DNA的凝膠電泳瓊脂糖凝膠電泳含不同量瓊脂糖的凝膠的分離范圍凝膠中的瓊脂糖含量〔％（w/v）〕線狀DNA分子的有效分離范圍（kb）0.35—600.61－200.70.8—100.90.5—71.20.4—61.50.2—32.00.1—2常用電泳緩沖液緩沖液使用液濃儲存液（每升）Tris-乙酸(TAE)1x：0.04mol/LTris—乙酸0.001mol/LEDTA50x：242gTris堿57.1ml冰乙酸100ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)Tris-磷酸(TPE)1x:0.09mol/LTris-磷酸0.002mol/LEDTA10x:108gTris堿15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)40ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)Tris-硼酸(TBE)a0?5x:0.045mol/LTris硼酸0.001mol/LEDTA5x:54gTris堿27.5g硼酸20ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)堿性緩沖液b1x：50mmol/LNaOH1mmol/LEDTA1x:5ml10mol/LNaOH2ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)a.TBE濃溶液長時間存放后會形成沉淀物，為避免這一問題，可在室溫下用玻璃瓶保存5X溶液，出現(xiàn)沉淀后則予以廢棄。以往都以1XTBE作為使用液（即1：5稀釋濃貯存液）進行瓊脂糖凝膠電泳。但0.5X的使用液已具備足夠的緩沖容量。目前幾乎所有的瓊脂糖凝膠電泳都以1：10稀釋的貯存液作為使用液。進行聚丙烯酰胺凝膠電泳使用的1XTBE，是瓊脂糖凝膠電泳時使用液濃度的2倍。聚丙烯酰胺凝膠垂直槽的緩沖液槽較小，故通過緩沖液的電流通量通常較大，需要使用1XTBE以提供足夠的緩沖容量。b.堿性電泳緩沖液應現(xiàn)用現(xiàn)配。

凝膠加樣緩沖液緩沖液類型6X緩沖液貯存溫度I0.25%溴酚藍0.25%二甲苯青FF40%(w/v)蔗糖水溶液4°CII0.25%溴酚藍0.25%二甲苯青FF15%聚蔗糖(Ficoll)(400型；Pharmacia)水溶液室溫III0.25%溴酚藍0.25%二甲苯青FF30%甘油水溶液4CW0.25%溴酚藍40%(w/v)蔗糖水溶液4C堿性加樣緩沖液V300mmol/LNaOH6mmol/LEDTA18%聚蔗糖（Ficoll）（400型；Pharmacia）水溶液0.15%溴甲酚綠0.25%二甲苯青FF4C使用以上凝膠加樣緩沖液的目的有三：增大樣品濃度，以確保DNA均勻進入樣品孔內(nèi)；使樣品呈現(xiàn)顏色，從而使加樣操作更為便利；含有在電場中能以可預知速率向陽極泳動的染料。溴酚藍在瓊脂糖凝膠中泳動的速率約為二甲苯青FF的2.2倍，而與瓊脂糖濃度無關。以0.5XTBE作電泳液時，溴酚藍在瓊脂糖中的泳動速率約與長300bp的雙鏈DNA相同，而二甲苯青FF的泳動則與長4kb的雙鏈線狀DNA相同。在瓊脂糖濃度為0.5—1.4%的范圍內(nèi)，這些對應關系受凝膠濃度變化的影響并不顯著。選用哪一種加樣染料純屬個人喜惡。但是，對于堿性凝膠應當使用溴甲酚綠作為示蹤染料，因為在堿性pH條件下其顯色較溴酚藍更為鮮明。聚丙烯酰胺凝膠電泳DNA在聚丙烯酰胺凝膠中的有效分離范圍丙烯酰胺〔％（w/v）〕a有效分離范圍（bp）二甲苯青FFb溴酚藍b3.51000—20004601005.080－500260658.060—4001604512.040—200702015.025—150601520.06—1004512N,N'-亞甲基雙丙烯酰胺占丙烯酰胺濃度的1/3.給出的數(shù)字是遷移率與染料相同的雙鏈DNA片斷的粗略大小（核苷酸對）30％丙烯酰胺：丙烯酰胺29gN,N'-亞甲基雙丙烯酰胺1g加水至100ml將溶液加熱至37°C使化學藥品溶解小心：丙烯酰胺是強烈的神經(jīng)毒素，可經(jīng)皮膚吸收。丙烯酰胺的作用具有累積性。稱取粉末狀丙烯酰胺及亞甲雙丙烯酰胺時必須帶手套和面具。取用含上述化學藥品的溶液也要戴手套。盡管可以認為聚丙烯酰胺無毒，但鑒于其中可能含有少量未聚合的丙烯酰胺，故仍應小心處理。10％過硫酸銨過硫酸銨1g加水至10ml可在4C保存數(shù)周。制備聚丙烯酰胺凝膠所用試劑的體積（總體積100ml）制備不同濃度（％）凝膠所用試劑的毫升數(shù)試劑-3.5%5.0%8.0%12.0%20.0%30％丙烯酰胺11.616.626.640.066.6水67.762.752.739.312.75