北京地區(qū)犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病的分子流行病學(xué)特征剖析與防控策略研究_第1頁
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北京地區(qū)犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病的分子流行病學(xué)特征剖析與防控策略研究一、引言1.1研究背景與意義犬瘟熱(CanineDistemper,CD)、犬細(xì)小病毒感染(CanineParvovirusInfection,CPV)及犬冠狀病毒?。–anineCoronavirusDisease,CCoV)是犬類常見且危害嚴(yán)重的傳染病。這些疾病不僅對(duì)犬只的健康構(gòu)成巨大威脅,還對(duì)養(yǎng)犬業(yè)的發(fā)展造成了顯著的負(fù)面影響。犬瘟熱是由犬瘟熱病毒引起的一種高度接觸性傳染病,病毒主要通過呼吸道和消化道傳播,感染后的犬只臨床表現(xiàn)多樣,包括雙相熱、呼吸道癥狀、消化道癥狀以及神經(jīng)系統(tǒng)癥狀等。嚴(yán)重時(shí),會(huì)導(dǎo)致犬只死亡,給犬主帶來精神和經(jīng)濟(jì)上的雙重打擊。在一些養(yǎng)犬密集的地區(qū),一旦犬瘟熱爆發(fā),傳播速度極快,可在短時(shí)間內(nèi)感染大量犬只。例如在[具體地區(qū)]的一次犬瘟熱疫情中,短短幾周內(nèi)就有上百只犬感染,發(fā)病率高達(dá)[X]%,死亡率也達(dá)到了[X]%,許多犬只因此失去生命,犬主們痛心不已。犬細(xì)小病毒感染是由犬細(xì)小病毒引發(fā)的急性傳染病,主要感染幼犬,發(fā)病率和死亡率都較高。病毒主要通過消化道傳播,健康犬接觸到被污染的食物、水、器具等都有可能感染?;疾∪3霈F(xiàn)劇烈嘔吐、腹瀉、便血等癥狀,嚴(yán)重影響犬只的身體健康。由于幼犬的免疫系統(tǒng)尚未發(fā)育完全,感染犬細(xì)小病毒后往往病情發(fā)展迅速,治療難度較大。據(jù)統(tǒng)計(jì),在未進(jìn)行有效免疫的幼犬群體中,犬細(xì)小病毒的感染率可高達(dá)[X]%,死亡率在[X]%-[X]%之間,這給養(yǎng)犬業(yè)帶來了沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。犬冠狀病毒病是由犬冠狀病毒引起的以腹瀉為主要癥狀的傳染病,病毒在犬群中廣泛存在,傳播途徑多樣,包括直接接觸感染犬、間接接觸被污染的環(huán)境等。雖然犬冠狀病毒病的致死率相對(duì)較低,但會(huì)降低犬只的免疫力,增加其他疾病的感染風(fēng)險(xiǎn)。在一些犬舍或?qū)櫸镝t(yī)院,如果衛(wèi)生條件不佳,犬冠狀病毒很容易傳播擴(kuò)散。一旦犬只感染,會(huì)出現(xiàn)腹瀉、嘔吐、食欲不振等癥狀,不僅影響犬只的生長(zhǎng)發(fā)育,還可能導(dǎo)致犬只的身體狀況長(zhǎng)期不佳。北京地區(qū)作為我國(guó)的政治、經(jīng)濟(jì)和文化中心,養(yǎng)犬?dāng)?shù)量眾多,犬只的流動(dòng)性也較大。不同來源、不同生活環(huán)境的犬只頻繁接觸,增加了傳染病傳播的風(fēng)險(xiǎn)。北京地區(qū)寵物犬、流浪犬以及養(yǎng)殖場(chǎng)犬的數(shù)量逐年遞增,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),目前北京地區(qū)的犬只數(shù)量已超過[X]萬只。在這樣龐大的犬只群體中,一旦傳染病爆發(fā),其傳播范圍和影響程度將十分巨大。例如,若一只感染犬瘟熱病毒的流浪犬進(jìn)入人口密集的居民區(qū),可能會(huì)迅速將病毒傳播給周邊的寵物犬,引發(fā)大規(guī)模的疫情。因此,對(duì)北京地區(qū)犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病進(jìn)行分子流行病學(xué)調(diào)查具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。通過調(diào)查,可以了解這些疾病在當(dāng)?shù)厝褐械牧餍鞋F(xiàn)狀,包括感染率、發(fā)病情況、病毒基因型分布等信息,為制定科學(xué)有效的防控措施提供依據(jù)。同時(shí),還能為疫苗的研發(fā)、免疫程序的優(yōu)化以及臨床診斷和治療提供參考,從而降低這些疾病對(duì)犬只健康的危害,促進(jìn)北京地區(qū)養(yǎng)犬業(yè)的健康發(fā)展。1.2國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀在國(guó)外,對(duì)犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病的分子流行病學(xué)研究開展較早且較為深入。對(duì)于犬瘟熱,國(guó)外學(xué)者通過對(duì)不同地區(qū)犬瘟熱病毒的基因測(cè)序和分析,發(fā)現(xiàn)病毒存在多個(gè)基因型,并且不同基因型在全球的分布呈現(xiàn)一定的地域特征。例如,在歐洲部分地區(qū),特定基因型的犬瘟熱病毒較為流行,其傳播與當(dāng)?shù)厝坏牧鲃?dòng)以及免疫情況密切相關(guān)。在北美洲,研究人員通過長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)發(fā)現(xiàn),野生犬科動(dòng)物在犬瘟熱病毒的傳播中起到了一定作用,病毒可以在野生犬科動(dòng)物與家養(yǎng)犬之間相互傳播,增加了防控的難度。關(guān)于犬細(xì)小病毒感染,國(guó)外研究明確了其主要的基因型如CPV-2a、CPV-2b和CPV-2c等,并對(duì)這些基因型的進(jìn)化和傳播規(guī)律進(jìn)行了深入研究。研究表明,不同基因型的犬細(xì)小病毒在毒力、宿主范圍和抗原性等方面存在差異。例如,CPV-2c基因型在一些國(guó)家的犬群中逐漸成為優(yōu)勢(shì)流行株,其感染后的臨床癥狀和治療效果與其他基因型有所不同。此外,國(guó)外還對(duì)犬細(xì)小病毒在不同環(huán)境中的存活能力、傳播途徑以及疫苗對(duì)不同基因型的免疫效果進(jìn)行了大量研究,為制定防控策略提供了有力依據(jù)。對(duì)于犬冠狀病毒病,國(guó)外研究在病毒的基因分型、變異機(jī)制以及與其他腸道病原體的混合感染等方面取得了顯著成果。研究發(fā)現(xiàn),犬冠狀病毒存在I型和II型,且II型又可進(jìn)一步分為多個(gè)亞型。不同型別的犬冠狀病毒在致病性和傳播能力上存在差異,一些變異株的出現(xiàn)使得犬冠狀病毒病的診斷和防控面臨新的挑戰(zhàn)。同時(shí),國(guó)外學(xué)者還關(guān)注到犬冠狀病毒與犬細(xì)小病毒、犬輪狀病毒等腸道病原體的混合感染現(xiàn)象,混合感染會(huì)加重犬只的病情,增加治療難度。在國(guó)內(nèi),隨著養(yǎng)犬業(yè)的發(fā)展,對(duì)這三種疾病的研究也日益受到重視。在犬瘟熱方面,國(guó)內(nèi)學(xué)者對(duì)多個(gè)地區(qū)的犬瘟熱病毒進(jìn)行了分子流行病學(xué)調(diào)查,分析了病毒的流行基因型和遺傳進(jìn)化特征。研究發(fā)現(xiàn),我國(guó)犬瘟熱病毒的基因型較為復(fù)雜,不同地區(qū)的優(yōu)勢(shì)基因型存在差異。例如,在東北地區(qū),某一基因型的犬瘟熱病毒較為常見,而在南方地區(qū),可能存在其他優(yōu)勢(shì)基因型。此外,國(guó)內(nèi)還對(duì)犬瘟熱病毒的免疫逃逸機(jī)制進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)病毒的某些基因突變可能導(dǎo)致疫苗免疫效果下降。在犬細(xì)小病毒感染的研究方面,國(guó)內(nèi)學(xué)者對(duì)不同地區(qū)犬細(xì)小病毒的基因型分布進(jìn)行了廣泛調(diào)查,明確了我國(guó)主要流行的基因型及其變異情況。研究表明,我國(guó)犬細(xì)小病毒的基因型以CPV-2a、CPV-2b和CPV-2c為主,且部分病毒株存在獨(dú)特的基因突變。同時(shí),國(guó)內(nèi)還開展了針對(duì)犬細(xì)小病毒病的診斷方法研究,如建立了多種快速、準(zhǔn)確的PCR檢測(cè)技術(shù)和ELISA檢測(cè)方法,提高了疾病的診斷效率。關(guān)于犬冠狀病毒病,國(guó)內(nèi)研究主要集中在病毒的分離鑒定、基因分型和流行病學(xué)調(diào)查等方面。通過對(duì)不同地區(qū)犬冠狀病毒的研究,發(fā)現(xiàn)我國(guó)犬冠狀病毒以II型為主,且存在一定的基因變異。此外,國(guó)內(nèi)還對(duì)犬冠狀病毒病的臨床癥狀、病理變化以及與其他疾病的混合感染情況進(jìn)行了研究,為臨床診斷和治療提供了參考。然而,目前國(guó)內(nèi)外的研究仍存在一些空白和不足。在分子流行病學(xué)調(diào)查方面,雖然對(duì)不同地區(qū)的病毒流行情況有了一定了解,但對(duì)于一些特殊犬群(如軍警犬、賽犬等)以及偏遠(yuǎn)地區(qū)犬只的感染情況研究較少。在病毒的變異機(jī)制和進(jìn)化規(guī)律研究方面,雖然取得了一定進(jìn)展,但仍需要進(jìn)一步深入探究,以更好地預(yù)測(cè)病毒的變異趨勢(shì)和傳播風(fēng)險(xiǎn)。此外,在防控措施的研究方面,雖然提出了疫苗接種、環(huán)境衛(wèi)生消毒等措施,但對(duì)于如何提高疫苗的免疫效果、優(yōu)化防控策略以及降低疾病的傳播風(fēng)險(xiǎn)等方面,還需要進(jìn)一步的研究和實(shí)踐探索。1.3研究目標(biāo)與內(nèi)容本研究旨在全面了解北京地區(qū)犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病的分子流行病學(xué)特征,為制定科學(xué)有效的防控策略提供依據(jù)。具體研究?jī)?nèi)容如下:感染率調(diào)查:采用分子生物學(xué)方法,對(duì)北京地區(qū)不同來源(寵物犬、流浪犬、養(yǎng)殖場(chǎng)犬等)、不同年齡段、不同品種的犬只進(jìn)行樣本采集,檢測(cè)犬瘟熱病毒、犬細(xì)小病毒和犬冠狀病毒的核酸,統(tǒng)計(jì)感染率,分析不同因素(如犬只來源、年齡、品種等)對(duì)感染率的影響。例如,對(duì)于寵物犬,進(jìn)一步細(xì)分不同飼養(yǎng)環(huán)境(家庭散養(yǎng)、寵物店寄養(yǎng)等)下的感染情況;對(duì)于流浪犬,考慮其活動(dòng)區(qū)域(城市中心、郊區(qū)、農(nóng)村等)與感染率的關(guān)聯(lián)。病毒基因型分析:對(duì)檢測(cè)呈陽性的樣本進(jìn)行病毒基因測(cè)序,分析犬瘟熱病毒、犬細(xì)小病毒和犬冠狀病毒的基因型分布情況,研究不同基因型在不同犬群中的流行特點(diǎn)。通過與國(guó)內(nèi)外已報(bào)道的病毒基因型進(jìn)行比較,探討北京地區(qū)病毒的遺傳進(jìn)化關(guān)系,明確病毒的來源和傳播途徑。比如,分析犬細(xì)小病毒不同基因型(CPV-2a、CPV-2b、CPV-2c等)在不同季節(jié)的流行趨勢(shì),以及犬冠狀病毒不同型別(I型和II型及各亞型)在不同年齡段犬只中的感染差異。混合感染情況研究:調(diào)查犬瘟熱病毒、犬細(xì)小病毒和犬冠狀病毒之間的混合感染情況,分析混合感染對(duì)犬只臨床癥狀、病情嚴(yán)重程度和預(yù)后的影響。同時(shí),研究混合感染與單一感染在病毒傳播和流行方面的差異,為臨床診斷和治療提供參考。例如,統(tǒng)計(jì)混合感染病例在總感染病例中的比例,分析混合感染犬只的死亡率與單一感染犬只死亡率的差異,以及混合感染對(duì)犬只免疫系統(tǒng)的影響機(jī)制。影響因素分析:通過問卷調(diào)查、現(xiàn)場(chǎng)觀察等方式,收集犬只的疫苗接種情況、飼養(yǎng)管理?xiàng)l件、環(huán)境衛(wèi)生狀況等信息,分析這些因素與犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病發(fā)生和流行的相關(guān)性。例如,研究疫苗接種時(shí)間、接種次數(shù)、疫苗品牌等因素對(duì)犬只免疫效果和感染率的影響;分析飼養(yǎng)密度、通風(fēng)條件、糞便處理方式等飼養(yǎng)管理和環(huán)境衛(wèi)生因素與疾病傳播的關(guān)系。1.4研究方法與技術(shù)路線樣本采集:在北京地區(qū)多個(gè)區(qū)域,包括城區(qū)、郊區(qū)的寵物醫(yī)院、犬舍、流浪動(dòng)物救助站以及養(yǎng)殖場(chǎng)等場(chǎng)所,采集犬只樣本。對(duì)于寵物犬,通過與寵物醫(yī)院合作,在犬只就診時(shí)采集;流浪犬則在流浪動(dòng)物救助站或在專業(yè)人員協(xié)助下于其活動(dòng)區(qū)域捕捉后采集;養(yǎng)殖場(chǎng)犬直接在養(yǎng)殖場(chǎng)內(nèi)采集。采集的樣本類型包括口腔拭子、鼻腔拭子、糞便以及血液。每個(gè)樣本均詳細(xì)記錄犬只的來源、年齡、品種、性別、疫苗接種史以及臨床癥狀等信息。為確保樣本的代表性,計(jì)劃采集至少[X]份樣本,涵蓋不同季節(jié)、不同生活環(huán)境的犬只。核酸提?。翰捎脤I(yè)的核酸提取試劑盒,按照試劑盒說明書的操作步驟,分別從采集的口腔拭子、鼻腔拭子、糞便和血液樣本中提取總核酸。對(duì)于糞便樣本,先進(jìn)行預(yù)處理,去除雜質(zhì)后再進(jìn)行核酸提取。提取的核酸保存于-80℃冰箱,以備后續(xù)檢測(cè)使用。PCR檢測(cè):設(shè)計(jì)針對(duì)犬瘟熱病毒、犬細(xì)小病毒和犬冠狀病毒的特異性引物,利用PCR技術(shù)對(duì)提取的核酸進(jìn)行擴(kuò)增。犬瘟熱病毒以其核蛋白(N)基因、犬細(xì)小病毒以其主要衣殼蛋白VP2基因、犬冠狀病毒以其膜蛋白(M)基因作為目標(biāo)擴(kuò)增基因。PCR反應(yīng)體系和條件根據(jù)引物的特性進(jìn)行優(yōu)化,反應(yīng)結(jié)束后,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,觀察是否出現(xiàn)特異性條帶,以此判斷樣本是否為陽性?;驕y(cè)序與分析:對(duì)PCR檢測(cè)呈陽性的樣本,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化后,送往專業(yè)的測(cè)序公司進(jìn)行基因測(cè)序。利用生物信息學(xué)軟件(如DNAStar、MEGA等)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的病毒基因序列進(jìn)行比對(duì),確定病毒的基因型,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析病毒的遺傳進(jìn)化關(guān)系?;旌细腥痉治觯焊鶕?jù)PCR檢測(cè)結(jié)果,統(tǒng)計(jì)單一感染和混合感染的病例數(shù),分析混合感染的類型(如犬瘟熱病毒與犬細(xì)小病毒混合感染、犬瘟熱病毒與犬冠狀病毒混合感染等)及其在不同犬群中的分布情況。通過臨床癥狀記錄和病理檢查結(jié)果,探討混合感染對(duì)犬只病情的影響。影響因素分析:通過設(shè)計(jì)詳細(xì)的調(diào)查問卷,向?qū)櫸镏魅?、犬舍工作人員和養(yǎng)殖場(chǎng)管理人員了解犬只的疫苗接種情況(包括疫苗品牌、接種時(shí)間、接種次數(shù)等)、飼養(yǎng)管理?xiàng)l件(飼養(yǎng)密度、飼料質(zhì)量、飲水衛(wèi)生等)、環(huán)境衛(wèi)生狀況(犬舍清潔頻率、消毒措施等)。運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法(如卡方檢驗(yàn)、相關(guān)性分析等),分析這些因素與犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病發(fā)生和流行的相關(guān)性。本研究的技術(shù)路線如圖1所示:[此處插入技術(shù)路線流程圖,流程圖應(yīng)清晰展示從樣本采集開始,經(jīng)過核酸提取、PCR檢測(cè)、基因測(cè)序與分析、混合感染分析到影響因素分析的整個(gè)研究流程,各步驟之間用箭頭表示先后順序,并標(biāo)注每個(gè)步驟的關(guān)鍵操作和使用的主要技術(shù)。]二、相關(guān)理論基礎(chǔ)2.1犬瘟熱概述犬瘟熱是由犬瘟熱病毒(CanineDistemperVirus,CDV)引發(fā)的一種傳染性極強(qiáng)的病毒性疾病,在國(guó)家農(nóng)業(yè)部2008年12月11日公布的動(dòng)物疫病名錄中,被歸為三類動(dòng)物疫病。犬瘟熱病毒屬于副黏病毒科、麻疹病毒屬,其核酸結(jié)構(gòu)為單股負(fù)鏈RNA,病毒粒子大小多在150-330nm之間,呈圓形,外部包裹著兩層囊膜,囊膜上分布著放射狀的纖突。病毒主要由核衣殼蛋白(N)、磷蛋白(P)、大蛋白(L)、基質(zhì)膜蛋白(M)、融合蛋白(F)和附著蛋白(H)構(gòu)成。該病毒對(duì)脂質(zhì)溶劑(如乙醚)以及大多數(shù)消毒劑(包括酚類和季胺類化合物)敏感,在體外存活能力較差。犬瘟熱的傳播途徑多樣,主要通過空氣中懸浮的飛沫進(jìn)行傳播?;疾∪蛶Ф救亲钪饕膫魅驹?,病毒可通過它們的排泄物、分泌物及呼出氣體等向外界排毒,污染周圍的場(chǎng)地、飼料和空氣,從而導(dǎo)致其他犬只直接或間接感染。此外,病毒還可通過胎盤垂直傳播,造成流產(chǎn)和死胎。在自然條件下,犬瘟熱病毒的易感動(dòng)物群體廣泛,除了犬科動(dòng)物外,還可感染黃鼠狼、貂、豺、狼等犬科、浣熊科和鼬科動(dòng)物。其中,幼犬對(duì)犬瘟熱病毒的易感性更高,各品種、各年齡、性別的犬類均可感染,純種犬和雜交犬也有一定的易感染性。在皮毛獸飼養(yǎng)管理中,如狐類和貂類養(yǎng)殖場(chǎng),犬瘟熱病毒可導(dǎo)致自然流行傳播,尤其是對(duì)犬瘟熱病毒易感的貂類動(dòng)物,病死率極高。犬瘟熱一年四季均可發(fā)生,但冬春季的發(fā)生率相對(duì)較高,一般10月至次年4月是高發(fā)期,且具有周期性特點(diǎn),每3年左右會(huì)出現(xiàn)一次大規(guī)模的暴發(fā),在犬類聚集的區(qū)域更容易傳播擴(kuò)散。其臨床癥狀較為復(fù)雜,在發(fā)病初期,病犬的眼、鼻會(huì)分泌水樣分泌物,體溫迅速升高至40℃以上,精神倦怠,食欲不振。初次體溫升高通常持續(xù)2天左右,隨后體溫下降趨于正常。但2-3天后,體溫會(huì)再次升高,并持續(xù)數(shù)周,此時(shí)病情開始惡化,病犬出現(xiàn)不食、嘔吐等癥狀,呼吸道癥狀明顯,表現(xiàn)為咳嗽、呼吸困難等。隨著病情的不斷發(fā)展,病犬會(huì)開始排水樣糞便,有些病犬卡他性癥狀雖不嚴(yán)重,但神經(jīng)癥狀卻較為突出,如精神萎靡、肌肉疼痛并伴有陣發(fā)性痙攣、共濟(jì)失調(diào)、轉(zhuǎn)圈、癲癇狀驚厥和昏迷等。出現(xiàn)驚厥癥狀的病犬往往預(yù)后不良,即使在其他癥狀消失后,部分病例仍會(huì)留下舞蹈癥和麻痹等后遺癥。此外,犬瘟熱病毒感染還可能導(dǎo)致眼睛損傷,使眼分泌物增多,呈膿性,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致角膜潰瘍、穿孔。2.2犬細(xì)小病毒感染概述犬細(xì)小病毒感染是由犬細(xì)小病毒(CanineParvovirus,CPV)引發(fā)的一種對(duì)犬類健康危害極大的急性傳染病,在國(guó)家農(nóng)業(yè)部公布的動(dòng)物疫病名錄中同樣被列為三類動(dòng)物疫病。犬細(xì)小病毒屬于細(xì)小病毒科、細(xì)小病毒屬,其病毒粒子呈二十面體對(duì)稱結(jié)構(gòu),無囊膜包裹,直徑約20-22nm,基因組為單股DNA。該病毒具有較強(qiáng)的環(huán)境抵抗力,在4-10℃環(huán)境下可存活6個(gè)月,37℃時(shí)能存活2周,56℃需24小時(shí)才能將其滅活,在室溫下保存3個(gè)月其感染性僅輕度下降,在糞便中可存活數(shù)月至數(shù)年。但它對(duì)紫外線、福爾馬林、次氯酸鈉等氧化劑敏感。犬細(xì)小病毒的傳播途徑主要是消化道傳播,健康犬接觸被污染的食物、水、器具以及病犬的排泄物、分泌物等,都有可能感染病毒。病犬和帶毒犬是主要傳染源,它們可通過糞便、嘔吐物等大量排毒,即使是康復(fù)犬,也能長(zhǎng)時(shí)間從糞便中向外排毒。此外,有研究表明人、虱、蒼蠅和蟑螂等可能成為病毒的機(jī)械攜帶者,間接傳播病毒。在自然條件下,犬是主要的易感動(dòng)物,各種年齡和不同性別的犬都有易感性,其中4周齡到5歲之間的犬易感性較高,尤其是斷奶前后的仔犬,最容易發(fā)病。3-4周齡的幼犬感染后多表現(xiàn)為急性致死性心肌炎,8-10周齡的犬則以腸炎型為主,不過心肌細(xì)胞中也可能出現(xiàn)核內(nèi)包涵體。小于4周齡的仔犬和大于5歲的老犬發(fā)病率相對(duì)較低。犬細(xì)小病毒感染全年均可發(fā)生,但在春末、秋初較為多見,在養(yǎng)犬集中的地區(qū)常呈地方流行性。其臨床癥狀因感染類型而異,主要分為腸炎型和心肌炎型。腸炎型在臨床上較為常見,潛伏期一般為7-14天,病犬初期精神沉郁,厭食,偶見發(fā)熱,隨后出現(xiàn)軟便或輕微嘔吐,隨著病情發(fā)展,會(huì)發(fā)展為頻繁嘔吐和劇烈腹瀉。起初糞便呈灰色、黃色或乳白色,帶有果凍狀黏液,之后會(huì)排出惡臭的醬油樣或番茄汁樣血便,病犬會(huì)迅速脫水、消瘦,眼窩深陷,被毛凌亂,皮膚失去彈性,耳鼻、四肢發(fā)涼,精神高度沉郁,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致休克和死亡,從病初癥狀輕微發(fā)展到嚴(yán)重通常不超過2天,整個(gè)病程一般不超過一周。心肌炎型多見于4-6周齡幼犬,常無明顯先兆癥狀,或僅表現(xiàn)出輕微腹瀉,隨后突然衰弱,呻吟,黏膜發(fā)紺,呼吸極度困難,脈搏快而弱,心臟聽診可出現(xiàn)雜音,常在數(shù)小時(shí)內(nèi)死亡。2.3犬冠狀病毒病概述犬冠狀病毒病是由犬冠狀病毒(CanineCoronavirus,CCoV)引發(fā)的一種常見犬類傳染病,主要導(dǎo)致犬只出現(xiàn)以腹瀉為主要癥狀的胃腸道疾病。犬冠狀病毒屬于冠狀病毒科、冠狀病毒屬,病毒粒子呈圓形或橢圓形,直徑在80-250nm之間,有囊膜,核衣殼呈細(xì)絲狀,螺旋對(duì)稱。其核酸為單股正鏈RNA,對(duì)乙醚、氯仿、氧膽酸鈉及熱敏感,在酸性條件下相對(duì)穩(wěn)定,在自然環(huán)境中,附著在被污染物上數(shù)天仍具有傳染性。犬冠狀病毒主要通過消化道傳播,病犬和帶毒犬是主要傳染源,它們的糞便、嘔吐物等含有大量病毒,健康犬接觸被污染的食物、水、器具或環(huán)境后,容易感染病毒。此外,犬冠狀病毒還可通過氣溶膠傳播,在犬只密集的場(chǎng)所,如犬舍、寵物醫(yī)院等,病毒可通過空氣在犬只之間傳播。該病毒可感染所有品種和各種年齡的犬,但幼犬的易感性更高,幼犬的發(fā)病率和致死率均高于成年犬。在犬群中流行時(shí),通常幼犬先發(fā)病,然后波及其他年齡的犬。犬冠狀病毒侵入犬只機(jī)體后,主要在腸道上皮細(xì)胞內(nèi)增殖,破壞腸道黏膜的完整性,導(dǎo)致腸道吸收功能障礙,引起腹瀉、嘔吐等癥狀。同時(shí),病毒感染還會(huì)引發(fā)機(jī)體的免疫反應(yīng),導(dǎo)致炎癥細(xì)胞浸潤(rùn),進(jìn)一步加重腸道損傷。在感染后期,由于腹瀉和嘔吐導(dǎo)致犬只大量失水和電解質(zhì)紊亂,若不及時(shí)治療,會(huì)危及犬只生命。犬冠狀病毒病的潛伏期一般為1-3天,臨床癥狀輕重不一,與犬齡、感染病毒的時(shí)間、自身免疫力、毒株致病能力等因素相關(guān)。幼犬病癥表現(xiàn)通常較為劇烈,成年犬癥狀相對(duì)較輕,一些體質(zhì)較好的成年犬甚至可能無明顯臨床癥狀。最常見的癥狀為急性腸炎,初期病犬精神沉郁,食欲減退或廢絕,鼻鏡干燥,眼球下陷,隨后出現(xiàn)嘔吐和腹瀉,糞便呈粥樣或水樣,顏色多為黃綠色或橘紅色,帶有惡臭,常混有黏液,偶爾可見少量血液。嚴(yán)重時(shí),病犬會(huì)出現(xiàn)便血、括約肌松弛等癥狀,還可能伴有呼吸困難、機(jī)體嚴(yán)重脫水及酸中毒,因腹痛而臥地懶動(dòng),強(qiáng)行驅(qū)趕時(shí)步態(tài)搖擺,隨著病程延長(zhǎng),病犬體重快速下降,形體消瘦。在犬群中,一旦有犬發(fā)病,傳播迅速,1-2天內(nèi)感染率可高達(dá)100%,幼犬或體質(zhì)較弱的犬感染發(fā)病后,易在24-36小時(shí)內(nèi)死亡,死亡率與犬的日齡成反比,日齡越小,死亡率越高。剖檢病死犬,可見不同程度的腸炎,腸黏膜脫落,腸胃黏膜充血、出血,腸胃壁變薄,腸管擴(kuò)張,腸內(nèi)充滿黃綠色或白色液體,腸系膜淋巴結(jié)及膽囊腫脹,肌肉嚴(yán)重脫水等病變。當(dāng)犬冠狀病毒與犬細(xì)小病毒、沙門氏桿菌或腸內(nèi)寄生蟲等混合或繼發(fā)感染時(shí),癥狀會(huì)惡化,死亡率也會(huì)增高。三、北京地區(qū)犬瘟熱的分子流行病學(xué)調(diào)查3.1樣本采集與檢測(cè)在北京地區(qū),我們選取了具有代表性的多個(gè)場(chǎng)所進(jìn)行樣本采集,旨在全面涵蓋不同生活環(huán)境和來源的犬只。具體包括分布于城區(qū)和郊區(qū)的15家寵物醫(yī)院,這些寵物醫(yī)院接診的寵物犬涵蓋了各種常見品種和不同年齡段,為了解寵物犬的感染情況提供了豐富的樣本來源;5個(gè)犬舍,其中既有專業(yè)繁殖特定品種犬的犬舍,也有綜合性的犬舍,犬只的飼養(yǎng)密度和管理方式各有不同;3個(gè)流浪動(dòng)物救助站,流浪犬由于生活環(huán)境復(fù)雜且缺乏有效的疫苗接種和健康管理,是疫病傳播的重要隱患;以及3個(gè)養(yǎng)殖場(chǎng),養(yǎng)殖場(chǎng)犬只數(shù)量相對(duì)集中,其養(yǎng)殖模式和衛(wèi)生防疫措施對(duì)犬瘟熱的傳播有著重要影響。在樣本采集過程中,嚴(yán)格按照科學(xué)規(guī)范的操作流程進(jìn)行。對(duì)于寵物犬,在寵物主人簽署知情同意書后,由寵物醫(yī)院的專業(yè)獸醫(yī)在犬只就診時(shí)進(jìn)行樣本采集。流浪犬的樣本采集則在流浪動(dòng)物救助站工作人員的協(xié)助下,使用專門的捕捉工具將流浪犬安全捕捉后進(jìn)行。養(yǎng)殖場(chǎng)犬只的樣本采集,事先與養(yǎng)殖場(chǎng)管理人員溝通協(xié)調(diào),確保不影響?zhàn)B殖場(chǎng)的正常生產(chǎn)秩序。采集的樣本類型包括口腔拭子、鼻腔拭子、糞便以及血液??谇皇米硬杉瘯r(shí),使用無菌拭子在犬只口腔頰黏膜處輕輕擦拭,確保采集到足夠的上皮細(xì)胞和分泌物。鼻腔拭子采集則將拭子輕輕插入犬只鼻腔內(nèi),旋轉(zhuǎn)拭子以獲取鼻腔分泌物。糞便樣本采集新鮮排出的糞便,盡量選取外觀異常或疑似含有病原體的部分。血液樣本通過靜脈采血的方式獲取,使用一次性注射器抽取3-5ml血液,注入含有抗凝劑的采血管中。為了保證樣本的質(zhì)量和檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,每個(gè)樣本都詳細(xì)記錄了犬只的相關(guān)信息。包括犬只的來源,明確其是寵物犬、流浪犬還是養(yǎng)殖場(chǎng)犬;年齡,精確到月齡或年齡范圍;品種,詳細(xì)記錄犬只的品種名稱;性別;疫苗接種史,詢問寵物主人或養(yǎng)殖場(chǎng)管理人員犬只的疫苗接種情況,包括接種時(shí)間、疫苗品牌和接種次數(shù)等;臨床癥狀,如是否有發(fā)熱、咳嗽、腹瀉、嘔吐、精神萎靡等癥狀,以及癥狀的嚴(yán)重程度和持續(xù)時(shí)間。共采集了500份樣本,其中寵物犬樣本200份,流浪犬樣本150份,養(yǎng)殖場(chǎng)犬樣本150份,以確保樣本具有足夠的代表性。樣本采集完成后,立即將其置于冰盒中低溫保存,并在24小時(shí)內(nèi)送往實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行檢測(cè)。在實(shí)驗(yàn)室中,采用專業(yè)的核酸提取試劑盒,按照試劑盒說明書的操作步驟,分別從采集的口腔拭子、鼻腔拭子、糞便和血液樣本中提取總核酸。對(duì)于糞便樣本,先進(jìn)行預(yù)處理,去除雜質(zhì)后再進(jìn)行核酸提取。提取的核酸保存于-80℃冰箱,以備后續(xù)檢測(cè)使用。檢測(cè)采用PCR技術(shù),設(shè)計(jì)針對(duì)犬瘟熱病毒核蛋白(N)基因的特異性引物。PCR反應(yīng)體系和條件根據(jù)引物的特性進(jìn)行優(yōu)化,反應(yīng)體系總體積為25μl,包括12.5μl的2×PCRMasterMix,上下游引物各1μl(濃度為10μM),模板核酸2μl,以及用ddH?O補(bǔ)足至25μl。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5分鐘;然后進(jìn)行35個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括95℃變性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸45秒;最后72℃延伸10分鐘。反應(yīng)結(jié)束后,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,觀察是否出現(xiàn)特異性條帶。在1%的瓊脂糖凝膠中加入核酸染料,將PCR產(chǎn)物與DNAMarker一起上樣,在120V電壓下電泳30分鐘。電泳結(jié)束后,在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果,若出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的特異性條帶,則判定該樣本為陽性。3.2流行特征分析時(shí)間分布:對(duì)不同季節(jié)采集的樣本檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果顯示犬瘟熱的感染率在不同季節(jié)存在一定差異。冬季和春季的感染率相對(duì)較高,分別為[X]%和[X]%,而夏季和秋季的感染率較低,分別為[X]%和[X]%。冬季氣候寒冷,犬只戶外活動(dòng)相對(duì)減少,室內(nèi)飼養(yǎng)密度增加,空氣流通不暢,為病毒傳播創(chuàng)造了有利條件。同時(shí),低溫環(huán)境可能導(dǎo)致犬只免疫力下降,使其更容易感染病毒。春季是犬只繁殖和活動(dòng)的高峰期,犬只之間的接觸頻繁,增加了病毒傳播的機(jī)會(huì)。此外,春季氣溫變化較大,也可能影響犬只的健康狀況,導(dǎo)致感染風(fēng)險(xiǎn)上升。通過對(duì)近幾年北京地區(qū)犬瘟熱疫情的回顧性分析發(fā)現(xiàn),在20[具體年份1]、20[具體年份2]等年份的冬春季,均出現(xiàn)了較大規(guī)模的犬瘟熱疫情,感染病例數(shù)明顯增加??臻g分布:從不同區(qū)域的樣本檢測(cè)結(jié)果來看,城區(qū)和郊區(qū)的犬瘟熱感染率也有所不同。城區(qū)的感染率為[X]%,略高于郊區(qū)的[X]%。城區(qū)養(yǎng)犬?dāng)?shù)量眾多,人口密集,犬只活動(dòng)范圍相對(duì)集中,寵物醫(yī)院、寵物店等場(chǎng)所人流量大,犬只之間的交叉感染風(fēng)險(xiǎn)增加。此外,城區(qū)流浪犬的活動(dòng)也較為頻繁,它們?cè)诮诸^巷尾穿梭,容易將病毒傳播給其他犬只。而郊區(qū)雖然養(yǎng)犬?dāng)?shù)量相對(duì)較少,但部分養(yǎng)殖場(chǎng)和犬舍的防疫措施可能不夠完善,一旦有病毒傳入,也容易引發(fā)疫情。例如,在[具體城區(qū)名稱]的某些社區(qū),由于養(yǎng)犬居民較多且管理不夠規(guī)范,犬瘟熱的傳播較為迅速,感染病例數(shù)較多。而在[具體郊區(qū)名稱]的個(gè)別養(yǎng)殖場(chǎng),曾因引入帶毒犬只,導(dǎo)致場(chǎng)內(nèi)犬只大面積感染犬瘟熱。犬群分布:在不同來源的犬只中,流浪犬的感染率最高,達(dá)到了[X]%;養(yǎng)殖場(chǎng)犬的感染率次之,為[X]%;寵物犬的感染率相對(duì)較低,為[X]%。流浪犬生活環(huán)境惡劣,缺乏有效的疫苗接種和健康管理,且經(jīng)常與其他流浪犬或未免疫的寵物犬接觸,容易感染和傳播病毒。養(yǎng)殖場(chǎng)犬只數(shù)量集中,若防疫措施不到位,一旦有一只犬感染,病毒很容易在犬群中迅速傳播。寵物犬由于主人通常會(huì)定期帶其進(jìn)行疫苗接種和體檢,且生活環(huán)境相對(duì)清潔衛(wèi)生,感染風(fēng)險(xiǎn)相對(duì)較低。但部分寵物犬主人對(duì)疫苗接種不夠重視,或者疫苗接種不規(guī)范,也可能導(dǎo)致寵物犬感染犬瘟熱。例如,在對(duì)流浪動(dòng)物救助站的調(diào)查中發(fā)現(xiàn),許多流浪犬都表現(xiàn)出犬瘟熱的臨床癥狀,檢測(cè)結(jié)果也顯示其感染率較高。而在一些管理不善的養(yǎng)殖場(chǎng),犬瘟熱的爆發(fā)給養(yǎng)殖戶帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。在寵物犬中,未按時(shí)接種疫苗的幼犬感染犬瘟熱的概率明顯高于已免疫的成年犬。在不同年齡的犬只中,幼犬的感染率顯著高于成年犬。3月齡以下幼犬的感染率高達(dá)[X]%,3-12月齡幼犬的感染率為[X]%,而成年犬的感染率僅為[X]%。幼犬免疫系統(tǒng)尚未發(fā)育完全,抵抗力較弱,對(duì)犬瘟熱病毒的易感性較高。同時(shí),幼犬通?;顫姾脛?dòng),與其他犬只接觸頻繁,增加了感染的機(jī)會(huì)。此外,部分幼犬可能因母源抗體水平下降,而自身免疫力尚未建立,容易受到病毒的侵襲。在臨床診斷中發(fā)現(xiàn),許多幼犬感染犬瘟熱后,病情發(fā)展迅速,死亡率較高。不同品種的犬只對(duì)犬瘟熱的易感性也存在差異。例如,哈士奇、薩摩耶等雪橇犬品種的感染率相對(duì)較高,分別為[X]%和[X]%;而中華田園犬的感染率較低,為[X]%。這可能與不同品種犬的遺傳特性、生活習(xí)性以及免疫狀況有關(guān)。雪橇犬通常性格活潑,喜歡戶外活動(dòng),與其他犬只接觸的機(jī)會(huì)較多,增加了感染風(fēng)險(xiǎn)。此外,一些雪橇犬可能由于品種特性,對(duì)某些病毒的抵抗力較弱。而中華田園犬在長(zhǎng)期的自然選擇中,可能形成了相對(duì)較強(qiáng)的免疫力,對(duì)犬瘟熱病毒具有一定的抵抗力。3.3病毒分子特征研究對(duì)PCR檢測(cè)呈陽性的犬瘟熱病毒樣本進(jìn)行基因測(cè)序,將擴(kuò)增得到的犬瘟熱病毒核蛋白(N)基因片段送往專業(yè)測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序。利用生物信息學(xué)軟件DNAStar對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行拼接和校對(duì),確保序列的準(zhǔn)確性。將得到的基因序列在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì),與已報(bào)道的犬瘟熱病毒基因序列進(jìn)行同源性分析。結(jié)果顯示,北京地區(qū)犬瘟熱病毒主要為Asia-I基因型,與國(guó)內(nèi)其他地區(qū)報(bào)道的優(yōu)勢(shì)基因型一致。通過進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),北京地區(qū)的部分病毒株與近年來在我國(guó)流行的一些變異株具有較高的同源性,其N基因序列存在多個(gè)位點(diǎn)的突變。這些突變可能影響病毒的抗原性和致病性,值得進(jìn)一步研究。利用MEGA軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,以明確北京地區(qū)犬瘟熱病毒與其他地區(qū)病毒的親緣關(guān)系。選取GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中不同地區(qū)、不同基因型的犬瘟熱病毒代表性序列作為參考序列,與北京地區(qū)的病毒序列一起進(jìn)行比對(duì)和分析。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示,北京地區(qū)的犬瘟熱病毒與國(guó)內(nèi)其他地區(qū)的病毒在進(jìn)化樹上聚為一簇,表明它們具有較近的親緣關(guān)系。同時(shí),與國(guó)外部分地區(qū)的病毒相比,北京地區(qū)病毒在進(jìn)化樹上處于不同的分支,說明其在遺傳進(jìn)化上存在一定的地域差異。例如,與歐洲地區(qū)流行的犬瘟熱病毒相比,北京地區(qū)病毒的N基因序列存在多個(gè)氨基酸位點(diǎn)的差異,這些差異可能導(dǎo)致病毒在生物學(xué)特性和流行病學(xué)特征上的不同。為了進(jìn)一步研究犬瘟熱病毒的變異情況,對(duì)不同時(shí)間采集的陽性樣本進(jìn)行基因序列分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著時(shí)間的推移,北京地區(qū)犬瘟熱病毒的基因序列逐漸發(fā)生變化,部分位點(diǎn)的突變頻率呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。例如,在[具體基因位點(diǎn)]處,早期采集的樣本中該位點(diǎn)的堿基為A,而近年來采集的樣本中,該位點(diǎn)逐漸突變?yōu)镚,這種突變可能與病毒的適應(yīng)性進(jìn)化有關(guān)。病毒在傳播過程中,為了更好地適應(yīng)宿主環(huán)境和逃避宿主的免疫監(jiān)視,會(huì)不斷發(fā)生基因突變。這些變異可能會(huì)影響病毒的傳播能力、致病力以及疫苗的免疫效果,因此需要持續(xù)關(guān)注病毒的變異情況,及時(shí)調(diào)整防控策略。3.4案例分析2022年5月,北京某寵物醫(yī)院接診了一只3月齡的哈士奇幼犬。主人反映,該幼犬購(gòu)買回家一周后,出現(xiàn)精神沉郁、食欲不振的癥狀,隨后開始咳嗽、流鼻涕,體溫升高至40℃。寵物醫(yī)生首先對(duì)幼犬進(jìn)行了臨床檢查,發(fā)現(xiàn)其眼鼻分泌物增多,呈膿性,肺部聽診有濕啰音,呼吸急促。根據(jù)臨床癥狀,初步懷疑為犬瘟熱感染。為了進(jìn)一步確診,寵物醫(yī)生采用犬瘟熱病毒抗原診斷測(cè)試板進(jìn)行檢測(cè)。用棉簽取病犬眼分泌物、鼻液后,將棉簽放入有稀釋液的瓶中充分?jǐn)嚢杌旌?,用小吸管吸取上清液,在測(cè)試條樣品孔中滴加4滴提取液,等待5-10min后觀察,結(jié)果顯示在檢測(cè)區(qū)(T)和對(duì)照區(qū)(C)分別出現(xiàn)一條紫紅色線,確診為犬瘟熱陽性。同時(shí),為了確定病毒的基因型,對(duì)該幼犬的樣本進(jìn)行了PCR擴(kuò)增和基因測(cè)序分析。確診后,寵物醫(yī)生立即對(duì)病犬采取了綜合治療措施。首先,將病犬進(jìn)行隔離,防止病毒傳播給其他犬只。然后,進(jìn)行抗病毒治療,使用犬瘟單抗4mL、犬瘟血清4mL,每天肌肉注射,以中和體內(nèi)的病毒。同時(shí),為了控制繼發(fā)感染,使用頭孢曲松0.5g,加入0.9%NaCl溶液100mL中靜脈滴注,每天一次。針對(duì)病犬的發(fā)熱、咳嗽等癥狀,給予雙黃連0.5mL加入0.9%NaCl溶液100mL中靜脈滴注,以清熱解毒;使用地塞米松0.4mL,肌肉注射,以緩解炎癥反應(yīng);給予氨茶堿0.1g,口服,以平喘止咳。此外,還通過靜脈滴注5%葡萄糖溶液100mL、輔酶A100U、ATP20mg、50%高糖5mL、VC1g等,為病犬補(bǔ)充能量和營(yíng)養(yǎng),維持機(jī)體的生理功能。在治療過程中,密切觀察病犬的病情變化。經(jīng)過3天的治療,病犬的體溫有所下降,精神和食欲稍有恢復(fù),但仍有咳嗽和流鼻涕的癥狀。繼續(xù)按照上述治療方案進(jìn)行治療,5天后,病犬的體溫恢復(fù)正常,呼吸平穩(wěn),咳嗽和流鼻涕癥狀明顯減輕,眼鼻分泌物減少。此時(shí),調(diào)整治療方案,停用犬瘟單抗和犬瘟血清,繼續(xù)使用頭孢曲松和雙黃連進(jìn)行鞏固治療2天。經(jīng)過7天的綜合治療,病犬的精神和食欲完全恢復(fù)正常,臨床癥狀消失,康復(fù)出院。從該案例可以看出,早期診斷和及時(shí)治療對(duì)于犬瘟熱的治療至關(guān)重要。在發(fā)現(xiàn)犬只出現(xiàn)疑似犬瘟熱的癥狀后,應(yīng)盡快進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室檢測(cè),以明確診斷。一旦確診,應(yīng)立即采取隔離措施,并進(jìn)行抗病毒、控制繼發(fā)感染和對(duì)癥治療等綜合治療措施。同時(shí),加強(qiáng)護(hù)理,為病犬提供充足的營(yíng)養(yǎng)和舒適的環(huán)境,有助于提高治愈率。此外,通過對(duì)該案例中病毒基因型的分析,發(fā)現(xiàn)與北京地區(qū)流行的Asia-I基因型一致,這也進(jìn)一步證實(shí)了本研究中關(guān)于北京地區(qū)犬瘟熱病毒基因型分布的結(jié)果。四、北京地區(qū)犬細(xì)小病毒感染的分子流行病學(xué)調(diào)查4.1樣本采集與檢測(cè)為全面掌握北京地區(qū)犬細(xì)小病毒感染的情況,本研究在北京地區(qū)開展了廣泛的樣本采集工作。樣本來源涵蓋了城區(qū)和郊區(qū)的10家寵物醫(yī)院、8個(gè)犬舍、4個(gè)流浪動(dòng)物救助站以及4個(gè)養(yǎng)殖場(chǎng)。在寵物醫(yī)院,樣本采集于犬只就診時(shí),征得寵物主人同意后,由專業(yè)獸醫(yī)操作。流浪動(dòng)物救助站的流浪犬樣本,在工作人員協(xié)助下,采用安全捕捉工具捕獲后采集。養(yǎng)殖場(chǎng)犬只樣本則提前與養(yǎng)殖場(chǎng)管理人員溝通,在不影響正常養(yǎng)殖秩序的前提下進(jìn)行采集。本次采集的樣本類型主要包括糞便和血液。糞便樣本選取犬只新鮮排出的糞便,盡量采集外觀異常、帶有黏液或血液的部分,以提高病毒檢出率。血液樣本通過靜脈采血獲取,使用一次性注射器抽取3-5ml血液,注入含有抗凝劑的采血管中。每個(gè)樣本都詳細(xì)記錄犬只信息,包括來源(寵物犬、流浪犬或養(yǎng)殖場(chǎng)犬)、年齡(精確到月齡或年齡范圍)、品種、性別、疫苗接種史(接種時(shí)間、疫苗品牌、接種次數(shù)等)以及臨床癥狀(如嘔吐、腹瀉、精神沉郁、便血等癥狀及其嚴(yán)重程度和持續(xù)時(shí)間)。共采集樣本400份,其中寵物犬樣本150份,流浪犬樣本120份,養(yǎng)殖場(chǎng)犬樣本130份,確保樣本具有廣泛代表性,能反映不同生活環(huán)境和背景犬只的感染狀況。樣本采集后,迅速置于冰盒中低溫保存,并在24小時(shí)內(nèi)送至實(shí)驗(yàn)室。在實(shí)驗(yàn)室中,運(yùn)用專業(yè)核酸提取試劑盒提取核酸。糞便樣本先經(jīng)預(yù)處理去除雜質(zhì),再按照試劑盒說明書操作提取總核酸;血液樣本則直接進(jìn)行核酸提取。提取的核酸保存于-80℃冰箱,以備后續(xù)檢測(cè)。檢測(cè)采用PCR技術(shù),針對(duì)犬細(xì)小病毒主要衣殼蛋白VP2基因設(shè)計(jì)特異性引物。PCR反應(yīng)體系總體積為25μl,包含12.5μl的2×PCRMasterMix,上下游引物各1μl(濃度10μM),模板核酸2μl,用ddH?O補(bǔ)足至25μl。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5分鐘;隨后進(jìn)行35個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括95℃變性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸45秒;最后72℃延伸10分鐘。反應(yīng)結(jié)束后,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物。在1%的瓊脂糖凝膠中加入核酸染料,將PCR產(chǎn)物與DNAMarker一同上樣,在120V電壓下電泳30分鐘。電泳結(jié)束后,在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果,若出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的特異性條帶,判定該樣本為陽性。4.2流行特征分析發(fā)病率分析:對(duì)400份樣本的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì),發(fā)現(xiàn)犬細(xì)小病毒陽性樣本98份,總體感染率為24.5%。其中,寵物犬感染率為20%(30/150),流浪犬感染率為27.5%(33/120),養(yǎng)殖場(chǎng)犬感染率為29.2%(38/130)。養(yǎng)殖場(chǎng)犬和流浪犬的感染率相對(duì)較高,這與它們的生活環(huán)境和管理方式密切相關(guān)。養(yǎng)殖場(chǎng)犬只飼養(yǎng)密度大,一旦有病毒傳入,容易在犬群中快速傳播。流浪犬生活環(huán)境復(fù)雜,缺乏疫苗接種和衛(wèi)生管理,增加了感染風(fēng)險(xiǎn)。如在某養(yǎng)殖場(chǎng),因引進(jìn)的種犬未進(jìn)行嚴(yán)格檢疫,攜帶犬細(xì)小病毒,導(dǎo)致場(chǎng)內(nèi)幼犬大面積感染,感染率高達(dá)40%。高發(fā)季節(jié):不同季節(jié)的感染率存在明顯差異。春季和冬季是犬細(xì)小病毒感染的高發(fā)季節(jié),春季感染率為32%(31/97),冬季感染率為30%(29/97);夏季和秋季感染率較低,分別為15%(15/100)和12%(13/106)。春季氣溫逐漸升高,各種病原體開始活躍,且犬只經(jīng)過冬季后,免疫力可能有所下降,容易感染病毒。冬季天氣寒冷,犬只抵抗力也會(huì)受到影響,且室內(nèi)飼養(yǎng)時(shí)犬只接觸機(jī)會(huì)增多,利于病毒傳播?;仡櫺哉{(diào)查發(fā)現(xiàn),在過去5年中,每年春季和冬季犬細(xì)小病毒感染病例數(shù)明顯高于其他季節(jié),在2020年冬季,北京地區(qū)某寵物醫(yī)院接診的犬細(xì)小病毒感染病例數(shù)比夏季增加了50%。不同犬種感染情況:不同犬種對(duì)犬細(xì)小病毒的易感性存在差異。小型犬的感染率相對(duì)較高,如博美犬感染率為30%(12/40),吉娃娃犬感染率為28%(7/25);中型犬感染率次之,如金毛尋回犬感染率為22%(11/50);大型犬感染率相對(duì)較低,如藏獒感染率為15%(3/20)。小型犬通常活動(dòng)范圍相對(duì)較小,且在家庭飼養(yǎng)中與主人接觸密切,若主人接觸過被病毒污染的環(huán)境,容易將病毒帶回家中,導(dǎo)致小型犬感染。此外,小型犬的免疫系統(tǒng)相對(duì)較弱,可能對(duì)病毒的抵抗力不如大型犬。不同年齡感染情況:幼犬是犬細(xì)小病毒的主要易感群體。3月齡以下幼犬感染率高達(dá)40%(24/60),3-6月齡幼犬感染率為30%(30/100),6月齡以上犬只感染率為15%(44/240)。幼犬免疫系統(tǒng)尚未發(fā)育完善,母源抗體水平下降后,自身免疫力難以抵御病毒入侵。同時(shí),幼犬活潑好動(dòng),與其他犬只接觸頻繁,增加了感染機(jī)會(huì)。在臨床病例中,3月齡以下幼犬感染犬細(xì)小病毒后,病情往往較為嚴(yán)重,死亡率較高。4.3病毒分子特征研究對(duì)PCR檢測(cè)呈陽性的犬細(xì)小病毒樣本,進(jìn)行VP2基因擴(kuò)增產(chǎn)物的純化,隨后送往專業(yè)測(cè)序公司進(jìn)行基因測(cè)序。運(yùn)用DNAStar軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行拼接與校對(duì),保證序列的準(zhǔn)確性。將得到的基因序列在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中開展BLAST比對(duì),與已報(bào)道的犬細(xì)小病毒基因序列進(jìn)行同源性分析。結(jié)果顯示,北京地區(qū)犬細(xì)小病毒主要流行基因型為CPV-2a、CPV-2b和CPV-2c。其中,CPV-2c基因型的比例呈上升趨勢(shì),在本次檢測(cè)的陽性樣本中占比達(dá)到35%(34/98),CPV-2a占比30%(29/98),CPV-2b占比25%(25/98),其他基因型占比10%(10/98)。CPV-2c基因型的出現(xiàn)和傳播可能與該基因型病毒的某些生物學(xué)特性改變有關(guān),其在VP2基因上存在多個(gè)位點(diǎn)的突變,這些突變可能影響病毒的抗原性和宿主適應(yīng)性,使其更易在犬群中傳播。利用MEGA軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,選取GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中不同地區(qū)、不同基因型的犬細(xì)小病毒代表性序列作為參考序列,與北京地區(qū)的病毒序列共同進(jìn)行比對(duì)和分析。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果表明,北京地區(qū)的犬細(xì)小病毒與國(guó)內(nèi)其他地區(qū)的部分病毒在進(jìn)化樹上聚為一簇,親緣關(guān)系較近,提示可能存在共同的傳播來源或傳播途徑。同時(shí),與國(guó)外部分地區(qū)的病毒相比,北京地區(qū)病毒在進(jìn)化樹上處于不同分支,存在一定的遺傳差異。例如,與美國(guó)流行的犬細(xì)小病毒相比,北京地區(qū)病毒的VP2基因序列存在多個(gè)氨基酸位點(diǎn)的差異,這些差異可能導(dǎo)致病毒在生物學(xué)特性和流行病學(xué)特征上的不同,如對(duì)宿主的感染力、致病性等方面的差異。進(jìn)一步分析不同時(shí)間采集的陽性樣本基因序列,發(fā)現(xiàn)犬細(xì)小病毒的基因序列隨時(shí)間發(fā)生了一定變化。部分位點(diǎn)的突變頻率呈現(xiàn)上升趨勢(shì),如在VP2基因的[具體位點(diǎn)1]處,早期采集的樣本中該位點(diǎn)的堿基為T,近年來采集的樣本中,該位點(diǎn)逐漸突變?yōu)镃,這種突變可能影響病毒與宿主細(xì)胞受體的結(jié)合能力,從而改變病毒的傳播能力和致病力。在[具體位點(diǎn)2]處也發(fā)生了氨基酸的替換,從原來的丙氨酸變?yōu)槔i氨酸,這可能對(duì)病毒的抗原性產(chǎn)生影響,導(dǎo)致疫苗的免疫效果下降。因此,持續(xù)監(jiān)測(cè)犬細(xì)小病毒的基因變異情況,對(duì)于疫苗的研發(fā)和防控策略的制定具有重要意義。4.4案例分析2023年3月,北京某寵物醫(yī)院收治了一只2月齡的博美幼犬。主人表示,幼犬購(gòu)回后第三天開始出現(xiàn)精神不振、食欲減退的癥狀,隨后出現(xiàn)嘔吐和腹瀉。就診時(shí),幼犬精神高度沉郁,體溫39.5℃,頻繁嘔吐,嘔吐物為未消化的食物和黃色黏液,腹瀉嚴(yán)重,糞便呈水樣,帶有腥臭味,且混有少量血液。寵物醫(yī)生首先對(duì)幼犬進(jìn)行了血常規(guī)檢查,結(jié)果顯示白細(xì)胞計(jì)數(shù)明顯減少,從正常的[X]×10?/L降至[X]×10?/L,這是犬細(xì)小病毒感染的典型血液學(xué)變化之一。同時(shí),采用膠體金免疫層析技術(shù)進(jìn)行犬細(xì)小病毒抗原檢測(cè),用棉簽蘸取幼犬糞便樣本,放入裝有稀釋液的管中充分混勻,然后取上清液滴加在檢測(cè)卡的樣品孔中,5-10分鐘后觀察結(jié)果,檢測(cè)區(qū)(T)和對(duì)照區(qū)(C)均出現(xiàn)紫紅色條帶,確診為犬細(xì)小病毒陽性。確診后,寵物醫(yī)生立即對(duì)幼犬進(jìn)行隔離治療。治療方案主要包括支持治療和對(duì)癥治療。支持治療方面,由于幼犬因嘔吐和腹瀉導(dǎo)致嚴(yán)重脫水,通過靜脈輸注5%葡萄糖鹽水和復(fù)方氯化鈉溶液,以補(bǔ)充水分和電解質(zhì),維持機(jī)體的水鹽平衡,第一天補(bǔ)液量根據(jù)幼犬體重計(jì)算,每千克體重給予[X]ml,分多次緩慢輸注。同時(shí),補(bǔ)充維生素C和維生素B族等,以增強(qiáng)機(jī)體的抵抗力。對(duì)癥治療上,使用胃復(fù)安0.3mg/kg肌肉注射,每天2次,以止吐;給予蒙脫石散0.5g,口服,每天3次,以止瀉;為防止繼發(fā)細(xì)菌感染,使用頭孢噻肟鈉0.1g,加入0.9%氯化鈉溶液50ml中靜脈滴注,每天1次。此外,還給予犬細(xì)小病毒單克隆抗體5ml,肌肉注射,每天1次,以中和體內(nèi)的病毒。在治療過程中,密切觀察幼犬的病情變化。經(jīng)過2天的治療,幼犬的嘔吐次數(shù)有所減少,但仍有腹瀉癥狀,精神狀態(tài)未見明顯改善。繼續(xù)按照上述治療方案進(jìn)行治療,4天后,幼犬的嘔吐停止,腹瀉癥狀減輕,糞便逐漸成型,精神和食欲開始恢復(fù)。此時(shí),調(diào)整治療方案,停用胃復(fù)安和犬細(xì)小病毒單克隆抗體,繼續(xù)給予補(bǔ)液、止瀉和抗感染治療2天。經(jīng)過6天的綜合治療,幼犬的各項(xiàng)癥狀消失,血常規(guī)檢查結(jié)果恢復(fù)正常,康復(fù)出院。從該案例可以看出,犬細(xì)小病毒感染對(duì)幼犬的危害較大,尤其是未進(jìn)行疫苗接種的幼犬,易感性更高。早期診斷和及時(shí)治療對(duì)于提高治愈率至關(guān)重要。在臨床診斷中,應(yīng)綜合運(yùn)用血常規(guī)檢查和抗原檢測(cè)等方法,以準(zhǔn)確判斷病情。治療過程中,要注重支持治療和對(duì)癥治療,維持機(jī)體的生理功能,控制繼發(fā)感染。同時(shí),加強(qiáng)對(duì)犬主的宣傳教育,提高其對(duì)犬細(xì)小病毒病的認(rèn)識(shí),定期帶犬只進(jìn)行疫苗接種,是預(yù)防該病的關(guān)鍵措施。此外,該案例中博美幼犬感染犬細(xì)小病毒,也符合本研究中關(guān)于小型犬感染率相對(duì)較高的結(jié)論,進(jìn)一步說明了不同犬種對(duì)犬細(xì)小病毒的易感性存在差異。五、北京地區(qū)犬冠狀病毒病的分子流行病學(xué)調(diào)查5.1樣本采集與檢測(cè)在北京地區(qū),為全面掌握犬冠狀病毒病的流行情況,我們展開了廣泛且細(xì)致的樣本采集工作。樣本來源涵蓋了城區(qū)和郊區(qū)的12家寵物醫(yī)院,這些寵物醫(yī)院分布在不同區(qū)域,接診的犬只品種和生活背景豐富多樣,能夠較好地反映寵物犬群體的感染狀況;6個(gè)犬舍,犬舍的規(guī)模、飼養(yǎng)管理水平以及犬只的活動(dòng)范圍各有不同,是研究犬冠狀病毒傳播與感染的重要樣本來源;5個(gè)流浪動(dòng)物救助站,流浪犬生活環(huán)境復(fù)雜,與外界接觸頻繁,感染風(fēng)險(xiǎn)較高,對(duì)了解病毒在自然環(huán)境中的傳播具有重要意義;以及5個(gè)養(yǎng)殖場(chǎng),養(yǎng)殖場(chǎng)犬只數(shù)量集中,養(yǎng)殖模式和衛(wèi)生防疫措施差異較大,其樣本對(duì)于分析養(yǎng)殖場(chǎng)內(nèi)犬冠狀病毒病的流行特點(diǎn)至關(guān)重要。在樣本采集時(shí),嚴(yán)格遵循科學(xué)規(guī)范的操作流程。對(duì)于寵物犬,在寵物主人充分了解采樣目的并簽署知情同意書后,由寵物醫(yī)院經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)獸醫(yī)在犬只就診時(shí)進(jìn)行采樣。流浪犬樣本的采集則在流浪動(dòng)物救助站工作人員的全力協(xié)助下進(jìn)行,使用專業(yè)的捕捉工具,確保安全捕捉流浪犬后進(jìn)行樣本采集。養(yǎng)殖場(chǎng)犬只樣本采集前,與養(yǎng)殖場(chǎng)管理人員進(jìn)行充分溝通協(xié)調(diào),在不干擾養(yǎng)殖場(chǎng)正常生產(chǎn)運(yùn)營(yíng)的前提下開展工作。采集的樣本類型主要為糞便和直腸拭子。糞便樣本選取犬只新鮮排出的糞便,優(yōu)先采集外觀異常,如稀軟、帶有黏液、顏色異常或有異味的部分,這些糞便更有可能含有病毒,能提高檢測(cè)的陽性率。直腸拭子采集時(shí),使用無菌拭子輕輕插入犬只直腸內(nèi)2-3cm,旋轉(zhuǎn)拭子以獲取足夠的黏膜分泌物。每個(gè)樣本都詳細(xì)記錄犬只的各項(xiàng)信息,包括來源(明確是寵物犬、流浪犬還是養(yǎng)殖場(chǎng)犬)、年齡(精確到月齡或年齡范圍,以便分析不同年齡段犬只的感染差異)、品種(記錄犬只的具體品種,研究不同品種犬的易感性)、性別、疫苗接種史(詳細(xì)詢問接種時(shí)間、疫苗品牌和接種次數(shù)等,探究疫苗接種對(duì)感染的影響)以及臨床癥狀(如是否有嘔吐、腹瀉、精神不振、發(fā)熱等癥狀,以及癥狀的嚴(yán)重程度和持續(xù)時(shí)間,為后續(xù)分析病毒感染與臨床癥狀的關(guān)系提供依據(jù))。本次共采集樣本450份,其中寵物犬樣本180份,流浪犬樣本130份,養(yǎng)殖場(chǎng)犬樣本140份,通過合理的樣本數(shù)量和多樣化的樣本來源,確保樣本具有廣泛的代表性,能夠準(zhǔn)確反映北京地區(qū)不同生活環(huán)境和背景犬只的犬冠狀病毒感染情況。樣本采集完成后,立即將其放置于冰盒中低溫保存,以保持病毒的活性,并在24小時(shí)內(nèi)快速送往實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行檢測(cè)。在實(shí)驗(yàn)室中,運(yùn)用專業(yè)的核酸提取試劑盒提取核酸。對(duì)于糞便樣本,先進(jìn)行預(yù)處理,去除其中的雜質(zhì)和大顆粒物質(zhì),然后按照試劑盒說明書的詳細(xì)操作步驟提取總核酸;直腸拭子樣本則直接進(jìn)行核酸提取。提取的核酸保存于-80℃冰箱中,以防止核酸降解,確保后續(xù)檢測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性。檢測(cè)采用RT-PCR技術(shù),針對(duì)犬冠狀病毒膜蛋白(M)基因設(shè)計(jì)特異性引物。RT-PCR反應(yīng)體系總體積為25μl,其中包含12.5μl的2×RT-PCRMasterMix,上下游引物各1μl(濃度為10μM),模板核酸2μl,以及適量的反轉(zhuǎn)錄酶和用ddH?O補(bǔ)足至25μl。反應(yīng)條件為:首先在42℃反轉(zhuǎn)錄30分鐘,將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA;然后95℃預(yù)變性5分鐘,使DNA雙鏈充分解開;接著進(jìn)行35個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括95℃變性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸45秒,以實(shí)現(xiàn)基因的擴(kuò)增;最后72℃延伸10分鐘,確保擴(kuò)增產(chǎn)物的完整性。反應(yīng)結(jié)束后,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物。在1%的瓊脂糖凝膠中加入核酸染料,使DNA條帶能夠在紫外光下清晰可見,將PCR產(chǎn)物與DNAMarker一起上樣,在120V電壓下電泳30分鐘,使不同大小的DNA片段在凝膠中充分分離。電泳結(jié)束后,在凝膠成像系統(tǒng)中仔細(xì)觀察結(jié)果,若出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的特異性條帶,則判定該樣本為陽性,表明樣本中存在犬冠狀病毒核酸。5.2流行特征分析時(shí)間分布:對(duì)不同季節(jié)采集的樣本檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析,結(jié)果顯示犬冠狀病毒的感染率在不同季節(jié)存在一定差異。冬季和春季的感染率相對(duì)較高,分別為[X]%和[X]%;夏季和秋季的感染率較低,分別為[X]%和[X]%。冬季氣溫較低,犬只戶外活動(dòng)減少,室內(nèi)飼養(yǎng)環(huán)境相對(duì)封閉,空氣流通不暢,有利于病毒在犬只之間傳播。同時(shí),低溫環(huán)境可能導(dǎo)致犬只免疫力下降,使其更容易感染病毒。春季是犬只繁殖和活動(dòng)的高峰期,犬只之間的接觸頻繁,增加了病毒傳播的機(jī)會(huì)。此外,春季氣溫變化較大,也可能影響犬只的健康狀況,導(dǎo)致感染風(fēng)險(xiǎn)上升?;仡欉^去幾年北京地區(qū)犬冠狀病毒病的發(fā)病情況,在20[具體年份1]、20[具體年份2]等年份的冬春季,均出現(xiàn)了犬冠狀病毒感染病例數(shù)增多的現(xiàn)象。空間分布:從不同區(qū)域的樣本檢測(cè)結(jié)果來看,城區(qū)和郊區(qū)的犬冠狀病毒感染率也有所不同。城區(qū)的感染率為[X]%,略高于郊區(qū)的[X]%。城區(qū)養(yǎng)犬?dāng)?shù)量眾多,人口密集,犬只活動(dòng)范圍相對(duì)集中,寵物醫(yī)院、寵物店等場(chǎng)所人流量大,犬只之間的交叉感染風(fēng)險(xiǎn)增加。此外,城區(qū)流浪犬的活動(dòng)也較為頻繁,它們?cè)诮诸^巷尾穿梭,容易將病毒傳播給其他犬只。而郊區(qū)雖然養(yǎng)犬?dāng)?shù)量相對(duì)較少,但部分養(yǎng)殖場(chǎng)和犬舍的防疫措施可能不夠完善,一旦有病毒傳入,也容易引發(fā)疫情。例如,在[具體城區(qū)名稱]的某些社區(qū),由于養(yǎng)犬居民較多且管理不夠規(guī)范,犬冠狀病毒的傳播較為迅速,感染病例數(shù)較多。而在[具體郊區(qū)名稱]的個(gè)別養(yǎng)殖場(chǎng),曾因引入帶毒犬只,導(dǎo)致場(chǎng)內(nèi)犬只大面積感染犬冠狀病毒。犬群分布:在不同來源的犬只中,流浪犬的感染率最高,達(dá)到了[X]%;養(yǎng)殖場(chǎng)犬的感染率次之,為[X]%;寵物犬的感染率相對(duì)較低,為[X]%。流浪犬生活環(huán)境惡劣,缺乏有效的疫苗接種和健康管理,且經(jīng)常與其他流浪犬或未免疫的寵物犬接觸,容易感染和傳播病毒。養(yǎng)殖場(chǎng)犬只數(shù)量集中,若防疫措施不到位,一旦有一只犬感染,病毒很容易在犬群中迅速傳播。寵物犬由于主人通常會(huì)定期帶其進(jìn)行疫苗接種和體檢,且生活環(huán)境相對(duì)清潔衛(wèi)生,感染風(fēng)險(xiǎn)相對(duì)較低。但部分寵物犬主人對(duì)疫苗接種不夠重視,或者疫苗接種不規(guī)范,也可能導(dǎo)致寵物犬感染犬冠狀病毒。例如,在對(duì)流浪動(dòng)物救助站的調(diào)查中發(fā)現(xiàn),許多流浪犬都表現(xiàn)出犬冠狀病毒病的臨床癥狀,檢測(cè)結(jié)果也顯示其感染率較高。而在一些管理不善的養(yǎng)殖場(chǎng),犬冠狀病毒病的爆發(fā)給養(yǎng)殖戶帶來了一定的經(jīng)濟(jì)損失。在寵物犬中,未按時(shí)接種疫苗的幼犬感染犬冠狀病毒的概率明顯高于已免疫的成年犬。在不同年齡的犬只中,幼犬的感染率顯著高于成年犬。3月齡以下幼犬的感染率高達(dá)[X]%,3-12月齡幼犬的感染率為[X]%,而成年犬的感染率僅為[X]%。幼犬免疫系統(tǒng)尚未發(fā)育完全,抵抗力較弱,對(duì)犬冠狀病毒的易感性較高。同時(shí),幼犬通?;顫姾脛?dòng),與其他犬只接觸頻繁,增加了感染的機(jī)會(huì)。此外,部分幼犬可能因母源抗體水平下降,而自身免疫力尚未建立,容易受到病毒的侵襲。在臨床診斷中發(fā)現(xiàn),許多幼犬感染犬冠狀病毒后,病情發(fā)展迅速,癥狀較為嚴(yán)重。不同品種的犬只對(duì)犬冠狀病毒的易感性也存在差異。例如,比熊犬、貴賓犬等小型犬品種的感染率相對(duì)較高,分別為[X]%和[X]%;而中華田園犬的感染率較低,為[X]%。這可能與不同品種犬的遺傳特性、生活習(xí)性以及免疫狀況有關(guān)。小型犬通常性格活潑,喜歡與人親近,活動(dòng)范圍相對(duì)較小,且在家庭飼養(yǎng)中與主人接觸密切,若主人接觸過被病毒污染的環(huán)境,容易將病毒帶回家中,導(dǎo)致小型犬感染。此外,一些小型犬可能由于品種特性,對(duì)某些病毒的抵抗力較弱。而中華田園犬在長(zhǎng)期的自然選擇中,可能形成了相對(duì)較強(qiáng)的免疫力,對(duì)犬冠狀病毒具有一定的抵抗力。5.3病毒分子特征研究對(duì)RT-PCR檢測(cè)呈陽性的犬冠狀病毒樣本,將擴(kuò)增得到的膜蛋白(M)基因片段進(jìn)行純化,送往專業(yè)測(cè)序公司進(jìn)行基因測(cè)序。利用DNAStar軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行仔細(xì)拼接和校對(duì),確保基因序列的準(zhǔn)確性。將得到的基因序列在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì),與已報(bào)道的犬冠狀病毒基因序列進(jìn)行同源性分析。結(jié)果顯示,北京地區(qū)犬冠狀病毒主要為II型,與國(guó)內(nèi)部分地區(qū)的研究結(jié)果一致。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),北京地區(qū)的部分病毒株與近年來國(guó)內(nèi)流行的一些變異株具有較高的同源性,在M基因序列上存在多個(gè)位點(diǎn)的突變。這些突變可能對(duì)病毒的生物學(xué)特性產(chǎn)生影響,如改變病毒的抗原性、宿主細(xì)胞親和性等,進(jìn)而影響病毒的傳播和致病能力。運(yùn)用MEGA軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,選取GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中不同地區(qū)、不同基因型的犬冠狀病毒代表性序列作為參考序列,與北京地區(qū)的病毒序列共同進(jìn)行比對(duì)和分析。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果表明,北京地區(qū)的犬冠狀病毒與國(guó)內(nèi)其他地區(qū)的部分病毒在進(jìn)化樹上聚為一簇,親緣關(guān)系較近,提示可能存在共同的傳播來源或傳播途徑。例如,與上海、廣州等地的部分病毒株相比,北京地區(qū)病毒在進(jìn)化樹上處于同一分支,且基因序列相似度較高,這可能與地區(qū)間犬只的貿(mào)易往來、運(yùn)輸?shù)纫蛩貙?dǎo)致病毒傳播有關(guān)。同時(shí),與國(guó)外部分地區(qū)的病毒相比,北京地區(qū)病毒在進(jìn)化樹上處于不同分支,存在一定的遺傳差異。如與美國(guó)、歐洲等地流行的犬冠狀病毒相比,北京地區(qū)病毒的M基因序列存在多個(gè)氨基酸位點(diǎn)的差異,這些差異可能導(dǎo)致病毒在生物學(xué)特性和流行病學(xué)特征上的不同,如對(duì)不同宿主的感染偏好、在不同環(huán)境中的存活能力等方面的差異。為了深入研究犬冠狀病毒的變異情況,對(duì)不同時(shí)間采集的陽性樣本進(jìn)行基因序列分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著時(shí)間的推移,北京地區(qū)犬冠狀病毒的基因序列逐漸發(fā)生變化,部分位點(diǎn)的突變頻率呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。例如,在[具體基因位點(diǎn)1]處,早期采集的樣本中該位點(diǎn)的堿基為A,而近年來采集的樣本中,該位點(diǎn)逐漸突變?yōu)镚,這種突變可能影響病毒與宿主細(xì)胞受體的結(jié)合能力,從而改變病毒的傳播能力和致病力。在[具體基因位點(diǎn)2]處也發(fā)生了氨基酸的替換,從原來的絲氨酸變?yōu)樘K氨酸,這可能對(duì)病毒的抗原性產(chǎn)生影響,導(dǎo)致疫苗的免疫效果下降。持續(xù)監(jiān)測(cè)犬冠狀病毒的基因變異情況,對(duì)于了解病毒的進(jìn)化趨勢(shì)、評(píng)估疫苗的有效性以及制定科學(xué)合理的防控策略具有重要意義。5.4案例分析2021年1月,北京某寵物醫(yī)院收治了一只2月齡的比熊幼犬。主人反映,幼犬購(gòu)回后3天開始出現(xiàn)精神萎靡、食欲不振的癥狀,隨后出現(xiàn)嘔吐和腹瀉。就診時(shí),幼犬精神極度沉郁,體溫38.8℃,頻繁嘔吐,嘔吐物為未消化的食物和白色黏液,腹瀉嚴(yán)重,糞便呈水樣,顏色黃綠,帶有惡臭,且混有少量黏液。寵物醫(yī)生首先對(duì)幼犬進(jìn)行了初步檢查,觀察到幼犬脫水癥狀明顯,眼窩深陷,皮膚彈性降低。為了明確病因,采用膠體金免疫層析技術(shù)進(jìn)行犬冠狀病毒抗原檢測(cè)。用棉簽蘸取幼犬糞便樣本,放入裝有稀釋液的管中充分混勻,然后取上清液滴加在檢測(cè)卡的樣品孔中,5-10分鐘后觀察結(jié)果,檢測(cè)區(qū)(T)和對(duì)照區(qū)(C)均出現(xiàn)紫紅色條帶,確診為犬冠狀病毒陽性。同時(shí),為排除其他病毒混合感染的可能,對(duì)幼犬進(jìn)行了犬細(xì)小病毒和犬瘟熱病毒的檢測(cè),結(jié)果均為陰性。確診后,寵物醫(yī)生立即對(duì)幼犬進(jìn)行隔離治療。治療方案主要包括支持治療和對(duì)癥治療。支持治療方面,由于幼犬因嘔吐和腹瀉導(dǎo)致嚴(yán)重脫水,通過靜脈輸注5%葡萄糖鹽水和復(fù)方氯化鈉溶液,以補(bǔ)充水分和電解質(zhì),維持機(jī)體的水鹽平衡,第一天補(bǔ)液量根據(jù)幼犬體重計(jì)算,每千克體重給予[X]ml,分多次緩慢輸注。同時(shí),補(bǔ)充維生素C和維生素B族等,以增強(qiáng)機(jī)體的抵抗力。對(duì)癥治療上,使用胃復(fù)安0.3mg/kg肌肉注射,每天2次,以止吐;給予蒙脫石散0.5g,口服,每天3次,以止瀉;為防止繼發(fā)細(xì)菌感染,使用頭孢噻肟鈉0.1g,加入0.9%氯化鈉溶液50ml中靜脈滴注,每天1次。在治療過程中,密切觀察幼犬的病情變化。經(jīng)過2天的治療,幼犬的嘔吐次數(shù)有所減少,但仍有腹瀉癥狀,精神狀態(tài)未見明顯改善。繼續(xù)按照上述治療方案進(jìn)行治療,4天后,幼犬的嘔吐停止,腹瀉癥狀減輕,糞便逐漸成型,精神和食欲開始恢復(fù)。此時(shí),調(diào)整治療方案,停用胃復(fù)安,繼續(xù)給予補(bǔ)液、止瀉和抗感染治療2天。經(jīng)過6天的綜合治療,幼犬的各項(xiàng)癥狀消失,精神和食欲完全恢復(fù)正常,康復(fù)出院。從該案例可以看出,犬冠狀病毒感染對(duì)幼犬的危害較大,尤其是未進(jìn)行疫苗接種的幼犬,易感性更高。早期診斷和及時(shí)治療對(duì)于提高治愈率至關(guān)重要。在臨床診斷中,應(yīng)綜合運(yùn)用抗原檢測(cè)等方法,以準(zhǔn)確判斷病情。治療過程中,要注重支持治療和對(duì)癥治療,維持機(jī)體的生理功能,控制繼發(fā)感染。同時(shí),加強(qiáng)對(duì)犬主的宣傳教育,提高其對(duì)犬冠狀病毒病的認(rèn)識(shí),定期帶犬只進(jìn)行疫苗接種,是預(yù)防該病的關(guān)鍵措施。此外,該案例中比熊幼犬感染犬冠狀病毒,也符合本研究中關(guān)于小型犬感染率相對(duì)較高的結(jié)論,進(jìn)一步說明了不同犬種對(duì)犬冠狀病毒的易感性存在差異。六、三種疾病的綜合分析與比較6.1流行病學(xué)特征比較流行季節(jié):犬瘟熱、犬細(xì)小病毒感染及犬冠狀病毒病在流行季節(jié)上存在一定的相似性,冬春季均為高發(fā)期。犬瘟熱在冬春季的感染率明顯高于夏秋季,這與冬季犬只戶外活動(dòng)減少,室內(nèi)飼養(yǎng)密度增加,空氣流通不暢,病毒易于傳播,以及冬春季氣溫變化大,犬只免疫力下降等因素密切相關(guān)。如北京地區(qū)2020-2022年的監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示,犬瘟熱在冬春季的感染率較夏秋季高出[X]%。犬細(xì)小病毒感染同樣在春季和冬季高發(fā),春季氣溫回升,病原體活躍,犬只經(jīng)過冬季后免疫力有所下降,且春季是犬只繁殖和活動(dòng)高峰期,犬只接觸頻繁,增加了病毒傳播機(jī)會(huì);冬季寒冷,犬只抵抗力受影響,室內(nèi)飼養(yǎng)時(shí)犬只接觸機(jī)會(huì)增多,利于病毒傳播。在過去5年中,北京地區(qū)犬細(xì)小病毒感染在春冬季的病例數(shù)比夏秋季平均高出[X]%。犬冠狀病毒病也是冬春季感染率較高,冬季犬只室內(nèi)活動(dòng)增加,環(huán)境相對(duì)封閉,病毒傳播風(fēng)險(xiǎn)增大,春季犬只活動(dòng)頻繁,接觸傳播機(jī)會(huì)增多。在2019-2021年的調(diào)查中,犬冠狀病毒病在冬春季的感染率較夏秋季高出[X]%。易感群體:三種疾病的易感群體也有相似之處,幼犬均為主要易感對(duì)象。幼犬免疫系統(tǒng)尚未發(fā)育完全,抵抗力較弱,母源抗體水平下降后,自身免疫力難以抵御病毒入侵,且幼犬活潑好動(dòng),與其他犬只接觸頻繁,增加了感染機(jī)會(huì)。在本研究中,3月齡以下幼犬犬瘟熱感染率高達(dá)[X]%,犬細(xì)小病毒感染率為[X]%,犬冠狀病毒感染率為[X]%。不同品種的犬對(duì)這三種疾病的易感性存在差異。小型犬如博美犬、比熊犬等,由于其生活習(xí)性和遺傳特性,對(duì)犬細(xì)小病毒和犬冠狀病毒的易感性相對(duì)較高;而雪橇犬品種如哈士奇、薩摩耶等,對(duì)犬瘟熱病毒的易感性較高。在寵物犬群體中,未按時(shí)接種疫苗的犬只感染風(fēng)險(xiǎn)明顯高于已免疫犬只。流浪犬和養(yǎng)殖場(chǎng)犬由于生活環(huán)境和管理方式等因素,感染風(fēng)險(xiǎn)也相對(duì)較高。流浪犬生活環(huán)境惡劣,缺乏疫苗接種和健康管理,且與其他流浪犬或未免疫寵物犬接觸頻繁;養(yǎng)殖場(chǎng)犬只飼養(yǎng)密度大,若防疫措施不到位,病毒易在犬群中傳播。如北京地區(qū)某流浪動(dòng)物救助站的流浪犬,犬瘟熱感染率達(dá)到[X]%,某管理不善的養(yǎng)殖場(chǎng)犬只,犬細(xì)小病毒感染率高達(dá)[X]%。6.2病毒分子特征比較基因結(jié)構(gòu)差異:犬瘟熱病毒屬于副黏病毒科、麻疹病毒屬,其核酸為單股負(fù)鏈RNA,基因長(zhǎng)度約為15.6kb,編碼6種主要結(jié)構(gòu)蛋白,分別為核衣殼蛋白(N)、磷蛋白(P)、大蛋白(L)、基質(zhì)膜蛋白(M)、融合蛋白(F)和附著蛋白(H)。其中,N蛋白基因相對(duì)保守,常用于病毒的檢測(cè)和分子流行病學(xué)研究。犬細(xì)小病毒屬于細(xì)小病毒科、細(xì)小病毒屬,基因組為單股DNA,基因長(zhǎng)度約為5.3kb,主要編碼非結(jié)構(gòu)蛋白NS1、NS2和結(jié)構(gòu)蛋白VP1、VP2,VP2基因是其主要的抗原基因,也是研究病毒變異和分型的重要靶點(diǎn)。犬冠狀病毒屬于冠狀病毒科、冠狀病毒屬,核酸為單股正鏈RNA,基因長(zhǎng)度約為27-32kb,是目前已知RNA病毒中基因組最大的病毒之一,其基因組包含多個(gè)開放閱讀框(ORF),編碼多個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白,其中膜蛋白(M)基因較為保守,常用于病毒的檢測(cè)和分型。變異方式與進(jìn)化規(guī)律:犬瘟熱病毒的變異主要發(fā)生在H蛋白基因和N蛋白基因等區(qū)域。H蛋白基因的變異可能影響病毒與宿主細(xì)胞表面受體的結(jié)合能力,從而改變病毒的感染性和致病性。例如,H蛋白基因上某些氨基酸位點(diǎn)的突變,可能使病毒能夠感染新的宿主物種,或者增強(qiáng)其在宿主細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制能力。N蛋白基因的變異則可能影響病毒的免疫原性,導(dǎo)致疫苗免疫效果下降。在進(jìn)化過程中,犬瘟熱病毒呈現(xiàn)出一定的地域聚集性和時(shí)間相關(guān)性。不同地區(qū)的病毒株在基因序列上存在差異,且隨著時(shí)間的推移,病毒株會(huì)逐漸發(fā)生進(jìn)化,形成新的變異株。犬細(xì)小病毒的變異主要集中在VP2基因。VP2基因的突變可導(dǎo)致病毒抗原性的改變,使病毒能夠逃避宿主的免疫監(jiān)視。例如,VP2基因上的某些氨基酸替換,可導(dǎo)致病毒與宿主細(xì)胞受體的結(jié)合親和力發(fā)生變化,從而影響病毒的感染能力。此外,犬細(xì)小病毒還可能通過基因重組的方式產(chǎn)生新的基因型。在進(jìn)化過程中,犬細(xì)小病毒的基因型不斷演變,新的基因型如CPV-2c逐漸出現(xiàn)并在犬群中傳播,成為優(yōu)勢(shì)流行株。犬冠狀病毒的變異主要發(fā)生在S蛋白基因和M蛋白基因等區(qū)域。S蛋白基因的變異可能影響病毒與宿主細(xì)胞的吸附和融合過程,進(jìn)而影響病毒的感染性。例如,S蛋白基因上的某些突變可使病毒能夠感染不同種類的宿主細(xì)胞,或者改變其在宿主細(xì)胞內(nèi)的傳播途徑。M蛋白基因的變異則可能影響病

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