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ICS65.020.20DB6111楊凌農(nóng)業(yè)高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)示范區(qū)地方標(biāo)準(zhǔn)DetectionofLivingPseudomonassyringaepv.actinidiaefromKiwifruitpoLLen楊凌示范區(qū)市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布IDB6111/T149—2020本文件是依據(jù)GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》給出的規(guī)則起草。本文件由西北農(nóng)林科技大學(xué)提出。本文件由楊凌農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化專(zhuān)業(yè)技術(shù)委員會(huì)歸口。本文件起草單位:西北農(nóng)林科技大學(xué)、陜西省獼猴桃工程技術(shù)研究中心、楊凌現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化研究推廣服務(wù)中心。本文件主要起草人:黃麗麗、徐亮勝、雷玉山、高小寧、馮浩、王娜娜。本文件由西北農(nóng)林科技大學(xué)負(fù)責(zé)解釋。本文件為首次發(fā)布。單位:西北農(nóng)林科技大學(xué)電話址:陜西省楊凌區(qū)邰成路西北農(nóng)林科技大學(xué)郵編:712100DB6111/T149—20201獼猴桃花粉潰瘍病菌活菌檢測(cè)技術(shù)規(guī)程本文件規(guī)定了獼猴桃花粉中活性潰瘍病菌(Pseudomonassyringaepv.Actinidiae,Psa)檢測(cè)方法的原理、檢測(cè)方法、檢測(cè)樣品與菌株保存、結(jié)果記錄與資料保存的要求和內(nèi)容。本文件適用于活性潰瘍病菌的檢測(cè)。2規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682-2008分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB/T23621-2009農(nóng)業(yè)植物檢疫實(shí)驗(yàn)室基礎(chǔ)條件SN/T0168-2015進(jìn)出口食品中菌落總數(shù)計(jì)數(shù)方法SN/T0800.1-2016進(jìn)出口糧油、飼料檢驗(yàn)抽樣和制樣方法3原理獼猴桃為雌雄異株植物,雌雄株之間必須通過(guò)授粉才能坐果,花粉中可以攜帶活性潰瘍病菌。本文件利用常規(guī)生物學(xué)鑒定方法和菌落PCR檢測(cè)方法對(duì)花粉中潰瘍病菌進(jìn)行檢測(cè),為阻止獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌的傳播提供技術(shù)支撐。4檢測(cè)方法4.1實(shí)驗(yàn)室要求獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌檢測(cè)所用實(shí)驗(yàn)室的設(shè)置與管理符合GB/T23621—2009要求。除另有規(guī)定外,本標(biāo)準(zhǔn)中的所有試劑均為分析純或生化試劑。實(shí)驗(yàn)用水應(yīng)符合GB6682中一級(jí)水的規(guī)格。病原菌培養(yǎng)及鑒定所需試劑見(jiàn)附錄B。4.2檢驗(yàn)程序及鑒定方法獼猴桃花粉Psa活菌檢驗(yàn)程序見(jiàn)圖1。4.2.1操作步驟4.2.1.1檢測(cè)樣品抽取見(jiàn)SN/T0800.1-2016。4.2.1.2抽樣數(shù)量2DB6111/T149—202010瓶(件)以下,逐瓶抽取,10瓶~100瓶,隨機(jī)選10瓶抽取樣品;100瓶以上,按照一批花粉總瓶數(shù)的平方根數(shù)抽取,見(jiàn)公式(1)。每瓶(件)抽取2g花粉。...................................................................................式中:N—一批花粉總瓶(件)數(shù)。n—應(yīng)抽取瓶(件)數(shù)(取整數(shù),小數(shù)部分向上約)。檢檢樣稀釋 平板接種總菌落計(jì)數(shù)PCR確認(rèn)試驗(yàn) 檢測(cè)報(bào)告圖1獼猴桃花粉Psa活菌檢驗(yàn)程序4.2.2抽樣方法無(wú)菌條件下將裝花粉的容器充分震蕩,使容器內(nèi)花粉充分混勻;容器表面用75%乙醇在包裝口擦拭消毒,待10min~15min后,用無(wú)菌藥匙取2g花粉于無(wú)菌的10mL離心管中,每瓶(件)花粉需換用1把藥匙。-20℃~40℃保存?zhèn)溆谩?.2.3樣品制備4.2.3.1制備樣品勻液無(wú)菌操作稱(chēng)取1g樣品,加入裝有9mL的滅菌雙蒸水的和適量玻璃珠的50mL稀釋瓶中,迅速振搖,將樣品混勻,制成1:10的樣品勻漿液。振搖時(shí)振幅為30cm,7s內(nèi)振搖25次,也可以用機(jī)械振蕩器振蕩15s代替手搖。4.2.3.2稀釋樣品勻液無(wú)菌條件下取樣品勻液1mL加到9mL稀釋劑中,并以此類(lèi)推,分別制成10-2、10-3、10-4連續(xù)稀釋度或其它合適稀釋度的樣品勻液。4.2.4選擇性培養(yǎng)基平板接種和培養(yǎng)DB6111/T149—202034.2.4.1無(wú)菌條件下各取1mL不同稀釋度的樣品勻液,均勻涂布在KBA+萘啶酮酸(終濃度為10μg/mL)平板培養(yǎng)基上。放入培養(yǎng)箱在25℃培養(yǎng)1h后,翻轉(zhuǎn)培養(yǎng)皿,倒置培養(yǎng)47h。觀察菌落形態(tài)和病原菌形態(tài)特征。獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌落和病原菌形態(tài)特征見(jiàn)附錄A第A.6章,根據(jù)菌落特征選取可疑菌落做進(jìn)一步鑒定。4.2.4.2KBA培養(yǎng)基的配制方法為:在培養(yǎng)基中加入蛋白胨20.0g、硫酸鎂(MgSO4·7H2O)1.5g、磷酸氫二鉀(K2HPO4)1.5g、甘油10mL、瓊脂粉15.0g,并用滅菌雙蒸水補(bǔ)充至1000mL,將pH值調(diào)整到6.8~7.0。4.2.5菌落計(jì)數(shù)選擇菌落數(shù)在25個(gè)~250個(gè)的平板進(jìn)行計(jì)數(shù),計(jì)數(shù)所有菌落形成單位(CFU),包括極微小的菌落。記錄菌落數(shù)和稀釋倍數(shù)。如果不能立即計(jì)數(shù),平板在0℃~4℃存放時(shí)間不得超過(guò)24h。4.2.6PCR檢測(cè)4.2.6.1從已計(jì)數(shù)的平板中挑取單菌落進(jìn)行PCR確認(rèn)試驗(yàn)平板菌落數(shù)小于30個(gè),需全部進(jìn)行PCR確認(rèn);菌落數(shù)介于31個(gè)~250個(gè)時(shí),隨機(jī)挑取30個(gè)菌落進(jìn)行PCR確認(rèn)試驗(yàn)。注:PCR實(shí)驗(yàn)室區(qū)的設(shè)置與管理符合GB/T4.2.6.2熱裂解法制備DNA模板用無(wú)菌牙簽挑取平板上培養(yǎng)36h~48h的單菌落,置于200μL的0.85%無(wú)菌生理鹽水中,充分混勻;在13000r/min離心3min,棄掉上清液;再加入1mL滅菌雙蒸水,充分混勻;置于100℃水浴或金屬浴中10min;冰浴冷卻后,13000r/min離心3min,收集上清液;按1:10的比例用滅菌雙蒸水稀釋上清液即為DNA模板;取2μLDNA模板進(jìn)行PCR檢測(cè)。所有DNA模板可直接用于PCR反應(yīng)或在4℃保存1天。否則,應(yīng)在-20℃以下保存?zhèn)溆?1周內(nèi))。4.2.6.3陽(yáng)性對(duì)照與陰性對(duì)照。用已知的Psa標(biāo)準(zhǔn)菌株(M228)作為陽(yáng)性對(duì)照;用丁香假單胞桿菌番茄致病變種(Pst)或等效標(biāo)準(zhǔn)菌株作為陰性對(duì)照。滅菌雙蒸水作為空白對(duì)照。PCR制樣及檢測(cè)方法見(jiàn)附錄B的結(jié)果判定。4.2.7平板培養(yǎng)結(jié)果判定平板培養(yǎng)放置6d以上,如未發(fā)現(xiàn)疑似細(xì)菌菌落,判定為不帶有Psa。如發(fā)現(xiàn)疑似細(xì)菌菌落,進(jìn)行菌落計(jì)數(shù),并做進(jìn)一步PCR鑒定。4.2.8PCR結(jié)果判定若待測(cè)樣品和陽(yáng)性對(duì)照存在243bp條帶,陰性對(duì)照和空白對(duì)照無(wú)此條帶,則判定待測(cè)樣品為陽(yáng)性,其攜帶有Psa;否則為陰性。5樣品與菌株保存?zhèn)浞輼悠芳皬臉悠分蟹蛛x到并鑒定為Psa菌株,應(yīng)妥善保存。備份樣品菌株可接種于KBA培養(yǎng)基斜面上,25℃恒溫培養(yǎng)2d~3d后置于4℃冰箱保存,或加入10%體積的甘油制成甘油菌液,置于-80℃冰DB6111/T149—20204箱長(zhǎng)期保存。其它不需要保存的樣品及檢測(cè)過(guò)程中產(chǎn)生的廢物、廢水等應(yīng)經(jīng)高壓滅菌后集中銷(xiāo)毀,用具也應(yīng)進(jìn)行滅菌處理。6結(jié)果記錄與資料保存實(shí)驗(yàn)記錄應(yīng)包括:樣品來(lái)源、種類(lèi)(品種)、采集時(shí)間、檢測(cè)時(shí)間、地點(diǎn)和結(jié)果等,并要有檢測(cè)人員、審核人員簽字。PCR檢測(cè)需要有電泳結(jié)果照片等,上述材料應(yīng)歸檔并妥善保存。DB6111/T149—20205(資料性附錄)獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌(psa)相關(guān)資料A.1英文名稱(chēng)KiwifruitBacteriaLCankerA.2學(xué)名Pseudomonassyringaepv.actinidiaeA.3分布地區(qū)中國(guó)、日本、韓國(guó)、新西蘭、意大利、美國(guó)、法國(guó)、葡萄牙、土爾其、西班牙、伊朗、希臘。A.4寄主范圍該病原菌自然侵染的寄主主要為獼猴桃屬(ActinidiaLindL);人工接種可侵染桃(PrunusescuLentum)等。A.5病害癥狀A(yù).5.1枝潰瘍癥狀多從莖蔓幼芽、皮孔、葉痕、果柄痕及枝條分叉部位開(kāi)始發(fā)病,初期呈水漬狀,后擴(kuò)大,顏色加深,皮層組織變軟隆起,與木質(zhì)部分離,后期病部皮層縱向線狀龜裂,傷口、皮孔、芽眼、葉痕等部位流出白色黏液,傷流期與植株傷流液混合后變?yōu)榧t褐色或鐵銹紅色,剝開(kāi)皮層后可見(jiàn)木質(zhì)部呈黑褐色,韌皮部潰瘍腐爛,病斑繞莖擴(kuò)展到新梢后影響營(yíng)養(yǎng)和水分的吸收與輸送導(dǎo)致新梢枝葉萎蔫枯死。A.5.2葉斑癥狀新生葉片上呈現(xiàn)紅色小點(diǎn),后形成2mm~3mm不規(guī)則褐色或暗褐色病斑,病斑周?chē)?mm~5mm的明顯水漬狀黃色暈圈,潮濕條件下病斑擴(kuò)大,導(dǎo)致整個(gè)葉片焦枯、卷曲。A.5.3花腐癥狀花蕾受害后嚴(yán)重的不能張開(kāi),變褐死后脫落;受害較輕的花蕾雖能開(kāi)放,但開(kāi)放速度慢或不能完全開(kāi)放,這種花可能脫落也可能座果,通常果實(shí)較小,易落果或發(fā)育成畸形果。A.6病原菌形態(tài)特征及培養(yǎng)性狀DB6111/T149—20206Psa為好氧細(xì)菌,病原菌菌體直桿狀,有的稍彎曲,單細(xì)胞,菌體大小為(1.4μm~2.3μm)×(0.4μm~0.5μm),多數(shù)具1根極生鞭毛,少數(shù)為2根~3根。革蘭氏染色陰性,不具莢膜,不產(chǎn)生芽孢。在KBA培養(yǎng)基上菌落呈白色或淺黃色、表面光滑、有黃綠色熒光;在牛肉蛋白胨培養(yǎng)基上呈圓形、乳白色、表面光滑、全緣。病原菌生長(zhǎng)最適溫度為25℃~28℃,生長(zhǎng)最高溫度為35℃,生長(zhǎng)最低溫度為-12℃以下,致死溫度為55℃、10min。A.7傳播途徑該病原菌的遠(yuǎn)距離傳播主要靠帶菌苗木、接穗、花粉和昆蟲(chóng)。在田間,該病原菌主要通過(guò)雨水、灌溉水、農(nóng)具、昆蟲(chóng)等傳播,由傷口、自然孔口等侵入寄主組織。DB6111/T149—20207(資料性附錄)獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌(psa)PCR檢測(cè)方法B.1試劑及配制——TE緩沖液:10mMTris·HCL,1mMEDTA,pH8.0?!狿CR試劑:特異引物對(duì)(10μmoL/L)、2×MasterMix、TempLate(0.1ng/mL~1ng/mL)——2000bpDNAMarker、5moL/LNaCL、70%乙醇、核酸染料——電泳緩沖液TBE(5×)(pH8.0):每升溶液中含54gTris,27.5g硼酸,10mMEDTA。電泳時(shí)稀釋成1×濃度使用?!傊悄z(1%稱(chēng)取0.1g瓊脂糖加入到10mL1×TBE溶液中,微波爐煮沸后加入1‰體積核酸染料,混勻后制膠。B.2PCR檢測(cè)B.2.1PCR檢測(cè)引物引物對(duì)1:Psa-F1/Psa-R1(引物序列為正向引物P0F:5`-CTGCAACAGGCGACGGCGAGGC-3`、反向引物P6R:5`-CATAGGCTTCTGGTTTTCTTCCTGATCC-3`,擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為243bp),使用TE溶液(pH8.0)將合成的引物干粉稀釋成10μmoL/L儲(chǔ)存液。B.2.2PCR反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件B.2.2.1PCR反應(yīng)體系2×MasterMix10μL、TempLate(0.1ng/mL~1ng/mL)1μL、正反引物各1μL、補(bǔ)滅菌雙蒸水至反應(yīng)體系總體積為20μL。B.2.2.2PCR擴(kuò)增條件將配制完成的反應(yīng)管放入PCR儀中,啟動(dòng)反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,66℃退火30s,72℃延伸1min,35cycLes;72℃5min,4℃保溫。在進(jìn)行PCR檢測(cè)時(shí),需同時(shí)設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照、陰性對(duì)照和空白對(duì)照。B.3凝膠電泳稱(chēng)量2.0g瓊脂糖,加入至200mL的1×TAE電泳緩沖液中,充分混勻。微波爐反復(fù)加熱至沸騰,直到瓊脂糖完全融化形成清亮透明的溶液。待瓊脂糖溶液冷卻至60℃左右時(shí),加入GeLRed(膠體體積與染料體積比為20:1),充分混勻后,輕輕倒入已放置好梳子的模具中,凝膠長(zhǎng)度要大于10cm,厚度為3mm~5mm。檢查梳齒下或梳齒間有無(wú)氣泡,如果有,則用一次性吸頭小心排掉氣泡。當(dāng)瓊脂糖凝膠完全凝結(jié)后,輕輕拔出梳子,小心將膠塊和膠床放入電泳槽中,樣品孔朝向陰極端。向電泳槽中加入1×TAEDB6111/T149—20208電泳緩沖液,液面高于膠面1mm~2mm。用微量移液器吸5μLPCR產(chǎn)物加入上樣孔中;其中,第1個(gè)泳道中加入2μLDNAMarker,陽(yáng)性對(duì)照的PCR反應(yīng)產(chǎn)物加入到最后1個(gè)泳道。接通電源,根據(jù)公式:電壓=電泳槽正負(fù)極間的距離(cm)×5V/cm計(jì)算并設(shè)定電泳儀電壓數(shù)值;啟動(dòng)電壓開(kāi)關(guān),電泳開(kāi)始以正負(fù)極鉑金絲出現(xiàn)氣泡為準(zhǔn),電泳時(shí)間為30min~45min。B.4成像觀察與記錄電泳結(jié)束后,取出瓊脂糖凝膠置于凝膠成像儀下,根據(jù)DNAMarker判斷擴(kuò)增產(chǎn)物條帶的大小,記錄結(jié)果,并將電子文件存檔備查。B.5結(jié)果判定如果待測(cè)樣品和陽(yáng)性對(duì)照同時(shí)出現(xiàn)243bp大小的目的條帶,而陰性對(duì)照、空白對(duì)照均沒(méi)有該條帶,則判定待測(cè)樣品為陽(yáng)性;如果陽(yáng)性對(duì)照出現(xiàn)目的條帶,而陰性對(duì)照、空白對(duì)照、待測(cè)樣品中均未出現(xiàn)目的條帶,則判定待測(cè)樣品為陰性。B.6結(jié)果報(bào)告B.6.1數(shù)字修約參見(jiàn)SN/T0168

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