第一包：多組學(xué)生物信息分析服務(wù)1.服務(wù)范圍：對500例樣本進(jìn)行mRNA轉(zhuǎn)錄組、miRNA轉(zhuǎn)錄組、lncRNA轉(zhuǎn)錄組、蛋白組的多組學(xué)生物信息分析。2.基本要求：需具備多組學(xué)生物信息分析能力。3.分析范圍：用于mRNA轉(zhuǎn)錄組、miRNA轉(zhuǎn)錄組、lncRNA轉(zhuǎn)錄組、蛋白組的多組學(xué)生物信息分析。4.多組學(xué)生物信息分析步驟4.1.分別對疾病組vs對照組樣本進(jìn)行差異mRNA篩選（差異篩選1）。4.2.分別對疾病組vs對照組樣本進(jìn)行差異miRNA篩選（差異篩選2）。4.3.分別對疾病組vs對照組樣本進(jìn)行差異LncRNA篩選（差異篩選3）。4.4.分別對疾病組vs對照組樣本進(jìn)行差異蛋白篩選（差異篩選4）4.5.對上述差異基因1~4，根據(jù)其在每個(gè)樣本中的表達(dá)值，進(jìn)行聚類分析。（聚類分析）4.6.對總體差異基因進(jìn)行火山圖分析，分析樣本差異倍數(shù)和P值之間的關(guān)系（需樣本重復(fù)數(shù)大于3）。（火山圖）4.7.對總體差異基因進(jìn)行散點(diǎn)圖分析，分析樣本整體上下調(diào)偏離情況。（散點(diǎn)圖）4.8.對mRNA進(jìn)行顯著性功能富集分析，得到具有顯著性、靶向性的功能以及顯著性功能對應(yīng)的靶基因。（功能富集）4.9.對富集得到的顯著性功能以柱狀圖的形式展示。（功能柱狀圖）4.10.對mRNA進(jìn)行顯著性Pathway分析，得到具有顯著性、靶向性的Pathway以及顯著性Pathway對應(yīng)的靶基因。（信號通路富集）4.11.富集得到的顯著性信號通路以柱狀圖的形式展示。（信號通路柱狀圖）4.12.對所有信號通路中的差異基因都進(jìn)行PathwayMapping注釋，在KEGG的信號通路界面對差異基因進(jìn)行投影，上調(diào)標(biāo)記為紅色，下調(diào)標(biāo)記為紫色。（PathwayMapping注釋）4.13.以差異mRNA和蛋白篩選結(jié)果的交集為研究對象，基于疾病已經(jīng)驗(yàn)證的基因和基因之間的關(guān)系，構(gòu)建差異基因信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)，研究差異基因間的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程，并從網(wǎng)絡(luò)中得到起信號中樞作用的基因。（全局信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)）4.14.以號通路的顯著性分析中顯著的Pathway為研究對象，構(gòu)建出整個(gè)Pathway和Pathway之間的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)關(guān)系，并找到最上游的源頭Pathway、中樞Pathway以及最終效應(yīng)Pathway。（信號通路作用網(wǎng)絡(luò)）4.15.以差異mRNA為研究對象，通過其轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的序列，預(yù)測上游轉(zhuǎn)錄因子，并構(gòu)TF調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，通過網(wǎng)絡(luò)中的核心值，定位核心的轉(zhuǎn)錄因子和轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的樞紐基因。（轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）4.16.以篩選到的差異miRNA數(shù)據(jù)，通過多個(gè)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行靶基因預(yù)測。（多數(shù)據(jù)庫靶基因預(yù)測）4.17.對上一步的靶基因預(yù)測結(jié)果和差異mRNA結(jié)果進(jìn)行負(fù)相關(guān)分析，得到miRNA上調(diào)-靶基因下調(diào)（反之亦然）的對應(yīng)關(guān)系。（負(fù)相關(guān)）4.18.構(gòu)建差異miRNA與交集靶基因之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，得到網(wǎng)絡(luò)中起核心調(diào)控作用的miRNA和被miRNA調(diào)控的關(guān)鍵靶基因。（MicroRNA對基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）4.19.構(gòu)建差異miRNA和顯著性功能的作用網(wǎng)絡(luò)，得到網(wǎng)絡(luò)中起主要調(diào)控作用的miRNA和miRNA所調(diào)控的主要功能。（MicroRNA對功能的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）4.20.構(gòu)建差異miRNA和顯著性通路的作用網(wǎng)絡(luò)，得到網(wǎng)絡(luò)中起主要調(diào)控作用的miRNA和miRNA所調(diào)控的主要通路。（MicroRNA對信號通路的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）4.21.以差異mRNA和lncRNA為研究對象，通過每個(gè)基因的芯片實(shí)測值，構(gòu)建疾病組與對照組的動態(tài)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，從動態(tài)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)上的差異來分析其之間的作用關(guān)系，定位哪些lncRNA在共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)上處于核心位置，并推斷這些lncRNA的功能（此分析需樣本重復(fù)數(shù)大≥3）。（共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）。4.22.根據(jù)上一步（共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）分析結(jié)果，根據(jù)差異LncRNA和被預(yù)測靶基因參與的顯著性Pathway，利用LncRNA和靶基因Pathway的屬性，構(gòu)建LncRNATargetPathwayNetwork。該網(wǎng)絡(luò)反映目標(biāo)LncRNA對Pathway的作用關(guān)系。根據(jù)網(wǎng)絡(luò)中各LncRNA的位置函數(shù)計(jì)算出網(wǎng)絡(luò)特征值。特征值最高的LncRNA處于網(wǎng)絡(luò)的樞紐性地位，該LncRNA對多個(gè)Pathway和樣本狀態(tài)有重要的調(diào)控價(jià)值，同時(shí)，評價(jià)Pathway在網(wǎng)絡(luò)中的特征值，可以發(fā)現(xiàn)差異LncRNA所調(diào)控的核心Pathway。（LncRNA對信號通路的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）4.23.查詢差異LncRNA序列，通過自由能計(jì)算，推斷LncRNA結(jié)合miRNA的能力，得到LncRNA-mRNA靶向關(guān)系。（LncRNA-miRNA靶向預(yù)測）4.24.通過共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)——CoexpressionNetwork中得到的正相關(guān)的LncRNA-mRNA配對關(guān)系。（調(diào)用正向共表達(dá)結(jié)果）4.25.通過結(jié)合“多數(shù)據(jù)庫靶基因預(yù)測（mRNA-miRNA靶向關(guān)系）”“LncRNA-miRNA靶向預(yù)測”“調(diào)用正向共表達(dá)結(jié)果”部分結(jié)果，得到與miRNA有靶向關(guān)系的mRNA、LncRNA。4.26.由于ceRNA調(diào)控關(guān)系中ceRNA可以通過競爭性地結(jié)合miRNA來調(diào)節(jié)基因表達(dá)。ceRNA的上調(diào)導(dǎo)致結(jié)吸附的miRNA增多，從而導(dǎo)致對應(yīng)mRNA的表達(dá)上調(diào)。反之亦然。因此ceRNA與mRNA應(yīng)在共表達(dá)中為正相關(guān)關(guān)系，從而大大減少ceRNA網(wǎng)絡(luò)的假陽性。（ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)）5.項(xiàng)目交付周期：≤10個(gè)工作日/每批次。6.多組學(xué)生物信息分析成功率：≥99%7.分析通量：每批最大分析數(shù)量可為100例。8.靈活性：每批最小分析數(shù)量可為2例。9.售后服務(wù)9.1.提供數(shù)據(jù)存儲12個(gè)月服務(wù)。9.2.提供數(shù)據(jù)的采集、保存、傳輸方法指導(dǎo)9.3.投訴響應(yīng)時(shí)間：工作日1小時(shí)內(nèi)回復(fù)，6小時(shí)內(nèi)指派合格的技術(shù)人員跟進(jìn)。9.4.提供3年技術(shù)服務(wù)培訓(xùn)及服務(wù)9.4.1.提供≥5次多組學(xué)生物信息分析培訓(xùn)。9.4.2.提供≥5次集中答疑。9.4.3.每次培訓(xùn)人數(shù)可為1-100人。9.4.4.每次培訓(xùn)時(shí)間≥1天。9.4.5.對分析流程、分解結(jié)果解讀、文章撰寫等內(nèi)容提供培訓(xùn)。第二包：組學(xué)檢測驗(yàn)證配套試劑耗材一、qPCR和Western實(shí)驗(yàn)配套試劑耗材1.RNA提取試劑盒1.1包含了所有RNA柱式提取所需的成分，能快速高效的提取能用于下游實(shí)驗(yàn)的RNA.1.2技術(shù)參數(shù)1.2.1樣本：細(xì)菌、血液、細(xì)胞、液體樣品（血清）、組織、酵母等。1.2.2提取所需時(shí)間：小于20分鐘。1.2.3單次提取量：單次從單一提取物提取要達(dá)到1000ug。1.2.4試劑盒中各組分不含有酚/氯仿等高污染腐蝕性組分。1.2.5RNA純化產(chǎn)物能應(yīng)用于基因芯片分析、下一代測序、Northern印跡、核酸酶保護(hù)分析、實(shí)時(shí)定量PCR（QPCR）、逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)（RT-PCR）等1.3配置要求：可提供能滿足5000份樣品提取的試劑2.反轉(zhuǎn)錄試劑盒2.1以RNA為模板高效合成第一鏈cDNA的完整系統(tǒng)。2.2技術(shù)參數(shù)2.2.1可以高效合成長達(dá)13kb的全長第一鏈cDNA2.2.2最佳活性溫度為42°C2.2.3試劑盒中包含反轉(zhuǎn)錄所需所有試劑，提供oligo(dT)18引物和隨機(jī)六聚體引物，并且包含RNase抑制劑2.2.5既可反轉(zhuǎn)錄mRNA，又可轉(zhuǎn)錄microRNA等無PolyA尾巴的RNA2.3配置要求：50個(gè)100次包裝試劑盒3.RealtimePCR專用試劑3.1技術(shù)參數(shù)3.1.12x濃度的RealtimeMIX，染料是SYBRGreenI3.1.2寬動態(tài)范圍(6log)&靈敏度(1個(gè)拷貝)，在寬廣的范圍內(nèi)有良好的標(biāo)準(zhǔn)曲線，在較寬的起始范圍內(nèi)的數(shù)據(jù)可靠性，可實(shí)現(xiàn)低豐度轉(zhuǎn)錄本檢測；3.1.4采用熱啟動酶3.1.5含有"Dual-Lock”DNA聚合酶3.1.6適用于所有ABI以及市面上主流的熒光定量儀器3.1.7含有熱不穩(wěn)定性尿嘧啶DNA糖基化酶（UNG），降解此前擴(kuò)增的含有dUTP的DNA后再循環(huán)，有效的防止氣溶膠污染3.1.9可長期儲存于4°C，配置反應(yīng)液前后可保證常溫72小時(shí)穩(wěn)定性；3.1.10可支持標(biāo)準(zhǔn)模式（1h）和快速模式（30min）反應(yīng)程序；3.2配置要求：需求10000次反應(yīng)的RealtimePCR專用試劑4.蛋白酶/磷酸酶抑制劑混合物4.1蛋白酶/磷酸酶抑制劑混合物獨(dú)立溶液為細(xì)胞和組織裂解物的蛋白樣品提供完整保護(hù)4.2技術(shù)參數(shù)4.2.1試劑狀態(tài)：100倍濃度的蛋白酶及磷酸酶抑制劑混合物液體4.2.2試劑種成分及儲存要求：不含DMSO，不含AEBSF，4℃保存4.2.3后期應(yīng)用：處理的樣本能與質(zhì)譜分析兼容4.3配置要求：可提供約10個(gè)5ml包裝5.組織蛋白質(zhì)抽提試劑5.1組織蛋白抽提試劑從組織樣品中溫和的抽提總蛋白。5.2技術(shù)參數(shù)5.2.1裂解要求：溫和除垢劑裂解，后期可進(jìn)行考馬斯和BCA蛋白定量分析5.2.2裂解產(chǎn)物要求：所得的蛋白處于非變性可溶狀態(tài)，可用于免疫沉淀，酶活性分析和其他親和實(shí)驗(yàn)；可以通過透析快速方便的去除去垢劑；可以與其他成分一起使用(例如蛋白酶抑制劑、鹽、還原劑、螯合劑等)5.2.3成分要求：不含胺基并且可透析、緩沖體系為25mMN-二(羥乙基)甘氨酸和150mM氯化鈉(pH7.6)5.2.4操作：可在細(xì)胞板中直接裂解貼壁細(xì)胞，5分鐘完成裂解。5.3配置要求：需求3500ml哺乳動物蛋白抽提試劑。6.超高靈敏度增強(qiáng)型化學(xué)發(fā)光(ECL)底物6.1能用于辣根過氧化物酶(HRP)的增強(qiáng)型化學(xué)發(fā)光底物。6.2技術(shù)參數(shù)6.2.1靈敏度：使用適當(dāng)?shù)囊豢购投箷r(shí)，可在硝化纖維膜或PVDF膜上檢測豐度為低飛克級的蛋白條帶6.2.2檢測范圍：所得信號的可定量檢測范圍跨越兩個(gè)數(shù)量級6.2.3發(fā)光時(shí)長：光信號輸出長達(dá)8小時(shí)6.2.4儲存：試劑盒組分能夠在4°C條件下穩(wěn)定放置一年，在室溫下可穩(wěn)定放置6個(gè)月6.3配置需求：需求10盒200ml包裝的7.蛋白marker7.1用于Westernblotting的預(yù)染蛋白MARKER7.2技術(shù)參數(shù)7.2.1即用型預(yù)染彩虹marker7.2.2分子量范圍：10kD-250kD，分子量依次為10kD、15kD、25kD、35kD、55kD、70kD、100kD、130kD、250kD7.2.3即用型上樣，無需煮沸，稀釋或添加還原劑7.2.4呈彩色，70和25kDa為橙色，10kDa為綠色7.2.5質(zhì)量可靠，每一批次都經(jīng)過SDS和Westernblotting檢測7.3配置需求：13支500ul包裝7.4質(zhì)量保證：提供的試劑盒≥12個(gè)月的質(zhì)量保證期8.WB上樣緩沖液8.1用于Westernblotting樣品上樣8.2技術(shù)參數(shù)8.2.1濃度：要求4X的濃度8.2.2含有LDS，不含SDS8.2.3PH值在7.6，室溫保存8.2.4在非還原性電泳中即用8.3配置要求：20支5ml包裝二：實(shí)驗(yàn)配套抗體1.技術(shù)參數(shù)1.1抗體進(jìn)行了敲除驗(yàn)證1.2有使用該抗體發(fā)表過多篇文獻(xiàn)報(bào)道1.3產(chǎn)品有16位的防偽碼及二維碼1.4部分需求特殊的兔單抗1.5抗體經(jīng)過了嚴(yán)格質(zhì)量控制（種屬和使用范圍驗(yàn)證）2.配置需求：心血管、炎癥、代謝相關(guān)的36種蛋白抗體三、通路集成抗體及試劑盒1.技術(shù)參數(shù)1.1信號通路中現(xiàn)有的集成抗體試劑盒1.2一個(gè)試劑盒能檢測多個(gè)蛋白1.3產(chǎn)品有16位的防偽碼及二維碼，可官網(wǎng)查真?zhèn)?.4抗體經(jīng)過了嚴(yán)格質(zhì)量控制（種屬和使用范圍驗(yàn)證）2.配置需求：心血管、炎癥、代謝相關(guān)通路關(guān)鍵蛋白的61種通路集成抗體試劑盒四、胎牛血清1.敏感嬌貴細(xì)胞培養(yǎng)用進(jìn)口優(yōu)質(zhì)胎牛血清2.技術(shù)參數(shù)2.1內(nèi)毒素含量：≤10EU/ml2.2血紅蛋白含量：≤30mg/dl2.3IgG水平小于5ug/ml2.4出廠時(shí)質(zhì)檢無病毒、支原體、衣原體3.配置需求：13瓶500ml包裝五、Annexin-FITC/PI檢測試劑盒1.本試劑盒用于流式方法檢測細(xì)胞凋亡。2.技術(shù)參數(shù)2.1能用于BD流式細(xì)胞儀檢測凋亡細(xì)胞2.2能夠同時(shí)進(jìn)行雙染色3.配置需求：需要1800次反應(yīng)二、售后服務(wù)1.質(zhì)