江南大學(xué)801生物化學(xué)總結(jié)-名詞解釋_第1頁(yè)
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江南大學(xué)801生物化學(xué)總結(jié)名詞解釋?zhuān)ㄕ鹿?jié)版)第0章緒論1、生物化學(xué)Biochemistry:可以認(rèn)為是生命的化學(xué),是研究微生物、植物、動(dòng)物及人體等的化學(xué)組成和生命過(guò)程中的化學(xué)變化的一門(mén)科學(xué)。第1章糖類(lèi)Carbohydrates1、糖類(lèi)Carbohydrates:多羥基醛或多羥基酮及其縮聚物和衍生物的總稱(chēng)。2、手性碳原子:又稱(chēng)不對(duì)稱(chēng)碳原子(asymmetriccarbonatom)是指與四個(gè)不同的原子或原子基團(tuán)共價(jià)連接并因而失去對(duì)稱(chēng)性的四面體碳,也稱(chēng)手性碳原子、不對(duì)稱(chēng)中心或手性中心,常用C*表示。3、旋光性opticalactivity:旋光物質(zhì)使平面偏振光的偏振面發(fā)生旋轉(zhuǎn)的能力,又稱(chēng)為光學(xué)活性或旋光度。4、旋光異構(gòu)體opticalisomers:是一組至少存在一對(duì)不可疊合的鏡像體的立體異構(gòu)體。5、構(gòu)型Configuration:指在立體異構(gòu)體中不對(duì)稱(chēng)碳原子上相連的各原子或取代基團(tuán)特有的、固定的空間排布。構(gòu)型的轉(zhuǎn)變伴隨著共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。6、差向異構(gòu)體epimer:僅一個(gè)手性碳原子的構(gòu)型不同的非對(duì)映異構(gòu)體稱(chēng)為差向異構(gòu)體。如葡萄糖,甘露糖,半乳糖7、異頭碳原子anomericC1:羰基碳原子變成的不對(duì)稱(chēng)碳原子稱(chēng)異頭碳原子。也就是半縮醛碳原子。異頭物anomer:羰基碳上形成的兩種差向異構(gòu)體稱(chēng)異頭物。α-型異頭物:異頭碳羥基與Cn-1*-OH在同側(cè);β-型異頭物:異頭碳羥基與Cn-1*-OH在相反側(cè)7.1、α-和β-異頭物:葡糖糖分子形成環(huán)狀半縮醛之后,C1原子也變成了不對(duì)稱(chēng)碳原子,半縮醛羥基可產(chǎn)生兩種不同的排列方位,因此形成了α-和β-兩種異頭物,α-型的羥基位于決定構(gòu)型的羥基的同側(cè),α-型則位于相反的一側(cè)。8、變旋現(xiàn)象mutarotation:在新配置的單糖溶液中,由于α-型與β-型可通過(guò)開(kāi)鏈結(jié)構(gòu)相互轉(zhuǎn)化,從而引起溶液旋光性改變的現(xiàn)象。9、哈沃斯式結(jié)構(gòu)HaworthProjections:1926年Haworth提出用透視式表達(dá)糖的環(huán)狀結(jié)構(gòu),透視式中省略了構(gòu)成環(huán)的碳原子,原向右的羥基處于平面下,向左羥基處于平面上;透視式中,D、L和α、β的確定分別是以C5上羥甲基和C1半縮醛羥基在含氧環(huán)上的排布而確定的。10、構(gòu)象Conformation:指有機(jī)分子中,不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周?chē)脑有D(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí),不涉及共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會(huì)改變分子的光學(xué)活性。11、雙糖Disaccharides:是由兩個(gè)單糖分子以α-或β-糖苷鍵結(jié)合而成的。12、淀粉的糊化Gelatinization:將淀粉的乳濁液加熱,淀粉粒會(huì)吸水溶脹,至一定溫度時(shí),體積膨脹幾十倍,淀粉粒解體,淀粉分子均勻分散成粘性很大的膠體溶液的過(guò)程。13、淀粉的老化Ageing/退行Retrogradation:糊化淀粉溶液經(jīng)緩慢冷卻,會(huì)變渾濁,甚至產(chǎn)生凝結(jié)沉淀的現(xiàn)象。14、糊精:是淀粉從輕度水解直到變成寡糖之間各種不同分子量中間產(chǎn)物的總稱(chēng)。極限糊精limitdexitrin:是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部位,該部位經(jīng)支鏈淀粉酶的水解作用,糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶的作用后仍然存在,進(jìn)一步降解需要α(1→6)糖苷鍵的水解。15、蛋白聚糖(proteoglycan,PG):蛋白聚糖是一類(lèi)特殊的糖蛋白,由一條或多條糖胺聚糖和一個(gè)核心蛋白共價(jià)連接而成。16、肽聚糖peptidoglycan:是以NAG與NAM組成的多糖鏈為骨干與四肽連接所成的雜多糖。是許多細(xì)菌細(xì)胞壁的主要成分,可以保護(hù)細(xì)菌細(xì)胞不易受損。17、單糖Monosaccharides:不能水解成更小分子的糖類(lèi)。18、寡糖/低聚糖Oligosaccharides:由2~20個(gè)單糖通過(guò)糖苷鍵連接而成的糖類(lèi)物質(zhì)。19、多糖Polysaccharides:由20個(gè)以上的單糖通過(guò)糖苷鍵連接而成的聚合物。20、結(jié)合糖/復(fù)合糖Glycoconjugate:是指糖與非糖物質(zhì)的結(jié)合物,常見(jiàn)的是與蛋白是的結(jié)合物,分布廣泛,功能多樣,分為蛋白多糖和糖蛋白。21、異構(gòu)isomerism:是指存在兩個(gè)或多個(gè)具有相同數(shù)目和種類(lèi)的原子并因而具有相同相對(duì)分子質(zhì)量的化合物。22、比旋:又叫旋光率specificrotation:?jiǎn)挝粷舛群蛦挝婚L(zhǎng)度下的旋光度。23、還原糖reducingsugar:羰基碳/異頭碳沒(méi)有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當(dāng)還原劑的糖。24、糖苷glycoside:環(huán)狀單糖的半縮醛羥基/半縮酮羥基與另一化合物發(fā)生縮合形成的縮醛/縮酮。25、糖苷鍵glycosidebond:一個(gè)糖的半縮醛羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛鍵/縮酮鍵,常見(jiàn)的糖苷鍵有O—糖苷鍵、N—糖苷鍵。26、糖原glycogen:是含有分支的α(1→4)糖苷鍵的葡萄糖殘基的同聚物,之戀在分支點(diǎn)處通過(guò)α(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。分為肝糖原和肌糖原。27、纖維素cellulose:纖維素是線形葡聚糖,殘基間通過(guò)β(1→4)糖苷鍵連接的纖維二糖可看成是它的二糖單位,是植物(包括某些真菌和細(xì)菌)的結(jié)構(gòu)多糖,是它們的細(xì)胞壁的主要成分。28、半纖維素hemicellulose:是指堿溶性的的植物細(xì)胞壁多糖,也即出去果膠物質(zhì)后的殘留物能被15%NaOH提取的多糖。29、受體receptor:是指位于細(xì)胞膜上,細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中能與來(lái)自胞外的生物活性分子(信號(hào)分子)專(zhuān)一結(jié)合并將帶來(lái)的信息傳遞給效應(yīng)器(如離子通道、酶等),從而引起相應(yīng)生物學(xué)效應(yīng)的生物大分子。30、糖蛋白glycoproteins:是指以蛋白質(zhì)分子為主體,在一定部位以共價(jià)鍵與若干短鏈(2~10個(gè)以上)糖殘基相結(jié)合所形成的復(fù)合物,在體內(nèi)具有非常重要的生理作用。31、醛糖aldose:一類(lèi)單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C1)是一個(gè)醛基酮糖ketose:一類(lèi)單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C2)是一個(gè)酮基32、吡喃糖pyranose和呋喃糖furanose:在單糖的水溶液中,C5羥基和C1醛基之間發(fā)生半縮醛化之后形成的六元環(huán)狀結(jié)構(gòu)成為吡喃糖。單糖在C5羥基和C2酮基之間發(fā)生半縮酮化之后形成的五元環(huán)狀結(jié)構(gòu)成為呋喃糖。33、淀粉starch:是一種多糖,是葡萄糖殘基的同聚物,有兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是由α-D-葡萄糖經(jīng)α-1,4-糖苷鍵脫水縮合而成的線性大分子,易溶于水,無(wú)分支。另一種是支鏈淀粉:主鏈由α-D-葡萄糖經(jīng)α-1,4-糖苷鍵脫水縮合而成;支鏈(長(zhǎng)約24~30個(gè)殘基):由α-1,6-葡萄糖苷鍵連接到主鏈上,每個(gè)分支點(diǎn)間隔約8~9個(gè)殘基。34、葡萄糖效應(yīng)glucoseeffect(二次生長(zhǎng)現(xiàn)象diauxie):將大腸桿菌培養(yǎng)在含乳糖和葡萄糖的培養(yǎng)基上,發(fā)現(xiàn)該菌優(yōu)先利用葡萄糖,在葡萄糖耗盡后才開(kāi)始利用乳糖。因而產(chǎn)生了在兩個(gè)對(duì)數(shù)期之間隔著一個(gè)生長(zhǎng)延滯期的現(xiàn)象,稱(chēng)為二次生長(zhǎng)現(xiàn)象,研究其原因發(fā)現(xiàn)葡萄糖的存在阻遏了分解乳糖酶系的合成,因此這一現(xiàn)象又稱(chēng)為葡萄糖效應(yīng)。35、巴斯德效應(yīng)Pasteureffect:是指在酒精發(fā)酵過(guò)程中,在有氧情況下,由于呼吸作用,酒精產(chǎn)量大大下降,糖的消耗速率大幅減慢的現(xiàn)象,由于此現(xiàn)象由巴斯德發(fā)現(xiàn),因此這種有氧呼吸抑制發(fā)酵的作用稱(chēng)為巴斯德效應(yīng)。第2章脂質(zhì)1ipid1、脂質(zhì)1ipid(脂類(lèi)或類(lèi)脂):是一類(lèi)低溶于水而高溶于非極性溶劑的生物有機(jī)分子。對(duì)大多數(shù)脂質(zhì)而言,其化學(xué)本質(zhì)是:脂肪酸和醇所形成的酯類(lèi)及其衍生物。2、脂肪酸fattyacid,F(xiàn)A:是由一條長(zhǎng)的烴鏈(“尾”)和一個(gè)末端羧基(“頭”)組成的羧酸。RCOOH飽和脂肪酸saturatedfattyacid:烴鏈不含雙鍵(和三鍵)的為飽和脂肪酸。軟脂酸(16C)、硬脂酸(18C)不飽和脂肪酸unsaturatedfattyacid:含一個(gè)或多個(gè)雙鍵的為不飽和脂肪酸。油酸、亞油酸、亞麻酸、花生四烯酸、EPA、DHA3、必需脂肪酸essentialfattyacid:為人體生長(zhǎng)所必需但又不能自身合成,必須從食物中攝取的脂肪酸。在脂肪中有三種脂肪酸是人體所必需的,即亞油酸,亞麻酸,花生四烯酸。4、脂肪酸的α-氧化α-oxidation:α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游離脂肪酸作為底物,有分子氧間接參與,經(jīng)脂肪酸過(guò)氧化物酶催化作用,由α碳原子開(kāi)始氧化,氧化產(chǎn)物是D-α-羥脂肪酸或少一個(gè)碳原子的脂肪酸。5、脂肪酸的β-氧化β-oxidation:脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下,在α碳原子和β碳原子之間斷裂,β碳原子氧化成羧基生成含2個(gè)碳原子的乙酰CoA和比原來(lái)少2個(gè)碳原子的脂酰CoA。6、脂肪酸ω-氧化ω-oxidation:ω-氧化是C5、C6、C10、C12脂肪酸在遠(yuǎn)離羧基的烷基末端碳原子被氧化成羥基,再進(jìn)一步氧化而成為羧基,生成α,ω-二羧酸的過(guò)程。7、檸檬酸穿梭citriateshuttle:就是線粒體內(nèi)的乙酰CoA與草酰乙酸縮合成檸檬酸,然后經(jīng)內(nèi)膜上的三羧酸載體運(yùn)至胞液中,在檸檬酸裂解酶催化下,需消耗ATP將檸檬酸裂解回草酰乙酸和乙酰CoA,后者就可用于脂肪酸合成,而草酰乙酸經(jīng)還原后再氧化脫羧成丙酮酸,丙酮酸經(jīng)內(nèi)膜載體運(yùn)回線粒體,在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸,這樣就可又一次參與轉(zhuǎn)運(yùn)乙酰CoA的循環(huán)。8、乙酰CoA羧化酶系acetyl-CoAcarnoxylase:大腸桿菌乙酰CoA羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基載體蛋白(BCCP)和轉(zhuǎn)羧基酶三種組份,它們共同作用催化乙酰CoA的羧化反應(yīng),生成丙二酸單酰-CoA。9、脂肪酸合酶系統(tǒng)fattyacidsynthasesystem:脂肪酸合酶系統(tǒng)包括酰基載體蛋白(ACP)和6種酶,它們分別是:乙酰轉(zhuǎn)酰酶;丙二酸單酰轉(zhuǎn)酰酶;β-酮脂酰ACP合成酶;β-酮脂酰ACP還原酶;β-羥;脂酰ACP脫水酶;烯脂酰ACP還原酶。10、皂化值(價(jià))/酸值acidnumber:油脂的堿水解作用稱(chēng)皂化作用。皂化1g油脂所需的KOHmg數(shù)稱(chēng)為皂化值(價(jià))。皂化值是三酰甘油中脂肪酸平均鏈長(zhǎng)即三酰甘油(TG)平均相對(duì)分子質(zhì)量的量度。11、碘值(價(jià)):指100g油脂鹵化時(shí)所能吸收碘的克數(shù)。12、乙酰值:指1g乙?;挠椭纸獬龅囊宜嵊肒OH中和時(shí),所需KOH的mg數(shù)。反映油脂的羥基化程度。13、神經(jīng)酰胺(ceramide,Cer):是脂肪酸通過(guò)酰胺鍵與鞘氨醇的—NH2相連形成的,是鞘脂類(lèi)(鞘磷脂和鞘糖脂)共同的基本結(jié)構(gòu)。14、糖脂Glycosphingolipids:糖通過(guò)其半縮醛羥基以糖苷鍵與脂質(zhì)連接的化合物。15、類(lèi)固醇steroid:也稱(chēng)甾(zai)類(lèi),這類(lèi)化合物的結(jié)構(gòu)以環(huán)戊烷多氫菲為基礎(chǔ)。是由3個(gè)六元環(huán)(A、B、C環(huán))和一個(gè)五元環(huán)(D環(huán))稠合而成。16、萜terpene:是由兩個(gè)或多個(gè)異戊二烯單位連接而成。17、脂蛋白1ipoprotein:是由脂質(zhì)和蛋白質(zhì)以非共價(jià)鍵(疏水相互作用、范德華力和靜電引力)結(jié)合而成的復(fù)合物。脂蛋白中的蛋白質(zhì)部分稱(chēng)脫輔基脂蛋白或載脂蛋白(apolipoprotein,apo)。18、乳靡微粒(chylomicronCM):由小腸上皮細(xì)胞合成,主要來(lái)自食物油脂,顆粒大,使光散射,呈乳濁狀,這是用餐后血清渾濁的原因。其比重小,在4℃冰箱過(guò)夜時(shí),上浮形成乳白色奶油樣層,是臨床檢驗(yàn)的簡(jiǎn)易方法。主要生理功能是轉(zhuǎn)運(yùn)外源油脂。19、極低密度脂蛋白(verylowdensitylipoprotein,VLDL):有肝細(xì)胞合成,主要成分也是油脂。當(dāng)血液流經(jīng)油脂組織、肝和肌肉等組織的毛細(xì)血管時(shí),乳糜微粒和VLDL被毛細(xì)血管壁脂蛋白脂酶水解,所以正常人空腹時(shí)不易檢出乳糜微粒和VLDL。主要生理功能是轉(zhuǎn)運(yùn)內(nèi)源油脂,如肝臟中由葡萄糖轉(zhuǎn)化生成的脂類(lèi)。20、低密度脂蛋白(lowdensitylipoprotein,LDL):來(lái)自肝臟,富含膽固醇,磷脂。主要生理功能是轉(zhuǎn)運(yùn)膽固醇和磷脂到肝臟。含量過(guò)高易患動(dòng)脈粥樣硬化。電泳時(shí)稱(chēng)為β脂蛋白。21、高密度脂蛋白(highdensitylipoprotein,HDL):來(lái)自肝臟,其顆粒最小,脂類(lèi)主要是磷脂和膽固醇。主要生理功能是轉(zhuǎn)運(yùn)磷脂和膽固醇??杉せ钪久?,清除膽固醇。22、極高密度脂蛋白(VHDL):由清蛋白和游離脂肪酸構(gòu)成,前者由肝臟合成,在油脂組織中組成VHDL。主要生理功能是轉(zhuǎn)運(yùn)游離脂肪酸。23、兩親化合物amphipathiccompound:具有極性頭(親水)和非極性尾(親脂)的分子。24、蠟wax:是不溶于水的固體,由長(zhǎng)鏈脂肪酸和長(zhǎng)鏈一元醇或固醇形成的酯,其硬度由烴鏈的長(zhǎng)度和飽和度決定。長(zhǎng)鏈?zhǔn)侵笩N基碳數(shù)為16或16以上者。簡(jiǎn)單蠟酯的通式為RCOOR。25、自由基freeradical:也成為游離基,是指含有奇數(shù)價(jià)電子并因此在一個(gè)軌道上具有一個(gè)不成對(duì)的原子或原子團(tuán)。26、抗氧化劑antioxidant:具有還原性而能抑制靶分子自動(dòng)氧化,即抑制自由基鏈反應(yīng)的物質(zhì)。27、磷脂phospholipid:是指含的非脂成分為磷酸和氮堿(如膽堿,乙醇胺)的脂質(zhì)。磷脂根據(jù)醇成分的不同,又可分為甘油磷脂(如磷脂酸、磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺等)和鞘氨醇磷脂(簡(jiǎn)稱(chēng)鞘磷脂)。28、鞘磷脂sphingomyelin:即鞘氨醇磷脂phosphosphingolipid,是由鞘氨醇、脂肪酸和磷酰膽堿(少數(shù)是磷酰乙醇胺)組成。29、甘油磷脂glyceriophospholipid:也稱(chēng)為磷酸甘油酯phophoglyceride,由甘油、脂肪酸、磷酸和其他基團(tuán)(如膽堿、氨基乙醇、絲氨酸、脂酰基等中的一種或兩種)所組成,是磷脂酸的衍生物。30、生物膜biologicalmembrane:是指細(xì)胞的外周膜和內(nèi)膜系統(tǒng)。31、外周膜蛋白peripheralmembraneprotein:通過(guò)與膜脂的極性頭部或內(nèi)在膜蛋白的例子相互作用而形成氫鍵,與膜的內(nèi)或外表面若結(jié)合的膜蛋白。32、內(nèi)在膜蛋白integralmembraneprotein:插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。33、血漿脂蛋白plasma1ipoprotein:是指血漿中的脂類(lèi)不以自由狀態(tài)存在,而是與血漿中的蛋白質(zhì)結(jié)合,以脂蛋白的形式存在,是一種具有運(yùn)輸功能的脂蛋白。34、卵磷脂lecithin:即磷脂酰膽堿PC,是磷脂酰與膽堿形成的復(fù)合物。35、腦磷脂cephalin:即磷脂酰乙醇胺PE,是磷脂酰與乙醇胺形成的復(fù)合物。36、流動(dòng)鑲嵌模型fluidmosaicmodel:是singer在1972年根據(jù)膜的不對(duì)稱(chēng)性和流動(dòng)性提出來(lái)的生物膜的結(jié)構(gòu)模型。在這個(gè)模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層,脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對(duì)稱(chēng)性,有的蛋白質(zhì)鑲在脂雙層表面,有的部分或全部嵌入其內(nèi)部,有的則橫跨整個(gè)膜,另外脂質(zhì)和膜蛋白可以進(jìn)行橫向擴(kuò)散運(yùn)動(dòng)。37、通透系數(shù)permeabilitycoefficient:是離子或小分子擴(kuò)散過(guò)脂雙層能力的一種度量,通透系數(shù)的大小與這些離子或分子在非極性溶液中溶解度成比例。第3章氨基酸Aminoacid1、必需氨基酸(essentialaminoacid):指人體(和其它哺乳動(dòng)物)自身不能合成,機(jī)體又必需,需要從飲食中獲得的氨基酸。包括Val,Leu,Ile,Lys,Met,Thr,Phe,Trp八種2、半必需氨基酸:人和哺乳動(dòng)物雖然能夠合成,但數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)達(dá)不到機(jī)體需求的氨基酸,尤其是在胚胎發(fā)育以及嬰幼兒期間,只有Arg、His兩種。3、非必需氨基酸:人和哺乳動(dòng)物能夠合成,能滿(mǎn)足機(jī)體需求的氨基酸,包括Asp,Glu,Gly,Ala,Pro,Cys,Tyr,Ser,Asn,Gln十種。4、氨基酸的等電點(diǎn)(pI):氨基酸分子中所帶正負(fù)電荷相等,即靜電荷為零時(shí)的溶液pH值,用符號(hào)pI表示。5、兩性離子(dipolarion):指在同一氨基酸分子上含有等量的正負(fù)兩種電荷,又稱(chēng)兼性離子或偶極離子。6、稀有氨基酸(rareaminoacid):指存在于蛋白質(zhì)中的20種常見(jiàn)氨基酸以外的其它罕見(jiàn)氨基酸,它們是正常氨基酸的衍生物。第4章蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)構(gòu)ProteinStructure1、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)(proteinprimarystructure):指肽鏈中的氨基酸排列順序和連接方式。它是一個(gè)無(wú)空間概念的一級(jí)結(jié)構(gòu)。一級(jí)結(jié)構(gòu)包括肽鍵和二硫鍵連接。2、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)(proteinsecondarystructure):指在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤(pán)繞和折疊的方式,不涉及側(cè)鏈的構(gòu)象及整個(gè)肽鏈的空間排列。它是完整肽鏈構(gòu)象的結(jié)構(gòu)單元(構(gòu)象單元)。3、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)(proteintertiarystructure):指蛋白質(zhì)在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級(jí)鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。4、肽鍵(peptidebond):蛋白質(zhì)分子中一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)氨基酸的氨基脫水縮合所形成的酰胺鍵即為肽鍵。5、氫鍵(hydrogenbond):指負(fù)電性很強(qiáng)的氧原子或氮原子與N-H或O-H的氫原子間的相互吸引力。6、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)(proteinquaternarystructure):指多亞基蛋白質(zhì)分子中各個(gè)具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。是指由相同或不同的稱(chēng)作亞基(subunit)的亞單位按照一定排布方式聚合而成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),亞基本身都具有球狀三級(jí)結(jié)構(gòu),一般只包含一條多肽鏈,也有的由二條或二條以上由二硫鍵連接的肽鏈組成。7、肽單位(肽單元):在多肽鏈中,從一個(gè)αC原子到相鄰的下一個(gè)αC原子,包括-Cα-CO-NH-Cα-,組成一個(gè)肽單位。除了第一和最后一個(gè)αC原子外,每一個(gè)αC原子均屬于兩個(gè)這樣的肽單位。8、肽平面:由于肽鍵具有部分雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn),所以連接在肽鍵兩端原子上的基團(tuán)均處于一個(gè)平面上,這個(gè)平面就叫做肽平面。肽鍵兩側(cè)的αC原子、參與組成肽鍵的羧基碳及其氧原子和α氨基氮及其氫原子都處于肽平面之中。9、范德華力(vanderWaalsforce):中性原子之間通過(guò)瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子間的力。當(dāng)兩個(gè)原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時(shí),范德華力最強(qiáng)。10、疏水作用(hydrophobicinteraction):在水介質(zhì)中,促使疏水基團(tuán)聚集于大分子內(nèi)部的、非極性分子之間的弱的、非共價(jià)的相互作用,這是一種由熵驅(qū)動(dòng)的過(guò)程。如蛋白質(zhì)分子中的疏水側(cè)鏈避開(kāi)水相而相互聚集而形成的作用力。11、離子鍵(ionicbond):也稱(chēng)為靜電鍵或鹽鍵,是正負(fù)電荷之間的靜電相互作用。F=Q1Q2/εR212、二硫鍵disulfatebond:通過(guò)兩個(gè)巰基的氧化形成的共價(jià)鍵。其在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要作用。第5章蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)1、α螺旋α—helix:也稱(chēng)3.613-螺旋,是蛋白質(zhì)中最常見(jiàn)、最典型、含量最豐富的二級(jí)結(jié)構(gòu)元件,是一種重復(fù)性結(jié)構(gòu),每圈螺旋占3.6個(gè)氨基酸殘基,沿螺旋軸方向(螺距)上升0.54nm,每個(gè)殘基繞軸旋轉(zhuǎn)100。殘基的側(cè)鏈伸向外側(cè)。2、β折疊片β—pleatedsheet:是一種重復(fù)性的結(jié)構(gòu),可以把它想象為由折疊的條狀紙片側(cè)向并排而成。肽主鏈沿紙條形成鋸齒狀。氫鍵是在片層間而不是片層內(nèi)形成。折疊片上的側(cè)鏈都垂直于折疊片的平面,并交替地從平面上下二側(cè)伸出。3、超二級(jí)結(jié)構(gòu)super—secondarystruture:指蛋白質(zhì)分子中相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單位(主要是α-螺旋和β-折疊)組合在一起所形成的有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。主要的組合形式有四種,分別為:αα、βαβ、βββ、αβα。4、結(jié)構(gòu)域structuraldomain:指蛋白質(zhì)多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步卷曲折疊成幾個(gè)相對(duì)獨(dú)立的、以松散肽鏈相連的、近似球形的組裝體。5、亞基subunit:四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)中每個(gè)球狀蛋白質(zhì)稱(chēng)為亞基,亞基一般是一條多肽鏈。亞基有時(shí)也稱(chēng)單體6、單體蛋白質(zhì):僅由一個(gè)亞基組成并因此無(wú)四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)稱(chēng)為單體蛋白質(zhì)。7、別構(gòu)效應(yīng)allostericeffect:是指調(diào)節(jié)物或效應(yīng)物與酶的別構(gòu)中心結(jié)合后,引起酶蛋白構(gòu)象的變化,使得酶的活性中心對(duì)底物的結(jié)合與催化作用收到影響,從而調(diào)節(jié)酶催反應(yīng)速度計(jì)代謝過(guò)程的效應(yīng)。8、鹽析saltingout:在蛋白質(zhì)溶液中加入一定量的高濃度中性鹽(如硫酸銨),使蛋白質(zhì)溶解度降低并沉淀析出的現(xiàn)象稱(chēng)為鹽析。9、鹽溶saltingin:在蛋白質(zhì)溶液中加入少量中性鹽使蛋白質(zhì)溶解度增加的現(xiàn)象。10、蛋白質(zhì)的變性denaturationoftheprotein:蛋白質(zhì)分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機(jī)溶劑以及一些變性劑的作用時(shí),次級(jí)鍵遭到破壞導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,但其一級(jí)結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變。11、蛋白質(zhì)的復(fù)性renaturationoftheprotein:指在一定條件下,變性的蛋白質(zhì)分子恢復(fù)其原有的天然構(gòu)象并恢復(fù)生物活性的現(xiàn)象12、蛋白質(zhì)的沉淀作用(precipitation):在外界因素影響下,蛋白質(zhì)分子失去水化膜或被中和其所帶電荷,導(dǎo)致溶解度降低從而使蛋白質(zhì)變得不穩(wěn)定而沉淀的現(xiàn)象稱(chēng)為蛋白質(zhì)的沉淀作用。13、協(xié)同效應(yīng):變構(gòu)作用在亞基間有協(xié)同效應(yīng),即酶的一個(gè)亞基與配基結(jié)合后發(fā)生變構(gòu)作用,從而影響整個(gè)酶分子的其他亞基發(fā)生相應(yīng)的變化,改變對(duì)后繼配基的親和力,分為正協(xié)同效應(yīng)和負(fù)協(xié)同效應(yīng)。14、正協(xié)同效應(yīng):是指酶的一個(gè)亞基與配基結(jié)合后,影響其他亞基發(fā)生同向的變化,即一個(gè)亞基與變構(gòu)激活劑結(jié)合,構(gòu)象改變,活力增加,其他亞基的協(xié)同變化也是活力增加。15、負(fù)協(xié)同效應(yīng):是指酶的一個(gè)亞基與配基結(jié)合后,發(fā)生構(gòu)象和活性的改變,影響其他亞基發(fā)生同反的變化。第6章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系1、波爾效應(yīng)(Bohr效應(yīng)):CO2濃度的增加可降低細(xì)胞內(nèi)的pH,引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降的現(xiàn)象?!|(zhì)子和CO2促進(jìn)血紅蛋白釋放氧的效應(yīng)。即去氧血紅蛋白對(duì)H+的親和力比氧合血紅蛋白大。因此,增加H+濃度(降低pH)將提高O2從血紅蛋白中的釋放。2、沉降常數(shù)svedberg:每單位引力場(chǎng)沉降分子下沉的速度,以s表示。3、鐮刀形細(xì)胞貧血癥sickle-cellanemia:血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞稱(chēng)鐮刀狀。其特點(diǎn)是病人的血紅蛋白的β亞基N-端的第六位氨基酸殘基是纈氨酸Val,而不是正常下的谷氨酸殘基Glu。4、血紅蛋白hemoglobin:是由含有血紅素輔基的4個(gè)亞基組成的結(jié)合蛋白。負(fù)責(zé)將氧由肺運(yùn)輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為S型。5、肌紅蛋白myoglobin:是由一條肽鏈和一個(gè)血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白。是肌肉內(nèi)儲(chǔ)存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。第7章蛋白質(zhì)的分離、純化和表征1、蛋白質(zhì)電泳(Electrophoresis):在不同的pH環(huán)境下,蛋白質(zhì)的電學(xué)性質(zhì)不同。在大于等電點(diǎn)的溶液中,蛋白質(zhì)粒子帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極移動(dòng);在小于等電點(diǎn)的溶液中,蛋白質(zhì)粒子帶正電荷,在電場(chǎng)中向負(fù)極移動(dòng)。這種現(xiàn)象稱(chēng)為蛋白質(zhì)電泳。2、透析(dialysis):是利用蛋白質(zhì)分子不能通過(guò)半透膜的性質(zhì),使蛋白質(zhì)和其他小分子物質(zhì)如無(wú)機(jī)鹽、單糖等分開(kāi)。常用的半透膜是玻璃紙和其他改型的纖維素材料。3、超濾ultrafiltration:是指利用蛋白質(zhì)不能通過(guò)半透膜的性質(zhì),去除樣品中的小分子的非蛋白質(zhì)物質(zhì),具體操作為利用壓力或離心力,強(qiáng)行使水和其他小分子溶質(zhì)通過(guò)半透膜,而蛋白質(zhì)被截留在膜上,以達(dá)到濃縮和脫鹽的目的。4、電泳(electrophoresis):在外電場(chǎng)的作用下,帶電顆粒,向著與其電性相反的電極移動(dòng),這種現(xiàn)象稱(chēng)為電泳。5、聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamindegelelectrophoresis,簡(jiǎn)稱(chēng)PAGE):也稱(chēng)圓盤(pán)電泳,它是在區(qū)帶電泳的基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的。它以聚丙烯酰胺凝膠為支持物,一般制作成凝膠柱或凝膠板,6、等電聚焦凝膠電泳(IEF):在電泳支持介質(zhì)中加入載體兩性電解質(zhì)(carrierampholytes),通以直流電后在正負(fù)極之間形成穩(wěn)定、連續(xù)和線性的pH梯度,蛋白質(zhì)在pH梯度凝膠中受電場(chǎng)力作用下泳動(dòng),它的分離僅僅決定于其本身的等電點(diǎn)。7、分子篩效應(yīng):大小和形狀不同的蛋白質(zhì)通過(guò)一定孔徑分離膠時(shí),受阻滯的程度不同而表現(xiàn)出不同的遷移率,這就是分子篩效應(yīng)。8、雙向電泳(two-dimensionalelectrophoresis):是等電聚膠電泳和SDS的結(jié)合,即先進(jìn)行等電聚膠電泳,按pI分離,然后在進(jìn)行SDS按分子大小分離,經(jīng)染色的得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。9、毛細(xì)管電泳(capillaryelectrophoresis):是以彈性石英毛細(xì)管(內(nèi)徑為25-100微米散熱性好)為分離通道,以高壓電場(chǎng)(可高至30千伏)為驅(qū)動(dòng)力,依據(jù)樣品中各組分之間帶電性和分配行為上的差異而實(shí)現(xiàn)的電泳分離的分析方法。10、層析chromatography:按照在移動(dòng)相和固定相(可以是氣體或液體)之間的分配比例,將混合分子分開(kāi)的技術(shù)。11、親和層析(affinitychromatography):是利用蛋白質(zhì)分子對(duì)其配體分子特有的識(shí)別能力,也即生物學(xué)親和力(底物和酶,抗原與抗體,酶與抑制劑,受體與底物等),建立起來(lái)的一種有效的純化方法。它經(jīng)常只需要經(jīng)過(guò)一步的處理即可將某種所需蛋白質(zhì)從復(fù)雜的混合物中分離出來(lái),并且純度相當(dāng)高。12、離子交換層析ion-exchangecolum:使用帶有固定的帶電基團(tuán)的聚合樹(shù)脂或凝膠的層析。13、凝膠過(guò)濾層析gelfiltrationchromatography:也叫做分子排阻層析,一種利用帶孔凝膠珠做基質(zhì),按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物的層析技術(shù)。14、高效液相色譜層析HPLC:15、吸附層析:就是利用待純化的分子和雜質(zhì)分子與吸附劑之間的吸附能力和解吸性質(zhì)不同而達(dá)到分離目的的。第8章酶通論1、酶Enzyme:又稱(chēng)為生物催化劑,由活細(xì)胞產(chǎn)生的,對(duì)底物具有極高催化效能和高度專(zhuān)一性的蛋白質(zhì)或核酸2、單體酶monomericenzyme:由一條多肽鏈組成,多是催化水解反應(yīng)的酶,相對(duì)分子質(zhì)量在13000~35000之間,如脲酶、溶菌酶、RNaseA、胃蛋白酶、胰蛋白酶。3、寡聚酶oligomericenzyme:由數(shù)個(gè)亞基組成,這亞基可以使相同的,也可以是不同的,絕大多數(shù)都含有偶數(shù)個(gè)亞基,亞基之間靠次級(jí)鍵結(jié)合,彼此容易分開(kāi),M>35000,大多數(shù)寡聚酶的聚合形式是活性形式,而解聚形式是失活形式。相當(dāng)數(shù)量的寡聚酶是調(diào)節(jié)酶,在代謝調(diào)控中起重要作用。如磷酸化酶a,3-磷酸甘油醛脫氫酶。4、多酶體系multienzymesystem:是由幾種酶靠非共價(jià)鍵彼此嵌合而成。所有反應(yīng)依次連接,有利于一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行,第一個(gè)酶的產(chǎn)物是第二個(gè)酶的底物。這類(lèi)多酶復(fù)合體相對(duì)分子質(zhì)量很高,例如脂肪酸合成中的脂肪酸合成酶復(fù)合體,是由7種酶和一個(gè)?;鶖y帶蛋白構(gòu)成。在復(fù)合體中如果缺少一個(gè)酶反應(yīng)將不能進(jìn)行。5、活化能activationenergy:在一定溫度下1摩爾底物全部進(jìn)入活化態(tài)所需要的自由能。6、全酶holoenzyme:具有催化活性的酶,包括所必需的亞基、輔基和其他輔助因子。全酶=酶蛋白+輔助因子7、輔酶coenzyme:是指與酶蛋白結(jié)合疏松的有機(jī)小分子物質(zhì)。作為底物接受質(zhì)子或基團(tuán)后就離開(kāi),用透析法很容易與酶蛋白分開(kāi)。如輔酶I和輔酶Ⅱ8、輔基prostheticgroup:是指以共價(jià)鍵與酶蛋白緊密結(jié)合的輔助因子,不能用透析法去除,需要一定的化學(xué)處理才能與酶蛋白分開(kāi)。金屬離子多為輔基,有些有機(jī)小分子也可為輔基。如細(xì)胞色素氧化酶中的鐵卟啉,丙酮酸氧化酶中的黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)9、脫輔基酶蛋白apoenzyme:酶中去除催化活性可能需要的有機(jī)或無(wú)機(jī)輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。10、氧化-還原酶Oxidoreductase轉(zhuǎn)移酶Transferase水解酶hydrolase核酸酶ribozyme裂合酶Lyase異構(gòu)酶Isomerase合成酶LigaseorSynthetase11、酶的活性中心activecenter:是指在一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相聚甚遠(yuǎn),甚至位于不同肽鏈上的少數(shù)幾個(gè)氨基酸殘基或這些殘基上的基團(tuán)通過(guò)肽鏈盤(pán)繞折疊而在三維結(jié)構(gòu)上相互靠近,形成一個(gè)能與底物結(jié)合并催化其形成產(chǎn)物的位于酶蛋白表面的特化的空間區(qū)域。12、酶活力enzymeactivity:也成為酶活性,是指酶催化某一化學(xué)反應(yīng)的能力??梢杂迷谝欢l件下所催化的某一化學(xué)反應(yīng)的反應(yīng)速率來(lái)表示,酶催化的反應(yīng)速率愈大,酶的活力愈高;反應(yīng)速率愈小,酶的活力就愈低。兩者呈線性關(guān)系。在純化過(guò)程中表明酶活力的損失程度。13、酶的活力單位U,activityunit:在一定條件下,一定時(shí)間內(nèi)將一定量的底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量。2種表示IU(常用):在最適反應(yīng)條件(溫度25℃)下,每分鐘內(nèi)催化1微摩爾(umo1)底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量,定為一個(gè)酶活力單位,即1IU=1umol/min。Kat:在最適條件下,每秒鐘能催化1摩爾(mo1)底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量,定為1Kat單位(1Kat=1mol·s—1)。Kat單位與IU單位之間的換算關(guān)系如下:1Kat=60×106IU1IU=1/60μKat=16.7nKat14、酶的比活specificactivity:每mg蛋白質(zhì)所含的酶活力單位數(shù)表示。表明純化過(guò)程中純化的程度。比活力=活力U/mg蛋白=總活力U/總蛋白mg=Kat/蛋白mg15、抗體酶abzyme:一種具有催化能力的蛋白質(zhì),其實(shí)質(zhì)上是免疫球蛋白,但在易變區(qū)被賦予了酶的屬性,又稱(chēng)為催化性抗體。16、固定化酶immobilizedenzyme:將水溶性酶用物理或化學(xué)方法處理,固定于高分子支持物(或載體)上而成為不溶于水,但仍有酶活性的一種酶制劑形式,稱(chēng)固定化酶。17、異構(gòu)酶isomerase:是指能催化各種同分異構(gòu)體相互轉(zhuǎn)化的酶。18、誘導(dǎo)酶inducedenzyme:是指當(dāng)生物體或細(xì)胞中加入特定誘導(dǎo)物后產(chǎn)生的酶,它的含量在誘導(dǎo)物存在條件下顯著增高,這種誘導(dǎo)物往往是該酶底物的類(lèi)似物或底物本身。19、調(diào)節(jié)酶regulatoryenzyme:是指對(duì)代謝途徑的反應(yīng)速度起調(diào)節(jié)作用的酶。他們的分子一般具有明顯的活性部位和調(diào)節(jié)部位,起催化能力可因與調(diào)節(jié)劑結(jié)合而改變。20、別構(gòu)酶allosericenzyme:當(dāng)調(diào)節(jié)物和調(diào)節(jié)部位結(jié)合時(shí),會(huì)引起酶分子構(gòu)象發(fā)生變化而導(dǎo)致酶活性的改變。21、同工酶isoenzyme:是指能催化相同的化學(xué)反應(yīng),但其蛋白分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)和免疫性能等方面存在明顯差異的一組酶。22、鎖鑰假說(shuō):酶有特定構(gòu)象,正好與特定底物結(jié)合。即認(rèn)為酶的活性部位的構(gòu)象是僵硬不變的。23、誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō)inducedfit:酶的空間構(gòu)型可由于底物誘導(dǎo)而發(fā)生精細(xì)變化,以適應(yīng)與底物相互作用,形成正確催化部位。即認(rèn)為酶的構(gòu)象是柔韌可變的。24、酶原激活oligoenzymeactivation:某些酶先以無(wú)活性的酶原的形式合成及分泌,然后再到達(dá)作用部位時(shí)有另外的物質(zhì)作用,使其失去部分肽段從而形成或暴露活性中心形成誘惑性的酶分子的過(guò)程。25、酶原:酶的無(wú)活性前體,通常在有限度的蛋白質(zhì)水解作用后,轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂谢钚缘拿?。?0章酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)1、米氏方程Michaelis—Mentenequation:表示一個(gè)酶促反應(yīng)的起始速度V與底物濃度[S]關(guān)系的速度方程。2、米氏常數(shù)Michaeliscontant/Km值:是酶的一個(gè)重要參數(shù)。Km值是指對(duì)于一個(gè)給定的反應(yīng),酶反應(yīng)速度(V)達(dá)到最大反應(yīng)速度(Vmax)一半時(shí)底物的濃度(單位M或mM)。米氏常數(shù)是酶的特征常數(shù),只與酶的性質(zhì)有關(guān),不受底物濃度和酶濃度的影響。Km=(k2+k3)/k13、催化常數(shù)catalyticconstant,Kcat:又稱(chēng)為轉(zhuǎn)換數(shù),是一個(gè)動(dòng)力學(xué)常數(shù),當(dāng)?shù)孜锾幱陲柡蜖顟B(tài)下一個(gè)酶催化一個(gè)反應(yīng)有多快的一個(gè)測(cè)量。催化常數(shù)=Vmax/[E]total(最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度)或是每摩爾酶活性部位每秒鐘轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的分子數(shù)叫做轉(zhuǎn)換數(shù)(簡(jiǎn)稱(chēng)TN)kcat值越大,表示酶的催化效率越高。4、雙倒數(shù)作圖法doublereciprocalplot或LineweaverBurkplot:是指一個(gè)酶促反應(yīng)的速度的倒數(shù)1/V,對(duì)底物濃度的倒數(shù)1/[S]的作圖。X和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速率的倒數(shù)。5、Hanes—Woolf作圖法:將左式兩邊均乘以[S]得:以[s]/v~[s]作圖,得一直線,橫軸的截距為-Km,斜率為1/Vmax。6、Q10溫度系數(shù):反應(yīng)溫度提高10℃,其反應(yīng)速率與原來(lái)反應(yīng)速率之比,對(duì)大多數(shù)酶來(lái)講,溫度系數(shù)Q10多為2。7、激活劑activator:凡是能提高酶活性的物質(zhì)。其中大部分是無(wú)機(jī)離子或簡(jiǎn)單有機(jī)化合物。8、抑制劑inhibitor:使酶的必需基因或酶的活性部位中的基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)改變而降低酶活力甚至使酶完全喪失活性的物質(zhì)。9、抑制作用inhibition:酶在不變性的情況下,由于必需基團(tuán)或活性中心化學(xué)性質(zhì)的改變而引起的酶活性降低或喪失。抑制劑對(duì)酶的作用具有一定的選擇性。10、失活作用inactivation:破壞酶分子三維結(jié)構(gòu)使酶蛋白變性,導(dǎo)致酶喪失活性的作用,變性劑對(duì)酶的變性作用無(wú)選擇性。11、不可逆抑制作用irreversibleinhibition:抑制劑與酶分子的必需基團(tuán)共價(jià)結(jié)合引起酶活性的抑制,且不能采用透析等簡(jiǎn)單方法使酶活性恢復(fù)的抑制作用就是不可逆抑制作用。12、可逆抑制作用reversibleinhibition:抑制劑以非共價(jià)鍵與酶分子可逆性結(jié)合造成酶活性的抑制,且可采用透析等簡(jiǎn)單方法去除抑制劑而使酶活性完全恢復(fù)的抑制作用就是可逆抑制作用??赡嬉种谱饔冒ǜ?jìng)爭(zhēng)性、反競(jìng)爭(zhēng)性、和非競(jìng)爭(zhēng)性抑制幾種類(lèi)型。13、競(jìng)爭(zhēng)性抑制competitiveinhibition:抑制劑與底物競(jìng)爭(zhēng)酶的同一活性中心位點(diǎn),阻礙了底物與酶的結(jié)合,使酶的催化活性降低,抑制反應(yīng)的進(jìn)行。競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑多為底物的結(jié)構(gòu)類(lèi)似物,如:丙二酸是琥珀酸脫氫酶的抑制劑。通過(guò)增加底物濃度可以解除這種抑制作用。Km值增大,Vm值不變。14、非競(jìng)爭(zhēng)性抑制noncompetitiveinhibition:抑制劑既可以與游離酶結(jié)合,也可以與ES復(fù)合物結(jié)合,使酶的催化活性降低,稱(chēng)為非競(jìng)爭(zhēng)性抑制。Km值不變,Vm值降低。15、反競(jìng)爭(zhēng)性抑制:抑制劑不能與游離酶結(jié)合,但可與ES復(fù)合物結(jié)合并阻止產(chǎn)物生成,使酶的催化活性降低,稱(chēng)酶的反競(jìng)爭(zhēng)性抑制。Km和Vm同比例減小,即抑制劑增加酶和底物的親和性第11章酶的作用機(jī)制和調(diào)節(jié)1、鄰近效應(yīng)proximity:是指酶與底物結(jié)合以后,使底物和底物之間,酶的催化基團(tuán)與底物之間結(jié)合于同一分子而使有效濃度得以極大的升高,從而使反應(yīng)速率大大增加的一種效應(yīng)。(實(shí)質(zhì)為大大增加了底物的有效濃度)2、定向效應(yīng)orientation:底物-底物之間,底物-酶催化基團(tuán)之間的正確取向,由于這種作用反應(yīng)速率增加107倍3、酸堿催化acid-basecatalysis:是通過(guò)瞬時(shí)的向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物接受質(zhì)子以穩(wěn)定過(guò)渡態(tài),加速反應(yīng)的一類(lèi)催化機(jī)制。4、共價(jià)催化covalentcatalysis:在催化時(shí),親核基團(tuán)或親電基團(tuán)發(fā)生親核取代和親電加成反應(yīng),通過(guò)共價(jià)鍵與底物形成不穩(wěn)定的共價(jià)酶-底物復(fù)合物,降低反應(yīng)活化能,使反應(yīng)加速。分為親核催化和親電催化。5、別構(gòu)調(diào)控allostericregulation:某些化合物與酶分子的調(diào)節(jié)部位可逆地非共價(jià)結(jié)合后發(fā)生構(gòu)象的改變,進(jìn)而改變酶活性狀態(tài)以及代謝反應(yīng)的速度,這種調(diào)節(jié)作用稱(chēng)為別構(gòu)調(diào)控。6、別構(gòu)效應(yīng):調(diào)節(jié)物(或效應(yīng)物)與酶分子的調(diào)節(jié)位點(diǎn)結(jié)合后,誘導(dǎo)出或穩(wěn)定住酶分子的某種構(gòu)象,使酶活性中心對(duì)底物的結(jié)合和催化作用受到影響,從而調(diào)節(jié)酶的反應(yīng)速度及代謝過(guò)程,這種效應(yīng)稱(chēng)為酶的別構(gòu)效應(yīng)7、別構(gòu)劑:凡能使酶分子發(fā)生別構(gòu)作用的物質(zhì)別構(gòu)激活劑:因別構(gòu)導(dǎo)致酶活性增加的物質(zhì)稱(chēng)為正效應(yīng)物或別構(gòu)激活劑。別構(gòu)抑制劑:因別構(gòu)導(dǎo)致酶活性下降的物質(zhì)稱(chēng)為負(fù)效應(yīng)物或別構(gòu)抑制劑。8、同促效應(yīng):底物分子本身對(duì)別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)作用。一種配體(底物)的結(jié)合對(duì)其它部位的同種配體親和力的影響。調(diào)節(jié)物分子就是反應(yīng)的底物分子,因此酶分子具有2個(gè)以上的底物結(jié)合中心9、異促效應(yīng):效應(yīng)物(非底物)對(duì)別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)作用。效應(yīng)物與別構(gòu)部位結(jié)合對(duì)底物與活性部位結(jié)合的影響(激活或抑制)調(diào)節(jié)物不是底物分子,因此酶既可與底物結(jié)合,又可與其它調(diào)節(jié)分子結(jié)合10、齊變模型concertedmodel:相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式,按照最簡(jiǎn)單的齊變模式,由于一個(gè)底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)象在T(對(duì)底物親和力底的構(gòu)象)和R(對(duì)底物親和力高的構(gòu)象)之間變換。之一模式提出所有蛋白質(zhì)亞基都具有相同的構(gòu)象。(協(xié)同模型)11、序變模型sequentialmodel:相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式,按照最簡(jiǎn)單的序變模式,一個(gè)配體的結(jié)合會(huì)誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化,并使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個(gè)亞基對(duì)配體具有高的親和力。(結(jié)合了誘導(dǎo)契合假說(shuō))12、靜電效應(yīng)staticeffect:酶蛋白功能基團(tuán)中帶正、負(fù)電荷的氨基酸之間可通過(guò)靜電相互作用穩(wěn)定E-S過(guò)渡態(tài)(氧陰離子、正碳離子)。13、絲氨酸蛋白酶serineprotease:活性部位含有在催化期間起親和作用的絲氨酸殘基的蛋白質(zhì)酶。14、共價(jià)修飾調(diào)節(jié):酶蛋白分子中的某些基團(tuán)可以在其他酶的催化下發(fā)生共價(jià)修飾,從而導(dǎo)致酶在活性形式與非活性形式之間相互轉(zhuǎn)變,稱(chēng)為共價(jià)修飾調(diào)節(jié)。第12章維生素1、維生素vitamin:是指維持動(dòng)物細(xì)胞正常功能所必需的,但在動(dòng)物體內(nèi)不能自身合成而必須由食物供給的一類(lèi)小分子有機(jī)化合物。2、脂溶性維生素lipid-solublevitamin:一類(lèi)溶于脂溶劑的,由長(zhǎng)的碳?xì)滏溁虺憝h(huán)組成的聚戊二烯化合物。以獨(dú)立發(fā)揮生理功能為主。3、水溶性維生素water-solublevitamin:一類(lèi)溶于水的有機(jī)營(yíng)養(yǎng)分子,其中包括在酶的催化中起重要作用的B族維生素以及抗壞血酸等。絕大多數(shù)以輔酶或輔基形式參與酶的代謝反應(yīng)4、生物素biotin:參與所化反應(yīng)的一種酶的輔助因子,起固定CO2的作用。第13章核酸通論1、核酸nucleicacid:由單核苷酸通過(guò)磷酸二酯鍵相連而成的高分子化合物。2、核苷nucleoside:是嘌呤和嘧啶堿通過(guò)共價(jià)鍵與戊糖連接組成的化合物,核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖鍵連接。3、核苷酸:是核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。4、cAMP:3’,5’-環(huán)腺苷酸。是細(xì)胞內(nèi)的第二信使,由于某些激素或其他分子信號(hào)刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成,它通過(guò)激活PKA(cAMP依賴(lài)性蛋白激酶),使靶細(xì)胞蛋白質(zhì)磷酸化,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞反應(yīng)。5、脫氧核糖核酸DNA:通過(guò)3’,5’-磷酸二酯鍵連接形成的特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸。6、核糖核酸RNA:通過(guò)3’,5’-磷酸二酯鍵連接的形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。7、轉(zhuǎn)移RNA(transferRNA,tRNA);核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA);信使RNA(messengerRNA,mRNA)第14章核酸的結(jié)構(gòu)1、操縱子:指原核生物基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,包括在功能上彼此相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因及其調(diào)控部位,調(diào)控部位由啟動(dòng)子和操縱基因(阻遏蛋白結(jié)合區(qū))所組成。2、沉降系數(shù):是指在單位離心力的作用下粒子的沉降速度,表示分子的沉降特性,以svedberg表示,簡(jiǎn)寫(xiě)為S,單位為秒,1S=1X10-13s3、夏格夫法則Chargaffprincipal:所有DNA中腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩爾數(shù)相等(A=T);鳥(niǎo)嘌呤和胞嘧啶的摩爾數(shù)也相等(G=C);即嘌呤的總數(shù)等于嘧啶的總數(shù)(A+G=C+T)。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒(méi)有組織和器官的特異性。此外,生長(zhǎng)和發(fā)育階段、營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。4、大溝majorgroove和小溝minorgroove:繞B-DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽/溝,寬的溝稱(chēng)為大溝,窄的溝稱(chēng)為小溝,大溝、小溝都是由于堿基對(duì)堆積和戊糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。5、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)DNAdoublehelix:由兩條反向平行的多核苷酸鏈,共同圍繞中心軸盤(pán)旋而成的雙螺旋結(jié)構(gòu);兩條鏈的堿基互補(bǔ),靠氫鍵維系;戊糖、磷酸在螺旋外側(cè),堿基在內(nèi)側(cè)。6、核小體nucleosome:用于染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位,是由組蛋白核心和盤(pán)繞其上的DNA鏈所構(gòu)成。7、DNA超螺旋DNAsupercoiling:DNA本身的卷曲一般是DNA雙螺旋的彎曲欠旋(負(fù)超螺旋)或過(guò)旋(正超螺旋)的結(jié)果。第15章核酸的物理化學(xué)性質(zhì)1、DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶DNAtopoisomerse:能增加或減少DNA超螺旋程度,或能改變DNA分子的連環(huán)數(shù)的酶2、限制性?xún)?nèi)切酶restrctionendonuclease:存在于細(xì)菌體內(nèi)的,專(zhuān)門(mén)降解外源DNA,是一類(lèi)能夠識(shí)別雙鏈DNA分子中的某種特定核苷酸序列,并由此切割DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的核酸內(nèi)切酶。產(chǎn)生粘性末端和平末端。3、DNA變性denaturation與復(fù)性renaturation:變性是指核酸在受到加熱、極端PH和離子強(qiáng)度降低等因素或特殊的化學(xué)試劑的作用,其雙螺旋區(qū)的氫鍵斷裂,變成單鏈的過(guò)程,其中并不涉及共價(jià)鍵斷裂。復(fù)性是指變性DNA在合適的條件下,又可使兩條彼此分開(kāi)的鏈重新締合,成為雙螺旋結(jié)構(gòu)。4、Tm:指核酸分子在發(fā)生熱變性的時(shí),其在260nm的紫外吸收會(huì)急劇增加,當(dāng)紫外吸收變化達(dá)到最大變化的半數(shù)值時(shí),此時(shí)對(duì)應(yīng)的溫度稱(chēng)為解鏈/熔解/變性溫度。5、增色效應(yīng)hyperchromiceffect:DNA由雙鏈變成單鏈的過(guò)程會(huì)導(dǎo)致溶液紫外光吸收的增加現(xiàn)象。6、減色效應(yīng)hypochromiceffect:在核酸中由于堿基的堆積作用氫鍵形成,造成核酸比同濃度游離的核苷酸對(duì)紫外光的吸收減少,變性核酸在復(fù)性后其在260nm處的紫外吸收值降低的現(xiàn)象。7、分子雜交hybridization:兩條來(lái)源不同的單鏈核酸(DNA或RNA),只要它們有大致相同的互補(bǔ)堿基順序,經(jīng)退火處理即可復(fù)性,形成新的雜種雙螺旋,這一現(xiàn)象稱(chēng)為核酸的分子雜交。8、Southern印跡雜交(Southern-blotting):將在電泳凝膠中分離的DNA片段轉(zhuǎn)移并結(jié)合在適當(dāng)?shù)臑V膜上,然后通過(guò)與標(biāo)記的單鏈DNA或RNA探針的雜交作用檢測(cè)這些被轉(zhuǎn)移的DNA片段?!狣NA片段的轉(zhuǎn)移9、Northern-blotting:將RNA分子從電泳凝膠轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素濾膜或其它化學(xué)修飾的活性濾紙上,進(jìn)行核酸雜交的一種實(shí)驗(yàn)方法?!猂NA片段的轉(zhuǎn)移10、Western-blotting:將蛋白質(zhì)從PAGE電泳凝膠中轉(zhuǎn)移并結(jié)合到硝酸纖維素濾膜上,然后同放射同位素標(biāo)記的特定蛋白質(zhì)的抗體進(jìn)行反應(yīng)的技術(shù)?!鞍踪|(zhì)在PAGE后的轉(zhuǎn)移11、Eastern-blotting:將蛋白質(zhì)從IEF電泳凝膠中轉(zhuǎn)移并結(jié)合到硝酸纖維素濾膜上,然后同放射同位素標(biāo)記的特定蛋白質(zhì)的抗體進(jìn)行反應(yīng)的技術(shù)?!鞍踪|(zhì)在IEF后的轉(zhuǎn)移12、單核苷酸mononucleotide:核苷與磷酸縮合生成的磷酸酯稱(chēng)為單核苷酸。13、磷酸二酯鍵phosphodiesterbonds:是核酸中核苷酸之間的連鍵方式,即前一個(gè)核苷酸中通過(guò)磷酸單酯鍵結(jié)合的磷酸基團(tuán)再與后一個(gè)核苷酸戊糖上的羥基形成的磷酸酯鍵。14、堿基互補(bǔ)規(guī)律complementarybasepairing:在形成雙螺旋結(jié)構(gòu)的過(guò)程中,由于各種堿基的大小與結(jié)構(gòu)的不同,使得堿基之間的互補(bǔ)配對(duì)只能在G…C(或C…G)和A…T(或T…A)之間進(jìn)行,這種堿基配對(duì)的規(guī)律就稱(chēng)為堿基配對(duì)規(guī)律(互補(bǔ)規(guī)律)。15、反密碼子anticodon:在tRNA鏈上有三個(gè)特定的堿基,組成一個(gè)反密碼子,由這些反密碼子按堿基配對(duì)原則識(shí)別mRNA鏈上的密碼子。反密碼子與密碼子的方向相反。16、核酸的變性、復(fù)性denaturation、renaturation:當(dāng)呈雙螺旋結(jié)構(gòu)的DNA溶液緩慢加熱時(shí),其中的氫鍵便斷開(kāi),雙鏈DNA便脫解為單鏈,這叫做核酸的“溶解”或變性。在適宜的溫度下,分散開(kāi)的兩條DNA鏈可以完全重新結(jié)合成和原來(lái)一樣的雙股螺旋。這個(gè)DNA螺旋的重組過(guò)程稱(chēng)為“復(fù)性”。17、退火annealing:當(dāng)將雙股鏈呈分散狀態(tài)的DNA溶液緩慢冷卻時(shí),它們可以發(fā)生不同程度的重新結(jié)合而形成雙鏈螺旋結(jié)構(gòu),這種現(xiàn)象稱(chēng)為“退火”。18、增色效應(yīng)hyperchromiceffect:當(dāng)DNA從雙螺旋結(jié)構(gòu)變?yōu)閱捂湹臒o(wú)規(guī)則卷曲狀態(tài)時(shí),它在260nm處的吸收便增加,這叫“增色效應(yīng)”。19、減色效應(yīng)hypochromiceffect:DNA在260nm處的光密度比在DNA分子中的各個(gè)堿基在260nm處吸收的光密度的總和小得多(約少35%~40%),這現(xiàn)象稱(chēng)為“減色效應(yīng)”。20、發(fā)夾結(jié)構(gòu)hairpinstructure:RNA是單鏈線形分子,只有局部區(qū)域?yàn)殡p鏈結(jié)構(gòu)。這些結(jié)構(gòu)是由于RNA單鏈分子通過(guò)自身回折使得互補(bǔ)的堿基對(duì)相遇,形成氫鍵結(jié)合而成的,稱(chēng)為發(fā)夾結(jié)構(gòu)。21、DNA的熔解溫度(Tm值):在加熱使DNA變性的過(guò)程中,引起DNA發(fā)生變性或“熔解”的溫度變化范圍只不過(guò)幾度,這個(gè)溫度變化范圍的中點(diǎn)稱(chēng)為熔解溫度(Tm)。22、環(huán)化核苷酸cyclicnucleotide:?jiǎn)魏塑账嶂械牧姿峄謩e與戊糖的3’-OH及5’-OH形成酯鍵,這種磷酸內(nèi)酯的結(jié)構(gòu)稱(chēng)為環(huán)化核苷酸。第16章核酸的研究方法(實(shí)驗(yàn))1、DNA聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreaction;PCR):體外模擬自然DNA復(fù)制過(guò)程的DNA擴(kuò)增技術(shù),它以一條待擴(kuò)增的DNA鏈為模板,加入人工合成的與目的DNA序列互補(bǔ)的寡聚脫氧核苷酸作為引物,通過(guò)TaqDNA聚合酶促反應(yīng)快速、專(zhuān)一地體外擴(kuò)增特異的DNA序列。第17-21章新陳代謝和生物能學(xué)1、新陳代謝metabolism:生物體從環(huán)境吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)并排出廢物,以維持其生命活動(dòng),這些營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)在體內(nèi)所經(jīng)歷的一切化學(xué)變化即為新陳代謝/代謝。2、分解代謝catabolism:生物體內(nèi)一切物質(zhì)的分解作用,即生物細(xì)胞將營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)或細(xì)胞組分降解、轉(zhuǎn)化為小分子物質(zhì)并放出能量,或把物質(zhì)排出細(xì)胞的過(guò)程。如葡萄糖、蛋白質(zhì)、脂類(lèi)等的徹底降解和能量的釋放,有機(jī)物或無(wú)機(jī)離子運(yùn)出細(xì)胞的過(guò)程。3、合成代謝anabolism:生物體內(nèi)一切物質(zhì)的合成作用,即細(xì)胞從外界環(huán)境中攝取生命活動(dòng)所需的各種物質(zhì),并將這些物質(zhì)轉(zhuǎn)化成自身物質(zhì)的過(guò)程。如糖、氨基酸等的合成、無(wú)機(jī)鹽等的吸收與大分子合成。4、體內(nèi)實(shí)驗(yàn)invivo:用整體生物材料或高等動(dòng)物離體器官或微生物細(xì)胞群體進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。如同位素示蹤法,代謝平衡實(shí)驗(yàn)5、體外實(shí)驗(yàn)invitro:用離體細(xì)胞制劑進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。離體生物材料包括:細(xì)胞勻漿、細(xì)胞亞顯微組分制劑、酶制劑等。如酶抑制劑和代謝拮抗物的應(yīng)用6、內(nèi)能internalenergy:是體系內(nèi)部質(zhì)點(diǎn)能量的總和,通常用U/E表示。7、高能鍵high-energybond:一般將水解時(shí)能釋放出5Kcal/20.92kJ以上的自由能的化學(xué)鍵稱(chēng)為高能鍵。8、反饋抑制feedbackinhition:催化一個(gè)代謝途徑中前面反應(yīng)的酶受到同一途徑終產(chǎn)物抑制的現(xiàn)象。9、前饋激活feed-forwardacticition:代謝途徑中一個(gè)酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現(xiàn)象。第22-26章EMP/TCA/生物氧化/PPP/糖異生/糖原的分解和合成1、EMP/糖酵解glycolysis:是指葡萄糖在無(wú)氧條件下被酶降解成丙酮酸并釋放出能量的過(guò)程。是植物、動(dòng)物、微生物細(xì)胞中葡萄糖分解產(chǎn)生能量的共同代謝途徑。2、底物水平磷酸化substratephosphorlation:指ATP的形成直接與一個(gè)中間代謝物(如磷酸烯醇式丙酮酸)上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移相偶聯(lián)的作用。如磷酸烯醇式丙酮酸生成丙酮酸時(shí)產(chǎn)生的ATP,琥珀酰CoA生成琥珀酸時(shí)釋放的能量用于生成GTP,GTP可轉(zhuǎn)變?yōu)锳TP。底物水平磷酸化:是指產(chǎn)物氧化還原反應(yīng)過(guò)程中,分子內(nèi)能量重新排布,使得無(wú)機(jī)磷酸酯化,形成高能磷酸鍵,后者在酶的作用下將能量轉(zhuǎn)給ADP生成ATP。3、氧化磷酸化作用OxidativePhosphorylation:是指與生物氧化相偶聯(lián)的磷酸化作用,發(fā)生在線粒體中,當(dāng)電子從NADH或FADH2經(jīng)電子傳遞鏈傳遞至氧生成水時(shí),產(chǎn)生的能量使ADP磷酸化生成ATP的作用稱(chēng)氧化磷酸化作用。氧化磷酸化OxidativePhosphorylation::是指與生物氧化相偶聯(lián)的磷酸化作用,發(fā)生在線粒體中,生物氧化過(guò)程中電子傳遞在線粒體內(nèi)膜兩側(cè)產(chǎn)生了H+濃度差,H+順濃度差流動(dòng)時(shí)推動(dòng)了ATP的生成,能量的最終來(lái)源是代謝過(guò)程中產(chǎn)生的還原型輔酶所含有的化學(xué)能。4、光合磷酸化作用photophosphorylation:是指與光合作用相偶聯(lián)的磷酸化作用,發(fā)生在葉綠體中,光照引起的電子傳遞在葉綠體類(lèi)囊體膜上兩側(cè)產(chǎn)生了H+濃度差,H+順濃度差流動(dòng)時(shí)推動(dòng)了ATP的生成,能量的最終來(lái)源是光能。5、乳酸循環(huán)Coricycle:肌肉中積累的乳酸經(jīng)血液循環(huán)進(jìn)入肝臟,在肝臟異生為葡萄糖后又回到肌肉中被利用的過(guò)程稱(chēng)為Cori(柯瑞)循環(huán)。6、TCA循環(huán)/三羧酸循環(huán)/檸檬酸循環(huán)/Krebs循環(huán)citricacidcycle:是指在線粒體中,乙酰CoA首先與草酰乙酸縮合生成檸檬酸,然后經(jīng)過(guò)一系列的代謝反應(yīng),乙?;谎趸纸?,而草酰乙酸再生的循環(huán)反應(yīng)過(guò)程。由于途徑的第一個(gè)代謝物是檸檬酸,故稱(chēng)為檸檬酸循環(huán);又由于檸檬酸含有三個(gè)羧基,故也稱(chēng)為三羧酸循環(huán)。糖的有氧氧化aerobicoxidation:葡萄糖在有氧條件下徹底氧化分解生成CO2和H2O,并釋放出大量能量的過(guò)程7、乙醛酸循環(huán)glyoxylatecycle:是某些植物、細(xì)菌和酵母菌中檸檬酸循環(huán)的修改形式,通過(guò)該循環(huán)使得乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖,它繞過(guò)了檸檬酸循環(huán)中生成兩個(gè)CO2的步驟。特征酶是異檸檬酸裂解酶和蘋(píng)果酸合成酶。8、磷酸戊糖途徑PPP/HMS(pentosephosphatepathway):也稱(chēng)為磷酸己糖支路,是一個(gè)G-6-P經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑,該途徑包括氧化和非氧化兩個(gè)階段,在氧化階段,G-6-P轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子的NADPH;在非氧化階段,核酮糖-5-磷酸異構(gòu)化生成核糖-5-磷酸或轉(zhuǎn)化為酵解的中間代謝產(chǎn)物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。9、生物氧化biologicaloxidation:生物體內(nèi)能源物質(zhì)在活細(xì)胞中氧化分解,釋放化學(xué)能并轉(zhuǎn)換為生物能的生化過(guò)程。10、呼吸作用respiratoryaction:高等動(dòng)物通過(guò)肺進(jìn)行呼吸,吸入氧氣、排出CO2。吸入的O2用以氧化攝入體內(nèi)的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),獲得能量,所以生物氧化又稱(chēng)呼吸作用(組織呼吸、細(xì)胞呼吸)。11、呼吸鏈respiratorychain:呼吸鏈又稱(chēng)為電子傳遞鏈。是由存在于線粒體內(nèi)膜上的一系列電子傳遞體組成。代謝物在分解過(guò)程中產(chǎn)生的還原輔酶經(jīng)這一系列的電子傳遞作用,最終將氫傳遞至氧,生成水。由于參與傳遞的酶和電子載體是按一定的順序排列成鏈狀,故稱(chēng)其為呼吸鏈或電子傳遞鏈electrontransportchain。12、電子傳遞抑制劑Electrontransferinhibitors:能夠阻斷呼吸鏈中某部位電子傳遞的物質(zhì)稱(chēng)為電子傳遞抑制劑。是研究電子傳遞鏈順序的一種重要方法。13、化學(xué)滲透假說(shuō)chemosmotichypothesis:電子傳遞的自由能驅(qū)動(dòng)H+從線粒體基質(zhì)跨過(guò)內(nèi)膜進(jìn)入到膜間隙,從而形成跨線粒體內(nèi)膜的H+電化學(xué)梯度,這個(gè)梯度的電化學(xué)電勢(shì)驅(qū)動(dòng)ATP的合成。14、解偶聯(lián)作用Uncouplingrole:使電子傳遞和氧化磷酸化兩個(gè)過(guò)程分離的作用,如2,4-二硝基苯酚可使電子傳遞和氧化磷酸化解偶聯(lián),結(jié)果電子傳遞失去控制,氧消耗增加,但ATP的合成停止。15、氧化磷酸化抑制劑oxidativephosphorylationinhibitor:作用是直接干擾ATP的生成過(guò)程,但不直接抑制電子傳遞鏈上載體的作用。抑制ATP的形成、又抑制氧氣的利用。例:寡霉素和DCCD(二環(huán)己基碳二亞胺),作用于F0,阻止質(zhì)子流出。16、離子載體抑制劑ionophoredepressant:這是一類(lèi)脂溶性物質(zhì)。這種物質(zhì)能與某些離子結(jié)合并作為它們的載體使這些離子能夠穿過(guò)膜。它和解偶聯(lián)試劑的區(qū)別在于:它是除H+以外其他1價(jià)陽(yáng)離子的載體,這類(lèi)抑制劑是通過(guò)增加線粒體內(nèi)膜對(duì)一價(jià)陽(yáng)離子的通透性而破壞氧化磷酸化過(guò)程。例如:纈氨霉素valinomycin、短桿菌肽gramicidin17、P/Oratio:是指呼吸過(guò)程中無(wú)機(jī)磷酸(Pi)的消耗量和分子氧(O2)的消耗量的比值。由于在氧化磷酸化過(guò)程中,沒(méi)穿第一對(duì)電子消耗一個(gè)氧原子,而每生成一分子ATP消耗一分子無(wú)機(jī)磷酸,因此,P/O的數(shù)值就相當(dāng)于一對(duì)電子經(jīng)呼吸鏈傳遞至分子氧所產(chǎn)生的ATP的分子數(shù)。電子從NADPH傳遞給O2時(shí),P/O=3;而從FADH2傳遞給O2時(shí),P/O=2.18、高能化合物highenergycompound:在標(biāo)準(zhǔn)條件下水解時(shí),自由能大幅度減少的化合物。一般是指水解時(shí)放的能量能驅(qū)動(dòng)ADP磷酸化合成ATP的化合物。/是指分子結(jié)構(gòu)中含高能鍵的化合物稱(chēng)為高能化合物。19、底物循環(huán)substratecycle:是指兩種代謝物分別由不同的酶催化的單向互變過(guò)程。20、丙酮酸羧化支路Pyruvatecarboxylationbranch:是指糖異生過(guò)程中,為克服糖酵解中丙酮酸激酶的能障,由丙酮酸羧化酶和磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶催化的,從丙酮酸生成草酰乙酸,然后再生成PEP,這兩步反應(yīng)構(gòu)成的途徑,稱(chēng)為丙酮酸羧化支路。21、糖異生作用gluconeogenesis:由非糖物質(zhì)生成葡萄糖的過(guò)程稱(chēng)為糖異生作用,糖異生的前體主要有乳酸、丙酮酸、甘油和生糖氨基酸等。糖異生作用主要存在于肝臟中。22、糖原分解glycogenbreakdown:是指糖原中的葡萄糖殘基水解生成6-磷酸葡萄糖或葡萄糖的過(guò)程。23、半乳糖血癥galactosemia:人類(lèi)的一種遺傳型代謝缺陷,是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉(zhuǎn)移酶,導(dǎo)致嬰兒不能代謝奶汁中的乳糖生成半乳糖。第28章脂類(lèi)的分解代謝1、脂肪酸的β-氧化Fattyacidβ-oxidation:脂肪酸在體內(nèi)氧化時(shí)在羧基端的β-碳原子上進(jìn)行氧化,碳鏈逐次斷裂,每次斷下一個(gè)二碳單位,即乙酰CoA,該過(guò)程稱(chēng)作β-氧化。每一輪的β-氧化分為氧化、水解、再氧化和硫解四步。2、肉毒堿:肉毒堿是一種由賴(lài)氨酸衍生的兼性化合物。它可以與脂肪酸結(jié)合生成脂酰肉堿,在脂酰肉堿轉(zhuǎn)移酶的作用下,將脂肪酸從胞質(zhì)帶入線粒體。脂肪酸進(jìn)入線粒體后進(jìn)行β-氧化,肉堿再次返回胞質(zhì)進(jìn)行下一輪轉(zhuǎn)運(yùn),所以肉堿是脂肪酸從胞質(zhì)到線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)的載體。3、檸檬酸穿梭系統(tǒng):脂肪酸合成的前體是乙酰CoA,脂肪酸合成的場(chǎng)所是胞質(zhì)。由于乙酰CoA主要存在于線粒體中,而且不能自由通過(guò)線粒體膜,所以乙酰CoA首先與草酰乙酸合成檸檬酸,檸檬酸可以自由穿過(guò)線粒體膜進(jìn)入胞質(zhì)。在胞質(zhì)中,檸檬酸又裂解為乙酰CoA和草酰乙酸,乙酰CoA進(jìn)入脂肪酸合成途徑,而草酰乙酸形成蘋(píng)果酸后又進(jìn)一步轉(zhuǎn)變成丙酮酸,丙酮酸可自由通過(guò)線粒體膜進(jìn)入線粒體.這一乙酰CoA從線粒體向胞質(zhì)中轉(zhuǎn)運(yùn)的過(guò)程稱(chēng)為檸檬酸穿梭系統(tǒng)。4、脂肪酸的ω-氧化fattyacidsω-oxidation:脂肪酸的末端甲基(ω-端)經(jīng)氧化轉(zhuǎn)變成羥基,繼而再氧化成羧基,從而形成α,ω-二羧酸的過(guò)程。兩端都可以進(jìn)行β-氧化5、脂肪酸α-氧化fattyacidsα-oxidation:脂肪酸氧化作用發(fā)生在α-碳原子上,分解出CO2,生成比原來(lái)少一個(gè)碳原子的脂肪酸,這種氧化作用稱(chēng)為α-氧化作用。6、酮體ketonebody:是乙酰乙酸、β-羥丁酸和丙酮三種物質(zhì)的統(tǒng)稱(chēng),他們是在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子。7、肉毒堿穿梭系統(tǒng)carnitineshuttlesystem:脂酰CoA通過(guò)形成脂酰肉毒堿從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體的一個(gè)穿梭循環(huán)途徑。8、檸檬酸穿梭系統(tǒng)Citricacidshuttlesystem:將乙酰CoA從線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)的穿梭循環(huán)途徑。在轉(zhuǎn)運(yùn)乙酰CoA的同時(shí),細(xì)胞質(zhì)中NADH氧化成NAD+,NADP+還原為NADPH。每循環(huán)一次小號(hào)兩分子的ATP。9、脂肪酸合成酶系統(tǒng)fattyacidsynthaseenzymesystem:是指一類(lèi)存在于細(xì)胞質(zhì)中的多酶復(fù)合體,能催化脂肪酸合成的一套循環(huán)反應(yīng),該復(fù)合體是由6種酶和一個(gè)酰基載體蛋白組成的。10、?;d體蛋白acylcarrierprotein/ACP:是一種對(duì)熱穩(wěn)定的蛋白質(zhì),分子量小,在其絲氨酸殘基上結(jié)合一個(gè)4’-磷酸泛酰巰基乙胺,ACP起著轉(zhuǎn)運(yùn)?;淖饔?,與脂肪酸合成酶系的每一個(gè)酶順序發(fā)生作用,以合成脂肪酸。11、葡萄糖—丙氨酸循環(huán):在肌肉中,由酵解產(chǎn)生的丙酮酸在轉(zhuǎn)氨酶的作用下,接受其他氨基酸的氨基形成丙氨酸,丙氨酸是中性無(wú)毒物質(zhì),通過(guò)血液到達(dá)肝臟,在谷丙轉(zhuǎn)氨酶的作用下將氨基移交給α-酮戊二酸生成丙酮酸和谷氨酸。谷氨酸在谷氨酸脫氫酶的作用下脫去氨基,氨進(jìn)入尿素合成途徑,丙酮酸在肝細(xì)胞中異生為葡萄糖再轉(zhuǎn)運(yùn)至肌肉氧化供能,氨的這一轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程稱(chēng)為葡萄糖-丙酮酸循環(huán)。12、尿素—檸檬酸雙循環(huán):在尿素循環(huán)中生成的延胡索酸,使尿素循環(huán)和檸檬酸循環(huán)密切聯(lián)系在一起。精氨琥珀酸裂解形成的延胡索酸可轉(zhuǎn)變?yōu)樘O(píng)果酸,蘋(píng)果酸進(jìn)一步氧化生成草酰乙酸,草酰乙酸既可進(jìn)入檸檬酸循環(huán),也可經(jīng)轉(zhuǎn)氨作用再次形成天冬氨酸進(jìn)入尿素循環(huán),這樣尿素循環(huán)和檸檬酸循環(huán)密切聯(lián)系在一起,人們稱(chēng)此為尿素-檸檬酸雙循環(huán)。第30-31章氨基酸代謝1、轉(zhuǎn)氨基作用transamination:在轉(zhuǎn)氨酶的催化下,α-氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移到α-酮酸的酮基碳原子上,結(jié)果原來(lái)的α-氨基酸生成相應(yīng)的α-酮酸,而原來(lái)的α-酮酸則形成了相應(yīng)的α-氨基酸,這種作用稱(chēng)為轉(zhuǎn)氨基作用或氨基移換作用。此作用是可逆的。2、氧化脫氨基作用oxidativedeamination:氨基酸在酶的催化下脫去氨基生成相應(yīng)的α-酮酸的過(guò)程稱(chēng)為氧化脫氨基作用。有兩種酶L-氨基酸氧化酶、氨基酸氧化酶。3、聯(lián)合脫氨基作用combineddeamination:聯(lián)合脫氨基作用是將轉(zhuǎn)氨基作用和脫氨基作用偶聯(lián)在一起的脫氨方式。自然界中谷氨酸脫氫酶的活力最高,所以各種氨基酸首先在轉(zhuǎn)氨酶的作用下,將氨基轉(zhuǎn)移給α-酮戊二酸形成谷氨酸后,借助谷氨酸脫氫酶將氨基脫去,這是體內(nèi)脫氨基的主要方式。4、氨基酸的脫羧基作用decarboxylation:氨基酸在脫羧酶的作用下脫掉羧基生成相應(yīng)的一級(jí)胺類(lèi)化合物的作用。脫羧酶的輔酶為磷酸吡哆醛。5、尿素循環(huán)ureacycle:是指脊椎動(dòng)物肝臟中的尿素合成途徑,每一次循環(huán)生成1分子尿素,從體內(nèi)清除掉2分子氨和1分子CO2,由于途徑中有循環(huán)出現(xiàn)鳥(niǎo)氨酸,所以也稱(chēng)鳥(niǎo)氨酸循環(huán)。6、生糖氨基酸glucogenicaminoacid:降解后可生成能作為糖異生前體的分子(丙酮酸、α-酮戊二酸、琥珀酰輔酶A、延胡索酸和草酰乙酸)的氨基酸稱(chēng)為生糖氨基酸。7、生酮氨基酸ketogenicaminoacid:降解后可生成乙酰CoA、酮體或乙酰乙酰輔酶A的氨基酸稱(chēng)為生酮氨基酸。8、一碳單位onecarbonunit:一碳單位是指某些氨基酸分解代謝過(guò)程中產(chǎn)生的僅含有一個(gè)碳原子的基團(tuán)(不包括CO2),如:甲基(CH3-)、亞甲基(-CH2-)、次甲基(-CH=)、甲?;∣=CH-)、亞氨甲基(HN=CH-)等,一碳單位可來(lái)源于甘氨酸、蘇氨酸、絲氨酸和組氨酸等的分解代謝,一碳單位參與各種生物活性物質(zhì)的修飾,參與嘌呤嘧啶的合成等。一碳單位的載體主要是四氫葉酸,功能是參與生物分子的修飾。9、生物固氮biologicalnitrogenfixation:大氣中的氮被還原成氨的過(guò)程,其只發(fā)生在少數(shù)細(xì)菌和藻類(lèi)中。10、S-腺苷甲硫氨酸S-adenosylmethionineSAM:它是甲硫氨酸的活性形式,在動(dòng)植物體內(nèi)廣泛存在,它是由底物L(fēng)-甲硫氨酸和ATP經(jīng)S-腺苷甲硫氨酸合成酶酶促合成的。甲硫鍵是高能鍵,當(dāng)膽堿、肌酸及其它甲基化合物生成時(shí)它作為甲基供體而起作用。11、L-氨基酸氧化酶L-aminoacidoxidase:是一種需氧脫氫酶,以FAD或FMN為輔基,脫下的氫原子交給O2,生成H2O2該酶活性不高,在各組織器官中分布有限,因此作用不大。12、L-谷氨酸脫氫酶L-glutamatedehydro-genase:是一種不需氧脫氫酶,以NAD+或NADP+為輔酶,生成的NADH或NADPH可進(jìn)入呼吸鏈進(jìn)行氧化磷酸化。活性高,分布廣泛,因而作用較大。該酶屬于變構(gòu)酶,其活性受ATP、GTP、NADH的抑制,受ADP、GDP、一些氨基酸的激活。13、蛋白酶:以稱(chēng)肽鏈內(nèi)切酶(Endopeptidase),作用于多肽鏈內(nèi)部的肽鍵,生成較原來(lái)含氨基酸數(shù)少的肽段,不同來(lái)源的蛋白酶水解專(zhuān)一性不同。14、L-丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶(alaninetransaminase,ALT)又稱(chēng)為谷丙轉(zhuǎn)氨酶(GPT)。催化丙氨酸與α-酮戊二酸之間的氨基移換反應(yīng),為可逆反應(yīng)。該酶在肝臟中活性較高,在肝臟疾病時(shí),可引起血清中ALT活性明顯升高15、天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(aspartatetransaminase,AST)又稱(chēng)為谷草轉(zhuǎn)氨酶(GOT)。催化天冬氨酸與α-酮戊二酸之間的氨基移換反應(yīng),為可逆反應(yīng)。該酶在心肌中活性較高,故在心肌疾患時(shí),血清中AST活性明顯升高16、核酸酶Nuclease:作用于核酸分子中的磷酸二酯鍵的酶,分解產(chǎn)物為寡核苷酸或核苷酸,根據(jù)作用位置不同可分為核酸外切酶和核酸內(nèi)切酶。17、氨基酸的活化Aminoacidactivation:氨基酸在參入多肽鏈之前必須被活化,即在氨酰-tRNA合成酶的催化下,氨基酸的α-羧基通過(guò)高能酯鍵與對(duì)應(yīng)的tRNA的3’端腺苷酸的羥基相連。18、苯丙酮尿癥phenylketonuriaPKU:由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙氨酸堆積的代謝遺傳病。缺乏苯丙氨酸羥化酶,苯丙氨酸只能依靠轉(zhuǎn)氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸,苯丙酮酸的堆積對(duì)神經(jīng)系統(tǒng)有毒害作用,是智力發(fā)育出現(xiàn)障礙。19、尿黑酸癥alcaptonuria:是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸酶引起的代謝遺傳病。這種病人尿中含有尿黑酸,在堿性條件下暴露于氧氣中,氧化并聚合為類(lèi)似于黑色素的物質(zhì)。第33章核酸的代謝1、核糖核酸酶(RNase):作用于RNA內(nèi)部的磷酸二酯鍵,切割RNA的5′-酯鍵。產(chǎn)物是含有5′-OH末端和3′-磷酸基末端的寡核苷酸片段或游離的3′-核苷酸。2、脫氧核糖核酸酶Ⅰ(DNaseⅠ):來(lái)源于牛胰臟,切割雙鏈或單鏈DNA的3′-酯鍵→5′-P、3′-OH末端的寡核苷酸片段的混合物3、脫氧核糖核酸酶Ⅱ(DNaseⅡ):存在于脾和胸腺中,作用于磷酸二酯鍵的5′-酯鍵→5′-OH、3′-P末端的寡脫氧核苷酸4、嘌呤核苷酸的從頭合成途徑(denovosynthesis):通過(guò)利用一些簡(jiǎn)單的前體物,如5-磷酸核糖、氨基酸、一碳單位及CO2等,逐步合成嘌呤核苷酸的過(guò)程稱(chēng)為嘌呤核苷酸的從頭合成途徑。5、Lesch-Nyhan綜合癥/自毀容貌癥/Lesch-Nyhansyndrome:嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶在人體嘌呤核苷酸合成代謝中起重要作用。自毀容貌癥患者腦中缺乏次黃嘌呤-鳥(niǎo)嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶,使嘌呤核苷酸的補(bǔ)救合成途徑受阻,導(dǎo)致中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能失常,自我毀傷等。6、別嘌呤醇allopurinol/ALLO:是結(jié)構(gòu)上類(lèi)似于黃嘌呤的化合物(在嘌呤環(huán)上第7位是C,第8位是N),對(duì)黃嘌呤氧化酶有很強(qiáng)的抑制作用,常用來(lái)治療痛風(fēng)。7、自殺抑制作用suicidesubstrate:底物類(lèi)似物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成該酶的抑制劑。例如別嘌呤醇對(duì)黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種類(lèi)型。第34章DNA的復(fù)制與修復(fù)1、半保留復(fù)制semi-conservativereplication:DNA復(fù)制時(shí),親代DNA的兩條鏈解開(kāi),分別作為模板合成互補(bǔ)鏈,得到的兩個(gè)子代DNA分子都是由一條來(lái)自親代的模板鏈和一條新合成的互補(bǔ)鏈組成的,這樣的復(fù)制方式稱(chēng)為半保留復(fù)制。2、拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ(TopoisomeraseⅠ):只能消除負(fù)超螺旋??墒笵NA雙鏈中的一條

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