《生物信息學(xué)》教學(xué)大綱課程編號(hào)：08180052英文名稱(chēng)：Bioinformatics學(xué)分：2學(xué)時(shí)：總學(xué)時(shí)32學(xué)時(shí)，其中理論32學(xué)時(shí)，實(shí)踐0學(xué)時(shí)先修課程：生物化學(xué)、分子生物學(xué)、大學(xué)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程類(lèi)別：專(zhuān)業(yè)主干課程授課對(duì)象：生物科學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)生教學(xué)單位：生命科學(xué)學(xué)院修讀學(xué)期：第5學(xué)期一、課程描述和目標(biāo)生物信息學(xué)是一門(mén)新型交叉應(yīng)用性學(xué)科，是現(xiàn)代生物學(xué)研究的重要工具。生物信息學(xué)方面的理論基礎(chǔ)和基本技能學(xué)習(xí)，培養(yǎng)學(xué)生信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)等多學(xué)科知識(shí)交叉綜合運(yùn)用的能力，掌握運(yùn)用生物信息學(xué)理論、方法和技術(shù)初步解決科研和實(shí)際工作中生物信息的存儲(chǔ)、檢索、分析和利用的問(wèn)題。課程目標(biāo)1：專(zhuān)業(yè)知識(shí)方面，通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)，使學(xué)生掌握生物信息學(xué)的基本概念和基本原理；理解各種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、軟件工具的工作原理。課程目標(biāo)2：專(zhuān)業(yè)能力方面，使學(xué)生掌握常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、軟件的使用方法，具備生物信息收集、分析、挖掘、利用等方面的基本能力，培養(yǎng)學(xué)生信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)等多學(xué)科知識(shí)交叉綜合運(yùn)用的能力。課程目標(biāo)3：專(zhuān)業(yè)素養(yǎng)方面，具備良好的生物信息學(xué)拓展和學(xué)習(xí)思維能力，具備一定的解決生物信息學(xué)復(fù)雜問(wèn)題的能力。二、課程目標(biāo)對(duì)畢業(yè)要求的支撐關(guān)系畢業(yè)要求指標(biāo)點(diǎn)課程目標(biāo)權(quán)重5.1學(xué)習(xí)想象：具備運(yùn)用理科相關(guān)課程的知識(shí)與技能，對(duì)復(fù)雜生命科學(xué)問(wèn)題進(jìn)行理解與表達(dá)，并提出新觀點(diǎn)、新設(shè)想和新見(jiàn)解的能力。課程目標(biāo)1課程目標(biāo)2H6.3專(zhuān)業(yè)能力：掌握資料查詢(xún)、文獻(xiàn)檢索及應(yīng)用現(xiàn)代信息技術(shù)獲取專(zhuān)業(yè)知識(shí)終身學(xué)習(xí)的能力。課程目標(biāo)1L9.2語(yǔ)言基礎(chǔ)：具備一定的語(yǔ)言能力，能夠用恰當(dāng)?shù)目陬^和書(shū)面表達(dá)方式，與社會(huì)公眾及同行進(jìn)行有效的溝通。課程目標(biāo)1課程目標(biāo)2課程目標(biāo)3M（注：要求課程目標(biāo)與畢業(yè)要求指標(biāo)點(diǎn)應(yīng)是一一對(duì)應(yīng)支撐）三、教學(xué)內(nèi)容、基本要求與學(xué)時(shí)分配序號(hào)教學(xué)內(nèi)容基本要求及重、難點(diǎn)（含德育要求）學(xué)時(shí)教學(xué)方式對(duì)應(yīng)課程目標(biāo)1生物信息學(xué)學(xué)科發(fā)展歷史、生物信息學(xué)研究領(lǐng)域與內(nèi)容理解和掌握生物信息學(xué)的研究?jī)?nèi)容2集中講授課程目標(biāo)12序列比對(duì)的概念、序列比對(duì)打分方法和算法、多序列比對(duì)、序列比對(duì)、進(jìn)化分析的常用軟件及數(shù)據(jù)搜索理解和掌握序列比對(duì)的方法和進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建方法7集中講授課堂操作課程目標(biāo)1、2、33生物數(shù)據(jù)庫(kù)及其檢索利用，包括核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)、結(jié)構(gòu)和藥物數(shù)據(jù)庫(kù)、數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)的提交理解和掌握各類(lèi)生物數(shù)據(jù)庫(kù)的基本內(nèi)容和檢索方法6集中講授課堂操作課程目標(biāo)1、2、34核酸序列的注釋分析包括核酸序列的結(jié)構(gòu)、信號(hào)檢索分析、基因的功能注釋、PCR引物的設(shè)計(jì)掌握原核和真核生物核酸序列的注釋分析方法7集中講授課堂操作課程目標(biāo)1、2、35蛋白質(zhì)序列分析和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)包括蛋白質(zhì)序列理化性質(zhì)分析、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)和結(jié)構(gòu)同源建模、蛋白質(zhì)的藥物分子設(shè)計(jì)掌握蛋白質(zhì)序列分析和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析的原理和方法6集中講授課堂操作課程目標(biāo)1、2、36轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)和蛋白組學(xué)概述了解轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)和蛋白組學(xué)的技術(shù)概況及應(yīng)用4集中講授課程目標(biāo)1、3合計(jì)32四、課程教學(xué)方法集中講授、小組討論五、學(xué)業(yè)評(píng)價(jià)和課程考核（一）考核方式及具體要求1.課程成績(jī)構(gòu)成與要求課程考核注重形成性和終結(jié)性評(píng)價(jià)相結(jié)合，考核內(nèi)容主要由平時(shí)作業(yè)、章節(jié)測(cè)試、期末考核組成，均按百分制計(jì)分，其中期末考核成績(jī)占50%、平時(shí)作業(yè)成績(jī)占30%、章節(jié)測(cè)試成績(jī)占20%。2.課程目標(biāo)達(dá)成考核與評(píng)價(jià)序號(hào)教學(xué)環(huán)節(jié)課程目標(biāo)1（分值）課程目標(biāo)2（分值）課程目標(biāo)3（分值）合計(jì)1平時(shí)作業(yè)51510302章節(jié)測(cè)試5105203期末考試10251550課程目標(biāo)對(duì)應(yīng)分值204040100（二）考核與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)1.平時(shí)成績(jī)考核與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)分值觀測(cè)點(diǎn)90-100分70-89分60-69分0-59分作業(yè)按時(shí)完成，90%以上的作業(yè)內(nèi)容齊全，在系統(tǒng)掌握生物信息學(xué)理論的基礎(chǔ)上，熟練運(yùn)用生物信息學(xué)網(wǎng)站和軟件開(kāi)展數(shù)據(jù)的檢索、儲(chǔ)存、分析和利用，提練、解決數(shù)據(jù)中的生物科學(xué)問(wèn)題。按時(shí)完成，70%以上的作業(yè)內(nèi)容齊全，在掌握生物信息學(xué)理論的基礎(chǔ)上，運(yùn)用生物信息學(xué)網(wǎng)站和軟件開(kāi)展數(shù)據(jù)的檢索、儲(chǔ)存、分析和利用，提練、解決數(shù)據(jù)中的生物科學(xué)問(wèn)題。延時(shí)完成，60%以上的作業(yè)內(nèi)容齊全，在基本掌握生物信息學(xué)理論的基礎(chǔ)上，能初步運(yùn)用生物信息學(xué)網(wǎng)站和軟件開(kāi)展數(shù)據(jù)的檢索、儲(chǔ)存、分析和利用，部分提練、解決數(shù)據(jù)中的生物科學(xué)問(wèn)題。不交和補(bǔ)交，50%以下的作業(yè)內(nèi)容齊全，不能較好掌握生物信息學(xué)理論，無(wú)法準(zhǔn)確運(yùn)用生物信息學(xué)網(wǎng)站和軟件開(kāi)展數(shù)據(jù)的檢索、儲(chǔ)存、分析和利用，不能提練、解決數(shù)據(jù)中的生物科學(xué)問(wèn)題。2.章節(jié)測(cè)試與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)章節(jié)測(cè)試根據(jù)測(cè)試題目及評(píng)分標(biāo)注進(jìn)行打分（百分制）。3.期末試卷考核與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)根據(jù)課程目標(biāo)及教學(xué)內(nèi)容，設(shè)計(jì)期末考核試題，綜合檢驗(yàn)學(xué)生對(duì)課程相關(guān)知識(shí)的掌握、綜合應(yīng)用及解決復(fù)雜問(wèn)題的能力，根據(jù)考試題目設(shè)計(jì)相應(yīng)評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)。六、教材與參考書(shū)（一）推薦教材1．《生物信息學(xué)（第四版）》，陳銘主編，科學(xué)出版社，2022年3月版；2．《生物信息學(xué)（第二版）》，李霞，雷健波，李亦學(xué)等編著，人民衛(wèi)生出版社，2015版。（二）參考資料1．《生物信息學(xué)與功能基因組學(xué)（原著第三版）》，Jonathan