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大一生物化學(xué)第一章第六章幻燈精華大一生物化學(xué)第一章第六章幻燈精華大一生物化學(xué)第一章第六章幻燈精華第一節(jié)
蛋白質(zhì)的分子組成各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近:平均為16%可以根據(jù)含氮量推算出蛋白質(zhì)的大致含量:樣品中蛋白質(zhì)含量=樣品含氮量x6.25大一生物化學(xué)第一章第六章幻燈精華大一生物化學(xué)第一章第六章幻燈第一節(jié)
蛋白質(zhì)的分子組成各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近:平均為16%可以根據(jù)含氮量推算出蛋白質(zhì)的大致含量:樣品中蛋白質(zhì)含量=樣品含氮量x6.25第一節(jié)
蛋白質(zhì)的分子組成各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近:平均為16第二節(jié)
蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)肽鍵的概念(peptidebond)
:由一個(gè)氨基酸的
-羧基與另一個(gè)氨基酸的
-氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵(-CO-NH-)。它是蛋白質(zhì)分子中最基本的一種化學(xué)鍵。第二節(jié)
蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)肽鍵的概念(peptidebond蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)概念:蛋白質(zhì)分子中,從N-端至C-端的氨基酸排列順序指多肽鏈中氨基酸的排列順序備注:任取其中一種概念主要維系化學(xué)鍵:肽鍵(了解)蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)概念:蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)肽單元(peptideunit)的概念:由于肽鍵具有部分雙鍵的性質(zhì),使參與肽鍵構(gòu)成的六個(gè)原子位于同一平面上,這一平面稱為肽單元或肽鍵平面。蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)肽單元(peptideunit)的概念:蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的概念指蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈主鏈原子的局部空間結(jié)構(gòu)不包括側(cè)鏈構(gòu)象的內(nèi)容不包括與其他肽段的相互關(guān)系主要維系蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵是:氫鍵(了解)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的概念蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的常見形式α-螺旋(α-helix)β-折疊(β-pleatedsheet)β-轉(zhuǎn)角(β-turn)無規(guī)卷曲(randomcoil)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的常見形式α-螺旋結(jié)構(gòu)特點(diǎn):為一右手螺旋,側(cè)鏈伸向螺旋外側(cè)螺旋每圈包含3.6個(gè)氨基酸殘基,螺距0.54nm螺旋以氫鍵維系α-螺旋結(jié)構(gòu)特點(diǎn):蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)概念:指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置也就是整條肽鏈所有原子的三維空間排布備注:其中任取一種均可蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)概念:蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)概念指蛋白質(zhì)分子中各個(gè)亞基的空間排布,亞基間接觸部位的布局和相互作用蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)概念第四節(jié)
蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)蛋白質(zhì)的兩性解離和等電點(diǎn)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的概念:當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時(shí)溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。第四節(jié)
蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)蛋白質(zhì)的兩性解離和等電點(diǎn)pI與溶液pH的關(guān)系pI與溶液pH關(guān)系氨基酸所帶電荷電場中移動(dòng)的方向pH=pI靜電荷為零不移動(dòng)pH>pI負(fù)電荷向正極移動(dòng)pH<pI正電荷向負(fù)極移動(dòng)pI與溶液pH的關(guān)系pI與溶液pH關(guān)系氨基酸所帶電荷電場中移蛋白質(zhì)變性作用概念:在某些物理或化學(xué)因素的作用下,蛋白質(zhì)分子特定的空間構(gòu)象被破壞(不包括肽鍵的斷裂),從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)理化性質(zhì)的改變和生物學(xué)活性喪失。蛋白質(zhì)變性作用蛋白質(zhì)變性本質(zhì)非共價(jià)鍵斷裂,而肽鍵不斷裂,不改變蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)變性本質(zhì)維持蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素水化膜顆粒表面電荷(電荷層)維持蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素鹽析法沉淀蛋白質(zhì)的原理:破壞水化膜減小表面靜電斥力鹽析法沉淀蛋白質(zhì)的原理:第二章
核酸的結(jié)構(gòu)與功能第二章
核酸的結(jié)構(gòu)與功能第一節(jié)
核酸的化學(xué)組成與一級(jí)結(jié)構(gòu)了解:核酸的基本組成單位是:核苷酸核酸的基本組成成分為:磷酸、戊糖、堿基第一節(jié)
核酸的化學(xué)組成與一級(jí)結(jié)構(gòu)了解:DNA和RNA基本化學(xué)組成的比較DNARNA戊糖脫氧核糖核糖嘌呤堿A,GA,G嘧啶堿C,TC,U磷酸磷酸磷酸DNA和RNA基本化學(xué)組成的比較DNARNA戊糖脫氧核糖核糖第二節(jié)
DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能了解:核苷酸之間以:3’,5’-磷酸二酯鍵連接形成核酸第二節(jié)
DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能了解:DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)DNA分子是反向平行、右手螺旋的互補(bǔ)雙鏈結(jié)構(gòu)兩條鏈間形成互補(bǔ)堿基對(duì)(A=T,G≡C)螺旋參數(shù):螺旋形成大溝與小溝;螺旋直徑為2.4nm;每個(gè)螺旋有10.5對(duì)堿基;相鄰堿基平面距離0.34nm維系作用:疏水作用力(堿基堆積力),氫鍵DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)DNA分子是反向平行、右手螺旋的互核小體結(jié)構(gòu)核小體的結(jié)構(gòu)包括:核心顆粒(H2A,H2B,H3,H4各2分子+1.75圈DNA)連接區(qū)(DNA+H1)核小體結(jié)構(gòu)核小體的結(jié)構(gòu)包括:第三節(jié)
RNA的結(jié)構(gòu)與功能真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)5’-端:7-甲基鳥嘌呤三磷酸核苷(m7GpppN)帽子結(jié)構(gòu)3’-端:多聚腺苷酸(polyA)尾巴結(jié)構(gòu)mRNA的功能:蛋白質(zhì)合成的模板第三節(jié)
RNA的結(jié)構(gòu)與功能真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)tRNA的結(jié)構(gòu)3′末端:—CCA-OHtRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)稱為“三葉草”結(jié)構(gòu)氨基酸臂DHU環(huán)反密碼環(huán)TψC環(huán)額外環(huán)tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)是:倒L型tRNA的結(jié)構(gòu)tRNA的功能蛋白質(zhì)合成的氨基酸載體tRNA的功能rRNA的結(jié)構(gòu)rRNA與蛋白質(zhì)一起構(gòu)成核糖體(核蛋白體)核糖體(核蛋白體)由大小亞基組成rRNA的功能:蛋白質(zhì)生物合成的場所rRNA的結(jié)構(gòu)第四節(jié)
核酸的理化性質(zhì)核酸的紫外吸收特性波長260nm(OD260)有最大吸收峰第四節(jié)
核酸的理化性質(zhì)核酸的紫外吸收特性核酸變性的概念:某些理化因素會(huì)導(dǎo)致DNA雙鏈互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵發(fā)生斷裂,使雙鏈DNA解離為單鏈的過程Tm的概念:DNA變性時(shí),△A260達(dá)到最大變化值的一半時(shí)所對(duì)應(yīng)的溫度稱為DNA的解鏈溫度或融解溫度(Tm)50%DNA變性時(shí)的溫度備注:任取其一核酸變性的概念:第三章
酶第三章
酶第一節(jié)
酶的分子結(jié)構(gòu)與功能酶的概念酶(enzyme,E):生物體內(nèi)對(duì)特異底物起高效催化作用的生物催化劑其化學(xué)本質(zhì)主要是蛋白質(zhì)(了解)少部分是核酸(了解)第一節(jié)
酶的分子結(jié)構(gòu)與功能酶的概念酶的活性中心(activecenter)的概念有些酶的必需基團(tuán)在一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但在空間結(jié)構(gòu)上彼此靠近,組成具有特定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,能和底物特異結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物,這一區(qū)域就稱為酶的活性中心或稱活性部位。酶的活性中心(activecenter)的概念同工酶的概念催化相同化學(xué)反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu),理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶稱為同工酶(isoenzyme)同工酶的概念同工酶的臨床應(yīng)用同工酶譜的改變有助于對(duì)疾病的診斷例如:心肌梗死時(shí)可見血清中LDH1活性明顯升高肝病時(shí)LDH5活性明顯升高血清CK2活性測定有利于對(duì)心肌梗死的早期診斷同工酶的臨床應(yīng)用第二節(jié)
酶的工作原理酶的作用特點(diǎn):高效性高度特異性高度不穩(wěn)定性可調(diào)節(jié)性第二節(jié)
酶的工作原理酶的作用特點(diǎn):第三節(jié)
酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)米—曼氏方程:VVmax[S]Km+[S]=──第三節(jié)
酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)米—曼氏方程:VVmax[S]KmKm值的意義Km等于酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度Km可近似表示酶對(duì)底物的親和力Km越小,酶與底物的親和力越大;反之亦然Km是酶的特征性常數(shù)之一Km值的意義溫度對(duì)反應(yīng)速率的影響(了解)雙重影響酶的最適溫度:酶促反應(yīng)速率最快時(shí)的反應(yīng)體系的溫度溫度對(duì)反應(yīng)速率的影響(了解)pH對(duì)反應(yīng)速率的影響(了解)最適pH:酶催化活性最大時(shí)的反應(yīng)體系的pHpH對(duì)反應(yīng)速率的影響(了解)競爭性抑制概念:抑制劑(I)與酶的底物(S)的結(jié)構(gòu)相似,可與S競爭E的活性中心,從而阻礙E和S結(jié)合成中間產(chǎn)物,從而使酶的活性降低。這種抑制作用稱為競爭性抑制作用競爭性抑制競爭性抑制的特點(diǎn):I結(jié)構(gòu)常與S結(jié)構(gòu)類似I/S與酶的結(jié)合部位相同:酶的活性中心[S]↑可以降低甚至消除抑制作用(表觀)Km值增大,Vm值不變競爭性抑制的特點(diǎn):競爭性抑制的臨床應(yīng)用磺胺類藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)與對(duì)氨基苯甲酸相似,它是二氫葉酸合成酶的競爭性抑制劑,可抑制二氫葉酸的合成,進(jìn)而達(dá)到抑菌作用教材p214:別嘌呤醇與次黃嘌呤結(jié)構(gòu)相似,可抑制黃嘌呤氧化酶,抑制尿酸的生成教材p212、p218中“抗代謝物”競爭性抑制的臨床應(yīng)用第四節(jié)
酶的調(diào)節(jié)酶原激活的實(shí)質(zhì)酶的活性中心形成或暴露的過程酶原激活的意義避免對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生自身消化可看作酶的儲(chǔ)存形式,在需要時(shí)轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘拿?,發(fā)揮催化活性第四節(jié)
酶的調(diào)節(jié)酶原激活的實(shí)質(zhì)糖酵解的概念
在無氧或供氧不足的條件下,葡萄糖或糖原在胞液中經(jīng)一系列反應(yīng)生成丙酮酸,進(jìn)而還原為乳酸并釋放出能量的過程。因其與酵母菌使糖生醇發(fā)酵的過程相似,故稱為糖酵解。第四章糖代謝
糖酵解的概念在無氧或供氧不足的條件下,葡萄糖或糖原糖酵解的特點(diǎn)
1個(gè)反應(yīng)場所2步底物水平磷酸化反應(yīng)3步關(guān)鍵酶催化的反應(yīng)糖酵解的特點(diǎn)
1個(gè)反應(yīng)場所2步底物水平磷酸化反應(yīng)3步關(guān)鍵酶催2步底物水平磷酸化反應(yīng)2步底物水平磷酸化反應(yīng)三步關(guān)鍵酶催化的反應(yīng)三步關(guān)鍵酶催化的反應(yīng)糖酵解的生理意義是人體內(nèi)成熟紅細(xì)胞獲取ATP的唯一途徑。是有氧條件下,某些組織細(xì)胞(皮膚、視網(wǎng)膜、睪丸細(xì)胞)主要的供能途徑。是機(jī)體劇烈運(yùn)動(dòng)時(shí)補(bǔ)充能量的有效方式。糖酵解的生理意義是人體內(nèi)成熟紅細(xì)胞獲取ATP的唯一途徑。糖的有氧氧化概念
在供氧充足的條件下,G在胞液與線粒體中徹底氧化分解,生成H2O和CO2與大量ATP的過程。是糖氧化供能的主要方式。糖的有氧氧化概念在供氧充足的條件下,G在胞液與線粒糖的有氧氧化反應(yīng)階段葡萄糖經(jīng)酵解途徑分解為丙酮酸丙酮酸氧化脫羧生成乙酰CoA三羧酸循環(huán)胞液線粒體糖的有氧氧化反應(yīng)階段葡萄糖經(jīng)酵解途徑分解為丙酮酸胞液線粒體三羧酸循環(huán)概念
線粒體中,乙酰CoA與草酰乙酸縮合生成檸檬酸,經(jīng)過一系列的代謝反應(yīng),乙?;谎趸纸?,而草酰乙酸再生并可參與下一次反應(yīng)。由于這一過程由含三個(gè)羧基的檸檬酸開始循環(huán)反應(yīng),故稱為三羧酸循環(huán)。是機(jī)體獲取能量的主要途徑。一分子乙?;?jīng)三羧酸循環(huán)徹底氧化可生成10分子ATP。三羧酸循環(huán)概念線粒體中,乙酰CoA與草酰乙酸縮合TCA循環(huán)小結(jié)場所:線粒體特點(diǎn):4次脫氫反應(yīng)3個(gè)關(guān)鍵酶2次脫羧1次底物水平磷酸化反應(yīng)能量生成:一分子乙?;?jīng)三羧酸循環(huán)徹底氧化可生成10分子ATP。TCA循環(huán)小結(jié)場所:線粒體4次脫氫反應(yīng)3個(gè)關(guān)鍵酶2次脫羧1次磷酸戊糖途徑反應(yīng)特點(diǎn)關(guān)鍵酶:葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G6PD)缺乏?。篏6PD缺乏癥(蠶豆?。┝姿嵛焯峭緩椒磻?yīng)特點(diǎn)關(guān)鍵酶:葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G6P磷酸戊糖途徑生理意義1.5-磷酸核糖是合成核苷酸和核酸的重要原料。2.NADPH+H+具有多方面的生理作用:NADPH+H+是體內(nèi)許多合成代謝的供氫體;NADPH+H+參與體內(nèi)羥化反應(yīng);NADPH+H+可維持還原型GSH的含量。磷酸戊糖途徑生理意義1.5-磷酸核糖是合成核苷酸和核酸的糖異生概念:非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)镚或Gn的過程?;旧鲜翘墙徒獾哪孢^程。糖異生原料:甘油、有機(jī)酸(乳酸、丙酮酸、TAC中的各種羧酸等)、生糖氨基酸。糖異生概念:血糖的來源與去路血糖的來源與去路第五章脂類代謝1.脂肪動(dòng)員的概念與其限速酶。脂肪動(dòng)員:指儲(chǔ)存在脂肪細(xì)胞中的脂肪,被肪脂酶逐步水解為脂肪酸與甘油,并釋放入血以供其他組織氧化利用的過程。脂肪動(dòng)員的限速酶:TG脂肪酶第五章脂類代謝1.脂肪動(dòng)員的概念與其限速酶。2.飽和脂肪酸的β—氧化的概念、基本過程與其能量的計(jì)算。飽和脂肪酸的β—氧化的概念脂肪酸活化為脂酰CoA進(jìn)入線粒體,在脂肪酸氧化酶體系的催化下,于脂?;绿荚由线M(jìn)行脫氫、水化、再脫氫、硫解反應(yīng),生成比原來少2個(gè)碳原子的脂酰CoA和1分子乙酰CoA。由于氧化分解固定在脂?;挛惶荚由?,故稱為β-氧化。2.飽和脂肪酸的β—氧化的概念、基本過程與其能量的計(jì)算。脫氫加水再脫氫硫解脂酰CoA
β-羥脂酰CoAβ-酮脂酰CoA脂酰CoA+乙酰CoA
脂酰CoA
脫氫酶α,β-烯酰CoAL(+)-β羥脂酰CoA脫氫酶
NAD+NADH+H+⊿2--烯脂酰CoA
水化酶H2O
FADFADH2β酮脂酰CoA
硫解酶CoA-SH
飽和脂肪酸的β—氧化的基本過程(要求:反應(yīng)步驟名稱)RCH2CH2C~SCoAO=O=脫氫加水再脫氫硫解脂酰CoAβ-羥脂酰CATP生成數(shù)=[(n/2-1)×(1.5+2.5)]+n/2×10凈生成ATP數(shù)=ATP生成數(shù)-2飽和脂肪酸的能量計(jì)算ATP生成數(shù)=[(n/2-1)×(1.5+2.5)]3.酮體的分類、合成原料與意義。
乙酰乙酸、β-羥丁酸、丙酮三者總稱酮體,是脂肪酸在肝臟中氧化不徹底的產(chǎn)物。酮體酮體代謝特點(diǎn):肝內(nèi)生酮、肝外利用3.酮體的分類、合成原料與意義。
乙酰乙酸、β-羥丁酮體生成的生理意義酮體是肝臟輸出能源的一種形式。酮體可透過血腦屏障,是腦組織的重要能源(尤其長期饑餓狀態(tài)下)。酮體利用的增加可減少糖的利用,有利于維持血糖水平恒定,節(jié)省蛋白質(zhì)的消耗。酮體生成的生理意義酮體是肝臟輸出能源的一種形式。酮體可透過血葡萄糖磷酸戊糖途徑4.膽固醇合成的原料乙酰CoA、ATP、NADPH
葡萄糖磷酸戊糖途徑4.膽固醇合成的原料乙酰CoA、ATP、膽固醇在體內(nèi)的轉(zhuǎn)變膽固醇可轉(zhuǎn)變?yōu)槟懼崮懝檀伎赊D(zhuǎn)化為類固醇激素膽固醇可轉(zhuǎn)化為維生素D3的前體
膽固醇在體內(nèi)的轉(zhuǎn)變膽固醇可轉(zhuǎn)變?yōu)槟懼嵫c血漿中的蛋白質(zhì)結(jié)合,以脂蛋白(lipoprotein)形式運(yùn)輸。*血漿脂蛋白脂類載脂蛋白(apo)5.血漿脂蛋白的概念血脂與血漿中的蛋白質(zhì)結(jié)合,以脂蛋白(lipoprotein)血漿脂蛋白的對(duì)應(yīng)關(guān)系、組成特點(diǎn)與其功能最多最多血漿脂蛋白的對(duì)應(yīng)關(guān)系、組成特點(diǎn)與其功能最多最多第六章生物氧化1.呼吸鏈的概念:線粒體內(nèi)膜上存在著由多種酶和輔酶組成的遞氫、遞電子的復(fù)合物,它們按一定的順序排列組成電子傳遞鏈。代謝物脫下的H,通過電子傳遞鏈的傳遞,最終與激活的氧結(jié)合生成水,并產(chǎn)生可利用的能量。這一連鎖反應(yīng)因與細(xì)胞攝取氧的過程有關(guān),故又稱為呼吸鏈。第六章生物氧化1.呼吸鏈的概念:線粒體內(nèi)膜上存在著由多體內(nèi)兩條重要的呼吸鏈的傳遞體的排列順序。NADH氧化呼吸鏈(主要呼吸鏈)NADH→復(fù)合體Ⅰ→CoQ→復(fù)合體Ⅲ→
復(fù)合體Ⅳ→O
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