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酶切回收連接第1頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四質(zhì)粒DNA的酶切第2頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四定義:識別dsDNA的特異序列,并在識別位點或其周圍切割雙鏈DNA的一類內(nèi)切酶。限制性核酸內(nèi)切酶第3頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四Ⅱ類內(nèi)切酶作用特點能在特殊位點識別和切斷dsDNA,識別序列4-6bp,具有回文結(jié)構(gòu)(180度旋轉(zhuǎn)對稱結(jié)構(gòu))HindⅢ產(chǎn)生5'粘性末端AAGCTTTTCGAAAAGCTTTTCGAA第4頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四SstⅠGAGCTCCTCGAG產(chǎn)生3'粘性末端GAGCTCC
TCGAG粘端切口第5頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四GTCCAGHindⅡGTCGACCAGCTGGACCTG+平端切口第6頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四第一個字母取自產(chǎn)生該酶的細菌屬名,用大寫;第二、第三個字母是該細菌的種名,用小寫;第四個字母代表株;用羅馬數(shù)字表示發(fā)現(xiàn)的先后次序。3、命名:HindⅢ
Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血桿菌d株的第三種酶屬
系
株序書寫方法:前3個字母斜體第7頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四酶活性單位指在限定條件下(溫度、Buffer),1hr消化1ugDNA的酶量稱為一個酶單位(unit)。實際工作中,為保證消化完全,1ugDNA的消化需要3-5個單位的酶,反應(yīng)時間也要適度延長,通常是反應(yīng)過夜。第8頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四酶切反應(yīng)系統(tǒng)的設(shè)計回收DNA通常酶切10μg實際酶的用量應(yīng)是理論用量的3-5倍。酶通常保存在50%的甘油中,使用時甘油濃度必須小于5%,故酶至少稀釋10倍。Buffer通常是10×,使用時稀釋10倍??偡磻?yīng)體積20-50ul,不足用tdH2O補足。第9頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四DNA的量酶的用量(U/C)酶在50%甘油中,甘油在總體積的濃度要小于5%反應(yīng)的總體積Buffer的體積水的體積第10頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四質(zhì)粒DNA15μl(10μg)HindIII(20U/μl)
1.5μl10×緩沖液E3μl三蒸水9μl_____________________________________總體積
30μlXbaI(20U/μl1.5μl加樣順序加樣后混勻,短暫離心,使之至管底。第11頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四DNA片段的
分離純化第12頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四四、操作步驟:關(guān)鍵操作:點樣在加樣孔正上方,不要進入孔中甚至戳穿孔底加樣器一旦按下,就一定保持按住直至加樣器離開加樣孔,否則會將樣品又吸回到tip中,使加樣失敗第13頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四載體DNA目的基因第14頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四
bp—1534—994—695—515—377—237
ABCM
第15頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四酚抽提法切下含目的DNA的膠塊。加入酚,將膠塊沒過即可。振蕩后低溫凍結(jié),視溫度而定時間。30℃水浴融化,若體積小,可補加TE。振蕩器上振蕩。12,000rpm離心5min。取上清200μl。第16頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四用200μl的氯仿:異戊醇抽提(振蕩,離心12000rpm,5min,取上清)。加20μlNaAc,400μl無水乙醇沉淀DNA,冰凍約30min甚至過夜。12,000rpm離心10min,棄上清。將DNA溶于約30μlTE中。第17頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四DNA片段的連接反應(yīng)第18頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四
DNA連接酶ligase催化DNA5'磷酸基與3'羥基之間形成磷酸二酯鍵(ATP)
5'5'3'3'OHPOHPDNA連接酶DNA連接酶第19頁,共21頁,2023年,2月20日,星期四總體積20μl載體0.1~0.2μg目的基因:載體mol數(shù)=1~5:1H2O10×buffer載體目的基因ligase總體積20μlμlμlμl
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