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徐州市人民醫(yī)院基因測序技術(shù)考核一、單選題(共10題,每題2分,總計20分)1.以下哪種技術(shù)不屬于高通量測序(HTS)的范疇?A.Illumina測序B.IonTorrent測序C.Sanger測序D.PacBio測序2.在基因測序過程中,用于去除樣本中DNA/RNA污染的試劑是?A.乙醇B.異丙醇C.乙酸D.氯仿3.基因測序中,"NGS"的全稱是?A.Next-GenerationSequencingB.NormalGeneSequencingC.NewGeneSequencingD.NextGeneSystem4.徐州市人民醫(yī)院開展腫瘤基因測序時,通常使用哪種數(shù)據(jù)庫進行結(jié)果比對?A.GenBankB.EMBLC.DDBJD.以上都是5.以下哪種方法常用于提高測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性?A.雙端測序(Paired-endsequencing)B.單端測序(Single-endsequencing)C.測長測序(Long-readsequencing)D.以上都不是6.在基因測序報告中,"SNP"指的是?A.單倍型變異B.單核苷酸多態(tài)性C.基因缺失D.基因重復(fù)7.徐州市人民醫(yī)院進行病原體基因測序時,常用的樣本類型是?A.血液樣本B.痰液樣本C.組織樣本D.以上都是8.基因測序中,"PCR"的作用是?A.擴增目標(biāo)DNA片段B.直接測序C.數(shù)據(jù)分析D.純化測序產(chǎn)物9.在基因測序質(zhì)量控制中,"Q30"指的是?A.質(zhì)量得分B.高通量測序C.基因數(shù)量D.測序深度10.徐州市人民醫(yī)院開展遺傳病基因測序時,常用于檢測的是什么?A.單基因遺傳病B.多基因遺傳病C.染色體異常D.以上都是二、多選題(共5題,每題3分,總計15分)1.基因測序流程中,以下哪些步驟是必要的?A.樣本DNA提取B.PCR擴增C.測序反應(yīng)D.數(shù)據(jù)分析E.結(jié)果報告2.以下哪些數(shù)據(jù)庫可用于基因測序數(shù)據(jù)比對?A.NCBIB.EnsemblC.UCSCD.GnomonE.HumanGenomeProject3.徐州市人民醫(yī)院進行腫瘤基因測序時,可能涉及的檢測項目包括?A.KRAS基因突變B.EGFR基因擴增C.ALK基因重排D.TP53基因突變E.HER2基因檢測4.基因測序中,以下哪些因素會影響測序準(zhǔn)確性?A.樣本質(zhì)量B.測序平臺C.實驗操作D.數(shù)據(jù)分析軟件E.試劑純度5.以下哪些技術(shù)屬于基因測序的衍生技術(shù)?A.基因芯片B.毛細(xì)管電泳C.數(shù)字PCRD.RNA測序E.基因編輯三、判斷題(共10題,每題1分,總計10分)1.Sanger測序是目前最常用的高通量測序技術(shù)之一。(×)2.基因測序報告中的"Coverage"表示測序深度。(×)3.徐州市人民醫(yī)院的病原體基因測序主要用于傳染病診斷。(√)4.基因測序數(shù)據(jù)比對時,常用BLAST工具。(√)5.基因測序前需要去除樣本中的RNA污染。(√)6."NGS"技術(shù)可以實現(xiàn)對全長基因的測序。(√)7.基因測序報告中的"SNV"指的是插入/缺失變異。(×)8.基因測序質(zhì)量控制中,"Q30"越高表示測序質(zhì)量越好。(√)9.徐州市人民醫(yī)院的遺傳病基因測序僅限于單基因遺傳病。(×)10.基因測序數(shù)據(jù)需要經(jīng)過生物信息學(xué)分析才能解讀。(√)四、簡答題(共5題,每題5分,總計25分)1.簡述高通量測序(HTS)的基本流程。2.解釋基因測序中"Coverage"的含義及其臨床意義。3.列舉徐州市人民醫(yī)院開展腫瘤基因測序時,常見的檢測項目及其臨床應(yīng)用。4.說明基因測序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制的重要性,并列舉至少三種質(zhì)量控制方法。5.比較Sanger測序和NGS技術(shù)的優(yōu)缺點。五、論述題(共2題,每題10分,總計20分)1.結(jié)合徐州市人民醫(yī)院的實際情況,論述基因測序技術(shù)在臨床診斷中的應(yīng)用價值。2.分析基因測序技術(shù)在未來精準(zhǔn)醫(yī)療中的發(fā)展趨勢及其面臨的挑戰(zhàn)。答案與解析一、單選題1.C-Sanger測序?qū)儆诘谝淮鷾y序技術(shù),不屬于HTS范疇。2.B-異丙醇常用于去除DNA/RNA中的雜質(zhì)。3.A-NGS是Next-GenerationSequencing的縮寫。4.D-腫瘤基因測序常使用GenBank、EMBL、DDBJ等數(shù)據(jù)庫。5.A-雙端測序通過兩端測序提高準(zhǔn)確性。6.B-SNP是單核苷酸多態(tài)性的縮寫。7.B-病原體測序常用痰液、血液等樣本。8.A-PCR用于擴增目標(biāo)DNA片段。9.A-Q30表示測序質(zhì)量得分。10.D-遺傳病測序可檢測單基因、多基因及染色體異常。二、多選題1.A、B、C、D、E-全流程包括樣本提取、擴增、測序、分析及報告。2.A、B、C、D、E-以上均為常用基因比對數(shù)據(jù)庫。3.A、B、C、D、E-腫瘤測序常檢測KRAS、EGFR、ALK、TP53、HER2等。4.A、B、C、D、E-樣本質(zhì)量、平臺、操作、軟件、試劑均影響準(zhǔn)確性。5.A、C、D、E-基因芯片、數(shù)字PCR、RNA測序、基因編輯是衍生技術(shù)。三、判斷題1.×-Sanger測序?qū)儆诘谝淮鷾y序技術(shù)。2.×-Coverage表示測序深度,而非測序質(zhì)量。3.√-病原體測序主要用于傳染病診斷。4.√-BLAST是常用的基因比對工具。5.√-RNA污染會干擾DNA測序。6.√-NGS可測序全長基因。7.×-SNV指單核苷酸變異,而非插入/缺失。8.√-Q30越高,測序質(zhì)量越好。9.×-遺傳病測序可檢測多基因及染色體異常。10.√-數(shù)據(jù)需經(jīng)生物信息學(xué)分析才能解讀。四、簡答題1.高通量測序基本流程-樣本制備(DNA/RNA提取、純化)→PCR擴增(可選)→測序反應(yīng)(雙端、單端等)→數(shù)據(jù)生成→生物信息學(xué)分析→結(jié)果解讀。2.Coverage的含義及臨床意義-Coverage指測序深度,即每個堿基被測序的次數(shù)。高Coverage提高檢測準(zhǔn)確性,臨床可反映基因表達(dá)水平或突變檢出率。3.腫瘤基因測序項目及臨床應(yīng)用-KRAS(肺癌靶向治療)、EGFR(肺癌EGFR-TKIs治療)、ALK(非小細(xì)胞肺癌靶向治療)、TP53(癌基因檢測)、HER2(乳腺癌靶向治療)。4.基因測序質(zhì)量控制方法-樣本質(zhì)量檢測(如260/280比值)、測序深度分析、比對率檢測、SNP檢測。5.Sanger測序與NGS的比較-Sanger:單片段測序,精度高,但通量低;NGS:多片段并行測序,通量高,但精度相對較低。五、論述題1.基因測序技術(shù)在徐州市人民醫(yī)院的應(yīng)用價值-
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