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免疫共沉淀技術(shù)第1頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月定義及原理操作流程優(yōu)點和不足注意事項應(yīng)用及實例展望第2頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月定義及原理免疫共沉淀定義
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CO-IP)也稱免疫共吸附或免疫下拉技術(shù),能夠從細胞裂解物中特異性的分離并富集目標蛋白。
CO-IP是通過抗原抗體之間的專一性作用為基礎(chǔ)來研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。也是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。第3頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月基本原理
在細胞裂解液中加入抗目的蛋白的抗體,孵育后再加入與抗體特異結(jié)合的偶聯(lián)于sepharosebeads上的proteinA/G,與細胞中的抗體結(jié)合,形成一種復(fù)合物:目的蛋白/目的蛋白-抗目的蛋白抗體-proteinA/G,經(jīng)過變性凝膠電泳,復(fù)合物分開。
最后通過免疫印跡或質(zhì)譜檢測目的蛋白。第4頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月原理流程示意圖第5頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月操作流程免疫共沉淀實驗流程(1)蛋白樣品準備(如果為細胞樣品需先裂解)(2)抗原抗體結(jié)合反應(yīng)(3)ProteinA/G與抗原抗體復(fù)合物結(jié)合
(4)免疫復(fù)合物與proteinA/G解離
(2%SDS煮沸處理)(5)分析鑒定(WesternBlot或質(zhì)譜分析)第6頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月實驗流程如圖所示第7頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月優(yōu)點和不足優(yōu)點1.可以分離到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物2.蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進行的,可以避免人為影響。缺點和局限性1.難以檢測蛋白質(zhì)的低親和力和短暫的相互作用2.不能夠確定第三種蛋白的橋聯(lián)作用第8頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月應(yīng)用及實例應(yīng)用領(lǐng)域:
免疫共沉淀實驗用途非常廣泛,但一般主要用于低豐度蛋白的富集和濃縮,為SDS和MS質(zhì)譜分析鑒定準備樣品。應(yīng)用范圍:1.尋找新的相互作用蛋白2.驗證目的蛋白和待測蛋白是否有相互作用第9頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月實例鼻咽癌細胞中p53相結(jié)合蛋白的分離和鑒定P53基因是一種人體抑癌基因,人體癌癥一半由于該基因突變失活1.抗P53抗體與HEN1和HEN2細胞總蛋白進行免疫共沉淀。2.SDS分離免疫沉淀復(fù)合物3.切取p53結(jié)合蛋白條帶,酶解后進行電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜分析,得到相應(yīng)肽列標簽4.搜索數(shù)據(jù)庫分析目的蛋白相關(guān)數(shù)據(jù)進行后續(xù)研究第10頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月染色質(zhì)免疫沉淀(CHIP)研究體內(nèi)DNA-蛋白質(zhì)相互作用的重要工具。它不僅可以靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA片段的結(jié)合情況,還可以用來研究組蛋白與基因表達的關(guān)系。第11頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月CHIP原理在活細胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物將其隨機切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段通過免疫學(xué)方法沉淀此復(fù)合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段對目的片斷的純化與檢測第12頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月操作步驟一、固定
在活細胞狀態(tài)下,用甲醛固定蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物,然后用化學(xué)(微球菌酶)或者機械(超聲波)的手段將其隨機切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段。二、免疫沉淀
利用目的蛋白質(zhì)的特異抗體通過抗原-抗體反應(yīng)形成DNA-蛋白質(zhì)-抗體復(fù)合體,然后沉淀此復(fù)合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段。三、純化與檢測
經(jīng)蛋白質(zhì)與DNA解偶聯(lián),DNA片段純化等處理后,用PCR等方法檢測DNA與蛋白質(zhì)的結(jié)合情況.第13頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月注意事項超聲波破碎條件的選擇抗體量的選擇PCR反應(yīng)條件的選擇Input對照陽性對照:如組蛋白抗體陰性對照:陰性引物條件選擇對照設(shè)置第14頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月基因表達:反式因子和順式作用元件之間相互作用。
真核生物的基因組DNA以染色質(zhì)的形式存在。研究蛋白質(zhì)與DNA
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