《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)》教學(xué)大綱課程編號(hào)：08220202英文名稱：BioinformaticsExperiment學(xué)分：1學(xué)時(shí)：總學(xué)時(shí)32學(xué)時(shí)，其中理論0學(xué)時(shí)，實(shí)踐32學(xué)時(shí)先修課程：生物化學(xué)、分子生物學(xué)、大學(xué)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程類別：專業(yè)主干課程授課對(duì)象：生物科學(xué)專業(yè)學(xué)生教學(xué)單位：生命科學(xué)學(xué)院修讀學(xué)期：第5學(xué)期一、課程描述和目標(biāo)生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)是生物信息學(xué)課程的配套實(shí)踐課程。本課程運(yùn)用生物信息學(xué)理論和方法進(jìn)行生物信息的獲取、存儲(chǔ)、分析、利用等基本技能學(xué)習(xí)，培養(yǎng)學(xué)生信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)等多學(xué)科知識(shí)交叉綜合運(yùn)用以解決生命科學(xué)基本問(wèn)題的能力。課程目標(biāo)1：掌握運(yùn)用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行生物數(shù)據(jù)查詢、獲取、處理、分析和解釋的能力。課程目標(biāo)2：掌握運(yùn)用生物信息學(xué)軟件和在線工具進(jìn)行基因和蛋白質(zhì)序列結(jié)構(gòu)分析和功能注釋的方法，具備對(duì)基因和蛋白質(zhì)進(jìn)行功能預(yù)測(cè)分析的能力。課程目標(biāo)3：運(yùn)用進(jìn)化分析軟件、組學(xué)分析軟件等多種生物信息學(xué)工具對(duì)生物數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合、深度分析，具備一定解決生物信息學(xué)復(fù)雜問(wèn)題和解析生物數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)問(wèn)題的能力。二、課程目標(biāo)對(duì)畢業(yè)要求的支撐關(guān)系畢業(yè)要求指標(biāo)點(diǎn)課程目標(biāo)權(quán)重5.1學(xué)習(xí)想象：具備運(yùn)用理科相關(guān)課程的知識(shí)與技能，對(duì)復(fù)雜生命科學(xué)問(wèn)題進(jìn)行理解與表達(dá)，并提出新觀點(diǎn)、新設(shè)想和新見(jiàn)解的能力。課程目標(biāo)1課程目標(biāo)2H6.3專業(yè)能力：掌握資料查詢、文獻(xiàn)檢索及應(yīng)用現(xiàn)代信息技術(shù)獲取專業(yè)知識(shí)終身學(xué)習(xí)的能力。課程目標(biāo)1L9.2語(yǔ)言基礎(chǔ)：具備一定的語(yǔ)言能力，能夠用恰當(dāng)?shù)目陬^和書(shū)面表達(dá)方式，與社會(huì)公眾及同行進(jìn)行有效的溝通。課程目標(biāo)1課程目標(biāo)2課程目標(biāo)3M（注：要求課程目標(biāo)與畢業(yè)要求指標(biāo)點(diǎn)應(yīng)是一一對(duì)應(yīng)支撐）三、教學(xué)內(nèi)容、基本要求與學(xué)時(shí)分配序號(hào)教學(xué)內(nèi)容基本要求及重、難點(diǎn)（含德育要求）學(xué)時(shí)教學(xué)方式對(duì)應(yīng)課程目標(biāo)1生物數(shù)據(jù)庫(kù)檢索和數(shù)據(jù)提交掌握各類生物數(shù)據(jù)庫(kù)的基本內(nèi)容、檢索方法和GenBank等數(shù)據(jù)庫(kù)中序列的提交6實(shí)踐操作課程目標(biāo)1、22多重序列比對(duì)系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)構(gòu)建掌握使用Clustalx進(jìn)行序列多重比對(duì)的方法和MEGA軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的方法，重點(diǎn)掌握建樹(shù)的模型和計(jì)算方法的選擇4小組討論、實(shí)踐操作課程目標(biāo)1、2、33基因結(jié)構(gòu)分析和功能注釋核酸序列的結(jié)構(gòu)、元件預(yù)測(cè)、基因的功能注釋、PCR引物的設(shè)計(jì)6實(shí)踐操作課程目標(biāo)1、24蛋白質(zhì)序列分析掌握蛋白質(zhì)序列理化性質(zhì)分析、修飾分析和結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)4實(shí)踐操作課程目標(biāo)1、25蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)掌握同源建模等蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法和質(zhì)量評(píng)估方法，了解蛋白質(zhì)3D結(jié)構(gòu)可視化軟件VMD的使用方法4小組討論、實(shí)踐操作課程目標(biāo)1、2、36轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析掌握轉(zhuǎn)錄因子定位和識(shí)別方法4實(shí)踐操作課程目標(biāo)2、37轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組分析了解轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組定量和差異表達(dá)分析方法4小組討論、實(shí)踐操作課程目標(biāo)2、3合計(jì)32四、課程教學(xué)方法小組討論、實(shí)踐操作五、學(xué)業(yè)評(píng)價(jià)和課程考核（一）考核方式及具體要求1.課程成績(jī)構(gòu)成與要求課程考核注重形成性和終結(jié)性評(píng)價(jià)相結(jié)合，考核內(nèi)容主要由課堂實(shí)踐操作測(cè)試、實(shí)驗(yàn)報(bào)告組成，均按百分制計(jì)分，其中課堂實(shí)踐操作測(cè)試成績(jī)占50%、實(shí)驗(yàn)報(bào)告成績(jī)占50%。2.課程目標(biāo)達(dá)成考核與評(píng)價(jià)序號(hào)教學(xué)環(huán)節(jié)課程目標(biāo)1（分值）課程目標(biāo)2（分值）課程目標(biāo)3（分值）合計(jì)1課堂實(shí)踐操作151520502實(shí)驗(yàn)報(bào)告15152050課程目標(biāo)對(duì)應(yīng)分值303040100（二）考核與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)1.課堂實(shí)踐操作考核與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)按照實(shí)踐操作的時(shí)間、方法、結(jié)果和小組討論開(kāi)展情況進(jìn)行評(píng)價(jià)。2.實(shí)驗(yàn)報(bào)告考核與評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)分值觀測(cè)點(diǎn)90-100分70-89分60-69分0-59分實(shí)驗(yàn)報(bào)告列出完整的實(shí)驗(yàn)操作步驟，獲得準(zhǔn)確、完整的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，正確的分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果所蘊(yùn)含的生物學(xué)科學(xué)問(wèn)題或意義。列出完整的實(shí)驗(yàn)操作步驟，獲得、完整的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，能部分開(kāi)展分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果所蘊(yùn)含的生物學(xué)科學(xué)問(wèn)題或意義討論并獲得結(jié)果。列出主要的實(shí)驗(yàn)操作步驟，獲得主要的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，沒(méi)有開(kāi)展實(shí)驗(yàn)結(jié)果所蘊(yùn)含的生物學(xué)科學(xué)問(wèn)題或意義分析和討論。列出部分實(shí)驗(yàn)操作步驟，獲得部分的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，沒(méi)有開(kāi)展實(shí)驗(yàn)結(jié)果所蘊(yùn)含的生物學(xué)科學(xué)問(wèn)題或意義分析和討論。六、教材與參考書(shū)（一）推薦教材1．《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)》，陳銘，原春暉主編，科學(xué)出版社，2022年3月版；2．《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)及習(xí)題集》，馮世鵬著，電子工業(yè)出版社，2021年7月版；