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文檔簡介
第二十一章氨基酸、蛋白質(zhì)和核酸
蛋白質(zhì)(protein)存在于一切細胞中。它們是構(gòu)成人體和動植物組織的基本材料,肌肉、毛發(fā)、皮膚、指甲、腱、神經(jīng)、激素、抗體、血清、血紅蛋白、酶等都是由不同蛋白質(zhì)組成的。蛋白質(zhì)在有機體中承擔著多種生物功能,它們能供給機體營養(yǎng),輸送氧氣,控制代謝過程,防御疾病、傳遞遺傳信息,負責(zé)機械運動,執(zhí)行保護機能,等等。可以說,蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ),是參與體內(nèi)各種生物化學(xué)變化最重要的組分。生命的基本特征就是蛋白質(zhì)的不斷自我更新。
從化學(xué)上看,蛋白質(zhì)是氨基酸的高聚物;氨基酸是構(gòu)成蛋白質(zhì)的“基石'因此要討論蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和性質(zhì),首先要了解氨基酸。
在本章介紹與蛋白質(zhì)有密切關(guān)系的另一類生物高分子化合物——核酸。21.1氨基酸
分子中既含有氨基(—NH2),又含有羧基(—COOH)的化合物叫氨基酸(aminoacids)。根據(jù)氨基和羧基的相對位置不同,又可分為α-,β-,γ-或δ-氨基酸。組成蛋白質(zhì)的幾乎都是α-氨基酸。一、氨基酸的結(jié)構(gòu)、分類和命名
在自然界存在的α-氨基酸(亦稱天然氨基酸)目前已經(jīng)知道的有一百多種,但組成蛋白質(zhì)的氨基酸僅二十多種(見表21-1)。
天然氨基酸常使用俗名(根據(jù)來源或性質(zhì)),例如,微具甜味的稱為甘氨酸;最初從蠶絲中得到的氨基酸叫絲氨酸;最初由一種叫天門冬的幼苗中發(fā)現(xiàn)的稱為天門冬氨酸。每種氨基酸都有縮寫符號(即英文名稱的頭三個字母)。
從表21-1中可以看出,各種氨基酸的差別主要在于R基團的不同,而R基團的結(jié)構(gòu)是多種多樣的。在有些氨基酸的R基團中含有羥基、巰基、芳環(huán)或雜環(huán),有的氨基酸分子中含有兩個氨基或羧基。根據(jù)分子中氨基和羧基的數(shù)目可將氨基酸分為中性氨基酸(氨基和羧基數(shù)目相等);酸性氨基酸(羧基數(shù)目大于氨基數(shù));堿性氨基酸(氨基數(shù)目大于羧基數(shù))。例如:
天然氨基酸,除甘氨酸外,α碳原子都有手性,且都是L構(gòu)型。氨基酸的構(gòu)型是與乳酸相比而確定的(也就是從甘油醛導(dǎo)出來的)。例如,與L-乳酸相應(yīng)的L-丙氨酸的構(gòu)型是:
正像糖類化合物一樣,氨基酸的構(gòu)型習(xí)慣于用D,L標記法。如果用R/S法標記,那么天然氨基酸大多屬于S構(gòu)型。但也有R構(gòu)型的,如L-半胱氨酸為R構(gòu)型。二、氨基酸的性質(zhì)
氨基酸是含有氨基和羧基的雙官能團化合物,所以它們既具有羧酸的性質(zhì),又具有胺類的性質(zhì),同時還具有這兩種官能團相互影響而賦于它們的某些特性。1.兩性和等電點(isoelectricpoint)
氨基酸既含有堿性基團(—NH2),又含有酸性基團(—COOH)。它們具有兩性,與強酸或強堿作用都能生成鹽。
胺與羧酸反應(yīng)很容易形成銨鹽,當氨基和羧基存在于同一分子時,可在分子內(nèi)發(fā)生質(zhì)子遷移而形成內(nèi)鹽(zwitterion):
氨基酸的某些物理和光譜性質(zhì)表明,它們是以偶極離子(dipolarion)形式存在的分子中沒有游離的—NH2或—COOH。例如,氨基酸一般在200°C以下不熔化,具有很高的熔點(實際上是分解點)。氨基酸可溶于水,而不溶于苯、醚等有機溶劑。這些都是由偶極離子結(jié)構(gòu)所導(dǎo)致的特性。氨基酸的紅外光譜上,沒有典型的羧基(—C00H)伸展吸收峰(1725?1700cm―1),而只有C00-的伸展吸收峰(1650?1545cm—1)。
氨基酸偶極離子作為兩性物質(zhì),既能從一個強酸接受一個質(zhì)子,又可向強堿給出一個質(zhì)子。
若在氨基酸的平衡水溶液中加入酸,則生成正離子2,加堿生成負離子3。當把該溶液置于電場中,在強酸性條件下,氨基酸分子主要以正離子2存在,應(yīng)向陰極移動;在強堿性條件下,氨基酸分子主要以負離子3存在,應(yīng)向陽極移動。調(diào)節(jié)pH值,使平衡水溶液中的氨基酸分子主要以偶極離子1存在,其凈電荷為零,氨基酸分子既不向陰極也不向陽極移動,此時溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點,簡稱pl(isoelectricpoint)。由于各種氨基酸結(jié)構(gòu)不同,酸、堿性質(zhì)不同,所以等電點也不盡相同。一般酸性氨基酸約為3,中性氨基酸約為6,堿性氨基酸約為9?11。
氨基酸等電點可由相應(yīng)氨基酸鹽酸鹽的pKa值求出。如丙氨酸鹽酸鹽,可看作一個二元酸,具有兩個平衡常數(shù)K1和K2
用堿調(diào)節(jié)丙氨酸鹽酸鹽水溶液pH值,當加入0.5mol堿時,平衡中氨基酸正離子4的濃度與偶極離子5的相同,[4]=[5]此時溶液pH值等于pK1,實際上此溶液中只有50%的偶極離子5。當加入1.5mol堿時,溶液中氨基酸偶極離子5的濃度等于負離子6,[5]=[6]此時溶液的pH值等于pK2,溶液中也含50%偶極離子5。所以使丙氨酸完全以偶極離子5存在時,pH值應(yīng)為pK1和pK2的平均值,這個pH值即為丙氨酸的等電點(pI),pI=(pK1+pK2)/2。根據(jù)表21-2數(shù)據(jù),丙氨酸鹽酸鹽的pK1為2.3、pK2為9.7,可求出丙氨酸等電點為6.0:
又如賴氨酸的鹽酸鹽具有三個PK值,它的離解平衡可描述如下:
平衡中第二步離解可生成凈電荷為零的偶極離子,它繼續(xù)離解生成負離子的形式。根據(jù)表21-2中賴氨酸的pK值,可求出賴氨酸等電點(pI)約為9.8:
等電點是每一種氨基酸的特定常數(shù)。在等電點時,氨基酸的水溶解度最小,所以可利用不同氨基酸的等電點來進行分離提純。用電泳技術(shù)分離氨基酸正是基于不同氨基酸具有不同等電點性質(zhì)。問題21-1寫出下列氨基酸在給定PH值的離子結(jié)構(gòu)。(1)半胱氨酸(PH4.80) (2)精氨酸(PH10.95)問題21-2下列氨基酸在pH=6時,置于電場中,推測其移動方向。
(1)纈氨酸
(2)谷氨酸(3)賴氨酸2.羧基的反應(yīng)3.氨基的反應(yīng)
以上這些反應(yīng)在化學(xué)上和生物體中都很重要,例如,氨基酸和HNO2反應(yīng),定量放出氮氣,可用來測定—NH2的含量。氨基酸和甲醛反應(yīng)可以在用酸堿滴定測羧基的含量時將氨基保護起來,避免干擾。氨基酸與2,4-二硝基氟苯的反應(yīng)可用于多肽結(jié)構(gòu)的N-端分析(見21.2節(jié))。氨基酸氧化脫氨生成酮酸的反應(yīng)在生物體內(nèi)是在酶的催化下完成的,它是體內(nèi)蛋白質(zhì)分解代謝中的重要過程。4.與水合茚三酮的反應(yīng)
α-氨基酸與水合茚三酮在堿性溶液中加熱,發(fā)生氧化、脫氨、脫羧作用,最終生成藍紫色物質(zhì)。其反應(yīng)過程為:
這是檢驗氨基酸的靈敏方法。與水合茚三酮反應(yīng),脯氨酸或羥脯氨酸顯黃色。
在生化實驗中,常常用紙層析、柱層析或薄層層析法分離氨基酸,當氨基酸分開后,總是利用水合茚三酮的顯色來定性或定量測定各種氨基酸。5.氨基酸的受熱反應(yīng)
氨基酸的受熱反應(yīng)與相應(yīng)的羥基酸的極為相似:α-氨基酸加熱生成交酰胺或肽(關(guān)于肽見21.2節(jié));β-氨基酸加熱生成α,β不飽和酸;γ-氨基酸加熱生成內(nèi)酰胺。
三、氨基酸的來源與合成
氨基酸不僅是組成蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)單元,而且它們本身也是人體生長的重要營養(yǎng)物質(zhì),具有特殊的生理作用,因此氨基酸的生產(chǎn)和應(yīng)用早就得到人們的重視。
生產(chǎn)氨基酸主要有以下四條途徑:1.蛋白質(zhì)的水解
由蛋白質(zhì)水解制備氨基酸是從1820年開始的,這是一個最古老的方法。味精早期就是由小麥蛋白質(zhì)—面筋水解得到。胱氨酸、半咣氨酸是由頭發(fā)水解制得的。
蛋白質(zhì)水解法的缺點是分離比較困難,因為水解時所得到的總是各種氨基酸的混合物。2.微生物發(fā)酵法
該法是以糖質(zhì)原料(如淀粉、果糖、蔗糖)或以石油及其制品(如石蠟油、煤油、乙醇、醋酸)
為主要碳源,在其他氮、磷、鉀等物質(zhì)存在下,經(jīng)過微生物發(fā)酵時生成氨基酸。1957年開始用該法生產(chǎn)谷氨酸(味精),目前谷氨酸發(fā)酵工藝生產(chǎn)的谷氨酸占世界年總產(chǎn)量(20萬噸)中的大部分。微生物發(fā)酵法的原料價廉,在大多數(shù)情況下,由于細菌的特異作用,能直接得到L型氨基酸,無須再進行外消旋體的拆分。3.酶法
在酶的作用下,可將一定原料轉(zhuǎn)化成L-氨基酸。酶法的特點是酶的催化選擇性很強,生產(chǎn)過程簡單,周期短,成本低,產(chǎn)率高,副產(chǎn)物少。目前利用酶法生產(chǎn)的氨基酸有L-丙氨酸,L-天門冬氨酸,L-賴氨酸,L-色氨酸,L-鳥氨酸等。4.合成法
為了經(jīng)濟、大量地生產(chǎn)氨基酸,還需要用化學(xué)合成法。合成氨基酸的主要方法有以下幾種:
在這種反應(yīng)中,常常有仲、叔胺衍生物生成,不易得到純的產(chǎn)品。但在使用大量過量氨的情況下還是可以得到一定產(chǎn)率的氨基酸。例如:(6)氨基酸手性合成
用上述方法獲得的氨基酸都是外消旋體,只有經(jīng)過拆分才能得到L或D構(gòu)型氨基酸。氨基酸不對稱合成近年來發(fā)展很快,例如,利用膦銠手性絡(luò)合催化劑可得到L或D構(gòu)型的氨基酸,有的光學(xué)產(chǎn)率可達100%。最常用的催化劑是R-1,2-雙(二苯基膦基)丙烷和銠的絡(luò)合物,R-1,2-雙(二苯基膦基)丙烷可被叫做R-prophose,它可作為配基。當用R-prohose與降冰片二烯反應(yīng)后,可生成手性銠絡(luò)合物,在溶劑(如乙醇)中用氫處理,
可得到氨基酸不對稱合成的手性催化劑,其分子式為[Rh(R-prophose)(H2)(C2H5OH)2]+。當2-乙酰氨基丙烯酸在這個催化劑存在下氫化,可產(chǎn)生L-乙酰氨基丙酸,經(jīng)水解得到L-丙氨酸。由于催化劑是手性的,加氫過程具有立體選擇性,可成功地完成這個不對稱合成。
當采用3位有取代基的(Z)-乙酰氨基丙烯酸時,利用這個膦銠催化劑的手性誘導(dǎo)作用經(jīng)上述步驟可合成其他L-氨基酸。
在氨基酸手性合成中貢獻最大的科學(xué)家之一是Knowks,他不僅在1968年首次合成出了催化氫化的催化劑,并不斷地
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