lk=Tw+Wr第62頁/共71頁連環(huán)差ΔLk=Lk-Lk0,可以反映超螺旋的程度
Lk0指在生理條件下松弛時cccDNA的連環(huán)數(shù)
ΔLk絕對值遠(yuǎn)大于零,DNA會因過度扭曲產(chǎn)生超螺旋;
ΔLk>0,產(chǎn)生正超螺旋;
ΔLk<
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