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2025年大學(xué)《化學(xué)生物學(xué)》專業(yè)題庫(kù)——生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)技巧探究考試時(shí)間:______分鐘總分:______分姓名:______一、簡(jiǎn)述凝膠過(guò)濾層析(凝膠滲透色譜)分離蛋白質(zhì)的原理,并指出其適用于分離蛋白質(zhì)的主要依據(jù)。二、在進(jìn)行酶動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)時(shí),為什么通常需要設(shè)置一系列不同的底物濃度?簡(jiǎn)述雙倒數(shù)作圖法(Lineweaver-BurkPlot)的原理及其優(yōu)缺點(diǎn)。三、核酸電泳是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的常用技術(shù)。請(qǐng)簡(jiǎn)述瓊脂糖凝膠電泳分離核酸的原理,并說(shuō)明影響核酸遷移速率的主要因素有哪些。四、在蛋白質(zhì)印跡(WesternBlot)實(shí)驗(yàn)中,將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移至固相載體后,為何需要進(jìn)行封閉處理?封閉不充分或封閉過(guò)度可能分別對(duì)后續(xù)的抗體結(jié)合產(chǎn)生什么影響?五、設(shè)計(jì)一個(gè)實(shí)驗(yàn)方案,用于檢測(cè)某酶制劑在不同溫度(例如4°C,25°C,37°C,50°C)下的活性變化。請(qǐng)寫(xiě)出實(shí)驗(yàn)的核心步驟,包括所需主要試劑、儀器以及活性測(cè)定的簡(jiǎn)要方法。六、某學(xué)生在進(jìn)行蛋白質(zhì)純化實(shí)驗(yàn)時(shí),發(fā)現(xiàn)純化后的蛋白樣品在SDS電泳時(shí)出現(xiàn)多條主帶,且主帶位置與預(yù)期分子量不符。請(qǐng)分析可能的原因,并提出至少兩種進(jìn)一步確認(rèn)問(wèn)題所在或解決問(wèn)題的思路。七、簡(jiǎn)述PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù)的基本原理,并列舉三個(gè)影響PCR反應(yīng)擴(kuò)增效率的關(guān)鍵因素。八、在分子克隆實(shí)驗(yàn)中,將外源DNA片段克隆到表達(dá)載體上后,進(jìn)行轉(zhuǎn)化前,為何要對(duì)感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行預(yù)處理(如冰上融化、熱激等)?這些步驟的目的是什么?九、比較親和層析與離子交換層析在蛋白質(zhì)純化中的應(yīng)用特點(diǎn),說(shuō)明這兩種方法各自適合分離哪種類型的蛋白質(zhì),并簡(jiǎn)述其基本原理。十、某研究項(xiàng)目需要從細(xì)胞中提取總RNA。請(qǐng)簡(jiǎn)述從細(xì)胞裂解到獲得高質(zhì)量RNA樣品的主要步驟,并說(shuō)明在操作過(guò)程中需要注意避免哪些因素對(duì)RNA質(zhì)量造成影響。試卷答案一、原理:利用多孔性凝膠顆粒作為固定相,當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液通過(guò)凝膠時(shí),根據(jù)蛋白質(zhì)分子大小與凝膠孔道大小的相對(duì)關(guān)系,實(shí)現(xiàn)大小不同的蛋白質(zhì)分離。大分子蛋白質(zhì)無(wú)法進(jìn)入或只能進(jìn)入少量凝膠孔道,主要受流體力學(xué)阻力影響,遷移速度較快;小分子蛋白質(zhì)可以進(jìn)入孔道,受流體力學(xué)阻力和孔道內(nèi)擴(kuò)散阻力雙重影響,遷移速度較慢。主要依據(jù):蛋白質(zhì)分子的大?。ㄖ睆交蛩畡?dòng)力學(xué)半徑)。不同大小的蛋白質(zhì)在凝膠孔道中的阻滯效應(yīng)不同,導(dǎo)致在洗脫時(shí)產(chǎn)生不同的遷移速率。二、原因:通過(guò)設(shè)置不同底物濃度,可以測(cè)量不同條件下(主要是不同底物濃度下)的酶反應(yīng)速率(V),從而繪制出酶促反應(yīng)速率(V)與底物濃度([S])的關(guān)系曲線(如Michaelis-Menten曲線),進(jìn)而分析酶的特性(如Km值)。原理:基于酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)基本方程V=(Vmax*[S])/(Km+[S])。通過(guò)取倒數(shù),將非線性關(guān)系轉(zhuǎn)換為線性關(guān)系:1/V=(Km/Vmax)*(1/[S])+1/[S]。在雙倒數(shù)坐標(biāo)系中,該方程呈現(xiàn)直線形式,其縱軸截距為1/Vmax,斜率為Km/Vmax。優(yōu)點(diǎn):將復(fù)雜的非直線關(guān)系簡(jiǎn)化為直線關(guān)系,便于通過(guò)作圖更直觀地求算酶的特征常數(shù)Vmax和Km。缺點(diǎn):對(duì)縱軸截距(1/Vmax)的測(cè)定精度受Vmax值影響較大,當(dāng)Vmax較小時(shí),誤差會(huì)顯著增大;且當(dāng)[S]>>Km時(shí),1/[S]項(xiàng)接近零,直線趨于水平,難以準(zhǔn)確測(cè)定Km值;對(duì)低濃度底物下的反應(yīng)速率測(cè)量誤差較大。三、原理:利用核酸分子帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極遷移。核酸分子(特別是DNA)是長(zhǎng)鏈大分子,其遷移速率不僅取決于電荷量和電荷密度,更主要受分子大小(長(zhǎng)度、構(gòu)象)和形狀的影響。在凝膠基質(zhì)中,分子需要“穿梭”通過(guò)網(wǎng)孔,分子越大,通過(guò)網(wǎng)孔的阻礙越大,遷移越慢。主要影響因素:1)核酸分子大小和構(gòu)象:大小是主要因素,越大越慢。構(gòu)象(如超螺旋、線性、環(huán)狀)也會(huì)影響遷移速率。2)凝膠濃度:瓊脂糖濃度越高,凝膠孔徑越小,對(duì)大分子核酸的阻礙越大,遷移速率越慢。3)電場(chǎng)強(qiáng)度:電壓越高,遷移速率越快。4)緩沖液系統(tǒng):緩沖液種類、離子強(qiáng)度、pH值會(huì)影響核酸的構(gòu)象和電荷狀態(tài),進(jìn)而影響遷移速率。5)溫度:通常溫度升高,分子熱運(yùn)動(dòng)加劇,遷移速率略有加快,但過(guò)高溫度可能導(dǎo)致核酸降解或凝膠熔化。四、目的:封閉處理是為了阻斷固相載體(如PVDF、NC膜)上未結(jié)合的活性位點(diǎn)(如氨基、羧基)與后續(xù)加入的抗體發(fā)生非特異性結(jié)合,從而提高抗體結(jié)合的特異性和信號(hào)的穩(wěn)定性。影響:封閉不充分:會(huì)導(dǎo)致載體上的未封閉位點(diǎn)與抗體結(jié)合,產(chǎn)生大量非特異性背景,掩蓋或干擾特異性信號(hào),使得實(shí)驗(yàn)結(jié)果難以判讀。封閉過(guò)度:可能會(huì)使載體表面過(guò)度“惰化”,甚至封閉其上可能存在的與抗體有弱特異性結(jié)合的區(qū)域,導(dǎo)致抗體結(jié)合效率降低,即使存在特異性結(jié)合,也可能因?yàn)樾盘?hào)過(guò)弱而難以檢測(cè)到。五、核心步驟:1.準(zhǔn)備酶促反應(yīng)體系:包含待測(cè)酶樣品、特定底物、緩沖液(pH、溫度等條件應(yīng)預(yù)先設(shè)定并保持恒定)、以及必要的激活劑或抑制劑(如適用)。設(shè)置不同溫度梯度組(4°C,25°C,37°C,50°C)。2.設(shè)置反應(yīng)條件:將酶促反應(yīng)體系置于設(shè)定好溫度的恒溫水浴鍋中預(yù)熱。3.啟動(dòng)反應(yīng):在統(tǒng)一時(shí)間點(diǎn)加入酶,開(kāi)始計(jì)時(shí)。4.定時(shí)取樣:在預(yù)設(shè)的時(shí)間點(diǎn)(例如,反應(yīng)達(dá)到線性期后),從各組中精確吸取等量反應(yīng)液。5.終止反應(yīng):立即加入適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)終止液(如酸、甲醛等)使酶失活,并使產(chǎn)物反應(yīng)停止。6.測(cè)定活性:采用適當(dāng)?shù)姆椒y(cè)定產(chǎn)物生成量或底物消耗量。常用方法如:分光光度法(測(cè)定產(chǎn)物OD值變化速率)、熒光法(測(cè)定熒光強(qiáng)度變化速率)或放射性同位素法(測(cè)定放射性產(chǎn)物積累速率)。7.數(shù)據(jù)處理:計(jì)算各溫度下酶的活性(通常表示為單位時(shí)間、單位酶量的產(chǎn)物量或底物消耗量),繪制酶活性隨溫度變化的曲線,確定最適溫度。六、可能原因:1.蛋白質(zhì)樣品純化不純:存在其他雜蛋白干擾,尤其是在SDS的還原條件下,某些雜蛋白可能跑偏或與目標(biāo)蛋白發(fā)生非特異性聚集。2.蛋白質(zhì)降解:樣品在純化過(guò)程中或儲(chǔ)存不當(dāng)發(fā)生了酶解或氧化等降解。3.蛋白質(zhì)發(fā)生聚集或變性:目標(biāo)蛋白可能形成了聚集體,或者雖然溶解但在電泳條件下部分區(qū)域發(fā)生異常聚集或沉淀。4.SDS操作問(wèn)題:如上樣量不準(zhǔn)、電壓或電泳時(shí)間不當(dāng)、樣品與凝膠混合不均、還原劑(如β-巰基乙醇)添加不足或過(guò)量等。5.載體或緩沖液?jiǎn)栴}:凝膠本身有問(wèn)題或緩沖液pH、離子強(qiáng)度異常。思路:1.重復(fù)進(jìn)行SDS,觀察條帶是否依然異常,以排除操作誤差。2.進(jìn)行凝膠成像定量分析,比較各條帶(包括主帶和預(yù)期條帶)的相對(duì)分子量和相對(duì)含量,看是否符合預(yù)期。3.嘗試進(jìn)行進(jìn)一步純化,看是否能得到單一主帶。4.進(jìn)行蛋白質(zhì)測(cè)序(如質(zhì)譜),鑒定主帶和異常條帶分別是什么蛋白質(zhì),判斷是純化不純還是蛋白本身有問(wèn)題。5.嘗試使用不同濃度的SDS凝膠進(jìn)行分離,看是否能分離出更多細(xì)節(jié)或得到更清晰的單一主帶。6.檢查樣品的溶解性,嘗試超聲或透析等方法改善。七、原理:PCR利用DNA聚合酶在體外特定溫度循環(huán)條件下,以少量模板DNA、兩種脫氧核苷三磷酸(dNTPs)和一對(duì)特異性引物,通過(guò)DNA聚合酶的酶促合成反應(yīng),選擇性、酶促、可控制地?cái)U(kuò)增特定DNA片段的過(guò)程。包括變性(高溫使模板DNA雙鏈解開(kāi))、退火(低溫使引物與模板DNA互補(bǔ)結(jié)合)、延伸(中溫DNA聚合酶在引物3'端合成新鏈)三個(gè)基本步驟的重復(fù)循環(huán)。關(guān)鍵因素:1.DNA聚合酶的活性:酶的濃度和活性直接影響產(chǎn)物的擴(kuò)增效率。2.引物的質(zhì)量和濃度:引物需特異性強(qiáng)、無(wú)二聚體或非特異性結(jié)合,濃度合適。引物二聚體或非特異性結(jié)合會(huì)競(jìng)爭(zhēng)模板或占據(jù)酶,降低特異性擴(kuò)增效率。3.脫氧核苷三磷酸(dNTPs)的濃度和種類:dNTPs是合成新鏈的原料,其濃度必須足夠且比例正確。降解或錯(cuò)配的dNTPs會(huì)降低效率。4.模板DNA的質(zhì)量和濃度:模板量過(guò)少會(huì)降低擴(kuò)增信號(hào),模板質(zhì)量差(如降解)會(huì)影響擴(kuò)增效率。5.PCR反應(yīng)緩沖液:包括pH值、離子強(qiáng)度(如Mg2?濃度)等,需優(yōu)化至適合所用酶的最適條件。八、目的:感受態(tài)細(xì)胞是指經(jīng)過(guò)特殊處理(通常是物理或化學(xué)方法)使其細(xì)胞壁或細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)變得通透,能夠吸收外源DNA分子的細(xì)胞。轉(zhuǎn)化前對(duì)感受態(tài)細(xì)胞的預(yù)處理是為了最大化其攝取外源DNA的能力,提高轉(zhuǎn)化效率。預(yù)處理步驟及目的:1.冰上融化:使細(xì)胞處于低溫狀態(tài),降低其代謝活動(dòng),減緩DNA降解(如果DNA是預(yù)冷的),并使細(xì)胞膜流動(dòng)性降低,有利于后續(xù)的熱激處理。2.熱激(HeatShock):將融化的感受態(tài)細(xì)胞短暫暴露于較高溫度(通常42°C,持續(xù)幾秒到一分鐘),這一步驟通常與鈣離子(Ca2?)存在有關(guān)。高溫會(huì)瞬間改變細(xì)胞膜的通透性,形成暫時(shí)性的孔道,使外源DNA能夠進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部。3.(有時(shí)還包括)鈣離子處理:Ca2?有助于穩(wěn)定細(xì)胞膜和DNA,促進(jìn)DNA與細(xì)胞表面的結(jié)合,并在熱激時(shí)幫助DNA進(jìn)入細(xì)胞。九、親和層析:應(yīng)用特點(diǎn):利用抗原-抗體、酶-底物、受體-配體等具有高度特異性結(jié)合的分子對(duì)進(jìn)行分離。結(jié)合力強(qiáng),特異性高,通常能實(shí)現(xiàn)高效純化。適用蛋白:適合分離純化那些表面具有特定識(shí)別位點(diǎn)的蛋白質(zhì)(如已知抗體結(jié)合位點(diǎn)、酶活性位點(diǎn)、特定激素受體等)。原理:將帶有特異性配體的固定相(填料)裝在層析柱中,樣品流過(guò)時(shí),目標(biāo)蛋白因其與配體的特異性結(jié)合而被吸附在柱子上,而其他蛋白則流出。用洗脫液改變配體與目標(biāo)蛋白的結(jié)合條件(如改變pH、離子強(qiáng)度、競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑濃度等),使目標(biāo)蛋白特異性解離下來(lái)而被洗脫收集。離子交換層析:應(yīng)用特點(diǎn):利用蛋白質(zhì)分子表面所帶電荷與帶有相反電荷的離子交換樹(shù)脂之間的靜電作用進(jìn)行分離。分離機(jī)制相對(duì)簡(jiǎn)單,可調(diào)節(jié)參數(shù)多,應(yīng)用廣泛。適用蛋白:適合分離純化等電點(diǎn)(pI)與層析柱填料電荷性質(zhì)相反的蛋白質(zhì)。通過(guò)改變緩沖液pH或離子強(qiáng)度,可以調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)電荷和樹(shù)脂電荷,控制蛋白質(zhì)的吸附和洗脫。原理:離子交換樹(shù)脂帶有固定電荷(如季銨基團(tuán)帶正電,磺酸基團(tuán)帶負(fù)電)。當(dāng)帶相反電荷的蛋白質(zhì)樣品流過(guò)柱子時(shí),會(huì)與樹(shù)脂發(fā)生靜電吸附。通過(guò)改變洗脫緩沖液的pH值(改變蛋白質(zhì)電荷)或離子強(qiáng)度(改變?nèi)芤褐凶杂呻x子濃度,競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合位點(diǎn)),可以降低蛋白質(zhì)與樹(shù)脂之間的靜電引力,使蛋白質(zhì)從樹(shù)脂上解離下來(lái),按其電荷或大小差異被洗脫。十、主要步驟:1.細(xì)胞裂解:使用合適的裂解緩沖液(通常含有高鹽、非離子去垢劑、蛋白酶抑制劑等)在適當(dāng)條件下(如冰浴、超聲波、高壓勻漿等)破碎細(xì)胞,使細(xì)胞內(nèi)容物釋放出來(lái)。裂解需徹底但避免過(guò)度剪切或蛋白質(zhì)變性。2.去除細(xì)胞核和細(xì)胞器:通過(guò)低速離心去除細(xì)胞核和有膜細(xì)胞器,保留胞質(zhì)中的RNA。3.RNA沉淀:加入異丙醇或乙醇,低溫孵育,使RNA在高鹽濃度下沉淀出來(lái)。4.洗滌:將RNA沉淀用乙醇洗滌,去除殘留的鹽分、蛋白質(zhì)和其他雜質(zhì)。5.終止洗滌并溶解:棄去上清,小心吸干乙醇,將RNA沉淀在DEPC水或無(wú)RNA酶水中懸浮、重懸或溶解。6.(

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